Estudos funcionais anteriores identificaram um módulo cis-regulador (MCR) de 67 pb (-253/- 187) na região promotora do gene de pufe de DNA BhC4-1 que dirige a expressão do gene repórter na glândula anelar de Drosophila melanogaster. Uma análise bioinformática identificou 67 sequências de D. melanogaster que são similares a sequências contidas no MCR de glândula anelar. Uma das sequências identificadas reside em um fragmento genômico de 657 pb localizado aproximadamente 2500 pb à montante do CG13711, 400 pb à montante do CG12493, em uma região genômica que constitui um dos íntrons do CG32239 (Gef64C). A caracterização preliminar de três linhagens transformadas com a construção 657 pb-lacZ mostrou expressão do gene repórter no sistema traqueal de larvas e prépupas e no tórax de adultos. Baseado padrão de expressão promovido por este MCR, o mesmo foi denominado Traqueia-Tórax (TT). O principal objetivo do presente trabalho constituiu estender a caracterização molecular das linhagens da série TT-lacZ. Inicialmente embriões, larvas de primeiro, segundo e terceiro estádio, prépupas 0 h, 1 h e 2 h, pupas 24 h e adultos com 1, 3 e 5 dias foram investigados quanto ao padrão de expressão do repórter utilizando ensaio histoquímico que detecta atividade de ?-galactosidase. A expressão do gene repórter é inicialmente detectada no sistema traqueal durante o terceiro estádio larval e continua a ser detectada neste tecido em prépupas 0 h, 1 h e 2 h e pupas 24 h. Em adultos, a expressão do gene repórter é verificada nos músculos longitudinais dorsais em adultos de 3 e 5 dias. Uma vez que o MCR TT reside em uma região intergênica e a informação disponível sobre os CGs próximos ainda é escassa, não foi possível inferir qual dos CGs é regulado pelo MCR TT. Neste contexto, o padrão de expressão do RNAm do gene repórter lacZ e do CG13711, CG12493 e CG32239 foi investigado no sistema traqueal de larvas e prépupas e no tórax de adultos de uma das linhagens da série TT-lacZ utilizando RT-qPCR. Os níveis de expressão do RNAm lacZ aumentam cerca de 3 vezes em prépupas 0 horas, quando comparados com os níveis de expressão do RNAm lacZ presentes no sistema traqueal de larvas de terceiro estádio. Um padrão de expressão similar foi observado no caso do CG32239 e do CG13711. Nos tóraxes de adultos de 3 e 5 dias de idade os níveis de expressão do RNAm lacZ aumentam cerca de 37 vezes e 11 vezes, respectivamente, quando comparados aos níveis de expressão iv do RNAm lacZ presentes nos tóraxes de adultos de 1 dia. No tórax de adultos, o único CG que apresenta um padrão de expressão similar ao padrão de expressão de lacZ constitui o CG12493. Em conjunto, nós concluímos que o MCR TT promove um padrão dinâmico de expressão durante o desenvolvimento. Além disso, com base nos resultados de RT-qPCR, nós sugerimos que o MCR TT regula a expressão do RNAm do CG32239 no sistema traqueal durante a transição larva-prépupa e também a expressão do RNAm do CG12493 no tórax de adultos de 3 e 5 dias de idade. Além de estender a caracterização funcional de um novo MCR, nossos resultados também contribuem com novas informações acerca dos padrões de expressão no desenvolvimento de três CGs de D. melanogaster. / Previous functional studies identified in the DNA puff BhC4-1 promoter region a 67 bp (- 253/-187) cis-regulatory module (CRM) that drives reporter gene expression in the ring gland of D. melanogaster. A bioinformatics analysis identified 67 Drosophila melanogaster sequences that are similar to sequences contained in the ring gland CRM. One of the identified sequences resides in a 657 bp genomic fragment located about 2500 bp upstream CG13711, about 400 bp upstream CG12493, in a genomic region that constitutes one of the introns of CG32239 (Gef64C). The preliminary characterization of three transgenic lines transformed with a 657 bp-lacZ construct revealed reporter gene expression in the larval/prepupal tracheal system and in adult thorax. Based on the pattern of expression driven by this CRM we named it Trachea-Thorax (TT). The main goal of this work was to extend the molecular characterization of the lines of the TT-lacZ series. Initially ?-galactosidase histochemical assays were performed in embryos, first, second and third instar larvae, 0h, 1h and 2h prepupae, 24 h pupae and 1, 3 and 5 days old adults. Reporter gene expression is initially detected during the third larval instar in the tracheal system and continues to be detected in this tissue at 0 h, 1h and 2 h prepupa and, 24 h pupa. During the adult stage, reporter gene expression is verified in the dorsal longitudinal muscles of 3 and 5 days old adults. Since the TT CRM lies in an intergenic region and the available information about the nearby CGs is still scarce it was not possible to infer which of the CGs is regulated by the TT CRM. In this context, the mRNA pattern of expression of the lacZ reporter gene and of CG13711, CG12493 and CG32239 was investigated in the tracheal system of both larvae and prepupae and in adult thoraxes of one of the transgenic lines of the TT-lacZ series using RTqPCR. The lacZ mRNA expression levels increase about 3 times in 0 h prepupae when compared to the lacZ mRNA expression levels present in the tracheal system of third instar larvae. A similar pattern of expression was observed for both CG32239 and CG13711. In three and five days old adult thoraxes lacZ mRNA expression levels increase about 37 times and 11 times, respectively, when compared to lacZ mRNA expression levels present in one day old thoraxes. In the adult thorax, the only CG that presents a similar pattern of expression constitutes CG12493. Overall, we conclude that the TT CRM drives a dynamic pattern of ii expression throughout development. Additionally, based on RT-qPCR results, we suggest that the TT CRM regulates the expression of CG32239 mRNA in the tracheal system during the larvae to prepupae transition, as well as the expression of CG12493 mRNA in the thorax of 3 and 5 days old adults. Besides extending the functional characterization of a novel CRM our results also contribute new information about the developmental patterns of expression of three Drosophila melanogaster CGs.

Made available in DSpace on 2017-07-25T19:30:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Paula Pasqualini.pdf: 1305407 bytes, checksum: e0a308695b165383f1cd7da356df3b66 (MD5) Previous issue date: 2013-12-06 / In recent years, the cultivation of blueberry (Vaccinium ashei Reade) has attracted the attention of producers, traders and consumers. However, its expansion is limited by unavailability of appropriate varieties to the different Brazilian regions, difficulties in their propagation and shortage of seedlings of quality. Understanding the processes involved in seed germination is important when seeking to obtain genetic variability and new cultivars adapted to different edaphoclimatic conditions. Yet, the micropropagation is an alternative for obtaining a large number of healthy plants, in a short time, through clonal propagation. In this context, aiming to support the crop establishment in the Campos Gerais region, it was sought in this paper to study the seminiferous propagation and micropropagation of the blueberry, being its objectives to evaluate the germination behavior and viability levels of Vaccinium ashei Reade seeds, Briteblue and Climax cultivars, by means of germination and tetrazolium tests; elaboration of protocol for establishing blueberry in vitro (Vaccinium ashei Reade) cv. Brightwell, in WPM medium, in the presence of 2iP and evaluate the influence of silver thiosulfate in this initial phase of tissue culture. In relation to the seminiferous propagation, it was observed through the germination test that blueberry seeds of cultivars Briteblue and Climax submitted to treatments derived from the combination of variables - exposure or not to KOH, substrates (SP and MS/2) and temperatures (10⁰C and 25⁰C) - requires over 46 days for the issuing of the first normal seedling, and after 6 months from the beginning of the test the germination percentage does not exceed 40%. Otherwise, the tetrazolium test, based on staining of tissues, allows the establishment of different levels of viability for seeds of cvs Briteblue and Climax. In the micropropagation of blueberry cv. Brightwell, the use of medium culture WPM, added of 5 mg.L-1 2iP, in the in vitro establishment stage from nodal segments allows to obtain primordial leaves and shoots after 30 days of cultivation, whereas the use of 45 mM of STS at this stage supports the development of vegetative buds and leaves. / Nos últimos anos, o cultivo do mirtileiro (Vaccinium ashei Reade) tem despertado a atenção de produtores, comerciantes e consumidores. No entanto, a sua expansão é limitada em razão da indisponibilidade de variedades adequadas às diferentes regiões brasileiras, dificuldades de propagação e escassez de mudas de qualidade. Entender os processos envolvidos na germinação das sementes é importante quando se busca obter variabilidade genética e novas cultivares adaptadas a condições edafoclimáticas distintas. Já a micropropagação é uma alternativa para a obtenção de um grande número de mudas sadias, em curto espaço de tempo, através de propagação clonal. Nesse contexto, visando favorecer o estabelecimento da cultura na região dos Campos Gerais, buscou-se neste trabalho estudar a propagação seminífera e a micropropagação do mirtileiro, sendo seus objetivos determinar o comportamento germinativo e níveis de viabilidade de sementes de Vaccinium ashei Reade cultivares Briteblue e Climax por meio dos testes de germinação e de tetrazólio; elaborar protocolo para estabelecimento in vitro de mirtileiro (Vaccinium ashei Reade) cv. Brightwell, em meio WPM, na presença de 2iP e avaliar a influência do tiossulfato de prata nesta fase inicial da cultura de tecidos. Em relação à propagação seminífera, observou-se através do teste de germinação que sementes de mirtilo das cultivares Briteblue e Climax submetidas a tratamentos oriundos da combinação das variáveis - exposição ou não ao KOH, substratos (SP e MS/2) e temperaturas (10⁰C e 25⁰C) - demandam acima de 46 dias para a emissão da primeira plântula normal e, após 6 meses do início do teste, a porcentagem de germinação não ultrapassa 40%. Já o teste de tetrazólio, baseado na coloração dos tecidos, permite o estabelecimento de diferentes níveis de viabilidade para sementes das cvs Briteblue e Climax. Na micropropagação do mirtileiro cv. Brightwell, o uso do meio de cultura WPM, acrescido de 5 mg.L-1 de 2iP, no estágio de estabelecimento in vitro a partir de segmentos nodais, permite a obtenção de primórdios foliares e brotações após 30 dias de cultivo, sendo que o uso de 45 μM de STS nesta fase favorece o desenvolvimento das gemas vegetativas e folhas.

Made available in DSpace on 2016-04-25T18:39:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Adilson Afonso da Silva.pdf: 668832 bytes, checksum: c95aa26ee4bce1272567ca87bd9aa72e (MD5) Previous issue date: 2013-08-01 / The auditor has is important for the capital market because it´s increasing the quantity of companies that are looking for such market as an alternative and way to raise funds to invest in their operations. This market offers many options for raising funds and in most of these operations the company is required to have its financial statements audited. Depending on the operation performed by the company or the transaction chosen by the company, such company needs to follow the specific regulation issued by a regulatory agency responsible for such sector or market. This agency is responsible for both, for issuing regulations related to the industry and for rmonitoring the companies operations in a supervision way. In addition to requiring the audited financial statements, the regulators often require additional work of auditors in order to get additional credibility of the information provided by these companies. Some procedures required by the regulators are common or similar and others are specific. This difference in requirements makes the auditor seeks a constant update and an extensive knowledge of the markets where it operates. This growing capital market has required auditors' greater involvement and participation by giving more credibility to financial and accounting data disclosed by companies. The objective of this dissertation is to demonstrate the main requirements issued by the regulators, specifically BACEN and CVM, related to the auditor and specifically related to auditing the financial statements. The purpose is also to focus on capital markets. We have conducted a search of the major normatives issued by such regulators of the market and compared them to identify convergences and divergences. The focus of this research was to comparatively describe the work performed by the auditor on accounting audit based on the capital market. The main operations were considered: i) initial public offering of shares (open capital) or (Initial Public Offering - IPO), ii) the issuance of bonds in the local market and abroad (bonds, debentures and other) and obtaining loans and iii) the process of mergers and acquisitions and privatizations (where the auditor's process support and support analyzing accounting information before completing the acquisition transactions "due diligence"). As a result we found that specifically in accounting audit there is no relevant differences in the regulatory requirements of the Central Bank and the CVM, regulators considered for such research. Both even issuing their own rules, make reference to the same audit requirements defined by the CFC and Ibracon. We found that each agency defines different periodicities for auditing and specific accounting standards, as the case of the Central Bank, but all have the same goal and the requirements are very close. Related to operations of the capital markets that are not regulated as mergers and acquisitions, we fond that the work is set by client or contractor and the scope may vary and even the format of each report case by case / O auditor tem um papel importante no mercado de capitais por que cada vez mais as empresas buscam esse mercado como forma de captar recursos para investir nas suas operações. Esse mercado oferece várias opções de captação de recursos e na maioria dessas operações a empresa precisa apresentar as suas demonstrações financeiras auditadas. Dependendo da operação realizada pela empresa ou da forma escolhida para efetuar a captação de recursos a mesma precisa seguir regulamentações específicas do órgão regulador responsável pelo respectivo setor ou mercado. Esses órgãos são responsáveis tanto pela emissão das normas que regulam o setor e as empresas que nele operam quanto pela fiscalização das mesmas. Além das demonstrações financeiras auditadas esses reguladores muitas vezes requerem trabalhos adicionais dos auditores para confirmar e dar credibilidade nas informações apresentadas por essas empresas. Quanto aos procedimentos requeridos pelos reguladores, alguns são comuns ou semelhantes e outros são específicos. Essa diferença de requerimentos faz com que o auditor busque uma constante atualização e um amplo conhecimento dos mercados onde ele atua. Esse crescente mercado de capitais tem requerido dos auditores um maior envolvimento e participação dando maior credibilidade aos dados financeiros e contábeis divulgados pelas empresas. O objetivo dessa dissertação é demonstrar o papel do auditor e os diferentes requerimentos dos reguladores para o mesmo com foco no mercado de capitais. Efetuamos uma pesquisa dos principais normativos publicados pelos principais reguladores desse mercado e os comparamos para identificar as convergências e divergências. O foco dessa pesquisa foi descrever comparativamente o papel executado pelo auditor na auditoria contábil tende como base o mercado de capitais, considerando como os principais órgãos reguladores (CVM, Bacen e outros). As principais operações consideradas foram: i) oferta pública inicial de ações (abertura de capitais) ou (Initial Public Offering IPO); ii) emissão de títulos privados no mercado local e no exterior (bonds, debêntures e outros) e obtenção de empréstimos; e iii) no processo de fusões e aquisições e privatizações (processo onde o auditor da suporte e apoio analisando as informações contábeis antes de concluir as transações de aquisição due diligence ). Como resultado foi possível verificar que especificamente na auditoria contábil não há diferenças relevantes nos requerimentos regulatórios do BACEN e da CVM, órgãos utilizados para a pesquisa. Ambos, mesmo emitindo suas próprias normas, fazem referencia aos mesmos requerimentos de auditoria definidos pelo CFC e Ibracon. Verificamos que cada órgão define periodicidades de auditoria diferentes e até padrões contábeis específicos, como o caso do BACEN mas, todos tem um mesmo objetivo e requerimentos muito próximos. Quanto as operações do mercado de capitais que não são reguladas como as fusões e aquisições, constatamos que o trabalho é definido com o solicitante ou contratante podendo variar o escopo e formato de caso para caso

Orientador: Gilberto Pechoto de Melo / Resumo: As metodologias de monitoramento da integridade estrutural baseadas em observadores de estado, em sua grande maioria, utilizam o resíduo obtido a partir da diferença entre a medida e a estimativa de dada resposta dinâmica do sistema para o processo de detecção de danos. Contudo, em determinadas situações, tem-se interesse em realizar o monitoramento através de certa resposta dinâmica que não pode ser medida diretamente. Desta forma, a principal contribuição deste trabalho é propor uma metodologia de detecção de danos para sistemas mecânicos, cujo resíduo é obtido a partir da diferença entre as estimativas do comportamento dinâmico de determinada região do sistema. Estas estimativas são geradas por dois observadores de estado de ordem plena em paralelo, ambos projetados a partir do modelo físico-matemático do sistema em monitoramento sem danos, cujos os ganhos ótimos são determinados pelo método LQR, do inglês Linear Quadratic Regulator. A diferença entre os observadores consiste em serem baseados em conjuntos de medidas distintos. Simulações computacionais são apresentadas para demonstrar a aplicação desta metodologia, de maneira que são discutidas as vantagens e desvantagens em monitorar o sistema utilizando diferentes tipos de força de excitação. Os resultados obtidos são satisfatórios para a detecção dos tipos de dano considerados neste trabalho. / Abstract: Structural health monitoring methodologies based on state observers, for the most part, use the residual obtained from the di erence between the measurement and the estimate of the given dynamic response of the system to the damage detection process. However, in certain situations, it is interesting to carry out the monitoring through a certain dynamic response that can not be measured directly. In this way, the main contribution of this work is to propose a methodology of damage detection for mechanical systems, whose residue is obtained from the di erence between the estimates of the dynamic behavior of a certain region of the system. These estimates are generated by two parallel full-order state observers, both designed from the physical-mathematical model of the monitoring system without damages, whose optimal gains are determined by the LQR (Linear Quadratic Regulator) method. The di erence between observers is that they are based on di erent sets of measures. Computational simulations are presented to demonstrate the application of this methodology, so that the advantages and disadvantages of monitoring the system using di erent types of excitation force are discussed. The results obtained are satisfactory for the detection of the types of damage considered in this work. / Mestre

Os trabalhos foram conduzidos no Laboratório de Fisiologia Pós-Colheita do Departamento de Ciências Biológicas da ESALQ-USP, no período de agosto de 2001 a agosto de 2002. Verificaram-se os efeitos isolados do regulador vegetal ácido giberélico, 1-metilciclopropeno e aminoetoxivinilglicina, e também nas combinações de 1-MCP com GA3 e AVG com GA3, em pós-colheita de tangor ‘Murcote’ e de lima ácida ‘Tahiti’. A escolha das variedades ocorreu em função do seu potencial, tanto para o mercado interno, quanto para a exportação de frutas frescas. As concentrações utilizadas foram: 20 mg L -1 de GA3; 0,1, 0,5 e 1,0 mL L -1 de 1-MCP; 10, 50 e 100 mg L -1 de AVG e as combinações de 0,5 mL L -1 de 1-MCP com 20 mg L -1 de GA3 e 50 mg L -1 de AVG com 20 mg L -1 de GA3, além do controle. Aplicou-se o 1-MCP através da exposição dos frutos ao gás durante 12 h em caixas herméticas a 20 o C. O AVG e o GA3 foram aplicados submergindo os frutos em solução aquosa contendo as devidas concentrações, durante um minuto. Nas combinações, o GA3 foi aplicado após os tratamentos com 1-MCP ou AVG. O delineamento experimental adotado foi inteiramente casualizado, em esquema fatorial para verificar a ação do 1-MCP e do AVG em tangor ‘Murcote’e na lima ‘Tahiti’. Para as combinações de 1-MCP+GA3 e do AVG+GA3, utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado com parcelas subdivididas no tempo. Determinou-se a evolução da coloração na casca (L, C* e h o ), os níveis de sólidos solúveis totais ( o Brix), acidez titulável total (%), vitamina C, perda de massa (%), quantidade de suco (%) e taxa respiratória dos frutos sob refrigeração e após 3 dias a 25 o C. Os resultados foram submetidos à análise de regressão. O 1-MCP não tem efeito sobre a coloração de casca, em aplicações tardias em tangor ‘Murcote’. A concentração de 0,5 mL L -1 foi suficiente para reduzir a taxa respiratória e o consumo de vitamina C. As características físico-químicas mantiveram-se adequadas para o consumo durante 45 dias de armazenamento refrigerado. O AVG aplicado em pós-colheita realçou a intensidade da cor na casca de tangor ‘Murcote’, diminuiu o consumo de sólidos solúveis totais, a taxa respiratória e não afetou a acidez titulável. As combinações de 1-MCP e AVG com GA3 não tiveram efeitos na coloração da casca do tangor ‘Murcote’, após estágio avançado de pigmentação na casca. As combinações também não afetaram o nível de acidez titulável, vitamina C, a perda de massa e a taxa respiratória do tangor ‘Murcote’. Com relação à lima ácida ‘Tahiti’, o tratamento com 1-MCP a 0,5 ou 1,0 mL L -1 atrasou mudanças na coloração da casca (croma e ângulo de cor), promoveu maior teor de sólidos solúveis totais e diminuiu a amplitude de variação do ratio. O AVG não impediu a mudança na cor da casca, porém diminuiu o consumo de SST e de ATT; não afetou a taxa respiratória e o nível de vitamina C. A combinação do 1-MCP+GA3 retardou a evolução na mudança da cor de casca durante 60 dias. O nível de vitamina C manteve-se elevado. Não houve alterações na taxa respiratória e na quantidade de suco nos frutos da lima ácida ‘Tahiti’. / The experiments were conducted from August 2001 to August 2002 in the post-harvest Physiology Laboratory, Department of Biology, ESALQ-USP. It was checked the isolated effect of gibberellic acid, 1-methylcyclopropene and aminoethoxyvinilglycine, and also the combinations of 1-MCP with GA3 and AVG with GA3, on ‘Murcott’ tangor and ‘Tahiti’ lime post-harvest. The cultivars were chosen because of their potential, both for the internal market as for fresh fruit exportation. The following concentrations were applied: GA3 at 20 mg L -1 ; 1-MCP at 0.1, 0.5 and 1.0 mL L -1 ; AVG at 10, 50 and 100 mg L -1 and the combinations of 1-MCP at 0.5 mL L -1 with GA3 at 20 mg L -1 and AVG at 50 mg L -1 with GA3 at 20 mg L -1 , and the control. The fruits were exposed to 1-MCP gas during 12 h in hermetic boxes at 20 o C. AVG and GA3 were applied dipping the fruits, for a minute, in solutions with the mentioned concentrations. In combinations, GA3 was applied after the treatments with 1-MCP or AVG. The experimental design was totally randomized factorial to check the action of 1-MCP and AVG on ‘Murcott’ tangor and ‘Tahiti’ lime. For the combinations of 1- MCP+GA3 and AVG+GA3, totally randomized design was used with time subdivided parcels. It was determined the evolution in the peel color (L, C* e h o ), the levels of total soluble solids ( o Brix), total titriable acidity (%), vitamin C, mass loss (%), juice content (%) and respiratory rate of the fruits under cold storage and after 3 days at 25 o C. The results were submitted to regression analysis. 1-MCP doesn’t have any effect on the peel color, in late application, on tangor ‘Murcott’. The 1-MCP at 0.5 mL L -1 was enough to reduce the respiratory rate and the waste of C vitamin. The physic-chemical characteristics were kept suitable for the consumption during 45 days of cold storage. The AVG, in post-harvest application, enhanced the peel color intensity of ‘Murcott’ tangor, decreased the waste of total soluble solids, the respiratory rate and didn’t affect the total titrable acidity. The combinations of 1-MCP and AVG with GA3 didn’t have any effect on the peel color of ‘Murcott’ tangor, after an advanced stage of peel coloration. The combinations didn’t affect the levels of total titrable acidity, C vitamin, mass loss and respiratory rate of ‘Murcott’ tangor. In relation to ‘Tahiti’ lime, the treatment with 1-MCP at 0.5 or 1.0 mL L -1 delayed changes in the peel color (color croma and angle), promoted higher concentration of total soluble solids and decreased the range of ratio variation. The AVG didn’t prevent peel color change, however it decreased the waste of TSS and of TTA; it didn’t affect the respiratory rate and the level of C vitamin. The combination of 1-MCP+GA3 delayed the evolution in the change of peel color during 60 days. The level of C vitamin was kept high. There weren’t changes in the respiratory rate and in juice content ‘Tahiti’ lime.

O gene fator regulador de interferon 4 (IRF4), localizado na região cromossômica 6p25- p23, é um membro da família de fatores reguladores de interferon (IRF), um grupo de fatores de transcrição de ligação ao DNA, sendo IRF4 primariamente associado ao desenvolvimento e resposta imune e expresso exclusivamente em células do sistema imunológico e em linhagens melanocíticas. Embora muitos estudos tenham associado IRF4 a diversas condições, como melanoma e leucemia linfocítica crônica, um recente Genome-Wide Association Study (GWAS) identificou que alelos do SNP rs12203592 (intron 4) estão associados com variação fenotípica em relação à presença de sardas, pigmentação da pele, cabelos e olhos. Estudos funcionais realizados em células melanocíticas humanas e de camundongos revelaram que este SNP está diretamente envolvido na regulação da expressão de IRF4, sugerindo uma clara função na pigmentação do melanócito. Apesar destes achados, a diversidade das regiões regulatórias e codificadora de IRF4 não foi até o momento analisada em populações miscigenadas. A fim de avaliar se outros sítios de variação ao longo do gene IRF4 podem estar associados à pigmentação humana, as regiões regulatórias (promotora e 3´UTR) e codificadora (9 exons e regiões intrônicas flanqueadoras, incluindo o SNP rs12203592) foram analisadas por sequenciamento de nova geração em uma amostra miscigenada da população brasileira. A amostra populacional foi composta por 228 indivíduos não aparentados de Ribeirão Preto, estado de São Paulo, Brasil, os quais foram estratificados de acordo com a pigmentação da pele (clara, média e escura), olhos (azul, verde, castanho-claros e castanho-escuros), cabelo (ruivo, loiro-claro, loiroescuro, castanho-claro, castanho-escuro e preto) bem como em relação à presença de sardas e intensidade de cabelos grisalhos. Bibliotecas de DNA foram preparadas utilizando o Sistema de Enriquecimento de Alvo Haloplex (Agilent Technologies) e sequenciadas na plataforma MiSeq (Illumina). Os pacotes de software CutAdapt, BWA and GATK foram utilizados, respectivamente, para trimagem das sequências dos adaptadores, alinhamento e identificação de variantes. Haplótipos e alelos não identificados foram inferidos pelo método PHASE, embora a fase conhecida entre os sítios de variação (obtida pelo GATK) tenha sido levada em consideração. Um total de 105 sítios de variação foram identificados. Apenas dois deles apresentaram frequências genotípicas que não atendem ao esperado pelo equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW). Dezoito destes SNPs apresentaram forte associação a pelo menos uma característica de pigmentação. Entretanto, se a conservadora correção de Bonferroni para múltiplos testes for levada em consideração, apenas duas associações, ambas envolvendo o SNP rs12203592, permanecem significativas: a associação do alelo T com pele clara e olhos azuis. Este resultado está de acordo com estudos prévios, que reportam que o alelo rs12203592*T leva a uma menor ativação de IRF4 e a uma expressão reduzida da tirosinase, resultando em sensibilidade ao sol e olhos azuis. Foi inferido um total de 101 haplótipos, estando a distribuição destes de acordo com o esperado pelo EHW. Quando os haplótipos foram divididos em haplótipos da promotora, codificadora e 3´UTR foram observadas, respectivamente, 17, 29 e 37 diferentes combinações haplotípicas. Várias associações foram identificadas, particularmente envolvendo o haplótipo mais frequente da promotora, os dois haplótipos mais frequentes da codificadora e o haplótipo mais frequente da 3´UTR, todos associados com pele clara, olhos azuis, cabelos castanhos e cabelos grisalhos. Estes resultados sugerem que outras variantes além de rs12203592, quando consideradas em um contexto haplotípico, são associadas com a pigmentação humana. / The Interferon Regulatory Factor 4 (IRF4) gene, located at chromosomal region 6p25- p23, is a member of the interferon regulatory factor (IRF) family, a group of DNAbinding transcription factors, with the IRF4 primarily associated with immune system development and response and expressed exclusively in immune system cells and melanocytic lineages. Although many studies have shown that IRF4 is associated with many human conditions, such as melanoma and chronic lymphocytic leukemia, a recent Genome-Wide Association Study (GWAS) identified that alleles from the SNP rs12203592 (intron 4) is also associated with phenotypic variation regarding presence of freckles, hair, eye and skin pigmentation. Functional studies in human and mice melanin-containing cells revealed that such SNP is directly involved in the regulation of IRF4 expression, suggesting a clear role in melanocyte pigmentation. In spite of these findings, the regulatory and coding IRF4 diversities in admixed populations have not been evaluated so far. In order to verify if other variation sites spread across the IRF4 gene may be associated with human pigmentation, the regulatory (promoter and 3\'UTR regions) and coding (9 exons and flanking intronic regions, including the SNP rs12203592) regions were analyzed by next-generation sequencing procedures in a Brazilian admixed population sample. The population sample was composed of 228 unrelated individuals from the Ribeirão Preto area, São Paulo State, Brazil, which were stratified according to eye (blue, green, hazel, light-brown, and dark-brown), hair (red, blond, dark-blond, light-brown, dark-brown and black) and skin (light, intermediate and dark) pigmentation, as well as regarding the presence of freckles and intensity of hair greying. DNA libraries were prepared using the Haloplex Target Enrichment System (Agilent Technologies) and sequenced at the MiSeq platform (Illumina). CutAdapt, BWA and GATK software packages were used for trimming adaptor sequences, alignment and genotype calling, respectively. Missing alleles and haplotypes were inferred by using the PHASE method, although the known phase between variable sites (obtained by GATK) was taken into account. A total of 105 variation sites were identified. Only two of them presented genotype frequencies that did not fit Hardy- Weinberg equilibrium (HWE) expectations. Eighteen of these SNPs presented strong association with at least one pigmentation feature. However, if the conservative Bonferroni correction for multiple tests is taken into account, only two associations, both of them involving the rs12203592 SNP, remain significant: allele T associated with light skin and blue eyes. This result is in agreement with previous reports that the rs12203592*T allele leads to reduced IRF4 activation and reduced tyrosinase expression, leading to sun sensitivity and blue eyes. A total of 101 different haplotypes were inferred, and haplotype distribution was in agreement to HWE expectations. When haplotypes were subdivided in promoter, coding and 3\'UTR haplotypes, 17, 29 and 37 different haplotypes were observed, respectively. Various associations were identified, particularly involving the most frequent promoter haplotype, the two most frequent coding (only one of them with allele rs12203592*T), and the most frequent 3\'UTR, all of them with light skin, blue eyes, brown hair and hair greying. These results suggest that other variation sites besides rs12203592, when considered in a haplotypic background, are associated with human pigmentation.

Submitted by Samira Prince (prince@ufpa.br) on 2012-06-05T13:42:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_AnaliseReguladorVelocidade.pdf: 1272295 bytes, checksum: d0238e9bc770122f02aa785945e7aeac (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Samira Prince(prince@ufpa.br) on 2012-06-05T13:43:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_AnaliseReguladorVelocidade.pdf: 1272295 bytes, checksum: d0238e9bc770122f02aa785945e7aeac (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-05T13:43:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_AnaliseReguladorVelocidade.pdf: 1272295 bytes, checksum: d0238e9bc770122f02aa785945e7aeac (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2011 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Analisa uma proposta de um controlador digital para o regulador de velocidade da Usina Hidroelétrica de Curuá-Una, utilizando duas estratégias de projeto, a estratégia indireta com o projeto do controlador sendo feito no plano contínuo e depois discretizado e a estratégia direta, em que o controlador é projetado inteiramente no plano discreto. O conhecimento gerado no simulador é de grande importância, pois é uma das grandes ferramentas para avaliar o comportamento dos controladores digitais propostos, em ambiente seguro. O estudo dos controladores também permite uma substituição de equipamentos antigos, com produção descontinuada, por equipamentos novos que permitem a confecção de controladores modernos, digitais e inteligentes, que proporcionam uma substituição de técnicas antigas de controle por estratégias avançadas de controle, maximizando o rendimento do sistema em condições adversas de operação. O trabalho levanta as diferenças, vantagens e desvantagens de cada controlador, com o objetivo de auxiliar na escolha do controlador mais adequado para projetos de controladores avançados: tipo um controle adaptativo, controle fuzzy ou controle neural. As dificuldades de projeto e os resultados das simulações foram os principais indicadores na avaliações dos dois RV digitais projetados. De uma forma geral o RV digital direto apresentou melhor desempenho, estabilidade e menor esforço computacional, entretanto, o RV digital indireto mostrou desempenho similar, menor degradação devido às não linearidades e ao menor esforço de projeto. / This paper makes an analyze of a digital controller for the speed control in a hydroelectric factory of Curuá-Una. It’s used two design strategies, one that uses the indirect approach where the controller design is still done on the continues plane and then discretized and direct strategy , where the controller is designed entirely in the discrete plane. The knowledge generated using simulated tests is of great importance because it is one of the major tools to evaluate the performance of digital controllers in a secure environment. The study also contribute with the replacement of old equipment ( with a discontinued production) for digitalized equipment that allow the implementation of modern controllers, this way providing the replacement of classic continues controllers for advanced modern digital controllers, maximizing the efficiency of the system under adverse operation conditions. The work raises the differences, advantages and disadvantages of each controller, in order to assist in choosing the most suitable driver for the design of advanced controllers: adaptive control, fuzzy control or neural control. The difficulties of design and simulation results were the main indicators in assessments of the two digital speed regulator (SR) projected. In overall the SR Direct Digital had the best performance, stability and less effort, however, SR indirect digital performance showed similar, less degradation due to nonlinearities and less design effort.

Esta dissertação de mestrado aborda o problema de regulação robusta recursiva para sistemas lineares discretos sujeitos a incertezas paramétricas. Um novo funcional quadrático, baseado na combinação de função penalidade e função custo do tipo jogos, é projetado para lidar com este problema. Uma característica interessante desta abordagem é que a recursividade pode ser realizada sem a necessidade do ajuste de parâmetros auxiliares. Bastante útil para aplicações online. A solução proposta é baseada numa equação recursiva de Riccati. Também, a convergência e a estabilidade do regulador para o sistema linear incerto invariante no tempo são garantidas. / This dissertation deals with robust recursive regulators for discrete-time systems subject to parametric uncertainties. A new quadratic functional based on the combination of penalty functions and game theory is proposed to solve this class of problems. An important issue of this approach is that the recursiveness can be performed without the need of adjusting auxiliary parameters. It is useful for online applications. The solution proposed is based on Riccati equation which guarantees the convergence and stability of the time-invariant system.

Submitted by Maria Beatriz Vieira (mbeatriz.vieira@gmail.com) on 2017-03-30T15:57:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) dissertacão_juliano_gaviraghi.pdf: 249908 bytes, checksum: ee78203a834f948cd74c62765ca4bb2a (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-04-05T19:10:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 dissertacão_juliano_gaviraghi.pdf: 249908 bytes, checksum: ee78203a834f948cd74c62765ca4bb2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-04-05T19:11:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 dissertacão_juliano_gaviraghi.pdf: 249908 bytes, checksum: ee78203a834f948cd74c62765ca4bb2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-05T19:12:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 dissertacão_juliano_gaviraghi.pdf: 249908 bytes, checksum: ee78203a834f948cd74c62765ca4bb2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-05-18 / Sem bolsa / O trigo (Triticum aestivum L.) é uma cultura difundida mundialmente, seja na forma de grão ou de seus inúmeros derivados obtidos pela sua industrialização. A adubação com o nitrogênio é fundamental para o aumento da produtividade. Portanto, na indicação técnica, a dose de Itrogenio a ser utilizada tem por base a expectativa de rendimento da cultura, teor de matéria orgânica do solo e da cultura antecessora. Aliado ao nitrogênio podem ser utilizados redutores de crescimento diminuindo as chances de acamamento e aumentando ainda mais a produtividade e a qualidade de grãos. Dessa maneira, o objetivo do trabalho foi avaliar o desempenho de sementes de cultivares de trigo produzidas sob diferentes doses de N-fertilizante e aplicação concomitante de redutor de crescimento. O estudo foi desenvolvido em 2013 na área na granja Cerofeju no município de Redentora-RS. O experimento foi delineado em blocos casualizados com três repetições, constituindose em quinze cultivares de trigo predominantes na região e de diferentes padrões tecnológicos. Foi utilizada a uréia como fonte de N em cobertura com doses de 100, 200 e 300 kg ha-2, também utilizou-se o redutor de crescimento Moddus® na dose e época recomendada pelo fabricante. O aumento nas doses de uréia proporcionou maiores produtividades e uma qualidade fisiológica superior das sementes de trigo. / Wheat (Triticum aestivum L.) is a widespread crop worldwide, whether in the form of grain or its numerous derivatives obtained by industrialization. The fertilization with nitrogen is critical to increasing productivity. Therefore, in the technical recommendations, the dose of nitrogen to be used is based on the expected crop yield, organic matter content of soil and the previous crop. Growth reducers can be coupled with nitrogen decreasing the chances of lodging and further increasing the productivity and quality of grain. Thus, the aim of this study was to evaluate the seed performance of wheat cultivars produced under different N fertilizer doses and concomitant application of growth reducers. The study was performed in 2013 at Cerofeju farm in the municipality of Redentora - RS. The experiment was designed in randomized blocks with three replicates, composed by fifteen wheat cultivars prevalent in the region and of different technological classes. Urea was used as nitrogen source at doses of 100, 200 and 300 kg ha-1 and the growth reducer Moddus® at recommended dose and period. The increase in urea doses led to higher yields and higher physiological quality of wheat seeds.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-07T17:17:10Z No. of bitstreams: 1 Deivid Almeida da Costa.pdf: 3034904 bytes, checksum: a3834e78a3b01627180c99a9fddc24a9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T17:17:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Deivid Almeida da Costa.pdf: 3034904 bytes, checksum: a3834e78a3b01627180c99a9fddc24a9 (MD5) Previous issue date: 2007-02-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The somatic embryogenesis is a technique of plant tissue culture with several application potentials, as in the clonal propagation of plants, in the regeneration of transformed cells and in the basic studies of the molecular, biochemical and morphologic events that happen duringthe embryogenesis. In spite of the several works reporting somatic embryogenesis in cotton, several problems still persist in the regeneration through embryogenesis. The most of the works is with the line cocker, due to the fact of the cotton to be recalcitrant for the somatic embryogenesis. This way, the present study was conceived with the intention of analyzing the morphogenic response of the cotton to several growth regulators and stressful agents during the induction of embryogenic callus and somatic embryos, correlating the callus production with the antioxidant enzymes expression. For induction of the embryogenic callus, hypocotyl of germinated cotton (BRS – 187 – 8H) surface-sterilized seeds was used. The embriogenic callus induction medium (MICE) consisted of the MSB medium with different combinations and concentrations of 2,4-D, Kinetin, 2iP and Picloram. For conversion of embryogenic callus, it was used the embryo induction medium (MIE) that consistes of MSB medium and MSB supplemented with zeatin; L-glutamine, asparagine; espermine, espermidine or different concentrations of NH4NO3 and KNO3. The results show that among the MICE tested, the medium with 0,1 mg L-1 2,4-D and 0,3 mg L-1 Kinetin (MSB1 medium) and the MCIM medium showed the largest average in the production of embryogenic callus by explant. Explants in the MIE-1 presented the best proliferation of the embryogenic callus. However, the formation of globular and embryogenic structures was only visualized in the embryogenic callus formed in MSB1 medium, which were transferred for MSB medium and subcultivated in MIE-4 medium. It was concluded that different growth regulators can induce the formation of embryogenic callus in cotton cultivar BRS – 187 – 8H and the suppression of the growth regulators favors the appearance of globular and pre-embryogenic structures. In the experiments of the influence of the stress in cotton callus formation and the isozymic antioxidant system expression, it was used for induction of embryogenic callus, thecombination of MSB and MSB1 medium with two concentrations of FeEDTA: the concentration standard of the MS medium; and a concentration five times larger. It wasestablished three regimes of luminous intensity: darkness; 3,4 Klx and 6,0 Klx. Embryogenic callus were obtained on the MSB1 (3,4 Klx), MSB1 (6,0 Klx) and MSB1+FeEDTA (5X) medium. The electrophoretic system of the catalase and peroxidase showed variation in the intensity of the bands. The results show that the embryogenic callus formation dependent of the action of growth regulators and of the light presence, and the isozymic standards of catalase and peroxidase present similar pattern and they are related with the embryogenic aspect of the calluses. / A embriogênese somática é uma técnica de cultura de tecidos vegetais com diversos potenciais de aplicação, como na propagação clonal de plantas, na regeneração de células transformadas geneticamente e nos estudos básicos dos eventos moleculares e bioquímicos e morfológicos que ocorrem durante a embriogênese. Apesar dos diversos trabalhos relatando embriogênese somática em algodão, vários problemas ainda persistem na regeneração via embriogênese e a maioria dos trabalhos é com a linha cocker, devido a recalcitrância do algodão a embriogênese somática. Deste modo, o presente estudo foi concebido com o intuito de analisar a resposta morfogênica do algodão a vários reguladores de crescimento e agentes estressantes durante a indução de calos embriogênicos e embriões somáticos, correlacionando a calogênese com a expressão de isoformas do sistema antioxidativo. Para indução dos calos embriogênicos utilizou-se sementes desinfestadas da cultivar de algodão BRS – 187 – 8H. Os meios de indução de calos embriogênicos (MICE) utilizados consistiram no meio MSB acrescido de varias combinações e concentrações dos reguladores de crescimento 2,4-D; Cinetina, Picloram e 2-iP. Já para conversão dos calos embriogênicos em embriões, utilizouse o meio de indução de embiões (MIE) que consiste no meio MSB e MSB acrescido dezeatina, ou diferentes concentrações de NH4NO3 e KNO3, ou acrescido de L glutamina; asparagina; espermina; espermidina. Os dados obtidos mostram que entre os MICE testados, o meio contendo 0,1 mg L-1 de 2,4-D e 0,3 mg L-1 de cinetina (meio MSB1) e o meio MCIM mostraram as maiores médias na produção de calos embriogênicos por explante. Entre os MIE, o MIE-1 apresentou melhor proliferação dos calos embriogênicos. Contudo, a formação de estruturas globulares e embriogênicas só foi visualizada nos calos embriogênicos formados em meio MSB1 e transferidos para meio MSB e subcultivados em meio MIE-4. Concluiu-se então que diferentes reguladores podem induzir a formação de calos embriogênicos na cultivar BRS – 187 – 8H, e a supressão dos reguladores de crescimento favorece o surgimento de estruturas globulares e pré-embriogênicas. Nos experimentos da influência do estresse na calogênese e a expressão de isoenzimas do sistema antioxidativo, utilizou-se para a induçãode calos embriogênicos a combinação do meio MSB e MSB1 com duas concentrações de FeEDTA: a concentração padrão do meio MS; e uma concentração cinco vezes maior. E foiestabelecido três regimes de intensidade luminosa: escuro; 3,4 Klx e 6,0 Klx. Calos embriogênicos foram obtidos nos meios MSB1(3,4 Klx), MSB1(6,0 Klx) e MSB1+FeEDTA(5X). Analises de eletroforese de isoenzimas da catalase e peroxidase mostraram variação na intensidade das bandas. Os resultados obtidos permitiram concluir que formação de calos embriogênicos é dependente da ação de reguladores de crescimento e da presença de luz, e que as isoformas de catalase e peroxidase apresentam padrão similar e estão relacionadas com o aspecto embriogênico dos calos.