Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In pursuit of knowledge about the performance of agricultural tractors on the market and make the appropriate selection of attachments for each tractor, the research has presented mathematical models as an important tool in the representation of the traction performance of tractors. But that, however, Brazilian researchers found as the main limitation in applying these mathematical models using data characteristic of soil and machinery North American and European. By the need to obtain representative values of soil conditions and Brazilian machinery, the goal was to determine demand models for prediction of traction performance of tractors in operations that require traction force. Sets were used mechanized tractorseeding, disc harrow and chisel plow operating on two soil textures, loamy and silty. Seeking for a graphical representation of demand required traction force, slipage and fuel consumption was held to simulate the different mathematical models by the help of computer program Table Curve 3D v.2.03 (Jandel Scientific) and Table Curve 2Dv.2.03 (Jandel Scientific) capable of providing information for the empirical prediction of these parameters. It was found that the forward speed of the tractor directly influences the demand pull of all sets mechanized, differing from the model proposed by ASAE D497.2 (1995). The speed when interacting with the mass of the disk harrow represents the traction performance parameters using linear models, as well as its interaction with the working depth of the chisel plow by quadratic models with good fit, over 70%. The seeding showed an increase in demand of traction with the linear increase of tractor speed. Predictive theories Cn, Bn and Mn have good correlation with experimental values in soils typical Brazilian, corresponding on average 70% for values measured experimentally. Theory being the most Mn related behavior of energy demand and slipage action. New parameters are needed to estimate the traction force of tillers and planters, as well as the change of coefficients to characterize these machinery. As models for seeding, disc harrow and chisel plow: D = Fi. [1474 + (601.S)]. W.T , D = Fi. [290 + (57.S)]. W.T and D = Fi. [110 + (32.S) + (-2.9. S2)]. W.T, respectively. / Na busca do conhecimento sobre o desempenho de tratores agrícolas disponíveis no mercado e realizar a seleção adequada dos implementos para cada trator, a pesquisa tem apresentado modelos matemáticos como importante ferramenta na representação do desempenho em tração dos tratores. Mas que, no entanto, pesquisadores brasileiros encontram como principal limitação na aplicação destes modelos matemáticos a utilização de dados característicos de solos e máquinas Norte-Americanas e Européias. Pela necessidade de se obterem valores representativos das condições de solo e máquinas brasileiras, o objetivo deste trabalho foi determinar modelos de demanda de tração para predição do desempenho de tratores em operações que demandam força de tração. Foram utilizados os conjuntos mecanizados trator-semadora-adubadora, trator-grade aradora e trator-escarificador operando em duas texturas de solo, média e argilosa. Buscando-se a representação gráfica de demanda requerida de força de tração, patinagem e consumo de combustível realizou-se a simulação dos diferentes modelos matemáticos pelo auxílio do programa computacional Table Curve 3D v.2.03 (Jandel Scientific) e Table Curve 2Dv.2.03 (Jandel Scientific) capaz de oferecer informações para a predição empírica destes parâmetros. Verificou-se que a velocidade de deslocamento do trator influencia diretamente na demanda em tração de todos os conjuntos mecanizados, diferindo do modelo proposto pela ASAE D 497.2 (1995). A velocidade ao interagir com a massa da grade aradora representa os parâmetros de desempenho em tração através de modelos lineares, assim como, a sua interação com a profundidade de trabalho do escarificador por modelos quadráticos, com bom ajuste, acima de 70%. A semeadora apresentou aumento em demanda de tração com o aumento linear da velocidade do trator. As teorias preditivas Cn, Bn e Mn apresentam correlação boa com os valores experimentais sob solos característicos brasileiros, correspondendo em média de 70% ao valores medidos experimentalmente. Sendo a Teoria Mn a mais relacionada ao comportamento de demanda energética e patinagem medidas. Novos parâmetros são necessários para estimativa da força de tração de escarificadores e semeadoras, bem como, a alteração dos coeficientes para caracterizar estes conjuntos mecanizados. Sendo os modelos para semeadora, grade aradora e escarificador: D = Fi.[1474 + (601.S)].W.T; D = Fi.[290 + (57.S)].W.T e D = Fi.[110 + (32.S) + (-2,9.S2)].W.T, respectivamente.

Submitted by Maike Costa (maiksebas@gmail.com) on 2017-07-03T13:42:30Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2175297 bytes, checksum: 0d32244b68ce823204f52f4f1ca022de (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-03T13:42:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2175297 bytes, checksum: 0d32244b68ce823204f52f4f1ca022de (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Genomic islands (GIs) are regions of the bacterial and archaeal genomes that were acquired through the phenomenon of horizontal transfer. Usually, these regions provide important adaptations to these organisms, such as antibiotic resistance and pathogenicity, whose effects can be harmful to other species. For these reasons, many computational methodologies have been proposed for their prediction, however, none of them are capable to precisely identify the whole repertoire of islands present in a given genomic sequence. Therefore, the development of new approaches that explore different aspects of these regions is timely, allowing the identification of those not known. In this paper, it is proposed a novel method for the identification of GIs, built based on mean shift clustering algorithm, with the automatic bandwidth calculation, necessary to its operation. Test results with genomic island inserted in bacterial genomes show that the method is capable of identifying these regions, with sensitivity rates above 99%. Tests performed with bacterial genomes with known GIs revealed the potential of the method for their identification and for the discovery of new island. The detailed study of the new islands content pointed the presence of typical GIs elements, confirming its effectiveness in the prediction of these regions. / Ilhas genômicas (IGs) são regiões do genoma de bactérias e arqueas adquiridas por meio do fenômeno da transferência horizontal. Frequentemente, essas regiões proporcionam importantes adaptações a esses organismos, como resistência a antibióticos e patogenicidade, cujos efeitos podem ser danosos a outras espécies. Por essa razão, diversas metodologias computacionais foram propostas para a sua predição, porém nenhuma capaz de identificar o repertório completo de ilhas presentes em uma determinada sequência genômica. Portanto, torna-se oportuno o desenvolvimento de novas abordagens que explorem diferentes aspectos dessas regiões, permitindo a identificação daquelas não conhecidas. Nesse trabalho, propõe-se um novo método para a identificação de IGs, construído com base no algoritmo de agrupamento mean shift, com o cálculo automático da largura de banda, indispensável para o seu funcionamento. Resultados dos testes com ilhas genômicas inseridas em genomas de bactérias mostram que o método é capaz de identificar essas regiões com taxas de acerto acima de 99%. Testes realizados com genomas de bactérias com IGs conhecidas revelaram o potencial do método para a sua identificação e para a descoberta de novas ilhas. O estudo detalhado do conteúdo das novas ilhas apontou a presença de elementos típicos de IGs, confirmando a eficácia do método na predição dessas regiões.

Submitted by HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO CHIAIA null (chiaia1@yahoo.com.br) on 2017-10-26T12:35:23Z No. of bitstreams: 1 Tese_Hermenegildo_Lucas_Justino_Chiaia.pdf: 1161047 bytes, checksum: 270c67e433de8ecdefbd997478489876 (MD5) / Approved for entry into archive by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com) on 2017-10-31T17:44:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 chiaia_hlj_dr_jabo.pdf: 1161047 bytes, checksum: 270c67e433de8ecdefbd997478489876 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-31T17:44:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 chiaia_hlj_dr_jabo.pdf: 1161047 bytes, checksum: 270c67e433de8ecdefbd997478489876 (MD5) Previous issue date: 2017-10-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Existem diferentes métodos e pseudo-fenótipos utilizados em predições genômicas, sendo necessário determinar o ideal para a característica de interesse. Os ácidos graxos da carne que contribuem de forma prejudicial para a saúde humana têm recebido considerável atenção nos últimos anos. O objetivo desse estudo foi avaliar a acurácia de predição genômica de diferentes métodos (SNP-BLUP, BayesC, BayesCπ e Bayesian Lasso) e pseudo-fenótipos (fenótipo ajustado para os efeitos fixos, valor genético estimado via pedigree e valor genético genômico obtido pelo método single step GBLUP) em dados simulados e reais de perfil de ácidos graxos no músculo Longissimus thoracis da raça Nelore terminados em confinamento. A proposta de inclusão do GEBV obtido pelo método passo único genômico BLUP (ssGBLUP) como pseudofenótipo nesta pesquisa é inédita em predição genômica, para responder um dos problemas frequentes ao utilizar a matriz advinda da informação genealógica, pela maioria dos produtores de gado de corte utilizarem o sistema de acasalamento que utiliza reprodutores multiplos. Foram utilizados cerca de 963 bovinos machos inteiros da raça Nelore terminados em confinamento e genotipados com um painel de 777.962 SNPs do Ilumina BovineSNP BeadChip. A informação genômica pode servir para melhorar o perfil de ácidos graxos em animais do grupo Zebu, por ter-se observado valores genômicos preditos com com acurácia de baixa a moderada magnitude. Nenhum dos métodos foi melhor para todos os ácidos graxos em termos de acurácia, no entanto, o método SNP-BLUP permitiu realizar avaliação menos viesada. O método ssGBLUP apresentou-se como ferramenta alternativa para obter GBVs como pseudo-fenôtipo mais acurado em situações de pedigree incompleto, pela alta proporção de de reprodutores múltiplos, sendo mais apropriado que o EBV e o fenótipo ajustado aos efeitos fixos para predizer o valor genômico dos animais. / There are different methods and pseudo-phenotypes used in genomic predictions, being necessary to determine the ideal for each trait of interest. Beef fatty acids that contribute to human health have received considerable attention in the last years. Thus, the objective of this study was to evaluate genomic predition accuracy of different methodologies (SNP-BLUP, BayesCπ, BayesC and Bayesian Lasso) pseudo-phenotypes (adjusted phenotype, estimated breeding value and genomic estimated breeding value by ssGBLUP) in simulated and real data of fatty acid profile in the Longissimus thoracis muscle of Nelore cattle finished in feedlot. The inclusion of the GEBV obtained by single step genomic BLUP (ssGBLUP) method as pseudo-phenotype in this research is innovator in genomic prediction, to answer one of the frequent problems when using the matrix derived from pedigree, by the mating system that uses multiple sires for many cattle breeders. A total of 963 Nelore bulls with phenotype for fatty acid profiles, were genotyped using the Illumina Bovine HD Bead Chip with 777,962 SNPs. Genomic information can assist in improving fatty acid profile in Zebu animals, since the use of genomic information yielded genomic values for fatty acid profile with accuracies ranging from low to moderate. None of the methods excelled in terms of accuracy, however the SNP-BLUP method allows obtaining less biased genomic evaluations. The ssGBLUP model is an appropriate alternative to obtaining more reliable and less biased GEBVs as pseudo-phenotypes in situations of missing pedigree, due to high proportion of multiple sires, being more appropriate than the EBVs or adjusted phenotypes for fixed effect to predict direct genomic values.

The study of predictors of health risk is important to assist professionals in the area in making clinical decisions at the individual or collective level. With focus on the elderly population, in 2005, the Elders Risk Assessment (ERA) was developed in Rochester, MN, USA. Its main advantage over other predictors is the practicality of use, since the data are obtained in an administrative way through the medical record review. Until now, this instrument has not been studied in Brazil. In this sense, this work was developed to use the ERA instrument as a predictor of risk of health problems in the elderly attended at the Hospital Universitário de Santa Maria, RS. The outcomes (events) considered for risk prediction were hospital admissions and urgent/emergency care. From the review of medical records, the ERA scores were obtained from a sample of 135 older adults seen outpatient in the year 2010 and the outcomes were surveyed between 2010 and 2012. Like the original study, the results showed a positive correlation between higher ERA scores and greater number of events. It is concluded that the ERA instrument can be used in our environment as a tool for risk screening for unfavorable events in the health of the elderly. It is also possible to characterize strategies of clinical approach in order to modify the tendency towards unfavorable outcomes. Considering the population cut and the study design chosen, other works are needed to prove the reproducibility of the instrument under different conditions, both in the public health system (SUS) and in the supplementary health. / O estudo de preditores de risco em saúde é importante para auxiliar os profissionais da área na tomada de decisões clínicas no âmbito individual ou coletivo. Com foco na população de idosos, em 2005, foi desenvolvido em Rochester, MN, USA, o instrumento Elders Risk Assessment (ERA). Sua principal vantagem em relação a outros preditores é a praticidade de uso, visto que os dados são obtidos de maneira administrativa através da revisão de prontuário médico. O referido instrumento, até o presente momento, não foi estudado no Brasil. Nesse sentido, esse trabalho foi desenvolvido com o objetivo de utilizar o instrumento ERA como preditor de risco de agravos na saúde de idosos atendidos no Hospital Universitário de Santa Maria, RS. Os desfechos (eventos) considerados para a predição de risco foram internações hospitalares e atendimento em situação de urgência/emergência. A partir da revisão de prontuários médicos, foram obtidos os escores ERA de uma amostra de 135 idosos atendidos ambulatorialmente no ano 2010 e os desfechos foram pesquisados entre os anos 2010 e 2012. À semelhança do estudo original, os resultados demonstraram uma correlação positiva entre escores ERA mais elevados e maior número de eventos. Conclui-se que o instrumento ERA pode ser utilizado em nosso meio como ferramenta de rastreio de risco para eventos desfavoráveis em saúde de idosos. Pode, ainda, balizar estratégias de abordagem clínica com o objetivo de modificar a tendência para desfechos desfavoráveis. Considerando-se o recorte populacional e o desenho de estudo escolhido, novos trabalhos são necessários para comprovar a reprodutibilidade do instrumento em condições distintas, tanto no sistema público de saúde (SUS) quanto na saúde suplementar.

Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Haroldo Henrique de Rezende Neves / Banca: Danisio Prado Munari / Banca: Lenira El Faro / Banca: Patrícia Tholon / Resumo: Características longitudinais são de grande importância para aprodução animal, no entanto, quando se trata de seleção genômica vários métodosestão sendo avaliados para características pontuais, como produção de leite emidades específicas ou produção total. Dessa forma, a aplicação destes métodos atrajetórias completas do fenótipo de interesse ao longo do tempo pode ser umaferramenta importante para a tomada de decisão do melhor momento para seleçãodos animais. No presente estudo foram utilizados dados de produção de leite,porcentagem de gordura, porcentagem de proteína e escore de células somáticas debovinos leiteiros da raça Holandesa em uma metodologia de dois estágios: i) osmodelos não lineares de Wood (1967), Cobby & Le Du (1978) e Wilmink (1987)foram ajustados aos dados de cada característica; ii) as estimativas de parâmetrosobtidas para as curvas individuais no modelo que proporcionou melhor ajuste aosdados (Wilmink) foram utilizadas como fenótipos nas análises genômicas. Além dosmodelos não lineares, também foi utilizado um modelo de regressão aleatória(RRM), considerando polinômios de Legendre quadráticos para a modelagem dosefeitos genético aditivo e de ambiente permanente. No segundo estágio foramtestados diferentes métodos para estimação dos valores genéticos genômicos(GEBV): RR-BLUP e LASSO, que consideraram como fenótipos as estimativas dosparâmetros obtidas anteriormente e os coeficientes de regressão estimados viaRRM. A cor... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Longitudinal traits are of great importance for animal production, however, when it comes to genomic selection several methods are being evaluated for specific traits, such as milk yield in specific ages or total yield. Thus, applying these methods to complete trajectories of the phenotype of interest over time can be an important tool for helping to decide the best time to select the animals. In this study, milk yield, fat and protein percentage, and somatic cell score data of dairy cattle were used, in a two-stage procedure: i) where the nonlinear Wood (1967), Cobby & Le Du (1978) and Wilmink (1987) were adjusted; ii) the model that provided the best fit was the Wilmink model (1987), whose parameter estimates were used as phenotypes later. In addition to the non-linear models, it was also used a random regression model, considering quadratic Legendre polynomials to model the additive genetic and permanent environment effects. In the second stage different methods for estimation of genomic breeding values (GEBV) were applied: RR-BLUP and LASSO, which considered as phenotypes the estimated parameters previously obtained and the random regression coefficients. The correspondence between phenotypes and GEBV was verified by through cross validation using the k-fold method. For all traits, the genomic prediction accuracies of Wilmink's model parameters were low when RR-BLUP was used. Furthermore, the accuracies for parameter c showed values close to zero for most traits. The pred... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Ney Lemke / Coorientador: Marcio Luis Acencio / Banca Sandra Regina Costa Maruyama / Banca: Marcelo Mendes Brandão / Banca: Claudia Pio / Banca: Angelo Jose Magro / Resumo: Uma importante questão levantada logo após o primeiro sequenciamento completo do genoma de um organismo foi: quantos genes são essenciais para a vida celular? Experimentos de deleção individual realizados com a bactéria Escherichia coli revelaram que menos de 10% dos seus genes apresentam essa condição, ou seja, a inativação de cada um deles leva a total inviabilidade da bactéria. A teoria de redes fornece uma representação abstrata de um sistema biológico, onde o conjunto de nodos são os componentes biológicos (proteínas, genes, metabólitos, etc) e o conjunto de arestas são as interações de natureza biológica (interação física entre proteínas, interações metabólicas, interações de regulação transcricional, etc) que conectam cada dois componentes biológicos. A posição dos componentes biológicos em uma rede indica sua importância para a manutenção do sistema biológico. De forma geral, componentes localizados em posições centrais em uma rede biológica são aqueles componentes chaves para a integridade do sistema. Neste trabalho, decidimos investigar a posição dos restantes 90% dos genes considerados não-essenciais na rede integrada de interações gênicas (RIG) de E. coli. Especificamente, investigamos os genes condicionalmente essenciais, isto é, genes que são essenciais somente em determinadas condições de estresse. Além disso, investigamos também a posição na rede de pares de genes que constituem interações genéticas agravantes, isto é, pares de genes que quando deletados conjuntamente agravam a viabilidade do organismo. Utilizando uma abordagem puramente computacional baseada em aprendizado de máquina e propriedades topológicas da RIG, nós criamos modelos preditivos de árvores de decisão para definirmos como esses genes condicionalmente essenciais e as interações genéticas agravantes estão distribuídas na RIG. Ainda, uma lista com as probabilidades de classificação de cada... / Abstract: An important question raised after the first complete genome sequencing was: how many genes are essential for the cell life? Single deletion experiments carried out with the bacteria Escherichia coli unveiled that less than 10% of their genes are essential, which means that the inativation of each one leads to the total bacteria inviability. The network theory provides an abstract representation of a biological system, where a set of nodes are the biological components (protein, genes, metabolites, etc) and the set of edges are the interactions (protein-protein physical interactions, metabolic interactions, transcriptional regulational interactions, etc) that link each two biological components. The position of the biological components in a network indicates its importance for the maintenance of the biological system. In general, components located in central positions in a network are those key components for the system integrity. In this work, we decided to survey the position of the 90% genes considered not essential in integrated network of gene interactions (INGI) of the E. coli. Specifically, we investigated the conditionally essential genes, i. e. those genes essential under some type of stress. Moreover, we also investigated the network position of gene pairs that constitute aggravating genetic interaction, i. e. genes pairs that when deleted simultaneously aggravates the organism viability. Using a purely computational approach based on machine learning and topological properties of the INGI, we created preditive decision trees models to define how those conditionally essential genes and the aggravating genetic interaction are distributed in the INGI. A list with the probability of classification for each gene/interaction were obtained. The performance evaluation of our models demonstrates that this methodology can be applied with success in predicting conditionally essential genes. The prediction of genetic interactions also ... / Doutor

Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-10-15T13:04:02Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Carolina Messias Silva - 2015.pdf: 1781931 bytes, checksum: 4cf011ce814b66cb9826613e2e90cc68 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-10-15T14:44:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Carolina Messias Silva - 2015.pdf: 1781931 bytes, checksum: 4cf011ce814b66cb9826613e2e90cc68 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-15T14:44:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Carolina Messias Silva - 2015.pdf: 1781931 bytes, checksum: 4cf011ce814b66cb9826613e2e90cc68 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-12-04 / In Brazil, the total production of maize has increased continuously due to the advances in technology but also to the new frontiers for the maize crop, including the expansion of the second crop (safrinha; usually maize after soybean). Therefore, the exploitation of new sources of germplasm seems to be imperative to attend the actual and future demands for modern cultivars adapted to the greatly variable environments available to the maize crop. The present work was based on a partial diallel (intergroup) cross to provide quantitative information on the potential of two groups of varieties (NAP – exotics; HG – local) and their combining abilities to direct the synthesis of new populations to be used in hybrid crosses or as base for breeding programs. The experiments were carried out in two planting seasons (safra – 1 st crop; safrinha – 2 nd crop) following the completely randomized block design with four replications of plots 5 m long spaced 0.9 m with 25 plants per plot after thinning. The following traits were analysed: ear yield, grain yield, ear length, ear diameter, plant height, ear height, number of ears per plot, number of plants per plot, male flowering, stalk diameter, tassel branch number, and tassel length. The populations under study presented acceptable levels for yield potential and agronomic traits, thus assuring good perspectives for their use in breeding programs. The prediction for the new populations to be synthesized from the cross between the two groups of varieties contributed positively and HG-3 population was the most appropriate, in both eras, as the parent variety most promising Group II (HG) to be used as a basis for incorporation of varieties of Group I (NAP). / No Brasil, a produção total de milho tem aumentado continuamente devido aos avanços na tecnologia, mas também às novas fronteiras para a cultura do milho, incluindo a expansão da segunda safra (safrinha; geralmente milho depois de soja). Portanto, a exploração de novas fontes de germoplasma é importante para atender às demandas atuais e futuras para desenvolvimento de cultivares modernas adaptadas à diversidade de ambientes disponíveis para a cultura do milho. Objetivou-se com o presente trabalho, baseado em um dialelo (intergrupo), parcial fornecer informações quantitativas sobre o potencial dos dois grupos de variedades (NAP - exóticas; HG - local) quanto às capacidades combinatorias para dirigir a síntese de novas populações para serem usadas na geração de híbridos ou como base para seleção recorrente. Os experimentos foram realizados em duas épocas de plantio (Safra – primeira safra; safrinha - segunda safra) utilizando-se o delineamento em blocos casualizados com quatro repetições e parcelas de 5 m de comprimento espaçadas 0,9 m, com 25 plantas por parcela após o desbaste. Os seguintes caracteres foram avaliados: florescimento masculino, diâmetro de colmo, altura da planta, altura da espiga, número de ramificações do pendão, comprimento do pendão, diâmetro da espiga, comprimento da espiga, peso de espigas, rendimento de grãos. As populações avaliadadas apresentaram padrão aceitável para rendimento de grãos e características agronômicas, indicando boas perspectivas para a sua utilização em programas de melhoramento. A predição para as novas populações a serem sintetizadas a partir do cruzamento entre os dois grupos de variedades colaborou de maneira positiva e a população HG-3 foi a mais indicada, em ambas as épocas, como a variedade progenitora mais promissora do Grupo II (HG) a ser usada como base para a incorporação de variedades do Grupo I (NAP).

Estudou-se a aplicação do conceito de \"risco\" na área materno-infantil, partindo da proposta da Organização Mundial de Saúde relativa ao \"enfoque de risco\" na organização dos serviços de saúde. O estudo concentrou-se mais no desenvolvimento de instrumentos de identificação de grupos de alto risco de óbito infantil, seja no período neonatal, seja no período pós-neonatal. O trabalho baseou-se em um estudo de caso-controle, onde o grupo de casos correspondeu a óbitos registrados de menores de um ano de idade, ocorridos nos anos de 1984 e 1985, de pais residentes nos municípios de Cotia e Vargem Grande Paulista, totalizando 149 óbitos (casos). O grupo controle foi formado por uma amostra probabilística de 216 crianças nascidas em 1984, filhas de pais residentes em Cotia e Vargem Grande Paulista e que sobreviveram ao primeiro ano de vida. As mães de ambos os grupos responderam a um questionário, através de entrevistas domiciliárias para a identificação de variáveis independentes associadas ao óbito infantil. As variáveis que mostraram associação estatisticamente significante foram então agrupadas de forma a constituírem quatro escalas de risco: a primeira para uso em pré-natal, a segunda para uso por ocasião do parto, a terceira para uso no período neonatal e a quarta para uso em puericultura após o período neonatal. As variáveis participaram nas escalas ponderadas pelos valores das razões dos produtos cruzados. As escalas apresentam diferentes pontos de corte e a cada um deles corresponde uma dada sensibilidade, especificidade e poder preditivo. As características específicas do sistema de saúde nos municípios estudados e a tendência de alguns indicadores de saúde infantil nesta área indicam a oportunidade e o potencial da aplicação da estratégia de enfoque de risco no setor materno-infantil. Os instrumentos preditivos propostos neste estudo são possivelmente adequados a esta estratégia, uma vez que foram desenvolvidos a partir dos dados locais. No entanto, a sua efetiva utilidade só poderá ser melhor avaliada após sua aplicação em um programa concreto de atenção materno-infantil, baseado no enfoque de risco. / It was studied the application of the concept of \"risk\" in maternal and child health, the starting point being the World Health Organization proposal of \"risk approach\" in health services. The study was concerned with the development of a scoring system for identification of high risk groups of death in the first year of life, whether in the neonatal or in the post-neonatal periods, and was based on a case control study. The case group was the registered death of children under one year of life, during the years of 1984 and 1985, whose parents lived in Cotia and Vargem Grande Paulista. It was studied 149 cases. The control group was a probabilistic sample of 216 children born in 1984, which survived the first year of life and whose parents lived in the study area (Cotia and Vargem Grande Paulista). All the mothers were interviewed according to a questionnaire for the identification of independent variables associated to infant death. The statistically associated variables were grouped in four scales; the first one to be used in the antenatal period, the second to be used before the delivery, the third to be used in the neonatal period and the fourth to be used in the post neonatal period. The variables were weighted in the scales by the values of the odds ratio, and they have different cut points, each one having its own sensibility, specificity and predictive value. The health system and the trends of the infant health indicators of the study area show the opportunity and the potencial for the use of the strategy of \"risk approach\" in maternal and child health care. The predictive scales of this study are, possibly, appropriated to the risk strategy, once they were developed with local data. Nevertheless, its efficiency will be better evaluated only with its real use in a maternal and child health programme, based on the \"risk approach\".

Orientador: Antonio Carlos Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-10T00:54:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tagliaferro_ElainePereiradaSilva_D.pdf: 1277589 bytes, checksum: 7d18c6a6334732d392cd1f298fe1c272 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A avaliação de risco de cárie é uma ferramenta importante na odontologia, uma vez que favorece o planejamento das ações em saúde com base em evidência científica. Esta tese, composta por dois estudos, teve como objetivos: a) apresentar uma visão geral e atual da avaliação de risco de cárie dentária (Capítulo 1); e b) determinar quais variáveis clínicas, comportamentais, socioeconômicas e demográficas identificaram indivíduos com maior probabilidade de desenvolver incremento de cárie, em estudo longitudinal realizado em um período de sete anos (Capítulo 2). No primeiro estudo, uma revisão da literatura odontológica sobre avaliação de risco de cárie nos últimos 10 anos foi realizada, a fim de identificar os fatores/preditores de risco da doença em crianças e adolescentes. Para isso, uma busca de artigos científicos publicados entre 1997 e 2007 foi conduzida na base de dados MEDLINE. Os estudos foram conduzidos principalmente com escolares (n= 19), seguidos pelas pesquisas realizadas em crianças em idade pré-escolar (n=l1), adolescentes (n=8) e crianças de até dois anos (n=5). A experiência de cárie, condição gengival, contagem microbiológica, hábitos de higiene oral, concentração de minerais no biofilme dental, exposição ao fluoreto, nível socioeconômico e educacional, características demográficas, antropométricas, bem como hábitos bucais, dietéticos e de escovação foram as variáveis estudadas. A experiência passada de cárie foi o preditor dç risco predominante em todas as faixas etárias pesquisadas. Outras variáveis como os hábitos dietéticos, incluindo o consumo de açúcar, e os de escovação também podem ajudar a identificar indivíduos de alto risco de cárie. No segundo estudo, 206 escolares de três escolas de Piracicaba, estado de São Paulo, foram examinados no baseline e após sete anos pelos mesmos cirurgiões-dentistas, previamente calibrados, sob luz natural, usando espelho e sonda e seguindo as recomendações da Organização Mundial da Saúde para levantamentos epidemiológicos em saúde bucal. Os examinadores coletaram dados sobre as seguintes variáveis clínicas: cárie dentária, fluorose, higiene oral e presença de selante. Adicionalmente, informações sobre nível socioeconômico, uso de fluoreto, acesso a serviços odontológicos, hábitos dietéticos e de higiene oral foram obtidas no baseline por meio de questionário semi-estruturado enviado aos pais. Para testar a associação entre o incremento de superficies cariadas, perdidas e obturadas (CPOS) e as variáveis independentes, uma análise univariada foi conduzida utilizando-se o teste de Qui-quadrado ou o Exato de Fisher. A regressão logística múltipla foi usada para obter estimativas de Odds Ratios (OR), seus intervalos de confiança (IC) ao nível de 95% e níveis de significância. O modelo de predição demonstrou que os escolares com experiência de cárie em dentes permanentes (OR=2,49; IC=1,02-6,04; p=0,04) ou em dentes decíduos (OR=2,29; IC=1,24-4,23; p=0,00l), bem como aqueles cuja escolaridade máxima da mãe era de oito anos de estudo (OR=1,88; IC=1,03-3,45; p=0,03) apresentaram probabilidades significativamente superiores de apresentar incremento de CPOS. Os resultados desta tese demonstraram que o nível educacional materno pode identificar os escolares com risco de desenvolver a doença e que as variáveis relacionadas à experiência passada de cárie continuam sendo o principal preditor de risco / Abstract: Caries risk assessment is an important tool for dentistry, because it may help planning health actions based on scientific evidences. This thesis, composed of two studies, aimed to a) present an overview of caries risk assessment (Chapter 1); and b) determine which clinical, behavioral, socioeconomic and demographic variables could identify children with higher probability of developing caries increment in a seven-year longitudinal study (Chapter 2). In the first study, a search of the published English language literature from 1997 to 2007 was made for articles that reported on caries risk assessment in the MEDLINE database. The studies were conducted mainly in schoolchildren (n=19), followed by preschool children (n=11), adolescents (n=8), and infants (n=5). Variables such as caries experience, gingival status, microbiological counts, oral hygiene, plaque mineral concentration, fluoride history, socioeconomic and educationallevel, demographic, anthropometrical, oral, dietary and toothbrushing habits were studied. Past caries experience has been the predominant predictor of caries risk in 0-18-years old subjects. Other predictors such as dietary habits, including sugar intake, and toothbrushing habits may also help to identify high-risk individuals. Variables related to caries experience continue to be the main predictor of caries incremento In the second study, two hundred and six children from three schools in Piracicaba, Brazil, were examined at baseline and after 7 years by the same calibrated dentists in an outdoor setting, under natural light, using a dental mirror and probe following the World Health Organization recommendations for oral health surveys. The examiners collected data on the following clinical variables: dental caries, fluorosis, oral hygiene and presence of sealant. Moreover, information on socioeconomic level, fluoride usage, dental service utilization, dietary and oral hygiene habits was also obtained at baseline by means of a semi-structured questionnaire sent to the parents. In order to evaluate the association between the decayed, filling and missed surfaces (DMFS) increment and independent variables, a univariate analysis was performed using the Chi-square or Fisher exact tests. The multivariate logistic regression was used to estimate the adjusted Odds Ratio (OR), their 95% confidence intervals (C I) and significance levels. The prediction model demonstrated that the schoolchildren with caries experience in permanent (OR=2.49; CI=1.02-6.04; p=0.04) or primary teeth (OR=2.29; CI=1.24-4.23; p=0.001), as well as those whose mothers' educational level was up to eight years of schooling (OR=1.88; CI=1.03-3.45; p=0.03) were more prone to have DMFS increment. The results of this thesis demonstrated that the educational leveI of mothers could identify the schoolchildren at risk of developing the disease and that variables related to past caries experience continue to be the main risk predictor / Doutorado / Saude Coletiva / Doutor em Odontologia

Concerns about global warming and climate change have triggered a growing demand for renewable energy. In this scenario, the interest in using sugarcane straw as raw material for energy production has increased. However, straw plays an important role in maintaining soil quality. In addition, uncertainties as to produced straw amount and the straw removal impact on the stalk yield have raised doubts as to the use this raw material. In this sense, the objective this study was evaluate the short-term (2-year) the sugarcane straw removal impacts on soil and yield modeling of sugarcane stalk and straw, using soil attributes of different layers. Two experiments were carried out in São Paulo state, Brazil: one at Capivari (sandy clay loam soil) and another at Valparaíso (sandy loam soil). We have tested five rates of straw removal (i.e., equivalent to 0, 25, 50, 75 and 100 %). Soil samples were taken from 0-2.5, 2.5-5, 5-10, 10-20 and 20-30 cm layers to analyze pH, total C and N, P, K, Ca, Mg, bulk density and soil penetration resistance. Plant samples were collected to determine the straw and stalk yield. The impacts caused by straw removal differed between the areas, however, they concentrated on the more soil superficial layer. In sandy clay loam soil, straw removal led to organic carbon depletion and soil compaction, while in the sandy loam soil the chemical attributes (i.e. Ca and Mg contents) were the most impacted. In general, the results suggest that straw removal causes reduction more significant in soil quality for the sandy clay loam soil. The results indicate the possibility to remove about half-straw amount deposited on soil\'s surface (8.7 Mg ha-1 straw remaining) without causing severe implications on the quality of this soil. In contrast, although any amount of straw was sufficient to cause alterations the quality of the sandy loam soil, these impacts were less intense and are not magnified with the increase of straw removal. It was possible to model sugarcane straw and stalk yield using soil attributes. The 0-20 cm layer was the most important layer in the stalk yield definition, whereas the 0-5 cm layer, which the impacts caused by the straw removal were concentrated, was less important. Thus, we noticed that impacts caused to soil by straw removal have little influence on crop productivity. Straw prediction has proved more complex and possibly requires additional information (e.g crop and climate information) for good results to be obtained. Overall, the results suggest that the planned removal of straw for energy purposes can occur in a sustainable way, but should take into account site conditions, e.g soil properties. However, long-term research with different approaches is still necessary, both to follow up and confirm our results, and to develop ways to reduce damage caused by this activity. / Preocupações acerca do aquecimento global e mudanças climáticas tem provocado uma crescente demanda por energias renováveis. Nesse cenário, tem aumentado o interesse em utilizar a palha de cana-de-açúcar como matéria prima para produção de energia. Contudo, a palha desempenha importante papel na manutenção da qualidade do solo. Aliado a isso, incertezas quanto a quantidade de palha produzida e o impacto da remoção da palha na produção de colmos tem levantado duvidas quanto ao uso dessa matéria prima. Nesse sentido, o objetivo desse estudo foi avaliar a curto prazo (2 anos) os impactos da remoção da palha de cana-de-açucar no solo, e modelar a produção de palha e colmo de cana-de-açucar utilizando atributos do solo de diferentes camadas. Para tanto, foram conduzidos dois experimentos nos municípios de Capivari (solo de textura média) e Valparaíso (solo de textura arenosa), estado de São Paulo, Brasil. Foram testados cinco taxas de remoção de palha (i.e., equivalentes a 0, 25, 50, 75 e 100 %). Amostras de solo foram coletadas nas camadas 0-2,5, 2,5-5, 5-10, 10-20 e 20-30 cm de profundidade para determinação de C, N, pH, P, K, Ca, Mg, densidade do solo e resistência do solo a penetração. Amostras de planta foram coletadas para determinar a produção de colmo e palha. Os impactos causados pela remoção da palha diferiu entre as áreas, no entato, se concentraram na camada mais superficial do solo. No solo de textura média a remoção da palha levou a depleção do carbono orgânico e a compactação do solo, enquanto que, no solo de textura arenosa os atributos químicos (i.e teores de Ca e Mg) foram os mais impactados. Os resultados indicam a possibilidade de remover cerca de metade da quantidade de palha depositada sobre o solo (8.7 Mg ha-1 palha remanecente) sem causar graves implicações na qualidade deste solo. Em contraste, no solo de textura arenosa, qualquer quantidade de palha foi suficiente para causar alterações na qualidade do solo, contudo, essas alterações foram menos intensas e não aumentaram com as taxas de remoção da palha. Foi possível modelar a produção de colmo e palha de cana-de-açucar utilizando atributos do solo. A camada 0-20 cm foi a mais importante na definição da produção de colmos, ao passo que a camada 0-5 cm, camada em que se concentra os impactos causados pela remoção da palha, foi menos importante. Assim, notamos que os impactos causados ao solo pela remoção da palha tem pouca influencia na produtividade da cultura. A predição da palha se mostrou mais complexa e possivelmente requer informações adicionas (e.g informações da cultivar e de clima) para que bons resultados sejam obtidos. No geral, os resultados sugerem que a remoção planejada da palha para fins energéticos pode ocorre de maneira susutentável, porém deve levar em conta condições locais, e.g propriedades do solo. Contudo, pesquisas de longo prazo com diferentes abordagens ainda são necessárias, tanto para acompanhar e confirmar nossos resultados, como para desenvolver soluções que atenuem os danos causados por esta atividade.