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Copepods in aquaculture : improving the quality and quantity of copepods for application as potential live prey / Les copépodes dans l’aquaculture : amélioration de la qualité et de la quantité de copépodes pour une utilisation comme proie vivante potentielle

Pan, Yen-Ju 01 July 2016 (has links)
Cette thèse contient quatre études majeures ciblant l'aquaculture des copépodes : (1) les conditions optimales de la culture de deux espèces tropicales, le calanoide Acartia bilobata et le cyclopoide Apocyclops royi ; (2) les œufs de résistance d'A. bilobata ; (3) les effets d'une sélection d’une souche performante d’A. royi en utilisant un nouveau protocole multi-générationnel et thermique ; (4) la pertinence de l’introduction des copépodes dans le régime alimentaire des larves de poissons. Pour le nourrissage des copépodes, les micro-algues de petites tailles (3-6 µm) riches en acides gras polyinsaturés (AGPI) sont plus avantageuses pour les deux espèces testées dans cette étude. De plus, nous avons démontré qu’A. royi, contrairement à A. bilobata, est capable de synthétiser des chaines longues d’AGPI à partir de chaines plus courtes d’AGPI. La salinité optimale pour le développement de la population est égale à 20. Les différentes caractéristiques de production d'œufs quiescents et de diapause, viables pendant plusieurs mois après stockage à 4°C, ont été identifiées chez deux souches d'A. bilobata. Une expérience de sélection de femelles d’A. royi a combiné les critères de productivité et du profil lipidique. Basé sur nos résultats obtenus sur l’élevage de larves de poissons, le régime alimentaire basé sur les nauplii d’A. tonsa obtenus en utilisant les œufs de résistance stockés à faible température, pourrait être avantageux pour des larves pélagiques; cependant, l'utilisation d'A. royi comme proie vivante devrait être soigneusement évaluée par la considération spécifique du comportement de nage de l'espèce de poisson ciblée. / The present thesis contains four major studies addressed on copepod aquaculture: (1) optimal culture conditions of two tropical copepod species Acartia bilobata (Calanoida) and Apocyclops royi (Cyclopoida); (2) resting eggs of A. bilobata; (3) effects of thermal selective breeding on A. royi; (4) feeding suitability of copepod-based diets on larval fish. For copepod feeding, small-sized microalgae (3-6 μm) with rich polyunsaturated fatty acids (PUFAs) are preferable for both copepod species. Furthermore, we found that the cyclopoid A. royi, contrary to the calanoid A. bilobata, is capable of synthesizing long-chain PUFAs from short-chain PUFAs. The salinity affects differently the A. royi at different life stages, but it is suggested to cultivate this species at salinity 20 for the highest productivity. Various features of quiescent and diapausing eggs productions are identified in two culture strains of A. bilobata with different domestication levels, and those eggs remain viable after several months of cold storage (4°C). The larger female with higher nauplii production and compensative fatty acid increase were obtained in the cold-selected strain of A. royi. Based on our results found in fish larvae feeding trials, the diet based on A. tonsa nauplii derived from quiescent eggs could be beneficial for pelagic fish larvae; however, the use of A. royi as live prey should be carefully evaluated by the specific consideration of swimming behavior of targeted fish species. This thesis reveals the biological and physiological understandings on copepods, and provides implications on the application of copepods as promising live prey for larviculture.
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Etude du rôle des sémiochimiques dans les stratégies d'évitement des prédateurs chez deux gastéropodes terrestres : Deroceras reticulatum (Muller, 1774) et xeropicta derbentina (Krynicki, 1836)

Bursztyka, Piotr 10 December 2015 (has links) (PDF)
Malgré des inconvénients rédhibitoires, l’utilisation de molluscicides reste prédominante dans les stratégies de lutte contre les gastéropodes terrestres, une situation qui appelle au développement d’alternatives. Bien que les gastéropodes terrestres reposent essentiellement sur la chémodétection pour la réalisation d’un grand nombre d’interactions capitales avec leur environnement, leur perception de la prédation reste largement méconnue malgré son importance écologique. Nous avons donc étudié l’altération de comportements de maintenance chez deux espèces de gastéropodes terrestres nuisibles, la limace Deroceras reticulatum et l’escargot Xeropicta derbentina, en présence de composés chimiques issus de différentes espèces de carabes, une catégorie importante de prédateurs mallacophages. Les résultats obtenus indiquent que les caractéristiques écologiques des prédateurs sont cruciales dans la perception de la pertinence de la menace par ces gastéropodes.
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Influence de l'intensification agricole et de la sélection de proies des parents sur la diète des oisillons chez l'Hirondelle bicolore (Tachycineta bicolor)

Bellavance, Véronique January 2014 (has links)
L’anthropisation est un phénomène mondial qui affecte plusieurs taxa qui se retrouvent dans des milieux variés, autant terrestres qu’aquatiques. Même si, pour quelques espèces, ces changements sont bénéfiques, pour la plupart d’entres-elles ils entrainent des conséquences désastreuses pouvant mener au déclin de leurs populations. L’avifaune insectivore aérienne champêtre n’est pas épargnée par ce phénomène puisque la détérioration des aires de reproduction par l’intensification des pratiques agricoles a participé, de manière non équivoque, au déclin de cette faune. En effet, plusieurs études ont montré des effets négatifs de l’intensification agricole sur certains traits d’histoire de vie de ses oiseaux (p. ex. : diminution de la croissance et du succès reproducteur chez les oiseaux de milieux intensifs vs milieux extensifs). Afin d’expliquer ces effets, l’hypothèse la plus souvent suggérée se base sur le fait que dans les milieux agricoles intensifs où des insecticides sont utilisés, la disponibilité en insectes est inférieure aux milieux naturels. Donc, par l’entremise d’une diminution en abondance et en diversité d’insectes disponibles dans les milieux agricoles, la diète des oiseaux est affectée ce qui peut potentiellement participer au déclin des insectivores aériens. Or, peu d’études ont tenté de déterminer la diète d’un insectivore aérien champêtre en déclin dans les milieux agricoles ou ont tenté de déterminer les variables qui peuvent influencer sa sélection de proies, changeant potentiellement la composition même de la diète. Sachant que 1) la diète insectivore est influencée par la disponibilité de proies dans le milieu; que 2) la disponibilité de proies est influencée par l’environnement (paysage, conditions météorologiques et temporelles, etc.); et que 3) les stratégies de quête alimentaire de l’insectivore aérien (fréquence et durée des quêtes, nombre de proies capturées, stratégies de sélection et d’évitement de proies, etc.) fluctuent et dépendent de la disponibilité de proies dans l’environnement et de l’environnement lui-même, je me suis intéressée, dans ce mémoire, aux fluctuations dans la sélection de proies d’un insectivore aérien, selon différentes variables. Plus particulièrement, je me suis intéressée à l’effet de l’intensification agricole, de la disponibilité de proies dans les milieux agricoles, de la condition morphologique de la femelle, de l’état de sa niché et des conditions environnementales et temporelles sur la sélection de proies d’un insectivore aérien en déclin. Ainsi, dans cette étude, des becquées alimentaires ont été récoltées chez l’Hirondelle bicolore (Tachycineta bicolor), passereau insectivore aérien en déclin dans le Nord-Est de l’Amérique du Nord depuis plus de 25 ans, puis comparées à des échantillons d’insectes disponibles, tous deux récoltés le long d’un gradient d’intensification agricole dans de Sud du Québec. Mes résultats montrent d’abord que les diptères représentent l’ordre le plus important dans la diète de l’Hirondelle bicolore et supportent l’idée d’un effet négatif de l’intensification des pratiques agricoles sur l’abondance en arthropodes disponibles dans le milieu. Par ailleurs, j’ai également montré que les associations entre les composantes du paysage agricole et certains taxa d’insectes étaient différentes entre les becquées et les pièges à insectes, suggérant une potentielle sélection de proies de la part des hirondelles. J’ai finalement déterminé les variables qui affectent le plus fortement la sélection de diptères par l’Hirondelle bicolore, c’est-à-dire la disponibilité de diptères dans le milieu, l’intensification agricole et la date de récolte des échantillons et ce, contrôlé pour des variables météorologiques et temporelles confondantes Cette étude est, jusqu’à présent, la plus développée et complète sur ce sujet tant au niveau de la couverture spatio-temporelle qu’au niveau de l’ampleur de l’échantillonnage qui aboutit en une base de données inégalée De plus, seule l’approche statistique complexe réalisée dans le cadre de cette étude permet d’adéquatement caractériser les déterminismes de la sélection de proies qui visent à comprendre une réponse comportementale potentielle de l’insectivore aérien face à des pressions au niveau des proies lui étant disponibles dans les milieux agricoles causée par l’intensification des pratiques agricoles.
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Étude d'un modèle comportemental du vieillissement : la construction de la toile chez une araignée orbitèle / Study of a behavioural model of ageing : the web construction in an orb-weaving spider

Anotaux, Mylène 14 December 2012 (has links)
Le vieillissement est un phénomène naturel, obligatoire et irréversible, souvent associé à un déclin des performances et des fonctions de l'organisme. Bien que les comportements nous renseignent sur l'état physiologique et neurologique de l'organisme, très peu d'études ont portées sur les relations entre l'âge et les comportements. La recherche de nouveaux modèles permettant d'appréhender cette relation pourrait donc être primordiale. Chez les araignées orbitèles, la toile est une structure géométrique complexe d'une apparente régularité. Sa construction résulte d'une succession de comportements organisés et répétés et chaque variation dans la structure de la toile peut être interpréter comme une variation comportementale de l'araignée lors de la construction. L'objectif de cette étude était de mettre en évidence des variations structurelles dans la géométrie de la toile de l'araignée Zygiella x-notata qui pourraient être corrélées au vieillissement de l'araignée, et de savoir comment le vieillissement agissait sur la mobilité de l'araignée lors de sa construction et lors de la capture des proies. Nos résultats montrent que le vieillissement a affecté les caractéristiques géométriques de la toile, le comportement de construction et le comportement de capture de l'araignée. Notre étude a permis de valider la pertinence de l'utilisation des araignées orbitèles et de leurs toiles géométriques comme modèles innovants pour l'étude des relations entre vieillissement et comportement / Ageing is an obligatory and natural progressive process often associated with a decline in organism functions and performances. Although behaviours inform us about the physiological and neurological state of an organism, relationship between behaviour and ageing remains largely misunderstood. Thus, the research of new animal models that could assess this relationship would be crucial. In orb weaving spiders, the web is a complex geometrical structure, which presents a visible regularity. Its construction results of a succession of organized and repeatable behaviours and each variation in web characteristics could be interpreted as a behavioural variation during web construction. The objective of this study was to highlight structural variations in web's structure of the spider Zygiella-x-notata, which were correlated with spider's age, and to know how ageing affected spider mobility during web construction and prey capture. Our results showed that ageing influenced the geometrical structure of the orb-web, and the spider web-building and prey capture behaviours. Our study allowed to validate the pertinence of the use of spiders and their orb web as innovative models for studies of relationships between ageing and behaviour
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Etude du rôle des sémiochimiques dans les stratégies d'évitement des prédateurs chez deux gastéropodes terrestres : Deroceras reticulatum (Muller, 1774) et xeropicta derbentina (Krynicki, 1836) / Study of the role of semiochemicals in predator avoidance strategies in two terrestrial gastropods : Deroceras reticulatum (Müller, 1774) and Xeropicta derbentina (Krynicki, 1836)

Bursztyka, Piotr 10 December 2015 (has links)
Malgré des inconvénients rédhibitoires, l’utilisation de molluscicides reste prédominante dans les stratégies de lutte contre les gastéropodes terrestres, une situation qui appelle au développement d’alternatives. Bien que les gastéropodes terrestres reposent essentiellement sur la chémodétection pour la réalisation d’un grand nombre d’interactions capitales avec leur environnement, leur perception de la prédation reste largement méconnue malgré son importance écologique. Nous avons donc étudié l’altération de comportements de maintenance chez deux espèces de gastéropodes terrestres nuisibles, la limace Deroceras reticulatum et l’escargot Xeropicta derbentina, en présence de composés chimiques issus de différentes espèces de carabes, une catégorie importante de prédateurs mallacophages. Les résultats obtenus indiquent que les caractéristiques écologiques des prédateurs sont cruciales dans la perception de la pertinence de la menace par ces gastéropodes. / Despite crippling drawbacks, molluscicides remain predominant in strategies employed against terrestrial gastropods pests, a situation that call for the development of alternatives. Although chemodetection drive many crucial interactions in terrestrial gastropods, their perception of predation remains largely unknown despite its ecological importance. We investigated the alteration of self-maintenance behaviours of two harmful land gastropods, the slug Derocers reticulatum and the snail Xeropicta derbentina, exposed to chemical compounds from different ground beetle species, an important category of gastropod predators. The results obtained indicate that the ecological features of the predators are crucial for the perception of the relevance of the predation threat by these gastropods.
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Étude d'un modèle de Gause généralisé avec récolte de proies et fonction de Holling type III généralisée

Etoua, Remy Magloire Dieudonné January 2008 (has links)
Thèse numérisée par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.
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Voyages avec les fous du Cap : influences sociales pour les stratégies d'approvisionnement alimentaire, observées par vidéo / Come aboard with Cape gannets : social influences in foraging strategies, observed from videos

Thiebault, Andrea 17 December 2013 (has links)
En milieu marin, les oiseaux sont souvent observés en groupe lors de la recherche et de la chasse de proies. Les mécanismes sous-jacents à ces comportements ainsi que leurs conséquences sur l'approvisionnement alimentaire des individus sont peu connus du fait des difficultés d'observation en mer. Pour expliquer ces stratégies de groupe communes à de nombreuses espèces d'oiseaux marins, la principale hypothèse propose qu'elles répondent aux spécificités de leurs champs de proies. Le milieu marin pélagique est caractérisé par une forte variabilité spatio-temporelle. Dans ce milieu ouvert, les ressources sont agrégées de façon hiérarchiques et leur localisation est changeante. Le milieu marin est ainsi propice au développement de stratégies de groupe pour l'approvisionnement alimentaire. Cette thèse étudie les interactions sociales lors des voyages en mer d'un oiseau marin, le fou du Cap. L'objectif est d'en évaluer la prévalence et les effets sur l'approvisionnement alimentaire des individus. Des adultes reproducteurs ont été équipés de GPS et de micro-caméras afin d'étudier leurs mouvements en mer en relation avec leur contexte proximal. Tous les oiseaux équipés ont interagi avec des congénères, lors des phases de posées sur l'eau, en vol pour la recherche de proie, ou en chasse sur un banc de proies. La présence de congénères est le moteur principal des mouvements des fous du Cap à une échelle inférieure à la dizaine ou la vingtaine de kilomètres. Plusieurs types d'interactions ayant une influence sur les capacités d'approvisionnement alimentaire des individus ont été mis en évidence. Lors de la recherche de proies, les fous réagissent à leurs congénères en modifiant leur direction de vol, et réduisent ainsi leur temps de recherche. Les fous sont attirés par les agrégations de congénères ; la détection de groupes de prédateurs en chasse augmente les distances de détection des proies. Par ailleurs, des observations vidéos sous-marines de groupes de prédateurs en chasse sur des bancs de poissons ont été utilisées pour quantifier l'influence des prédateurs sur les captures de proies des fous du Cap. Les attaques successives des prédateurs déstructurent les bancs et augmentent les succès de capture des individus. La thèse met en évidence le rôle prépondérant des interactions sociales entre oiseaux marins au cours de toutes les étapes d'un voyage d'approvisionnement alimentaire : de l'orientation vers une zone potentielle de nourrissage à la capture de proies, en passant par la localisation et l'exploitation de bancs de poissons. Le développement des stratégies de groupe chez les fous du Cap répond d'une part à la difficulté de localisation et d'autre part aux stratégies d'évitement de leurs proies. La capacité à former des groupes de chasse pour rechercher et exploiter des proies pourrait constituer une condition essentielle au maintien des populations de fous du Cap, et pourrait expliquer la forte occurrence de ce comportement chez les oiseaux marins. La notion de compétition entre oiseaux de mer serait donc à tempérer, tant la facilitation entre eux est importante. / In the marine environment, seabirds are commonly observed foraging in groups. The mechanisms underlying these behaviours, and their consequences on the foraging success of individuals, are poorly understood due to the difficulties in studying their behaviour at sea. The main hypothesis proposed to explain these group strategies, which are common to many seabird species, is that seabirds respond to the characteristics of their prey fields. The marine environment is vast and highly dynamic. The resources are aggregated in hierarchical patches of which the location is constantly changing. The marine environment therefore favours the evolution of foraging group strategies to increase the success of individuals. The objective of this thesis is to study the social interactions during the foraging trips of a seabird, the Cape gannet, and to study their effects on the foraging decisions of individuals. Breeders were equipped with GPS devices and video-cameras in order to study their movement at sea in relation to their proximate environment. All the individuals equipped in this study interacted with conspecifics at sea, either when sitting on the water, flying in search for prey, or hunting at a school of fish. Predators within the proximate environment of Cape gannets were the main drivers of their movement patterns at scales roughly < 20 km. Several types of interactions were observed to affect the foraging capacities of individuals. While searching for prey, gannets reacted to conspecifics by changing their flight direction thereby reducing the time to find prey. Gannets were attracted to aggregations of conspecifics, and the detection and joining of foraging groups increased their abilities to find and hunt for inconspicuous prey. Furthermore, underwater video footages of pelagic fish schools under predation were used to quantify the influence of group foraging on the feeding success of Cape gannets. Successive attacks by several individuals disorganized the fish schools and increased the feeding success of individual birds. This thesis highlights the important role of social interactions along all stages of a foraging trip in Cape gannets: when choosing a direction from the colony to orientate towards a patch of food, in order to locate inconspicuous prey, and to capture fish in schools. The use of group strategies in Cape gannets seems to have evolved in response to both the difficulties in locating prey in the marine environment and the anti-predatory behaviour of fish schools. The ability to form groups to forage at sea could be essential to the persistence of Cape gannet populations. These mechanisms could partly explain the prevalence of colonial breeding in seabirds. Competition between seabirds should therefore be moderated, as facilitation during foraging seems to play a crucial role in enhancing feeding success of individuals.
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Étude d'un modèle de Gause généralisé avec récolte de proies et fonction de Holling type III généralisée

Etoua, Remy Magloire Dieudonné January 2008 (has links)
Thèse numérisée par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal
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Pratiques, prédateurs, proies, pullulations de campagnols prairiaux et biodiversité / Practices, predators, preys, common voles outbreak and biodiversity

Halliez, Guillaume 05 November 2015 (has links)
Dans le contexte des grands bouleversements socio-économiques, technologiques et environnementaux des révolutions agricoles, les zones de montagnes sont souvent considérées comme favorables à la biodiversité et à des pratiques agricoles respectueuses de l'environnement. Pourtant, ces territoires subissent une pression anthropique réelle via l'agriculture ou la sylviculture menant à une des questions fondamentales du siècle à venir sur l'altération des ressources naturelles pas les activités anthropiques. Ces nouveaux systèmes agricoles ont entraîné l'émergence ou l'augmentation d'abondance d'espèces devenues des pestes agricoles. En raison des pertes de productions alimentaires, de la lutte chimique et des dégâts sur la faune non-cible, des réservoirs de zoonoses qu’ils représentent ou comme maillon essentiel des réseaux trophiques, les micro-mammifères et leurs pullulations représentent un domaine d’étude de première importance en écologie. Les politiques agricoles qui ont mené à une spécialisation des pratiques agricoles vers la production herbagère ont contribué à favoriser l’apparition des pullulations de campagnols prairiaux (campagnol terrestre et campagnol des champs) via l’augmentation de la production végétale et une homogénéisation du paysage agricole dans le Massif Jurassien et le Massif Central. Tandis que certains prédateurs comme les petits mustélidés se spécialisent dans la consommation de ces micro-mammifères. D’autres prédateurs, considérés comme généralistes, présentent une réponse fonctionnelle alimentaire en adaptant leur alimentation à la disponibilité de la ressource. Cette réponse fonctionnelle peut être à l’origine d’un report de prédation sur des proies alternatives aux micro-mammifères. Parmi toutes ces espèces, la petite faune chassable et patrimoniale représente à l’heure actuelle des enjeux de gestion et de conservation marqués.Cette thèse a pour but de comparer deux zones géographiques (vallée alpine de la Haute-Romanche et Massif Jurassien) présentant un degré a priori différent de connaissances sur les systèmes de pullulations de campagnols prairiaux. Nous avons, au travers de ce travail, comparé le phénomène de pullulation observé en Haute-Romanche avec les connaissances actuelles du Massif Jurassien. Nous avons également, par l’analyse de données de monitoring à long terme et la mise en place d’expérimentations de terrain, essayé d’apporter des informations quant aux relations entre proies et prédateurs dans un système de pullulation de campagnol prairiaux en milieu tempéré. L’objectif est de tenter une comparaison tant que faire se peut entre les deux zones géographiques pour améliorer la gestion de ces écosystèmes.Notre premier travail fut d’analyser les données récoltées entre 1998 et 2010 pour caractériser le fonctionnement spatio-temporel du campagnol terrestre en Haute-Romanche. Nous avons également confronté ces données à l’histoire agricole de la vallée entre 1810 et 2003 à l’échelle parcellaire. Dans un premier temps, nous avons constaté que le scénario historique agricole était similaire entre cette vallée de la Haute-Romanche et d’autres zones montagnardes européennes, avec une spécialisation sur la production herbagère et comme effet direct la disparition virtuelle des zones labourées, le cantonnement des zones de fauches dans les fonds de vallée et l’extension des zones de pâtures au reste des zones exploitées pour l’agriculture. En se basant sur ces données, nous avons pu mettre en évidence un lien corrélatif à l’échelle parcellaire entre l’occupation du sol actuelle et l’intensité de la pullulation du campagnol terrestre. Les zones pâturées ont présenté une amplitude de l’abondance en campagnol terrestre moins importante que les zones fauchées. L’occupation agricole actuelle étant directement dépendant de l’histoire agricole de la vallée, il apparaît vraisemblable que la spécialisation agricole vers la production herbagère dans cette vallée est, comme dans le Jura, à l’origine / In the context of the great socio-economic, technological and environmental upheavals of agricultural revolutions, mountain areas are often considered as favorable to biodiversity and environmentally friendly agricultural practices. However, these territories are under real anthropic pressure via agriculture or forestry leading to one of the fundamental questions of the coming century on the alteration of natural resources, not human activities. These new farming systems have led to the emergence or increase in abundance of species that have become agricultural pests. Due to loss of food production, chemical control and damage to non-target fauna, reservoirs of zoonoses they represent or as an essential link in food webs, micro-mammals and their outbreaks represent an area of study of primary importance in ecology. Agricultural policies that have led to a specialization of agricultural practices towards grassland production have contributed to the emergence of outbreaks of prairie voles (ground vole and field vole) through increased crop production and homogenization of the agricultural landscape. in the Jurassic Massif and the Massif Central. While some predators like small mustelids specialize in the consumption of these micro-mammals. Other predators, considered as generalists, present a functional food response by adapting their diet to the availability of the resource. This functional response may be at the origin of a postponement of predation on prey alternatives to micro-mammals. Of all these species, hunting and heritage small-scale wildlife presently represent marked management and conservation issues. The purpose of this thesis is to compare two geographical zones (Upper Romans valley and Upper Jurassic mountains) with a priori different degree of knowledge about prairie volcano outbreak systems. Through this work, we compared the phenomenon of outbreaks observed in Haute-Romanche with current knowledge of the Jurassian Massif. We also, through the analysis of long-term monitoring data and the implementation of field experiments, tried to provide information on the relations between prey and predators in a meadow vole breeding system in a temperate environment. . The objective is to try to make a comparison as much as possible between the two geographical areas to improve the management of these ecosystems. Our first work was to analyze the data collected between 1998 and 2010 to characterize the spatio-temporal functioning of the ground vole in Haute-Romanche. We also compared these data to the agricultural history of the valley between 1810 and 2003 at the plot scale. Firstly, we found that the agricultural historical scenario was similar between this valley of Haute-Romanche and other European mountain areas, with a specialization on grassland production and as a direct effect the virtual disappearance of plowed areas, the cantonment of mowing areas in the valley bottoms and extension of grazing areas to the rest of the areas used for agriculture. Based on these data, we were able to highlight a correlative link at the plot scale between the current land use and the intensity of the vole's overgrowth. Grazing areas had a lower vole abundance than mowed areas. The current agricultural occupation being directly dependent on the agricultural history of the valley, it seems likely that the agricultural specialization towards grassland production in this valley is, as in the Jura, the origin
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Étude acoustique du macrozooplancton au Pérou : estimation de biomasse, distribution spatiale, impact du forçage physique, et conséquences sur la distribution des poissons fourrage / Acoustic study of macrozooplancton off Peru : biomass estimation, spatial patterns, impact of physical forcing, and effect on forage fish distribution

Ballón Soto, Roberto Michael 12 May 2010 (has links)
La partie nord du Système du courant de Humboldt (NSCH) couvre moins de 0.1% de la surface océanique mondiale mais produit plus de poisons, en particulier d'anchois du Pérou (Engraulis ringens), par unité de surface que n'importe quelle autre région du monde. Bien que ce système produise suffisamment de macrozooplancton pour alimenter les populations de poisson fourrage, le manque d'informations sur ce compartiment limite nos capacités d'étude. L'objectif de cette thèse est d'étudier la dynamique de la distribution spatiotemporelle de la biomasse en macrozooplancton du NSCH en relation avec l'environnement physique et les poissons fourrage, à différentes échelles. Pour ce faire une méthode acoustique bi-fréquences a été développée et appliqué à des séries de données acoustiques historiques. Des informations à haute résolution ont ainsi pu être extraite sur la biomasse et les patrons de distribution du macrozooplancton, de la galathée pélagique 'munida', des poissons et des autres compartiments. Cette méthode nous a également permis d'estimer l'extension verticale de la communauté épipélagique (ZVEEC). Nous avons démontré que ZVEEC coïncide avec la limite supérieure de la zone de minimum d'oxygène (ZMO), ce qui permet de produire des donnés spatialisées à haute résolution de la limite supérieure de la ZMO et d'estimer le volume d'habitat de l'anchois. Notre estimation de biomasse en macrozooplancton, environ quatre fois supérieures aux estimations antérieures, est en accord avec les découvertes récentes sur l'écologie trophique des poissons fourrage du NSCH et fournit des éléments étayant les théories actuelles sur l'origine de la haute productivité en poissons du NSCH. L'étude des impacts des structures physiques de submeso- et mesoéchelle sur la distribution du macrozooplancton supporte l'hypothèse d'une structuration de type 'bottom-up'. Nous avons également mis en évidence l'impact de la structuration spatiale du macrozooplancton sur la distribution des poissons fourrage. Les données physiques et biologiques à haute résolution obtenues grâce à cette étude ouvrent de nouvelles perspectives pour réaliser des études écologiques intégrées à échelles multiples et pour calibrer les modèles biogéochimiques, trophiques ou End-to-End. / The Northern Humboldt Current system (NHCS) represents less than 0.1% of the world ocean surface but produces more fish, mainly Peruvian anchovy (Engraulis ringens), per unit area than any other region in the world. Although this system produces enough macrozooplankton to feed its high production of forage fish, the paucity of information on zooplankton hampers research in the system. The objective of this study was to investigate the multiscale dynamics of the spatiotemporal distribution of the macrozooplankton biomass off Peru in relation to the physical environment and their fish predators. For that a bi-frequency acoustic method was developed and applied to extract, from historical acoustic data, high-resolution information on the biomass and the patterns of distribution of macrozooplankton, the pelagic red squad 'munida', fish and other marine compartments. This method also allows estimating the vertical extension of this epipelagic community (ZVEEC). We demonstrated that ZVEEC coincide with the upper limit of the oxygen minimum zone (OMZ), which allowed both producing high-resolution spatial data of the upper limit of the OMZ and estimating the volume habitat of anchovy. The estimated macrozooplankton biomass was about four times higher than previously reported. This estimate is in agreement with the recent findings on forage fish trophic ecology and supports the current hypotheses explaining the NHCS high fish production. The study of the impacts of the submeso- and mesoscale physical structures on macrozooplankton provided evidence of the bottom-up physical effect on the distribution of macrozooplankton biomass. We also found further evidence of the structuring bottom-up effect that macrozooplankton exert on forage fish. The high-resolution biological and physical data obtained in this study opens new perspective to perform integrated multiscale ecological studies and to calibrate biogeochemical, trophic and End-to-End models.

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