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Caracterização estrutural dos locos CRISPR em cepas brasileiras de Yersinia pestisFRANÇA, Camila Tenorio 08 August 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-08-08 / CAPES / Yersinia pestis é o agente causador da peste, doença primária de roedores transmitida por
pulgas, que pode afetar o homem e outros mamíferos. A subtipagem molecular das cepas de Y. pestis
tem sido dificultada pela grande similaridade genética entre os isolados. A análise dos locos CRISPR
(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) trouxe avanços em estudos filogenéticos
e tipagem de cepas de Y. pestis dos numerosos focos dos diversos países. O objetivo deste trabalho foi
avaliar a diversidade intraespecífica em cepas brasileiras de Y. pestis através do estudo dos locos
CRISPR. As três sequências CRISPR (YPa, YPb e YPc) reconhecidas da Y. pestis foram amplificadas
nas 98 cepas analisadas, originadas de diferentes fontes, focos e momentos epidemiológicos. Os
amplicons obtidos por PCR foram analisados em gel de agarose e sequenciados. O loco YPa se
mostrou o mais polimórfico, apresentando seis alelos de 449 a 630 pares de base (pb), seguido pelo
YPb, com quatro alelos de 271 a 392 pb. O loco YPc, monomórfico, apresentou apenas um alelo de
331 pb em toda as cepas. Foi observado que as repetições diretas (DRA) são compostas de 28 pb,
separadas por sequências espaçadoras únicas de 32 ou 33 pb em todos os locos. Dos 137 espaçadores já
conhecidos 18 foram encontrados nas cepas analisadas e, adicionalmente, 19 novos espaçadores foram
observados, 15 no loco YPa e quatro no loco YPb. A análise da distribuição dos espaçadores definiu 20
perfis genotípicos, refletindo a diversidade intraespecífica das cepas brasileiras, e evidenciou uma
correlação entre a presença de alguns conjuntos de sequências espaçadoras e os focos de origem das
cepas. A maioria dos perfis é exclusiva de uma cepa de um foco, e alguns são dispersos em vários
focos e períodos. As incorporações/perdas de motivos observadas nos locos YPa e YPb sugerem que
estes estão ativos e a ausência de alterações no loco YPc sugere inatividade. Em conclusão, a análise
dos locos CRISPR revelou heterogeneidade e identificou características genéticas exclusivas nas cepas
brasileiras que podem ser atribuídas à microevolução da bactéria após sua introdução no país.
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Estudo da variabilidade do veneno de Bothrops jararaca em uma população isolada da ilha de São Sebastião / COMPARATIVE STUDY OF Bothrops jararaca VENOM FROM MAINLAND AND SPECIMENS OF THE ISLAND OF SÃO SEBASTIÃO.Ribeiro Júnior, Marcos Antonio 29 October 2008 (has links)
A variabilidade na composição e nas atividades biológicas dos venenos de serpentes vem sendo documentada por diversos autores e pode ser observada em diversos níveis. As diferenças na composição dos venenos apresentam relevância na terapêutica dos envenenamentos ofídicos, tornando o estudo da variação dos venenos de extrema importância para a confecção de antivenenos mais específicos e de maior eficácia nos tratamentos de envenenamentos ofídicos em humanos. Os estudos das variações do veneno de serpentes em populações isoladas são raros, sendo no Brasil os casos mais conhecidos os da Bothrops insularis e Bothrops alcatraz. Diversos estudos sugerem que as oscilações do nível marinho, ocorridas há 11.000 anos, teriam isolado populações de serpentes nas ilhas recentemente formadas, resultando em duas diferentes rotas evolutivas que deram origem a estas espécies. Tendo em vista que a formação da Ilha de São Sebastião-SP ocorreu no mesmo período, isolando populações de animais ali existentes, nos propusemos a avaliar a variação nas atividades do veneno de 80 exemplares de serpentes Bothrops jararaca provenientes da ilha e da sua área de distribuição continental, comparando-as com o Veneno Referência Nacional, para as atividades proteolítica sobre caseína, fosfolipásica indireta, hemorrágica e amidolítica, assim como de seus perfis eletroforéticos (SDS-PAGE) e seu reconhecimento pelo soro antibotrópico comercial através da técnica de Western Blot. A análise eletroforética (SDS-PAGE 12,5%) através de densitometria óptica evidenciou, em sua maioria bandas protéicas de baixo peso molecular e a presença de duas áreas majoritárias com grande variação no número, disposição e intensidade das bandas nas faixas de pesos moleculares de 45 kDa e 25 kDa. A variação da disposição das bandas apresentadas nos géis correlacionou-se com a variação nas atividades. Amostras que apresentaram baixa atividade fosfolipásica foram exatamente aquelas que apresentaram poucas e tênues bandas com aproximadamente 14 kDa. A análise das atividades proteolítica sobre caseína, fosfolipásica e esterásica apresentou um padrão de similaridade que nos permitiu estabelecer duas grandes subpopulações de venenos; uma ao norte da distribuição geográfica amostrada, apresentando altas atividades proteolítica sobre caseína, fosfolipásica e amidolítica e outra ao sul apresentando menores valores para tais variedades. Não foi possível estabelecer uma relação direta entre o padrão de distribuição geográfica com a variação nas atividades hemorrágicas dos venenos amostrados. A técnica de Western Blot permitiu concluir que o soro antibotrópico comercial não apresenta um bom reconhecimento para proteínas de baixo peso molecular. A análise das atividades dos venenos dos exemplares insulares apresentou similaridade com as atividades das amostras de veneno de serpentes coletadas próximas à ilha, sugerindo que o intercâmbio gênico não tenha sido de todo interrompido, provavelmente devido à sua proximidade para com o continente. / The variability in composition and biological activities of snake venoms has been documented by several authors and can be observed in different levels. The study of the differences in venom composition is relevant for the therapeutic of snake envenoming, enabling the confection of more specific sera for the treatment of humans. The studies of snake venom variations in isolated population are scarce, and in Brazil, such studies concern mostly Bothrops Alcatraz and Bothrops insularis. Several studies suggest that the oscillations of the sea level which occurred 11,000 years ago might have isolated snake populations on the recently formed islands, resulting in two different evolutive routes which originated these species. Considering that the formation of Island of São Sebastião occurred within the same period, we decided to investigate the variability of 80 individual venom samples collected from specimens from the island and the continent, comparing these samples with the National Reference Venom for their caseinolytic, phospholipase, hemorrhagic and amidolytic activities, as well as electrophoretic profiles and immunoreactivity against the commercial anti-bothropic serum. Optical densitometry of the polyacrylamide gels indicated the presence of low molecular weight components and a molecular weight range with a high degree of variation of band number, migration pattern and intensity between 45 and 25 kDa. The variations in the electrophoretic profiles correlated with the differences observed in the enzymatic activities. Samples that presented low phospholipase activity also showed faint bands in the 14 kDa region. Taken together, the activities profiles enabled us to distinguish two distinct populations, one more to the north with higher activities, and another to the south with lower activities. There was no detectable correlation between geographic origin of the venom and hemorrhagic activity. By western blot we were able to observe the commercial antiserum fails in recognizing the low molecular weight components. These analyses showed that the insular venoms were very similar to the venoms obtained from continental areas close to the island, suggesting that the genic flow might not have been interrupted, probably due to the close vicinity of the island and the continent.
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Estudo da variabilidade do veneno de Bothrops jararaca em uma população isolada da ilha de São Sebastião / COMPARATIVE STUDY OF Bothrops jararaca VENOM FROM MAINLAND AND SPECIMENS OF THE ISLAND OF SÃO SEBASTIÃO.Marcos Antonio Ribeiro Júnior 29 October 2008 (has links)
A variabilidade na composição e nas atividades biológicas dos venenos de serpentes vem sendo documentada por diversos autores e pode ser observada em diversos níveis. As diferenças na composição dos venenos apresentam relevância na terapêutica dos envenenamentos ofídicos, tornando o estudo da variação dos venenos de extrema importância para a confecção de antivenenos mais específicos e de maior eficácia nos tratamentos de envenenamentos ofídicos em humanos. Os estudos das variações do veneno de serpentes em populações isoladas são raros, sendo no Brasil os casos mais conhecidos os da Bothrops insularis e Bothrops alcatraz. Diversos estudos sugerem que as oscilações do nível marinho, ocorridas há 11.000 anos, teriam isolado populações de serpentes nas ilhas recentemente formadas, resultando em duas diferentes rotas evolutivas que deram origem a estas espécies. Tendo em vista que a formação da Ilha de São Sebastião-SP ocorreu no mesmo período, isolando populações de animais ali existentes, nos propusemos a avaliar a variação nas atividades do veneno de 80 exemplares de serpentes Bothrops jararaca provenientes da ilha e da sua área de distribuição continental, comparando-as com o Veneno Referência Nacional, para as atividades proteolítica sobre caseína, fosfolipásica indireta, hemorrágica e amidolítica, assim como de seus perfis eletroforéticos (SDS-PAGE) e seu reconhecimento pelo soro antibotrópico comercial através da técnica de Western Blot. A análise eletroforética (SDS-PAGE 12,5%) através de densitometria óptica evidenciou, em sua maioria bandas protéicas de baixo peso molecular e a presença de duas áreas majoritárias com grande variação no número, disposição e intensidade das bandas nas faixas de pesos moleculares de 45 kDa e 25 kDa. A variação da disposição das bandas apresentadas nos géis correlacionou-se com a variação nas atividades. Amostras que apresentaram baixa atividade fosfolipásica foram exatamente aquelas que apresentaram poucas e tênues bandas com aproximadamente 14 kDa. A análise das atividades proteolítica sobre caseína, fosfolipásica e esterásica apresentou um padrão de similaridade que nos permitiu estabelecer duas grandes subpopulações de venenos; uma ao norte da distribuição geográfica amostrada, apresentando altas atividades proteolítica sobre caseína, fosfolipásica e amidolítica e outra ao sul apresentando menores valores para tais variedades. Não foi possível estabelecer uma relação direta entre o padrão de distribuição geográfica com a variação nas atividades hemorrágicas dos venenos amostrados. A técnica de Western Blot permitiu concluir que o soro antibotrópico comercial não apresenta um bom reconhecimento para proteínas de baixo peso molecular. A análise das atividades dos venenos dos exemplares insulares apresentou similaridade com as atividades das amostras de veneno de serpentes coletadas próximas à ilha, sugerindo que o intercâmbio gênico não tenha sido de todo interrompido, provavelmente devido à sua proximidade para com o continente. / The variability in composition and biological activities of snake venoms has been documented by several authors and can be observed in different levels. The study of the differences in venom composition is relevant for the therapeutic of snake envenoming, enabling the confection of more specific sera for the treatment of humans. The studies of snake venom variations in isolated population are scarce, and in Brazil, such studies concern mostly Bothrops Alcatraz and Bothrops insularis. Several studies suggest that the oscillations of the sea level which occurred 11,000 years ago might have isolated snake populations on the recently formed islands, resulting in two different evolutive routes which originated these species. Considering that the formation of Island of São Sebastião occurred within the same period, we decided to investigate the variability of 80 individual venom samples collected from specimens from the island and the continent, comparing these samples with the National Reference Venom for their caseinolytic, phospholipase, hemorrhagic and amidolytic activities, as well as electrophoretic profiles and immunoreactivity against the commercial anti-bothropic serum. Optical densitometry of the polyacrylamide gels indicated the presence of low molecular weight components and a molecular weight range with a high degree of variation of band number, migration pattern and intensity between 45 and 25 kDa. The variations in the electrophoretic profiles correlated with the differences observed in the enzymatic activities. Samples that presented low phospholipase activity also showed faint bands in the 14 kDa region. Taken together, the activities profiles enabled us to distinguish two distinct populations, one more to the north with higher activities, and another to the south with lower activities. There was no detectable correlation between geographic origin of the venom and hemorrhagic activity. By western blot we were able to observe the commercial antiserum fails in recognizing the low molecular weight components. These analyses showed that the insular venoms were very similar to the venoms obtained from continental areas close to the island, suggesting that the genic flow might not have been interrupted, probably due to the close vicinity of the island and the continent.
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Variação morfológica geográfica em lagartos dos gêneros Micrablepharus e Vanzosaura (Squamata, Gymnophthalmidae, Gymnophthalmini) e teste de hipóteses biogeográficas com o uso de modelagem de distribuição / Geographical variation in morphology of the genus Micrablepharus and Vanzosaura (Squamata, Gymnophthalmidae, Gymnophthalmini) and test of biogeographic hypotheses with the use of species distribution modelingRecoder, Renato Sousa 03 April 2012 (has links)
Vanzosaura rubricauda e Micrablepharus maximilian são duas espécies de lagartos microteídeos (Gymnophthalmidae) com ampla distribuição na \"grande diagonal\" de formações abertas da América do Sul. Ao longo de suas distribuições, as espécies estão sujeitas a condições ambientais muito variáveis, em região com complexa história geomorfológica. Representam bons modelos para estudo de variação geográfica. Com o uso de técnicas de biometria e análise espacial, estudei os padrões de variação geográfica em morfometria em V. rubricauda e M. maximiliani. Ambas as espécies apresentaram dimorfismo sexual e variação geográfica significante em morfometria e contagem de escamas. A variação geográfica em V. rubricauda é concordante entre os sexos e pode ser definida por um contraste entre alongamento do corpo e tamanho dos membros. Populações do \"Cerrado leste\" se destacam por possuir menor tamanho, troncos mais curtos, membros longos e baixo número de subcaudais lisas. Os padrões de coloração são grandemente variáveis em nível local, havendo polimorfismo em populações da Caatinga e em uma do Chaco. Em M. maximiliani a variação geográfica observada é menos evidente, porém populações do \"Cerrado oeste\" se destacam pelo maior tamanho e maiores contagens de escamas, enquanto do grupo \"Nordeste\" apresentam troncos mais curtos e pés proporcionalmente maiores. Em relação aos padrões geográficos, é destacada a heterogeneidade morfológica entre populações das duas espécies na região do Cerrado, e sua diferenciação em relação às populações do semiárido e restingas litorâneas. O modelo ecogeográfico que melhor explica a variação em V. rubricauda é aridez, determinando um contraste em morfologia entre populações do Cerrado em relação a outras regiões. Para M. maximiliani, temperatura, sazonalidade e geografia tiveram maior poder explanatório, no entanto, o padrão geografico é afetado por autocorrelação espacial. Modelos de paleodistribuição sugerem que flutuações climáticas podem ter causado isolamento de populações em climas pretéritos mais secos que o atual. O grau de diferenciação intraespecífica em V. rubricauda sugere a necessidade de uma reavaliação taxonômica do gênero. / Vanzosaura rubricauda and Micrablepharus maximilian are two species of microteiid lizards (Gymnophthalmidae) widespread in the \"great diagonal\" of open formations in South America. Throughout their distribution, the species are subject to highly variable environmental conditions, in a region with complex geomorphological history. Therefore, represent good models for a study of geographic variation. With the use of biometry techniques and spatial analysis I studied the patterns of morphological variation in V. rubricauda and M. maximiliani. Both species showed sexual dimorphism and significant geographical variation in morphometry and scale counting. Geographic variation in V. rubricauda is consistent between the sexes and can be defined by a contrast between body elongation and length of limbs. Populations of \"Eastern Cerrado\" are distinguished by having smaller body size, shorter trunks, longer limbs and low number of smooth subcaudal scales. The color patterns are highly variable at the local level, with polymorphism in populations of the Caatinga and Chaco. In M. maximiliani geographical variation observed is less clear however, populations of the \"Western Cerrado\" are larger and possess higher scale counts, while the group \"Northeast\" present shorter trunks and proportionately larger feet. Regarding geographic patterns, the morphological heterogeneity among populations of both species in the Cerrado region is highlighted, and its differentiation from the populations of the \"Northeast\" group. The ecogeographical model that best explains the variation in V. rubricauda is aridity, due a contrast in morphology between populations of the Cerrado in relation to other regions. For M. maximiliani, temperature, seasonality and geography had greater model selection; however, the geographical pattern is affected by spatial autocorrelation. Paleodistributional models suggest that climatic fluctuations may have caused isolation of population during past climates with drier conditions than current. The degree of intraspecific differentiation in V. rubricauda suggests the need of a taxonomic reassessment for the genus.
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Produção e qualidade de sementes de quinoa em função do arranjo espacial / Production and quality of quinoa seeds as a function of spatial arrangementOliveira Filho, Antonio Francelino de January 2017 (has links)
OLIVEIRA FILHO, Antonio Francelino de. Produção e qualidade de sementes de quinoa em função do arranjo espacial. 2017. 62 f. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia)–Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Deocleciano Xavier (dixavier.ufc@gmail.com) on 2017-07-31T18:04:13Z
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Previous issue date: 2017 / The aim of this study was to evaluate the effect over two years of population arrangements on vegetative characteristics, production components and physiological potential in seeds of the quinoa ‘BRS Piabiru’. The experiments were carried out in the experimental area of the agriculture sector of the Department of Plant Science, Federal University of Ceará Pici Campus, in Fortaleza, Ceará, during the agricultural years 2014/2015 (from October to February) and 2015/2016 (from September to January). The treatments were the result of a 3 x 3 factorial scheme (row spacings: 20, 40 and 60 cm, and plant spacings within a row: 10, 15 and 20 cm), with the treatments distributed over four replications. Vegetative characteristics were evaluated by plant height, stem diameter, number of branches, specific leaf area, leaf area index and shoot dry weight. For the production characteristics, the panicle length, seed to panicle ratio, productivity, 1000-seed weight and seed oil content were evaluated. The physiological potential of the seeds was evaluated by tests of germination and vigour (percentage germination, germination speed index, mean germination time and accelerated ageing). The experiments were analysed jointly in relation to cycle for seed production and quality. Population arrangement and planting cycle interact on the vegetative characteristics and yield of the quinoa, with the combination of 20 x 10 cm producing around 10 ton.ha-1 shoot dry weight, and 1,162.12 kg.ha-1 seeds. The physiological quality of the seed is dependent on the density within the row, where spacings of 15 and 20 cm promote greater percentage germination (over 84%). An increase in planting density gives a reduction in panicle size of more than 18 cm for some combinations, but this is compensated for by an increase in seed productivity. The agricultural year affected seed quality within the various plant populations, which may be related to climatic factors. / Objetivou-se com o presente trabalho avaliar os efeitos dos arranjos populacionais nas características vegetativas, componentes de produção e potencial fisiológico de sementes da cultivar de quinoa BRS Piabiru em dois anos. Os experimentos foram conduzidos na área experimental do setor de agricultura, Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal do Ceará, Campus do Pici, em Fortaleza, CE durante os anos agrícolas 2014/2015(de outubro a fevereiro) e 2015/2016 (de setembro a janeiro). Os tratamentos resultaram de um esquema fatorial 3x3 (espaçamentos entre fileiras: 20; 40 e 60 cm e espaçamentos entre plantas dentro da fileira: 10; 15 e 20 cm), sendo esses tratamentos distribuídos em quatro repetições. As características vegetativas foram avaliadas através da altura de plantas, diâmetro do caule, número de ramificações, área foliar específica, índice de área foliar e massa seca da parte aérea, já para as características de produção verificou-se o comprimento de panícula, relação semente panícula, produtividade, massa de 1000 sementes e teor de óleo nas sementes. O potencial fisiológico das sementes foi avaliado pelos testes de germinação e vigor (percentagem de germinação, índice de velocidade de germinação, tempo médio de germinação e envelhecimento acelerado). Os experimentos foram analisados de forma conjunta em relação ao ciclo para a produção e qualidade de sementes. O arranjo populacional e ciclo de plantio interagem sobre as características vegetativas e o rendimento de quinoa, com a combinação de 20 x 10 cm produzindo 10 ton ha-1 de massa seca da parte aérea e 1.162,12 kg ha-1 de sementes. A qualidade fisiológica das sementes é dependente da densidade no interior da fileira, sendo o espaçamento de 15 e 20 cm os que promovem maiores percentuais de germinação (acima de 84%). O aumento da densidade de plantio proporciona redução acima de 18 cm no tamanho das panículas em algumas combinações, porém é compensado pelo aumento da produtividade de sementes. O ano agrícola afeta a qualidade de sementes dentro das diversas populações de plantas, devido às condições meteorológicas.
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Padrão de atividade, mudanças no uso de substrato e efeitos da chuva diurna na atividade noturna de Phoneutria reidyi (Araneae: Ctenidae) na Amazônia CentralAlmeida, Marlus Queiroz 27 June 2016 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-26T14:06:58Z
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Previous issue date: 2016-06-27 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The wandering spiders are models for the understanding of the ecology of predators, but the
knowledge of their ecology is still based on few species, mostly from temperate regions. The
occurrence of rain is common in humid tropical forests, but their influence on the wandering
spiders behavior is virtually unknown and there are few studies on the intraspecific
coexistence in species where cannibalism may be an important interaction. During 16 months
i made 19 trips to get data on activity pattern, use of substrates, diet and effect of rainfall on
the nocturnal activity of wandering spider Phoneutria reidyi (Ctenidae) in a coconut
plantation in the municipality of Rio Preto da Eva, and 30 more days of data collection of
these spiders in the forest fragment of the campus of Federal University of Amazonas in
Manaus, to check the effect of rainfall in the activity of spiders in "terra firme". The censuses
of spiders were held in two time intervals at night, early evening (19:00 - 23:59h) and late
night (01:00 - 04:00h), and i obtained data on the use of substrate and diet spiders of different
stages of development. To check the effect of rain on the behavior of spiders, we compared
the number of active spiders in 30 pairs of subsequent nights, each pair with one night after a
daytime rain and another without daytime rain. There was a reduction in the activity of
spiders at the end of the night period, however, we found no evidence of temporal segregation
between different sizes of individuals, indicating that small spiders are not foraging at
different times to avoid competition for resources or cannibalism by spiders larger. However,
we found a strong shift in the use of foraging substrate and diet of these spiders in the final
phase of its development. We suggest that the cause in the difference on the use of foraging
substrate is that the smaller spiders avoid palms to reduce the probability of cannibalism in this
population where the density of this species is high. There was a strong reduction in nocturnal
activity of spiders in days with daytime rains in both areas studied (plantation and forest). We
discuss the causes and consequences of the powers of diurnal rainfall on the spider behavior
and the need to take this into count in ecological studies with bases in visual surveys and
pitfall traps. This study helped to show that the change in the use of foraging substrates can
help reduce intraspecific predation P. reidyi and to show the importance of rain on the
behavior of this species, which belongs to one of the spider genera of higher medical interest
the world, and whose ecology is still poorly known. / Aranhas errantes são modelos para a compreensão da ecologia de predadores, mas o
conhecimento sobre a sua ecologia ainda se baseia em poucas espécies, principalmente de
regiões temperadas. A ocorrência de chuva é frequente em florestas tropicais úmidas,
entretanto, a influência sobre o comportamento de aranhas errantes é praticamente
desconhecida e faltam estudos sobre a coexistência intraespecífica em espécies em que o
canibalismo pode ser uma interação importante. Durante 16 meses foi realizado 19 excursões
para obter dados sobre padrão de atividade, uso de substratos, dieta e efeito da chuva diurna
sobre a atividade noturna da aranha errante Phoneutria reidyi (Ctenidae) em uma plantação de
coqueiros no município do Rio Preto da Eva, e mais 30 dias de coletas de dados destas
aranhas no fragmento florestal do campus da Universidade Federal do Amazonas em Manaus,
para verificar o efeito da chuva diurna na atividade das aranhas em floresta de terra firme. As
contagens das aranhas foram realizadas em dois intervalos de horário do período noturno,
início da noite (19:00 às 23:59h) e final da noite (01:00 às 04:00h), além de obter dados sobre
o uso de substrato e da dieta em aranhas de diferentes estágios de desenvolvimento. Para
verificar o efeito da chuva na atividade de forrageio das aranhas, comparamos o número de
aranhas ativas em 30 pares de noites subsequentes, cada par com uma noite depois de uma
chuva diurna e outra sem chuva diurna. Houve uma redução na atividade das aranhas no final
do período noturno, no entanto, não encontramos evidencia de segregação temporal entre
indivíduos de tamanhos diferentes, indicando que as aranhas pequenas não estão forrageando
em horário diferentes para evitar a competição por recursos ou o canibalismo por aranhas
maiores. Entretanto, encontramos uma mudança no uso de substrato de forrageio e na dieta
destas aranhas na fase final do seu desenvolvimento. Sugerimos que a causa da diferença no
uso de substrato de forrageio seja que as aranhas menores evitam palmeiras para reduzir a
probabilidade de canibalismo nesta população onde a densidade desta espécie é alta. Ocorreu
redução da atividade noturna das aranhas em dias com chuvas diurnas em ambas as áreas
estudadas (plantação e floresta). Discutimos as potências causas e consequências do efeito da
chuva diurna sobre o comportamento das aranhas e a necessidade de levar isso em contar em
estudos ecológicos com bases em censos visuais e armadilhas de queda. Este estudo
contribuiu para mostrar que a mudança no uso de substratos de forrageio pode contribuir para
reduzir a predação intraespecífica de P. reidyi e para mostrar a importância da chuva sobre o
comportamento desta espécie, que pertence a um dos gêneros de aranhas de maior interesse
médico do mundo, e cuja ecologia ainda é pouco conhecida.
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Variação morfológica geográfica em lagartos dos gêneros Micrablepharus e Vanzosaura (Squamata, Gymnophthalmidae, Gymnophthalmini) e teste de hipóteses biogeográficas com o uso de modelagem de distribuição / Geographical variation in morphology of the genus Micrablepharus and Vanzosaura (Squamata, Gymnophthalmidae, Gymnophthalmini) and test of biogeographic hypotheses with the use of species distribution modelingRenato Sousa Recoder 03 April 2012 (has links)
Vanzosaura rubricauda e Micrablepharus maximilian são duas espécies de lagartos microteídeos (Gymnophthalmidae) com ampla distribuição na \"grande diagonal\" de formações abertas da América do Sul. Ao longo de suas distribuições, as espécies estão sujeitas a condições ambientais muito variáveis, em região com complexa história geomorfológica. Representam bons modelos para estudo de variação geográfica. Com o uso de técnicas de biometria e análise espacial, estudei os padrões de variação geográfica em morfometria em V. rubricauda e M. maximiliani. Ambas as espécies apresentaram dimorfismo sexual e variação geográfica significante em morfometria e contagem de escamas. A variação geográfica em V. rubricauda é concordante entre os sexos e pode ser definida por um contraste entre alongamento do corpo e tamanho dos membros. Populações do \"Cerrado leste\" se destacam por possuir menor tamanho, troncos mais curtos, membros longos e baixo número de subcaudais lisas. Os padrões de coloração são grandemente variáveis em nível local, havendo polimorfismo em populações da Caatinga e em uma do Chaco. Em M. maximiliani a variação geográfica observada é menos evidente, porém populações do \"Cerrado oeste\" se destacam pelo maior tamanho e maiores contagens de escamas, enquanto do grupo \"Nordeste\" apresentam troncos mais curtos e pés proporcionalmente maiores. Em relação aos padrões geográficos, é destacada a heterogeneidade morfológica entre populações das duas espécies na região do Cerrado, e sua diferenciação em relação às populações do semiárido e restingas litorâneas. O modelo ecogeográfico que melhor explica a variação em V. rubricauda é aridez, determinando um contraste em morfologia entre populações do Cerrado em relação a outras regiões. Para M. maximiliani, temperatura, sazonalidade e geografia tiveram maior poder explanatório, no entanto, o padrão geografico é afetado por autocorrelação espacial. Modelos de paleodistribuição sugerem que flutuações climáticas podem ter causado isolamento de populações em climas pretéritos mais secos que o atual. O grau de diferenciação intraespecífica em V. rubricauda sugere a necessidade de uma reavaliação taxonômica do gênero. / Vanzosaura rubricauda and Micrablepharus maximilian are two species of microteiid lizards (Gymnophthalmidae) widespread in the \"great diagonal\" of open formations in South America. Throughout their distribution, the species are subject to highly variable environmental conditions, in a region with complex geomorphological history. Therefore, represent good models for a study of geographic variation. With the use of biometry techniques and spatial analysis I studied the patterns of morphological variation in V. rubricauda and M. maximiliani. Both species showed sexual dimorphism and significant geographical variation in morphometry and scale counting. Geographic variation in V. rubricauda is consistent between the sexes and can be defined by a contrast between body elongation and length of limbs. Populations of \"Eastern Cerrado\" are distinguished by having smaller body size, shorter trunks, longer limbs and low number of smooth subcaudal scales. The color patterns are highly variable at the local level, with polymorphism in populations of the Caatinga and Chaco. In M. maximiliani geographical variation observed is less clear however, populations of the \"Western Cerrado\" are larger and possess higher scale counts, while the group \"Northeast\" present shorter trunks and proportionately larger feet. Regarding geographic patterns, the morphological heterogeneity among populations of both species in the Cerrado region is highlighted, and its differentiation from the populations of the \"Northeast\" group. The ecogeographical model that best explains the variation in V. rubricauda is aridity, due a contrast in morphology between populations of the Cerrado in relation to other regions. For M. maximiliani, temperature, seasonality and geography had greater model selection; however, the geographical pattern is affected by spatial autocorrelation. Paleodistributional models suggest that climatic fluctuations may have caused isolation of population during past climates with drier conditions than current. The degree of intraspecific differentiation in V. rubricauda suggests the need of a taxonomic reassessment for the genus.
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Efeitos da irradiância na fisiologia de Gracilaria caudata (Gracilariales, Rhodophyta): uma abordagem intraespecífica / Effects of irradiance in Gracilaria caudata: an intraespecific approachFaria, André Vinicius Fonseca de 17 September 2015 (has links)
Gracilaria caudata J. Agardh apresenta uma ampla distribuição geográfica, além de ser uma das principais agarófitas coletadas no nordeste brasileiro. Este estudo teve como objetivo avaliar os efeitos da irradiância (70 e 150 μmol fótons.m-2.s-1) no número de ramificações, nas taxas de crescimento, nos parâmetros da fotossíntese e no conteúdo pigmentar de gametófitos e tetrasporófitos procedentes de três localidades distintas da costa brasileira: estados do Ceará (CE), Bahia (BA) e São Paulo (SP). Além disto, uma variante de coloração marrom-esverdeada foi caracterizada. Exemplares cultivados em 150 μmol de fótons. m-2.s-1 apresentaram maiores taxas de crescimento, quando comparados aos cultivados em 70 μmol de fótons. m-2.s-1, independentemente da coloração e procedência da espécie. A fertilidade afetou de forma negativa as taxas de crescimento de tetrasporófitos de coloração vermelha e marrom-esverdeada, porém não afetou o desempenho fotossintetizante desses tetrasporófitos. Em 150 μmol de fótons. m-2.s-1, tetrasporófitos não-férteis de coloração vermelha apresentaram maiores taxas de crescimento, quando comparados aos não-férteis de coloração marrom-esverdeada, independentemente da irradiância; porém, esses últimos apresentaram maior conteúdo de ficocianina e aloficocianina. Quando gametófitos foram cultivados em 70 μmol de fótons. m-2.s-1 por 14 dias, não foi possível distinguir diferenças significativas quanto às taxas de crescimento entre as três populações, entretanto, quando o cultivo se estendeu por 28 dias, CE e SP mantiveram as taxas de crescimento semelhantes, porém, essas foram superiores às observadas para BA. Em 150 μmol de fótons. m-2.s-1, durante o cultivo por 14 dias, gametófitos do CE e SP mantiveram as taxas de crescimento semelhantes, e essas foram superiores às observadas para BA, enquanto que durante o cultivo por 28 dias, além de observarmos menores taxas para gametófitos da BA, os do CE apresentaram taxas superiores aos de SP. Tetrasporófitos do CE, BA e SP, cultivados em 70 μmol de fótons. m-2.s-1 por 28 dias, apresentaram taxas de crescimento semelhantes, porém, quando cultivados em 150 μmol de fótons. m-2.s-1, os do CE apresentaram maiores taxas, quando comparados aos da BA e SP, que apresentaram valores semelhantes. Quando gametófitos foram cultivados em 70 μmol de fótons. m-2.s-1 por 28 dias, CE e BA apresentaram maiores valores de FMax, α e Re do que SP, o que é esperado para algas procedentes de regiões mais próximas do equador, pois estariam mais adaptadas a altas irradiâncias do que as que ocorrem em altas latitudes; o mesmo foi observado para gametófitos e tetrasporófitos, cultivados em 150 μmol de fótons.m-2.s-1 por 28 dias. Gametófitos do CE e BA apresentaram maiores valores de Ik (técnica de fluorescência), αETR e FMax do que SP, quando cultivados em 150 μmol de fótons. m-2.s-1 por 14 dias. Nessa mesma irradiância e período, tetrasporófitos do CE e BA apresentaram maiores valores de α do que SP. Gametófitos de SP cultivados em 70 μmol de fótons. m-2.s-1 apresentaram maiores conteúdos de FE, FC, AFC e CL do que os cultivados em 150 μmol.de fótons. m-2.s-1. Nos demais gametófitos (BA e CE) esses valores foram semelhantes nas duas irradiâncias. Essas respostas podem indicar que gametófitos do CE e BA estejam mais adaptados para lidarem com altas irradiâncias do que os de SP. Gametófitos de SP apresentaram maiores concentrações de FE e FC, quando comparados aos tetrasporófitos de SP, independentemente da irradiância. Resultados semelhantes foram observados para os do CE, mas apenas quando cultivados em 70 μmol de fótons. m-2.s-1. Gametófitos do CE, cultivados em 150 μmol de fótons. m-2.s-1, apresentaram menores concentrações de FE e FC que os tetrasporófitos. Gametófitos e tetrasporófitos da BA mostraram valores de concentrações pigmentares semelhantes, independentemente da irradiância. Em síntese, a análise geral dos resultados sugere a ocorrência de ecótipos de G. caudata ao longo da costa brasileira e ressalta a diversidade da espécie quanto às respostas fisiológicas, considerando-se também que essas foram distintas entre tetrasporófitos e gametófitos de uma mesma população. Além disso, a ocorrência de uma variante de cor na natureza com características distintas do tipo mais comum confere à espécie maior capacidade de adaptação frente a diferentes fatores abióticos. Tetrasporophytes from CE, BA and SP, grown in 70 μmol de fótons. m-2.s-1 for 28 days, showed similar growth rates, however, when grown in 150 μmol de fótons. m-2.s-1, CE showed higher rates when compared to the BA and SP, which were very similar / Gracilaria caudate J. Agardh a wide geographic distribution, as well as being a major agarophyte collected in northeastern Brazil. This study aimed to evaluate the effects of irradiance (70 and 150 μmol photons. m-2.s-1) in number of branches, the growth rates, in photosynthesis parameters and pigment content of gametophytes and tetrasporophytes from three different locations of the Brazilian coast: Ceará State (CE), Bahia State (BA) and São Paulo State (SP). In addition, a variant of brown-green color was characterized. Specimens grown in 150 μmol photons. m-2.s-1 showed higher growth rates compared to those grown in 70 μmol photons. m-2.s-1, regardless of color and origin of the species. The fertility negatively affects growth rates of tetrasporophytes red and greenish-brown color, but did not affect the photosynthetic performance of these tetrasporophytes. In 150 μmol photons. m-2.s-1, non-fertile tetrasporophytes of red color had higher growth rates compared to non-fertile brown-green color, regardless of the irradiance; but the latter had higher content of phycocyanin and allophycocyanin. When gametophytes were grown in 70 μmol photons. m-2.s-1 for 14 days, it was not possible to distinguish significant differences in growth rates among the three populations, however, when the cultivation was extended for 28 days, CE and SP maintained similar growth rates, however, these were higher than those observed for BA. In 150 μmol photons. m-2.s-1 for the cultivation for 14 days, the CE and SP gametophytes remained similar growth rates and were superior to those observed for BA, whereas during the cultivation for 28 days, gametophytes of BA showed lower rates, the CE had higher rates than the SP. When gametophytes were grown in 70 μmol photons. m-2.s-1 for 28 days, CE and BA had higher Fmax, α and Re values than SP, which is expected to algae coming from regions closer to the equator, because they would be more adapted to high irradiances than that occur at high latitudes; the same was observed for gametophytes and tetrasporophytes grown in 150 μmol photons. m-2.s-1 for 28 days. Gametophytes from CE and BA showed higher values of Ik (fluorescence technique), αETR and Fmax than SP, when cultivated in 150 μmol photons. m-2.s-1 for 14 days. That same irradiance and period, the CE and BA tetrasporophytes had higher α values than SP. Gametophytes From SP grown in 70 μmol photons. m-2.s-1 had higher FE, FC, AFC and CL content than those grown in 150 μmol photons. m-2.s-1. In other gametophytes (BA and CE) these values were similar in both irradiance. These responses may indicate that gametophytes from CE and BA are further adapted to deal with high irradiances than SP. Gametophytes from SP showed higher concentrations of FE and FC when compared to tetrasporophytes from SP regardless of irradiance. Similar results were observed for the CE, only when grown at 70 μmol photons. m-2.s-1. Gametophytes from CE grown in 150 μmol photons. m-2.s-1, showed lower concentrations of FE and FC that tetrasporophytes. Gametophytes and tetrasporophytes BA showed similar pigment concentration values, regardless of irradiance. In summary, the overall analysis of the results suggests the occurrence of ecotypes for G. caudate along the Brazilian coast and emphasizes the diversity of species and the physiological responses, considering also that these were distinct from tetrasporophytes and gametophytes of the same population. Furthermore, the occurrence of a color variant in nature with different characteristics gives the most common type of species greater capacity against different abiotic adapt. Tetrasporophytes from CE, BA and SP, grown in 70 μmol photons. m-2.s-1 for 28 days, showed similar growth rates, however, when grown in 150 μmol photons. m-2.s-1, CE showed higher rates when compared to the BA and SP, which were very similar
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Diversidade intraespecífica em Gracilaria domingensis (Gracilariales, Rhodophyta): estudos fisiológicos na interpretação do polimorfismo de cor / Instraspecific diversity in Gracilaria domingensis (Gracilariales, Rhodophyta): physiological studies on the interpretation of the color polymorphysmFerreira, Luciana Bastos 04 December 2008 (has links)
O presente trabalho analisou as fases gametofítica e tetrasporofítica de morfos verde, vermelho e marrons de Gracilaria domingensis em laboratório. A capacidade reprodutiva foi testada considerando-se: i, número de cistocarpos diferenciados; ii, número de carpósporos e tetrásporos liberados; iii, diâmetro desses esporos; e iv, sobrevivência de carpósporos e tetrásporos, esse último em diferentes condições de irradiância, nutrientes, e radiação ultravioleta. A capacidade somática foi testada em diferentes fases do desenvolvimento por meio da análise dos seguintes parâmetros: i, taxas de crescimento em diferentes condições nutricionais; ii, taxas de crescimento em diferentes condições de radiação ultra-violeta; iii, atividade da enzima nitrato redutase em diferentes condições nutricionais; iv, taxas de fotossíntese; e v, síntese de aminoácidos semelhantes a micosporinas (MAAs) em diferentes condições de radiação UV-B. Uma das únicas diferenças observadas na capacidade reprodutiva entre as linhagens foi o maior período de liberação de carpósporos derivados dos cruzamentos envolvendo apenas gametófitos vermelhos. Essa característica disponibilizaria uma maior quantidade de propágulos dessa linhagem, trazendo vantagens competitivas em relação às demais no ambiente natural. Plantas verdes mostraram maiores valores de fotossíntese máxima, maior síntese de MAAs quando expostas à radiação UV-B, e maior teor de proteínas solúveis totais quando comparadas às plantas vermelhas. Essas respostas sugerem adaptações a ambientes oligotróficos e com intensa luminosidade. Foi observada heterose nas linhagens de tetrasporófitos marrons (VmVd ou VdVm) com relação a pelo menos um dos seguintes parâmetros: fotossíntese máxima e eficiência fotossintetizante; taxas de crescimento; conteúdo de proteínas solúveis totais; atividade da NR; e sobrevivência de carpósporos. Esse vigor híbrido, pelo menos quanto a alguns aspectos, favoreceria a manutenção do alelo verde na natureza. As linhagens de tetrasporófitos marrons apresentaram desempenho distinto quando comparadas entre si com relação a sobrevivência de esporos e taxas de crescimento, indicando que os dois genótipos se expressam de forma diferente frente a condições abióticas distintas. O número de carpósporos liberados foi semelhante ao de tetrásporos considerando-se a massa fresca das plantas férteis, porém, a sobrevivência desses últimos foi sempre maior. O desempenho somático e reprodutivo de tetrasporófitos foi maior que o de gametófitos na maior parte das condições testadas, independentemente da linhagem. Esses resultados demonstraram que as diferentes fases do histórico de vida de G. domingensis têm características metabólicas distintas, o que confere às plantas uma maior plasticidade fenotípica. As diferenças detectadas entre as linhagens no presente trabalho foram discretas. Caso as vantagens proporcionadas pelo alelo verde fossem muito superiores às apresentadas pelo alelo vermelho, ou vice-versa, seria esperado que, ao longo do tempo, uma das duas formas excluísse a outra. A coexistência dos morfos, porém, indica que cada um deles deve ocupar um nicho ligeiramente distinto do outro, o que confere à espécie vantagens frente a ambientes heterogêneos e/ou mudanças ambientais, possibilitando uma maior capacidade de adaptação. / This work investigated gametophytic and tetrasporophytic phases of green, red and brown morphs of Gracilaria domingensis in laboratory. The reproductive performance was tested considering the following: i, number of cystocarps produced; ii, number of carpospores and tetraspores released; iii, diameter of these spores; and iv, survival of carpospores and tetraspores in different nutrient, irradiance and UV-B conditions. The somatic performance of different life phases was tested considering the following: i, growth rates on different nutritional conditions; ii, growth rates on different UV-B conditions; iii, nitrate reductase (NR) activity on different nutritional conditions; iv, photosynthetic rates; and v, mycosporine-like amino acids (MAAs) synthesis on different UV-B conditions. Carpospores originated by the cross of red males x red females were released by a longer period of time when compared to the other carpospores strains. This was almost the only difference found in the reproductive performance among different strains, and could make a greater number of the red strain propagules available for settling. This result could represent competitive advantages in the natural environment. Green plants showed greater values of maximum photosynthesis, a greater MAAs synthesis when exposed to UV-B radiation, and greater amounts of total soluble proteins when compared to the red plants. These responses suggest adaptations to high irradiances and oligotrophic environments. Heterosis was observed in one of the two brown tetrasporophyte strains considering, at least, one of the following parameters: maximum photosynthesis and photosynthetic efficiency; growth rates; total soluble proteins content; NR activity; and survival of carpospores. The heterosis related to these aspects could favor the maintenance of the green allele in nature. The two brown tetrasporophytic strains showed different performance considering the survival of spores and growth rates, which indicates that the two genotypes are expressed in different ways depending on the abiotic conditions. The number of spores released was the same for carpospores and tetraspores when expressed by the fresh biomass of the fertile plants. However, survival of tetraspores was always higher. The somatic and reproductive performance of tettrasporphytes were higher than the gametophytes ones for most of the conditions tested, regardless the strain. These results demonstrate that the different life phases of G. domingensis have specific metabolic characteristics, which contributes to a higher phenotypic plasticity of this species. The differences found among the strains were slight. If the green allele promoted very superior advantages when compared to the ones promoted by the red allele, or vice-versa, it would be expected that, within time, one of the two morphs would exclude the other. The coexistence of the morphs, however, indicates that each one of them must occupy a slightly different niche, which provides advantages to the species concerning heterogonous environments, and /or environmental changes, and enable it with a greater adaptative capacity.
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Diversidade funcional em uma floresta de restinga / Functional diversity in a restinga forestVendrami, Juliana Lopes 07 July 2014 (has links)
Entender os processos responsáveis pela origem e manutenção da diversidade de espécies nas comunidades representa uma questão central em ecologia. Dos inúmeros processos aventados para explicar a diversidade de organismos, podemos destacar o filtro ambiental e a limitação de similaridade. O filtro ambiental atua restringindo a variação e a distribuição dos organismos em determinado ambiente, enquanto que a limitação de similaridade atua pressionando a diferenciação das características dos organismos, uma vez que a coexistência entre os indivíduos depende da divergência na utilização dos recursos. A abordagem funcional tem sido utilizada para testar os processos responsáveis pela coexistência de espécies e consiste na comparação da similaridade funcional entre as espécies de uma comunidade através da quantificação dos seus atributos. A combinação de diferentes atributos em um organismo define a sua estratégia ecológica e, consequentemente, a sua distribuição nos habitats. As florestas de restingas são ambientes propícios para testar as hipóteses de coexistência das espécies nas comunidades, por apresentarem gradientes ambientes bem marcados e que definem a disponibilidade de recursos. Nesse sentido, este trabalho teve como objetivo avaliar: i) o efeito da condição edáfica (seco e alagado) sobre os atributos funcionais e as estratégias ecológicas de espécies arbóreas de restinga alta e; ii) o efeito que os atributos funcionais e as estratégias ecológicas têm sobre a preferência de habitat pelas plantas. Realizamos este trabalho em uma área de restinga alta na Ilha do Cardoso (SP) que compreende dois tipos de solo: seco e alagado. Coletamos cinco atributos funcionais (área foliar, área foliar específica, espessura foliar, conteúdo de matéria seca foliar e densidade da madeira) de 44 espécies arbóreas. Selecionamos 30 indivíduos de cada espécie sendo 15 em cada tipo de solo. Utilizamos seleção de modelos para as análises estatísticas, sendo usados modelos lineares mistos e modelos lineares simples para avaliar o efeito do solo nos valores médios e na variação dos atributos e das estratégias ecológicas, respectivamente. Encontramos efeito do solo sobre os coeficientes de variação (CV) do conteúdo de matéria seca foliar (CMSF) e da área foliar específica (AFE), sendo maiores no solo alagado. No caso do CV da AFE, o efeito só foi significativo quando excluímos as palmeiras das análises. Não encontramos efeito do solo sobre a variação dos demais atributos funcionais, das estratégias ecológicas e tampouco do tipo de estratégia ecológica. Os resultados encontrados apontam que no ambiente alagado, a limitação de similaridade seja o processo preponderante na estruturação dessa comunidade. Tal resultado difere dos reportados por outros estudos em florestas tropicais. Não encontramos efeito dos atributos e das estratégias ecológicas sobre a preferência de habitat das espécies, com exceção do CV de CMSF e de AFE. Novamente, no caso do CV de AFE, o efeito só foi significativo quando excluímos Euterpe edulis (palmito-juçara) das análises. Este resultado reforça a importância da plasticidade fenotípica para definir a ocorrência das espécies em diferentes habitats / Understanding the processes underlying the origin and maintenance of species diversity in communities is a central goal in ecology. Among the numerous processes proposed to explain the organisms\' diversity, we can highlight environmental filter and limiting similarity. Environmental filter operates by restricting the variation and distribution of organisms in a given environment, while the process of limiting similarity acts by pressing differentiation in the organisms\' characteristics, because the coexistence of individuals depends on difference in resource utilization. The functional approach has been used to test the processes responsible for species coexistence and consists in the comparison of species functional similarities in a community through their traits. The combination of different traits in an organism defines its ecological strategy and, therefore, their distribution on habitats. Restinga forests are suitable to test species coexistence hypotheses in communities, because it presents a well marked environmental gradient, which is defined by resource availability. Thus, this study aimed to evaluate: i) the effect of soil condition (drained and flooded) on functional traits and on ecological strategies of restinga trees species and, ii) the effect of functional traits on plant´s habitat preference. We conducted this study in an area of high restinga at Cardoso Island (SP), which comprises two soil types: drained and flooded. We collected five functional traits (leaf area, specific leaf area, leaf thickness, leaf dry matter content and wood density) of 44 tree species. We selected 30 individuals of each species, 15 in each soil type. We used model selection for statistical analyses, being linear models to assess soil type effect on trait and ecological strategies variances and linear mixed models to assess ecological strategies mean values. We found soil effect on the coefficients of variation of leaf dry matter content (LDMC) and of specific leaf area (SLA), which was higher in the flooded soil. In the case of SLA coefficient of variance, the effect was only significant when we excluded the palms from analyses. We found no soil effect on the other functional traits and on ecological strategies variation, neither on ecological strategy type. As for the results, it was found that in the flooded soil, limiting similarity is the dominant process structuring this community. This result differs from those reported by other tropical forests researches. We found no effect of traits and ecological strategies on habitat species preference, with the exception of LDMC and SLA coefficients of variations. Again, for SLA coefficient of variation, the effect was only significant when we exclude Euterpe edulis (juçara palm) from analyses. This result reinforces the importance of phenotypic plasticity to define species occurrence in different habitats
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