The middle Holocene cataclysmic eruption of Mount Mazama blanketed Walker Rim, in south central Oregon, with 270 cm to 300 cm of pumice, causing capture of surface water systems by groundwater, stream relocation, and the formation of biologically diverse fens and seasonal wetlands. The pumice aquifer at Round Meadow, an 8.6 km2 basin, hosts both a fen and seasonally ponded wetlands. The Round Meadow watershed lies within a closed basin between the upper Klamath and Deschutes river basins. As the highest meadow at Walker Rim, it is a relatively well-constrained system to study the effects of hydrological disruption. A water budget was calculated for the basin, hydraulic conductivity was evaluated for the three main sediment layers in the meadow, recharge sources and evaporative trends were studied using stable isotope analysis, and aquifer residence times were estimated using CFC tracer water age dating. Water year 2014 was a drought year and observation of the system under stressed conditions allowed discrimination of four independently functioning components of the hydrogeologic system. These were the meadow, which is by far the largest component in terms of water storage, the fen where iron cementation and up to 1 m of peat holds water in a berm above the meadow, three springs which are sourced from deeper groundwater hosted in the bedrock which underlies the pumice deposit, and the outflow area. In all cases, the aquifer material is pumice, but the influence of the pre-eruption landscape and post-eruption modifications of the aquifer material have resulted in partial isolation of the components. The water budget analysis indicated that the basin lost 44 cm of water storage during WY 2014. Hydraulic conductivity values of 1x10-6, 2x10-2, and 4x10-5 cm/s, were determined for the diatomaceous silt underlying the pumice, the Plinian pumice fall aquifer, and for the diatomaceous silt overlying the pumice, respectively. The pumice is characterized as a perched, weakly confined aquifer and residence times in the pumice are much longer (decades) than for water near the surface of the meadow. Water discharging at the springs is isotopically different (lighter) than either the surface water or groundwater in the pumice aquifer. The fen at Round Meadow appears dependent on seasonal precipitation to recharge water, and responds to fluctuations in annual precipitation. The wetland meadows are volumetrically the main water-storing features at Round Meadow, and these are not homogenous features, but a combination of discrete components.

Duas espécies de cervídeos florestais ocorrem em simpatria na Amazônia: Mazama americana e Mazama nemorivaga. Ambas apresentam hábitos solitários e comportamento elusivo e por isso são difíceis de serem capturados. Além disso, são extremamente sensíveis aos métodos de captura os quais quase sempre implicam em altos níveis de estresse e injúrias. A utilização de DNA fecal tem sido empregada como alternativa não invasiva à captura, uma vez que, a partir do DNA extraído das fezes, é possível a identificação da espécie, sexo e identificação dos indivíduos. Cães farejadores vem sendo utilizados para aumentar a detecção das amostras fecais em campo e tem sido importantes aliados em estudos populacionais de cervídeos no Cerrado, Pantanal e Mata Atlântica. Nestes biomas a permanência das fezes pode ser favorecida por questões climáticas e/ou por características locais da biota especializada na degradação e remoção de excrementos. Trabalhos que utilizam fezes como fonte de informação na Amazônia não estão disponíveis bem como também não são suficientemente conhecidos os parâmetros inerentes a degradação e remoção de fezes naquele bioma. Neste sentido, este trabalho foi desenvolvido em uma área protegida do sudeste da Amazônia (Floresta Nacional do Jamari, Rondônia) e faz uma síntese sobre as implicações ecológicas da remoção de fezes de cervídeos de Mazama por coleópteros Scarabaeinae. Discute-se aqui: 1. A composição, riqueza e abundância de escarabaeíneos onde verificou-se a predileção por fezes frescas independente da espécie de cervídeo; 2. A elevada taxa de remoção das fezes na região amazônica onde verificamos taxas: (i) máxima: 100 pellets removidos em uma hora (4,5% das amostras) e; (ii) mínima: 100 pellets removidos entre 12 a 24 horas (58% das amostras) e; 3. A diversidade de ácaros foréticos Macrochelidae coletados durante a triagem dos Scarabaeinae. Por fim, apresento um modelo conceitual sobre a inobservância de amostras fecais para Amazônia onde considero dados empíricos de remoção por coleópteros aliados à experiência de busca ativa de fezes com cão farejador e com dados de presença e abundância de cervídeos obtidas com armadilhas fotográficas. Os treinamentos mostraram que o cão fora eficiente em encontrar fezes e o armadilhamento mostraram boa frequência das espécies de Mazama, contudo, a efetiva ação dos escarabeídeos mostrou-se um importante obstáculo as intenções de se obter amostras moleculares através de fezes na Amazônia. / Two species of forest deer occur sympatric in the Amazon: Mazama americana and Mazama nemorivaga. Both have solitary habits and elusive behavior and so are difficult to capture. Moreover, they are extremely sensitive to catching methods which often involve high levels of stress and injuries. The use of fecal DNA has been employed as a noninvasive alternative to capturing, since is possible made species identification, identification of individuals and sexing by DNA extracted from stools. Sniffer dogs have been used to increase the detection of fecal samples in the field and it has been important allies in population studies of deer in the Cerrado, Pantanal and Atlantic Forest. In these biomes the persistence of feces can be favored by climatic reasons and / or by local characteristics of specialized biota in the degradation and removal of excreta. Studies that use feces as a source of information in the Amazon are not available and also are not sufficiently known the parameters inherent of degradation and removal of feces in that biome. Thus, this study was conducted in a protected area of southeastern Amazon (Jamari National Forest, Rondonia) and provides an overview of the ecological implications of the removal of deer stool\'s Mazama by dung beetles Scarabaeinae. It is discussed here: 1. The composition, richness and abundance of Scarabaeinae where there was a predilection for fresh feces independently of the deer species; 2. The high rate of stool removal in the Amazon where we see: (i) maximum rate: 100 pellets removed in an hour (4.5% of the samples) and; (Ii) minimum rate: 100 pellets removed between 12 and 24 hours (58% of samples) and; 3. The diversity of Macrochelidae phoretic mites collected during the screening of Scarabaeinae. Finally, I present a conceptual model about detection failure of fecal samples to Amazon where I consider removal data by Coleoptera combined the experience of active search of stool with sniffer dog and data of presence and abundance of deer taken with camera traps. The training showed that the dog was efficient in finding feces and trapping showed good frequency of Mazama species, however, the effective action of scarabs proved to be a major obstacle to the intentions to obtain molecular samples through feces in the Amazon.

Thesis (Ph. D.)--Oregon State University, 1972. / Typescript (photocopy). Includes bibliographical references. Also available on the World Wide Web.

Duas espécies de cervídeos florestais ocorrem em simpatria na Amazônia: Mazama americana e Mazama nemorivaga. Ambas apresentam hábitos solitários e comportamento elusivo e por isso são difíceis de serem capturados. Além disso, são extremamente sensíveis aos métodos de captura os quais quase sempre implicam em altos níveis de estresse e injúrias. A utilização de DNA fecal tem sido empregada como alternativa não invasiva à captura, uma vez que, a partir do DNA extraído das fezes, é possível a identificação da espécie, sexo e identificação dos indivíduos. Cães farejadores vem sendo utilizados para aumentar a detecção das amostras fecais em campo e tem sido importantes aliados em estudos populacionais de cervídeos no Cerrado, Pantanal e Mata Atlântica. Nestes biomas a permanência das fezes pode ser favorecida por questões climáticas e/ou por características locais da biota especializada na degradação e remoção de excrementos. Trabalhos que utilizam fezes como fonte de informação na Amazônia não estão disponíveis bem como também não são suficientemente conhecidos os parâmetros inerentes a degradação e remoção de fezes naquele bioma. Neste sentido, este trabalho foi desenvolvido em uma área protegida do sudeste da Amazônia (Floresta Nacional do Jamari, Rondônia) e faz uma síntese sobre as implicações ecológicas da remoção de fezes de cervídeos de Mazama por coleópteros Scarabaeinae. Discute-se aqui: 1. A composição, riqueza e abundância de escarabaeíneos onde verificou-se a predileção por fezes frescas independente da espécie de cervídeo; 2. A elevada taxa de remoção das fezes na região amazônica onde verificamos taxas: (i) máxima: 100 pellets removidos em uma hora (4,5% das amostras) e; (ii) mínima: 100 pellets removidos entre 12 a 24 horas (58% das amostras) e; 3. A diversidade de ácaros foréticos Macrochelidae coletados durante a triagem dos Scarabaeinae. Por fim, apresento um modelo conceitual sobre a inobservância de amostras fecais para Amazônia onde considero dados empíricos de remoção por coleópteros aliados à experiência de busca ativa de fezes com cão farejador e com dados de presença e abundância de cervídeos obtidas com armadilhas fotográficas. Os treinamentos mostraram que o cão fora eficiente em encontrar fezes e o armadilhamento mostraram boa frequência das espécies de Mazama, contudo, a efetiva ação dos escarabeídeos mostrou-se um importante obstáculo as intenções de se obter amostras moleculares através de fezes na Amazônia. / Two species of forest deer occur sympatric in the Amazon: Mazama americana and Mazama nemorivaga. Both have solitary habits and elusive behavior and so are difficult to capture. Moreover, they are extremely sensitive to catching methods which often involve high levels of stress and injuries. The use of fecal DNA has been employed as a noninvasive alternative to capturing, since is possible made species identification, identification of individuals and sexing by DNA extracted from stools. Sniffer dogs have been used to increase the detection of fecal samples in the field and it has been important allies in population studies of deer in the Cerrado, Pantanal and Atlantic Forest. In these biomes the persistence of feces can be favored by climatic reasons and / or by local characteristics of specialized biota in the degradation and removal of excreta. Studies that use feces as a source of information in the Amazon are not available and also are not sufficiently known the parameters inherent of degradation and removal of feces in that biome. Thus, this study was conducted in a protected area of southeastern Amazon (Jamari National Forest, Rondonia) and provides an overview of the ecological implications of the removal of deer stool\'s Mazama by dung beetles Scarabaeinae. It is discussed here: 1. The composition, richness and abundance of Scarabaeinae where there was a predilection for fresh feces independently of the deer species; 2. The high rate of stool removal in the Amazon where we see: (i) maximum rate: 100 pellets removed in an hour (4.5% of the samples) and; (Ii) minimum rate: 100 pellets removed between 12 and 24 hours (58% of samples) and; 3. The diversity of Macrochelidae phoretic mites collected during the screening of Scarabaeinae. Finally, I present a conceptual model about detection failure of fecal samples to Amazon where I consider removal data by Coleoptera combined the experience of active search of stool with sniffer dog and data of presence and abundance of deer taken with camera traps. The training showed that the dog was efficient in finding feces and trapping showed good frequency of Mazama species, however, the effective action of scarabs proved to be a major obstacle to the intentions to obtain molecular samples through feces in the Amazon.

Submitted by Danielle Karla Martins Silva (danielle.martins@ufpe.br) on 2015-03-03T18:41:29Z No. of bitstreams: 2 Maria de Nazaré D. da Silva_DISSERTAÇÃO CÓPIA DO CD.pdf: 1282458 bytes, checksum: 73995027a8f3ea664d7426710dba2152 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-03T18:41:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Maria de Nazaré D. da Silva_DISSERTAÇÃO CÓPIA DO CD.pdf: 1282458 bytes, checksum: 73995027a8f3ea664d7426710dba2152 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / CNPq / Os atributos físicos da vegetação são variáveis importantes para estruturar as comunidades animais. Contudo, perturbações antrópicas cada vez mais freqüentes nos Neotrópicos, como a atividade de caça, podem muitas vezes ter efeitos catastróficos sobre estas comunidades. Assim, nós objetivamos avaliar como as características do hábitat e o impacto da caça pode afetar a estrutura da comunidade de ungulados no extremo norte da Amazônia brasileira. Para tal, foram realizadas amostragens através do transecto linear em duas áreas submetidas à pressão de caça, mas com diferentes fitofisionomias (assentamentos Novo Paraíso e Entre Rios) e uma área protegida com fitofisionomia semelhante ao assentamento Novo Paraíso, o Parque Nacional do Viruá. Foram analisados taxas de avistamento, abundância relativa, biomassa relativa e tamanhos médios de grupos, além de variáveis ambientais. Os ungulados foram mais abundantes na área protegida, com Tayassu pecari ocorrendo apenas nesta área. As demais espécies apresentaram tolerância às perturbações humanas, como a caça, sendo favorecidas possivelmente pelo sistema fonte-dreno que acorre através da matriz florestal contínua e intacta no entorno dos assentamentos. A caça foi à variável determinante na distribuição e abundância de ungulados nas áreas estudadas.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-25Bitstream added on 2014-06-13T19:17:41Z : No. of bitstreams: 1 cursino_ms_me_jabo.pdf: 1013380 bytes, checksum: e2baa17d3b529f6efabece49dc7a6901 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O veado mateiro, Mazama americana, apresenta populações cariotipicamente diferentes (citótipos) em diferentes regiões brasileiras. Estes citótipos apresentam uma diferenciação cariotípica que originou duas linhagens evolutivas A e B. Estas linhagens apresentam uma distância genética entre elas, maior que em relação a outras espécies de Mazama. A existência de mecanismo de isolamento reprodutivo pós-zigótico, devido a distância cariotípica das linhagens, comprovaria a existência de pelo menos duas espécies dentro do que hoje denomina-se Mazama americana. Para tal foram realizados cruzamentos inter e intracitótipos obtendo prole F1 híbrida (n=6) e pura (n=3). As fêmeas F1 foram analisadas quanto aos seus parâmetros reprodutivos por meio da dosagem de metabólitos fecais de progesterona, histologia de ovário e produção de embriões in vitro. As fêmeas puras apresentaram parâmetros similares aos já descritos para fêmeas de M. americana, porém os parâmetros das fêmeas híbridas apresentaram-se distintos das puras. Duas híbridas apresentaram esterilidade com ausência de células germinativas, resposta negativa ao protocolo de superovulação e ausência de foliculos para aspiração e posterior produção de embriões in vitro. As outras híbridas apresentaram subfertilidade. Uma vez encontrado o isolamento reprodutivo entre as linhagens A e B, foi possível identificar ao menos duas espécies dentro de Mazama americana. Sugerimos que os citótipos podem ser divididos em subespécies das linhagens, porém outros estudos devem ser realizados para que esta hipótese seja comprovada / The red brocket deer, Mazama americana, shows populations that are karyotipically different (cytotypes) distinct regions in Brasil. These karyotype differentiation led to two evolutionary lineages A and B. These lineages have a genetic distance between them greater than for other species of Mazama. Once to these differences culminate in a division of the taxon, need to require a study of reproductive isolation among lineages. For these, crossings were performed within and between cytotypes obtaining F1 hybrid (n = 6) and pure (n = 3) offspring. The F1 females were analyzed as to their reproductive parameters. It was possible to infer the reproductive capacity of these through the measurement of fecal progesterone metabolites, histology of ovary and embryo production in vitro. The pure females showed parameters similar to those described for females of M. American, but the parameters of the hybrid females were lower than those of the pure. Two hybrid presented sterility with absence of germ cells, negative response to the superovulation protocol, and absence of follicles for aspiration and subsequent production of embryos. The other hybrids showed subfertility. Once found the reproductive isolation between strains A and B, it was possible to identify at least two species within Mazama americana. We suggest that these cytotypes can be divided into subspecies strains, but other studies must be conducted so that this hypothesis is verified

Thesis (Ph. D.)--Pennsylvania State University. / Includes bibliographical references (p. 118-124).

Thesis (M.A.I.S.)--Oregon State University, 1999. / Typescript (photocopy). Includes bibliographical references (leaves 115-124). Also available online.

Thesis (M.S.)--University of Oregon, 1998. / Typescript. Includes vita and abstract. CD-ROM contains SEM backscatter electron images for appendix B. Includes bibliographical references (leaves 183-186). Also available via the Internet.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-24Bitstream added on 2014-06-13T20:43:06Z : No. of bitstreams: 1 abril_vv_dr_jabo.pdf: 1648950 bytes, checksum: a989c1942e3dd9ac9da5d7078193a943 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Estudos com veado-mateiro (Mazama americana) mostram que há muitas controvérsias quanto ao número de subespécies ou até quanto ao desdobramento destas em espécies. Em estudo citotaxonômico foram encontradas variações cromossômicas intra e interpopulacionais em populações de M. americana geograficamente distantes, com número diplóide de 48 a 53 e número fundamental de 46 a 57. Com base nisto, o presente estudo visou compreender como ocorreu a reorganização cromossômica dentro das variantes encontradas durante a evolução do grupo. Para isto, estrutura e organização dos cromossomos de M. americana foram analisadas para identificar os rearranjos que originaram a variação intraespecífica através das técnicas de bandamento cromossômico (bandas G, C, Ag-NOR), hibridação in situ (FISH) com sondas teloméricas e pintura cromossômica com o uso de sondas cromossômicas da espécie Mazama gouazoubira. Foram identificados seis citótipos distribrídos em 12 cariótipos diferentes: Rondônia (2n=42 ou 43 e NF=46; 2n=42 e NF=49), Juína (2n= 43, 44 ou 45 e NF=48; 2n=44 e NF=46), Jarí (2n=49; NF=56, Carajás (2n=50 e NF=54), Santarém (2n=51 e NF=56) e Paraná (2n=51,52 ou 53 e NF=56). O cariótipo básico do citótipo Paraná foi utilizado como base comparativa para os demais. Os rearranjos que originaram essas diferenças foram fusões cêntricas, em tandem e inversões pericêntricas. A análise de complexo sinaptonêmico confirmou a existência de um sistema sexual múltiplo do tipo XX/XY1Y2 através da detecção de uma trivalente sexual. Sítios teloméricos intersticiais evidenciam que a ocorrência de eventos de fusões em tandem foi essencial para a evolução cariotípica desta espécie e a homologia de sondas cromossomo-específicas de M. gouazoubira corroboram que o caminho da reorganização cromossômica entre estas espécies foi principalmente através de fusões. / Studies with the red brocket deer (Mazama americana) shown that there are a lot of controversies about the number of subspecies or about the unfolding of these in new species. Citotaxonomic studies found intra and interpopulational chromosomal variations, with diploid number varing from 48 to 53 and fundamental number from 46 to 57. Based on these studies, the aim of the present study was understood how the chromosomal reorganization occurred between this variants during the evolution process. For that, we analyzed the chromosomal structure and organization of M. americana, identifying the rearrangements responsible for the intraspecific variation through chromosome banding (G and C-banding, Ag-NOR), in situ hybridization of telomeric probes and chromosome painting using probes of M. gouazoubira species. It were found six different variants: Rondônia (2n=42 or 43 and FN=46; 2n=42 and FN=49), Juína (2n= 43, 44 or 45 and FN=48; 2n=44 and FN=46), Jarí (2n=49 and FN=56), Carajás (2n=50 and FN=54), Santarém (2n=51 and FN=56) and Paraná (2n=51,52 or 53 and FN=56). The basic karyotype of Paraná variant was choosing for comparative analysis. The rearrangements responsible for these chromosomal differences were centric and tandem fusions and pericentric inversions. The synaptonemal analysis sustained the existence of a multiple sexual system (XX/XY1Y2) with detection of a sexual trivalent. Intersticial telomeric sites shown the occurrence of tandem fusions was essential for the karyotype evolution of this species and the homology with the probes of M. gouazoubira corroborated that the way of chromosomal reorganization between these species was mainly through chromosome fusions.