Orientador : Jose Norberto W. Dachs / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Ciencia da Computação / Made available in DSpace on 2018-07-16T19:29:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RojasRojas_FranciscoAntonio_M.pdf: 2171210 bytes, checksum: 33f9db53d3598c45a60c49fadadbffe1 (MD5) Previous issue date: 1986 / Resumo: O problema de diagnóstico em ajustes, lineares ou não, tem obtido Grande atenção na literatura nos últimos oito anos, notadamente nos últimos cinco. Para o caso de ajustes lineares as duas técnicas mais comumente usadas hoje são o D de Cook e o DFFITS. Neste trabalho são provadas algumas propriedades dessas estatísticas e, principalmente, estudado empiricamente seu desempenho para um conjunto de dados. Conclue-se que o DFFITS deve ser preferido com relação ao D de Cook por sua capacidade não só de detectar possíveis pontos influentes no espaço dos x's mas também valores aberrantes dos y's / Abstract: The problem of diagnostics in linear and non linear fitting has deserved great attention in the technical literature for the past eight years, markedly in he last five ones. In the linear fitting problem the two most commonly used techniques are cook's D and DFFITS. In this work some properties of these statistics are proved but mainly their performance is studied empirically for a selected data set. The conclusion is that the DFFITB should be preferred to Cook's D, due to its ability to detected not only potentially influential points in the x's space but also outlying values in the y'S / Mestrado / Mestre em Estatística

Resumo: A idade ao primeiro parto (IPP) e a produtividade acumulada (PAC) são características utilizadas para avaliar o desempenho reprodutivo dos bovinos de corte. Com o objetivo de estudar a variação fenotípica destas características e as associações genéticas existentes com outras de interesse econômico, dados de animais do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN - Nelore Brasil) foram utilizados para estimar, pelo método de máxima verossimilhança restrita, parâmetros genéticos e tendências genéticas de IPP e PAC. Análises bi-característica foram efetuadas entre IPP e PAC e entre estas e peso corporal das fêmeas corrigido para 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, e perímetro escrotal dos machos corrigidos para 365 (PE365), 450 (PE450), 550 (PE550) e 730 (PE730) dias de idade. As tendências genéticas de PAC e IPP foram favoráveis indicando que os critérios de seleção adotados nestas fazendas estão favorecendo estas características. As médias de herdabilidades estimadas para IPP e PAC foram de 0,03 e 0,19, respectivamente. A seleção baseada no P365 ou P450 visando melhorar a IPP seria mais eficiente do que a seleção direta para esta característica. A seleção com base na PAC poderá favorecer as fêmeas com maiores P365, P450 e menores IPP. Nestes rebanhos, o perímetro escrotal não está associado geneticamente a IPP e ao índice PAC. / Abstract: Age at First Calving (AFC) and Accumulated Productivity (ACP) are traits used to evaluate the reproductive performance of the beef cattle. The knowledge of the existing genetic relationships between these traits and those that respond to the selection can aid the selective process. Data of a Brazilian Nelore cattle breeding program were used to estimate via REML the genetic, phenotypic and environmental parameters as well as the genetic trends of AFC and ACP. Bi-trait analyses were performed between AFC and ACP and between these traits and the heifers’ body weight adjusted to 365 (W365) and 450 (W450) days of age, and the males’ scrotal circumference adjusted to 365 (P365), 450 (P450), 550 (P550) and 730 (P730) days of age. The genetic trends of the AFC and ACP were favorable, indicating genetic gains of -0.011 days per year for AFC and 0.1655 kg of weaned calves per year for ACP. The means of estimated heritabilities for AFC and ACP were 0.03 and 0.19, respectively. The indirect selection for AFC by W365 and W450 is more efficient than the direct selection. The estimated genetic correlations indicated that the heavier heifers at these ages were the ones that produced more kilograms of weaned calves per year and had earlier AFC. In these herds, the males’ scrotal circumference was not genetically associated with AFC and ACP. / Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientadora: Cláudia Cristina Paro de Paz / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Raysildo Barbosa Lôbo / Mestre

Orientador: Luzia Aparecida Trinca / Banca: Francisco Marcelo Monteiro / Banca: Rogerio Antonio de Oliveira / Resumo: Encontrar delineamentos experimentais eficientes para modelos não-lineares, amplamente utilizados em farmacocinética, exige integração numérica sobre o espaço dos parâmetros e otimização numérica sobre o espaço do delineamento, duas tarefas computacionalmente muito exigentes. O esforço computacional aumenta á medida que o número de parâmetros do modelo aumenta. Assim, há uma necessidade de métodos rápidos e precisos para a resolução do problema. O objetivo desta pesquisa é aplicar e explorar a performance das regras básicas de quadratura múltipla BF e B_F e de um algoritmo adaptativo para a aproximação de integrais múltiplas implementados em cubature (código C por Steven G. Johnson e R por Balasubramanian Narasimhan, 2009) do R (R Development Core Team, 2012). Os delineamentos D- ótimos encontrados utilizando esta abordagem para dois modelos não-lineares em farmacocinética, decaimento exponencial (um parâmetro) e monocompartimental (três parâmetros), no contexto de efeitos fixos e efeitos mistos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Finding efficient experimental designs for nonlinear models widely used in pharmacokinetics requires numerical integration over the parameter's space and numerical optimization over the design's space, two computationally demanding tasks. Computational effort increases as the number of parameters in the model increases. Thus, there is a need for fast and accurate methods to solve the problem. The purpose of this research is to apply and explore the performance of the basic rules BF and B F and of an adaptive algorithm for approximating multiple integrals implemented in cubature (C code by Steven G. Johnson and R by Balasubramanian Narasimhan, 2009) in R (R Development Core Team, 2012). The obtained D-optimum designs using this approach for two pharmacokinetic nonlinear models, exponential decay (one parameter) and mono-compartmental (three parameters), in the context of fixed and mixed effects were compared with designs of experiments found byButton (1979), Atkinson et al. (2007), Gotwalt et al. (2009), in case of... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

A variabilidade espaçotemporal das inundações determinam os processos ecológicos e influenciam as atividades humanas no Pantanal. O entendimento da dinâmica das inundações é a chave para melhores práticas de gerenciamento e reação no caso de eventos extremos. Nesse estudo, métodos de quantificação de água e extração de sazonalidade foram aplicados numa série temporal de dez anos (2000 a 2009) das imagens MODIS13Q1 para a modelagem contínua das inundações. Foram determinadas 25 sub-regiões, totalizando 150.502 km2, baseado no regime das inundações e na geomorfologia. A área inundada variou de 5.539 km2 até 52.894 km2, com média de 18.329 km2, refletindo um período seco comparado às décadas anteriores. A maior parte do Pantanal (86.841 km2) inundou pelo menos uma vez no período, mas uma área relativamente grande permaneceu não inundada ou inundou por um período curto de tempo. Áreas não inundadas ou inundadas por curtos períodos de tempo ficaram espalhadas por todo o Pantanal, enquanto que áreas que inundam por longos períodos de tempo ou permanentemente inundadas se concentraram apenas em alguns locais. Quatro estágios principais de inundação foram determinados e os principais fluxos e armazenagem de água foram mapeados embora tenha ocorrido uma alta variabilidade interanual. Apesar das limitações de escala e problemas de sobreposição dos mapas, foi obtida uma boa concordância entre o mapa de frequência de inundação e os mapas de vegetação e solos. Modelos estatísticos logísticos não lineares foram determinados para as relações entre os principais compartimentos hidrológicos e foi possível estimar cenários passados de inundação baseado na relação entre a área inundada total do Pantanal e o nível do rio Paraguai. Relações de similaridade e de fluxos de água foram determinados entre os sub-compartimentos, caracterizando o comportamento espacial e temporal da água. Baseado nos dados e informações gerados foi proposto um sistema de alerta de inundações e secas para o Pantanal (SISMONPAN). / The flood variability in space and time determine the ecological process and influences human activities in the Pantanal wetland. The understanding of the flood dynamics is the key for better management practices and reaction in case of extreme events. In this study, methods for water quantification and seasonality extraction were applied to a ten years time series (2000 to 2009) of MODIS13Q1 images for continuous modeling of floods. Based in flood regime and geomorphology an area of 150.502 Km2 distributed in 25 sub-regions was determined for the Pantanal. The flooded area varied from 5.539 km2 to 52.894 km2, averaging 18.329km2, reflecting a dry period compared with the previous decades. Most of the Pantanal (86.841 km2) flooded at least once in the period, but a relative big area keeps no flooded or flooded in a short period. No flooded or short time flooded areas was spread over all the Pantanal, while long time to permanent flooded areas were concentrated in just some spots. Four main stages of floods were determined and the main water fluxes and water storage areas were mapped, although a high inter annual variability has been occurred. Despite the limitations of scale and map matching, a good agreement between flood frequency map with vegetation and soils maps was obtained. Nonlinear Logistic statistical models were determined for the relationships between the main hydrological compartments. It was possible to estimate past flood scenarios based in the relationship between total flooded area and Paraguay River stage. Similarity and water fluxes relationships were determined between the sub-compartments, characterizing the spatial and temporal water behavior. Based on the data and information generated, an alert system for dry and flood events (SISMONPAN) was proposed for the Pantanal.

Este trabalho tem como objetivo aplicar a teoria de modelos mistos ao estudo do teor de nitrogênio e carbono no solo, em diversas profundidades. Devido a grande quantidade de matéria orgânica no solo, o teor de nitrogênio e carbono apresentam alta variabilidade nas primeiras profundidades, além de apresentar um comportamento não linear. Assim, fez-se necessário utilizar a abordagem de modelos não lineares mistos a dados longitudinais. A utilização desta abordagem proporciona um modelo que permite modelar dados não lineares, com heterogeneidade de variâncias, fornecendo uma curva para cada amostra. / This paper has as an objective to apply the theory of mixed models to the content of nitrogen and carbon in the soil at various depths. Due to the large amount of organic material in the soil, the content of nitrogen and carbon present high variability in the depths of soil surface, and present a nonlinear behavior. Thus, it was necessary to use the approach of nonlinear mixed models to longitudinal data analysis. The use of this approach provides a model that allows to model nonlinear data with heterogeneity of variances by providing a curve for each sample.

A produção de milho tem uma grande importância para o país. Ter o conhecimento sobre o crescimento da planta é de fundamental importância para seu manejo. Pode-se obter esse conhecimento fazendo um estudo por meio de modelos de crescimento, para se obter informações por meio de parâmetros com interpretações biológicas que trazem consigo um resumo sobre a curva característica do crescimento da planta, que podem ajudar no planejamento da cultura e principalmente conhecer qual período a planta mais cresce, a época mais adequada para adubação e realização do controle de pragas. Considerar características não comuns de suposições do modelo pode dar maior confiabilidade nos resultados do ajuste, como por exemplo a consideração da heterocedasticidade e não normalidade residual. Sendo assim, esse trabalho teve o objetivo de ajustar o modelo logístico considerando a heterocedasticidade e diferentes distribuições para o erro como normalidade, assimetria normal e assimetria t-student, a dados da altura da planta do milho do híbrido transgênico 30F35 Y (Yieldgard), observados ao longo do tempo. O experimento foi realizado no município de Votuporanga-SP, em área experimental do Pólo Regional Noroeste Paulista da APTA (Agência Paulista de Tecnologia dos Agro-negócios), no ano agrícola 2011/2012. A primeira medição da altura da planta de milho foi realizada 15 dias após a semeadura. As medições seguintes ocorreram com 30, 40, 50 e 122 dias, respectivamente, após a semeadura. Em cada dia de avaliação foi medido a altura das plantas em centímetros, com auxílio de uma régua, sendo esta medida da base da planta (solo) até o ápice da última folha expandida do cartucho. Toda a análise foi realizada utilizando o software R. Todos os modelos considerados se ajustaram bem a curva de crescimento do híbrido transgênico 30F35 Y (Yieldgard), porém o modelo logístico considerando erros normais assimétricos foi escolhido como mais adequado para modelar a curva, com base nos avaliadores utilizados. / Maize production is of great importance for the country. Knowing the plant development is of major importance to its management. Such knowledge may be attained through growth curves studies, to obtain information through parameters with biological interpretation which are able to synthesize the plantt\'s growth curve. This synthesis may help in management issues, such as information on the period of most rapid growth, best time to apply fertilizers and control pests. Considering uncommon features of the model assumptions may provide greater reliability on the results of the fitted model, such as residual heteroscedasticity and non-normality. In that sense, this work aimed to fit the logistic model considering variance heterogeneity and different error distributions such as normal, skew-normal and skew-t, to the transgenic hybrid 30F35Y maize height data through time. The experiment was conducted in the municipality of Votuporanga-SP, in an experimental station of the Pólo Regional Noroeste Paulista da Agência Paulista de Tecnologia dos Agro-Negócios (APTA) during the agronomic year of 2011/2012. The first height data measurement was taken 15 days after sewing. The following measurements were taken at 30, 40, 50 and 122 days after sewing. Each day the plant height was measured in centimeters using a ruler, measuring from the plant base (soil) until the edge of the last expanded leaf. All analyses were carried out using software R. All considered models fitted the data reasonably well, however the logistic model considering skew-normal errors was chosen as most adequate to model the data, basing on the goodness-of-fit tests.

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-07Bitstream added on 2014-08-13T18:00:39Z : No. of bitstreams: 1 000756908.pdf: 521999 bytes, checksum: c92d8043980849d8b21f239dd04dac21 (MD5) / Em análise de modelo de crescimento com o objetivo de representar o desenvolvimento de organismos vivos por um período maior que sua fase inicial, utiliza-se, frequentemente, modelos não lineares. O objetivo deste trabalho foi ajustar o modelo não-linear de Gompertz utilizando o software SAS através de três estruturas diferentes: 1) modelo de efeitos fixos; 2) modelo autorregressivo de primeira ordem e 3) modelo de efeito misto a um conjunto de dados de crescimento em peso de ratos da linhagem Rattus norvegicus e para um conjunto de dados de crescimento em peso de vacas de três raças: Flamengas, Guernsey-Gir e Holandesas, para verificar o melhor modelo para os conjuntos de dados obtidos. Para tal, optou-se por seis critérios estatísticos como avaliadores de ajuste. Os critérios foram: Quadrado médio do resíduo, critério de informação de Akaike (AIC), critério de informação Bayesiano (BIC), erro de predição médio (EPM), resíduos nos pontos iniciais, chamadores 0, usado para avaliar o ajuste nas primeiras observações e um índice sendo um valor considerado como avaliador no final do ajuste (calculado pela razão entre os 20% dos maiores valores estimados e a assíntota estimada). Além destes, foram feitos testes de Durbin-Watson e Breusch-Pagan para verificar a independência dos resíduos e a heteroscedasticidade, respectivamente. Os resultados mostram que, em muitas repetiçõees, onde havia a necessidade de correção da autocorrelação e heterocedasticidade, o modelo autorregessivo de primeira ordem foi o melhor ajuste. Já em relação ao ajuste único, nos casos em que a autocorrelação foi significativa, o modelo autorregressivo foi o melhor segundo os critérios e, quando a autocorrelação foi não significativa, o modelo de efeitos fixos foi o melhor modelo / In growth model analyzing to represent the development of organisms for a larger period than its initial phase, it nonlinear models are often used . The aim of this work was to adjust the nonlinear Gompertz model using the software SAS by three different structures: 1) fixed effects model, 2) first-order autoregressive model and 3) mixed-effects model to a data of growth of female and male rats Rattus norvegicus and to a data of growth of three breeds cow to verify the best model for the data obtained. To attach the objective, six criteria was chosen as evaluators of statistical adjustment. The criteria were: residual mean square, Akaike information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), mean prediction error (EPM), residues in starting points, called res 0, used to assess the fit in the first observations and an index value being considered as an evaluator at the end of adjustment (calculated as the ratio between 20% of the largest estimated values and estimated asymptote). In addition, Durbin-Watson and Breusch-Pagan tests were performed to verify the independence of waste and heteroscedasticity, respectively. The results show that in many repetitions, where was need a correction of autocorrelation and heteroscedasticity, the first order autoregressive model was the best fit. In relation to the single adjustment, where the autocorrelation was significant, the autoregressive model was the best, according to the criteria utilized, and when the autocorrelation was not significant, the fixed effects model was the best model

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-08-16Bitstream added on 2014-06-13T19:19:23Z : No. of bitstreams: 1 000750099.pdf: 1001744 bytes, checksum: 9dd55fe10e48e8a981d10f0b406b4ba3 (MD5) / O objetivo foi descrever o crescimento em peso vivo, do fígado, do corpo adiposo, a deposição dos nutrientes corporais e das coxas, do consumo da dieta, e avaliar a eficiência proteica da dieta para rãs-touro na fase de engorda, criadas no sistema anfigranja através do ajuste de dois modelos não lineares o de Gompertz e o Logísitco. As estimativas para os parâmetros do modelo de Gompertz não apresentaram coerência com os resultados observados, diferente para os do modelo Logístico, o qual também apresentou os melhores ajustes para descrever as variáveis estudadas. As deposições máximas dos nutrientes ocorreram dentro do período experimental; sendo a de cinzas primeira e a do extrato etéreo mais tardio. A partir da relação entre deposição de proteína na carcaça e consumo de proteína da ração foi encontrada uma baixa eficiência proteica de 36,76%. O melhor modelo para descrever o consumo da dieta e a deposição dos nutrientes da rã-touro na engorda foi o Logístico. A composição centesimal média das pernas de rãs-touro durante a engorda foi de 79,29% de água, 15,83% de proteína, 1,74% de gordura e 2,99% de cinzas. As deposições máximas dos nutrientes ocorreram dentro do período experimental, sendo a de extrato etéreo a primeira e a de cinzas mais tardia. O melhor modelo para descrever a deposição dos nutrientes da rã-touro na fase de engorda foi o Logístico / The objective of this study was to describe growth rates of live body weight, liver and adipose body/tissue, as well as nutrient deposition on the body and legs and feed intake, in order to assess dietary protein efficiency for bullfrogs during the grow-out phase, raised under the “Amphifarm” system by adjusting two nonlinear models, Gompertz and Logistic. The parameters estimated for the Gompertz model were not consistent with the observed results; unlike the logistic model, which yielded the best fits to describe the variables. The maximum deposition of nutrients occurred within the trial period, with ash first and ether extract later. The low protein efficiency of 36.76% was given by the relationship between protein deposition on the carcass and dietary protein intake. The Logistic model best described the dietary intake of nutrients and nutrient deposition for bullfrogs during the grow-out phase. The average chemical composition of bullfrog legs was 79.29% water, 15.83% protein, 1.74% fat and 2.99% ash. The maximum deposition of nutrients was verified during the trial period; with ether extract first and ash later. The Logistic was the model that best described the deposition of nutrients of bullfrogs during the grow-out phase

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 475570 bytes, checksum: 32a4377514ec0978d86cb9bc9fcb45f1 (MD5) Previous issue date: 2013-07-31 / A hierarchical Bayesian modeling was used to evaluate the influence of halothane gene and its interaction with sex on pig ́s growth curves. Under this approach, the parameters from growth models (Logistic, Gompertz and von Bertalanffy) were estimated jointly with the effects of halothane gene and sex. A total of 344 F2 (Commercial x Piau) animals were weighted at birth, 21, 42, 63, 77, 105 and 150 days in life. The Logistic model has presented the best fit based on DIC (Deviance Information Criterion). Thus, the samples from marginal posterior distributions for the differences between the parameters estimates of Logistic model have indicated that the maturity weight of males with heterozygous genotypes (HALNn) was superior to males with homozygous genotypes (HALNN). In order to realize a comparison with the traditional methodology, the frequentist approach based on two distinct steps also was used, but there was not identified significant differences between growth curve parameter estimates from each group (combinations of halothane genotypes and sex). / Para avaliar a influência do gene halotano sobre a curva de crescimento de suínos, bem como sua interação com o sexo do animal, foi proposta uma modelagem hierárquica Bayesiana. Nesta abordagem, os parâmetros dos modelos não-lineares de crescimento (Logístico, Gompertz e von Bertalanffy) foram estimados conjuntamente com os efeitos de sexo e genótipos do gene halotano. Foram utilizados 344 animais F2(Comercial x Piau) pesados ao nascer, aos 21, 42, 63, 77, 105 e 150 dias. O modelo Logístico foi aquele que apresentou melhor qualidade de ajuste por apresentar menor DIC (Deviance Information Criterion) que os demais. As amostras das distribuições marginais a posteriori para as diferenças entre as estimativas dos parâmetros do modelo Logístico indicaram que o peso dos machos à idade adulta com genótipo heterozigoto (HALNn) foi superior ao dos homozigotos (HALNN). A título de comparação, também foi considerada a abordagem frequentista tradicional baseada em dois passos distintos, a qual, por apresentar um menor poder de discernimento estatístico, não mostrou diferenças significativas.

Orientador: Lídia Raquel de Carvalho / Banca: Jose Silvio Govone / Banca: Silvio Sandoval Zocchi / Resumo: Em análise de modelo de crescimento com o objetivo de representar o desenvolvimento de organismos vivos por um período maior que sua fase inicial, utiliza-se, frequentemente, modelos não lineares. O objetivo deste trabalho foi ajustar o modelo não-linear de Gompertz utilizando o software SAS através de três estruturas diferentes: 1) modelo de efeitos fixos; 2) modelo autorregressivo de primeira ordem e 3) modelo de efeito misto a um conjunto de dados de crescimento em peso de ratos da linhagem Rattus norvegicus e para um conjunto de dados de crescimento em peso de vacas de três raças: Flamengas, Guernsey-Gir e Holandesas, para verificar o melhor modelo para os conjuntos de dados obtidos. Para tal, optou-se por seis critérios estatísticos como avaliadores de ajuste. Os critérios foram: Quadrado médio do resíduo, critério de informação de Akaike (AIC), critério de informação Bayesiano (BIC), erro de predição médio (EPM), resíduos nos pontos iniciais, chamadores 0, usado para avaliar o ajuste nas primeiras observações e um índice sendo um valor considerado como avaliador no final do ajuste (calculado pela razão entre os 20% dos maiores valores estimados e a assíntota estimada). Além destes, foram feitos testes de Durbin-Watson e Breusch-Pagan para verificar a independência dos resíduos e a heteroscedasticidade, respectivamente. Os resultados mostram que, em muitas repetiçõees, onde havia a necessidade de correção da autocorrelação e heterocedasticidade, o modelo autorregessivo de primeira ordem foi o melhor ajuste. Já em relação ao ajuste único, nos casos em que a autocorrelação foi significativa, o modelo autorregressivo foi o melhor segundo os critérios e, quando a autocorrelação foi não significativa, o modelo de efeitos fixos foi o melhor modelo / Abstract: In growth model analyzing to represent the development of organisms for a larger period than its initial phase, it nonlinear models are often used . The aim of this work was to adjust the nonlinear Gompertz model using the software SAS by three different structures: 1) fixed effects model, 2) first-order autoregressive model and 3) mixed-effects model to a data of growth of female and male rats Rattus norvegicus and to a data of growth of three breeds cow to verify the best model for the data obtained. To attach the objective, six criteria was chosen as evaluators of statistical adjustment. The criteria were: residual mean square, Akaike information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), mean prediction error (EPM), residues in starting points, called res 0, used to assess the fit in the first observations and an index value being considered as an evaluator at the end of adjustment (calculated as the ratio between 20% of the largest estimated values and estimated asymptote). In addition, Durbin-Watson and Breusch-Pagan tests were performed to verify the independence of waste and heteroscedasticity, respectively. The results show that in many repetitions, where was need a correction of autocorrelation and heteroscedasticity, the first order autoregressive model was the best fit. In relation to the single adjustment, where the autocorrelation was significant, the autoregressive model was the best, according to the criteria utilized, and when the autocorrelation was not significant, the fixed effects model was the best model / Mestre