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Apesar de ainda não terem sido relatados Coronavírus aviários com potencial zoonótico, espécies de aves silvestres e domésticas podem portar CoVs de grande importância econômica como o vírus da Bronquite Infecciosa (IBV). Além disso, nos últimos anos, diversos novos CoVs geneticamente distintos do IBV vêm sendo identificados em diferentes famílias de aves e mamíferos silvestres e domésticos. O Brasil contem 18% do total da diversidade de espécies de aves no mundo, no entanto, estudos sobre a presença de Coronavírus em aves silvestres ainda são bastante escassos. O presente estudo tem por objetivo realizar análise retrospectiva da presença de Coronavírus em amostras de aves silvestres e domésticas de diferentes regiões brasileiras coletadas entre os anos de 2004 e 2013 através de RT-PCR; realizar a caracterização molecular e a análise filogenética afim de correlacionar sua epidemiologia às rotas de migrações de aves, à proximidade das regiões urbanas e de granjas avícolas, verificando a possibilidade de transmissão. Do total de 746 amostras testadas, 25 apresentaram resultados positivos para os Coronavírus com primers para o gene da RpRd e foram sequenciadas. Obtivemos sucesso no sequenciamento de 7 dessas amostras, sendo 4 positivas para Gammacoronavírus e 3 positivas para Deltacoronavírus. Na tentativa de sequenciamento do gene da proteína S uma galinha (Gallus gallus), da Ilha de Marajó-PA, mostrou sequência que foi identificada como uma cepa de IBV. Este trabalho é inédito no Brasil, pois demonstra a presença de Gamma e Deltacoronavírus aviários circulando em diversas regiões, próximo a áreas urbanas e indústrias avícolas, mostrando evidências de que aves silvestres podem carrear estes Coronavírus entre diferentes sítios migratórios no Brasil. / Regardless it has never been reported any avian Coronavirus with zoonotic potential, species of both wild and domestic birds can carry CoVs of great economic importance as the Infectious Bronchitis Virus (IBV). Furthermore, recently, many new CoVs, genetically distinct from IBV have been identified in different families of wild and domestic birds and mammals. Even though Brazil contains 18% of the bird species diversity in the world studies about the presence of Coronaviruses in wild birds are still quite scarce. This study aims to perform retrospective analysis of the presence of coronavirus in wild birds and domestic samples of different Brazilian regions collected between the years 2004 and 2013 by RT PCR and to perform molecular characterization and phylogenetic analysis in order to correlate its epidemiology to routes of bird migrations , the proximity of urban and poultry industry regions , verifying the possibility of transmission. Of the amount of 746 samples tested, 25 were positive for Coronavirus in PCR and nested PCR tests with primers for RpRd gene and were sequenced. We have succeeded in sequencing 7 of these samples which 4 were positive for Gammacoronavirus and 3 for Deltacoronavirus. In attempt of sequencing the S protein gene, we have succeeded in a chicken sample (Gallus gallus) from Ilha de Marajó-PA. This sample was identified as a strain of IBV. This work is unprecedented in Brazil, as it demonstrates the presence of Gamma and Deltacoronavirus in birds circulating in different regions, close to urban areas and poultry industries, showing evidence that wild birds may carry these Coronavirus between different migratory sites in Brazil.

A influenza aviária é uma enfermidade viral causada por vírus influenza A que acomete várias espécies de aves. No Brasil, a influenza aviária é considerada uma doença exótica, uma vez que os subtipos H5 e H7 nunca foram detectados. O Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento realiza vigilância permanente para esta enfermidade nos plantéis comerciais de produção avícola e também em aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias com o intuito de detectar precocemente a introdução dos subtipos H5 e H7 no país. No entanto, se desconhece a situação sanitária das aves de subsistência no que se refere à infecção por outros subtipos do vírus da influenza aviária. Considerando a importância deste tipo de criação como fonte de alimentos e de rendimentos em comunidades de baixa renda e o risco que provavelmente representa para a introdução da influenza aviária no Brasil, o objetivo deste trabalho foi monitorar as criações de aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias no período de 2011 a 2015, a fim de verificar a circulação de todos os subtipos do vírus da influenza aviária (AIV). Foram colhidas amostras de soro e suabes de traqueia e cloaca de 2816 aves criadas em onze diferentes sítios de aves migratórias localizados em sete estados brasileiros, totalizando 391 explorações de fundo de quintal amostradas. As amostras de soro (n = 2716) foram submetidas a triagem para pesquisa de anticorpos para a proteína NP do influenza A utilizando-se um kit comercial de ELISA competitivo, com posterior subtipificação das amostras positivas pela técnica de inibição da hemaglutinação para os dezesseis subtipos do vírus influenza A. Os suabes de cloaca e traqueia foram submetidos à prova de PCR em tempo real para detecção do RNA do vírus influenza A. Não foram detectados anticorpos para os subtipos H5 e H7 do AIV, mas anticorpos para os subtipos H1, H3, H4, H6, H8, H9, H10, H12, H13 e H16 foram identificados em aves oriundas de nove dos onze sítios. O RNA do AIV foi detectado em apenas três amostras pertencentes a uma mesma propriedade e nenhum vírus hemaglutinante foi isolado a partir deste material. Os resultados obtidos permitem concluir que os vírus de influenza aviária de baixa patogenicidade circulam em aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias no Brasil e alertam para a importância da ampliação da vigilância ativa nesta população / Avian influenza is a viral disease caused by an influenza A virus and affects various avian species. Avian influenza is considered an exotic disease in Brazil, since H5 and H7 notifiable subtypes have never been detected. The Ministry of Agriculture, Livestock and Food Supply carries out permanent surveillance for avian influenza in commercial poultry production flocks and also in backyard poultry raised in the vicinity of concentration areas of migratory birds with the purpose of detecting the early introduction of H5 and H7 subtypes in the country. However, the health status of backyard poultry in relation to infection by other avian influenza subtypes is unknown. Considering the importance of this kind of family production system as a source of food and revenue for low-income communities and the risk it probably represents for the introduction of avian influenza in Brazil, the aim of this work was monitoring backyard poultry raised in the vicinity of concentration areas of migratory birds from 2011 to 2015 to verify the circulation of all avian influenza virus (AIV) subtypes. Serum samples and cloacal and tracheal swabs were sampled from 2816 birds raised in eleven migratory birds concentration areas located in seven Brazilian states, totaling 391 backyard poultry flocks harvested. Serum samples (n = 2716) were screened using a commercial competitive ELISA kit to detect specific antibodies for the NP protein of the influenza A virus and afterwards the positive samples were subtyped through inhibition hemagglutination assay for the sixteen subtypes of influenza A viruses. Cloacal and tracheal swabs were tested by real-time PCR for detection of the influenza A virus RNA. No antibodies for H5 and H7 subtypes were detected, but antibodies for subtypes H1, H3, H4, H6, H8, H9, H10, H12, H13 e H16 have been identified in birds from nine out of eleven areas. The influenza A virus RNA was detected only in three samples from one flock and no hemagglutinating viruses were isolated from these specimens. Results obtained in this work suggest that low pathogenic avian influenza viruses are circulating in backyard poultry flocks raised in concentration areas of migratory birds in Brazil and alert to the importance of the expansion of active surveillance in this population

Orientadores: Clarice Weis Arns, Fernando Rosado Spilki / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-16T11:29:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Orsi_MariaAngela_D.pdf: 5800043 bytes, checksum: 7c499fd86a0e94ef1057fc62e1ba024f (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: O vírus da doença de Newcastle (VDN) é o agente causador de uma das mais importantes doenças em aves e representa uma ameaça para a indústria avícola. O VDN é um membro da família Paramyxoviridae, subfamília Paramyxovirinae, gênero Avulavirus. São vírus envelopados, não segmentados dotados de genoma RNA de fita simples sentido negativo, associado à doença do trato respiratório, digestivo e nervoso das aves. O Controle da DN se baseia em biossegurança, uso de vacinas e detecção precoce de lotes infectados. No presente estudo, examinamos dez vacinas vivas comercializadas no Brasil quanto à sua estabilidade térmica (ET), virulência e imunogenicidade. Em outra etapa do trabalho, investigou-se a soroprevalência perante o VDN em regiões de produção avícola voltada à exportação ou não de produtos aviários, seguido da detecção do VDN em aves migratórias. Os estudos são complementados pela análise filogenética de VDN isolado de aves comerciais, dos resultados alcançados, cumpre ressaltar: i) os testes de ET revelam elevada estabilidade para as vacinas utilizadas no país, mesmo após dois anos de sua fabricação; ii) o grau de proteção conferido por vacinas vivas contra a DN não depende da virulência residual conforme testes de inoculação intracerebral; iii) a soroprevalência contra VDN em aves nas regiões produtoras e exportadoras, foi de 39,1% e foram isoladas 77 amostras virais, sempre com perfil não-patogênico; iv) sorologia realizada em uma segunda oportunidade detectou-se uma soroprevalência de 28,8% e isolamento de 15 amostras virais que também foram caracterizadas como não-patogênicas; v) observou-se numa soropositividade de 41,7 a 84,3% dependendo da região e isolamento de 12 VDN na região Nordeste, caracterizados como não-patogênicas, indicando que nas áreas não exportadoras circulam vírus de baixa patogenicidade; vi) o genoma dos vírus isolados e das vacinas vivas, atesta que os vírus circulantes em aves comerciais são de provável origem vacinal e pertencem à classe II sendo 71,8% do genótipo II ou La Sota-like e 28,2% do genótipo I ou Ulster-like; vii) por último, a caracterização biológica dos isolados de aves migratórias mostram que há circulação de vírus de baixa e alta patogenicidade em nosso território. Portanto, este conjunto de trabalhos evidencia o status do Brasil como país livre da Doença de Newcastle em aves comerciais / Abstract: Newcastle disease virus (NDV) is the agent that causes one of the most important diseases in birds and represents a threat to industrial aviculture. NDV is a member of the Paramyxoviridae family, Paramyxovirinae subfamily, Avulavirus genus. In the present study, live vaccines commercialized in Brazil were examined in regard to their thermostability (TS), virulence and immunogenicity. In another stage of this work, soroprevalence was investigated, with viral isolation and characterization carried out in poultry production regions focused on production for exportation or domestic commercialization, followed by the detection of the virus in migratory birds. The studies were complemented by phylogenic analysis carried out on the isolates from the commercial birds. From the results obtained, it is important to underscore that i) the tests of TS revealed a high stability of the vaccines used in Brazil, even two years after their manufacture; ii) the level of protection given by live vaccines against NDV does not depend on residual virulence, as confirmed by tests of intracerebral inoculation iii) soroprevalence against NDV in regions with production for exportation was 39.1% and it was possible to isolate 77 samples, always with a non-pathogenic profile; iv) on a second opportunity, a soroprevalence of 28.8% was detected, with isolation of 15 samples, also classified as non-pathogenic; v) in the Brazilian Northeast, a seropositivity of 41.7 to 84.3% was observed depend of region, with isolation of 12 NDVs, characterized as non-pathogenic, indicating that virus of low pathogenicity circulates in those areas that do not export; vi) the genome of the isolated virus and vaccine implies that the circulating virus in commercial birds probably originates from the vaccine and belongs to class II, being 71.8% from genotype II or La Sota-like and 28.2% from genotype I or Ulster-like; vii) finally, the biological characterization of isolates from migratory birds showed that there is circulation of virus of low and high pathogenicity in Brazil. However, this set of studies agrees with the status of Brazil as being a country free of Newcastle disease in commercial birds / Doutorado / Ciencias Basicas / Doutor em Clínica Médica

A influenza aviária é uma enfermidade viral causada por vírus influenza A que acomete várias espécies de aves. No Brasil, a influenza aviária é considerada uma doença exótica, uma vez que os subtipos H5 e H7 nunca foram detectados. O Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento realiza vigilância permanente para esta enfermidade nos plantéis comerciais de produção avícola e também em aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias com o intuito de detectar precocemente a introdução dos subtipos H5 e H7 no país. No entanto, se desconhece a situação sanitária das aves de subsistência no que se refere à infecção por outros subtipos do vírus da influenza aviária. Considerando a importância deste tipo de criação como fonte de alimentos e de rendimentos em comunidades de baixa renda e o risco que provavelmente representa para a introdução da influenza aviária no Brasil, o objetivo deste trabalho foi monitorar as criações de aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias no período de 2011 a 2015, a fim de verificar a circulação de todos os subtipos do vírus da influenza aviária (AIV). Foram colhidas amostras de soro e suabes de traqueia e cloaca de 2816 aves criadas em onze diferentes sítios de aves migratórias localizados em sete estados brasileiros, totalizando 391 explorações de fundo de quintal amostradas. As amostras de soro (n = 2716) foram submetidas a triagem para pesquisa de anticorpos para a proteína NP do influenza A utilizando-se um kit comercial de ELISA competitivo, com posterior subtipificação das amostras positivas pela técnica de inibição da hemaglutinação para os dezesseis subtipos do vírus influenza A. Os suabes de cloaca e traqueia foram submetidos à prova de PCR em tempo real para detecção do RNA do vírus influenza A. Não foram detectados anticorpos para os subtipos H5 e H7 do AIV, mas anticorpos para os subtipos H1, H3, H4, H6, H8, H9, H10, H12, H13 e H16 foram identificados em aves oriundas de nove dos onze sítios. O RNA do AIV foi detectado em apenas três amostras pertencentes a uma mesma propriedade e nenhum vírus hemaglutinante foi isolado a partir deste material. Os resultados obtidos permitem concluir que os vírus de influenza aviária de baixa patogenicidade circulam em aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias no Brasil e alertam para a importância da ampliação da vigilância ativa nesta população / Avian influenza is a viral disease caused by an influenza A virus and affects various avian species. Avian influenza is considered an exotic disease in Brazil, since H5 and H7 notifiable subtypes have never been detected. The Ministry of Agriculture, Livestock and Food Supply carries out permanent surveillance for avian influenza in commercial poultry production flocks and also in backyard poultry raised in the vicinity of concentration areas of migratory birds with the purpose of detecting the early introduction of H5 and H7 subtypes in the country. However, the health status of backyard poultry in relation to infection by other avian influenza subtypes is unknown. Considering the importance of this kind of family production system as a source of food and revenue for low-income communities and the risk it probably represents for the introduction of avian influenza in Brazil, the aim of this work was monitoring backyard poultry raised in the vicinity of concentration areas of migratory birds from 2011 to 2015 to verify the circulation of all avian influenza virus (AIV) subtypes. Serum samples and cloacal and tracheal swabs were sampled from 2816 birds raised in eleven migratory birds concentration areas located in seven Brazilian states, totaling 391 backyard poultry flocks harvested. Serum samples (n = 2716) were screened using a commercial competitive ELISA kit to detect specific antibodies for the NP protein of the influenza A virus and afterwards the positive samples were subtyped through inhibition hemagglutination assay for the sixteen subtypes of influenza A viruses. Cloacal and tracheal swabs were tested by real-time PCR for detection of the influenza A virus RNA. No antibodies for H5 and H7 subtypes were detected, but antibodies for subtypes H1, H3, H4, H6, H8, H9, H10, H12, H13 e H16 have been identified in birds from nine out of eleven areas. The influenza A virus RNA was detected only in three samples from one flock and no hemagglutinating viruses were isolated from these specimens. Results obtained in this work suggest that low pathogenic avian influenza viruses are circulating in backyard poultry flocks raised in concentration areas of migratory birds in Brazil and alert to the importance of the expansion of active surveillance in this population

Made available in DSpace on 2016-08-17T15:00:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Roberta Kelley Pinheiro Soares.pdf: 605141 bytes, checksum: ffca594929daff1eb6453fdbe24415e1 (MD5) Previous issue date: 2008-02-15 / The aim of this work was demonstrate the spacial and temporal distribution of resident and migratory waterbirds in Santo Amaro Lake, municipality of Santo Amaro do Maranhão, in the West side of Parque Nacional dos Lençóis Maranheses, Maranhão State. This lake has 6000 ha total area and in the reason of it s huge extension it was splited in three places: Alagadiço (2200 ha), near Santo Amaro municipality and fulltime flooded; Guaperiba/Ponta Verde Lake (2200 ha), with sandbanks and open areas, presenting a quick decreasing of the water level; and Taquari Lake (1600 ha), with most of It s margin surrounded with dunes and huge open areas, fulltime flooded, but without macrophitas, presenting only sandbank vegetation. During the rainy season the observer conducted the census from the motorboat at a velocity of 6 km/h, percurring a transect paralell to the lake s margin. In dry station the census was made through a fixed point using animal tracking for locomotion. A total of 3.335 waterbirds were counted with 18 species. The resident birds had greater abundance in the rainy season. The most exploited site in both seasons was Alagadiço. The dry season presented greater abundance of migratory birds corresponding to their arrival from breeding areas in Northern Hemisphere. In both seasons Taquari lake was the most exploited by those birds. Resident birds breeds in Santo Amaro Lake in the rainy season and the gulls - believed as an isolated population - used the Lake to foraging while breeding in the dunes near Taquari lake. It s very important to create a management plan for the Parque Nacional dos Lençóis Maranhenses, specially to Santo Amaro Lake, being the lake used by a great diversity of resident and migratory waterbirds and used by the humans in the subsisting fishery activities. The sustainable use of the Lake warrants the Biota continuity on it, what also assure a good life condition for the people around Santo Amaro Lake. / Este trabalho tem por objetivo demonstrar a distribuição espacial e temporal das aves residentes e migratórias no Lago de Santo Amaro do Maranhão, localizado no município de Santo Amaro, porção oeste do Parque Nacional dos Lençóis Maranhenses. O Lago apresenta uma área de 6000 ha e devido a sua grande extensão, optou-se por compartimentá-lo em três sítios: Alagadiço (2200 ha), mais próximo do município de Santo Amaro e permanentemente inundado; Lago Guaperiba/Ponta Verde (2000 ha), com restingas e áreas abertas apresentando rápida descida de nível d água; Lago Taquari (1600 ha), com maior parte margeada por dunas e grandes áreas abertas, apresentando área permanentemente inundada, porém sem macrófitas sendo dominado por vegetação de restinga. Para a realização do censo durante o período chuvoso, foi utilizado como meio de locomoção um pequeno barco a motor com velocidade de 6 km/h, percorrendo um transecto na margem do Lago. No período seco o censo foi realizado por pontos de observação fixos utilizando tração animal para locomoção. Foram observadas 3.335 aves divididas em 18 espécies. A abundância de aves residentes foi maior no período chuvoso, sendo o sítio Alagadiço o mais explorado em todos os períodos. O período seco apresentou maior abundância de aves migratórias neárticas, coincidindo com a chegada de suas áreas de reprodução no Hemisfério Norte. O sítio Taquari foi mais explorado por essas aves em todos os períodos. Aves residentes reproduziram no Lago de Santo Amaro no período chuvoso e as gaivotas - acredita-se que seja uma população isolada - também utilizavam-no para forrageio, enquanto reproduziam nas dunas próximas ao Lago Taquari. É de fundamental importância que seja traçado um plano de manejo para o Parque Nacional dos Lençóis Maranhenses, em particular, para o Lago de Santo Amaro, já que este é utilizado por grande diversidade de aves aquáticas residentes e migratórias, bem como por humanos para atividade pesqueira de subsistência. Seu uso sustentável garante a continuidade da biota no Lago de Santo Amaro, o que garante também a qualidade de vida das pessoas que usam o Lago de Santo Amaro.

Made available in DSpace on 2016-08-18T17:23:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Daniel Rocha.pdf: 2551995 bytes, checksum: 65ba8cf188c0a50be02f159bd8286406 (MD5) Previous issue date: 2014-02-20 / Assessment of compliance of the Program Monitoring Migratory Birds (PMMB) during deployment pier in San Luis - MA, through documents obtained from the entrepreneur and the environmental agency. It was shown in this study that several PMMB guidelines were not followed and the results showed different patterns of the studies of other authors for the same region. Therefore, the PMMB was not completed as proposed and the results of monitoring may have been committed in this sense is not possible to define the dynamics of interference in birds studied by the project. / Avaliação do cumprimento do Programa de Monitoramento de Aves Migratórias (PMAM) durante a implantação de píer em São Luís MA, por meio de documentos obtidos junto ao empreendedor e ao órgão ambiental. Foi evidenciado nessa pesquisa que várias diretrizes do PMAM não foram seguidas e que os resultados mostraram padrões diferentes dos estudos de outros autores, para a mesma região. Portanto, o PMAM não foi cumprido conforme proposto e os resultados dos monitoramentos podem ter ficado comprometidos, nesse sentido não é possível definir a interferência na dinâmica das aves estudadas por parte do empreendimento.

Apesar de ainda não terem sido relatados Coronavírus aviários com potencial zoonótico, espécies de aves silvestres e domésticas podem portar CoVs de grande importância econômica como o vírus da Bronquite Infecciosa (IBV). Além disso, nos últimos anos, diversos novos CoVs geneticamente distintos do IBV vêm sendo identificados em diferentes famílias de aves e mamíferos silvestres e domésticos. O Brasil contem 18% do total da diversidade de espécies de aves no mundo, no entanto, estudos sobre a presença de Coronavírus em aves silvestres ainda são bastante escassos. O presente estudo tem por objetivo realizar análise retrospectiva da presença de Coronavírus em amostras de aves silvestres e domésticas de diferentes regiões brasileiras coletadas entre os anos de 2004 e 2013 através de RT-PCR; realizar a caracterização molecular e a análise filogenética afim de correlacionar sua epidemiologia às rotas de migrações de aves, à proximidade das regiões urbanas e de granjas avícolas, verificando a possibilidade de transmissão. Do total de 746 amostras testadas, 25 apresentaram resultados positivos para os Coronavírus com primers para o gene da RpRd e foram sequenciadas. Obtivemos sucesso no sequenciamento de 7 dessas amostras, sendo 4 positivas para Gammacoronavírus e 3 positivas para Deltacoronavírus. Na tentativa de sequenciamento do gene da proteína S uma galinha (Gallus gallus), da Ilha de Marajó-PA, mostrou sequência que foi identificada como uma cepa de IBV. Este trabalho é inédito no Brasil, pois demonstra a presença de Gamma e Deltacoronavírus aviários circulando em diversas regiões, próximo a áreas urbanas e indústrias avícolas, mostrando evidências de que aves silvestres podem carrear estes Coronavírus entre diferentes sítios migratórios no Brasil. / Regardless it has never been reported any avian Coronavirus with zoonotic potential, species of both wild and domestic birds can carry CoVs of great economic importance as the Infectious Bronchitis Virus (IBV). Furthermore, recently, many new CoVs, genetically distinct from IBV have been identified in different families of wild and domestic birds and mammals. Even though Brazil contains 18% of the bird species diversity in the world studies about the presence of Coronaviruses in wild birds are still quite scarce. This study aims to perform retrospective analysis of the presence of coronavirus in wild birds and domestic samples of different Brazilian regions collected between the years 2004 and 2013 by RT PCR and to perform molecular characterization and phylogenetic analysis in order to correlate its epidemiology to routes of bird migrations , the proximity of urban and poultry industry regions , verifying the possibility of transmission. Of the amount of 746 samples tested, 25 were positive for Coronavirus in PCR and nested PCR tests with primers for RpRd gene and were sequenced. We have succeeded in sequencing 7 of these samples which 4 were positive for Gammacoronavirus and 3 for Deltacoronavirus. In attempt of sequencing the S protein gene, we have succeeded in a chicken sample (Gallus gallus) from Ilha de Marajó-PA. This sample was identified as a strain of IBV. This work is unprecedented in Brazil, as it demonstrates the presence of Gamma and Deltacoronavirus in birds circulating in different regions, close to urban areas and poultry industries, showing evidence that wild birds may carry these Coronavirus between different migratory sites in Brazil.

Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-05-09T12:19:17Z No. of bitstreams: 1 DissBR.pdf: 1048371 bytes, checksum: a7b21c9d34f402da02fa685209276dbe (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-05-10T17:54:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissBR.pdf: 1048371 bytes, checksum: a7b21c9d34f402da02fa685209276dbe (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-05-10T17:54:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissBR.pdf: 1048371 bytes, checksum: a7b21c9d34f402da02fa685209276dbe (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-10T18:02:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissBR.pdf: 1048371 bytes, checksum: a7b21c9d34f402da02fa685209276dbe (MD5) Previous issue date: 2016-10-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Estuaries are highly productive environments susceptible to environmental variables, and important to the life cycle of various species, to waterfowl serve as a point of rest, feeding and nesting. These sites also receive migratory birds seeking the accumulation of energy required for the return to the reproductive areas. These species, as well as residents, have their distribution, occurrence, abundance and behavior influenced by environmental variables, seasonality and human presence. Thus this study aimed to characterize the structure of the community of waterfowl, as well as behavioral pattern, relationship with environmental variables and habitat use by them in the mouths of the rivers Tijucas and Inferninho. The Tijucas’ Bay where this study was conducted, presents sediment deposition and formation of extensive muddy plans. To collect the data length of 1.1 km was covered in each mouth, from June 2015 to May 2016, sampling occurred every two hours, from 08 hours to 16 hours. The data collected were species, average number, activity and micro-habitat. five microhabitats were considered, based on different faces found in two locations, and analyzed environmental variables were: wind speed, tide height, precipitation and temperature. The curve of rarefaction and Jackknife 2 were used to determine the sample sufficiency, Shannon index was used to estimate the annual and monthly diversity and similarity among the studied areas was calculated using the Jaccard index. Analysis of Variance (ANOVA) and Kruskal-Wallis test were used to determine the differences between species richness, average number and behavior of the species for hours and months of sampling. The behavior relative frequency was grouped by similarity of Bray-Curtis, the Indicator Species Analysis was used to determine the association of species with micro-habitats, and used Canonical Correlation Analysis (CCA) to determine the correlation between the variables environmental and behavior and between species. Were recorded 44 species of waterfowl in the voices of the two rivers, 10 migratory. The similarity between the two areas was 75%, indicating high similarity of microhabitats between areas. The diversity at the mouth of the river Tijucas was higher than the mouth of the river Inferninho, this difference is related to river discharge of rivers, hence the nutrient input. The difference in species richness, abundance was significant only between the months of observation, and the months with the highest diversity occurred in the late spring, summer and early fall, probably due to the life cycle and arrival of migratory species. The rest was the most frequent activity, followed by foraging, this was negatively related to temperature variation, it suggests that the higher the temperature, the lower the foraging, avoiding waste of energy and water. Foraging was negatively correlated with the height of the tide as the low tide provides a food resource. The indicator species analysis showed that most of the species was associated with only one micro-habitats, this can be explained by the abundance of available resource, since rich environments allow specialization of species. / Os estuários são ambientes de elevada produtividade, suscetíveis a variáveis ambientais, e importantes para o ciclo de vida de diversas espécies, para as aves aquáticas servem como ponto de descanso, alimentação e nidificação. Esses locais ainda recebem aves migratórias que buscam o acúmulo de energia necessário para o regresso às áreas reprodutivas. Essas espécies, assim como as residentes, têm suas distribuição, ocorrência, abundância e comportamento influenciados pelas variáveis ambientais, sazonalidade e presença humana. Dessa forma esse estudo teve o objetivo de caracterizar a estrutura da comunidade de aves aquáticas, bem como padrão comportamental, relação com variáveis ambientais e uso de hábitat pelas mesmas nas fozes dos rios Tijucas e Inferninho. A Baía de Tijucas, onde esse trabalho foi realizado, apresenta deposição de sedimento e formação de extensos planos lamosos. Para coletar os dados a extensão de 1,1 km foi percorrida em cada foz, de junho de 2015 a maio de 2016, as amostragens ocorreram a cada duas horas, das 08 horas às 16 horas. Os dados coletados foram: espécie, número médio, atividade realizada e micro-habitat ocupado. Foram considerados cinco micro-hábitats, baseado nas diferentes fisionomias encontradas nos dois locais, e as variáveis ambientais analisadas foram: velocidade do vento, altura da maré, precipitação e temperatura. A curva de rarefação e Jackknife 2 foram usados para determinara a suficiência amostral, o índice de Shannon foi usado para estimar a diversidade anual e mensal, e a similaridade entre as áreas estudadas foi calculado através do índice de Jaccard. Análise de Variância (ANOVA) e teste de Kruskal-Wallis foram usados para determinar as diferenças entre riqueza, número médio e comportamento das espécies por horário e meses de amostragem. A frequência relativa de comportamentos foi agrupada pela similaridade de Bray-Curtis, a Análise de Espécie foi usada para determinar a associação das espécies com os micro-habitats, e usou-se Análise de Correlação Canônica (CCA) para determinar a correlação entre as variáveis ambientais e comportamentos e entre espécies. Foram registradas 44 espécies de aves aquáticas nas fozes dos dois rios, sendo 10 migratórias. A similaridade entre as duas áreas foi de 75%, indicando alta semelhança de micro-habitats entre as mesmas. A diversidade na foz do rio Tijucas foi maior que a foz do rio Inferninho, essa diferença está relacionada a descarga fluvial dos rios, consequentemente ao aporte de nutrientes. A diferença de riqueza, abundancia foi significativa apenas entre os meses de observação, e os meses com maiores diversidades ocorreram no final da primavera, verão e começo do outono, provavelmente devido ao ciclo de vida e chegada das espécies migratórias. O descanso foi a atividade mais frequente, seguido de forrageio, este esteve negativamente relacionada a variação de temperatura, sugere que quanto maior a temperatura, menor o forrageio, evitando dispêndio de energia e água. O forrageio esteve negativamente relacionado com a altura da maré, já que a maré baixa disponibiliza recurso alimentar. A análise de espécies indicadoras apontou que a maior parte das espécies esteve associada a apenas um micro-habitat, isso pode ser explicado pela abundância de recurso disponível, já que ambientes ricos permitem a especialização das espécies.