Thesis (Ph. D.)--University of Wyoming, 2006. / Title from PDF title page (viewed on April 16, 2008). Includes bibliographical references.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-17T09:30:03Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 971904 bytes, checksum: 6fba372a708197c45ace38066444f048 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-17T09:30:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 971904 bytes, checksum: 6fba372a708197c45ace38066444f048 (MD5) Previous issue date: 2015-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Prochilodus argenteus, a curimatá-pacu, juntamente com a sua espécie irmã, Prochilodus costatus, representam cerca de 50% da biomassa total da pesca, sendo as espécies migratórias mais abundantes na região de Três Marias e ambas endêmicas da bacia do rio São Francisco. A construção de hidrelétricas altera o ambiente e o fluxo gênico entre populações que podiam não estar isoladas no passado. Desta forma, o objetivo deste estudo foi verifica se existem diferenças citogenéticas entre populações de Prochilodus argenteus que podem ter ficado isoladas pela barragem de Três Marias, bacia do rio São Francisco, Minas Gerais, Brasil, desde final da década de 1950. Foram coletados 44 espécimes: 14 a montante da represa, perto da cidade de Iguatama, e 30 a jusante (24 no Refugio Estadual da Vida Silvestre do rio Pandeiros e seis no município de Três Marias). O número diploide de 2n=54 e a fórmula cariotípica 40m + 14sm foram encontrados em todos os indivíduos. Em ambas as populações foram encontrados os seguintes padrões: a banda C apresentou blocos heterocromáticos centroméricos em todos os cromossomos, além de um bloco adicional pericentromérico no segundo par metacêntrico; a Ag-NOR evidenciou marcações simples no segundo par metacêntrico, coincidindo com a constrição secundária. Em aproximadamente 5% das metáfases ocorreu uma terceira marcação na região terminal de apenas um cromossomo. A técnica de Fluorescent in situ Hybridization (FISH) utilizando as sondas 18S e 5S rDNA evidenciou sintenia destas regiões no segundo par metacêntrico, coincidentes com a NOR e a constrição secundária. As sondas repetitivas (GA) 15 e (CA) 15 apresentaram marcações na região telomérica de todos os cromossomos e a sonda (CA) 15 evidenciou blocos na região pericentromérica no quarto par metacêntrico, sugerindo a ocorrência de inversão cromossômica. As sondas (CAA) 10 e (CAT) 10 apresentaram marcação na região telomérica na maioria dos braços cromossômicos e, de forma mais difusa, ao longo de alguns cromossomos. Com base nestes padrões, conclui-se que as populações, hoje isoladas pela UHE de Três Marias desde a década de 50, não sofreram diferenciação citogenética e podem ser consideradas como uma população única. / Prochilodus argenteus, the curimatá-pacu, along with its sister species, Prochilodus costatus represent about 50% of the total biomass of fish, and migratory species more abundant in the area of Three Marias, both endemic to the São Francisco River basin. The construction of hydroelectric dams changes the environment and precludes gene flow between populations that were not isolated in the past. Thus, the aim of this study was to determine if there cytogenetic differences between populations of Prochilodus argenteus that became isolated by the Três Marias Dam, São Francisco Basin, Minas Gerais, Brazil, since late 1950s. Forty-four specimens were collected: 14 upstream of the dam, near the city of Iguatama, and 30 downstream (24 in the Refugio Estadual da Vida Silvestre do rio Pandeiros and six in the Três Marias Dam channel). We found a stable karyotype formula of 40m + 14sm, 2n=54. The following patterns were observed in both populations: The C banding showed centromeric heterochromatin blocks in all chromosomes, plus an additional pericentromeric block in the second chromosome metacentric pair. The nucleolus organizer regions (Ag-NOR) occurred on the second metacentric pair, coinciding with the secondary constriction. About 5% of the metaphases showed a third mark in the telomeric region of only one chromosome complements. The Fluorescent in situ Hybridization (FISH) with the 18S and 5S rDNA probes revealed synteny of these regions on the second metacentric pair, coinciding with the NOR and the secondary constriction. The (GA) 15 and (CA) 15 repetitive DNA probes showed markings on the terminal region of most chromosomes, and the (CA) 15 repetitive DNA probe hybridized in the pericentromeric region of the fourth chromosome pair, suggesting a chromosomal inversion. The (CAA) 10 and (CAT) 10 repetitive DNA probes hybridized on the terminal region of most chromosome arms and along some chromosomes. Based on these cytogenetic patterns, we concluded that the populations now isolated by UHE Três Marias since the 50’s did not suffer cytogenetic differentiation and should be considered as a single population.

Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2018-05-28T17:49:41Z No. of bitstreams: 2 Bruna Soares.pdf: 1233072 bytes, checksum: ec6d54f3ae61588cc5fe38eb2661418a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-28T17:49:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Bruna Soares.pdf: 1233072 bytes, checksum: ec6d54f3ae61588cc5fe38eb2661418a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-05-30 / The Pleistocene began about 2.5 million years ago and was an epoch marked by climatic oscillations and glaciations. During the glaciation period the sea level diminished, causing the reduction of river levels and causing erosion of riverbeds, the rapids became more evident as barriers. In interglacial periods the sea level increased by 120 m causing inundations of the Amazon River and its tributaries, and as a result, the barriers ceased to exist for a while, thus allowing the expansion of the distribution of fish species. As a consequence the fish populations were isolated or expanded their distribution. Some rivers of the Amazon basin make an abrupt transition between the borders of the Brazilian Shield and the Amazonian plain favoring the occurrence of rapids and waterfalls such as those in the rivers Madeira, Tapajós, Xingu and Tocantins-Araguaia. Some studies in these rivers show that the rapids influence gene flow and dispersal of several species. The present study proposed to test if these rapids affect gene flow between populations of Prochilodus nigricans and also how the climate in the Pleistocene affected its distribution. Next Generation Sequencing (NGS) was used to verify the importance of physical barriers (rapids) and climatic changes in the Pleistocene on the genetic structure of the species Prochilodus nigricans. To test whether the rapids in Tocantins, Xingu, Tapajós and Madeira are barriers to gene flow for populations of Prochilodus nigricans downstream and upstream the rapids. Inference of biological groups based on Hardy-Weinberg equilibrium and binding disequilibrium was performed in Structure 2.3.4. The presence and direction of gene flow, and the time of divergence between the two populations in each river, was done using the MCMC approach and a coalescing model of isolation with migration, which estimates the migration rates and divergence times between two or more populations that diverged from an ancestral population in the IMa2 program. The results showed that the rapids of the Madeira, Tapajós, Xingu and Tocantins rivers are not total barriers for the populations of Prochilodus nigricans. There is a two-way gene flow between the populations located upstream and downstream of the waterfalls. Therefore the construction of hydroelectric dams or dams can affect gene flow. As far as the time of divergence of the populations, the observed results indicate that the climatic changes in the Pleistocene were possibly responsible for the separation of the populations in the rivers Madeira with 420 thousand years, Tapajós with 375 thousand years and Xingu 539 thousand years. The result of the Tocantins River 239 years, shows that the populations are not yet totally isolated. / O Pleistoceno iniciou-se há cerca de 2,5 milhões de anos e foi uma Época marcada por oscilações climáticas e glaciações. Durante o período de glaciação o nível do mar diminuía, provocando a redução dos níveis dos rios e causando a erosão dos leitos, as corredeiras ficavam mais evidentes como barreiras. Nos períodos interglaciais o nível do mar aumentava cerca de 120 m provocando inundações do rio Amazonas e seus afluentes como resultado, as barreiras deixaram de existir por um tempo, permitindo então a expansão da distribuição das espécies de peixes. Como consequência as populações de peixes foram isoladas ou expandiram sua distribuição. Alguns rios da bacia Amazônica fazem uma abrupta transição entre as bordas do Escudo Brasileiro e a planície Amazônica favorecendo a ocorrência de corredeiras e cachoeiras como ocorrem nos rios Madeira, Tapajós, Xingu e Tocantins-Araguaia. Alguns estudos realizados nesses rios mostram que as corredeiras influenciam o fluxo gênico e a dispersão de várias espécies. O presente estudo propôs testar se essas corredeiras afeta o fluxo gênico entre as populações de Prochilodus nigricans e também como o clima no Pleistoceno afetou a sua distribuição. Foi utilizado Sequenciamento de Nova Geração (Next Generation Sequencing – NGS), para verificar a importância das barreiras físicas (corredeiras) e mudanças climáticas no Pleistoceno na estrutura genética da espécie Prochilodus nigricans. Para testar se as corredeiras no Tocantins, Xingu, Tapajós e Madeira são barreiras para fluxo gênico para populações de Prochilodus nigricans a jusante e a montante das corredeiras. A estimativa de grupos biológicos baseados no equilíbrio Hardy-Weinberg e desequilíbrio de ligação foi realizada no Structure 2.3.4. A presença e direção do fluxo gênico, e o tempo de divergência entre as duas populações em cada rio, foi usando a abordagem de MCMC e um modelo coalescente de isolamento com migração, que estima as taxas de migração e tempos de divergência entre duas ou mais populações que divergiram de uma população ancestral, no programa IMa2. Os resultados mostraram que as corredeiras dos rios Madeira, Tapajós, Xingu e Tocantins, não são barreiras totais para as populações de Prochilodus nigricans. Existe o fluxo gênico bidirecional entre as populações localizadas a montante e a jusante das cachoeiras. Portanto a construção de hidrelétricas ou barragens podem afetar o fluxo gênico. Quanto ao tempo de divergência das populações, os resultados observados indicam que possivelmente as alterações climáticas do Pleistoceno foram responsáveis pela separação das populações nos rios Madeira com 420 mil anos, Tapajós com 375 mil anos e Xingu 539 mil anos. O resultado do rio Tocantins 239 anos, mostra que as populações ainda não estão totalmente isoladas.

O curimbatá (Prochilodus lineatus) é uma espécie de importância comercial na pesca continental brasileira, especialmente na região da bacia do Rio Grande. Diversos estudos foram realizados com o curimbatá nesta região, incluindo os de delimitação populacional. Desde então, a região passou por alterações ambientais causadas pela construção de diversas barragens, impossibilitando migrações a montante, essenciais para a reprodução de P. lineatus. O presente estudo teve como objetivo verificar o impacto das barragens, sob o ponto de vista genético, na população de curimbatá da bacia do Rio Grande. Para tanto, foi utilizada a técnica de PCR-RFLP do fragmento entre os genes ND2 e CO1 e também da região controle, ambos do mtDNA, com 10 e 15 enzimas de restrição, respectivamente. Foram realizadas coletas em nove localidades entre barragens que não possuíam escadas para a migração de peixes. As localidades são: no Rio Grande - Cardoso, Colômbia, Conceição das Alagoas, Igarapava, Pedregulho e São João Batista do Glória; no Rio Mogi-Guaçu - Pirassununga e Espírito Santo do Pinhal; e no Rio Pardo - Jaborandi. Os resultados obtidos na análise do fragmento ND2-CO1 com três amostras, sendo uma de cada rio, não evidenciaram divergência significativa. Os índices de diversidade genética (haplotípica e nucleotídica) observados foram baixos, quando comparados com outras espécies de peixes. Estes resultados são condizentes com o esperado para seqüências conservadas, por isso, optou-se pela análise de uma região mais variável, como a região controle do mtDNA. Os resultados obtidos para a região controle (Fst, distribuição de Monte Carlo, teste exato e AMOVA) evidenciaram divergência significativa entre a amostra de Jaborandi e as demais, este fato pode ser devido a uma sub-estruturação populacional, ou a um erro de identificação da localidade de coleta. As outras amostras evidenciaram que, em geral, fazem parte de uma única população sob o ponto de vista genético. Não foi observada estruturação por distância, já que não houve correlação entre a distância genética e a distância geográfica. Os índices de diversidade (nucleotídica e haplotípica) são considerados de altos a moderados, sendo que os maiores foram obtidos para as amostras localizadas em trechos onde ainda há características naturais da bacia. A presença de poucos haplótipos amplamente distribuídos e internos na rede de haplótipos e de diversos haplótipos raros localizados perifericamente na rede, são um indício de expansão populacional recente. A expansão foi averiguada, também, com testes de neutralidade e gráficos de distribuição mismatch. O tempo de expansão foi calculado em 238 mil anos, que corresponde ao Pleistoceno Médio, época de grandes mudanças climáticas na América do Sul. Em conclusão, as alterações ambientais provocadas pelas barragens não geraram, a curto prazo, diferenças significativas entre as amostras estudadas, assim como parecem não estar diminuindo a variabilidade genética do curimbatá, quando comparada com a de populações naturais de outros rios. A divergência obtida para Jaborandi deve ser melhor estudada, mas parece refletir ausência de fluxo anterior à construção das barragens. O objetivo pretendido é o de apresentar um parâmetro de comparação para estudos futuros, especialmente aqueles que enfoquem o monitoramento da variabilidade genética do curimbatá. Estudos de longo prazo devem ser realizados no intuito de auxiliar o manejo pesqueiro do curimbatá, inclusive em programas de repovoamento. / Prochilodus lineatus has a commercial importance in the Brazilian freshwater fishing, especially in the Rio Grande basin. Several studies have been done with P. lineatus in this area, including those delimiting populations. Since then, the Rio Grande basin has been changed due to environmental impacts caused by construction of several dams. The most expressive impact for this population of P. lineatus was the impossibility of upstream migration, essential for its reproduction. The present study aimed at genetically verifying the impact of dams in the population of P. lineatus from Rio Grande basin. The PCR-RFLP method was used in mitochondrial DNA fragments ND2-CO1 and control region, with 10 and 15 restriction enzymes, respectively. Nine samples colected between dams with no fish ladders were analyzed: in Rio Grande - Cardoso, Colômbia, Conceição das Alagoas, Igarapava, Pedregulho e São João Batista do Glória; in Rio Mogi-Guaçu - Pirassununga e Espírito Santo do Pinhal; and in Rio Pardo – Jaborandi. Analysis results of the ND2-CO1 fragment with three samples, one from each river, did not show significant divergence. Values of haplotype and nucleotide diversity were low when compared to other fish species. These results are expected for conserved sequences, so analysis of a more variable region, such as the control region, was chosen. Results of the control region (Fst, Monte Carlo distribution, exact test and AMOVA) showed a significant divergence between Jaborandi sample and the others. This could be due to a population structure, or to an error in the locality identification. The other samples seem to be part of a single population. Isolation by distance was not verified since there is no correlation between genetic and geographic distances. Values of haplotype and nucleotide diversity ranged from high to moderate, with the highest values found in samples from localities where natural features of the basin still exist. Presence of few and widely distributed haplotypes internally in the haplotype net, and the occurrence of several other rare haplotypes distributed peripherically in the haplotype net, are typical of a recent population expansion. The expansion was also verified in neutrality tests and mismatch distribution. The calculated expansion time is 238 thousands of years that correspond to the Median Pleistocene, a period of great climatic changes in South America. In conclusion, the environmental changes caused by dams did not generate significant differences among the analyzed samples, in a short-term, and did not seem to be decreasing the genetic variability of P. lineatus, when compared to other natural populations. Divergence obtained for Jaborandi should be better studied, but seems to reflect the absence of gene flow prior to the construction of dams. These work intents to present a comparative parameter for future studies, especially those monitoring the genetic variability of P. lineatus. Longterm studies must be conducted to help fisheries management of P. lineatus, including restock programs.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-01T16:42:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 942255 bytes, checksum: 78707c68d18c95c144f96f780a8b1aa1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-01T16:42:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 942255 bytes, checksum: 78707c68d18c95c144f96f780a8b1aa1 (MD5) Previous issue date: 2015-12-04 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / O objetivo deste trabalho foi desenvolver metodologia de conservação de sêmen de Prochilodus vimboides e Prochilodus lineatus, da bacia do rio Paraíba do Sul, a curto e a longo prazo. Os experimentos foram realizados na estação de piscicultura do Projeto Piabanha/PESAGRO–RJ e no Campo Experimental EPAMIG de Leopoldina, durante as piracemas de 2013/2014 e 2014/2015. Exemplares de Grumatã Prochilodus vimboides e Curimba Prochilodus lineatus foram induzidos com extrato bruto de hipófise de Carpa. Posteriormente, o sêmen foi coletado e suas características seminais avaliadas. No experimento de resfriamento o sêmen foi diluído na proporção 1:9 (v/v, sêmen: diluidor) em soluções compostas por NaCl 0,9%, NaCl 1,2%, glicose 5%, BTS 5% ou MIII 6%. Uma alíquota do sêmen foi mantida sem diluição (controle). A motilidade espermática foi ativada como solução de NaCl 0,29% e subjetivamente avaliada após 0, 1, 2, 3, 4 e 5 dias de armazenamento a 4-6oC. Na criopreservação do sêmen, foram utilizados os mesmos diluidores testados no resfriamento, porém combinados com três crioprotetores (dimetilsulfóxido-DMSO, Metilglicol e Etilglicol), na proporção 1:8:1 (sêmen:diluidor:crioprotetor). As amostras seminais diluídas foram envasadas em palhetas de 0,5 mL, congeladas em botijão de vapor de nitrogênio líquido e posteriormente armazenadas em nitrogênio líquido. Após o descongelamento em banho- maria a 60°C por 8 segundos, a motilidade espermática foi subjetivamente estimada em percentagem. Além disso, avaliou-se o estresse oxidativo ocorrido nessas amostras. A concentração espermática observada para P. vimboides foi de 27,1±15,8 x 10 9 espermatozoides/mL e o volume seminal de 1,4±0,7 mL. Para P. lineatus foi observado concentração espermática de 20,4 ± 6,4 x 10 9 espermatozoides/mL e volume seminal de 2,0 ± 0,4 mL. No resfriamento, amostras diluídas em BTS preservaram a motilidade espermática acima de 30% por até 2 dias em temperaturas de 4-6oC para P. vimboides e até 5 dias para P. lineatus, sendo este diluidor o melhor entre os testados (P<0,05). No congelamento, amostras seminais diluídas nas criosoluções compostas por glicose 5%+Metilglicol, apresentaram as maiores motilidades espermáticas (60% ± 11,8%; P<0,05) para P. vimboides, pós-descongelamento. Também foi observado nessas amostras menores atividades de catalase e peroxidação lipídica (MDA; P<0,05) nas células espermáticas. Já em P. lineatus as amostras seminais diluídas nas criosoluções compostas por glicose 5%+DMSO (dimetilsufóxido) foram as que proporcionaram as maiores motilidades espermáticas (66,1%±4,0%; P<0,05) e menores atividades de SOD, catalase (CAT) e peroxidação lipídica (MDA; P<0,05). Portanto, o sêmen de P. vimboides pode ser resfriado por até 48 horas em solução diluidora de BTS 5% e criopreservado em criosolução composta por glicose 5% + Metilglicol. E o sêmen de P. lineatus pode ser resfriado por até 5 dias em solução de BTS 5% e criopreservado em criosolução composta por glicose 5% + DMSO, com sucesso. / The objective in this work was to develop a methodology of semen conservation of Prochilodus vimboides and Prochilodus lineatus, from Paraíba do Sul river basin, at short and long period. The experiments were realized in the station of fish culture of the project Piabanha/PESAGRO–RJ and in the experimental field EPAMIG from Leopoldina during the “piracemas” from 2013/2014 and 2014/2015. Specimes of Grumatã Prochilodus vimboides and Curimba Prochilodus lineatus were induced by pituitary extract from carp. After the semen was collected and their seminal characteristics were evaluated. In the cooling experiment, the semen was diluted in the proportion 1:9 (v/v, semen, diluting) in saline solutions of NaCl 0,9%, NaCl 1,2%, glucose 5%, BTS 5% or M III 6%. One semen aliquot was kept undiluted and was used as control. The sperm motility was activated with solution of NaCl 0,29% and subjectively evaluated after 0, 1, 2, 3, 4 and 5 days of storage at 4-6oC. In the semen cryopreservation, were used the same extenders tested in the cooling, however combined with three cryoprotectants (dimethyl sulphoxide – DMSO, methylglycol and ethylglycol), in the proportion of 1:8:1 (semen, extender, cryoprotectant). The seminal samples diluted were potted in containers of 0,5 mL, frozen in nitrogen liquid vapor container and then stored in liquid nitrogen. Sperm motility was subjectively evaluated after thawing at 60°C-water bath for 8 s. Beside this, was evaluated the oxidative stress in these samples. The spermatic concentration observed for P. vimboides was of 27,1±15,8 x 10 9 sperm/mL and the seminal volume of 1,4±0,7 mL. For P. lineatus was observed spermatic concentration of 20,4 ± 6,4 x 10 9 sperm/mL and the seminal volume of 2,0 ± 0,4 mL. In cooling, samples diluted in BTS maintained the spermatic motility above 30 % for as long as 2 days at 4-6oC for P. vimboides and as long as 5 days for P. lineatus, being this extender the better between those tested (P<0,05). In freezing, seminal samples diluted in the cryosolutions composed by glucose 5%+ Methylglycol, presented higher spermatic motility (60% ± 11,8%; P<0,05) for P. vimboides post-thaw. Was also observed in these samples low activity of catalase and lipid peroxidatiom (MDA; P<0,05) in the spermatic cells. In P. lineatus the seminal samples diluted in cryosolutions composed by glucose 5%+DMSO (dimethyl sulphoxide) were those that provided the higher spermatic motility (66,1%±4,0%; P<0,05) and lower activity of SOD, catalase (CAT) and lipid peroxidation (MDA; P<0,05). However, the semen of P. vimboides can be cooled for up to 48 hours in extender solution of BTS 5% and cryopreserved in cryosolution composed by glucose 5% + Methylglycol. The semen of P. lineatus can be cooled for up to 5 days in solution of BTS 5% and cryopreserved in cryosolution composed by glucose 5% +DMSO, with success.

FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico / Esta tese de doutorado apresenta um estudo sobre a utilizaÃÃo de dois bioprodutos, o primeiro a base de extrato lÃquido da palma forrageira gigante (Opuntia ficus indica) liofilizado e o segundo a Ãgua de coco em pà ACP-104, como diluente de sÃmen de curimatà comum (Prochilodus brevis). Este estudo foi motivado pela escassez de informaÃÃes sobre o sÃmen da espÃcie, dos bioprodutos testados e pela necessidade de desenvolver um protocolo de resfriamento e criopreservaÃÃo utilizando sÃmen de curimatà comum associados aos bioprodutos à base de palma forrageira e ACP-104. A tese està apresentada em trÃs capÃtulos. O primeiro capÃtulo trata de um artigo de revisÃo contendo as biotÃcnicas empregadas na conservaÃÃo de gametas. Nele relatam-se as tÃcnicas de resfriamento, congelaÃÃo e descongelaÃÃo de sÃmen e avaliaÃÃo morfolÃgica e computadorizada de espermatozoides de curimatà comum (P. brevis). O segundo capÃtulo objetiva a criopreservaÃÃo e anÃlise morfolÃgica dos espermatozoides de curimatà comum (P. brevis) diluÃdos em soluÃÃes a base de extrato de palma forrageira gigante (O. ficus) liofilizado, ACP (Ãgua de coco em pÃ) e soluÃÃo de glicose a 5%. Neste experimento foi utilizado o programa computacional CASA (Computer-Assisted Sperm Analyser) para analisar as propriedades de trajetÃria e velocidade dos espermatozoides para cada soluÃÃo estudada. Esta pesquisa teve como objetivo principal avaliar os efeitos da criopreservaÃÃo do sÃmen de curimatà comum (P.brevis), utilizando como diluente o extrato de palma forrageira gigante (O. ficus) liofilizado (EPFL). A metodologia empregada na criopreservaÃÃo do sÃmen de curimatÃ, utilizando os diluentes ELPF 30%; ELPF 50%, ACP-104 e Glicose 5%, permitiu a obtenÃÃo de taxas de motilidade pÃs-descongelamento superiores a 60%. O melhor meio de congelaÃÃo seminal de P. brevis, nas condiÃÃes testadas à o que utiliza a associaÃÃo do ACP-104 com o DMSO 10%. A metodologia empregada na criopreservaÃÃo do sÃmen de curimatà (P. brevis), utilizando os diluentes ELPF 30%; ELPF 50%, ACP-104 e Glicose a 5%, foram adequadas, permitindo a obtenÃÃo de taxas de motilidade pÃs-descongelamento superiores a 60%. Os resultados expressivos foram aqueles obtidos quando se utilizou a associaÃÃo do ACP-104 e DMSO 10%. Os demais tratamentos podem ser considerados num programa de reproduÃÃo assistida, jà que apresentaram desempenho dentro dos padrÃes de utilizaÃÃo de sÃmen criopreservados na espÃcie Prochilodus brevis. / This thesis presents a study on the use of two bioproducts, the first base of liquid extract of giant cactus pear (Opuntia ficus indica) lyophilized and the second the coconut powder ACP-104 as diluent semen common curimatà (Prochilodus brevis). This study was motivated by the scarcity of information about the semen of species of tested bioproducts and the need to develop a protocol for cooling and cryopreservation of semen using common curimatà associated with bioproducts based on cactus pear and ACP-104. The thesis is presented in three chapters. The first chapter is a review article containing biotechnologies employed in the preservation of gametes. Report him to the techniques of cooling, freezing and thawing of semen and morphological and computerized assessment of sperm of common curimatà (P. brevis). The second chapter aims to morphological analysis and cryopreservation of sperm of common curimatà (P. brevis) diluted in solutions based on extracts of giant cactus pear (O. ficus) lyophilized, ACP (coconut milk powder) and glucose solution 5%. In this experiment the computer program CASA (Computer-Assisted Sperm Analyser) was used to analyze the properties of trajectory and speed of sperm for each solution studied. This research aimed to evaluate the effects of cryopreservation of semen from common curimatà (P.brevis), using as diluent extract giant cactus pear (O. ficus) lyophilized (EPFL). The methodology used in sperm cryopreservation of curimatà using the diluents ELPF 30%; ELPF 50%, ACP-104 and 5% dextrose, afforded the rate of post-thaw motility higher than 60%. The best way of semen freezing P. brevis, the tested conditions is what uses the association of ACP-104 with 10% DMSO. The methodology used in sperm cryopreservation of curimatà (P. brevis) using diluents ELPF 30%; ELPF 50%, ACP-104 and 5% glucose were suitable, capable of producing rates higher post-thaw motility 60%. The significant results were those obtained when using the combination of ACP-104 and 10% DMSO. The other treatments may be considered an assisted reproductive program, as presented within the performance standards for the use of cryopreserved semen in species Prochilodus brevis.

O curimbatá (Prochilodus lineatus) é uma espécie de importância comercial na pesca continental brasileira, especialmente na região da bacia do Rio Grande. Diversos estudos foram realizados com o curimbatá nesta região, incluindo os de delimitação populacional. Desde então, a região passou por alterações ambientais causadas pela construção de diversas barragens, impossibilitando migrações a montante, essenciais para a reprodução de P. lineatus. O presente estudo teve como objetivo verificar o impacto das barragens, sob o ponto de vista genético, na população de curimbatá da bacia do Rio Grande. Para tanto, foi utilizada a técnica de PCR-RFLP do fragmento entre os genes ND2 e CO1 e também da região controle, ambos do mtDNA, com 10 e 15 enzimas de restrição, respectivamente. Foram realizadas coletas em nove localidades entre barragens que não possuíam escadas para a migração de peixes. As localidades são: no Rio Grande - Cardoso, Colômbia, Conceição das Alagoas, Igarapava, Pedregulho e São João Batista do Glória; no Rio Mogi-Guaçu - Pirassununga e Espírito Santo do Pinhal; e no Rio Pardo - Jaborandi. Os resultados obtidos na análise do fragmento ND2-CO1 com três amostras, sendo uma de cada rio, não evidenciaram divergência significativa. Os índices de diversidade genética (haplotípica e nucleotídica) observados foram baixos, quando comparados com outras espécies de peixes. Estes resultados são condizentes com o esperado para seqüências conservadas, por isso, optou-se pela análise de uma região mais variável, como a região controle do mtDNA. Os resultados obtidos para a região controle (Fst, distribuição de Monte Carlo, teste exato e AMOVA) evidenciaram divergência significativa entre a amostra de Jaborandi e as demais, este fato pode ser devido a uma sub-estruturação populacional, ou a um erro de identificação da localidade de coleta. As outras amostras evidenciaram que, em geral, fazem parte de uma única população sob o ponto de vista genético. Não foi observada estruturação por distância, já que não houve correlação entre a distância genética e a distância geográfica. Os índices de diversidade (nucleotídica e haplotípica) são considerados de altos a moderados, sendo que os maiores foram obtidos para as amostras localizadas em trechos onde ainda há características naturais da bacia. A presença de poucos haplótipos amplamente distribuídos e internos na rede de haplótipos e de diversos haplótipos raros localizados perifericamente na rede, são um indício de expansão populacional recente. A expansão foi averiguada, também, com testes de neutralidade e gráficos de distribuição mismatch. O tempo de expansão foi calculado em 238 mil anos, que corresponde ao Pleistoceno Médio, época de grandes mudanças climáticas na América do Sul. Em conclusão, as alterações ambientais provocadas pelas barragens não geraram, a curto prazo, diferenças significativas entre as amostras estudadas, assim como parecem não estar diminuindo a variabilidade genética do curimbatá, quando comparada com a de populações naturais de outros rios. A divergência obtida para Jaborandi deve ser melhor estudada, mas parece refletir ausência de fluxo anterior à construção das barragens. O objetivo pretendido é o de apresentar um parâmetro de comparação para estudos futuros, especialmente aqueles que enfoquem o monitoramento da variabilidade genética do curimbatá. Estudos de longo prazo devem ser realizados no intuito de auxiliar o manejo pesqueiro do curimbatá, inclusive em programas de repovoamento. / Prochilodus lineatus has a commercial importance in the Brazilian freshwater fishing, especially in the Rio Grande basin. Several studies have been done with P. lineatus in this area, including those delimiting populations. Since then, the Rio Grande basin has been changed due to environmental impacts caused by construction of several dams. The most expressive impact for this population of P. lineatus was the impossibility of upstream migration, essential for its reproduction. The present study aimed at genetically verifying the impact of dams in the population of P. lineatus from Rio Grande basin. The PCR-RFLP method was used in mitochondrial DNA fragments ND2-CO1 and control region, with 10 and 15 restriction enzymes, respectively. Nine samples colected between dams with no fish ladders were analyzed: in Rio Grande - Cardoso, Colômbia, Conceição das Alagoas, Igarapava, Pedregulho e São João Batista do Glória; in Rio Mogi-Guaçu - Pirassununga e Espírito Santo do Pinhal; and in Rio Pardo – Jaborandi. Analysis results of the ND2-CO1 fragment with three samples, one from each river, did not show significant divergence. Values of haplotype and nucleotide diversity were low when compared to other fish species. These results are expected for conserved sequences, so analysis of a more variable region, such as the control region, was chosen. Results of the control region (Fst, Monte Carlo distribution, exact test and AMOVA) showed a significant divergence between Jaborandi sample and the others. This could be due to a population structure, or to an error in the locality identification. The other samples seem to be part of a single population. Isolation by distance was not verified since there is no correlation between genetic and geographic distances. Values of haplotype and nucleotide diversity ranged from high to moderate, with the highest values found in samples from localities where natural features of the basin still exist. Presence of few and widely distributed haplotypes internally in the haplotype net, and the occurrence of several other rare haplotypes distributed peripherically in the haplotype net, are typical of a recent population expansion. The expansion was also verified in neutrality tests and mismatch distribution. The calculated expansion time is 238 thousands of years that correspond to the Median Pleistocene, a period of great climatic changes in South America. In conclusion, the environmental changes caused by dams did not generate significant differences among the analyzed samples, in a short-term, and did not seem to be decreasing the genetic variability of P. lineatus, when compared to other natural populations. Divergence obtained for Jaborandi should be better studied, but seems to reflect the absence of gene flow prior to the construction of dams. These work intents to present a comparative parameter for future studies, especially those monitoring the genetic variability of P. lineatus. Longterm studies must be conducted to help fisheries management of P. lineatus, including restock programs.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-08-29T13:06:25Z No. of bitstreams: 2 OLIVEIRA, 1997. Determinacao da idade e dinamica do curimata.doc: 10865152 bytes, checksum: a5dd6e3c5928d3be6863e169923ada74 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-29T13:06:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 OLIVEIRA, 1997. Determinacao da idade e dinamica do curimata.doc: 10865152 bytes, checksum: a5dd6e3c5928d3be6863e169923ada74 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 1997-03-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The studies of age and aspects of the population dynamics of the Curimatã P. nigricans of Central Amazonia were performed, using 769 specimens obtained from experimental and commercial fishing. Age was determined using the growth marks in the scales of 270 specimens obtained from commercial fishing along a hydrological cycle (May / 92 to May / 93). The periodicity of formation of the main brands was determined by the variation of the marginal increment (IM) throughout the year, confirmed by the comparison with data observed in the nature, by Bayley (1983) and related to the variation of the water level and with seasonal events of the life cycle. Two falls in monthly MI values ​​indicative of the period of formation of the marks were observed throughout the year. One between September and October, at the end of the ebb and another between December and January, at the beginning of the flood. The migration during the ebb and flood, at the expense of the fat accumulated in the flood, would explain the decrease in the rhythm of growth and the consequent formation of the marks in the scales. In the flood, the environmental conditions propitiate the feeding and the improvement of the physiological condition, besides not occurring migration, favoring the fast growth of the species. Curimatan growth is very rapid in the first year of life, when the species reaches 19 cm on average, of standard length. After the second year, the growth rate decreases, when individuals, at 27 cm on average, have already reached sexual maturity. It is a kind of short life (A95 = 6 years), rapid growth (K = 0.465 / year) and high natural mortality rate (M = 0.51). / Os estudos de idade e de aspectos da dinâmica populacional do curimatã P. nigricans da Amazônia Central foram realizados, utilizando-se 769 exemplares obtidos da pesca experimental e comercial. A idade foi determinada utilizando-se as marcas de crescimento nas escamas de 270 exemplares obtidos da pesca comercial ao longo de um ciclo hidrológico (maio/92 a maio/93). A periodicidade de formação das marcas principais foi determinada pela variação do incremento marginal (IM) ao longo do ano, confirmada pela comparação com dados observados na natureza, por Bayley (1983) e relacionada com a variação do nível da água e com eventos sazonais do ciclo de vida. Duas quedas nos valores mensais do IM, indicativas do período de formação das marcas foram observadas ao longo do ano. Uma entre setembro e outubro, no final da vazante e outra entre dezembro e janeiro, no início da enchente. A migração durante a vazante e enchente, às custas da gordura acumulada na cheia, explicaria a diminuição no ritmo de crescimento e a conseqüente formação das marcas nas escamas. Na cheia, as condições ambientais propiciam a alimentação e a melhoria da condição fisiológica, além de não ocorrer migração, favorecendo o crescimento rápido da espécie. O crescimento do curimatã é muito rápido no primeiro ano de vida, quando a espécie atinge 19 cm em média, de comprimento padrão. Após o segundo ano, a taxa de crescimento diminui, quando os indivíduos, com 27 cm em média, já atingiram a maturidade sexual. Trata-se de uma espécie de vida curto (A95= 6 anos), crescimento rápido (K= 0,465/ano) e taxa de mortalidade natural alta (M= 0,51).

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2013-07-16T04:00:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 288227.pdf: 530657 bytes, checksum: 4d8edeade7c54b83c289bd10f94598d1 (MD5) / O Brasil é dependente dos regimes hidrológicos das Bacias Hidrográficas para gerar energia elétrica. A fragmentação do ambiente aquático, pela construção de barragens, gera alterações no meio causando problemas para a integridade do hábitat, composição e abundância de espécies, quebrando etapas essenciais do ciclo de vida de algumas espécies de peixes migradores como o Prochilodus lineatus, contribuindo para o declínio quantitativo e qualitativo ou isolamento de segmentos populacionais. Esta espécie tem grande importância comercial e se encontra amplamente distribuída nas bacias hidrográficas do Brasil (Solimões-Amazonas, Tocantins, São Francisco, Paraná-Paraguai e Uruguai). A bacia do alto rio Uruguai possui um grande número de barragens, podendo estar influenciando na reprodução desta espécie. Assim, este estudo teve como objetivos estimar a diversidade genética e analisar se há estruturação populacional em P. lineatus entre diferentes pontos nesta bacia. Foram analisados 153 exemplares desta espécie, coletados em 14 pontos amostrais de 4 sítios de coletas utilizando-se nove loci de microssatélites que apresentaram alto nível de polimorfismo. Nos resultados observou-se desvio no equilíbrio de Hardy-Weinberg para todos os pontos amostrais (p?0,05), exceto para o ponto 12, no sítio de coleta Montante UHE Itá que não apresentou diferença significativa (p?0,05), estando em equilíbrio de Hardy-Weinberg. O software structure, identificou uma estruturação entre os pontos amostrais analisados (K=3).

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-08-15Bitstream added on 2014-06-13T19:48:40Z : No. of bitstreams: 1 machado_mrf_me_jabo.pdf: 349142 bytes, checksum: 7ea843f05c11d971d486081daa92b71e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A espécie Prochilodus lineatus é de grande importância comercial na região dos rios Grande, Pardo e Mogi-Guaçu e tem como característica a formação de grandes cardumes, apta a desenvolver amplos deslocamentos migratórios. O presente trabalho objetivou avaliar, por meio das características morfométricas e etária, se os curimbatás (P. lineatus) dos diferentes estoques migradores e residentes constituem uma única população, havendo interação entre as sub-populações no período de piracema (migração reprodutiva). Utilizou-se um delineamento experimental inteiramente casualizado em esquema fatorial 4 x 2, com quatro tipos de estoques (um residente e três migradores) e dois sexos (macho e fêmea) com trinta repetições, considerando cada peixe como unidade experimental. Foi observada variação de 80,19% para o primeiro componente principal e 8,09% do segundo componente principal fornecida pelas dez variáveis morfométricas dos estoques residentes e migradores. O estoque residente correspondeu aos maiores valores para todas as variáveis morfométricas. Houve sobreposição dos escores individuais das mesmas características entre os estoques migradores. Observou-se predominância de machos entre os estoques residentes e migrador I e II. As semelhanças morfométricas verificadas entre os estoques migradores indicam tratar-se de uma única população, com pequenas variações interpopulacional. / The species Prochilodus lineatus have a great commercial importance in the area of the Grande, Pardo and Mogi-Guaçu rivers, having as characteristics the formation of great shoal, able to develop wide migratory displacements. The present work focused to evaluate, by means of the morphometrics characteristics and age, if the curimbatás (P. lineatus) of the different stocks migratories and residents constitute an only population, having interaction among the sub-populations in the piracema period (reproductive migration). To compare the morphometrics values of the analyses, the using the plotting was completely randomized by 4 x 2 factorial scheme, having as factors four stocks (one resident and three migratories) and two genders (male and female) with thirty replicates, considering each fish as an experimental unit.Variation of 80.19% was observed for the first main component and 8.09% of the second main component supplied by the ten morphometrics variable of the resident and migratories stocks. The resident stock corresponded the biggest values for the whole morphometrics variable. There was superposition of individual scores of the same characteristics among the migratories stocks. Significant predominance of males was observed between the resident stocks and migratories I and II. The morphometrics similiarity verified among the migratories stocks, facilitates to suppose to be an only population, with small variations interpopulation.