Doctorat en philosophie et lettres / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Les gènes Hox codent des facteurs de transcription à homéodomain (HD). Bien que ce dernier reconnaisse des séquences similaires in vitro, les protéines Hox achèvent des fonctions hautement spécifiques in vivo. Des séquences protéiques en dehors de l’HD influencent la spécificité d’action des protéines Hox par le recrutement de cofacteurs, dont le mieux caractérisé est Extradenticle (Exd) chez la drosophile. Des travaux récents au sein de notre équipe ont démontré la contribution fonctionnelle de trois motifs de AbdA, aussi bien dans des fonctions Exd-dépendantes qu’à des fonctions Exd-indépendantes. Mon travail de thèse a porté sur la caractérisation de la contribution des motifs protéiques de AbdA dans la sélection puis dans la régulation des gènes cibles en utilisant une approche combinée ChIPseq/RNAseq, dans un contexte Exd-indépendant. Le code ADN identifié nous a renseigné sur la présence d’inputs transcriptionnels additionnels. Ces derniers correspondant à des facteurs de transcription déjà connus, leur présence dans un complexe protéique avec AbdA a été démontrée par des analyses de spectrométrie de masse. Un second volet de mon travail de thèse a été l’identification de modifications post-traductionnelles pouvant rendre compte d’un mécanisme de régulation de l’activité des protéines Hox. Des analyses prédictives in silico, confirmées par des approches biochimiques et des analyses in vivo ont démontré la SUMOylation de AbdA. Ces résultats préliminaires posent les bases pour des travaux futures qui auront pour objectif d’identifier les résidus d’AbdA SUMOylés et d’élucider le rôle de cette modification dans la régulation de l’activité de la protéine AbdA. / Hox genes encode homeodomain-containing transcription factors (HD). Although the HD binds to similar DNA sequences in vitro, Hox proteins display a high functional specificity in vivo. Protein motifs outside of the HD influence Hox specificity through recruiting additional cofactors, with the best characterized being Extradenticle (Exd in Drosophila). Recent evidence from our group has uncovered the functional contribution of AbdA intrinsic motifs to AbdA Exd-dependent functions as well as AbdA Exd-independent functions. My PhD work has aimed to characterize the contribution of AbdA motifs to target gene selection and regulation using a combined approach of ChIPseq/RNAseq in an Exd-independent context. The DNA code identified provides us with new insights about additional transcriptional inputs from additional DNA-binding proteins lying in the vicinity of AbdA recognition sites. Mass spectrometry analysis establishes the occurrence of these additional DNA binding proteins in a multi-protein complex with AbdA. Deciphering the involvement of post-translational modifications in the regulation of Hox protein activity was another aspect of my PhD work. In silico predictive analysis, followed by biochemical approaches and in vivo assays reveal the potential for SUMOylation of AbdA as a potentially important regulatory component of AbdA activity. These preliminary results set the bases for further work aimed at identifying SUMOylated residues on AbdA and the functional relevance of such post-translational modification on AbdA activity regulation.

L'information occupe désormais une place centrale dans notre vie quotidienne, elle est à la fois omniprésente et facile d'accès. Pourtant, l'extraction de l'information à partir des données est un processus souvent inaccessible. En effet, même si les méthodes de fouilles de données sont maintenant accessibles à tous, les résultats de ces fouilles sont souvent complexes à obtenir et à exploiter pour l'utilisateur. La fouille de motifs combinée à l'utilisation de contraintes est une direction très prometteuse de la littérature pour à la fois améliorer l'efficience de la fouille et rendre ses résultats plus appréhendables par l'utilisateur. Cependant, la combinaison de contraintes désirée par l'utilisateur est souvent problématique car, elle n'est pas toujours adaptable aux caractéristiques des données fouillées tel que le bruit. Dans cette thèse, nous proposons deux nouvelles contraintes et un algorithme pour pallier ce problème. La contrainte de robustesse permet de fouiller des données bruitées en conservant la valeur ajoutée de la contrainte de contiguïté. La contrainte de clôture allégée améliore l'appréhendabilité de la fouille de motifs tout en étant plus résistante au bruit que la contrainte de clôture classique. L'algorithme C3Ro est un algorithme générique de fouille de motifs séquentiels intégrant de nombreuses contraintes, notamment les deux nouvelles contraintes que nous avons introduites, afin de proposer à l'utilisateur la fouille la plus efficiente possible tout en réduisant au maximum la taille de l'ensemble des motifs extraits. C3Ro rivalise avec les meilleurs algorithmes de fouille de motifs de la littérature en termes de temps d'exécution tout en consommant significativement moins de mémoire. C3Ro a été expérimenté dans le cadre de l’extraction de compétences présentes dans les offres d'emploi sur le Web / Information now occupies a central place in our daily lives, it is both ubiquitous and easy to access. Yet extracting information from data is often an inaccessible process. Indeed, even though data mining methods are now accessible to all, the results of these mining are often complex to obtain and exploit for the user. Pattern mining combined with the use of constraints is a very promising direction of the literature to both improve the efficiency of the mining and make its results more apprehensible to the user. However, the combination of constraints desired by the user is often problematic because it does not always fit with the characteristics of the searched data such as noise. In this thesis, we propose two new constraints and an algorithm to overcome this issue. The robustness constraint allows to mine noisy data while preserving the added value of the contiguity constraint. The extended closedness constraint improves the apprehensibility of the set of extracted patterns while being more noise-resistant than the conventional closedness constraint. The C3Ro algorithm is a generic sequential pattern mining algorithm that integrates many constraints, including the two new constraints that we have introduced, to provide the user the most efficient mining possible while reducing the size of the set of extracted patterns. C3Ro competes with the best pattern mining algorithms in the literature in terms of execution time while consuming significantly less memory. C3Ro has been experienced in extracting competencies from web-based job postings

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La syrinx, flûte champêtre à multiples tuyaux, est surtout connue comme la "flûte de Pan", parce que Pan, ce dieu mi-homme, mi-chèvre, en serait le créateur. Cependant, chez d’autres auteurs anciens il y a des versions différentes. Mais c’est surtout à partir de mosaïques et de peintures comprises entre le IIè s. av. J.-C. et le IVè s. ap. J.-C. que nous prenons conscience que cette flûte est l’attribut d’autres personnages soit: les satyres, les putti, les bergers etc., ce qui a comme conséquence de changer le symbolisme de l’instrument. Nous constatons que la syrinx est spécifiquement rattachée au domaine champêtre comme nous le montrent non pas seulement nos peintures et nos mosaïques analysées, mais aussi d’autres types de support comparatif : sarcophage, statue, monnaie, textile, vase etc. Enfin, toujours à partir de nos monuments, une typologie a été dressée pour ressortir les différents modèles de syrinx, les plus importants et/ou les plus significatifs. / Montréal Trigonix inc. 2018

Thèse en cotutelle entre l'Université Laval, Québec, Canada et l'Université de Strasbourg, Strasbourg, France / Le Rapt de Proserpine de Claudien et l'Enlèvement d'Hélène de Collouthos sont deux œuvres tardo-antiques qui présentent plusieurs versions, parfois contradictoires sous certains aspects, des agressions éponymes. Dans ce mémoire, nous proposons une analyse comparative de ces textes centrée sur la violence exercée sur les femmes et l'ambiguïté qui l'entoure. Si la violence apparaît d'abord au lecteur par ses mentions explicites et littérales, étudiées dans le premier chapitre, elle se manifeste surtout de manière implicite ou métaphorique. À cette fin, Claudien et Collouthos ont recours au locus amoenus, à des présages de l'agression, à des comparaisons animales et à la métaphore de la femme-forteresse. Ces procédés et images permettent de souligner les diverses dimensions de l'agression, ainsi que sa richesse symbolique. Sur ce plan, les rêves et l'association du rapt au viol, au mariage et à la mort sont également significatifs. L'ambiguïté, introduite dès le début de chaque œuvre par l'emploi d'un terme polysémique, invite le lecteur à aller au-delà du premier niveau de lecture ; elle est subséquemment véhiculée par les termes employés (polysémiques, violents ou non-violents), les représentations contradictoires du rapt et le double sens inhérent des métaphores. La prédominance de l'ambiguïté reflète en un sens les multiples interprétations possibles de l'agression centrale de chaque mythe. Nous mettons ainsi en évidence la place qu'occupe l'ambiguïté dans l'expression de la violence, son impact sur l'interprétation du récit, et les parallèles créés entre Hélène et Proserpine.

Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2012-2013. / Eldorado de Laurent Gaudé et Comment devenir un monstre de Jean Barbe sont des romans contemporains dans lesquels les protagonistes, nommés Salvatore Piracci et François Chevalier, sont en quête d'eux-mêmes dans un monde montré d'emblée comme illogique et incertain. Dans ces fictions, la vie des personnages principaux est d'abord brisée, la structure textuelle, qui se compose de deux récits distincts, est fragmentée, et l'état du monde est chaotique, voire éclaté. Dans un premier temps, si nous nous attardons seulement à la vie des protagonistes, nous pouvons voir qu'elle évolue, qu'elle ne reste pas dans son état initial. De fait, dès le tout début des romans, les personnages principaux réfléchissent à leur situation personnelle et entreprennent un parcours laborieux. Ce dernier nous semble correspondre au processus de conversion profane puisqu'au sortir de leur cheminement, Salvatore Piracci et François Chevalier paraissent adhérer à la vie, étant désormais en harmonie à la fois avec ce qu'ils sont et avec le monde qui les entoure. Nous pouvons donc présumer que la conversion profane règle l'éclatement identitaire des personnages. Toutefois, la conversion dépasserait-elle la simple transformation identitaire des protagonistes? Ne désignerait-elle pas une quête de cohérence plus fondamentale? Ce mémoire a pour objectif de montrer comment la conversion profane, en plus de régler l'éclatement identitaire des personnages principaux, est en étroite corrélation avec différents éléments formels et thématiques des oeuvres de notre corpus, ayant ainsi des retentissements allant bien au-delà de la transformation d'un parcours individuel.

Ce mémoire se penche sur la question de la vraisemblance dans deux récits contemporains qui traitent de la métamorphose : La femme changée en bûche de Marie Ndiaye et Truismes de Marie Darrieussecq. L'étude dégage les stratégies de la vraisemblance sous trois angles : d'un point de vue narratologique, elle analyse la vraisemblance pragmatique et l'autorité narrative dans les deux romans; l'analyse de la vraisemblance diégétique touche aux questions de l'espace contemporain, à certaines études mythologiques ainsi qu'à la sémiotique du corps et de l'objet; le troisième aspect, axé sur la vraisemblance générique, porte sur l'influence du mode littéraire pour établir ou ébranler la vraisemblance dans le roman. L'analyse des enjeux de la vraisemblance dans deux récits relatant la métamorphose au sein d'univers tout à fait différents contribue à déceler quelques stratégies essentielles pour construire et raconter le réel à l'époque contemporaine.

Ce mémoire comparatiste s'applique à mettre en relation les poésies d'Hector de Saint-Denys Garneau (1912-1943) et de Francis Ponge (1899-1989) en y étudiant les rapports entre espace et subjectivité. À défaut de se laisser emporter par un lyrisme traditionnel, ces poètes expriment leur présence au monde, à la fois sensuelle et intellectuelle, à travers les paysages qui s'offrent à eux. En effet, fondamentalement moderne, l'écriture de l'espace, qui prend appui sur la matière du monde, du corps et des mots, effrite les frontières de la subjectivité poétique. Elle s'exprime différemment au sein des textes étudiés : alors que l'approche de l'espace chez Garneau semble s'effectuer par osmose, par imprégnation, dans une recherche de transparence, chez Ponge le paysage se présente comme objet à capturer pour mieux s'y affirmer. Néanmoins, dans leur goût pour la matérialité, pour une expression du soi qui prenne acte du dehors, Garneau et Ponge se retrouvent dans la peinture de Cézanne, dont le regard artistique devient une façon de percevoir l'espace. Le rapprochement de ces pratiques scripturale et picturale met en relief comment les oeuvres de Garneau et de Ponge permettent d'octroyer une valeur positive à la fragmentation du sujet, réconcilié dans l'art.

Le propos de ce mémoire est issu d'une première observation : le rapport particulier à la mémoire présent dans bon nombre de romans contemporains. L'émergence remarquée des récits de filiation, fictions biographiques, autofîctions et autres formes d'exploration du fait mémoriel démontre à quel point le passé est un matériau fécond sur le plan littéraire, toujours à mi-chemin entre l'Histoire et la fiction. Les romans de Patrick Chamoiseau et de Bessora, soit Texaco et Petroleum, exploitent eux aussi cette isotopie et présentent plusieurs similarités en termes de récurrences thématiques et stratégies textuelles. Outre les titres des oeuvres annonçant d'emblée le propos tournant autour de l'exploitation pétrolière et du capitalisme, les romans réunissent des traces de la mémoire, pour montrer à quel point la relation au passé est une notion toujours complexe, souvent insaisissable. Ce mémoire questionne donc la place du mémoriel, confronté à l'Histoire, ses déroutes et ses silences.