nÃo hà / A piscicultura nacional e encontra-se em franco desenvolvimento, com destaque para a RegiÃo Nordeste. Atualmente existe uma demanda por novas tÃcnicas de cultivo de espÃcies nativas, visto que a maior parte da produÃÃo nacional se baseia no cultivo de espÃcies exÃticas. O pirarucu e uma espÃcie nativa com grande potencial para a produÃÃo. A primeira tentativa de introduÃÃo do pirarucu no nordeste se deu na dÃcada de 1930 em setes aÃudes. Estas populaÃÃes de pirarucu serviram de fonte alimentar alternativa ao homem, porÃm, nÃo controlaram a densidade de populaÃÃes de peixes indesejados, como piranhas. Os estoques de pirarucu destes aÃudes foram esgotados apos 40 anos de sua introduÃÃo, tendo redes de espera como possÃvel principal fator contribuinte para isto. Fatores indiretos incluem a falta de fiscalizaÃÃo da pesca e o fim do perÃodo de defeso. No atual programa de re-introduÃÃo, conduzido pelo DNOCS a partir da dÃcada de 2000, os pirarucus sao manejados em cativeiro. Em geral, a metodologia de transporte, acondicionamento, reproduÃÃo e treinamento alimentar de pirarucu em cativeiro, tem sido eficientes. A melhor taxa de arraÃoamento de alevinos tanto em viveiros quanto em tanques foi de 2% da biomassa em raÃÃo. As desovas em cativeiro ocorreram entre os meses de agosto e fevereiro. A comercializaÃÃo de alevinos abrangeu quatro Estados nordestinos e um da regiÃo norte. Uma das dificuldades para o cultivo do pirarucu à a ausÃncia de caracteres externos que identifiquem o sexo de exemplares vivos. Resultados de um projeto piloto conduzido neste estudo restringem a utilidade de um determinado primer de RAPD e citogenÃtica para identificaÃÃo do sexo do pirarucu. / The national fish farming production is vastly increasing, especially in northeastern Brazil. There is currently a demand for new management techniques for native species. This is because most of Brazilian production is based on farming of exotic species. The bonytongue is a native species with great potential for farming. The bonytongue was first introduced in the northeastern Brazil in late 1930âs in seven dams. These bonytongue populations served as food resources for human populations, but did not control populations of undesirable fish species, as piranhas. The stocks of bonytongue populations in these dams were depleted after 40 years of its introduction. One main reason for this depletion is likely to be the use of drift nets. Other indirect factors be lack of fishery law enforcement. The current bonytongue re-introduction program, conducted by DNOCS, started in the decade of 2000 and have bonytongue fishes managed in fish farms. Overall, the methods employed for transport, acclimatization, reproduction and food training may be considered satisfactory. The best feeding rate for neonates was 2% of total biomass. Reproduction occurred between August and February. Neonate bonytongues were traded and taken to cities both in the Northeastern and North regions. One difficult for managing bonytongues is the absence of external characters for sexual identification. Results of a pilot project conducted in this study restrict the usefulness of one RAPD marker and cytogenetics for sexual determination of bonytonges.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-09-22T14:17:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Maria Gabriela Fink.pdf: 2394610 bytes, checksum: cf20c8cd8c9fe4906534252b394e0538 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-22T14:17:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Maria Gabriela Fink.pdf: 2394610 bytes, checksum: cf20c8cd8c9fe4906534252b394e0538 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-08-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Arapaima's marketing and capture were forbidden all over Amazonia due the dramatic situation of their populations. Currently, fishing is only allowed in a formal management system, although the informal fishing persists. Many gaps exist related to riverine communities’ participation and the success of community management systems in the short and long term. Thus, the aim of this study was to compare the perception, comprehension and cognitive aspects of local knowledge about the arapaima fishing and social institutions that interact in the system. We interviewed 64 residents of communities that have implemented arapaima management system (CMPP) and 18 in communities that did not have implemented it (SMPP) in Piagaçu-Purus Sustainable Development Reserve (RDS-PP), Amazonas. We observed that in CMPP communities there is a gradual evolution on local participation and understanding of co-management system. In this case, we could see a continuity of thought and collective behavior favorable to the system, ensuring compliance with local laws and regulations. In contrast, in SMPP communities, which access the benefits without sharing the system requirements (“free riders”), residents know their assignments, although in practice they do not recognize them. As consequence, we identified mismatches between residents and community leaders concern opinions and understandings. Between CMPP communities, these mismatches can also be seen, as well as the weakening of cultural concepts and informal institutions. We note that in both areas are occurring erosion of informal community management systems, rather than its continuity as a cooperative regulatory system for co-management. The greater the degree of knowledge about the formal rules, the lower the cultural competence over the informal rules. In all communities, Arapaima’s fishing economically important and guarantees local livelihoods as well as access to goods, through the dependent relationships between "patron-client". We believe that understanding and community empowerment to co-management system are extremely important for modifying the perception of the RDS-PP, as well as local participation and direct access to the benefits arising from the system. There are limitations in the process, which alerts the need to value and consider local knowledge in the different regulatory spheres. In addition another issue that may explain the phrase adopted to compose the title "Only live with fish, just like heron” affirmed by a research participant, portrays the importance of being stimulated other economic activities in order to reduce their dependence on one resource. Thus it is necessary to extend the action to other communities that are not involved in the co-management system, respecting the weight of Arapaima fishing for the Community, which as a traditional activity, presents meanings that go beyond the economic sphere. However, they are also considered and evaluated new sources of income as possible to ensure the continuity of the system and its perpetuation. Finally, the adoption of multilateral actions, integrated and collaborative involving the community and institutions are important to ensure not only the conservation of the resource, but also the knowledge and use of tradition as well as the transmission of knowledge, an assessment is needed periodic system, considering each context and local perspectives. / A comercialização e captura do pirarucu foram proibidas para toda a Amazônia por causa da drástica situação na qual suas populações se encontravam. Atualmente, a pesca só é permitida em um sistema de manejo formal, ainda que a pesca informal persista. Muitas lacunas existem em relação à participação das populações ribeirinhas e ao sucesso dos sistemas de manejo comunitário a curto e longo prazos. Desse modo, o objetivo desse estudo foi comparar a percepção, compreensão e os aspectos cognitivos do conhecimento local acerca da pesca do pirarucu e das instituições socias que interagem no sistema, entre os moradores de comunidades que implementaram o sistema de manejo do pirarucu (CMPP) e comunidades que não o implementaram (SMPP) na Reserva de Desenvolvimento Sustentável Piaguaçu-Purus (RDS-PP), Amazonas. Para tal, foram utilizados métodos comparativos fundamentados em entrevistas com 83 moradores, 65 nas CMPP e 18 nas SMPP. Observou-se que nas comunidades CMPP há uma evolução gradativa, quanto à participação local e compreensão do sistema de co-manejo, assim há uma continuidade do pensamento e comportamento coletivo favorável ao sistema, garantindo o cumprimento das normas locais e leis. Já nas comunidades SMPP, que acessam aos benefícios sem compartilharem com as obrigações do sistema (free riders), os moradores conhecem as suas atribuições, embora na prática não as reconheçam e assim são identificados desajustes nas compreensões e posicionamentos entre moradores e liderança. Esses desajustes também podem ser vistos entre as comunidades CMPP, bem como o enfraquecimento de conceitos culturais e instituições informais. Notamos que em ambas as áreas, estão ocorrendo processos de erosão dos sistemas informais de manejo comunitário, ao invés da sua continuidade como um sistema regulamentador cooperativo para a co-gestão. Quanto maior é o grau de conhecimento acerca das regras formais, menor é a competência cultural sobre as regras informais. Em todas as comunidades, a pesca do pirarucu é extremamente importante economicamente, garantido o sustento local e também o acesso às mercadorias, através das relações de dependência entre “patrão-freguês”. Consideramos que a compreensão e o empoderamento dos comunitários frente ao sistema de co-manejo são de extrema importância para a modificação da percepção acerca da RDS-PP, participação local e acesso direto aos benefícios advindos do sistema. Ainda existem limitações nesse processo, o que sinaliza a necessidade de valorizar e considerar os conhecimentos locais nas diferentes esferas regulamentadoras. É importante fomentar o diálogo e troca de saberes entre os comunitários, independente da presença do co-manejo, para que haja uma compreensão mais integral do sistema. Adicionalmente outra questão que pode explicar a frase adotada para compor o título “Só viver de peixe que nem garça” afirmada por um participante da pesquisa, retrata a importância de serem incentivadas outras atividades econômicas, a fim de reduzir a dependência destes sobre um só recurso. Dessa forma é necessário ampliar as ações para as demais comunidades que não estão envolvidas no sistema de co-manejo, respeitando a importância da pesca do pirarucu para os comunitários, que enquanto uma atividade tradicional, apresenta significados que vão além do âmbito econômico, mas que sejam consideradas as necessidades e possibilidades de inserção de novas alternativas e fontes de renda, como forma de garantir a continuidade do sistema e sua perpetuação. Por último, a adoção de ações multilaterais, integradas e colaborativas envolvendo os comunitários e as instituições são importante para garantir não apenas a conservação do recurso, mas também do conhecimento e da tradição de uso, bem como da transmissão desses conhecimentos, sendo necessário uma avaliação periódica do sistema, considerando cada contexto e as perspectivas locais.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-06-19T13:25:31Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Oscarina Batalha.pdf: 1112841 bytes, checksum: 9da6714be015d5d299c6934afcd0676d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-19T13:25:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Oscarina Batalha.pdf: 1112841 bytes, checksum: 9da6714be015d5d299c6934afcd0676d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-04-20 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Este estudo foi realizado para avaliar o efeito da farinha de silagem ácida de resíduos de pirarucu, sob os parâmetros de digestibilidade, desempenho de poedeiras, qualidade e análise sensorial de ovos. / Este estudo foi realizado para avaliar o efeito da farinha de silagem ácida de resíduos de pirarucu, sob os parâmetros de digestibilidade, desempenho de poedeiras, qualidade e análise sensorial de ovos.

GIRÃO, Mauro Vinícius Dutra. Avaliação dos procedimentos de introdução do Pirarucu (Arapaima gigas) na região Nordeste: retrospectiva histórica, situação atual e perspectivas futuras. 2007. 62 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Engenharia de Pesca, Fortaleza-CE, 2007 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-20T12:32:48Z No. of bitstreams: 1 2007_dis_mvdgirão.pdf: 1196774 bytes, checksum: 5d2fbcc22c1d7ac2c3680536bc20e531 (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-20T12:33:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_dis_mvdgirão.pdf: 1196774 bytes, checksum: 5d2fbcc22c1d7ac2c3680536bc20e531 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-20T12:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_dis_mvdgirão.pdf: 1196774 bytes, checksum: 5d2fbcc22c1d7ac2c3680536bc20e531 (MD5) Previous issue date: 2007 / The national fish farming production is vastly increasing, especially in northeastern Brazil. There is currently a demand for new management techniques for native species. This is because most of Brazilian production is based on farming of exotic species. The bonytongue is a native species with great potential for farming. The bonytongue was first introduced in the northeastern Brazil in late 1930’s in seven dams. These bonytongue populations served as food resources for human populations, but did not control populations of undesirable fish species, as piranhas. The stocks of bonytongue populations in these dams were depleted after 40 years of its introduction. One main reason for this depletion is likely to be the use of drift nets. Other indirect factors be lack of fishery law enforcement. The current bonytongue re-introduction program, conducted by DNOCS, started in the decade of 2000 and have bonytongue fishes managed in fish farms. Overall, the methods employed for transport, acclimatization, reproduction and food training may be considered satisfactory. The best feeding rate for neonates was 2% of total biomass. Reproduction occurred between August and February. Neonate bonytongues were traded and taken to cities both in the Northeastern and North regions. One difficult for managing bonytongues is the absence of external characters for sexual identification. Results of a pilot project conducted in this study restrict the usefulness of one RAPD marker and cytogenetics for sexual determination of bonytonges / A piscicultura nacional e encontra-se em franco desenvolvimento, com destaque para a Região Nordeste. Atualmente existe uma demanda por novas técnicas de cultivo de espécies nativas, visto que a maior parte da produção nacional se baseia no cultivo de espécies exóticas. O pirarucu e uma espécie nativa com grande potencial para a produção. A primeira tentativa de introdução do pirarucu no nordeste se deu na década de 1930 em setes açudes. Estas populações de pirarucu serviram de fonte alimentar alternativa ao homem, porém, não controlaram a densidade de populações de peixes indesejados, como piranhas. Os estoques de pirarucu destes açudes foram esgotados apos 40 anos de sua introdução, tendo redes de espera como possível principal fator contribuinte para isto. Fatores indiretos incluem a falta de fiscalização da pesca e o fim do período de defeso. No atual programa de re-introdução, conduzido pelo DNOCS a partir da década de 2000, os pirarucus sao manejados em cativeiro. Em geral, a metodologia de transporte, acondicionamento, reprodução e treinamento alimentar de pirarucu em cativeiro, tem sido eficientes. A melhor taxa de arraçoamento de alevinos tanto em viveiros quanto em tanques foi de 2% da biomassa em ração. As desovas em cativeiro ocorreram entre os meses de agosto e fevereiro. A comercialização de alevinos abrangeu quatro Estados nordestinos e um da região norte. Uma das dificuldades para o cultivo do pirarucu é a ausência de caracteres externos que identifiquem o sexo de exemplares vivos. Resultados de um projeto piloto conduzido neste estudo restringem a utilidade de um determinado primer de RAPD e citogenética para identificação do sexo do pirarucu.

O Pirarucu (Arapaima gigas) é um peixe gigante da família Arapaimidae, nativo das bacias amazônicas que pode chegar a dois metros de comprimento e pesar mais de 200 Kg. Está presente no Equador, na Colômbia, no Peru, na Bolívia e no Brasil. Atualmente a espécie está ameaçada de extinção devido à pesca predatória e ao aumento da presença humana em seus viveiros naturais. No presente trabalho, os cDNAs da subunidade (ag-GTHα) e da subunidade β do hormônio folículo estimulante de A. gigas (ag-FSH) foram isolados e clonados pela primeira vez, possibilitando uma melhor compreensão da diversidade e evolução desta glicoproteína em peixes e a futura síntese biotecnológica deste hormônio para fins reprodutivos e alimentícios. Tanto o cDNA do ag-GTHα quanto aquele do ag-FSHβ foram sintetizados pela reação de transcriptase reversa (RT) e pela reação em cadeia da polimerase (PCR) utilizando como molde RNA total proveniente das glândulas hipofisárias de A. gigas. O cDNA da subunidade ag-GTHα possui uma sequência codificadora (Open Reading Frame, ORF) de 348 pb, o que corresponde a uma proteína de 115 aminoácidos com um suposto peptídeo sinal de 24 aminoácidos e com um peptídeo maduro de 91 aminoácidos. Dez resíduos de cisteínas responsáveis pela formação de cinco pontes dissulfeto, dois sítios de N-glicosilação e três resíduos de prolinas apresentaram-se altamente conservados quando comparados com outras espécies de peixes. A comparação baseada em sequências de aminoácidos de GTHα de 38 espécies de peixes revelou alta identidade do A. gigas com membros das seguintes ordens: Acipenseriformes, Anguiliformes, Siluriformes e Cypriniformes (87,1-89,5%), e, a menor identidade com os Gadiformes e Cyprinodontiformes (55%). A identidade com a análoga sequência de GTHα de Homo sapiens foi de 67%. Para a subunidade ag-FSHβ, a ORF correspondente foi de 381 pb, produzindo uma proteína de 126 aminoácidos com um peptídeo sinal de 18 e um peptídeo maduro de 108 aminoácidos. Quando comparado com as sequências de Anguilla marmorata, Acipenser gueldenstaedtii e Homo sapiens, o peptídeo maduro de ag-FSHβ mostrou conter 12 resíduos de cisteínas responsáveis pela formação de seis pontes dissulfeto, duas prolinas e um sítio de glicosilação perfeitamente conservados, apresentando identidades de 63, 50 e 45% respectivamente em suas sequências de aminoácidos. As árvores filogenéticas construídas mostraram, em geral, que o A. gigas, da ordem dos Osteoglossiformes, se apresenta como grupo irmão dos Clupeocefala, enquanto os Elopomorpha (Anguiliformes) formam o grupo mais basal de todos os teleósteos aqui analisados. / Pirarucu (Arapaima gigas) is a giant fish of the Arapaimidae family native to the Amazon river basin, that can reach 3 meters in length, weighing up to 250 Kg. It is present in Equador, Colombia, Peru, Bolivia and Brazil. This species is in danger of disappearing due to exploitation by the fishing industry and increasing human presence in its natural habitat. In the present work the cDNAs of the gonadotropin -subunit (ag-GTH) and of follicle-stimulating hormone β subunit (ag-FSHβ) were isolated and cloned for the first time. As a consequence, a better understanding of the diversity and evolution of this glycoprotein in fish and its future biotechnological synthesis for reproductive and alimentary purposes will be possible. Both cDNAs of ag-GTHα and ag-FSHβ have been synthesized via reverse transcriptase reaction (RT-PCR) and polymerase chain reaction (PCR) using as a template total RNA extracted from A. gigas pituitary glands. Ag-GTHα- subunit has a coding sequence (open reading frame, ORF) of 348 bp, corresponding to a 115 amino acid protein, with a putative signal peptide of 24 aminoacids and a mature peptide of 91 amino acids. Ten cysteine residues, responsible for the formation of five disulfide linkages, two N-glycosylation sites and three proline residues were found highly conserved when compared to other fish species. A comparison based on the amino acid sequence of the GTHα- subunit from 38 different species of fish showed high identity of A. gigas with members of the following orders: Acipenseriformes, Siluriformes and Cypriniformes (87.1-89.5%), while the lowest identity was found with Gadiformes and Cyprinodontiformes (55%). In comparison with the analogous sequence of Homo sapiens an identity of 67% was found. For the ag-FSHβ subunit an ORF of 381 bp, coding for a 126 amino acid protein, with a signal peptide of 18 and a mature peptide of 108 amino acids, was found. When compared with the Anguilla marmorata, Acipenser gueldenstaedtii and Homo sapiens, the mature peptide of ag-FSHβ showed the presence of the twelve cysteine residues responsible for the formation of six disulfide linkages, two proline residues and one glycosylation site, all of them perfectly conserved. The identity with the mentioned species were 63, 50 and 45% respectively. The obtained phylogenetic trees have shown, in general, that A. gigas of the order of Osteoglossiformes appears as sister group of Clupeocephala, while Elopomorpha (Anguilliformes) forms the most basal group of all analyzed teleosts.

O Pirarucu (Arapaima gigas) é um peixe gigante da família Arapaimidae, nativo das bacias amazônicas que pode chegar a dois metros de comprimento e pesar mais de 200 Kg. Está presente no Equador, na Colômbia, no Peru, na Bolívia e no Brasil. Atualmente a espécie está ameaçada de extinção devido à pesca predatória e ao aumento da presença humana em seus viveiros naturais. No presente trabalho, os cDNAs da subunidade (ag-GTHα) e da subunidade β do hormônio folículo estimulante de A. gigas (ag-FSH) foram isolados e clonados pela primeira vez, possibilitando uma melhor compreensão da diversidade e evolução desta glicoproteína em peixes e a futura síntese biotecnológica deste hormônio para fins reprodutivos e alimentícios. Tanto o cDNA do ag-GTHα quanto aquele do ag-FSHβ foram sintetizados pela reação de transcriptase reversa (RT) e pela reação em cadeia da polimerase (PCR) utilizando como molde RNA total proveniente das glândulas hipofisárias de A. gigas. O cDNA da subunidade ag-GTHα possui uma sequência codificadora (Open Reading Frame, ORF) de 348 pb, o que corresponde a uma proteína de 115 aminoácidos com um suposto peptídeo sinal de 24 aminoácidos e com um peptídeo maduro de 91 aminoácidos. Dez resíduos de cisteínas responsáveis pela formação de cinco pontes dissulfeto, dois sítios de N-glicosilação e três resíduos de prolinas apresentaram-se altamente conservados quando comparados com outras espécies de peixes. A comparação baseada em sequências de aminoácidos de GTHα de 38 espécies de peixes revelou alta identidade do A. gigas com membros das seguintes ordens: Acipenseriformes, Anguiliformes, Siluriformes e Cypriniformes (87,1-89,5%), e, a menor identidade com os Gadiformes e Cyprinodontiformes (55%). A identidade com a análoga sequência de GTHα de Homo sapiens foi de 67%. Para a subunidade ag-FSHβ, a ORF correspondente foi de 381 pb, produzindo uma proteína de 126 aminoácidos com um peptídeo sinal de 18 e um peptídeo maduro de 108 aminoácidos. Quando comparado com as sequências de Anguilla marmorata, Acipenser gueldenstaedtii e Homo sapiens, o peptídeo maduro de ag-FSHβ mostrou conter 12 resíduos de cisteínas responsáveis pela formação de seis pontes dissulfeto, duas prolinas e um sítio de glicosilação perfeitamente conservados, apresentando identidades de 63, 50 e 45% respectivamente em suas sequências de aminoácidos. As árvores filogenéticas construídas mostraram, em geral, que o A. gigas, da ordem dos Osteoglossiformes, se apresenta como grupo irmão dos Clupeocefala, enquanto os Elopomorpha (Anguiliformes) formam o grupo mais basal de todos os teleósteos aqui analisados. / Pirarucu (Arapaima gigas) is a giant fish of the Arapaimidae family native to the Amazon river basin, that can reach 3 meters in length, weighing up to 250 Kg. It is present in Equador, Colombia, Peru, Bolivia and Brazil. This species is in danger of disappearing due to exploitation by the fishing industry and increasing human presence in its natural habitat. In the present work the cDNAs of the gonadotropin -subunit (ag-GTH) and of follicle-stimulating hormone β subunit (ag-FSHβ) were isolated and cloned for the first time. As a consequence, a better understanding of the diversity and evolution of this glycoprotein in fish and its future biotechnological synthesis for reproductive and alimentary purposes will be possible. Both cDNAs of ag-GTHα and ag-FSHβ have been synthesized via reverse transcriptase reaction (RT-PCR) and polymerase chain reaction (PCR) using as a template total RNA extracted from A. gigas pituitary glands. Ag-GTHα- subunit has a coding sequence (open reading frame, ORF) of 348 bp, corresponding to a 115 amino acid protein, with a putative signal peptide of 24 aminoacids and a mature peptide of 91 amino acids. Ten cysteine residues, responsible for the formation of five disulfide linkages, two N-glycosylation sites and three proline residues were found highly conserved when compared to other fish species. A comparison based on the amino acid sequence of the GTHα- subunit from 38 different species of fish showed high identity of A. gigas with members of the following orders: Acipenseriformes, Siluriformes and Cypriniformes (87.1-89.5%), while the lowest identity was found with Gadiformes and Cyprinodontiformes (55%). In comparison with the analogous sequence of Homo sapiens an identity of 67% was found. For the ag-FSHβ subunit an ORF of 381 bp, coding for a 126 amino acid protein, with a signal peptide of 18 and a mature peptide of 108 amino acids, was found. When compared with the Anguilla marmorata, Acipenser gueldenstaedtii and Homo sapiens, the mature peptide of ag-FSHβ showed the presence of the twelve cysteine residues responsible for the formation of six disulfide linkages, two proline residues and one glycosylation site, all of them perfectly conserved. The identity with the mentioned species were 63, 50 and 45% respectively. The obtained phylogenetic trees have shown, in general, that A. gigas of the order of Osteoglossiformes appears as sister group of Clupeocephala, while Elopomorpha (Anguilliformes) forms the most basal group of all analyzed teleosts.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseDKSM.pdf: 1610771 bytes, checksum: c876a68dec001f134b288f61b73e2bf8 (MD5) Previous issue date: 2003-08-29 / Universidade Federal de Sao Carlos / In South America the osteoglossiforms are represented by the Arapaima and the Osteoglossum sorts, which are mostly found in the Amazonic basin, Tocantins Araguaia. There are virtually no genetic studies on this group, which highlights conservation groups need for information. The Arapaima gigas species, of the hydrographic basin Tocantins Araguaia, showed a 2n=56 chromosomes, with cariotypical formula: 28M/SM+28ST/A. Silver nitrate marking revealed a simple RON, located intersticially in the shorter arm of pair three, confirmed by a fluorescent hybration in situ, with a rDNA 18S probe, that highlighted a polymorphism in the RON sites. The constituent heterocromatin was found in the centromerical region of all chromosomes. The molecular genetic studies with RAPD marker showed the presence of only one Arapaima gigas population, with a significant intrapopulational variation. The results obtained in this work are an important contribution to the understanding of the genetics of the Arapaima gigas species and the Osteoglossiforms group, providing, moreover, subsidies for genetic handling and conservation of the Arapaima gigas species in the Médio Araguaia, state of Mato Grosso do Sul, Brazil. / Os Osteoglossiformes são representados na América do Sul pelos gêneros Arapaima e Osteoglossum, que ocorrem particularmente na região Amazônica, nas bacias Amazônica e Tocantins-Araguaia. Os estudos genéticos neste grupo são praticamente inexistentes, evidenciando a necessidade de informações para programas de conservação. A espécie Arapaima gigas da bacia hidrográfica Tocantins-Araguaia apresentou um 2n=56 cromossomos, com fórmula cariotípica 28M/SM+28ST/ A. A marcação por nitrato de prata evidenciou uma RON simples localizada intersticialmente no braço curto do par três, confirmada pela hibridação fluorescente in situ com sonda de rDNA 18S, que evidenciou um polimorfismo de tamanho nos sítios de RON. A heterocromatina constitutiva foi localizada na região centromérica de todos os cromossomos. Os estudos genéticos moleculares com marcador RAPD evidenciaram a ocorrência de uma única população de Arapaima gigas na região de coleta, com variabilidade intrapopulacional significativa. Os resultados obtidos no presente trabalho são contribuições importantes para o conhecimento da genética da espécie Arapaima gigas e do grupo Osteoglossiformes, fornecendo, ainda, subsídios para programas de manejo e conservação genética da espécie Arapaima gigas no Médio Araguaia, estado do Mato Grosso, Brasil.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2012. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-10-10T13:35:15Z No. of bitstreams: 1 2012_IassudaraGarciaAlmeida.pdf: 2157003 bytes, checksum: 1ff1c34bf2a468eec5d25a95671992a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2012-10-15T14:06:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_IassudaraGarciaAlmeida.pdf: 2157003 bytes, checksum: 1ff1c34bf2a468eec5d25a95671992a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-15T14:06:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_IassudaraGarciaAlmeida.pdf: 2157003 bytes, checksum: 1ff1c34bf2a468eec5d25a95671992a2 (MD5) / O pirarucu (Arapaima gigas) é considerado um dos maiores peixes de água doce, podendo atingir três metros e peso aproximado de 200 quilos. Este peixe possui grande importância econômica para populações ribeirinhas da Bacia Amazônica, por esse motivo vem sofrendo uma grande exploração comercial resultando na drástica redução de espécimes e consequentemente na variabilidade genética desta espécie. O presente trabalho visa associar duas metodologias, com o objetivo de gerar mais conhecimentos sobre a biologia da espécie que sejam úteis para o desenvolvimento de tecnologias para a criação do pirarucu em cativeiro e sua conservação nas bacias fluviais onde pode ser encontrado. O pirarucu possui o comportamento de formar casais para acasalamento, o que proporciona uma barreira para sua criação em cativeiro, pois a identificação do sexo só é possível no período de maturidade sexual e por meio de métodos inviáveis economicamente e ao bem estar do peixe. Na tentativa de solucionar esse problema foi realizada uma varredura do genoma desta espécie utilizando a metodologia BSA (“Bulk Segregant Analysis”) associada a marcadores RAPD (“Random Amplified Polymorphic DNA”) a fim de prospectar sequências sexo-específicas para o desenvolvimento de um marcador molecular para sexagem de peixes pré-púberes. Foram combinadas amostras de machos e fêmeas para formar bulks sexo-específicos e estes foram avaliados com 566 primers RAPD (Operon®). Foram amplificados 2.609 fragmentos com uma cobertura estimada de um marcador a cada 714Kb. Os resultados sugerem que o pirarucu possui um sistema de determinação sexual não cromossômico ou, alternativamente, que a espécie sofreu perda recente do cromossomo sexual. O pirarucu tem passado por uma drástica redução populacional e conseqüente diminuição da variabilidade genética em algumas regiões da Bacia Amazônica. A fim de determinar o estado dessas populações e sua variabilidade, estudos de dinâmica populacional e estrutura genética têm sido realizados. Nesses estudos, normalmente se trabalha com um N amostral reduzido e uma maior abrangência geográfica. No entanto, com base nos dados obtidos neste trabalho, foi possível observar que uma amostragem maior de apenas uma região pode fornecer resultados semelhantes. A metodologia utilizada fundamentou-se no sequenciamento e análise de duas regiões do mtDNA, ATPase (n=95) e citocromo oxidase (n=97) em indivíduos de quatro populações, geograficamente próximas, na região Santarém – PA. Também foi possível concluir que em se tratando dessa espécie a variabilidade genética encontrada é baixa, no entanto, entre as populações estudadas é possível encontrar certa diferenciação. Além disso, de acordo com a distribuição das redes de haplótipos observada, é possível sugerir uma recente expansão populacional de peixes oriundos da região Santa Maria. Esses resultados são compatíveis com os poucos trabalhos reportados na literatura sobre essa espécie, comprovando que é possível aumentar o N amostral e reduzir a representatividade geográfica, e assim melhorar a realização de estratégias de manejo locais a partir dos resultados de estudos filogenéticos para análise da estrutura populacional da espécie. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The arapaima (Arapaima gigas) is considered one of the largest freshwater fish and can reach three meters and weighing approximately 200 pounds. This fish has great economic importance to coastal communities in the Amazon Basin, for this reason has been undergoing a major commercial operation resulting in drastic reduction of specimens and thus genetic variability in this species. The present work aims to link two methodologies, in order to generate more knowledge about the biology of the species that are useful for the development of technologies for the creation of arapaima in captivity and conservation in river basins where it can be found. The arapaima has behavior to form mating pairs, which provides a barrier to their breeding in captivity, because the sex identification is possible only in the period of sexual maturity and by methods uneconomical and welfare of the fish. In an attempt to solve this problem, we scanned the genome of this species using the methodology BSA ("Bulk Segregant Analysis") associated with RAPD ("Random Amplified Polymorphic DNA") to sex-specific sequences prospect for the development of a molecular marker for sexing fish prepubescent. Samples were combined to form male and female sex-specific bulks and these were evaluated with 566 RAPD primers (Operon ®). 2609 fragments were amplified with an estimated coverage of one marker every 714Kb. The results suggest that pirarucu has a system for determining sex chromosome not or, alternatively, that it has suffered sudden loss of the sex chromosome. The arapaima has undergone a drastic population reduction and consequent reduction of genetic variability in some regions of the Amazon Basin. In order to determine the status of these populations and their variability, studies of population dynamics and genetic structure have been performed. In these studies, usually working with a small sample N and greater geographic coverage. However, based on data obtained in this study we observed that a larger sample of one region can provide similar results. The methodology is based on the sequencing and analysis of two regions of mtDNA, ATPase (n = 95) and cytochrome oxidase (n = 97) in individuals from four populations, geographically close, in the Santarém - PA. It was also concluded that when it comes to this kind of genetic variability found is low, however, among the studied populations is possible to find some differentiation. Moreover, according to the distribution networks of haplotypes observed, it is possible to suggest a recent population expansion of fish from the Santa Maria region. These results are consistent with the few studies reported in the literature on this species, showing that it is possible to increase the sample size N and reduce geographic representation, and thereby improve the performance of local management strategies from the results of phylogenetic studies for analysis of the structure population of the species.

Made available in DSpace on 2015-04-20T12:31:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ricardo do Amaral.pdf: 7789911 bytes, checksum: 0c6938c0a8498734d74cedfd87bd7459 (MD5) Previous issue date: 2008-12-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The pirarucu, Arapaima gigas is an Amazon native species with high market value and crescent interest by aquaculturists in its rears. As a carnivorous fish, it needs a high level protein diet. The goal of this study was to evaluate the growth performance of pirarucu, Arapaima gigas, juveniles fed with diets produced with ingredients available in the State of Acre-Brazil, notably; blood meal (BM), Brazil nut residue Bertholletia excelsa (BNR) and meat and bone meal (MBM) combined with two energetic sources (animal fat and soybean oil). The study was driven into three phases in a complete randomized design, using different juveniles batch, previously conditioned to feed training to accept dry ration. At the end of each phase, the fish were measured, and one or two were sacrificed in each experimental unit for carcass analysis (whole body), for: moisture, protein, lipid and ash content. During the experiment, fish were kept under a natural photoperiod (12 light: 12 dark). In the first experiment were tested using diets with (0, 3, 6, 9, 12, 15, 18 or 21%) spray-dried blood meal and animal fat as an energy source. A total of 192 pirarucu juveniles(8,5±0,4g) were randomly distributed into the 24 circular fiber glass tanks, supplied with 250 L water (8 fish/tank). Parameters monitored were water temperature (daily, 8:00/14:00h) and pH, dissolved oxygen, ammonia, nitrite, weekly. The fishes fed diets with 9% BM did not present a statistical difference (P>0,05) for evaluated body variables as compared with control diet (0% BM). At the second experiment five experimental rations were used to assess the Brazil nut residue performance at two levels (2 and 4%) as an ingredient able to allow up to 12% of the BM above, the 9% level indicated in the first experiment. One hundred twenty fish (13.10±1,9g) were stocked into 20 circular fiber glass tanks (6/tank) supplies with 300 L water. At this phase, soybean oil was used as energy source. Besides the control treatment with 0% BM and 0% BNR, four diets were tested: (9% xv BM - 2% BNR, 9% BM - 4% BNR) and (12% BM - 2% BNR, 12% BM - 4% BNR). No improvement at the fish performance was observed in animals feed with rations produced with 12% BM as a result of the addition of 2 or 4% BNR. A worse performance was detected in some variables compared with the control diet; even in animals feed with 9% BM diets. In the third set of experiments, three levels of MBM (6, 9 and 12%) were tested besides two energetic sources (animal fat and soybean oil). One hundred ninety two fish (9.21±1,7g) were stocked into 24 fiber glass tanks (8/tank) supplies with 300 L water. No significant statistical difference between treatments (P>0.05) on weight gain, survival and condition faction were detected. The voluntary fed intake showed significant difference among the two treatments with 12% and the 9% MBM + soybean oil compared with the others. The two diets with 6% MBM and the diet with 9% MBM + animal fat showed better protein efficiency rate performance compared to the others. It was concluded that is possible to include BM and MBM up to 9% when animal fat is used as energy source. The inclusion of BNR at 2% or even 4%, / O pirarucu, Arapaima gigas, é uma espécie nativa da Amazônia de alto valor comercial despertando grande interesse no seu cultivo em cativeiro. Por ser um peixe carnívoro, necessita de ração com alto teor protéico. O Objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho zootécnico de juvenis de pirarucu, Arapaima gigas, alimentados com dietas contendo ingredientes disponíveis no Estado do Acre, em particular a farinha de sangue spray-dried (FSSD), o resíduo de castanha-do-brasil Bertholletia excelsa (RC) e a farinha de carne e ossos (FCO) combinados com duas fontes energéticas (banha e óleo de soja). O trabalho de pesquisa foi realizado em três etapas, com delineamento inteiramente casualizado, utilizando três diferentes lotes de alevinos, sendo estes previamente submetidos a treinamento alimentar para aceitação de ração seca. No final de cada fase, os peixes foram submetidos à biometria sendo sacrificados um ou dois animais de cada unidade experimental para realização de análise de carcaça (peixes inteiros), sendo determinados: umidade, proteína bruta, lipídio e cinza. Durante todas as fases os peixes foram submetidos a um fotoperíodo de 12 h luz:12 h escuro. No primeiro experimento foram testadas dietas extrusadas com (0, 3, 6, 9, 12, 15, 18 e 21%) de farinha de sangue spray dried e banha de suíno como fonte de energia. Foram utilizados 192 alevinos 8,5±0,4g, distribuídos em 24 caixas em fibra de vidro abastecidas com 250 L (8 peixes/caixa) sendo monitorados os seguintes parâmetros: temperatura da água (8:00 e 14:00h) diariamente, além de oxigênio, amônia, nitrito e pH (semanalmente). Os peixes alimentados com dietas contendo até 9% de FSSD não apresentaram diferença significativa (P>0,05) em relação à testemunha (0% FSSD) nos parâmetros de desempenho zootécnico avaliados. Este grupo (3, 6 e 9%) de FSSD tiveram desempenho superior (P 0,05) às dietas com (12, 15, 18 e 21%) de FSSD. Na segunda etapa foram elaboradas cinco rações experimentais objetivando avaliar o desempenho do resíduo de castanha (RC) nos teores de (2 e 4%) como ingrediente capaz de viabilizar um incremento para 12% no teor de FSSD possível de ser utilizado, superior portanto aos 9% identificados na primeira etapa como o máximo admissível. Foram utilizadas 20 caixas em fibra de vidro, com capacidade de 500 litros e abastecidas com 300 litros de água cada. Estas foram povoadas com 120 alevinos (6 por caixa) oriundos de uma mesma ninhada com peso médio inicial de 13,10±1,9g. Nesta xiii etapa foi utilizado óleo de soja como fonte de energia. Além da testemunha com 0% de FSSD e 0% de RC, foram testadas quatro formulações: (9% FSSD - 2% RC, 9% FSSD- 4% RC) e (12% FSSD - 2% RC, 12% FSSD - 4% RC). Não foi observada melhora no desempenho dos peixes alimentados com ração contendo 12% de FSSD em função da adição de 2 ou 4% de RC. Ocorreu ainda, um pior desempenho em alguns parâmetros em relação à testemunha, mesmo nos animais arraçoados com dieta contendo 9% de FSSD. Na terceira etapa foram avaliados três níveis de inclusão de farinha de carne e ossos (FCO) (6, 9 e 12%) além de duas fontes de energia (banha de suíno e óleo de soja). Foram utilizados 192 alevinos (9,21±1,7g), distribuídos por 24 caixas em fibra de vidro, com capacidade de 500 litros e abastecidas com 300 litros de água cada. Não foi observada diferença estatística significativa no ganho de peso, sobrevivência e fator de condição entre os tratamentos (P>0,05). O consumo voluntário apresentou diferença significativa (P 0,05) nos dois tratamentos com 12% de FCO e com 9% de FCO com óleo de soja em relação aos demais. A eficiência protéica apresentou melhor desempenho nos dois tratamentos com 6% de FCO e no com 9% de FCO e banha em relação aos demais. Foi identificada a possibilidade de inclusão de até 9% de FSSD e 9% de FCO quando utilizada banha como fonte energética. A utilização do RC nos níveis de 2% e 4% não viabilizou o aumento no teor de FSSD na dieta de 9 para 12%.

O Arapaima gigas, conhecido popularmente no Brasil como pirarucu, pertence ao grupo mais primitivo dos teleósteos, sendo um dos maiores peixes de água doce da América do Sul. Desde os anos 40 informações divergentes têm sido dadas em relação ao seu tamanho e peso máximo, porém todas concordam com o fato de que se trata de uma espécie de grande porte, com exemplares pesando de 125 a 200 quilos e um comprimento de 2 a 3 metros. Sua carne é desprovida de espinhas e apresenta baixo teor de gordura. Os níveis de rendimento da carcaça são elevados e o crescimento juvenil da espécie é consideravelmente rápido. Por isso, o pirarucu, apresenta um atraente valor de mercado e grande importância para o comércio de pescado amazônico. A pesca predatória tem reduzido significativamente a população dessa espécie nas regiões amazônicas ao longo dos anos. Sendo assim, desde os anos 2000, o pirarucu foi incluído na lista de animais sobre explorados ou em perigo de extinção do IBAMA. A ausência de um empreendimento de aquicultura capaz de produzir o pirarucu a preços competitivos, de forma previsível e em larga escala deve-se principalmente ao fato de que essa espécie, de um modo geral, apresenta dificuldades no processo reprodutivo em cativeiro, apresentando uma ovulação, espermiação e/ou maturação final gonadal insatisfatória. O hormônio folículo estimulante (FSH) é um hormônio gonadotrófico que exerce um papel importante na maturação folicular inicial das gônodas. Assim como os mamíferos, os peixes também apresentam hormônios gonadotróficos (GTHs) heterodiméricos, onde a subunidade α é comum entre os hormônios pertencentes a essa família e a subunidade β determina a atividade hormonal específica. As subunidades α e β do hormônio folículo estimulante de Arapaima gigas (ag-FSH) foram previamente isoladas pelo nosso grupo de pesquisa ao longo dos anos e possibilitaram um estudo de modelagem tridimensional baseada nas sequências de aminoácidos obtidas. Paralelamente, foi realizada a expressão do ag-FSH recombinante com níveis de rendimento satisfatórios (28 mg/L) através da expressão em células de embrião de rim humano (HEK 293), purificando-o e caracterizando-o a partir de técnicas cromatográficas padronizadas pelo nosso grupo de pesquisa. / Arapaima gigas, popularly known in Brazil as pirarucu, belongs to the most primitive group of teleosts, being one of the largest freshwater fish in South America. Since 1940, divergent information has been given regarding its size and maximum weight, but all agree that it is a large species, with specimens weighing from 125 to 200 kilograms and with a 2 to 3 meters of length. Its meat is devoid of fish bones and has low fat content. Carcass yield levels are high and juvenile growth of the species is considerably fast. Therefore, the pirarucu, presents an attractive market value and great importance for the Amazonian fish trade. Predatory fishing has significantly reduced the population of this species in Amazonian regions over the years. Thus, since 2000, pirarucu has been included in IBAMA\'s list of exploited or endangered animals. The absence of an aquaculture enterprise able to produce pirarucu at competitive prices in a predictable and large scale is mainly because this species, in general, presents difficulties in the reproductive process in captivity, presenting an unsatisfactory ovulation, spermiation and / or late gonadal maturation. The follicle-stimulating hormone (FSH) is a gonadotrophic hormone that plays an important role in the initial follicular maturation of the gonads. Like mammals, fish also have heterodimeric gonadotrophic hormones (GTHs), where the α subunit is common between the hormones belonging to this family and the β subunit determines the specific hormonal activity. The α and β subunits of the follicle stimulating hormone of Arapaima gigas (ag-FSH) were previously isolated by our research group over the years and provided a three-dimensional modeling study based on the obtained amino acid sequences. At the same time, the recombinant ag-FSH was expressed with satisfactory yields (28 mg/L) in human kidney embryonic cells (HEK 293), purified and characterized from chromatographic techniques, standardized by our group.