Dissertation (Ph.D.)--Auburn University, 2005. / Vita. Includes bibliographic references (ℓ. 158-176)

Thesis (M. Phil.)--University of Hong Kong, 2006. / Title proper from title frame. Also available in printed format.

Dissertation (Ph.D.)--Auburn University, 2006. / Abstract. Vita. Includes bibliographic references.

Dissertation (Ph.D.)--Auburn University, 2006. / Abstract. Vita. Includes bibliographic references.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Aquicultura / Made available in DSpace on 2012-10-23T14:13:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 243426.pdf: 342754 bytes, checksum: a8fc4b8ede8769addc1aa4306fbee7ba (MD5) / Uma das formas de controle da amônia ocorre através das bactérias heterotróficas, estimuladas pela elevação da relação C/N com carboidratos. Um ensaio foi conduzido em nove unidades experimentais para testar o efeito de diferentes razões C/N sobre os parâmetros físico-químicos e microbiológicos na água de cultivo de juvenis de Litopenaeus vannamei. Melaço em pó foi adicionado na água junto com a ração, para que relação C/N fosse mantida em 10/1, 20/1 e 30/1. O melaço foi eficiente no controle da amônia, porém relações intermediárias acima de 10/1 devem ser empregadas. Quanto maior a fertilização com melaço, maior a quantidade de sólidos orgânicos na água. Estes aumentaram a demanda de oxigênio e diminuíram a luz disponível para os produtores primários, inibindo a fotossíntese. A conversão alimentar não foi afetada pelas maiores concentrações de sólidos e não houve diferença no crescimento e sobrevivência dos camarões. O tempo elevado de retenção dos sólidos teve maior influência sobre os microorganismos do que as diferentes fertilizações com melaço. Células com formato de vibriões aparecem provavelmente, degradando a biomassa bacteriana gerada no inicio do cultivo e os dias finais apresentam dominância de formas filamentosas. Estas aparecem, em grande quantidade, aderidas às brânquias dos camarões gerando mortalidade.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:32:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 331665.pdf: 2088502 bytes, checksum: e7f0cdc51ccc72417fd1f4dcd884500a (MD5) Previous issue date: 2014 / Os camarões possuem importância econômica, distribuídos por todo tropical e subtropical em todas as regiões do mundo. Por causa da pressão contínua sobre os estoques pesqueiros de camarões para consumo humano, a carcinicultura em muitos países se desenvolveu como uma importante ferramenta para suprir fonte de proteína de crustáceos. A espécie Litopenaeus vannamei ou camarão branco do Pacífico é uma espécie oriunda do pacífico que foi introduzida com maior sucesso nas fazendas de cultivo devido suportarem grande variação de salinidade. Possui intestino anterior e posterior de origem ectodérmica e intestino médio de origem endodérmica o que faz esta região uma região de secreção e absorção de nutrientes. No intestino médio dos peneídeos, assim como em insetos, ocorre a presença da membrana peritrófica, sendo que nos insetos lhe foi aferida uma função fisiológica importante: a circulação endo ectoperitrófica. Na presente tese, através do conhecimento da bioquímica da digestão de proteínas e pelo conhecimento do comportamento das enzimas ao longo do intestino médio do camarão, foi possível identificar o mesmo padrão de decréscimo de atividade ao logo deste, que foi desfeito, ao ser suplementado a dieta com proteínas (ovoalbumina nas concentrações de 60% e 80% m/m). Estas atividades enzimáticas foram observadas através de reação de digestão com substratos sintéticos (suc-AAPF-pNA, bz-R-pNA e L-pNA), substrato proteico (Azoalbumina) e zimograma em SDS-PAGE 12% contendo 0,1% de gelatina. Na tentativa de purificar e identificar algumas enzimas foi utilizado cromatografia de troca iônica em coluna do tipo Mono - Q. Em outros experimentos que corroboram a hipótese de circulação endo ectoperitrófica em camarões foi utilizado o processo de gavagem que através de filmagens foi possível visualizar o processo acontecendo, fundamentando assim a circulação endo ectoperitrófica em camarões.<br> / Abstract: Prawns and shrimps have economic importance, distributed throughout tropical and subtropical regions in the world. Because of continued pressure on fish stocks of shrimps for human consumption, shrimp farming in many countries has developed as an important tool to meet protein source crustaceans. The Litopenaeus vannamei species or Pacific white shrimp is a species from Pacific which was introduced more successfully in cultivation farms due withstand large variations in salinity. Shrimps have anterior and posterior intestine from ectodermal and endodermal origin, which it makes this region a region of secretion and absorption of nutrients. The midgut of penaeids, as in insects, the presence of the peritrophic membrane occurs, and it was measured in insects an important physiological function: the endo ectoperitrophic circulation. In this thesis, through the knowledge of the biochemistry of protein digestion and knowledge of the behavior of the enzymes along the midgut of juvenile shrimp, it was possible to identify the same pattern of decrease of the enzyme activities, which were shifted, when the diet was supplemented with a protein (ovalbumin at the concentrations of 60% and 80% w / w). These enzyme activities were assessed by digestion reaction with synthetic substrates (suc-AAPF-pNA, bz-R-L-pNA and pNA) protein substrate (azoalbumina) and zymogram on SDS-12% PAGE containing 0.1% gelatin. In an attempt to purify and identify some enzymes it was used ion-exchange chromatography on Mono-type column - Q. Other experiments support the hypothesis that the endo ectoperitrophic circulation takes place in shrimps by using the gavage process, through which it was possible to document the process.

FONSECA, Renata Stock. Dinâmica da comunidade fitoplanctônica em um viveiro de engorda de camarão marinho (Litopenaeus vannamei) no Estado do Ceará. 2006. 90 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universitade Federal do Ceará, Fortaleza, 2006. / Submitted by Debora Oliveira (deby_borboletinha@hotmail.com) on 2012-01-26T13:32:07Z No. of bitstreams: 1 2006_dis_rsfonseca.pdf: 1354052 bytes, checksum: 73c27aa896090f12949d76d03a945ab7 (MD5) / Approved for entry into archive by Debora Oliveira(deby_borboletinha@hotmail.com) on 2012-01-26T14:06:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_dis_rsfonseca.pdf: 1354052 bytes, checksum: 73c27aa896090f12949d76d03a945ab7 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-01-26T14:06:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_dis_rsfonseca.pdf: 1354052 bytes, checksum: 73c27aa896090f12949d76d03a945ab7 (MD5) Previous issue date: 2006 / In shrimp ponds, the phytoplankton community can exhibit development patterns associated with environmental, operational and biological factors. The present study characterized the weekly phytoplankton composition and biomass changes in a pond over the growth cycle of Litopenaeus vannamei. Shrimp of 1.35 ± 0.63 cm in body length were stocked in a 3.3 ha pond under 42.4 animals/m2. Water sampling took place in the estuary (E), water inlet canal (C), pond plateau (P) and near the pond water drainage outlet (D). Horizontal net sampling was carried out with a 20 μm mesh net for taxonomic identification of phytoplankton. For chlorophyll a and phytoplankton counting samplings were conducted on the water sub-surface. Simultaneously, water analysis was carried out for temperature, salinity, dissolved oxygen, pH, visibility, depth, phosphate, reactive silicate, ammonium nitrogen, nitrate, nitrite and suspended solids. Shrimp were harvested after 85 days of rearing and achieved 11.18 g in body weight, 1.85 FCR and 52.9% survival. Feed contributed with 92.1% and 95.8% of nitrogen and phosphorous inputs into the pond, with the remainder attributed to chemical fertilizers. Pond soil organic matter was statistically higher in D (31.99 ± 13.66 g/kg) when compared to P (4.10 ± 1.56 g/kg; P < 0.05). However, soil pH between these sampling stations did not show statistically significant differences (P > 0.05), achieving a mean of 7.86 ± 0.40 for P and 7.82 ± 0.65 for D. While water temperature showed a similar trend for all sampling stations (P > 0.05), water pH was statistically higher for P and D (8.45 and 8.47, respectively; P < 0.05). Water salinity varied between 10‰ (E) and 35‰ (C, P and D), with minimum levels observed in the initial phases of the study. Dissolved phosphate ranged from 0.01 mg/l (C) to 0.24 mg/l (P) and nitrate from 0.002 mg/l (C, P and D) to 0.05 mg/l (P). Total Dissolved Nitrogen showed no statistically significant differences throughout the growth cycle (P > 0.05), except for E. The N:P, N:Si and Si:P molar ratios were below Redfield suggested ratios, except for Si:P in E and C. Chlorophyll a varied between 1.63 μg/l (C) and 184.83 μg/l (D). In P and D, chlorophyll a increased progressively throughout the study period. In the pond, phytoplankton showed an ecological succession different from the E and C. In P and D, diatoms predominated initially, but it was followed by excessive blooms of cyanophytes and euglenophytes. High inputs of feed and fertilizers were the main contributors for these blooms, potentially harmful to shrimp. The dissolved nutrients ((N-NH3,4, N-NO2 -, N-NO3 -, P-PO4 3- e Si) carried out a larger influence on the phytoplankton development in the pond. / Em viveiros de camarão, a comunidade fitoplanctônica pode apresentar padrões de desenvolvimento associados aos fatores bióticos, abióticos e operacionais. O presente estudo objetivou caracterizar as mudanças semanais na composição e biomassa fitoplanctônica em um viveiro de engorda do camarão Litopenaeus vannamei. Camarões com 1,35 ± 0,63 cm de comprimento corporal foram povoados em um viveiro de 3,3 ha sob densidade de 42,4 indivíduos/m2. As amostragens de água foram realizadas no estuário (E), canal de abastecimento (C), no platô (P) e ponto de descarga (D) de água do viveiro. As amostragens qualitativas do fitoplâncton foram realizadas através de arrastos horizontais com rede de 20 μm. Para análise de clorofila a e contagem do número de organismos fitoplanctônicos foram coletadas amostras de sub-superfície. Simultaneamente, foram realizadas análises da temperatura, salinidade, oxigênio dissolvido, pH, transparência, profundidade, fosfato, silício reativo, nitrogênio amoniacal, nitrito, nitrato e material em suspensão da água. O camarão foi despescado após 85 dias de engorda, alcançado 11,18 g de peso médio, FCA de 1,85 e sobrevivência de 52,9%. A ração contribuiu com 92,1 e 95,8% de aportes de nitrogênio e fósforo no viveiro, com o restante atribuído a fertilizantes químicos. Os valores de matéria orgânica no solo do viveiro apresentaram-se estatisticamente mais elevados em D (31,99 ± 13,66 g/kg) quando comparado à P (4,10 ± 1,56 g/kg; P < 0,05). Contudo, o pH do solo destas estações não apresentou diferença estatística significativa (P > 0,05), alcançando média de 7,86 ± 0,40 para P e 7,82 ± 0,65 para D. Enquanto a temperatura da água foi semelhante para as estações de amostragem (P > 0,05), o pH apresentou-se estatisticamente mais elevado para P e D (8,45 e 8,47, respectivamente; P < 0,05). A salinidade oscilou entre 10‰ (E) e 35‰ (C, P e D), com níveis mais baixos no início do ciclo. O fosfato dissolvido oscilou entre 0,01 mg/l (C) e 0,24 mg/l (P) e o nitrito entre 0,002 mg/l (C, P e D) e 0,05 mg/l (P). O Nitrogênio Total Dissolvido não apresentou diferença estatística significativa ao longo do cultivo (P > 0,05), exceto para E. As razões de N:P, N:Si e Si:P foram abaixo da razão de Redfield em todas as estações de amostragem, exceto para Si:P nas estações E e C. A clorofila a variou entre 1,63 μg/l (C) a 184,83 μg/l (D). P e D apresentaram aumento progressivo de clorofila a ao longo do cultivo. O padrão da sucessão fitoplanctônica no estuário e canal foi distinto do observado no viveiro, onde foi observada inicialmente a predominância de diatomáceas seguida por florações excessivas de cianofíceas e euglenofíceas, intercalado por uma floração de dinoflagelados detectado no 22º. Dia de cultivo. Os aportes elevados de ração e fertilizantes no viveiro foram os fatores que tiveram maior contribuição para o desenvolvimento destas florações de microalgas potencialmente nocivas ao camarão. Os nutrientes dissolvidos (N-NH3,4, N-NO2 -, N-NO3 -, P-PO4 3- e Si) esempenharam uma maior influência sobre o desenvolvimento do fitoplâncton no viveiro de cultivo.

FEIJÓ, Rubens Galdino. Prospecção de genes relacionados à ocorrência de enfermidades no camarão Litopenaeus Vannamei (Boone, 1931) sob condições de cultivo. 2009. 106 f. Dissertação (Mestrado em Ciencias Marinahs Tropicais) - Instituto de Ciencias do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2009. / Submitted by Debora Oliveira (deby_borboletinha@hotmail.com) on 2012-01-26T12:36:04Z No. of bitstreams: 1 2009_dis_rgfeijó.pdf: 1571381 bytes, checksum: 22972f2932df950ac476b4312cbfd726 (MD5) / Approved for entry into archive by Debora Oliveira(deby_borboletinha@hotmail.com) on 2012-01-26T14:08:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_dis_rgfeijó.pdf: 1571381 bytes, checksum: 22972f2932df950ac476b4312cbfd726 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-01-26T14:08:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_dis_rgfeijó.pdf: 1571381 bytes, checksum: 22972f2932df950ac476b4312cbfd726 (MD5) Previous issue date: 2009 / The marine shrimp culture has achieved great importance in the global economy as an agriculture business, not only for jobs and income generation, but especially because it represents a viable alternative source of animal protein for the growing global food demand. However, the occurrence of diseases in shrimp culture, especially those of viral aetiology, has significantly compromised the activity, causing high mortality rates and consequent economic loss. The identification and characterization of genes related to shrimp diseases has helped understanding the immune responses triggered in the infectious processes, and mechanisms related to host-pathogen interaction, about which very little is known at the moment. The main objective of the present work was the prospection and characterization of genes related to diseases of the shrimp species Litopenaeus vannamei under typical rearing conditions. The health status investigation of 40 shrimps by histopathological and molecular methods of diagnosis resulted in the detection of IMN, IHHN, WSS, NHP, vibriosis and gregarines in various degrees and combinations. Shrimps have been grouped in classes for gene prospecting through the technique of Differential Display RT-CR (DDRT-PCR). The analysis of differential gene expression in the profiles produced resulted in the identification of three previously undescribed gene sequences potentially related to the occurrence of diseases in shrimp L. Vannamei. Two of these sequences (882-A1R2 and 730-A4R10) have not had homologies to any annotated invertebrate sequences. Fragment 842-A2R6 however, showed 99% nucleotide similarity with the mut-7 gene, which encodes a type of RNAse involved in the mechanism of post-transcriptional gene silencing through RNAi in the nematode Caenorhabditis elegans. It is suggested hare that this kind of mechanism may be involved in the silencing of double stranded RNA from viruses like the IMNV. / A carcinicultura marinha vem assumindo um papel de grande relevância na economia mundial, não somente pela geração de empregos e rendimentos, mas especialmente por representar uma alternativa viável para o atendimento da crescente demanda mundial por alimentos. No entanto, a ocorrência de enfermidades nos cultivos de camarões, principalmente as de etiologia viral, vem comprometendo significativamente a atividade, por provocarem elevados índices de mortalidade e conseqüente perda econômica. A identificação e caracterização de genes relacionados a enfermidades de camarões têm auxiliado significativamente na compreensão das respostas imunes desencadeadas nos processos infecciosos, assim como dos mecanismos relacionados à interação patógeno-hospedeiro, ainda de pouco conhecimento científico. O presente trabalho teve como objetivo principal a prospecção e caracterização de genes relacionados a enfermidades de camarões da espécie Litopenaeus vannamei sob condições de cultivo. A investigação sanitária de 40 camarões por métodos histopatológicos e moleculares de diagnóstico resultou na detecção da IMN, IHHN, WSS, NHP, vibrioses e gregarinas, o que permitiu o agrupamento destes camarões em classes diferenciais destinadas ao estudo de prospecção gênica através da técnica de Differential display RT-PCR (DDRT-PCR). A análise da expressão diferencial de genes nos perfis de expressão dos camarões agrupados de acordo com o status sanitário resultou na identificação de três sequências genéticas inéditas e potencialmente relacionadas à ocorrência de enfermidades no camarão L. vannamei, sendo duas sequências (882-A1R2 e 730-A4R10) de homologias indeterminada e uma (842-A2R6) com 99% de similaridade nucleotídica com o gene mut-7 que codifica um tipo de RNAse envolvida no mecanismo de silenciamento póstranscricional de genes do nematóide Caenorhabditis elegans. Este resultado sugere que o gene 842-A2R6 pode estar relacionado ao mecanismo de silenciamento de dsRNA associadas ao IMNV.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-08-01T04:12:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348098.pdf: 1370219 bytes, checksum: 8331bc18354bd7b5c270dd8c90b0724a (MD5) Previous issue date: 2017 / O cultivo integrado da Sarcocornia ambigua em aquaponia com o camarão Litopenaeus vannamei em bioflocos tem se mostrado promissor. O objetivo deste estudo foi avaliar o cultivo aquapônico de Sarcocornia ambigua e Litopenaeus vannamei sob diferentes relações de ração.m-² de planta e sua influência na qualidade de água do cultivo e no desempenho produtivo dos organismos cultivados. Para isto, foram estocados 250 camarões.m-3, em 6 unidades unidades aquapônicas dotadas de 1 tanque com volume útil de 800L, um decantador cilíndrico-cônico com 40 L de volume e uma bancada hidropônica em NFT ? Nutrient Film Technique. O experimento teve duração de 83 dias e consistiu em 2 tratamentos com triplicata, sendo: um com 0,4 m² de bancada hidropônica utilizando 40 plantas, perfazendo uma média de 100 g ração.m-2 de planta: outro com 0,8 m² e 80 plantas perfazendo uma média de 50 g ração.m-2 de planta. Foram monitorados oxigênio dissolvido, pH, alcalinidade, sólidos totais, amônia total, nitrito, nitrato e ortofosfato, além dos parâmetros de desempenho do camarão e da planta. Após análise estatística foram encontradas diferenças entre os tratamentos apenas para a amônia e nitrito. Osdemais parâmetros de qualidade de água não apresentaram diferença entre os tratamentos. Os parâmetros fitotécnicos apresentaram diferença estatística para biomassa final, sendo maior nas plantas cultivadas com uma média de 50 g ração m-2 de planta. Porém, não foi possível detectar diferença nos valores de produtividade (kg.m-²). No que tange o desempenho zootécnico dos camarões, também não foram encontradas diferenças estatísticas entre os tratamentos. Foi possível observar que utilizando uma relação de 50 g ração m-2 de planta é possível obter a melhor produção no cultivo aquapônico entre a halófita Sarcocornia ambigua e o Litopenaeus vannamei em bioflocos.<br> / Abstract : The integrated culture of Sarcocornia ambígua in aquaponics with the Litopenaeus vannamei shrimp in biofloc has been very promising. The aim of this study was to assess the aquaponic culture of Sarcocornia ambígua and Litopenaeus vannamei under different rate ratio of feed.m2 of plant and its influence in the quality of the culture?s water and in the productive performance of the cultivated organisms. In order to achieve this goal, 250 shrimps.m-3 were stored, in 6 aquaponic units equipped with an 800L tank, a 40L cylindro-conical decanter and a hydroponic bench in NFT ? Nutrient Film Technique. The experiment lasted for 83 days and was constituted by 2 treatments with triplicate: one with 0,4 m² of hydroponic bench using 40 plants, presenting an average of 100 g feed.m-2 of plant: a second one with 0,8 m² and 80 plants, presenting an average of 50 g feed.m-2. Dissolved oxygen, pH, alkalinity, total solids, total ammonia, nitrite, nitrate and orthophosphate, as well as the shrimp and plant?s performance parameters were monitored. After a statistical analysis, differences were found only between the treatments for ammonia and nitrite. The other water quality parameters did not present differences amongst the treatments. The phytotechnic parameters presented a statistical difference to final biomass, being greater in plants cultivated with an average of 50 g feed m-2 of plant. However, it was not possible to detect differences in the productive values (kg.m-²). In what regards the zootechnical performances of the shrimps, statistical differences amongst the treatments were not found either. It was possible to observe that using a rate ratio of 50 g feed m-2 of plant is possible to obtain the best production in the cultivation of aquaponics between the halophyte Sarcocornia ambígua and the Litopenaeus vannamei in biofloc.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-09-19T04:11:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 349365.pdf: 1650526 bytes, checksum: d7672c4be0919fd000f9e1101999a0f0 (MD5) Previous issue date: 2017 / O Litopenaeus vannamei, popularmente conhecido como camarão branco, é uma das espécies nativas do leste do oceano Pacífico, onde frequentemente é pescado e criado para fins comerciais, apresentando grande importancia para a carcinicultura mundial. O oxigênio dissolvido é considerado um fator extremanente limitante em cultivos semi-intensivo e intensivo, podendo afetar de forma significativa o crescimento dos camarões peneídeos. Este trabalho tem por objetivo avaliar a influência da temperatura sobre a taxa de consumo de oxigênio em Litopenaeus vannamei, com diferentes pesos corporais em condições de cultivo propriamente ditas, e não em jejum, conforme as pesquisas clássicas de fisiologia sobre consumo de oxigênio. O experimento foi conduzido no Laboratório de Camarões Marinhos (LCM). Foram utilizados respirômetros em sistema semi-aberto para a realização de medições do consumo individual de oxigênio em L. vannamei de 5, 10 e 15g a combinações de 20, 25 e 30ºC, alimentados e não alimentados. Os resultados obtidos sugerem que quanto maior for a temperatura, maior é a taxa de variação do consumo de oxigênio por unidade de peso (P<0,05). Com relação ao fator alimento, foi encontrado que a taxa de variação do consumo de oxigênio por unidade de peso em animais não alimentados foi similar (P>0,05) quando comparada com a taxa de variação do consumo de oxigênio por unidade de peso de animais alimentados.<br> / Abstract : Litopenaeus vannamei, popularly known as white shrimp, is one of the native species of the eastern Pacific Ocean, where it is often caught and raised for commercial purposes and of great importance for shrimp farming worldwide. Dissolved oxygen is an extremely limiting factor in semi-intensive and intensive cultures, and may significantly affect the growth of the penaeid prawns. The objective of this work was to evaluate the influence of temperature on the rate of oxygen consumption in Litopenaeus vannamei, with different body weights under culture conditions, rather than fasting, according to the classical studies of physiology on oxygen consumption. The experiment was conducted at the Laboratório de Camarões Marinhos (LCM). Respirators were used in a semi-open system for measurements of individual oxygen consumption in 5, 10 and 15g of L. vannamei at 20, 25 and 30ºC, fed and non-fed. The results suggest that the higher temperature result in a greater rate of variation of oxygen consumption per unit weight (P<0.05). Regarding the food factor, it was found that the rate of variation of oxygen consumption per unit of weight in non-fed animals was similar (P>0.05) when compared to the rate of variation of oxygen consumption per unit weight of fed animals.