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Obtenção e análise de sequências similares a Tnt1 em espécies nativas de Petunia Juss.(Solanaceae)

Kriedt, Raquel Athayde January 2012 (has links)
Elementos de transposição são caracterizados como segmentos de DNA capazes de mover-se no genoma em que estão inseridos. A diversidade e abundância desses elementos variam de espécie para espécie, sendo sua distribuição nem uniforme, nem aleatória. Com a grande quantidade de informações provenientes de projetos genoma, a busca de um sistema universal para classificação desses elementos é uma constante. Atualmente, elementos de transposição são divididos em duas classes, sendo os elementos da classe I, ou retrotransposons, divididos em cinco ordens. A ordem mais abundante em plantas é a dos LTR retrotransposons, no qual se insere a superfamília Ty1/Copia. Essa superfamília apresenta diversas famílias de elementos, dentre elas a família Tnt1. Tnt1 foi o primeiro elemento de transposição caracterizado na família Solanaceae, sendo um dos retrotransposons mais bem estudados em plantas. Originalmente isolado do genoma de Nicotiana tabacum, elementos similares a Tnt1 já foram encontrados em pimenta, berinjela, tomate, batata, e em petúnias de jardim. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho foi caracterizar a diversidade dos retrotransposons com LTR do clado Tork da superfamília Copia, relacionados ao elemento Tnt1, em espécies nativas do gênero Petunia. Para tanto, sequências foram obtidas a partir de reação de PCR com primers já descritos na literatura, com posterior clonagem dos fragmentos obtidos, e sequenciamento dos clones. Um total de 148 sequências únicas foram obtidas de 21 taxa diferentes, incluindo três espécies de Calibrachoa e uma espécie de Fabiana, ambos os gêneros relacionados à Petunia. Análises de relacionamento entre as sequências sugerem a classificação dessas em dez diferentes famílias de retrotransposons com LTR do tipo Copia (RLC), muitas com baixa diferenciação entre as sequências de uma mesma família. Entre essas, uma família de sequências quase que exclusiva de taxa encontrados em substrato com baixa umidade. Para uma visão mais completa, representantes dos diferentes grupos de Tnt1, Retrolyc1, e Retrosol foram incluídos na análise. Foi possível observar que as sequências obtidas no presente trabalho não são compartilhadas entre os elementos dos demais gêneros incluídos. As diferentes sequências aqui obtidas possibilitaram estudos de relacionamento e diversidade, e abrem portas para a utilização desses elementos em estudos subsequentes nos gêneros em questão, assim como em outros gêneros relacionados, uma vez que a conservação de partes do elemento é bastante grande. / Transposable elements are characterized as segments of DNA capable of moving across different parts of the host genome. Diversity and abundance of these elements vary from species to species, and distribution within a genome is usually neither random nor uniform. The amount of information resulting from genome projects demands a universal system for transposable elements’ classification. Nowadays, these elements are classified into two classes, with class I elements, or retrotransposons, being divided into five orders. The most abundant order in plants is the LTR retrotransposons order, in which the Ty1/Copia superfamily is classified. Ty1/Copia presents several families, being the Tnt1 family one of them. Tnt1 was the first transposable element characterized in Solanaceae, being the most well known retrotransposon in plants. Originally isolated from Nicotiana tabacum, Tnt1-related elements have been reported in peppers, eggplant, tomato, potato, and petunias. Therefore, the aim of this work was to characterize the diversity of LTR retrotransposons from the Tork clade of the Copia superfamily, related to Tnt1 elements, in wild Petunia species. Thereunto, sequences were retrieved from PCR reactions with primers previously described, cloned into competent cells. A total of 148 unique sequences were obtained from 21 different taxa, including three Calibrachoa and one Fabiana species, both genera closely related to Petunia. Relationship analysis among sequences suggests their classification into ten families of retrotransposons with LTR from Copia superfamily (RLC), most of low sequence diversity within a family. Among all families, one clade of sequences presented almost exclusively sequences of taxa find under substrates of low humidity conditions. For a more complete view, Tnt1, Retrolyc1, and Retrosol representatives were included in the analysis. Sequences retrieved in the present work are not shared among elements of remaining genera included. The diversity of sequences obtained here made relationship and diversity studies possible, and may be used in further investigations of the genera here studied, as well as in other related genera, since there are conserved fragments along these elements.
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Análise da diversidade genética e morfológica de Petunia axillaris (Lam.) Britton, Sterns e Poggenb (Solanaceae)

Turchetto, Caroline January 2010 (has links)
O Bioma Pampa é um dos seis grandes biomas brasileiros, estendendo-se também para a Argentina e o Uruguai. Em termos geomorfológicos, é uma região complexa, pois inclui diversas unidades geradas em contextos tectônicos e paleogeográficos distintos, sendo que é bem conhecida a continuidade geológica entre o Uruguai e RS. A conservação dos campos tem sido negligenciada; ameaçada pelo aumento das áreas com agricultura e silvicultura (pinus e eucalipto), e por uma aplicação leniente da legislação ambiental, como se tais formações naturais abertas não tivessem a mesma importância das florestas. O gênero Petunia Juss. (Solanaceae) tem uma longa história de cruzamentos artificiais, sendo os híbridos de P. axillaris e P. integrifolia mundialmente disseminados como plantas ornamentais conhecidos como petúnias de jardim. P. axillaris possui ampla distribuição geográfica, ocorrendo em todo Bioma Pampa, geralmente em afloramentos rochosos em beira de estrada. Através de caracteres morfológicos da flor, a espécie é dividida em três subespécies: P. axillaris ssp. axillaris, P. axillaris ssp. parodii e P. axillaris ssp. subandina. Nesse trabalho foram realizadas análises moleculares, morfológicas e ecológicas, através do sequenciamento dos espaçadores plastidiais trnS-trnG e trnH-psbA, da medida dos caracteres florais e da utilização de dados climáticos. O trabalho foi realizado com populações naturais abrangendo a área de distribuição da espécie. Os limites geográficos das subespécies são amplamente equivalentes entre os critérios morfológicos e ecológicos; para as subespécies axillaris e parodii, os dados suportam os dois grupos, já em relação às subespécies axillaris e subandina, esta separação é fraca, porque apesar de serem ecologicamente distintas, essas populações não são morfologicamente distintas uma da outra. Os dados de cpDNA não suportam os diferentes grupos, visto que as subespécies compartilham haplótipos, o que sugere divergência recente e retenção de polimorfismo ancestral. Apesar da falta de resolução genealógica e de apresentar estruturação geográfica pouco definida, os dados de cpDNA fornecem informações relevantes em relação à biogeografia da espécie, a qual teria tomado uma vasta proporção geográfica durante os períodos frio e seco do Quaternário, período de expansão dos campos. Os padrões de variação em P. axillaris, principalmente em relação à morfológica, são congruentes com a continuidade geológica entre RS e Uruguai. Mais estudos, com outras espécies, serão 14 relevantes para determinar se existe um padrão geográfico de distribuição das espécies nessa região. / The Pampa is one of the six major Brazilian Biome, covering also the Argentina and Uruguay Countries. Concerning to geomorphology, it is a complex region because includes several units generates in different tectonic and paleogeographic contexts and the geological continuity between Uruguay and Rio Grande do Sul (RS) State is very well known. This Biome is endangered because the increase of agriculture and forestry areas and its conservations has been neglected. There is lax enforcement of environmental legislation and has been given less importance than the rain forests. The genus Petunia Juss. (Solanaceae) has a long history of artificial breeding being the hybrids of the P. axillaris e P. integrifolia worldwide disseminated as ornamental plants and are known as P. X hybrida or garden petunia. P. axillaris has a wide geographic distribution, occurring throughout the Pampa Biome, usually in outcrops and in roadside. Based on morphological characters of the flowers, this species is separated in three subspecies: P. axillaris ssp. axillaris, P. axillaris ssp. parodii e P. axillaris ssp. subandina. In this work were carried out molecular, morphological and ecological analysis by sequencing of cpDNA trnS-trnG e trnH-psbA intergenic spacers, measurement of the floral traits and use of climate data. Natural populations were studied in the whole area of species distribution. The geographical limits of the subspecies are in agreement with morphological and ecological criteria and for ssp. axillaris e ssp. parodii, the data support the two groups. The separation between the ssp. axillaris e ssp. subandina is weak because although they are ecologically distinct, they are not morphologically different. The cpDNA data do not support the exclusivity of these groups since haplotypes were sharing among the three groups, suggesting recent divergence and ancestral polymorphism retention. Despite the lack of genealogical resolution and unclear geographical structure, the cpDNA data provide relevant information about the biogeographic history of this species, which would have occupied a large geographical area during the cold and dry in Quaternary when there was grassland expansion. The patterns of variation in P. axillaris, especially morphological variations, are consistent with the geological continuity between RS and Uruguay. Further studies including others species will be important to determine the existence of a geographic pattern of the species distribution in this region.
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Biochemical studies on pollen and pollen-pistil interaction in `Petunia hybrida` / by Rajender Kumar Kamboj

Kamboj, Rajender Kumar January 1986 (has links)
Bibliography: leaves 124-136 / xviii, 136 leaves, [22] leaves of plates : ill ; 30 cm. / Title page, contents and abstract only. The complete thesis in print form is available from the University Library. / Thesis (Ph.D.)--University of Adelaide, Dept. of Agricultural Biochemistry, 1986
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Análise da diversidade genética e morfológica de Petunia axillaris (Lam.) Britton, Sterns e Poggenb (Solanaceae)

Turchetto, Caroline January 2010 (has links)
O Bioma Pampa é um dos seis grandes biomas brasileiros, estendendo-se também para a Argentina e o Uruguai. Em termos geomorfológicos, é uma região complexa, pois inclui diversas unidades geradas em contextos tectônicos e paleogeográficos distintos, sendo que é bem conhecida a continuidade geológica entre o Uruguai e RS. A conservação dos campos tem sido negligenciada; ameaçada pelo aumento das áreas com agricultura e silvicultura (pinus e eucalipto), e por uma aplicação leniente da legislação ambiental, como se tais formações naturais abertas não tivessem a mesma importância das florestas. O gênero Petunia Juss. (Solanaceae) tem uma longa história de cruzamentos artificiais, sendo os híbridos de P. axillaris e P. integrifolia mundialmente disseminados como plantas ornamentais conhecidos como petúnias de jardim. P. axillaris possui ampla distribuição geográfica, ocorrendo em todo Bioma Pampa, geralmente em afloramentos rochosos em beira de estrada. Através de caracteres morfológicos da flor, a espécie é dividida em três subespécies: P. axillaris ssp. axillaris, P. axillaris ssp. parodii e P. axillaris ssp. subandina. Nesse trabalho foram realizadas análises moleculares, morfológicas e ecológicas, através do sequenciamento dos espaçadores plastidiais trnS-trnG e trnH-psbA, da medida dos caracteres florais e da utilização de dados climáticos. O trabalho foi realizado com populações naturais abrangendo a área de distribuição da espécie. Os limites geográficos das subespécies são amplamente equivalentes entre os critérios morfológicos e ecológicos; para as subespécies axillaris e parodii, os dados suportam os dois grupos, já em relação às subespécies axillaris e subandina, esta separação é fraca, porque apesar de serem ecologicamente distintas, essas populações não são morfologicamente distintas uma da outra. Os dados de cpDNA não suportam os diferentes grupos, visto que as subespécies compartilham haplótipos, o que sugere divergência recente e retenção de polimorfismo ancestral. Apesar da falta de resolução genealógica e de apresentar estruturação geográfica pouco definida, os dados de cpDNA fornecem informações relevantes em relação à biogeografia da espécie, a qual teria tomado uma vasta proporção geográfica durante os períodos frio e seco do Quaternário, período de expansão dos campos. Os padrões de variação em P. axillaris, principalmente em relação à morfológica, são congruentes com a continuidade geológica entre RS e Uruguai. Mais estudos, com outras espécies, serão 14 relevantes para determinar se existe um padrão geográfico de distribuição das espécies nessa região. / The Pampa is one of the six major Brazilian Biome, covering also the Argentina and Uruguay Countries. Concerning to geomorphology, it is a complex region because includes several units generates in different tectonic and paleogeographic contexts and the geological continuity between Uruguay and Rio Grande do Sul (RS) State is very well known. This Biome is endangered because the increase of agriculture and forestry areas and its conservations has been neglected. There is lax enforcement of environmental legislation and has been given less importance than the rain forests. The genus Petunia Juss. (Solanaceae) has a long history of artificial breeding being the hybrids of the P. axillaris e P. integrifolia worldwide disseminated as ornamental plants and are known as P. X hybrida or garden petunia. P. axillaris has a wide geographic distribution, occurring throughout the Pampa Biome, usually in outcrops and in roadside. Based on morphological characters of the flowers, this species is separated in three subspecies: P. axillaris ssp. axillaris, P. axillaris ssp. parodii e P. axillaris ssp. subandina. In this work were carried out molecular, morphological and ecological analysis by sequencing of cpDNA trnS-trnG e trnH-psbA intergenic spacers, measurement of the floral traits and use of climate data. Natural populations were studied in the whole area of species distribution. The geographical limits of the subspecies are in agreement with morphological and ecological criteria and for ssp. axillaris e ssp. parodii, the data support the two groups. The separation between the ssp. axillaris e ssp. subandina is weak because although they are ecologically distinct, they are not morphologically different. The cpDNA data do not support the exclusivity of these groups since haplotypes were sharing among the three groups, suggesting recent divergence and ancestral polymorphism retention. Despite the lack of genealogical resolution and unclear geographical structure, the cpDNA data provide relevant information about the biogeographic history of this species, which would have occupied a large geographical area during the cold and dry in Quaternary when there was grassland expansion. The patterns of variation in P. axillaris, especially morphological variations, are consistent with the geological continuity between RS and Uruguay. Further studies including others species will be important to determine the existence of a geographic pattern of the species distribution in this region.
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Obtenção e análise de sequências similares a Tnt1 em espécies nativas de Petunia Juss.(Solanaceae)

Kriedt, Raquel Athayde January 2012 (has links)
Elementos de transposição são caracterizados como segmentos de DNA capazes de mover-se no genoma em que estão inseridos. A diversidade e abundância desses elementos variam de espécie para espécie, sendo sua distribuição nem uniforme, nem aleatória. Com a grande quantidade de informações provenientes de projetos genoma, a busca de um sistema universal para classificação desses elementos é uma constante. Atualmente, elementos de transposição são divididos em duas classes, sendo os elementos da classe I, ou retrotransposons, divididos em cinco ordens. A ordem mais abundante em plantas é a dos LTR retrotransposons, no qual se insere a superfamília Ty1/Copia. Essa superfamília apresenta diversas famílias de elementos, dentre elas a família Tnt1. Tnt1 foi o primeiro elemento de transposição caracterizado na família Solanaceae, sendo um dos retrotransposons mais bem estudados em plantas. Originalmente isolado do genoma de Nicotiana tabacum, elementos similares a Tnt1 já foram encontrados em pimenta, berinjela, tomate, batata, e em petúnias de jardim. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho foi caracterizar a diversidade dos retrotransposons com LTR do clado Tork da superfamília Copia, relacionados ao elemento Tnt1, em espécies nativas do gênero Petunia. Para tanto, sequências foram obtidas a partir de reação de PCR com primers já descritos na literatura, com posterior clonagem dos fragmentos obtidos, e sequenciamento dos clones. Um total de 148 sequências únicas foram obtidas de 21 taxa diferentes, incluindo três espécies de Calibrachoa e uma espécie de Fabiana, ambos os gêneros relacionados à Petunia. Análises de relacionamento entre as sequências sugerem a classificação dessas em dez diferentes famílias de retrotransposons com LTR do tipo Copia (RLC), muitas com baixa diferenciação entre as sequências de uma mesma família. Entre essas, uma família de sequências quase que exclusiva de taxa encontrados em substrato com baixa umidade. Para uma visão mais completa, representantes dos diferentes grupos de Tnt1, Retrolyc1, e Retrosol foram incluídos na análise. Foi possível observar que as sequências obtidas no presente trabalho não são compartilhadas entre os elementos dos demais gêneros incluídos. As diferentes sequências aqui obtidas possibilitaram estudos de relacionamento e diversidade, e abrem portas para a utilização desses elementos em estudos subsequentes nos gêneros em questão, assim como em outros gêneros relacionados, uma vez que a conservação de partes do elemento é bastante grande. / Transposable elements are characterized as segments of DNA capable of moving across different parts of the host genome. Diversity and abundance of these elements vary from species to species, and distribution within a genome is usually neither random nor uniform. The amount of information resulting from genome projects demands a universal system for transposable elements’ classification. Nowadays, these elements are classified into two classes, with class I elements, or retrotransposons, being divided into five orders. The most abundant order in plants is the LTR retrotransposons order, in which the Ty1/Copia superfamily is classified. Ty1/Copia presents several families, being the Tnt1 family one of them. Tnt1 was the first transposable element characterized in Solanaceae, being the most well known retrotransposon in plants. Originally isolated from Nicotiana tabacum, Tnt1-related elements have been reported in peppers, eggplant, tomato, potato, and petunias. Therefore, the aim of this work was to characterize the diversity of LTR retrotransposons from the Tork clade of the Copia superfamily, related to Tnt1 elements, in wild Petunia species. Thereunto, sequences were retrieved from PCR reactions with primers previously described, cloned into competent cells. A total of 148 unique sequences were obtained from 21 different taxa, including three Calibrachoa and one Fabiana species, both genera closely related to Petunia. Relationship analysis among sequences suggests their classification into ten families of retrotransposons with LTR from Copia superfamily (RLC), most of low sequence diversity within a family. Among all families, one clade of sequences presented almost exclusively sequences of taxa find under substrates of low humidity conditions. For a more complete view, Tnt1, Retrolyc1, and Retrosol representatives were included in the analysis. Sequences retrieved in the present work are not shared among elements of remaining genera included. The diversity of sequences obtained here made relationship and diversity studies possible, and may be used in further investigations of the genera here studied, as well as in other related genera, since there are conserved fragments along these elements.
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Análise da diversidade genética e morfológica de Petunia axillaris (Lam.) Britton, Sterns e Poggenb (Solanaceae)

Turchetto, Caroline January 2010 (has links)
O Bioma Pampa é um dos seis grandes biomas brasileiros, estendendo-se também para a Argentina e o Uruguai. Em termos geomorfológicos, é uma região complexa, pois inclui diversas unidades geradas em contextos tectônicos e paleogeográficos distintos, sendo que é bem conhecida a continuidade geológica entre o Uruguai e RS. A conservação dos campos tem sido negligenciada; ameaçada pelo aumento das áreas com agricultura e silvicultura (pinus e eucalipto), e por uma aplicação leniente da legislação ambiental, como se tais formações naturais abertas não tivessem a mesma importância das florestas. O gênero Petunia Juss. (Solanaceae) tem uma longa história de cruzamentos artificiais, sendo os híbridos de P. axillaris e P. integrifolia mundialmente disseminados como plantas ornamentais conhecidos como petúnias de jardim. P. axillaris possui ampla distribuição geográfica, ocorrendo em todo Bioma Pampa, geralmente em afloramentos rochosos em beira de estrada. Através de caracteres morfológicos da flor, a espécie é dividida em três subespécies: P. axillaris ssp. axillaris, P. axillaris ssp. parodii e P. axillaris ssp. subandina. Nesse trabalho foram realizadas análises moleculares, morfológicas e ecológicas, através do sequenciamento dos espaçadores plastidiais trnS-trnG e trnH-psbA, da medida dos caracteres florais e da utilização de dados climáticos. O trabalho foi realizado com populações naturais abrangendo a área de distribuição da espécie. Os limites geográficos das subespécies são amplamente equivalentes entre os critérios morfológicos e ecológicos; para as subespécies axillaris e parodii, os dados suportam os dois grupos, já em relação às subespécies axillaris e subandina, esta separação é fraca, porque apesar de serem ecologicamente distintas, essas populações não são morfologicamente distintas uma da outra. Os dados de cpDNA não suportam os diferentes grupos, visto que as subespécies compartilham haplótipos, o que sugere divergência recente e retenção de polimorfismo ancestral. Apesar da falta de resolução genealógica e de apresentar estruturação geográfica pouco definida, os dados de cpDNA fornecem informações relevantes em relação à biogeografia da espécie, a qual teria tomado uma vasta proporção geográfica durante os períodos frio e seco do Quaternário, período de expansão dos campos. Os padrões de variação em P. axillaris, principalmente em relação à morfológica, são congruentes com a continuidade geológica entre RS e Uruguai. Mais estudos, com outras espécies, serão 14 relevantes para determinar se existe um padrão geográfico de distribuição das espécies nessa região. / The Pampa is one of the six major Brazilian Biome, covering also the Argentina and Uruguay Countries. Concerning to geomorphology, it is a complex region because includes several units generates in different tectonic and paleogeographic contexts and the geological continuity between Uruguay and Rio Grande do Sul (RS) State is very well known. This Biome is endangered because the increase of agriculture and forestry areas and its conservations has been neglected. There is lax enforcement of environmental legislation and has been given less importance than the rain forests. The genus Petunia Juss. (Solanaceae) has a long history of artificial breeding being the hybrids of the P. axillaris e P. integrifolia worldwide disseminated as ornamental plants and are known as P. X hybrida or garden petunia. P. axillaris has a wide geographic distribution, occurring throughout the Pampa Biome, usually in outcrops and in roadside. Based on morphological characters of the flowers, this species is separated in three subspecies: P. axillaris ssp. axillaris, P. axillaris ssp. parodii e P. axillaris ssp. subandina. In this work were carried out molecular, morphological and ecological analysis by sequencing of cpDNA trnS-trnG e trnH-psbA intergenic spacers, measurement of the floral traits and use of climate data. Natural populations were studied in the whole area of species distribution. The geographical limits of the subspecies are in agreement with morphological and ecological criteria and for ssp. axillaris e ssp. parodii, the data support the two groups. The separation between the ssp. axillaris e ssp. subandina is weak because although they are ecologically distinct, they are not morphologically different. The cpDNA data do not support the exclusivity of these groups since haplotypes were sharing among the three groups, suggesting recent divergence and ancestral polymorphism retention. Despite the lack of genealogical resolution and unclear geographical structure, the cpDNA data provide relevant information about the biogeographic history of this species, which would have occupied a large geographical area during the cold and dry in Quaternary when there was grassland expansion. The patterns of variation in P. axillaris, especially morphological variations, are consistent with the geological continuity between RS and Uruguay. Further studies including others species will be important to determine the existence of a geographic pattern of the species distribution in this region.
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Obtenção e análise de sequências similares a Tnt1 em espécies nativas de Petunia Juss.(Solanaceae)

Kriedt, Raquel Athayde January 2012 (has links)
Elementos de transposição são caracterizados como segmentos de DNA capazes de mover-se no genoma em que estão inseridos. A diversidade e abundância desses elementos variam de espécie para espécie, sendo sua distribuição nem uniforme, nem aleatória. Com a grande quantidade de informações provenientes de projetos genoma, a busca de um sistema universal para classificação desses elementos é uma constante. Atualmente, elementos de transposição são divididos em duas classes, sendo os elementos da classe I, ou retrotransposons, divididos em cinco ordens. A ordem mais abundante em plantas é a dos LTR retrotransposons, no qual se insere a superfamília Ty1/Copia. Essa superfamília apresenta diversas famílias de elementos, dentre elas a família Tnt1. Tnt1 foi o primeiro elemento de transposição caracterizado na família Solanaceae, sendo um dos retrotransposons mais bem estudados em plantas. Originalmente isolado do genoma de Nicotiana tabacum, elementos similares a Tnt1 já foram encontrados em pimenta, berinjela, tomate, batata, e em petúnias de jardim. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho foi caracterizar a diversidade dos retrotransposons com LTR do clado Tork da superfamília Copia, relacionados ao elemento Tnt1, em espécies nativas do gênero Petunia. Para tanto, sequências foram obtidas a partir de reação de PCR com primers já descritos na literatura, com posterior clonagem dos fragmentos obtidos, e sequenciamento dos clones. Um total de 148 sequências únicas foram obtidas de 21 taxa diferentes, incluindo três espécies de Calibrachoa e uma espécie de Fabiana, ambos os gêneros relacionados à Petunia. Análises de relacionamento entre as sequências sugerem a classificação dessas em dez diferentes famílias de retrotransposons com LTR do tipo Copia (RLC), muitas com baixa diferenciação entre as sequências de uma mesma família. Entre essas, uma família de sequências quase que exclusiva de taxa encontrados em substrato com baixa umidade. Para uma visão mais completa, representantes dos diferentes grupos de Tnt1, Retrolyc1, e Retrosol foram incluídos na análise. Foi possível observar que as sequências obtidas no presente trabalho não são compartilhadas entre os elementos dos demais gêneros incluídos. As diferentes sequências aqui obtidas possibilitaram estudos de relacionamento e diversidade, e abrem portas para a utilização desses elementos em estudos subsequentes nos gêneros em questão, assim como em outros gêneros relacionados, uma vez que a conservação de partes do elemento é bastante grande. / Transposable elements are characterized as segments of DNA capable of moving across different parts of the host genome. Diversity and abundance of these elements vary from species to species, and distribution within a genome is usually neither random nor uniform. The amount of information resulting from genome projects demands a universal system for transposable elements’ classification. Nowadays, these elements are classified into two classes, with class I elements, or retrotransposons, being divided into five orders. The most abundant order in plants is the LTR retrotransposons order, in which the Ty1/Copia superfamily is classified. Ty1/Copia presents several families, being the Tnt1 family one of them. Tnt1 was the first transposable element characterized in Solanaceae, being the most well known retrotransposon in plants. Originally isolated from Nicotiana tabacum, Tnt1-related elements have been reported in peppers, eggplant, tomato, potato, and petunias. Therefore, the aim of this work was to characterize the diversity of LTR retrotransposons from the Tork clade of the Copia superfamily, related to Tnt1 elements, in wild Petunia species. Thereunto, sequences were retrieved from PCR reactions with primers previously described, cloned into competent cells. A total of 148 unique sequences were obtained from 21 different taxa, including three Calibrachoa and one Fabiana species, both genera closely related to Petunia. Relationship analysis among sequences suggests their classification into ten families of retrotransposons with LTR from Copia superfamily (RLC), most of low sequence diversity within a family. Among all families, one clade of sequences presented almost exclusively sequences of taxa find under substrates of low humidity conditions. For a more complete view, Tnt1, Retrolyc1, and Retrosol representatives were included in the analysis. Sequences retrieved in the present work are not shared among elements of remaining genera included. The diversity of sequences obtained here made relationship and diversity studies possible, and may be used in further investigations of the genera here studied, as well as in other related genera, since there are conserved fragments along these elements.
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The synthesis of short-chain saturated fatty acids and their role in the control of ethylene sensitivity in senescing petunia flowers

Botha, Marie Louise 26 March 2012 (has links)
Ph.D. / The sensitivity of Petunia hybrida flowers to the plant hormone ethylene increases during the early stages of senescence and directly after pollination of the flowers. During these early stages .of senescence, ethylene production is very low and only increases after ethylene sensitivity had already increased. The increase in ethylene sensitivity is due to the forming of short-chain saturated fatty acids that accumulate in the petal tissue during the early stage of senescence. Following pollination, these acids are formed in the stylar tissue and transported to the corolla where it causes a rapid increase in ethylene sensitivity. The synthesis of short-chain saturated fatty acids is controlled by the enzyme acetyl-GoA carboxylase. As the acitivity of this enzyme decreases, the concentrations of short-chain fatty acids increase due to the lack of malonyl-GoA required for chain lengthening. During the early stages of senescence, the activity of this enzyme decreases simultaneously with an increase in short-chain fatty acids and ethylene-sensitivity. The results of this study indicate that acetyl-GoA carboxylase is a key enzyme involved in the control of ethylene sensitivity in petunia flowers.
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Characterization of <i>Petunia x hybrida</i> ‘Mitchell Diploid’ Metacaspases during Petal Senescence

Moon, Youyoun 14 December 2010 (has links)
No description available.
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Aplinkos veiksnių įtaka petunijų (Petunia) regeneracijai in vitro / The Influence of Environmental Factors on the Regeneration of Petunia (Petunia) in vitro

Doveikaitė, Miglė 03 September 2010 (has links)
Darbo objektu pasirinkti Petunia genties augalai, siekiant įvertinti, šių plačiai naudojamų balkonų ir lauko želdinimui gėlių, fitohormonų ir šviesos – tamsos įtaką audinių regeneracijai. Atskirų veiksnių poveikiai literatūroje dažnai aprašomi, tačiau kompleksinis veikimas analizuojamas mažai. Tokio tipo tyrimai yra svarbūs tiek mokslui, tiek verslui. Atlikto tyrimo tikslas ištirti kompleksinę fitohormonų ir šviesos įtaką Petunia regeneracijai in vitro. Tikslui pasiekti atlikta mokslinės ir metodinės literatūros, susijusios su darbo tema, analizė. Atlikti eksperimentai su izoliuotais Petunia eksplantais, kultivuojant juos skirtingos sudėties terpėse šviesoje ir tamsoje bei įvertinta eksplantuose įvykusi regeneracija. Pagrindinis metodas tyrimams atlikti – 1IAR ir 5BAP fitohormonų integravimas į MS terpę. Metodo akcentas – šviesos ir tamsos sąlygos, kuriose buvo kultivuojami eksplantai terpėje su fitohormonais ir kontrolinėje (be fitohormonų) MS terpėje. Atlikus tyrimą nustatyta, kad P. nana compacta stiebo ir lapo eksplantai pasižymi 100% regeneracija kultivuojami terpėje su fitohormonais tamsoje. Nustatyta, kad lapų eksplantuose rizogenezė indukuojama beveik 2 kartus rečiau nei iš stiebų izoliuotuose audiniuose. Rezultatų analizė parodė, kad kultivuojant stiebo dalis, 56% daugiau ūglių eksplantai suformuoja terpėje su fitohormonais ir visais atvejais tamsoje jų buvo mažiau nei šviesoje. Daugiausiai, 3,1 ūglių/eksplante, buvo P. grandiflora MS (1IAR:5:BAP) regenerantuose... [toliau žr. visą tekstą] / Plants of Petunia genus, flowers widely used for planting on balconies and outdoors, have been selected as the object of the Paper in order to estimate the influence of phytohormones and light – darkness on regeneration of tissues. The influence of particular factors is often described in literature, however, complex influence thereof is analysed scarcely. Researches of this type are very important for both science and business. Aim of the research carried out is to study the complex influence of phytohormones and light on regeneration in vitro of Petunia. Analysis of scientific and methodical readings related to subject of the Paper has bee carried out in order to achieve the above aim. Experiments with isolated Petunia explants have been made by cultivating them in media of different compositions in light and darkness and regeneration that took place in the explants was evaluated. The key research method was integration of 1IAA and 5BAP phytohormones into MS medium. Focus of the method – conditions of light and darkness under which the explants were cultivated in the medium with phytohormones and control (without phytohormones) MS medium. Upon completion it was determined 100% P. nana compacta footstalk and leaf explants regeneration cultivating them in the medium with phytohormones in darkness. It has been determined that rhizogenesis induced in leaf explants was above 2 times less than in case of footstalk in isolated tissues. The results analysis showed that, in case... [to full text]

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