Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-06-13T20:01:46Z No. of bitstreams: 1 JoaoVitorCamposESilva_TESE.pdf: 12506950 bytes, checksum: e9fc88f37cc1beed649e156bf769125b (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-06-19T12:27:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JoaoVitorCamposESilva_TESE.pdf: 12506950 bytes, checksum: e9fc88f37cc1beed649e156bf769125b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-19T12:27:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JoaoVitorCamposESilva_TESE.pdf: 12506950 bytes, checksum: e9fc88f37cc1beed649e156bf769125b (MD5) Previous issue date: 2016-06-22 / Sistemas de ?gua doce representam os ambientes mais amea?ados do mundo, com taxas de extin??o consideravelmente maiores que ambientes terrestres. Esses sistemas podem ser descritos como sistemas s?cio ecol?gicos, onde rela??es sociais, biol?gicas e biof?sicas s?o complexas e rec?procas. Um bom exemplo dessa complexidade est? nas v?rzeas amaz?nicas, onde uma alt?ssima diversidade biol?gica e ?tnica coexiste. Estabelecer planos de conserva??o para as v?rzeas da Amaz?nia ? uma tarefa hom?rica, uma vez que as amea?as que pairam sob esses ambientes n?o param de crescer. Diante da insufici?ncia governamental, em termos de recursos financeiros e humanos, argumentamos que a inclus?o de comunidades locais no processo de conserva??o pode ser uma eficiente estrat?gia. Esses esquemas de conserva??o participativa t?m sido implementados em v?rios ecossistemas do mundo, visando a descentraliza??o da conserva??o e o empoderamento das comunidades locais. No entanto, a literatura global carece de estudos que avaliem os efeitos desses esquemas sob ? luz dos principais objetivos do mil?nio: conserva??o da biodiversidade, redu??o da pobreza e melhoria da qualidade de vida das comunidades tradicionais. Na presente tese avaliamos dois s?lidos sistemas de conserva??o participativa na Amaz?nia brasileira, o manejo comunit?rio do pirarucu e o manejo da tartaruga da Amaz?nia. Cada cap?tulo dessa tese traz uma abordagem diferente para essa problem?tica, avaliando os efeitos do manejo participativo em uma abordagem multi-tr?fica. Por fim, conclu?mos que a sociedade brasileira est? frente a dois modelos muito interessantes de conserva??o, que ainda precisam de ajustes, mas que possuem um potencial incr?vel de contribuir com a conserva??o da v?rzea e com a melhoria da qualidade de vida das comunidades locais.

Dissertação(mestrado)-Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Instituto de Oceanografia, 2010. / Submitted by Cristiane Silva (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2012-07-27T18:37:10Z No. of bitstreams: 1 dissertaao_marcondes_furg.pdf: 2005279 bytes, checksum: fc0c0eb36bbdf4eba569243c6a16f38d (MD5) / Approved for entry into archive by Bruna Vieira(bruninha_vieira@ibest.com.br) on 2012-07-27T18:56:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dissertaao_marcondes_furg.pdf: 2005279 bytes, checksum: fc0c0eb36bbdf4eba569243c6a16f38d (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-27T18:56:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertaao_marcondes_furg.pdf: 2005279 bytes, checksum: fc0c0eb36bbdf4eba569243c6a16f38d (MD5) Previous issue date: 2010 / O pescado é um alimento altamente perecível, e como tal exige cuidados especiais em sua manipulação, estando sujeito a contaminação por diversos organismos. Em condições normais de refrigeração, o prazo de vida útil dos alimentos está limitado pelos processos de deterioração enzimática, microbiológica e oxidativa o que limita seu prazo de distribuição e comercialização. A efetiva consolidação da aqüicultura depende do escoamento da produção que por sua vez dependerá da demanda dos produtos. Para que o consumo de pescado no Brasil seja ampliado, é necessário que haja oferta de produtos com a qualidade exigida pelo consumidor. Este trabalho objetivou avaliar o efeito sobre a embalagem em atmosfera modificada (EAM) em filés de pirarucu (Arapaima gigas). Foram utilizados espécimes provenientes de áreas de cultivo do Estado do Amazonas, da região de Manacapuru, Norte do Brasil, os quais foram beneficiados, eviscerados, filetados e acondicionados em sacos plásticos de alta densidade de etileno-álcool-vinilico – EVOH. As amostras foram submetidas a 6 tratamentos: A (Controle), 4 atmosferas contendo aproximadamente 0,5 L de ar: B (100 % CO2); C (40% O2 / 60% CO2); D (50% O2 / 50% CO2), E (30% O2 / 30% N2 / 40% CO2) e um F (a vácuo). As amostras embaladas foram mantidas sob refrigeração, na faixa de 2 ± 1oC, quando foram submetidas a análise nos tempos zero,1,7,14,21,30,45 e 50 dias de armazenamento refrigerado em estufa climatizada. Foram realizadas analises físico-químicas (bases voláteis totais – N-BVT, pH), da estabilidade lipídica (TBA), de textura (força de cisalhamento), de cor e microbiológicas. Observou-se que as amostras mantidas em aerobiose (controle) apresentaram um rápido aumento dos valores de N-BVT, com seu pico máximo no 50º dia de estocagem (67,59 mg N-BVT/100 g). A produção de N-BVT nos outros tratamentos manteve-se, durante o decorrer do período de armazenamento, em torno de 21 mg de N-BVT/100g. As amostras controle apresentaram aumento de pH, a partir do 30º dia de armazenamento, tendo seu valor máximo (6,98) no 50º dia. Os tratamentos com atmosferas modificadas mostraram comportamento de valores de pH ao longo do armazenamento semelhantes e próximos ao pH inicial (6,4). A maioria dos tratamentos ultrapassou o limite proposto pela legislação no 30o dia de estocagem (7 Log. de UFC/g). Durante o período de armazenamento não foi detectada a presença de Salmonela nem de E. coli. . Os índices de TBA mantiveram-se abaixo de 1,5 mg MA/Kg, os padrões de cor oscilaram pouco e a textura (força de cisalhamento) variaram entre 2,39 e 6,88N. De acordo com os resultados obtidos, pode-se concluir que a embalagem B(100 % CO2), se destacou das demais, apresentando um bom desempenho, estendendo o prazo de vida-útil por até 45 dias, sendo eficaz para manutenção dos parâmetros físico-químicos e de qualidade dentro dos limites de aceitabilidade propostos pela legislação vigente. / Fish meal is a type of perishable food, which is required special cares in handling because it could be contaminated for several organisms. Under normal cooling conditions, the deadline of food shelf-life is limited by enzymatic, microbiological and oxidative deterioration processes limiting their period of distribution and marketing. The effective consolidation of aquaculture depends on the production outflow which in turn depends on product demand. For the fish consumption in Brazil be expanded, it is necessary product offering with the quality required by consumer. The aim of this study was to evaluate the effect of modified atmosphere packaging (MAP) in pirarucu fillets (Arapaima gigas) from Manacapuru region, Amazonas, Brazil. The specimens used were adquired from fishfarm and were processed, gutted, turned into fillet and packed in plastic bags with high density of ethylene-vinyl alcohol – EVOH. The samples were submitted to 6 treatments: A (control), and four atmosphere conditions with 0.5 L of air; B – 100% of CO2; C – 40% of O2 and 60% of CO2; D – 50% of O2 and 50% of CO2; E – 30% of O2, 30% of N2 and 40% of CO2; and F – vacuum. The packaged samples were maintained under cooling in temperatures about to 2 ± 1oC, and then the samples ware submitted to analysis with eight different times of storage and cooling in an acclimated heater (zero, 1, 7, 14, 21, 30, 45 and 50 days). Physical-chemical analysis (TVB-N, pH) lipid stability (TBARS), texture (breaking strength), color and microbiology were examined. The samples stored under aerobic conditions (A) showed fast increase of N-BVT values, with a peak on day 50th of storage (67.59mg TVB-N/100g). The production of TVB-N in the others treatments kept up about 21mg TVB-N /100g thought of storage time. The samples from treatment A (control) showed an increase of pH from the 30th day of storage getting its maximum value (6.98) on the 50th day. The others treatments demonstrated equal pH behavior, the values was near to initial pH value of the sample. The treatments exceeded the microbiological limit proposed by legislation on the 30th day of storage (7 Log de UFC/g). Throughout of the storage stage was not detected the occurrence of Salmonella e E. coli. . The TBA indexes remained below 1.5 mg MA / kg, the color patterns varied little and texture (shear force) ranged between 2.39 and 6.88 N. According to the results of this study, was concluded that the package B (100% CO2), distinguished from the others treatments, showing a fine performance, increasing the deadline of lifetime up to 45 days. Therefore this time is effective to the physical-chemical parameters maintenance and the quality of the fish within the limits of acceptability proposed by legislation in vigor.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-11-14T18:00:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_GeneticaPopulacoesPirarucus.pdf: 4393818 bytes, checksum: de194584ab198c388e23bb0cd690c5b3 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-11-19T16:48:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_GeneticaPopulacoesPirarucus.pdf: 4393818 bytes, checksum: de194584ab198c388e23bb0cd690c5b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-19T16:48:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_GeneticaPopulacoesPirarucus.pdf: 4393818 bytes, checksum: de194584ab198c388e23bb0cd690c5b3 (MD5) Previous issue date: 2008 / O pirarucu (Arapaima gigas) é um importante recurso pesqueiro da região amazônica, que vem sendo explorado desde o século XIX, havendo indícios de diminuição do tamanho populacional em algumas localidades ao longo da sua distribuição. O manejo da pesca vem sendo uma das estratégias adotadas para manter essa atividade pesqueira associada a conservação da espécie. Neste trabalho avaliamos aspectos populacionais de pirarucus de duas localidades da Reserva Mamirauá (Jarauá e Maraã), e comparamos estas com as populações já analisadas de Santarém e Tucuruí, verificando suas variabilidade e estrutura genética. Para isso foram utilizados sete locos microssatélites genotipados para 463 pirarucus da Reserva Mamirauá coletados ao longo de cinco anos. Nossos resultados encontraram uma maior diversidade genética para esta população em comparação as encontradas em Santarém e Tucuruí. As análises indicam que o manejo esta sendo ecologicamente eficiente, não tendo havido alterações significantes ao longo dos cinco anos de estudo. A migração lateral, associada a um possível padrão de retorno ao lago sem fidelidade espacial, parece ter grande importância na homogeneização genética local. Entretanto, este fator é espacialmente limitado, sendo observada uma pequena diferenciação entre os pirarucus do Jarauá e do Maraã. Entre localidades mais distantes, a diferenciação é maior, apesar de somente a distância não ser capaz de explicar esse fenômeno. Acreditamos que a diminuição populacional em localidades intermediárias, provavelmente causada por sobre-pesca, pode estar influenciando a conectividade ao longo dos pontos estudados. / The pirarucu (Arapaima gigas) is an important fishing resource in the Amazon which has been exploited since the XIXth century. There are indications of a decrease in population size in some parts of its distribution. Management is one of the strategies adopted to maintain fishing activity associated to the conservation of the species. We evaluate aspects of pirarucu populations in two places in the Mamirauá Reserve (Jarauá and Maraã), and compare these populations with those of Santarém and Tucuruí, analyzing their genetic variability and structure. In order to achieve this, seven microsatellite loci were genotyped for 463 pirarucus from Mamirauá Reserve collected along five years. Our results show a greater genetic diversity for this population in comparison to populations from Santarém and Tucuruí. Analyses indicate that management has been ecologically efficient, since there were no significant change in genetic diversity over the five years of study. Lateral migration, associated with a possible standardized return to lakes without spacial fidelity seems to have great importance for local genetic admixture. However, this admixture is limited in space, with a small degree of genetic differentiation seem between pirarucus from Jarauá and Maraã. When including more distant localities to the analysis, the differentiation is greater though geographic distance cannot explain all of this. We believe that a population decline in intermediate localities, probably caused by overexploiting is influencing the connectivity among the localities studied.

Arapaima gigas is the largest scaled freshwater fish in the world reaching over 250 kg. With growth rates of 10 kg+ within 12 months, A. gigas is considered as a promising candidate species for aquaculture development in South America. However, the lack of reproductive control in captivity is hindering the industry expansion. The work carried out in this doctoral thesis therefore aimed to better understand the species’ reproductive physiology, develop tools to identify gender and monitor gonad development, test hormonal therapies to induce ovulation and spawning and characterise the cephalic secretion for its potential roles in pheromone release and during parental care. Initially, a genomic study investigated the overall extent of polymorphism in A. gigas, which was found to be surprisingly low, with only 2.3 % of identified RAD-tags (135 bases long) containing SNPs. Then, a panel with 293 single nucleotide polymorphism (SNP) was used to characterise the genetic diversity and structure of a range of Amazon populations. Results revealed populations from the Amazon and Solimões appeared to be genetically different from the Araguaia population, while Tocantins population comprised individuals from both stocks. This data provided a tool for broodstock identification and future management. The PhD then aimed to evaluate the effects of slow-release mGnRH implants and different broodstock size pairings on maturation and spawning. Results showed that the implants stimulated the brain-pituitary-gonad axis resulting in increased plasma levels of testosterone (females) and 11-ketotestosterone in males, respectively regardless of pairing sizes. However, no spawning was observed. Results also showed the release of sex steroids with potential pheromonal action through the cephalic secretion, a biological fluid released from the adult head along the reproductive period. Thereafter, a non-surgical field endoscopy method was developed and validated for ovarian assessment and gender identification. The method was then used to describe the female gonopore and obtain biopsy of the ovary through cannulation which allowed the description of oogenesis in A. gigas. Importantly, oocytes obtained by cannulation confirmed that adult females under investigation were maturing with oocytes in final maturation stage but failed to ovulate/spawn. Another hormonal induction trial was therefore performed in which a combination of GnRHa (mGnRHa/sGnRHa) was used by injection to induce ovulation and spawning in selected maturing females with effects on oocyte maturation monitored post-induction through biopsy. However, this trial appeared to not be successful at inducing ovulation or spawning. Finally, the peptidome and proteome of the cephalic secretion was further characterised through the comparison between parental and non-parental fish. Results highlighted the complex role of this biological fluid including potential roles on the developing offspring during the parental care period. Overall, this doctoral thesis provided new basic and applied data on A. gigas reproduction and tools that can be used in future studies to better understand the environmental and hormonal control of oogenesis and spawning.

Orientador: Maeli Dal Pai Silva / Tese ( doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-18T12:24:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carani_FernandaRegina_D.pdf: 24872848 bytes, checksum: e4b7c794fa866be614e932ec5a33eaf6 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: O pirarucu (Arapaima gigas) caracteriza-se como uma espécie promissora para a Aqüicultura, devido principalmente às suas características de rápido crescimento e rusticidade. Sua criação em regime intensivo tem obtido enorme sucesso, podendo alcançar até 10 quilos de peso corporal em apenas um ano de criação. O pirarucu é considerado hoje uma das mais importantes espécies de peixes da bacia Amazônica e, por esta razão, é primordial que se investigue os mecanismos celulares e moleculares que controlam o rápido crescimento muscular, contribuindo com novas estratégias de criação e com a manutenção da espécie. O crescimento do músculo estriado esquelético nos peixes pode ocorrer por dois mecanismos: hipertrofia e/ou hiperplasia das fibras, a partir de células satélites ou mioblastos. Esse processo é controlado por Fatores Reguladores Miogênicos (MRFs) e pelo fator de crescimento Miostatina. O objetivo do presente estudo foi avaliar as características morfológicas e o crescimento muscular hipertrófico e hiperplásico, bem como analisar a expressão gênica e protéica da MyoD, da Miogenina e da Miostatina na musculatura esquelética do pirarucu (A. gigas), em diferentes fases de crescimento. Os animais utilizados no presente estudo foram provenientes de duas pisciculturas: na primeira, foram obtidos os "alevinos" (pós-larvas; 48 g); na segunda, os animais em diferentes estágios de crescimento, divididos em quatro grupos de acordo com o peso corporal. Grupo A (50 gramas, n=7), grupo B (420 gramas, n=7), grupo C (5,5 quilogramas, n=7) e grupo D (9,1 quilogramas, n=7). As amostras musculares foram coletadas, congeladas e submetidas à coloração HE, para avaliação do padrão morfológico das fibras, e à reação para a enzima NADH-TR, para avaliar o metabolismo oxidativo das fibras. Para avaliar o padrão de crescimento hiperplásico e hipertrófico da musculatura branca, foi calculado o menor diâmetro de uma população de fibras por animal, e estas foram distribuídas em classes, na dependência do seu diâmetro. A análise da expressão gênica de MyoD, miogenina e miostatina foi feita por Reação em Cadeia da Polimerase após Transcrição Reversa (RTqPCR); para análise da expressão protéica, foi utilizado o Western Blot. A distribuição das fibras em classes de diâmetro exibiu o seguinte padrão: o grupo A mostrou a maior parte das fibras na classe 20, o grupo B, na classe 50, o grupo C, nas classes 50 e 80, e o grupo D, na classe 80. Isso indica uma alta taxa de hiperplasia das fibras nos grupos menores (A e B) e alta hipertrofia das fibras nos grupos maiores (C e D). Para a análise da expressão gênica de MyoD e miogenina no músculo vermelho e branco dos "alevinos", não houve diferença estatística; para a miostatina, houve expressão diferencial, com os maiores níveis encontrados no músculo branco em comparação com o músculo vermelho. Na avaliação da expressão de MyoD e miogenina, tanto a expressão gênica como a expressão protéica não mostraram diferença significativa. Por outro lado, a expressão gênica da miostatina foi menor no grupo A e maior nos demais, e a expressão da proteína miostatina foi maior no grupo A, diminuindo nos demais grupos. Estes resultados refletem as características de crescimento muscular da espécie e sugerem que a expressão dos MRFs e da miostatina são responsáveis pelo balanço entre a hiperplasia e a hipertrofia das fibras, contribuindo para o rápido crescimento da espécie e a manutenção das características do filé / Abstract: Pirarucu (Arapaima gigas) is a promising fish species for Aquaculture programs mainly by the fast growing feature and rusticity. Their rearing under intensive conditions generated much successful results, as they reach up to 10 kilograms in just one year. Considered one of the most important fish species from Amazon basin, it is of primary interest to investigate the cellular and molecular mechanisms that control the fast muscle growth in pirarucu, providing information for new rearing strategies and species conservation. In most fish, skeletal muscle growth occurs by two mechanisms: hypertrophy and hyperplasia, from satellite cells or myoblasts. These process are under control by Myogenic Regulatory Factors (MRFs) and by the growth factor Myostatin. The animals were obtained from two pisciculture, where we got the alevin pirarucu (n=7; 48 grams weight), and the specimens at different growth stages, divided into groups according body weight. Group A (50 grams, n=7), group B (420 grams, n=7), group C (5,5 kilograms, n=7) and group D (9,1 kilograms, n=7). Muscle samples were collected, frozen and stained with HE for morphological analysis, and submitted to NADH-TR enzyme reaction for oxidative methabolism analysis. To evaluate hyperplasic and hypertrophic muscle growth, it was measured the smallest diameter from a set of fibers, which were grouped into diameter classes. Gene expression analysis of MyoD, Myogenin and Myostatin were performed by Quantitative Polimerase Chain Reaction after Reverse Transcription (RT-qPCR); protein content analysis was by Western Blot technique. Muscle fibers distribution in classes showed the following pattern: group A showed most fibers in class 20, group B, in class 50, group C, in classes 50 and 80, and group D, in class 80. This is an indicative of high fiber hiperplasia rate in groups A and B, and high hypertrophy in groups C and D. There was no statistical difference in MyoD and Myogenin genes expression in red and white muscles of pirarucu; however, Myostatin expression showed high levels in white muscle compared to red muscle. Evaluating MyoD and Myogenin expression in white muscle of pirarucu at different growth stages, both gene and protein levels were similar. Myostatin gene expression was low in group A and high in the other groups; on the other hand, Myostatin protein was high in group A and low in the other groups. These results reflect the muscle growth characteristics in pirarucu and suggest that the MRFs and Myostatin expression are controlling the balance between hyperplasic and hypertrophic mechanisms, promoting the fast rate feature of pirarucu and their fillet quality / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural