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Desenvolvimento e implantação de sistema para a gestão da informação e vigilância de anomalias congênitas no Brasil / Development and implementation of a system for information management and surveillance of congenital anomalies in BrazilVieira, Ananda Amorim 13 February 2017 (has links)
Anomalia congênita (AC) é causada por alterações morfológicas e/ou funcionais ocasionada no desenvolvimento embrionário ou fetal devido a fatores genéticos, ambientais, multifatoriais ou desconhecidos. A detecção pode ser no período pré-natal, no recém-nascido ou posteriormente. Estudos recentes indicam que de 2% a 3% de todos os nascidos vivos no mundo apresentam AC. Alguns autores afirmam que no Brasil elas constituem a segunda causa de mortalidade infantil, com 11,2%. Particularmente, o país conta com sistemas de bancos de dados em saúde com informações sobre anomalias congênitas. Dentre estes sistemas, temos três que se destacam: o Sistema de Informações Hospitalares do SUS (SIH), o Sistema de Informações sobre Nascidos Vivos (SINASC) e o Sistema de Informações sobre Mortalidade (SIM). Todos são obtidos através do site do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde (DATASUS). Todavia, esses sistemas, de maneira isolada, não fornecem uma visão clara tanto da epidemiologia das anomalias congênitas, quanto dos indivíduos com esse agravo, se ao terem nascidos foram tratados ou em decorrência dela faleceram. Diante deste cenário, neste projeto tem-se por objetivo principal apresentar o sistema de vigilância de AC utilizando estas bases públicas com intuito de monitorar as anomalias no Brasil, mapeando os nascimentos, internações e óbitos. Este sistema tornou-se o Portal de Monitoramento de AC (PMAC), com dados que abrangem o período de janeiro 2001 a dezembro 2011. Ele conta com ferramentas que correspondem aos módulos de auditoria automática, que verifica subnotificações e inconsistência, módulos de análises epidemiológicas contendo incidência, fluxo de migração e coeficientes de mortalidade (infantil, perinatal, neonatal e segundo causas por AC). Este estudo também traz a realização da técnica do relacionamento probabilístico com a integração dos sistemas SINASC, SIH e SIM, que formaram um banco contribuindo com informações de rastreabilidade dos registros com anomalias, além de apresentar os resultados satisfatórios dos testes caixa-preta junto com a aplicação da técnica de avaliação heurística, realizados por usuários para avaliar a usabilidade do portal. Por fim, ressalta-se que o portal é dinâmico, e a manipulação dos dados por meio do acesso dos usuários a análises de cunho epidemiológico, em diversas agregações, permite auxiliar a gestão das informações, promover reflexões em torno desta temática, incentivar mais estudos e pesquisas, bem como prover recursos e apoiar medidas sociais e políticas para assistir os indivíduos acometidos por AC, suas famílias e a comunidade / Congenital anomaly (AC) is caused by morphological and / or functional alterations originated during embryonic or fetal development due to genetic, environmental, multifactorial or unknown factors. Detection may happen in the prenatal period, in the newborn or later. Recent studies indicate that AC is present in about 2% to 3% of all live births worldwide. Some authors affirm that in Brazil they are the second cause of infant mortality, with around 11.2%. In particular, Brazil has health databases systems with information about congenital anomalies. Among these systems we have three that stand out: the Hospital Information System of SUS (SIH), the Live Birth Information System (SINASC) and Mortality Information System (SIM). All of which can be obtained through the Informatics of public Health System Department\'s website (DATASUS). However, these systems in isolation do not provide a clear view both of the epidemiology of congenital anomalies as well as the individuals with this birth defect be treated or it result of their death. In this scenario, the main objective of this project is to present an AC surveillance system that uses these public databases to monitor the anomalies in Brazil by mapping births, hospitalizations and deaths. This system became the Portal of Monitoring of AC (PMAC), with data that cover the period from January 2001 to December 2011, with tools that correspond to the modules of automatic audit that verifies under notifications and inconsistency, modules of epidemiological analyzes containing incidence, migration flow and mortality coefficients (infant, perinatal, neonatal and second AC causes). This study also used the probabilistic linkage technique with an integration of the SINASC, SIH and SIM systems to build a database contributing with traceable information for the records with anomalies. In addition is presented satisfactory results for black box tests along with the portal usability evaluation performed with users through heuristic evaluation technique. Finally, it should be noted that the portal is dynamic offering options like user access to data manipulation through epidemiological analyzes in diverse aggregations. It helps to manage information, promote reflections around this theme, encourage further studies and research, as well as provide resources and support social and political measures to assist individuals affected by AC, their families and the community
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Desenvolvimento e implantação de sistema para a gestão da informação e vigilância de anomalias congênitas no Brasil / Development and implementation of a system for information management and surveillance of congenital anomalies in BrazilAnanda Amorim Vieira 13 February 2017 (has links)
Anomalia congênita (AC) é causada por alterações morfológicas e/ou funcionais ocasionada no desenvolvimento embrionário ou fetal devido a fatores genéticos, ambientais, multifatoriais ou desconhecidos. A detecção pode ser no período pré-natal, no recém-nascido ou posteriormente. Estudos recentes indicam que de 2% a 3% de todos os nascidos vivos no mundo apresentam AC. Alguns autores afirmam que no Brasil elas constituem a segunda causa de mortalidade infantil, com 11,2%. Particularmente, o país conta com sistemas de bancos de dados em saúde com informações sobre anomalias congênitas. Dentre estes sistemas, temos três que se destacam: o Sistema de Informações Hospitalares do SUS (SIH), o Sistema de Informações sobre Nascidos Vivos (SINASC) e o Sistema de Informações sobre Mortalidade (SIM). Todos são obtidos através do site do Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde (DATASUS). Todavia, esses sistemas, de maneira isolada, não fornecem uma visão clara tanto da epidemiologia das anomalias congênitas, quanto dos indivíduos com esse agravo, se ao terem nascidos foram tratados ou em decorrência dela faleceram. Diante deste cenário, neste projeto tem-se por objetivo principal apresentar o sistema de vigilância de AC utilizando estas bases públicas com intuito de monitorar as anomalias no Brasil, mapeando os nascimentos, internações e óbitos. Este sistema tornou-se o Portal de Monitoramento de AC (PMAC), com dados que abrangem o período de janeiro 2001 a dezembro 2011. Ele conta com ferramentas que correspondem aos módulos de auditoria automática, que verifica subnotificações e inconsistência, módulos de análises epidemiológicas contendo incidência, fluxo de migração e coeficientes de mortalidade (infantil, perinatal, neonatal e segundo causas por AC). Este estudo também traz a realização da técnica do relacionamento probabilístico com a integração dos sistemas SINASC, SIH e SIM, que formaram um banco contribuindo com informações de rastreabilidade dos registros com anomalias, além de apresentar os resultados satisfatórios dos testes caixa-preta junto com a aplicação da técnica de avaliação heurística, realizados por usuários para avaliar a usabilidade do portal. Por fim, ressalta-se que o portal é dinâmico, e a manipulação dos dados por meio do acesso dos usuários a análises de cunho epidemiológico, em diversas agregações, permite auxiliar a gestão das informações, promover reflexões em torno desta temática, incentivar mais estudos e pesquisas, bem como prover recursos e apoiar medidas sociais e políticas para assistir os indivíduos acometidos por AC, suas famílias e a comunidade / Congenital anomaly (AC) is caused by morphological and / or functional alterations originated during embryonic or fetal development due to genetic, environmental, multifactorial or unknown factors. Detection may happen in the prenatal period, in the newborn or later. Recent studies indicate that AC is present in about 2% to 3% of all live births worldwide. Some authors affirm that in Brazil they are the second cause of infant mortality, with around 11.2%. In particular, Brazil has health databases systems with information about congenital anomalies. Among these systems we have three that stand out: the Hospital Information System of SUS (SIH), the Live Birth Information System (SINASC) and Mortality Information System (SIM). All of which can be obtained through the Informatics of public Health System Department\'s website (DATASUS). However, these systems in isolation do not provide a clear view both of the epidemiology of congenital anomalies as well as the individuals with this birth defect be treated or it result of their death. In this scenario, the main objective of this project is to present an AC surveillance system that uses these public databases to monitor the anomalies in Brazil by mapping births, hospitalizations and deaths. This system became the Portal of Monitoring of AC (PMAC), with data that cover the period from January 2001 to December 2011, with tools that correspond to the modules of automatic audit that verifies under notifications and inconsistency, modules of epidemiological analyzes containing incidence, migration flow and mortality coefficients (infant, perinatal, neonatal and second AC causes). This study also used the probabilistic linkage technique with an integration of the SINASC, SIH and SIM systems to build a database contributing with traceable information for the records with anomalies. In addition is presented satisfactory results for black box tests along with the portal usability evaluation performed with users through heuristic evaluation technique. Finally, it should be noted that the portal is dynamic offering options like user access to data manipulation through epidemiological analyzes in diverse aggregations. It helps to manage information, promote reflections around this theme, encourage further studies and research, as well as provide resources and support social and political measures to assist individuals affected by AC, their families and the community
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Uso da técnica de linkage nos sistemas de informação em saúde: aplicação na base de dados do Registro de Câncer de base populacional do município de São Paulo / The use of the linkage technique in health information systems: application in the database of the São Paulo Population-based Cancer RegistryPeres, Stela Verzinhasse 07 December 2011 (has links)
A disponibilidade de grandes bases de dados informatizadas em saúde tornou a técnica de relacionamento de fontes de dados, também conhecida como linkage, uma alternativa para diferentes tipos de estudos. Esta técnica proporciona a geração de uma base de dados mais completa e de baixo custo operacional. Objetivo- Investigar a possibilidade de completar/aperfeiçoar as informações da base de dados do RCBP-SP, no período de 1997 a 2005, utilizando o processo de linkage com três outras bases, a saber: Programa de Aprimoramento de Mortalidade (PRO-AIM), Autorização e Procedimentos de Alta Complexidade (APAC-SIA/SUS) e Fundação Sistema Estadual de Análise de Dados (FSeade). Métodos- Neste estudo foi utilizada a base de dados do RCBP-SP, composta por 343.306 com casos incidentes de câncer do município de São Paulo, registrados no período de 1997 a 2005, com idades que variaram de menos de um a 106 anos, de ambos os sexos. Para a completitude das informações do RCBP-SP foram utilizadas as bases de dados, a saber: PRO-AIM, APAC-SIA/SUS e FSeade. Foram utilizadas as técnicas de linkage probabilística e determinística. O linkage probabilístico foi realizado pelo programa Reclink III versão 3.1.6. Quanto ao linkage determinístico as rotinas foram realizadas em Visual Basic, com as bases hospedadas em SQL Server. Foram calculados os coeficientes brutos de incidência (CBI) e mortalidade (CBM) antes e após o linkage. A análise de sobrevida global foi realizada pela técnica de Kaplan-Meier e para na comparação entre as curvas, utilizou-se o teste de log rank. Foram calculados os valores da área sob a curva, sensibilidade e especificidade para determinar o ponto de corte do escore de maior precisão na identificação dos pares verdadeiros. Resultados- Após o linkage, verificou-se um ganho de 101,5 por cento para a variável endereço e 31,5 por cento para a data do óbito e 80,0 por cento para a data da última informação. Quanto à variável nome da mãe, na base de dados do RCBP-SP antes do linkage esta informação representava somente 0,5 por cento , tendo sido complementada, no geral, em 76.332 registros. A análise de sobrevida global mostrou que antes do processo de linkage havia uma subestimação na probabilidade de estar vivo em todos os períodos analisados. No geral, para a análise de sobrevida truncada em sete anos, a probabilidade de estar vivo no primeiro ano de seguimento antes do linkage foi menor quando comparada a probabilidade de estar vivo ao primeiro ano de seguimento após o linkage (48,8 por cento x 61,1 por cento ; p< 0,001). Conclusão- A técnica de linkage tanto probabilística quanto determinística foi efetiva para completar/aperfeiçoar as informações da base de dados do RCBP-SP. Além do mais, o CBI apresentou um ganho de 3,4 por cento . Quanto ao CBM houve um ganho de 25,8 por cento . Após o uso da técnica de linkage, foi verificado que os valores para a sobrevida global estavam subestimados para ambos os sexos, faixas etárias e para as topografias de câncer / The availability of large computerized databases on health has enabled the record linkage technique, an alternative for different study designs. This technique provides the generation of a more complete database, at low operational cost. Objective to investigate the possibility of completing/improving information from the database of the RCBP-SP, in the period between 1997 and 2005, using the record linkage technique with other three databases, namely: Mortality Improvement Program (PRO-AIM), Authorization of Highly Complex Procedures (APAC-SIA/SUS) and State System of Data Analysis (FSeade), comparing different strategies. Methods In this study we used the database of the RCBP-SP composed of 343,306 incident cancer cases in the Municipality of São Paulo registered in the period between 1997 and 2005 with ages raging from under one to 106 years, from both sexes. To complete the database of the RCBP-SP three databases were used, namely: PRO-AIM, APAC-SIA/SUS and FSeade. Both probabilistic and deterministic record linkage were used. Probabilistic linkage was performed using the Reclink III software, version 3.1.6. As for the the deterministic record linkage, the routines were run in the Visual Basic and databases hosted on a SQL Server. Before and after record linkage, crude incidence (CIR) and mortality rates (CMR) were calculated. The overall survival analysis was performed using the Kaplan-Meier technique and for the comparison between curves, the log rank test was employed. In order to determine the most precise cut-off scores in identifying true matches, we calculated the area under the curve, as well as, sensitivity and specificity. Results After record linkage, it was verified a gain of 101.5 per cent for the variable address, 31.5 per cent for death date and 80,0 per cent for the date of latest information. As for the variable mother´s name, in the database of the RCBP-SP before record linkage, this information represented only 0.5 per cent , having been completed, in general, in 76,332 registries. The overall survival analysis showed that before the record linkage there was an underestimation of the probability of being alive for all periods assessed. In general, for the truncated survival at seven years, the probability of being alive at the first year of follow up before record linkage was lower when compared to the probability of being alive at the first year of follow up after record linkage (48.8 per cent x 61.1 per cent ; p< 0.001). Conclusion Both the probabilistic and deterministic record linkage were effective to complete/improve information from the database of the RCBP-SP. Moreover, the CIR had a gain of de 3.4 per cent . As for the CMR, there was a gain of 25.8 per cent . After using the record linkage technique, it was verified that values for overall survival were underestimated for both sexes, all age groups, and cancer sites
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A epidemiologia do câncer em crianças e adolescentes com Aids no Município de São Paulo: um estudo de base populacional / The cancer epidemiology in children and adolescents with AIDS in the Municipality of São Paulo: a population-based studyTanaka, Luana Fiengo 21 March 2017 (has links)
Introdução: A associação entre a infecção pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV) e o câncer tem sido documentada desde os primórdios da epidemia da síndrome da imunodeficiência adquirida (Aids). A introdução da highly active antirretroviral therapy (HAART) alterou, profundamente, o curso da epidemia da Aids, reduzindo, drasticamente, a incidência de manifestações definidoras da síndrome, incluindo cânceres. No entanto, existem informações limitadas sobre a incidência de câncer em crianças e adolescentes com Aids vivendo em países em desenvolvimento. Objetivo: Descrever a epidemiologia do câncer em crianças e adolescentes com Aids no Município de São Paulo, no período de 1997 a 2012. Métodos: Trata-se de um estudo de base populacional, utilizando as bases de dados do Registro de Câncer de Base Populacional do Município de São Paulo e do Sistema de Informações de Agravos de Notificação (SINAN). As crianças e adolescentes (< 20 anos) com Aids e câncer foram identificadas por meio de um processo de linkage probabilístico entre as bases de dados supracitadas. Foram calculadas as taxas de incidência brutas e ajustadas por milhão de habitantes. Para comparar a incidência de câncer na população com Aids e a população geral foi calculada a razão de incidência padronizada (RIP) e respectivos intervalos de confiança de 95 por cento (IC 95 por cento ). A análise de tendência foi feita por meio do cálculo do annual percent change (APC) e IC 95 por cento correspondentes. A análise da sobrevida global de cinco anos após o câncer entre pacientes com Aids e na população geral foi calculada por meio do estimador produto limite de Kaplan-Meier e modelos univariados de riscos proporcionais de Cox. Mapas coropléticos em escalas monocromáticas foram gerados para descrever a distribuição de casos no Município. Resultados: Foram identificados 24 casos de câncer em pacientes com Aids menores de 20 anos, sendo 62,5 por cento cânceres definidores de Aids. Os cânceres mais incidentes foram o linfoma não Hodgkin, incluindo o linfoma de Burkitt (12; 50,0 por cento ), o linfoma de Hodgkin (6; 25,0 por cento ) e o sarcoma de Kaposi (3; 12,5 por cento ). A taxa bruta de incidência foi de 1.461,3 casos/milhão. A análise de tendência revelou redução significativa da incidência para todos os cânceres (APC= -14,5), influenciada pela queda nos cânceres definidores de Aids (APC= -17,0). O risco para câncer se mostrou aumentado (RIP= 3,9), sobretudo para o linfoma não Hodgkin, excluindo linfoma de Burkitt (RIP= 22,5), linfoma de Burkitt (RIP= 29,7) e linfoma de Hodgkin (RIP= 18,7). A probabilidade acumulada de sobrevida aos cinco anos foi de 56,3 por cento em crianças e adolescentes com Aids versus 87,5 por cento na população geral. A hazard ratio para óbito foi 5,2 (IC 95 por cento = 2,0; 13,6). O mapa da distribuição geográfica mostrou concentração dos casos nas áreas de classes sociais mais baixas do Município. Conclusão: Houve redução acentuada da incidência de cânceres definidores de Aids, como provável resultado da introdução da HAART. No entanto, crianças e adolescentes com Aids permanecem sob risco aumentado para o desenvolvimento de câncer quando comparadas à população geral. Para aquelas que desenvolveram câncer, o risco para óbito também se mostrou substancialmente elevado / Introduction: The association between human immunodeficiency virus (HIV) infection and cancer has been documented since the beginning of the epidemic of the acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). The introduction of the highly active antiretroviral therapy (HAART) has profoundly altered the course of the AIDS epidemic, drastically reducing the incidence of AIDS-defining manifestations, including cancers. Nevertheless, there is limited information on the incidence of cancer in children and adolescents with AIDS living in developing countries. Objective: To describe the cancer epidemiology in children and adolescents with AIDS in the Municipality of São Paulo from 1997 to 2012. Methods: It is a population-based study, using the databases of the Population-based Cancer Registry of São Paulo and the Notifiable Diseases Information System (SINAN). Children and adolescents (< 20 years) with AIDS and cancer have been identified by means of a probabilistic record linkage process between the aforementioned databases. Crude and age-standardized incidence rates per million inhabitants were calculated. To compare the incidence of cancer in people with AIDS and that of the general population, standardized incidence ratio (SIR) and respective 95 per cent confidence intervals (95 per cent CI) were calculated. We examined trends by calculating the annual percent change (APC) and corresponding 95 per cent CI. The analyses of the overall five-year survival after cancer diagnosis among children and adolescents with AIDS and that of the general population were based on the Kaplan-Meier product limit estimator and univariate Cox proportional hazards models. Choropleth maps on monochromatic scales were generated to describe the distribution of cases across the Municipality. Results: We identified 24 cases of cancer in patients with AIDS aged 20 years and younger, of which, 62.5 per cent were AIDS-defining malignancies. The most incident cancers were non-Hodgkin\'s lymphoma, including Burkitt\'s lymphoma (12; 50.0 per cent ), Hodgkin\'s lymphoma (6; 25.0 per cent ) and Kaposi sarcoma (3; 12.5 per cent ). The age-standardized incidence rate was 1,461.3 cases/million. The trend analyses revealed a significant reduction in the incidence of all cancers (APC= -14.5), driven by the decrease in AIDS-defining cancers (APC= -17.0). The overall risk for cancer was significantly increased (SIR= 3.9), especially for non-Hodgkin lymphoma, excluding Burkitts lymphoma (SIR= 22.5), Burkitt\'s lymphoma (SIR= 29.7) and Hodgkin\'s lymphoma (SIR= 18.7). The overall probability of survival at five years after cancer was 56.3 per cent in children and adolescents with AIDS versus 87.5 per cent in the general population. The hazard ratio for death was 5.2 (95 per cent CI= 2.0, 13.6). The map of the geographical distribution showed a concentration of cases in the low-income areas of the Municipality. Conclusion: There was a marked reduction in the incidence of AIDS-defining cancers, likely to be a result of the introduction of HAART. However, children and adolescents with AIDS remain at increased risk for the development of cancer when compared to the general population. For those who developed cancer, the risk of death was also significantly higher
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Uso da técnica de linkage nos sistemas de informação em saúde: aplicação na base de dados do Registro de Câncer de base populacional do município de São Paulo / The use of the linkage technique in health information systems: application in the database of the São Paulo Population-based Cancer RegistryStela Verzinhasse Peres 07 December 2011 (has links)
A disponibilidade de grandes bases de dados informatizadas em saúde tornou a técnica de relacionamento de fontes de dados, também conhecida como linkage, uma alternativa para diferentes tipos de estudos. Esta técnica proporciona a geração de uma base de dados mais completa e de baixo custo operacional. Objetivo- Investigar a possibilidade de completar/aperfeiçoar as informações da base de dados do RCBP-SP, no período de 1997 a 2005, utilizando o processo de linkage com três outras bases, a saber: Programa de Aprimoramento de Mortalidade (PRO-AIM), Autorização e Procedimentos de Alta Complexidade (APAC-SIA/SUS) e Fundação Sistema Estadual de Análise de Dados (FSeade). Métodos- Neste estudo foi utilizada a base de dados do RCBP-SP, composta por 343.306 com casos incidentes de câncer do município de São Paulo, registrados no período de 1997 a 2005, com idades que variaram de menos de um a 106 anos, de ambos os sexos. Para a completitude das informações do RCBP-SP foram utilizadas as bases de dados, a saber: PRO-AIM, APAC-SIA/SUS e FSeade. Foram utilizadas as técnicas de linkage probabilística e determinística. O linkage probabilístico foi realizado pelo programa Reclink III versão 3.1.6. Quanto ao linkage determinístico as rotinas foram realizadas em Visual Basic, com as bases hospedadas em SQL Server. Foram calculados os coeficientes brutos de incidência (CBI) e mortalidade (CBM) antes e após o linkage. A análise de sobrevida global foi realizada pela técnica de Kaplan-Meier e para na comparação entre as curvas, utilizou-se o teste de log rank. Foram calculados os valores da área sob a curva, sensibilidade e especificidade para determinar o ponto de corte do escore de maior precisão na identificação dos pares verdadeiros. Resultados- Após o linkage, verificou-se um ganho de 101,5 por cento para a variável endereço e 31,5 por cento para a data do óbito e 80,0 por cento para a data da última informação. Quanto à variável nome da mãe, na base de dados do RCBP-SP antes do linkage esta informação representava somente 0,5 por cento , tendo sido complementada, no geral, em 76.332 registros. A análise de sobrevida global mostrou que antes do processo de linkage havia uma subestimação na probabilidade de estar vivo em todos os períodos analisados. No geral, para a análise de sobrevida truncada em sete anos, a probabilidade de estar vivo no primeiro ano de seguimento antes do linkage foi menor quando comparada a probabilidade de estar vivo ao primeiro ano de seguimento após o linkage (48,8 por cento x 61,1 por cento ; p< 0,001). Conclusão- A técnica de linkage tanto probabilística quanto determinística foi efetiva para completar/aperfeiçoar as informações da base de dados do RCBP-SP. Além do mais, o CBI apresentou um ganho de 3,4 por cento . Quanto ao CBM houve um ganho de 25,8 por cento . Após o uso da técnica de linkage, foi verificado que os valores para a sobrevida global estavam subestimados para ambos os sexos, faixas etárias e para as topografias de câncer / The availability of large computerized databases on health has enabled the record linkage technique, an alternative for different study designs. This technique provides the generation of a more complete database, at low operational cost. Objective to investigate the possibility of completing/improving information from the database of the RCBP-SP, in the period between 1997 and 2005, using the record linkage technique with other three databases, namely: Mortality Improvement Program (PRO-AIM), Authorization of Highly Complex Procedures (APAC-SIA/SUS) and State System of Data Analysis (FSeade), comparing different strategies. Methods In this study we used the database of the RCBP-SP composed of 343,306 incident cancer cases in the Municipality of São Paulo registered in the period between 1997 and 2005 with ages raging from under one to 106 years, from both sexes. To complete the database of the RCBP-SP three databases were used, namely: PRO-AIM, APAC-SIA/SUS and FSeade. Both probabilistic and deterministic record linkage were used. Probabilistic linkage was performed using the Reclink III software, version 3.1.6. As for the the deterministic record linkage, the routines were run in the Visual Basic and databases hosted on a SQL Server. Before and after record linkage, crude incidence (CIR) and mortality rates (CMR) were calculated. The overall survival analysis was performed using the Kaplan-Meier technique and for the comparison between curves, the log rank test was employed. In order to determine the most precise cut-off scores in identifying true matches, we calculated the area under the curve, as well as, sensitivity and specificity. Results After record linkage, it was verified a gain of 101.5 per cent for the variable address, 31.5 per cent for death date and 80,0 per cent for the date of latest information. As for the variable mother´s name, in the database of the RCBP-SP before record linkage, this information represented only 0.5 per cent , having been completed, in general, in 76,332 registries. The overall survival analysis showed that before the record linkage there was an underestimation of the probability of being alive for all periods assessed. In general, for the truncated survival at seven years, the probability of being alive at the first year of follow up before record linkage was lower when compared to the probability of being alive at the first year of follow up after record linkage (48.8 per cent x 61.1 per cent ; p< 0.001). Conclusion Both the probabilistic and deterministic record linkage were effective to complete/improve information from the database of the RCBP-SP. Moreover, the CIR had a gain of de 3.4 per cent . As for the CMR, there was a gain of 25.8 per cent . After using the record linkage technique, it was verified that values for overall survival were underestimated for both sexes, all age groups, and cancer sites
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A epidemiologia do câncer em crianças e adolescentes com Aids no Município de São Paulo: um estudo de base populacional / The cancer epidemiology in children and adolescents with AIDS in the Municipality of São Paulo: a population-based studyLuana Fiengo Tanaka 21 March 2017 (has links)
Introdução: A associação entre a infecção pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV) e o câncer tem sido documentada desde os primórdios da epidemia da síndrome da imunodeficiência adquirida (Aids). A introdução da highly active antirretroviral therapy (HAART) alterou, profundamente, o curso da epidemia da Aids, reduzindo, drasticamente, a incidência de manifestações definidoras da síndrome, incluindo cânceres. No entanto, existem informações limitadas sobre a incidência de câncer em crianças e adolescentes com Aids vivendo em países em desenvolvimento. Objetivo: Descrever a epidemiologia do câncer em crianças e adolescentes com Aids no Município de São Paulo, no período de 1997 a 2012. Métodos: Trata-se de um estudo de base populacional, utilizando as bases de dados do Registro de Câncer de Base Populacional do Município de São Paulo e do Sistema de Informações de Agravos de Notificação (SINAN). As crianças e adolescentes (< 20 anos) com Aids e câncer foram identificadas por meio de um processo de linkage probabilístico entre as bases de dados supracitadas. Foram calculadas as taxas de incidência brutas e ajustadas por milhão de habitantes. Para comparar a incidência de câncer na população com Aids e a população geral foi calculada a razão de incidência padronizada (RIP) e respectivos intervalos de confiança de 95 por cento (IC 95 por cento ). A análise de tendência foi feita por meio do cálculo do annual percent change (APC) e IC 95 por cento correspondentes. A análise da sobrevida global de cinco anos após o câncer entre pacientes com Aids e na população geral foi calculada por meio do estimador produto limite de Kaplan-Meier e modelos univariados de riscos proporcionais de Cox. Mapas coropléticos em escalas monocromáticas foram gerados para descrever a distribuição de casos no Município. Resultados: Foram identificados 24 casos de câncer em pacientes com Aids menores de 20 anos, sendo 62,5 por cento cânceres definidores de Aids. Os cânceres mais incidentes foram o linfoma não Hodgkin, incluindo o linfoma de Burkitt (12; 50,0 por cento ), o linfoma de Hodgkin (6; 25,0 por cento ) e o sarcoma de Kaposi (3; 12,5 por cento ). A taxa bruta de incidência foi de 1.461,3 casos/milhão. A análise de tendência revelou redução significativa da incidência para todos os cânceres (APC= -14,5), influenciada pela queda nos cânceres definidores de Aids (APC= -17,0). O risco para câncer se mostrou aumentado (RIP= 3,9), sobretudo para o linfoma não Hodgkin, excluindo linfoma de Burkitt (RIP= 22,5), linfoma de Burkitt (RIP= 29,7) e linfoma de Hodgkin (RIP= 18,7). A probabilidade acumulada de sobrevida aos cinco anos foi de 56,3 por cento em crianças e adolescentes com Aids versus 87,5 por cento na população geral. A hazard ratio para óbito foi 5,2 (IC 95 por cento = 2,0; 13,6). O mapa da distribuição geográfica mostrou concentração dos casos nas áreas de classes sociais mais baixas do Município. Conclusão: Houve redução acentuada da incidência de cânceres definidores de Aids, como provável resultado da introdução da HAART. No entanto, crianças e adolescentes com Aids permanecem sob risco aumentado para o desenvolvimento de câncer quando comparadas à população geral. Para aquelas que desenvolveram câncer, o risco para óbito também se mostrou substancialmente elevado / Introduction: The association between human immunodeficiency virus (HIV) infection and cancer has been documented since the beginning of the epidemic of the acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). The introduction of the highly active antiretroviral therapy (HAART) has profoundly altered the course of the AIDS epidemic, drastically reducing the incidence of AIDS-defining manifestations, including cancers. Nevertheless, there is limited information on the incidence of cancer in children and adolescents with AIDS living in developing countries. Objective: To describe the cancer epidemiology in children and adolescents with AIDS in the Municipality of São Paulo from 1997 to 2012. Methods: It is a population-based study, using the databases of the Population-based Cancer Registry of São Paulo and the Notifiable Diseases Information System (SINAN). Children and adolescents (< 20 years) with AIDS and cancer have been identified by means of a probabilistic record linkage process between the aforementioned databases. Crude and age-standardized incidence rates per million inhabitants were calculated. To compare the incidence of cancer in people with AIDS and that of the general population, standardized incidence ratio (SIR) and respective 95 per cent confidence intervals (95 per cent CI) were calculated. We examined trends by calculating the annual percent change (APC) and corresponding 95 per cent CI. The analyses of the overall five-year survival after cancer diagnosis among children and adolescents with AIDS and that of the general population were based on the Kaplan-Meier product limit estimator and univariate Cox proportional hazards models. Choropleth maps on monochromatic scales were generated to describe the distribution of cases across the Municipality. Results: We identified 24 cases of cancer in patients with AIDS aged 20 years and younger, of which, 62.5 per cent were AIDS-defining malignancies. The most incident cancers were non-Hodgkin\'s lymphoma, including Burkitt\'s lymphoma (12; 50.0 per cent ), Hodgkin\'s lymphoma (6; 25.0 per cent ) and Kaposi sarcoma (3; 12.5 per cent ). The age-standardized incidence rate was 1,461.3 cases/million. The trend analyses revealed a significant reduction in the incidence of all cancers (APC= -14.5), driven by the decrease in AIDS-defining cancers (APC= -17.0). The overall risk for cancer was significantly increased (SIR= 3.9), especially for non-Hodgkin lymphoma, excluding Burkitts lymphoma (SIR= 22.5), Burkitt\'s lymphoma (SIR= 29.7) and Hodgkin\'s lymphoma (SIR= 18.7). The overall probability of survival at five years after cancer was 56.3 per cent in children and adolescents with AIDS versus 87.5 per cent in the general population. The hazard ratio for death was 5.2 (95 per cent CI= 2.0, 13.6). The map of the geographical distribution showed a concentration of cases in the low-income areas of the Municipality. Conclusion: There was a marked reduction in the incidence of AIDS-defining cancers, likely to be a result of the introduction of HAART. However, children and adolescents with AIDS remain at increased risk for the development of cancer when compared to the general population. For those who developed cancer, the risk of death was also significantly higher
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