Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-08-24T19:46:46Z No. of bitstreams: 2 Dissertação IRSA_GMS_JZ.pdf: 2431795 bytes, checksum: 608f6f1aa78327ade6e822dbacf3ee87 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-24T19:46:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação IRSA_GMS_JZ.pdf: 2431795 bytes, checksum: 608f6f1aa78327ade6e822dbacf3ee87 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-11 / Instituto de Amparo a Ciência, Tecnologia e Inovação de Roraima - IACTI-RR / This study was conducted in the “lavrado” of Roraima, Brazil, in aquatic habitats along corridors of Buriti palm trees draining to the Branco, Takutu and Uraricoera river basins, totaling 10 samples. We aimed to investigate ichthyofaunal (species composition, richness, abundance, diversity, evenness and similarity) and trophic (diet) aspects of the local fish assemblages. Sampling was done once at each location in the dry season (October 2014 to February 2015) using dip nets and seine nets. Environmental (structural) characteristics of the water bodies (width, length and depth for later measurement area and volume) were also evaluated. Overall, 3733 specimens of fish were collected, distributed in 6 orders, 20 families, 43 genera and 56 species. Characiformes was the most representative group in number of species, followed by Perciformes, Gymnotiformes, Siluriformes and Cyprinodontiformes and Synbranchiformes. The family of greater richness and abundance was Characidae, followed by Lebiasinidae and Cichlidae. The similarity analysis in species composition among sites and between river basins, using the indices of Jaccard (presence / absence) and Bray-Curtis (abundance) showed a tendency of grouping part of the samples from the Branco River basin and also part of the samples of the Uraricoera River basin. However, river basin apparently did not constitute the most important factor in determining the composition of the fish fauna in the samples. The geographic distance among samples also did not explain most of the variation in the composition and structure of fish assemblages. Neither morphometric variables of the water bodies. These results do not allow us to state whether the low similarity among fish assemblages of the three river basins reflect the effects of historical factors, the influence of unevaluated local environmental factors, or stochastic processes. The diet of the fish fauna was based mainly on autochthonous items such as aquatic insects (larvae, pupae and adults), zooplankton and algae. This indicates that the fish of buritis palm trees corridors are dependent on the aquatic primary production in the dry season. / Este estudo foi realizado em área de lavrado de Roraima, Brasil, e incluiu veredas de buritizais que drenam para as bacias dos rios Branco, Tacutu e Uraricoera, totalizando 10 amostras. Teve o intuito de investigar aspectos ictiofaunísticos (composição, riqueza, abundância, diversidade, equitabilidade e similaridade) e tróficos (dieta) das assembleias de peixes. As coletas foram feitas uma vez em cada local no período de seca/estiagem (outubro de 2014 a fevereiro de 2015) com uso de puçás e rede de arrasto. Nos trechos amostrados foram mensuradas características estruturais dos corpos d’água (largura, comprimento e profundidade, para posterior cálculo de área e volume). Foram capturados 3733 exemplares de peixes, distribuídos em 6 ordens, 20 famílias, 43 gêneros e 56 espécies. Characiformes foi o grupo mais representativo em número de espécies, seguido de Perciformes, Gymnotiformes, Siluriformes, Cyprinodontiformes e Synbranchiformes. A família de maior riqueza e abundância foi Characidae, seguida de Lebiasinidae e Cichlidae. As análises de similaridade na composição de espécies entre os locais e entre bacias hidrográficas, a partir dos índices de Jaccard (presença/ausência) e Bray-Curtis (abundância das espécies) evidenciaram uma tendência de agrupamentos de parte das veredas da bacia do rio Branco e parte das veredas da bacia do rio Uraricoera. No entanto, a bacia hidrográfica aparentemente não foi o fator mais importante para determinar a composição da ictiofauna entre as veredas. A distância geográfica entre os locais de amostragem também não explicou adequadamente a similaridade na composição local de espécies, e a estrutura das assembleias de peixes não foi influenciada significativamente pela área e volume dos ambientes aquáticos. Os resultados obtidos não permitem afirmar com segurança se a baixa similaridade entre as assembleias de peixes das três bacias hidrográficas reflete eventos históricos ou se decorre de condições ambientais locais não mensuradas ou processos estocásticos. A dieta das espécies de peixes foi baseada principalmente em itens de origem autóctone, como insetos aquáticos (larvas, pupas e adultos), zooplâncton e algas. Esses resultados evidenciam que os peixes das veredas de buritizais são dependentes da produção primária aquática no período de seca.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-09-13T13:52:03Z No. of bitstreams: 2 Edika Sabrina.pdf: 2355352 bytes, checksum: bd199f9d627c46955e2c63cfd52499f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-13T13:52:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Edika Sabrina.pdf: 2355352 bytes, checksum: bd199f9d627c46955e2c63cfd52499f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Cichlids have different morphological, ecological and behavioral adaptations, promoting their adaptation in different environments throughout evolution. This diversity is reflected in the composition of cytogenomics group, which shows disparity in karyotype formula and diploid number of phylogenetically related species. The differences in composition and structure variations of these species are directly related to the repetitive fraction of the genome, since they correspond to most of the genome, and promotes chromosomal rearrangement events that can be observed by fluorescent in situ hybridization technique. Chromosome physical mapping of neotropical amazonian cichlid limited to specific elements that are the main targets of cytogenetic studies, such as non-LTR retrotransposons Rex and ribosomal DNA family. However, other participants in the repetitive portion of the genome have not yet been mapped until this present study. In addition, studies in African cichlids, brother phylogenetic group of neotropical, indicate that repetitive genomic composition of these species is much broader. Thanks to the recent availability of genomic sequencing of males and females of Amazonian species Cichla vazzoleri, Astronotus ocellatus, Pterophyllum scalare and Symphysodon discus, this study has identified, from a small fraction of the total genome of these species, other classes of repetitive elements in order to map them on chromosomes. The repetitive elements were identified as simple repeat and satellites DNA, and different classes of non-LTR retrotransposons LINE-like, LTR retrotransposons ERV-like and transposons Tc1-like. Moreover, it was possible to identify the proportion of each element in genomic sample used and relate the abundance of the number of copies of each element with the phylogeny of the host group, providing preliminary data on the participation of transposable throughout evolution. From this initial approach, the transposable elements more abundant were selected for use as probes in chromosomal physical mapping: retrotransposons non-LTR lines L2, RTE and Dong.R4 and transposons Tc1. The markings were conspicuous and widespread and not restricted to regions of heterochromatin. Some peculiarities were observed, such as retroelement L2 in Astronotus ocellatus, whose markings were mostly conspicuous in the centromeric and terminal regions, with the exception of chromosome pair 10 which showed strong marks scattered throughout the chromosome segment. Further investigation was conducted to identify possible variations of elements used as probes, the technique of in vivo cloning. In general, the sequences are relatively conserved, showing high degree of identity each other. Genomic data of transposable elements combined with its chromosomal mapping and their comparative nucleotide sequences provide preliminary data on the participation in the composition, organization and cytogenomics evolution of neotropical Amazonian cichlids. / Os ciclídeos apresentam diferentes adaptações morfológicas, ecológicas e comportamentais, promovendo sua adaptação em diversos ambientes ao longo da evolução. Essa diversidade é refletida na composição citogenômica do grupo, que apresenta disparidade na fórmula cariotípica e número diploide entre espécies próximas filogeneticamente. As diferenças na composição e estrutura cariotípica dessas espécies estão diretamente relacionadas à fração repetitiva do genoma, pois correspondem à maior parte, e favorecem eventos de rearranjo cromossômico, que podem ser observados pela técnica de hibridização fluorescente in situ. O mapeamento físico cromossômico de ciclídeos neotropicais amazônicos limita-se a elementos pontuais que são os principais alvos de estudos citogenéticos, como os retroelementos não-LTR da família Rex e DNAs ribossomais. Contudo, outros participantes da porção repetitiva do genoma ainda não foram mapeados até o presente estudo. Além disso, estudos em ciclídeos africanos, grupo filogenético irmão dos neotropicais, indicam que a composição genômica repetitiva dessas espécies é muito mais abrangente. Graças à recente disponibilidade do sequenciamento genômico de machos e fêmeas das espécies amazônicas Cichla vazzoleri, Astronotus ocellatus, Pterophyllum scalare e Symphysodon discus, o presente estudo identificou, a partir de uma pequena fração do genoma total destas espécies, outras classes de elementos repetitivos a fim de mapeá-los nos cromossomos. Os elementos repetitivos identificados foram repetições simples e DNA satélites, além de diferentes classes de retrotransposons não-LTRs do tipo LINE, retrotransposons LTRs do tipo ERV e transposons do tipo Tc1. Além disso, foi possível identificar a estimativa da proporção genômica e relacionar a abundância do número de cópias de cada elemento com a filogenia do grupo hospedeiro, fornecendo dados preliminares sobre a participação de transponíveis na evolução. A partir dessa abordagem inicial, foram selecionados os elementos transponíveis mais abundantes para serem utilizados como sondas no mapeamento físico cromossômico: retrotransposons não-LTRs lines L2, RTE e Dong.R4 e o transposon Tc1. As marcações foram conspícuas e dispersas e não se restringiram às regiões de heterocromatina. Algumas peculiaridades foram observadas, como a do retroelemento L2 em Astronotus ocellatus, cujas marcações foram majoritariamente conspícuas nas regiões centroméricas e terminais, com exceção do par cromossômico 10 que apresentou fortes marcações dispersas ao longo de todo o segmento cromossômico. Uma investigação adicional foi realizada a fim de identificar possíveis variações dos elementos utilizados como sondas, pela técnica de clonagem in vivo. De maneira geral, as sequências são relativamente conservadas, apresentando alto grau de identidade entre si. Dados genômicos dos elementos transponíveis combinado ao mapeamento cromossômico e análise comparativa de suas sequências nucleotídicas fornecem dados preliminares sobre a participação na composição, organização e evolução citogenômica de ciclídeos neotropicais amazônicos.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-02-14T13:26:24Z No. of bitstreams: 2 Ropke 2016_ O papel de mudancas hidrologicas de ordem sazonal e climática na estrutura da assembleia e historia de vida de peixes_.pdf: 5521309 bytes, checksum: 02596de4246d7e4a90327d6c966ba4be (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T13:26:24Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Ropke 2016_ O papel de mudancas hidrologicas de ordem sazonal e climática na estrutura da assembleia e historia de vida de peixes_.pdf: 5521309 bytes, checksum: 02596de4246d7e4a90327d6c966ba4be (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-04-12 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Flow varability in space and time is widely regarded as a master variable that shapes the ecological characteristics of rivers and streams. Recently combined effects of climate change and deforestation have changed precipitation patterns in the Amazon, which in turn have changed the magnitude and timing of annual flow cycle. Effects of these changes on freshwater ecology and biology are poorly known. Here we investigated the effect of seasonal and interannual hydrological dinamics on assemblage structure and fish reproductive investment, emphasising the role of extreme events. Analysis of long-term data for hydrology and fish surveys in a floodplain lake near the confluence of Amazon and Negro rivers reveals that: i) seasonal connectivity with two large rivers plays important role on seasonal species turnover and populational recolonization. Temporal � diversity was high in the lake and the assemblage was dominated by seasonally transient species. Relatively large species known to feed on resources within the floodplain were captured almost exclusively during the flood period. During the dry season, the assemblage was dominated by fishes adapted to harsh conditions of high temperature and low dissolved oxygen concentrations; ii) analysis of long-term data set showed a significant and concordant changes in hydrology and assemblage structure. Major shifts coincided with an intense drought in 2005, followed by years with annual flood pulses of higher magnitude and earlier dry season onset. After 2005, the fish assemblage assumed alternative and persistent taxonomic and functional compositions indicative of a regime shift in response to an external driver; iii) the analysis of effects of annual hydrological condition on reproduction shows that extreme events and the interaction of extreme events and body condition affected female fecundity negatively. Females of Acestrorhynchus falcirostris, a piscivorous species, reduced the fecundity when had poor body condition in year of intense flood. Advanced, long and intense dry seasons had negative effect on Psetrogaster rutiloides fecundity and interacted with body condition on Triportheus angulatus fecundity. Mean oocyte size was more affected by environmental condition, as high population density and hydrological situation and its interaction with phenotype than only by individual’s phenotype (body size and body condition). Population density had a positive effect on the mean oocyte size in all studied species. The combination of these results suggests that biodiversity conservation and inland fisheries management in the Amazon will need to account for recent climatic and hydrologic changes that have the potential to induce ecological regime shifts and population dynamics. / As variações temporais de vazão dos grandes rios têm sido sugeridas a muito tempo como uma variável chave nas características ecológicas dos sistemas aquáticos. Recentemente, o efeito combinado de desflorestamento e mudanças climáticas globais tem resultado em mudanças no padrão de pluviosidade da bacia Amazônica e, consequentemente, no padrão sazonal de vazão na porção central do rio Amazonas. Isso tem mudado significativamente a magnitude e o calendário de começo das fases do regime anual de inundação. Os efeitos dessas mudanças sobre a ecologia e biologia dos organismos aquáticas ainda são pouco conhecidos. Neste estudo nós investigamos o efeito da dinâmica sazonal e interanual do regime de inundação sobre a estrutura da assembleia e o investimento reprodutivo de algumas espécies de peixes. A partir de análises de uma série temporal de dados hidrológicos e de peixes coletados em um lago de várzea próximo à confluência dos rios Negro e Amazonas nós podemos observar que: i) a conectividade sazonal do lago com esses dois rios tem um papel importante na taxa sazonal de turnover de espécies e recolonização das populações. A diversidade beta foi alta e a comunidade foi dominanda por espécies transitórias sazonalmente no lago. Um número relativamente alto de espécies que sabidamente se alimentam de recursos na planície de inundação foram capturadas quase exclusivamente durante o período da cheia. Durante a estação seca, a assembleia de peixes foi dominada por espécies de peixes com adaptações conhecidas para condições de baixa disponibilidade de oxigênio e tolerância à alta temperatura; ii) análises da série temporal completa de 13 anos de dados mostrou que houve uma significativa e concordante mudança no regime hidrológico e estrutura da assembleia de peixes. A mudança mais intensa coincidiu com a severa seca de 2005 a qual foi seguida de anos com pulsos de inundação de alta magnitude e um adiantamento do início da estação seca. Após 2005, a assembleia de peixes apresentou uma estrutura diferente e persistente em termos taxonômicos e funcionais; iii) as análises do efeito da condição hidrológica anual sobre a reprodução mostraram que eventos extremos e sua interação com a condição corpórea das fêmeas afetaram negativamente a fecundidade produzida por elas. Fêmeas de Acestrorhynchus falcirostris, uma espécie piscívora, reduziram a fecundidade quando a condição corpórea era ruim durante anos de cheias intensas. Secas fortes, com começo adiantado e de longa duração tiveram efeito negativo na fecundidade de Psectrogaster rutiloides, e interagiram com a condição corpórea das fêmeas na fecundidade de Triportheus angulatus. O diâmetro médio dos ovócitos das fêmeas foi mais afetado pela densidade das populações e condição hidrológica que pelo tamanho do corpo e condição corpórea das fêmeas em todas as espécies. A combinação desses resultados sugere que, de modo geral, eventos extremos tem impacto negativo sobre a assembleia de peixes e sobre processos reprodutivos. Assim este estudo sugere que propostas direcionadas à conservação da biodiversidade e pesca em água doce na bacia Amazônica deveriam considerar o efeito das recentes mudanças hidrológicas que a bacia vem sofrendo, devido ao seu potencial de provocar fortes mudanças no funcionamento, estrutura e dinâmica das populações de organismos aquáticos.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-04-18T20:11:29Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Carlos_Rodrigues_Filho.pdf: 2629164 bytes, checksum: 9b590dc204162899854053ed768b8404 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T20:11:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Carlos_Rodrigues_Filho.pdf: 2629164 bytes, checksum: 9b590dc204162899854053ed768b8404 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Ecological studies at large scales have used the functional approach as a way of comparing regions with different taxonomic compositions. This approach is based on species characteristics that directly or indirectly affect your fitness. More recently, this aspect of biodiversity has been very important for conservation studies, due to the close relationship between environmental changes and functional diversity. One way of understanding the future is by understanding the past. Thus, identifying the consequences of historical and contemporary disturbances in the current assemblages can guide us in future decision-making. The objectives of this study were: (i) to investigate how local species richness influences functional structure in each region, (ii) to compare the importance of specialist and redundant species for each biome, using a random scenario of species loss, (iii) to evaluate the importance of contemporary and historical factors in the patterns of richness and functional dissimilarity in the Amazonian and Caatinga streams, and (iv) to investigate whether species of the same order present different functional strategies in streams with similar environmental conditions but different evolutionary history. For this, a database of fish assemblages of 69 streams of the Amazon and Caatinga biomes was used. As a result, we find that historical factors show the great importance of the local and regional structure of stream fish assemblages. In combination with contemporary factors, may be able to generate the various idiosyncratic patterns observed in the literature, by selecting different pools of species between regions. Assemblies experiencing long periods of historical instability have high levels of functional redundancy, possibly to resist the constant environmental changes over time. In summary, this study reinforces the importance of assessing historical factors in small and large-scale studies. However, we have also identified a joint action of contemporary and historical effects, suggesting that complex and unidirectional mechanisms (initially historical filters followed by contemporaries) are responsible for governing the functional structure patterns in stream fish assemblages of Amazonian biomes and the Caatinga. / Estudos ecológicos de largas escalas, tem utilizado a abordagem funcional como uma forma de comparar regiões com diferentes composições taxonômicas. Essa abordagem é baseada em características das espécies que afetam direta ou indiretamente seu fitness. Mais recentemente, essa faceta da biodiversidade tem se mostrado muito importante para estudos de conservação, devido a íntima relação entre mudanças ambientais e de diversidade funcional. Nesse contexto, uma das maneiras de entendermos o futuro é compreendendo o passado. Assim, identificar as consequências de fatores históricos e contemporâneos nas assembleias atuais podem nos guiar em futuras tomadas de decisões. Os objetivos desse estudo foram: (i) investigar como a riqueza local de espécies influencia estrutura funcional, (ii) comparar a importância de espécies especialistas e redundantes para cada bioma, utilizando um cenário randômico de perda de espécies, (iii) avaliar a importância de fatores contemporâneos e históricos nos padrões de riqueza e dissimilaridade funcional em peixes de riachos da Amazônia e da Caatinga e (iv) investigar se espécies da mesma ordem apresentam diferentes estratégias funcionais em riachos com condições ambientais semelhantes, mas diferentes histórias de formação. Para isso foi utilizado um banco de dados de assembleias de peixes de 69 riachos dos biomas Amazônia e Caatinga. Como resultado encontramos que fatores históricos apresentam elevada importância para a estrutura local e regional de assembleias de peixes de riachos. Seus efeitos, em combinação com fatores contemporâneos, geram os diversos padrões idiossincráticos observados na literatura, por selecionar diferentes pools de espécies entre regiões. Assembleias que experimentam longos períodos de instabilidade histórica apresentam altos níveis de redundância funcional, possivelmente para suportar as constantes modificações ambientais ao longo do tempo. Resumindo, este estudo reforça a importância de avaliar os fatores históricos em estudos de pequena e larga escala. Contudo, também identificamos ação conjunta de efeitos contemporâneos e históricos, sugerindo que mecanismos complexos e atuando de forma unidirecional (inicialmente filtros históricos seguidos de contemporâneos) são responsáveis por governar os padrões de estrutura funcional em assembleias de peixes de riachos dos biomas Amazônicos e da Caatinga.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-08-11T13:10:25Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Versão Final_DaniloCastanho.pdf: 1464196 bytes, checksum: 46d88e7e246157a89fec48fe8ae33a67 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-11T13:10:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Versão Final_DaniloCastanho.pdf: 1464196 bytes, checksum: 46d88e7e246157a89fec48fe8ae33a67 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The study of biodiversity through its functional facet brings advantages related to the understanding of the structuring mechanisms, the relationships between the species and their respective ecosystemic roles, and the prediction of changes in biological services in the face of environmental changes. One of the main sources of pressures on natural fish populations in the Amazon is fishing, which has been more intensively carried out over the last decades. Seeing that the ornamental fishery carried out in the middle portion of the Negro River basin is an extractive activity focused on certain species, it is possible that the pressure exerted by the activity generates disturbances in the functional structure of the communities and suppresses specific ecological functions. With this scenario, the present study sought to estimate the effects of ornamental fishing on the functional structure of streams fish assemblages, through the elaboration of hypothetical scenarios of subtraction of abundances of ornamental and non - ornamental species. Through the evaluation of three complementary functional indexes (Redundancy, Divergence and Functional Dispersion) we found that the assemblies studied have high functional diversity related to the use of the environment and food resources. The species exploited by ornamental fisheries contribute significantly to the functional redundancy of the assemblages, and the simulated withdrawal of the Tetra cardinal Paracheirodon axelrodi causes greater losses to the assembly than the removal of non-ornamental species. These results indicate that the activity should be performed in an orderly manner and with adequate management, in order not to spoil the functional structure of local fish assemblages. As the activity does not generate significant changes in the physical and chemical conditions of the environment, and that economic unfeasibility decreases the chances of local extinction, ornamental fishery in the Barcelos region is prone to remain viable without altering the stability of the ecosystem. / O estudo da biodiversidade através de sua faceta funcional traz vantagens relacionadas à compreensão dos mecanismos estruturadores, às relações entre as espécies e seus respectivos papeis ecossistêmicos, e à predição de alterações nos serviços biológicos frente às alterações ambientais. Uma das principais fontes de pressões sobre as populações naturais de peixes na Amazônia é a pesca, que tem sido realizada mais intensivamente ao longo das últimas décadas. Visto que a pesca ornamental realizada na porção média da bacia do rio Negro é uma atividade extrativista com foco direcionado a certas espécies, é possível que a pressão exercida pela atividade gere perturbações na estrutura funcional das comunidades e suprima funções ecológicas específicas. Com esse cenário, o presente estudo buscou estimar os efeitos da pesca ornamental na estrutura funcional de assembleias de peixes de igarapés, por meio da elaboração de cenários hipotéticos de subtração de abundâncias de espécies ornamentais e não ornamentais. Por meio da avaliação de três índices funcionais complementares (Redundância, Divergência e Dispersão funcional) constatamos que as assembleias estudadas possuem alta diversidade funcional relacionada ao uso do ambiente e de recursos alimentares. As espécies exploradas pela pesca ornamental contribuem significativamente para a redundância funcional das assembleias, e a retirada simulada do Tetra cardinal Paracheirodon axelrodi causa maiores perdas para a assembleia do que a retirada de espécies não ornamentais. Tais resultados indicam que a atividade deve ser executada de forma ordenada e com manejo adequado dos estoques, a fim de não comprometer a estrutura funcional das assembleias locais de peixes. Uma vez que a atividade não gera alterações significativas nas condições físicas e químicas do ambiente, e que a inviabilidade econômica diminui as chances de extinção local, a pesca ornamental na região de Barcelos tem condições propícias a se manter viável sem alterar a estabilidade do ecossistema.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 381156.pdf: 13539828 bytes, checksum: 28fa782a88d5f55c0b350e9d01fdb83e (MD5) Previous issue date: 2006-08-21 / A anatomia e osteologia de Parotocinclus maculicauda (Steindachner, 1877) s?o descritas e comparadas com outros loricari?deos e astroblep?deos examinados. O esqueleto de Parotocinclus maculicauda exibe fus?es, redu??es de tamanho e de n?mero de ?ssos, entre outros. Novas estruturas ou elementos ?sseos n?o descritos previamente na literatura tradicional, s?o descritos. Em adi??o, este hypoptopomat?neo foi utilizado como um modelo descritivo na busca de caracteres informativos para o estudo filogen?tico da subfam?lia Hypoptopomatinae. Baseado em 169 caracteres de osteologia e morfologia externa, foi realizada uma an?lise filogen?tica de 114 t?xon terminais de loricari?deos, especialmente das subfam?lias Hypoptopomatinae e Neoplecostominae. Os resultados permitem a re-diagnose da subfam?lia Hypoptopomatinae, reconhecendo 24 g?neros. Cinco agrupamentos monofil?ticos s?o reconhecidos como g?neros novos, e 34 novas esp?cies s?o identificadas. N?o foi encontrado suporte para demonstrar a monofilia de Otothyrini e as tribos previamente reconhecidas dentro de Hypoptopomatinae n?o s?o mantidas neste estudo. A inclus?o de representantes de outras subfamilias de Loricariidae na an?lise forneceu um melhor entendimento das rela??es filogen?ticas e da biodiversidade dos Loricariidae. Complementarmente, uma nova esp?cie de hypoptopomat?neo do g?nero Otocinclus ? descrita de duas localidades no alto rio Amazonas. O novo t?xon pode ser facilmente distinguido dos outros cong?neres, exceto Otocinclus cocama, pela presen?a de uma ?nica marca, fortemente pigmentada, em forma de morcego, na parte posterior da nadadeira caudal. De O. cocama a nova esp?cie ? distinguida pelo padr?o de colorido, que consiste em uma larga faixa lateral escura.A nova esp?cie ? possivelmente mais proximamente relacionada a um clado formado por O. huaorani, O. mariae, O. bororo, O. mura e O. cocama. Finalmente, Otocinclus arnoldi da bacia do rio da Prata ? revalidado da sinon?mia de O. flexilis, descrito da bacia do rio Jacu?. Tamb?m, Otocinclus mimulus de um tribuit?rio do Rio Paran?, ? considerado sin?nimo j?nior de Otocinclus arnoldi.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 382062.pdf: 17250596 bytes, checksum: 4895d4e222e5236e3481143673df137d (MD5) Previous issue date: 2006-08-11 / A diversidade morfol?gica da fauna de peixes de ?gua doce Neotropical ? considerada a maior dentre as ictiofaunas epicontinentais do planeta. Esta ? notavelmente maior que as estimativas, podendo chegar a um total de 8.000 esp?cies. A grande maioria dessas esp?cies est? inclu?da na superordem Ostariophysi a qual representa cerca de 25% das esp?cies de ambos ?gua doce e salgada. Sua grande diversidade ecol?gica e evolutiva faz deste grupo foco de estudos morfol?gicos e evolutivos. Uma das ordens, os Characiformes apresenta uma ampla diversidade morfol?gica na forma do corpo, tamanho, assim como na sua estrutura dentaria. Desta forma este trabalho tem como objetivo principal descrever e investigar, comparativamente representantes da ordem quanto ao aspecto da denti??o, seja os pr?prios dentes funcionais e de substitui??o ou as estruturas onde os mesmos est?o apoiados e/ou localizados. Para isso, foram utilizadas as t?cnicas da microscopia eletr?nica de varredura para descrever as ultra-estruturas e as histol?gicas para descrever morfologicamente os dentes de substitui??o, os processos de fixa??o dos dentes funcionais e a disposi??o dos dentes de substitui??o; acrescido a isto foi feito o exame de ossos que formam parte abertura oral. Todos estes processos tiveram como finalidade buscar padr?es morfol?gicos entre os representantes da ordem, podendo ser estes padr?es informativos ou n?o para as atuais hip?teses filogen?ticas do grupo. Secundariamente, verificar atrav?s dos resultados informativos obtidos, a corrobora??o das atuais. Foram analisadas 25 esp?cies representantes das 18 fam?lias da ordem. Ressalta-se aqui os seguintes caracteres que corroboraram a hip?tese de Calcagnotto et al. (2005: fig. 53) de rela??es pr?ximas entre Anostomidae, Chilodontidae, Prochilodontidae, Hemiodontidae e Parodontidae: organiza??o dos prismas de esmalte em rede dos dentes do pr?-maxilar (9.2), independentemente adquirido em Alestidae; implanta??o do dente funcional no l?bio (10.2), independentemente adquirido em Hemiodontidae; desenvolvimento dos dentes de substitui??o no tecido conjuntivo do l?bio (12.2), reverso a uma condi??o primitiva em Anostomidae; desenvolvimento dos dentes de substitui??o em grupos, envolvidos por uma camada de tecido conjuntivo (15.0), reverso a uma condi??o primitiva em Anostomidae; c?lulas odontoblastos largas (19.2), n?o codificado em Prochilodontidae, e regi?o da polpa dos dentes funcionais ampla, sem limite posterior identific?vel (20.0), reverso a uma condi??o primitiva em Prochilodontidae. O clado formado por Hemiodus e Apareiodon de Calcagnotto et al. 2005 ? sustentado pelo car?ter dentes de substitui??o em mais de duas fileiras horizontais (16.0), n?o codificado para Prochilodontidae. A condi??o do car?ter desenvolvimento dos dentes de substitui??o em cavidade de substitui??o (sensu Brewster, 1986) (14.0), corrobora a rela??o de Charax e Roeboides proposta por Lucena (1987, 2003). A an?lise feita aqui mostrou caracteres ?nicos para alguns dos g?neros estudados. Podemos citar: superf?cie do dente na regi?o apical com estrias (4.0) e posi??o dos dentes de substitui??o caninos no mesmo ?ngulo (18.1) exclusivos de Cynopotamus; trincheira com dentes na borda posterior de sua abertura dirigidos para tr?s (22.0) em Characidium; presen?a de pequenos foramens no teto da cripta est?o presentes, ao contr?rio de outros g?neros estudados que apresentam amplas aberturas na cripta, em Serrasalmus. Por fim, o trabalho confirma a enorme diversidade morfol?gica da denti??o que ocorre na ordem Characiformes.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431680.pdf: 16463641 bytes, checksum: 5d308424aa6204847b79a46e56df2868 (MD5) Previous issue date: 2011-03-14 / Belonidae ? composta por 48 esp?cies de peixes que compartilham o corpo alongado, as nadadeiras dorsal e anal posicionadas posteriormente, nadadeiras p?lvicas com seis raios e as maxilas finas e compridas, com dentes grandes e c?nicos. Apesar da grande homogeneidade morfol?gica, t?cnicas moleculares sugeriram que Belonidae n?o ? monofil?tica. Com o objetivo de testar a monofilia de Belonidae este estudo foi concebido para realizar uma abrangente an?lise filogen?tica de evid?ncia total. Para isto, foi realizada uma an?lise de m?xima parcim?nia sem pesagem diferencial dos caracteres, baseada numa matriz com 257 caracteres morfol?gicos e 4808 pares de bases de sete fragmentos de DNA (nuclear- RAG2, CK e TMO 4C4 e mitocondrial- 12S, 16S, ATPase 6 e 8, Citb) codificados a partir de 104 t?xons terminais. O grupo interno foi composto por todas as esp?cies recentes e f?sseis v?lidas de Belonidae e as popula??es mais representativas de algumas esp?cies que apresentam ampla distribui??o. Para grupo externo foram selecionadas esp?cies de quase todos os g?neros v?lidos de Beloniformes e tr?s representantes da ordem Cyprinodontiformes. A an?lise encontrou nove ?rvores igualmente mais parcimoniosas com 8465 passos (IC= 0,35; IR= 0,67). Nossos resultados corroboram a monofilia da superfam?lia Belonoidea e das fam?lias Exocoetidae, Scomberesocidae e Zenarchopteridae, e refutam a monofilia da superfam?lia Exocoetoidea e das fam?lias Belonidae e Hemiramphidae. Por este motivo, ? aqui proposta uma nova composi??o para a fam?lia Belonidae, com a anexa??o dos g?neros atualmente em Scomberesocidae. Esta nova classifica??o restaura a monofilia de Belonidae, que ? fortemente suportada por 20 sinapomorfias morfol?gicas e 19 moleculares. Em seu novo arranjo, a fam?lia Belonidae est? composta por 14 g?neros distribu?dos em quatro subfam?lias: Beloninae, Platybeloninae, Potamorrhaphinae e Strongylurinae. Todos os g?neros de Belonidae s?o monofil?ticos, a exce??o de Strongylura, que para tornar-se monof?tico deve ter suas esp?cies alocadas em quatro g?neros: Strongylura, Dorybelone e dois g?neros novos. S?o apresentadas diagnoses filogen?ticas para todas as subfam?lias e g?neros, al?m de discutidas hip?teses de evolu??o dos principais caracteres morfol?gicos.

As características estruturais e funcionais das comunidades aquáticas respondem às oscilações ambientais em diferentes escalas espaciais e temporais e também aos impactos antropogênicos. Os peixes são considerados excelentes indicadores da condição ou da saúde dos ecossistemas e são utilizados para avaliar os efeitos de diferentes tipos de estressores ambientais ou pressões sobre as assembléias de peixes, ou para avaliar um impacto específico utilizando uma única espécie. Este trabalho teve por objetivos testar a eficiência de diferentes metodologias na avaliação de degradação ambiental na região do Delta do rio Jacuí, RS. Para tanto, diferentes ferramentas foram utilizadas nesta avaliação, como a análise de parâmetros físico-químicos da água, variações quali-quantitativas na estrutura das assembléias de peixes, índices ecológicos (índices de diversidade, índice de qualidade integrado e índice de integridade biótica), análise da frequência de anomalias morfológicas e de parasitos, variações na alimentação e reprodução de duas espécies de peixes e análise histológica de gônadas. Este estudo foi desenvolvido em oito pontos de amostragem ao longo do Delta do Jacuí. O Delta localiza-se na região metropolitana de Porto Alegre, no estado do Rio Grande do Sul, e sofre com diferentes tipos de impactos, sendo os principais o despejo de esgotos domésticos e industriais. Através da classificação da qualidade da água do Delta do rio Jacuí, de acordo com a resolução 357 do CONAMA e demais análises, os pontos localizados nos rios formadores, exceto aquele situado no rio dos Sinos, apresentaram uma melhor qualidade em suas águas. Estes resultados são corroborados com as demais análises realizadas neste trabalho. Entre as variáveis ambientais consideradas, a temperatura da água, temperatura do ar, DBO, condutividade e a turbidez desempenharam um papel importante na estruturação das assembléias de peixes do Delta do rio Jacuí. Os métodos utilizados neste estudo mostraram-se eficientes, na maioria dos casos, para determinar locais de maior ou menor qualidade ambiental. Foram observadas variações na riqueza, nos índices ecológicos, em aspectos reprodutivos e alimentares, até variações a nível celular, através da análise histológica das gônadas. Não houve casualidade na ocorrência de anomalias morfológicas nas assembléias de peixes do Delta do rio Jacuí, sendo as maiores frequências observadas nos pontos DJ08, DJ02 e DJ07. Porém foi nos pontos DJ04, DJ06 e DJ08 que o teste Qui-Quadrado apresentou resultados significativos. A análise de anomalias morfológicas mostrou-se um instrumento valioso para a avaliação de impacto ambiental, assim como a análise da presença de parasitos. Os resultados do Índice de Integridade Biótica calculado neste estudo classificam os ambientes analisados como de qualidade boa a muito pobre. Para a região do Delta do Jacuí, a adaptação do IIB pareceu refletir eficientemente a classificação da condição ambiental dos trechos estudados. As diferentes ações antrópicas sofridas no Delta do rio Jacuí, RS foram responsáveis por alterações na dieta das espécies de peixes estudadas. Foi possível perceber também a grande plasticidade alimentar de Cyanocharax alburnus e Gymnogeophagus gymnogenys, que alteraram suas dietas de acordo com o alimento disponível em cada ambiente. Através da análise histopatológica das gônadas destas mesmas espécies foram observadas diversas alterações, todas elas presentes somente em gônadas femininas de ambas as espécies. A presença de variações histopatológicas indica que os peixes podem responder a efeitos diretos de contaminantes como também a efeitos secundários causados por estresse. Podese concluir que as assembléias de peixes do Delta do rio Jacuí são afetadas pelos mais variados impactos sofridos na região. O uso de diferentes metodologias para a avaliação de qualidade ambiental mostrou-se extremamente importantes, pois geram uma gama de informações bastante ampla, permitindo que se possa inferir com maior certeza sobre a atual situação do ecossistema. / Structural and functional characteristics of aquatic communities respond to environmental variations in different spatial and temporal scales and also to anthropogenic impacts. Fishes are considered excellent indicators of ecosystems health or condition. They are used to assess the effects of different types of environmental stressors or pressures upon fish assemblages, or to evaluate a specific impact on a single species. This study aimed to test the efficiency of different methodologies to evaluate environmental degradation in the Delta do rio Jacuí, RS. Different tools were used to this assessment such as the analysis of the physical and chemical parameters of the water, quali-quantitative variations on fish assemblage structure, ecological indices (diversity index, integrated quality index, and index of biotic integrity), morphological abnormalities and parasite frequency analysis, variations on feeding and reproduction of two fish species and histological analysis of gonads. This study was carried along eight sampling sites in Delta do rio Jacuí, within the metropolitan area of Porto Alegre, in the Rio Grande do Sul State. The area is affected by different kinds of impacts, mainly domestic and industrial sewage. The best water quality was found in the sampling sites located in those rivers which form the Delta except rio dos Sinos according to water classification analysis and CONAMA’s 357 resolution and other analysis. These results are corroborated by the other analysis presented in this study. Water and air temperature, DBO, conductivity, and turbidity had an important role in fish assemblage structure in the Delta do rio Jacuí. The methods applied in this study were efficient to determine high and low environmental quality sites in most cases. Variations in richness, ecological indices, reproductive and feeding aspects, at cell level through histological analysis of the gonads, were observed. There were no casualties in the occurrence of morphological abnormalities in fish assemblages of the Delta do rio Jacuí. Highest frequencies were observed at sites DJ08, DJ02 and DJ07 although significant results through chi-square test were obtained to the sites DJ04, DJ06 and DJ08. Morphological abnormalities analysis showed to be a valuable tool for environmental impact assessment as well as the analysis of parasite occurrence. Results to the Index of Biotic Integrity in this study classify the analyzed environments between good and very poor quality. The use and adaptation of this index seemed to reflect efficiently the environmental condition of the sampling sites in the area of Delta do Jacuí. The different anthropogenic impacts in the Delta do Jacuí were responsible for alterations in the diet of the fish species studied. It was also possible to note the high feeding plasticity of Cyanocharax alburnus and Gymnogeophagus gymnogenys, which has shifted their diets according to the available food item in each environment. Many alterations in female’s ovaries of these species were observed through histopathological analysis. The presence of histopathological variations may indicate that fish respond to direct effect of contaminants as well as secondary effects caused by stress. Finally, fish assemblages from Delta do rio Jacuí are affected by many impacts from the surroundings. The use of different methods to evaluate environmental quality showed to be very important, providing a wide range of information allowing inferring more precisely about the current ecosystem situation.

Submitted by GUADALUPE SAMPAIO FERREIRA null (guadasampaio@gmail.com) on 2017-03-15T19:22:17Z No. of bitstreams: 1 Tese_Guadalupe_Sampaio_Ferreira.pdf: 2230762 bytes, checksum: 8f45e525792b3bc473f7830fae3daa07 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2017-03-15T19:37:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ferreira_g_dr_jabo.pdf: 2230762 bytes, checksum: 8f45e525792b3bc473f7830fae3daa07 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-15T19:37:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ferreira_g_dr_jabo.pdf: 2230762 bytes, checksum: 8f45e525792b3bc473f7830fae3daa07 (MD5) Previous issue date: 2017-02-10 / Com o objetivo de estudar a fisiopatologia da reação inflamatória em tilápias, este estudo avaliou a participação do tratamento exógeno com cetoconazol sobre o efeito glicocorticoide de tilápias do Nilo, Oreochromis niloticus, durante aerocistite aguda induzida por Aeromonas hydrophila. Para tanto, foram utilizadas 91 tilápias, constituindo cinco tratamentos: Não tratado e não inoculado (Padrão fisiológico); Não tratado e inoculado (controle infectado); Tratado com dexametasona (DEXA) e inoculado; Tratado com cetoconazol (CETO) e inoculado; Tratado com DEXA + CETO e inoculado. Após anestesia profunda nos períodos experimentais de 6, 24 e 48 horas pós-inoculação (HPI) coletou-se o exsudato para contagem celular e sangue para determinação do hemograma completo, proteinograma, bioquímico sérico. Na fase inicial da infecção (6HPI), o tratamento subcutâneo das tilápias com 200 UI-kg-1 de cetoconazol resultou em atividade pró-inflamatória caracterizada pelo aumento do acúmulo de granulócitos e diminuição de trombócitos no exsudato, associado à neutrofilia e aumento dos níveis séricos de haptoglobina e ceruloplasmina. No quadro eritrocitário inicial de tilápias tratadas com cetoconazol, observou-se diminuição do número de hemácias com diminuição do hematócrito e do volume corpuscular médio, caracterizando alterações microcíticas comuns em deficiências por ferro, corroborando os aumentos observados nos níveis séricos das proteínas de fase aguda haptoglobina e ceruloplasmina. No pico de exsudação celular para o foco inflamado 24 HPI, tilápias tratadas com cetoconazol apresentaram aumento do acúmulo de trombócitos associado à trombocitopenia e aumento dos níveis séricos de transferrina. Na fase tardia da infecção (48 HPI), o tratamento subcutâneo das tilápias com 200 UI-kg-1 de cetoconazol resultou em atividade pró-inflamatória caracterizada pelo aumento do acúmulo de macrófagos no exsudato associado ao quadro de monocitose e diminuição da produção de espécies reativas de oxigênio na atividade respiratória leucocitária. Contudo, os resultados da participação do cetoconazol no efeito glicocorticoide demonstraram atividade pró-inflamatória por favorecer a cinética de acúmulo de granulócitos na fase inicial e de macrófagos em fase mais tardia com aumento de atividade de proteínas de fase aguda, entretanto, efeitos deletérios transitórios foram evidentes no quadro hematológico associados à patogenia da aeromonose em animais tratados com este derivado do imidazol.