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Análise evolutiva das subunidades ligadoras de substrato presentes no sistema de osmoproteção em procariotos

Coutinho, Tarcisio José Domingos 13 December 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-01T14:16:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1756619 bytes, checksum: d052f1be18e53f2beddaa57cda5b0a22 (MD5) Previous issue date: 2012-12-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Substrate-binding subunits are very important components of the solute importation system, known as the osmoprotectant system, which consists of a membrane protein belonging to the ABC superfamily. These molecules recognize specific substrates that have different physiological roles in prokaryotes, i.e. roles that contribute to the survival of these organisms in environments with high concentrations of salt. Using MEGA 5.05 software, this study performed a phylogenetic analysis of 431 nucleotide sequences of these subunits, orthologous to each other, collected from the database contained on the website http://www.genome.jp/kegg/. As a result of this analysis, phylogenetic trees were generated that clearly demonstrated that there was a horizontal transfer of some genes due to the sharing by different organisms. Also, two probable ancestral sequences were generated that showed homology with permeases that transport choline, glycine betaine and carnitine, which are trimethylamines currently present in various prokaryotes. Therefore, this system probably arose in prokaryotic organisms with the basic function of capturing nutrients, and by performing this basal function of being shared with other organisms, was fixed to the genome. However, because of the diversification of habitats by the prokaryotes, this system contributed decisively to the adaptation of these organisms to different environments, especially environments that had a high salt concentration; thus, acting and being currently characterized as a system of osmoprotection. / As subunidades ligadoras de substrato são componentes muito importantes do sistema de importação de soluto conhecido, como sistema de osmoproteção, que consiste em uma proteína de membrana pertencente à superfamlía ABC. Estas moléculas reconhecem substratos específicos que apresentam papéis fisiológicos diversos em procariotos, incluindo a colaboração para a sobrevivência destes organismos em ambientes com elevada concentração de sal. Utilizando o software MEGA 5.05, foi realizada uma análise filogenética de 431 sequências nucleotídicas destas subunidades, ortólogas entre si, coletadas a partir do banco de dados contido no site ttp://www.genome.jp/kegg/. Como resultado desta análise, foram geradas árvores filogenéticas que demonstraram claramente que houve a transferência horizontal de alguns dos genes devido ao ompartilhamento por organismos diferentes. Foram geradas também duas prováveis sequências ancestrais que apresentam homologia com permeases que transportam colina, glicina betaína e carnitina, que são aminas trimetiladas, presentes atualmente em diversos procariotos. Portanto, este sistema provavelmente surgiu em organismos procarióticos com a função básica de captura de nutrientes e por desempenhar esta função basal, ao ser compartilhado com outros organismos, foi fixado aos genomas. No entanto, a partir da diversificação de habitats, por parte dos procariotos, este sistema colaborou de forma decisiva para a adaptação destes organismos aos mais diversos ambientes, incluindo, especialmente os ambientes que apresentavam uma elevada concentração de sal, atuando e sendo caracterizado atualmente como um sistema de osmoproteção.
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Análise proteômica de paracoccidioides sp. em condições de estresse osmótico / Proteomic analysis of paracoccidioides sp. under osmotic stress

Rodrigues, Leandro Nascimento da Silva 28 November 2014 (has links)
Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-08-10T17:18:30Z No. of bitstreams: 2 Tese - Leandro Nascimento da Silva Rodrigues - 2014.pdf: 2636013 bytes, checksum: 332020037e85516d843bbcbfc5e4da75 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-15T13:41:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Leandro Nascimento da Silva Rodrigues - 2014.pdf: 2636013 bytes, checksum: 332020037e85516d843bbcbfc5e4da75 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-15T13:41:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Leandro Nascimento da Silva Rodrigues - 2014.pdf: 2636013 bytes, checksum: 332020037e85516d843bbcbfc5e4da75 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-11-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The dimorphic fungus Paracoccidioides is the etiological agent of paracoccidioidomycosis, a systemic mycosis with high relevance for the public health in Brazil and other Latin American countries such as Colombia and Venezuela. Generally, microorganisms require responses to stress conditions to survive in response to environmental changes and pathogenic organisms, particularly, require an effective response even higher to react against host defences. Osmotic stress has been used as a model to study signal transduction and seems to cause many cellular adaptations, which include signal transduction pathways modification, protein expression alteration and cellular volume and size regulation. In this work we have evaluated the proteomic profile of yeast cells of Paracoccidioides sp. (Pb01) obtained in osmotic stress condition. Data describe an osmoadaptative response of this fungus when subjected to this treatment. Proteins involved in the synthesis of the cell wall components were modulated, evidencing a remodelling of the cell wall. In addition, it was also observed alterations on the energy metabolism, given that proteins of the pentose phosphate pathway were abundant while proteins of the glycolysis were less abundant under osmotic stress condition. In addition changes in amino acid metabolism were also observed; more clearly the degradation of amino acids such as leucine, isoleucine and valine was induced during osmotic stress. Hereupon, our study suggests that Paracoccidioides sp. (Pb01) present a vast osmoadaptative repertoire; comprising different proteins which act complementarily and that this response could be able to minimize the effects caused by osmotic stress. / O fungo dimórfico Paracoccidioides é o agente etiológico da paracoccidioidomicose, uma micose sistêmica com grande relevância na saúde pública no Brasil e em outros países da América Latina, como Colômbia e Venezuela. Microrganismos, em geral, requerem respostas às condições de estresse para sobreviver às mudanças ambientais e patógenos, em particular, necessitam de uma resposta efetiva ainda maior para reagir às defesas do hospedeiro. O estresse osmótico é usado como um modelo para estudos de transdução de sinais e parece causar muitas adaptações celulares, as quais incluem alterações nas vias de transdução de sinais, expressão de proteínas e regulação do volume e tamanho celulares. Neste trabalho foi avaliado o perfil proteômico das células leveduriformes de Paracoccidioides sp. (Pb01) obtidas sob condições de estresse osmótico. Os dados evidenciam uma resposta osmoadaptativa deste fungo, quando submetido a este tipo de estresse. Proteínas envolvidas na biossíntese de componentes de parede celular foram moduladas, evidenciando um remodelamento de parede. Também foram observadas prováveis alterações no metabolismo de energia, tendo em vista que proteínas da via das pentoses fosfato mostraram-se abundantes, enquanto proteínas da via glicolítica mostraram-se em menor abundância frente às condições de estresse osmótico. Adicionalmente alterações no metabolismo de aminoácidos também foram observadas; de forma mais evidente a degradação de aminoácidos como leucina, valina e isoleucina foi induzida durante o estresse osmótico. Neste sentido, nosso estudo sugere que Paracoccidioides sp. (Pb01) possui um amplo repertório osmoadaptativo, composto por diferentes proteínas que atuam de maneira complementar e que devem atuar promovendo a minimização dos efeitos causados pelo estresse osmótico.

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