Pecari tajacu (caititus) e Tayassu pecari (queixadas) são simpátricos na maior parte de suas distribuições históricas e exercem funções similares em um mesmo nível trófico. Em razão do seu maior tamanho corporal e bandos mais numerosos, os queixadas podem ser considerados como uma espécie dominante em uma possível competição por interferência com os caititus. Contudo, as relações competitivas entre estas duas espécies ainda não são claras e os efeitos das interações por interferência são quase desconhecidos. Este trabalho avaliou o efeito da estacionalidade climática e de atividades antrópicas nas relações de competição por interferência entre caititus e queixadas no nordeste do Pantanal brasileiro. O primeiro capítulo é uma revisão dos principais temas do trabalho: taiassuídeos, Pantanal e a introdução de porcos na região. O segundo capítulo avaliou os efeitos da estacionalidade climática, a partir de uma perspectiva térmica e de disponibilidade de água, nos padrões de atividade e uso de recursos de caititus e queixadas durante as estações seca e úmida na região. As altas temperaturas associadas com a baixa disponibilidade de água na estação seca acentuaram a sobreposição temporal entre as espécies pela redução da atividade diurna. Contudo, neste período foi registrada uma sobreposição de habitat mais baixa do que no período úmido quando taiassuídeos evitaram as áreas intensamente alagadas. Os resultados mostram um aumento de sobreposição de nicho em um gradiente ambiental como resultado da estacionalidade climática podendo ser parcialmente compensado pela redução em outra dimensão. Neste caso, a partição temporal parece ser um mecanismo viável para redução da competição entre espécies potencialmente competidoras. O terceiro capítulo avaliou a influência da pecuária (principal forma de uso da terra na região) somado à presença de porcos ferais (Sus scrofa) nas relações de competição por interferência entre taiassuídeos. Foram comparados os padrões de atividade e as coocorrências dos taiassuídeos em uma unidade de conservação (livre de porcos) adjacente a uma fazenda de pecuária tradicional (com alta densidade de porcos). As duas espécies parecem adotar diferentes estratégias que permitem a sobrevivência nas fazendas de gado com presença de porcos. Os padrões observados nos caititus sugerem uma utilização mais restrita do espaço e uma tendência em reduzir a sobreposição temporal com seus potenciais competidores. Por outro lado, queixadas expandiram sua ocorrência na fazenda, embora também tenham modificado significativamente seu padrão de atividade permanecendo ativos durante maior parte do dia quando em simpatria com porcos. Contudo, as mudanças observadas na área da fazenda não levaram a um aumento direto da competição entre caititus e queixadas. Adicionalmente, a comparação entre porcos ferais nas duas áreas permite especular sobre a forte dependência desta espécie às mudanças ambientais resultantes da pecuária praticada na região. Por fim, o último capítulo discute os principais resultados e apresenta as conclusões finais. / Pecari tajacu and Tayassu pecari are sympatric over most of their historical range and perform similar functions in the same trophic level. Because of its greater body size and more numerous herds, the white-lipped peccary can be considered the dominant species in a possible interference competition with the collared peccary. However, the competitive relationships between these species are not yet clear and effects of interactions by interference are almost unknown. This study evaluated the effect of climatic seasonality and anthropogenic activities in the relations of interference competition between collared and white-lipped peccaries in the northeastern Brazilian Pantanal. The first chapter is an extensive review of the main themes: peccaries, Pantanal and the introduction of pigs in the region. The second chapter evaluated the effects of climate seasonality from a thermal perspective and water availability on the activity patterns and resource use of collared peccary and white-lipped peccary during wet and dry seasons. The high temperatures associated with water shortage in dry season accentuated the temporal overlap between the species due to the reduction of daytime activity. However, in this period there was a habitat overlap reduction compared to wet period where peccaries avoided the flooded areas. The results show that an increase in niche overlap on the environmental gradient as a result of climatic seasonality may be partially compensated by a reduction in other niche dimensions. In this case, temporal partitioning appears to be a viable mechanism to reduce competition by potentially competing species. The third chapter evaluated the potential influence of livestock (the main form of land use in region) added to the presence of feral hogs in the relations of interference competition between peccaries. It was compared the patterns of activity and co-occurrence of peccaries in a conservation area (free of pigs) adjacent to another area with a traditional cattle ranch (with high density of pigs). Both species seem adopt different strategies that enable their survival in cattle ranches with presence of pigs. The collared peccary patterns suggest a constrained use of space and a trend to reduce the temporal overlap with competitors. On the other hand, white-lipped peccaries increased the occurrence rate and also modified its pattern of activity remaining active during most of the day resulting in a high rate of co-occurrence with feral hogs. However, these changes observed in the cattle ranch area did not result in a direct increase of interference competition between peccaries. Additionally, the comparison between feral hogs in the two areas allows us to speculate about a strong dependence of this species on environmental changes resulting from livestock activities in the region. Finally, the last chapter discusses the main results found and presents the general conclusions.

Pecari tajacu (caititus) e Tayassu pecari (queixadas) são simpátricos na maior parte de suas distribuições históricas e exercem funções similares em um mesmo nível trófico. Em razão do seu maior tamanho corporal e bandos mais numerosos, os queixadas podem ser considerados como uma espécie dominante em uma possível competição por interferência com os caititus. Contudo, as relações competitivas entre estas duas espécies ainda não são claras e os efeitos das interações por interferência são quase desconhecidos. Este trabalho avaliou o efeito da estacionalidade climática e de atividades antrópicas nas relações de competição por interferência entre caititus e queixadas no nordeste do Pantanal brasileiro. O primeiro capítulo é uma revisão dos principais temas do trabalho: taiassuídeos, Pantanal e a introdução de porcos na região. O segundo capítulo avaliou os efeitos da estacionalidade climática, a partir de uma perspectiva térmica e de disponibilidade de água, nos padrões de atividade e uso de recursos de caititus e queixadas durante as estações seca e úmida na região. As altas temperaturas associadas com a baixa disponibilidade de água na estação seca acentuaram a sobreposição temporal entre as espécies pela redução da atividade diurna. Contudo, neste período foi registrada uma sobreposição de habitat mais baixa do que no período úmido quando taiassuídeos evitaram as áreas intensamente alagadas. Os resultados mostram um aumento de sobreposição de nicho em um gradiente ambiental como resultado da estacionalidade climática podendo ser parcialmente compensado pela redução em outra dimensão. Neste caso, a partição temporal parece ser um mecanismo viável para redução da competição entre espécies potencialmente competidoras. O terceiro capítulo avaliou a influência da pecuária (principal forma de uso da terra na região) somado à presença de porcos ferais (Sus scrofa) nas relações de competição por interferência entre taiassuídeos. Foram comparados os padrões de atividade e as coocorrências dos taiassuídeos em uma unidade de conservação (livre de porcos) adjacente a uma fazenda de pecuária tradicional (com alta densidade de porcos). As duas espécies parecem adotar diferentes estratégias que permitem a sobrevivência nas fazendas de gado com presença de porcos. Os padrões observados nos caititus sugerem uma utilização mais restrita do espaço e uma tendência em reduzir a sobreposição temporal com seus potenciais competidores. Por outro lado, queixadas expandiram sua ocorrência na fazenda, embora também tenham modificado significativamente seu padrão de atividade permanecendo ativos durante maior parte do dia quando em simpatria com porcos. Contudo, as mudanças observadas na área da fazenda não levaram a um aumento direto da competição entre caititus e queixadas. Adicionalmente, a comparação entre porcos ferais nas duas áreas permite especular sobre a forte dependência desta espécie às mudanças ambientais resultantes da pecuária praticada na região. Por fim, o último capítulo discute os principais resultados e apresenta as conclusões finais. / Pecari tajacu and Tayassu pecari are sympatric over most of their historical range and perform similar functions in the same trophic level. Because of its greater body size and more numerous herds, the white-lipped peccary can be considered the dominant species in a possible interference competition with the collared peccary. However, the competitive relationships between these species are not yet clear and effects of interactions by interference are almost unknown. This study evaluated the effect of climatic seasonality and anthropogenic activities in the relations of interference competition between collared and white-lipped peccaries in the northeastern Brazilian Pantanal. The first chapter is an extensive review of the main themes: peccaries, Pantanal and the introduction of pigs in the region. The second chapter evaluated the effects of climate seasonality from a thermal perspective and water availability on the activity patterns and resource use of collared peccary and white-lipped peccary during wet and dry seasons. The high temperatures associated with water shortage in dry season accentuated the temporal overlap between the species due to the reduction of daytime activity. However, in this period there was a habitat overlap reduction compared to wet period where peccaries avoided the flooded areas. The results show that an increase in niche overlap on the environmental gradient as a result of climatic seasonality may be partially compensated by a reduction in other niche dimensions. In this case, temporal partitioning appears to be a viable mechanism to reduce competition by potentially competing species. The third chapter evaluated the potential influence of livestock (the main form of land use in region) added to the presence of feral hogs in the relations of interference competition between peccaries. It was compared the patterns of activity and co-occurrence of peccaries in a conservation area (free of pigs) adjacent to another area with a traditional cattle ranch (with high density of pigs). Both species seem adopt different strategies that enable their survival in cattle ranches with presence of pigs. The collared peccary patterns suggest a constrained use of space and a trend to reduce the temporal overlap with competitors. On the other hand, white-lipped peccaries increased the occurrence rate and also modified its pattern of activity remaining active during most of the day resulting in a high rate of co-occurrence with feral hogs. However, these changes observed in the cattle ranch area did not result in a direct increase of interference competition between peccaries. Additionally, the comparison between feral hogs in the two areas allows us to speculate about a strong dependence of this species on environmental changes resulting from livestock activities in the region. Finally, the last chapter discusses the main results found and presents the general conclusions.

Pecari tajacu (caititus) e Tayassu pecari (queixadas) são simpátricos na maior parte de suas distribuições históricas e exercem funções similares em um mesmo nível trófico. Em razão do seu maior tamanho corporal e bandos mais numerosos, os queixadas podem ser considerados como uma espécie dominante em uma possível competição por interferência com os caititus. Contudo, as relações competitivas entre estas duas espécies ainda não são claras e os efeitos das interações por interferência são quase desconhecidos. Este trabalho avaliou o efeito da estacionalidade climática e de atividades antrópicas nas relações de competição por interferência entre caititus e queixadas no nordeste do Pantanal brasileiro. O primeiro capítulo é uma revisão dos principais temas do trabalho: taiassuídeos, Pantanal e a introdução de porcos na região. O segundo capítulo avaliou os efeitos da estacionalidade climática, a partir de uma perspectiva térmica e de disponibilidade de água, nos padrões de atividade e uso de recursos de caititus e queixadas durante as estações seca e úmida na região. As altas temperaturas associadas com a baixa disponibilidade de água na estação seca acentuaram a sobreposição temporal entre as espécies pela redução da atividade diurna. Contudo, neste período foi registrada uma sobreposição de habitat mais baixa do que no período úmido quando taiassuídeos evitaram as áreas intensamente alagadas. Os resultados mostram um aumento de sobreposição de nicho em um gradiente ambiental como resultado da estacionalidade climática podendo ser parcialmente compensado pela redução em outra dimensão. Neste caso, a partição temporal parece ser um mecanismo viável para redução da competição entre espécies potencialmente competidoras. O terceiro capítulo avaliou a influência da pecuária (principal forma de uso da terra na região) somado à presença de porcos ferais (Sus scrofa) nas relações de competição por interferência entre taiassuídeos. Foram comparados os padrões de atividade e as coocorrências dos taiassuídeos em uma unidade de conservação (livre de porcos) adjacente a uma fazenda de pecuária tradicional (com alta densidade de porcos). As duas espécies parecem adotar diferentes estratégias que permitem a sobrevivência nas fazendas de gado com presença de porcos. Os padrões observados nos caititus sugerem uma utilização mais restrita do espaço e uma tendência em reduzir a sobreposição temporal com seus potenciais competidores. Por outro lado, queixadas expandiram sua ocorrência na fazenda, embora também tenham modificado significativamente seu padrão de atividade permanecendo ativos durante maior parte do dia quando em simpatria com porcos. Contudo, as mudanças observadas na área da fazenda não levaram a um aumento direto da competição entre caititus e queixadas. Adicionalmente, a comparação entre porcos ferais nas duas áreas permite especular sobre a forte dependência desta espécie às mudanças ambientais resultantes da pecuária praticada na região. Por fim, o último capítulo discute os principais resultados e apresenta as conclusões finais. / Pecari tajacu and Tayassu pecari are sympatric over most of their historical range and perform similar functions in the same trophic level. Because of its greater body size and more numerous herds, the white-lipped peccary can be considered the dominant species in a possible interference competition with the collared peccary. However, the competitive relationships between these species are not yet clear and effects of interactions by interference are almost unknown. This study evaluated the effect of climatic seasonality and anthropogenic activities in the relations of interference competition between collared and white-lipped peccaries in the northeastern Brazilian Pantanal. The first chapter is an extensive review of the main themes: peccaries, Pantanal and the introduction of pigs in the region. The second chapter evaluated the effects of climate seasonality from a thermal perspective and water availability on the activity patterns and resource use of collared peccary and white-lipped peccary during wet and dry seasons. The high temperatures associated with water shortage in dry season accentuated the temporal overlap between the species due to the reduction of daytime activity. However, in this period there was a habitat overlap reduction compared to wet period where peccaries avoided the flooded areas. The results show that an increase in niche overlap on the environmental gradient as a result of climatic seasonality may be partially compensated by a reduction in other niche dimensions. In this case, temporal partitioning appears to be a viable mechanism to reduce competition by potentially competing species. The third chapter evaluated the potential influence of livestock (the main form of land use in region) added to the presence of feral hogs in the relations of interference competition between peccaries. It was compared the patterns of activity and co-occurrence of peccaries in a conservation area (free of pigs) adjacent to another area with a traditional cattle ranch (with high density of pigs). Both species seem adopt different strategies that enable their survival in cattle ranches with presence of pigs. The collared peccary patterns suggest a constrained use of space and a trend to reduce the temporal overlap with competitors. On the other hand, white-lipped peccaries increased the occurrence rate and also modified its pattern of activity remaining active during most of the day resulting in a high rate of co-occurrence with feral hogs. However, these changes observed in the cattle ranch area did not result in a direct increase of interference competition between peccaries. Additionally, the comparison between feral hogs in the two areas allows us to speculate about a strong dependence of this species on environmental changes resulting from livestock activities in the region. Finally, the last chapter discusses the main results found and presents the general conclusions.

Submitted by Danielle Karla Martins Silva (danielle.martins@ufpe.br) on 2015-03-03T18:41:29Z No. of bitstreams: 2 Maria de Nazaré D. da Silva_DISSERTAÇÃO CÓPIA DO CD.pdf: 1282458 bytes, checksum: 73995027a8f3ea664d7426710dba2152 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-03T18:41:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Maria de Nazaré D. da Silva_DISSERTAÇÃO CÓPIA DO CD.pdf: 1282458 bytes, checksum: 73995027a8f3ea664d7426710dba2152 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / CNPq / Os atributos físicos da vegetação são variáveis importantes para estruturar as comunidades animais. Contudo, perturbações antrópicas cada vez mais freqüentes nos Neotrópicos, como a atividade de caça, podem muitas vezes ter efeitos catastróficos sobre estas comunidades. Assim, nós objetivamos avaliar como as características do hábitat e o impacto da caça pode afetar a estrutura da comunidade de ungulados no extremo norte da Amazônia brasileira. Para tal, foram realizadas amostragens através do transecto linear em duas áreas submetidas à pressão de caça, mas com diferentes fitofisionomias (assentamentos Novo Paraíso e Entre Rios) e uma área protegida com fitofisionomia semelhante ao assentamento Novo Paraíso, o Parque Nacional do Viruá. Foram analisados taxas de avistamento, abundância relativa, biomassa relativa e tamanhos médios de grupos, além de variáveis ambientais. Os ungulados foram mais abundantes na área protegida, com Tayassu pecari ocorrendo apenas nesta área. As demais espécies apresentaram tolerância às perturbações humanas, como a caça, sendo favorecidas possivelmente pelo sistema fonte-dreno que acorre através da matriz florestal contínua e intacta no entorno dos assentamentos. A caça foi à variável determinante na distribuição e abundância de ungulados nas áreas estudadas.

Several years ago, a new genus and species of peccary, “Muknalia minima”, was described from the Pleistocene of Mexico. We previously examined that specimen and concluded that it was synonymous with the extant collared peccary, Pecari tajacu, but that taxonomic revision is rejected by the authors of the original study (this volume). Here, we provide further analysis of “Muknalia” and expand on previous evidence from both morphology and taphonomy that support synonymy with P. tajacu. We argue that morphological features, both in terms of size and shape, that were used to diagnose “Muknalia” all fall within the range of variation of the extant P. tajacu, or are a consequence of taphonomic modification, including human handling.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-01-10T16:57:36Z No. of bitstreams: 3 Tese - Adriana Marques Faria - 2016 - Parte 01.pdf: 5478875 bytes, checksum: ae9c08d62c1ad44305030954fe0b0a5e (MD5) Tese - Adriana Marques Faria - 2016 - Parte 02.pdf: 16834328 bytes, checksum: 2faf307ee33c6a223a00b491091a66f2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-11T09:54:12Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Tese - Adriana Marques Faria - 2016 - Parte 01.pdf: 5478875 bytes, checksum: ae9c08d62c1ad44305030954fe0b0a5e (MD5) Tese - Adriana Marques Faria - 2016 - Parte 02.pdf: 16834328 bytes, checksum: 2faf307ee33c6a223a00b491091a66f2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-11T09:54:12Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Tese - Adriana Marques Faria - 2016 - Parte 01.pdf: 5478875 bytes, checksum: ae9c08d62c1ad44305030954fe0b0a5e (MD5) Tese - Adriana Marques Faria - 2016 - Parte 02.pdf: 16834328 bytes, checksum: 2faf307ee33c6a223a00b491091a66f2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-12-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The closeness beteween wild and domestic animals with humans may result in common diseases involving these three groups, including zoonotic and antropozoonotic diseases. The study of bacteria and disease that affects animals is an important way to approach epidemiologic control and sanitary vigilance, as we do not understand the roll of wild animals in transmitting diseases among wild, exotic and domestic animals. The main objective of the present study was to search the presence of Escherichia coli and Salmonella sp. from rectal swabs of non-domesticated Suiformes in Commercial herds in Goiás State. It was collected rectal swabs of 100 Sus scrofa scrofa, 60 T. pecari and 30 P. tajacu, from different ages. The samples were used in order to obtain the isolation, antimicrobial profile, hemolisin test for E. coli and virulence and resistance gene presences in both bacteria. The serotyping was performed with polyvalent anti-O serum and the virulence and resistance gene deteccion by PCR technique. The results shown high rates of antimicrobial resistance and virulence and resistance genes in analyzed groups of E. coli. The isolation of Salmonella sp. occurred in one sample of S. scrofa, with high rates of antimicrobial resistance also, but no resistance and virulence genes were detected in this isolate. We must pay attention to the possibility of horizontal gene transference of virulence factors and resistance trough contaminated water and food, that may transform commensal bacteria in possible pathogenic agents. It is conclude: that Salmonella sp. is not commonly isolated from T. pecari and P. tajacu, showing low frequency of isolation in S. scrofa in these conditions; and E. coli with multidrug resistance patterns is isolated from S. scrofa, T. pecari and P. tajacu in commercial herds from Goiás State. / A proximidade de animais silvestres com animais domésticos e seres humanos pode resultar no aparecimento de doenças comuns a estes três grupos, incluindo doenças zoonóticas. O estudo de bactérias e doenças que acometem animais silvestres é importante para atuar na forma de controle epidemiológico e vigilância sanitária, visto que não se compreende o papel destes animais na transmissão de doenças entre outros animais silvestres, exóticos e domésticos. O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de pesquisara presença das bactérias Escherichia coli e Salmonella sp. em suabes retais provenientes de Suiformes não domesticados em criações comerciais no Estado de Goiás. Foram colhidos suabes retais de 100 Sus scrofa scrofa, 60 de Tayassu pecari e 30 de Pecari tajacu, de diferentes faixas etárias. À partir do material colhido fez-se o isolamento, perfil antimicrobiano, teste de hemólise para E. coli e detecção de genes de virulência e de resistência das bactérias. Para a detecção dos agentes, foi realizado exame bacteriológico convencional e ensaios de suscetibilidade a antimicrobianos. Foi realizadas a tipificação sorológica por teste sorológico com soro polivalente anti-O para a bactéria Salmonella e detecção de genes virulência e de resistência pela técnica de PCR nos isolados. Os resultados obtidos demonstraram altas taxas de resistência aos antimicrobianos e presença de genes de virulência em amostras de E. coli em todos os grupos testados. O isolamento de Salmonella sp. foi possível em uma amostra de S. scrofa, que apresentou também altas taxas de resistência à antimicrobianos, mas não houve detecção de genes de virulência ou de resistência neste isolado. Conclui-se que: nesta condição de criação Salmonella sp. não é isolada comumente de T. pecari e P. tajacu, sendo isolada em baixa frequência de S. scrofa; e que E. coli é isolada de S. scrofa, T. pecari e P. tajacu em rebanhos comerciais do Estado de Goiás, com múltiplos padrões de resistência antimicrobiana.

Muitas espécies de mamíferos selvagens são criadas para produção de carne. No Brasil, a capivara (Hydrochaeris hydrochaeris), a paca (Agouti paca), o cateto (Tayassu tajacu) e a queixada (Tayassu pecari) são criadas comercialmente para este fim, porém são escassas as informações sanitárias a respeito dessas espécies. Assim, o presente estudo teve por objetivo estudar a presença de infecção causada por leptospiras, micobactérias, brucelas e Erysipelothrix spp. em 138 animais dessas quatro espécies, provenientes de nove criadouros e abatidos em estabelecimento com Serviço de Inspeção Federal. Nenhum animal apresentou anticorpos séricos contra brucelas lisas. As capivaras apresentaram a maior freqüência de animais sorologicamente reagentes para leptospiras (54,5%), seguidas das queixadas (39%) e dos catetos (21,7%). O sorovar mais provável mais freqüente para as espécies estudadas foi o Grippotyphosa, seguido do Hardjobovis e do Tarassovi. Das capivaras foram isolados Leptospira santarosai a partir de rim e Mycobacterium xenopi a partir de linfonodo mesentérico. Das queixadas foi isolado Erysipelothrix rhusiopathiae a partir de tonsila. Segundo os bancos de dados Scopus, Pubmed e Cab Abstracts (Ovid), trata-se dos primeiros relatos de isolamento de M. xenopi em capivara e de E. rhusiopathiae em queixada. / Many species of wild mammals are raised for meat production. In Brazil, the capybara (Hydrochaeris hydrochaeris), paca (Agouti paca), collared peccary (Tayassu tajacu) and the white-lipped peccary (Tayassu pecari) are commercially bred, however there is limited sanitary information related to these species. This study aimed to search for the presence of infection caused by Leptospira spp., Mycobacteria spp., Brucella spp. and Erysipelothrix spp. in 138 animals belonging to those species, coming from nine commercial breeders and slaughtered under the Federal Inspection Service. None of these animals presented antibodies against smooth brucellas. The capybaras showed the highest frequency of seropositive animals for leptospirosis (54.4%), followed by the white-lipped peccaries (39%) and the collared peccaries (21.7%). The most frequent serovar was Grippotyphosa, followed by Hardjobovis and Tarassovi. Leptospira santarosai was isolated from the kidneys and Mycobacterium xenopi from the mesenteric lymph nodes of the examined capybaras. Erysipelothrix rhusiopathiae was isolated from the tonsils of one white-lipped peccary. According to the data banks Scopus, Pubmed e Cab Abstracts (Ovid), this is the first report of M. xenopi isolation from capybara and of E. rhusiopathiae from white-lipped peccary.

Queixadas (Tayassu pecari) são mamíferos ungulados sociais que vivem em bandos que facilmente ultrapassam 100 indivíduos. Os objetivos do presente estudo foram: 1) avaliar se há relação entre o parentesco e a estrutura social das queixadas e 2) re-analisar se há diferenciação genética entre queixadas de duas localidades do Pantanal do Mato Grosso do Sul, utilizando maior amostragem de indivíduos e de marcadores microssatélites. Foram genotipadas 184 amostras de queixadas (53 da Fazendo Rio Negro, RN e 131 da Fazenda Santa Emília, SE) para 15 microssatélites. O número de alelos encontrados variou de 2 a 12, com média de 4,60 em RN e 5,07 em SE. Embora o número de alelos médio foi significativamente maior em SE do que em RN (p < 0,05), a riqueza alélica média (4,59 na RN e 4,69 na SE) e as heterozigosidades médias observada e esperada (0,50 e 0,53 na RN e 0,55 e 0,55 na SE, respectivamente) foram similares em ambas as localidades, (p > 0,05). A mediana do coeficiente de parentesco em ambas as localidades foi significativamente maior entre os indivíduos de mesmo grupo de coleta do que entre os indivíduos de grupos de coleta diferentes, tanto para a análise incluindo todos os indivíduos como para a análise sem os indivíduos jovens. Isso sugere que tal resultado não é influenciado por possível captura de um jovem com seu progenitor. De forma similar, a mediana do coeficiente de parentesco considerando o sexo dos indivíduos (macho/macho, macho/fêmea e fêmea/fêmea) dentro e entre os grupos de coleta foi significativamente maior entre as categorias dentro dos grupos de coleta do que entre os grupos de coleta, tanto com os indivíduos jovens como sem os indivíduos jovens. Tais resultados sugerem que o parentesco possui influência na formação dos grupos sociais. O valor de FST encontrado entre as localidades foi de 0,017 e significativamente diferente de zero e o valor de DEST foi de 0,015. A análise Bayesiana, assumindo o modelo de mistura entre as populações e frequências alélicas correlacionadas, apontou o valor de K=1 como sendo o mais provável. Quando a localidade de coleta foi informada, o valor de K mais provável foi de 2 e os agrupamentos corresponderam exatamente às localidades amostradas. Esses resultados indicam que as queixadas das duas localidades estudadas compõem duas populações com alto fluxo gênico entre elas / White-lipped peccaries (Tayassu pecari) are social ungulates that live in herds of usually more than 100 individuals. The aims of the present study were: 1) to evaluate whether there is any correlation between relatedness and social structure of white-lipped peccaries and 2) to re-examine whether there is significant genetic differentiation in white-lipped peccaries from two adjacent locations of the Brazilian Pantanal, based on a larger sample of individuals and of microsatellite markers. In total, 184 peccaries (53 from Fazenda Rio Negro, RN and 131 from Fazenda Santa Emilia, SE) were genotyped for 15 microsatellites. The number of alleles observed per microsatellite varied from 2 to 12, with a mean of 4.60 in RN and 5.07 in SE. Although the mean number of alleles was significantly higher in SE than in RN (p < 0.05), the mean allelic richness (4.59 in RN and 4.69 in SE) and mean observed and expected heterozygosities (0.50 and 0.53 in RN and 0.55 and 0.55 in SE, respectively) were similar in both locations (p > 0,05). The median of the coefficient of relatedness in both locations was significantly higher between individuals captured together than between individuals from different capture groups, both for the analyses including all individuals as for the analyses without the youngsters. This suggests that this result is not influenced by the possible capture of a young with its parent. Similarly, the median of the coefficient of relatedness according to gender (male vs. male, male vs. female, and female vs. female) was significantly higher within than among capture groups, including or excluding young individuals. Those results suggest that relatedness has some importance in the social structure of white-lipped peccaries. The FST between the locations was 0.017 and significantly different from zero and the DEST was 0.015. The Bayesian analysis, assuming the model of population mixture and correlated allele frequencies, showed that the most likely K was 1. When the collection site was included in the analysis, the most likely value of K was 2 and the clusters corresponded exactly to the locations of origin of the samples. Those results suggest that the white-lipped peccaries of the two sites studied comprise two populations with high levels of gene flow between them

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3505.pdf: 1518341 bytes, checksum: 4efdb62d361c64397c9a8d593dc99efc (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Universidade Federal de Minas Gerais / The tayassuidae family, order Artiodactyla, occurs exclusevely in the American continet and has three extant species: Tayassu pecari, the White-lipped peccary, Pecari tajacu, the collared peccary, Catagonus wagneri, the chacoan peccary. The existence of a fourth species in the family, Pecari maximus, recently discovered, is being discussed. White-lipped peccaries occur from southern Mexico through northern Argentina, while collared peccaries have a wider distribution: from southern United States through northern Argentina. Both species play key roles in the ecossystem, being part of the trophic chain and acting as seeds predators and dispersers. They are hunted in various levels throughout thier range and suffer with habitat changes provoked by humans.Microssatellites are short repetitive sequences of DNA found all over the genome and present a high degree of polimorphysm, codominance and are selective neutral, therefore being considered a ideal molecular marker for populational studies. The flanking regions of these microssatellites tend to be conserved among related species, wich makes possible the cross amplification.The aim of this work was to describe and charaterize microssatellite loci for Tayassu pecari and to test their aplicability to population studies of Pecari tajacu. A partial enriched genomic library was constructed through the DNA cleavage with restriction enzymes, hybridiztion of the fragments with repetitive biotinilated probes and magnetic recovery of hybrids with streptavidincoated magnetic beads. Among 192 recombinant clones that were sequenced, 60 repetitive regions were obtained. Design of primers was possible for 19 of them and they were tested in 30 individuals from a wild population of White-lipped and 23 from a captive population of collared peccaries. 13 loci amplified in the White-lipped peccary population and ten of them polimorphyc. The genetic diversity in this population was considered moderated, two loci deviated from Hardy-Weinberg Equilibrium in response to the presence of an homozygous excess caused by null alleles. The genetic diversity found in the collared peccary population was slightly higher, probably due to the mixed origin of the animals. This difference may also be a result of different patterns or reproduction in the two species: while White-lipped herd seem to function as a relatevely closed reproductive units, the social flexibility of collared peccaries that occurs in the wild may favour the genetic diversity in the species, so when a captive population is established, its genetic diversity, as a reflex of the total genetic diversity, is also higher. There were more related individuals in the White-lipped population than were found for the collared population, which might be a consequence of the reproductive patterns of the two species. The genetic markers described here can be used in for popualtion studies in both species, and may base future managment and conservation programs for the maintaince of the peccaries. / A família Tayassuidae, ordem Artiodactyla, ocorre exclusivamente no continente americano e possui, atualmente, apenas três espécies: Tayassu pecari, as queixadas, Pecari tajacu, os catetos e Catagonus wagneri, o taguá. A existência de uma quarta espécie na família, Pecari maximus, recentemente descrita, vem sendo discutida. As queixadas distribuem-se do sul do México ao norte da Argentina, enquanto os catetos possuem uma distribuição mais ampla, sendo encontrados desde o sul dos Estados Unidos até o norte da Argentina. As duas espécies desempenham papel-chave nos ecossistemas, por fazerem parte da cadeia trófica e atuar como predadores e dispersores de sementes. São caçadas em diferentes intensidades ao longo de sua distribuição e também sofrem com a alteração, fragmentação e perda de habitats causados pela atuação humana em áreas naturais. Os microssatélites, sequências curtas e repetitivas, distribuemse uniformemente por todo o genoma, apresentam alto grau de polimorfismo, são codominantes e seletivamente neutros e, por isso, considerados como marcadores moleculares ideais para serem usados em estudos populacionais. O fato de a região flanqueadora dos microssatélites apresentarse extremamente conservada em algumas espécies relacionadas possibilita a utilização de marcadores microssatélites em espécies próximas àquelas para as quais foram descritos. Esse trabalho teve como objetivo descrever e caracterizar locos microssatélites para a espécie Tayassu pecari e testar sua aplicabilidade em estudos populacionais de Pecari tajacu. Para isso, foi construída uma biblioteca genômica parcial enriquecida. Tal metodologia baseia-se em três etapas principais: clivagem do DNA através de enzimas de restrição, hibridização dos fragmentos obtidos com sondas biotiniladas de sequência repetitiva e motif tetranucleotídico e recuperação magnética dos híbridos através da utilização de partículas magnéticas cobertas com streptavidina. Entre 192 colônias recombinantes que foram sequenciadas, foram obtidas 60 regiões repetitivas, tendo sido possível a construção de iniciadores para 19 delas. Dos iniciadores testados, 13 apresentaram um padrão satisfatório de amplificação em queixadas e 15 em catetos. Destes, dez foram polimórficos na população de queixadas analisada e 11 na de catetos. A variabilidade genética encontrada na população selvagem de queixadas estudada foi considerada moderada. Nessa população não foi encontrado desequilíbrio de ligação significativo e dois locos não se encontravam em Equilíbrio de Hardy-Weinberg, em virtude de um excesso de homozigotos, provocado pela presença de alelos nulos. A variabilidade genética encontrada na população cativa de catetos foi mais alta que a das queixadas, provavelmente por causa da origem diversa dos membros da população. Essa diferença também poderia ser explicada em função dos diferentes padrões de acasalamento das espécies: enquanto os bandos de queixadas parecem funcionar como unidades reprodutivas, a estrutura social mais flexível dos catetos, em vida livre, parece favorecer a maior diversidade genética nessa espécie, dessa forma, quando se estabelece uma popualação cativa, sua diversidade genética, que é um reflexo da diversidade total, também é maior. Foram encontrados mais indivíduos aparentados entre a população de queixadas do que na de catetos, o que pode ser uma conseqüência dos padrões reprodutivos das duas espécies. Os marcadores descritos aqui podem ser utilizados para estudos populacionais dessas duas espécies, que podem embasar futuros programas de manejo e conservação necessários para a manutenção das mesmas.

Muitas espécies de mamíferos selvagens são criadas para produção de carne. No Brasil, a capivara (Hydrochaeris hydrochaeris), a paca (Agouti paca), o cateto (Tayassu tajacu) e a queixada (Tayassu pecari) são criadas comercialmente para este fim, porém são escassas as informações sanitárias a respeito dessas espécies. Assim, o presente estudo teve por objetivo estudar a presença de infecção causada por leptospiras, micobactérias, brucelas e Erysipelothrix spp. em 138 animais dessas quatro espécies, provenientes de nove criadouros e abatidos em estabelecimento com Serviço de Inspeção Federal. Nenhum animal apresentou anticorpos séricos contra brucelas lisas. As capivaras apresentaram a maior freqüência de animais sorologicamente reagentes para leptospiras (54,5%), seguidas das queixadas (39%) e dos catetos (21,7%). O sorovar mais provável mais freqüente para as espécies estudadas foi o Grippotyphosa, seguido do Hardjobovis e do Tarassovi. Das capivaras foram isolados Leptospira santarosai a partir de rim e Mycobacterium xenopi a partir de linfonodo mesentérico. Das queixadas foi isolado Erysipelothrix rhusiopathiae a partir de tonsila. Segundo os bancos de dados Scopus, Pubmed e Cab Abstracts (Ovid), trata-se dos primeiros relatos de isolamento de M. xenopi em capivara e de E. rhusiopathiae em queixada. / Many species of wild mammals are raised for meat production. In Brazil, the capybara (Hydrochaeris hydrochaeris), paca (Agouti paca), collared peccary (Tayassu tajacu) and the white-lipped peccary (Tayassu pecari) are commercially bred, however there is limited sanitary information related to these species. This study aimed to search for the presence of infection caused by Leptospira spp., Mycobacteria spp., Brucella spp. and Erysipelothrix spp. in 138 animals belonging to those species, coming from nine commercial breeders and slaughtered under the Federal Inspection Service. None of these animals presented antibodies against smooth brucellas. The capybaras showed the highest frequency of seropositive animals for leptospirosis (54.4%), followed by the white-lipped peccaries (39%) and the collared peccaries (21.7%). The most frequent serovar was Grippotyphosa, followed by Hardjobovis and Tarassovi. Leptospira santarosai was isolated from the kidneys and Mycobacterium xenopi from the mesenteric lymph nodes of the examined capybaras. Erysipelothrix rhusiopathiae was isolated from the tonsils of one white-lipped peccary. According to the data banks Scopus, Pubmed e Cab Abstracts (Ovid), this is the first report of M. xenopi isolation from capybara and of E. rhusiopathiae from white-lipped peccary.