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Identificação e análise do padrão de expressão de genes codificantes de enzimas envolvidas na biossíntese de triacilglicerídios em mamona (Ricinus communis L.)

Cagliari, Alexandro January 2009 (has links)
Sementes de mamona (Ricinus communis) contêm grande quantidade de triacilglicerídios (TAGs) ricos em ácido ricinoléico (18:1OH), o qual é produzido pela conversão do ácido oléico (18:1) em ácido ricinoléico em uma reação catalizada pela enzima oleato hidroxilase (FAH12). Como resultado de suas propriedades físico-químicas, o óleo de mamona e seus derivados apresentam inúmeras aplicações industriais. A expressão heteróloga de FAH12 na oleaginosa modelo Arabidopsis thaliana resultou na produção de apenas 17% de ácidos graxos hidroxilados no óleo da semente. Este nível é muito inferior ao encontrado no óleo da mamona (90%), sugerindo que genes adicionais e maior conhecimento em relação à biossíntese de óleos em sementes são necessários antes de plantas serem manipuladas geneticamente visando a produção de óleos industrialmente importantes. Neste estudo, realizamos pesquisas no banco de dados genômico da mamona (http://castorbean.jcvi.org) com o objetivo de identificar genes da biossíntese de TAGs. No total, vinte e seis genes codificando seis distintas classes de enzimas envolvidas na biossíntese de TAGs foram identificados. A caracterização in silico e análises filogenéticas permitiram a identificação de isoformas plastidiais das famílias de enzimas glicerol-3-fosfato aciltransferase e ácido lisofosfatídico aciltransferase, envolvidas na rota procariótica da síntese de lipídios, que formam um cluster à parte das isoformas citoplasmáticas, envolvidas na rota eucariótica. Além disso, dois distintos polipeptídios da enzima diacilglicerol aciltransferase foram identificados. Adicionalmente genes codificantes das enzimas ácido fosfatídico fosfatase, fosfolipídio: diacilglicerol aciltransferase e colina fosfotransferase também foram identificados. A análise do padrão de expressão quantitativa demonstrou variação no perfil de expressão ao longo do desenvolvimento da semente de mamona tanto entre genes de diferentes classes de enzimas quanto entre genes de uma mesma classe de enzima. No geral, entretanto, existe uma tendência para um máximo nível de expressão nas fases intermediárias do desenvolvimento da semente, embora isso não tenha sido observado para todos os genes analisados. Os nossos resultados representam uma visão global da regulação da expressão de genes pertencentes a seis famílias enzimáticas envolvidas na biossíntese de TAGs em mamona ao longo do desenvolvimento da semente. Estes resultados podem vir a contribuir na escolha de possíveis genes-alvo para estratégias biotecnológicas que objetivem a produção de óleos desejáveis do ponto de vista nutricional e industrial. / Castor bean (Ricinus communis) seed oil contains high amounts of ricinoleic acid (18:1OH) rich triacylglycerols (TAGs), which is produced by the conversion of oleic acid (18:1) to ricinoleic acid in a reaction catalyzed by the enzyme oleato hidroxilase (FAH12). As result of its physical and chemical properties, castor oil and its derivatives are used for numerous bio-based products. Heterologous expression of FAH12 in the model oilseed plant Arabidopsis thaliana produced only up to 17% of hydroxy fatty acids in seed oils. This level is much lower than that found in castor oil (90%), suggesting that additional genes and significantly more knowledge of seed oil biosynthesis are needed before plants could be engineered to produce industrially important oils. In this study, we survey the Castor Bean Genome Database (http://castorbean.jcvi.org) to report the identification of TAG biosynthesis genes. A set of twenty-six genes encoding six distinct classes of enzymes involved in TAGs biosynthesis were identified. Interestingly, in silico characterization and phylogenetic analysis allowed us to identify plastidic isoforms of glycerol-3-phosphate acyltransferase and lysophophatidate acyltransferase enzyme families, involved in prokaryotic lipid biosynthesis pathway, that form a cluster apart from the cytoplasmic isoforms, involved in eukaryotic pathway. Besides, two distinct membrane bound polypeptides of diacylglycerol acyltransferase enzyme were identified. Additionally genes encompasses phosphatidate phophatase, phospholipid:diacylglycerol acyltransferase and choline-phosphotrasferase were also identified. Quantitative expression pattern analyses demonstrated variations on gene expressions along the castor seed development as much among enzyme classes as into the genes of same enzyme class. In general, however, there is a tendency of maximum expression level at the middle of seed development, although this is not observed for all the genes analyzed. These results represent snapshots of global expression regulation of genes encompassing six enzyme families involved in castor bean TAG biosynthesis along seed development. These results can contributed for the choice of genes that will be target to biotechnological approaches for the production of nutritionally and industrially desirable oils.
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Identificação e análise do padrão de expressão de genes codificantes de enzimas envolvidas na biossíntese de triacilglicerídios em mamona (Ricinus communis L.)

Cagliari, Alexandro January 2009 (has links)
Sementes de mamona (Ricinus communis) contêm grande quantidade de triacilglicerídios (TAGs) ricos em ácido ricinoléico (18:1OH), o qual é produzido pela conversão do ácido oléico (18:1) em ácido ricinoléico em uma reação catalizada pela enzima oleato hidroxilase (FAH12). Como resultado de suas propriedades físico-químicas, o óleo de mamona e seus derivados apresentam inúmeras aplicações industriais. A expressão heteróloga de FAH12 na oleaginosa modelo Arabidopsis thaliana resultou na produção de apenas 17% de ácidos graxos hidroxilados no óleo da semente. Este nível é muito inferior ao encontrado no óleo da mamona (90%), sugerindo que genes adicionais e maior conhecimento em relação à biossíntese de óleos em sementes são necessários antes de plantas serem manipuladas geneticamente visando a produção de óleos industrialmente importantes. Neste estudo, realizamos pesquisas no banco de dados genômico da mamona (http://castorbean.jcvi.org) com o objetivo de identificar genes da biossíntese de TAGs. No total, vinte e seis genes codificando seis distintas classes de enzimas envolvidas na biossíntese de TAGs foram identificados. A caracterização in silico e análises filogenéticas permitiram a identificação de isoformas plastidiais das famílias de enzimas glicerol-3-fosfato aciltransferase e ácido lisofosfatídico aciltransferase, envolvidas na rota procariótica da síntese de lipídios, que formam um cluster à parte das isoformas citoplasmáticas, envolvidas na rota eucariótica. Além disso, dois distintos polipeptídios da enzima diacilglicerol aciltransferase foram identificados. Adicionalmente genes codificantes das enzimas ácido fosfatídico fosfatase, fosfolipídio: diacilglicerol aciltransferase e colina fosfotransferase também foram identificados. A análise do padrão de expressão quantitativa demonstrou variação no perfil de expressão ao longo do desenvolvimento da semente de mamona tanto entre genes de diferentes classes de enzimas quanto entre genes de uma mesma classe de enzima. No geral, entretanto, existe uma tendência para um máximo nível de expressão nas fases intermediárias do desenvolvimento da semente, embora isso não tenha sido observado para todos os genes analisados. Os nossos resultados representam uma visão global da regulação da expressão de genes pertencentes a seis famílias enzimáticas envolvidas na biossíntese de TAGs em mamona ao longo do desenvolvimento da semente. Estes resultados podem vir a contribuir na escolha de possíveis genes-alvo para estratégias biotecnológicas que objetivem a produção de óleos desejáveis do ponto de vista nutricional e industrial. / Castor bean (Ricinus communis) seed oil contains high amounts of ricinoleic acid (18:1OH) rich triacylglycerols (TAGs), which is produced by the conversion of oleic acid (18:1) to ricinoleic acid in a reaction catalyzed by the enzyme oleato hidroxilase (FAH12). As result of its physical and chemical properties, castor oil and its derivatives are used for numerous bio-based products. Heterologous expression of FAH12 in the model oilseed plant Arabidopsis thaliana produced only up to 17% of hydroxy fatty acids in seed oils. This level is much lower than that found in castor oil (90%), suggesting that additional genes and significantly more knowledge of seed oil biosynthesis are needed before plants could be engineered to produce industrially important oils. In this study, we survey the Castor Bean Genome Database (http://castorbean.jcvi.org) to report the identification of TAG biosynthesis genes. A set of twenty-six genes encoding six distinct classes of enzymes involved in TAGs biosynthesis were identified. Interestingly, in silico characterization and phylogenetic analysis allowed us to identify plastidic isoforms of glycerol-3-phosphate acyltransferase and lysophophatidate acyltransferase enzyme families, involved in prokaryotic lipid biosynthesis pathway, that form a cluster apart from the cytoplasmic isoforms, involved in eukaryotic pathway. Besides, two distinct membrane bound polypeptides of diacylglycerol acyltransferase enzyme were identified. Additionally genes encompasses phosphatidate phophatase, phospholipid:diacylglycerol acyltransferase and choline-phosphotrasferase were also identified. Quantitative expression pattern analyses demonstrated variations on gene expressions along the castor seed development as much among enzyme classes as into the genes of same enzyme class. In general, however, there is a tendency of maximum expression level at the middle of seed development, although this is not observed for all the genes analyzed. These results represent snapshots of global expression regulation of genes encompassing six enzyme families involved in castor bean TAG biosynthesis along seed development. These results can contributed for the choice of genes that will be target to biotechnological approaches for the production of nutritionally and industrially desirable oils.
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Identificação e análise do padrão de expressão de genes codificantes de enzimas envolvidas na biossíntese de triacilglicerídios em mamona (Ricinus communis L.)

Cagliari, Alexandro January 2009 (has links)
Sementes de mamona (Ricinus communis) contêm grande quantidade de triacilglicerídios (TAGs) ricos em ácido ricinoléico (18:1OH), o qual é produzido pela conversão do ácido oléico (18:1) em ácido ricinoléico em uma reação catalizada pela enzima oleato hidroxilase (FAH12). Como resultado de suas propriedades físico-químicas, o óleo de mamona e seus derivados apresentam inúmeras aplicações industriais. A expressão heteróloga de FAH12 na oleaginosa modelo Arabidopsis thaliana resultou na produção de apenas 17% de ácidos graxos hidroxilados no óleo da semente. Este nível é muito inferior ao encontrado no óleo da mamona (90%), sugerindo que genes adicionais e maior conhecimento em relação à biossíntese de óleos em sementes são necessários antes de plantas serem manipuladas geneticamente visando a produção de óleos industrialmente importantes. Neste estudo, realizamos pesquisas no banco de dados genômico da mamona (http://castorbean.jcvi.org) com o objetivo de identificar genes da biossíntese de TAGs. No total, vinte e seis genes codificando seis distintas classes de enzimas envolvidas na biossíntese de TAGs foram identificados. A caracterização in silico e análises filogenéticas permitiram a identificação de isoformas plastidiais das famílias de enzimas glicerol-3-fosfato aciltransferase e ácido lisofosfatídico aciltransferase, envolvidas na rota procariótica da síntese de lipídios, que formam um cluster à parte das isoformas citoplasmáticas, envolvidas na rota eucariótica. Além disso, dois distintos polipeptídios da enzima diacilglicerol aciltransferase foram identificados. Adicionalmente genes codificantes das enzimas ácido fosfatídico fosfatase, fosfolipídio: diacilglicerol aciltransferase e colina fosfotransferase também foram identificados. A análise do padrão de expressão quantitativa demonstrou variação no perfil de expressão ao longo do desenvolvimento da semente de mamona tanto entre genes de diferentes classes de enzimas quanto entre genes de uma mesma classe de enzima. No geral, entretanto, existe uma tendência para um máximo nível de expressão nas fases intermediárias do desenvolvimento da semente, embora isso não tenha sido observado para todos os genes analisados. Os nossos resultados representam uma visão global da regulação da expressão de genes pertencentes a seis famílias enzimáticas envolvidas na biossíntese de TAGs em mamona ao longo do desenvolvimento da semente. Estes resultados podem vir a contribuir na escolha de possíveis genes-alvo para estratégias biotecnológicas que objetivem a produção de óleos desejáveis do ponto de vista nutricional e industrial. / Castor bean (Ricinus communis) seed oil contains high amounts of ricinoleic acid (18:1OH) rich triacylglycerols (TAGs), which is produced by the conversion of oleic acid (18:1) to ricinoleic acid in a reaction catalyzed by the enzyme oleato hidroxilase (FAH12). As result of its physical and chemical properties, castor oil and its derivatives are used for numerous bio-based products. Heterologous expression of FAH12 in the model oilseed plant Arabidopsis thaliana produced only up to 17% of hydroxy fatty acids in seed oils. This level is much lower than that found in castor oil (90%), suggesting that additional genes and significantly more knowledge of seed oil biosynthesis are needed before plants could be engineered to produce industrially important oils. In this study, we survey the Castor Bean Genome Database (http://castorbean.jcvi.org) to report the identification of TAG biosynthesis genes. A set of twenty-six genes encoding six distinct classes of enzymes involved in TAGs biosynthesis were identified. Interestingly, in silico characterization and phylogenetic analysis allowed us to identify plastidic isoforms of glycerol-3-phosphate acyltransferase and lysophophatidate acyltransferase enzyme families, involved in prokaryotic lipid biosynthesis pathway, that form a cluster apart from the cytoplasmic isoforms, involved in eukaryotic pathway. Besides, two distinct membrane bound polypeptides of diacylglycerol acyltransferase enzyme were identified. Additionally genes encompasses phosphatidate phophatase, phospholipid:diacylglycerol acyltransferase and choline-phosphotrasferase were also identified. Quantitative expression pattern analyses demonstrated variations on gene expressions along the castor seed development as much among enzyme classes as into the genes of same enzyme class. In general, however, there is a tendency of maximum expression level at the middle of seed development, although this is not observed for all the genes analyzed. These results represent snapshots of global expression regulation of genes encompassing six enzyme families involved in castor bean TAG biosynthesis along seed development. These results can contributed for the choice of genes that will be target to biotechnological approaches for the production of nutritionally and industrially desirable oils.
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Cultivo de higuerilla (Ricinus communis L.) como materia prima para la elaboración de biodiésel / Cultivation of higuerilla (Ricinus communis L.) as raw material for the elaboration of biodiesel

Delgado Valenzuela, Francisco Guillermo January 2013 (has links)
Memoria para optar al título profesional de: Ingeniero Agrónomo / La creciente preocupación por la continua alza en los precios de los combustibles fósiles y la contaminación ambiental producto de los gases de efecto invernadero, ha motivado la búsqueda de nuevas alternativas de fuentes de combustión, que ofrezcan mayor independencia energética y sean más inocuas con el medio ambiente. Una alternativa es el cultivo de especies con potencial bioenergético, como es el caso de la higuerilla (Ricinus communis L.), de la cual es posible elaborar biodiésel a partir del aceite de sus semillas. El presente estudio se enfocó en recopilar información sobre esta especie, relacionada principalmente a sus requerimientos agronómicos, su uso como materia prima en fabricación de biodiésel, así como profundizar en los antecedentes necesarios para su cultivo en Chile, que permitan decidir por ejemplo: el lugar, fechas y modo de establecimiento. También se hace mención de las principales plagas y enfermedades que pudiesen afectar su cultivo, junto con los demás usos que pueden darse al aceite de esta especie, principalmente vinculados todos ellos al área industrial. Se determinaron también las zonas más apropiadas en Chile para el establecimiento de un cultivo de higuerilla, en función de los requerimientos edafoclimáticos de esta especie y las características climatológicas de los distritos bioclimáticos presentes en el país. Además, se realizó una estimación de costos y prefactibilidad para una producción de semillas de higuerilla en una superficie de 1 ha. Para la realización de esta investigación, se recurrió principalmente a estudios realizados en Universidades y Departamentos Agrícolas de países Latinoamericanos como Brasil, Colombia y Ecuador, que llevan varios años cultivando higuerilla, así como publicaciones FAO y CEPAL, pues al no ser la higuerilla una especie cultivada en Chile, la información es relativamente escasa a nivel nacional. / The growing concern about the continued rise in the price of fossil fuels and environmental pollution arising from greenhouse gases has motivated the search for new alternative fuel sources that offer greater energy independence and be more environmentally friendly atmosphere. An alternative is the cultivation of bioenergy potential species, as in the case of higuerilla (Ricinus communis L.), which is possible to produce biodiesel from oil seeds. This study focused on collecting information on this species, mainly due to its agronomic requirements, use as feedstock in biodiesel production, as well as deepen the necessary background for cultivation in Chile, in order to decide for example, the place dates and setting mode. References to major pests and diseases that may affect its culture, along with other uses that may be the oil of this species, all of them linked primarily to the industrial area is also made. Chile the most appropriate for the establishment of a cultivation of higuerilla, depending on the soil and climate requirements of this species and the climatic characteristics of the districts bioclimatic zones in the country were also determined. In addition, a cost estimate and feasibility for higuerilla seed production in an area of 1 ha was performed. To carry out this research, mainly turned to studies in Universities and Agricultural Departments of Latin American countries like Brazil, Colombia and Ecuador, who have spent several years cultivating higuerilla and publications FAO and CEPAL, as to not be the higuerilla kind cultivated in Chile, the information is relatively scarce nationwide.
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Destoxificação da torta de mamona por produtos químicos alternativos / Detoxification of castor cake by alternative chemical compounds

Andrade, Igo Renan Albuquerque de January 2015 (has links)
ANDRADE, Igo Renan Albuquerque de. Destoxificação da torta de mamona por produtos químicos alternativos. 2015. 91 f. Tese (Doutorado em Zootecnia)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Vitor Campos (vitband@gmail.com) on 2016-10-06T23:04:56Z No. of bitstreams: 1 2015_tese_iraandrade.pdf: 1066084 bytes, checksum: d0e22653e500e6aad6267d895bef9366 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2016-10-07T17:45:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_tese_iraandrade.pdf: 1066084 bytes, checksum: d0e22653e500e6aad6267d895bef9366 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-07T17:45:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_tese_iraandrade.pdf: 1066084 bytes, checksum: d0e22653e500e6aad6267d895bef9366 (MD5) Previous issue date: 2015 / The objectives of the present study were to evaluate the use of alternative chemical sources in the degradation and inactivation of ricin and Ricinus communis agglutinin from castor cake; the use of an easily applicable methodology able to precisely identify the biological activity of the lectins present in the castor cake; and the influence of the detoxification process on the nutritional values of the castor cake and estimate the maximum sale price of detoxified cakes so that their use in the concentrate feed replacing soybean meal can be viable. The use efficiency of ten chemical compounds (calcitic limestone, magnesian limestone, sodium chloride, potassium chloride, dicalcium phosphate, monodicalcium phosphate, calcium hydroxide, sodium hydroxide, calcium oxide, and urea) in the inactivation of lectins from castor cake was evaluated, using four different volumes of water. Detoxification analyses were performed by visual observation and densitometry of electrophoresis gels, in addition to hemagglutination assays. After satisfactory results were obtained with the treatments using calcium oxide and sodium hydroxide, analyses of chemical composition; crude protein fractionation; rumen degradation of dry matter, crude protein, and neutral detergent fiber; and intestinal digestibility of crude protein were performed. Next, aiming to analyze the viability of using detoxified castor cake in concentrate diets completely replacing soybean meal, different diets were formulated to estimate its maximum sale costs. Alkaline treatments calcium oxide and sodium hydroxide provided complete inactivation of the lectins from castor cakes. Reagent concentration and water volume were decisive to the inactivation efficiency, with detoxification being effective when 60 or 90 g sodium hydroxide were used with water volumes equal to or greater than 1500 mL/kg castor cake or calcium oxide at the concentration of 90 g with 2500 or 3000 mL water/kg of cake. Chemical detoxification treatments directly influenced the profile of the different nitrogen fractions that compose the dietary crude protein; the rumen degradation parameters of dry matter, crude protein, and neutral detergent fiber; as well as the intestinal digestibility of the rumen-undegradable protein. Chemical detoxification treatments changed the nutritional value and the use of the dietary protein by the ruminant, reducing the nutritional value of the cakes and providing feedstuffs with different nutritional characteristics. Castor cakes treated with calcium oxide allowed a higher level of replacement of soybean meal as compared with the cakes treated with sodium hydroxide. In economic terms, the cakes treated with calcium oxide allowed a higher sale price of the product in relation to those treated with sodium hydroxide. / O presente estudo foi conduzido com o objetivo de avaliar o uso de fontes químicas alternativas na degradação e inativação da ricina e Ricinus communis aglutinina da torta de mamona; o uso de uma metodologia de fácil aplicação, capaz de identificar com precisão a atividade biológica das lectinas presentes na torta de mamona; bem como verificar a influência do processo de destoxificação sobre os valores nutritivos da torta de mamona e estimar o custo máximo de venda das tortas destoxificadas, para que seja viável a sua utilização na ração concentrada, em substituição ao farelo de soja. Foi avaliada a eficácia do uso de dez produtos químicos: calcário calcítico, calcário magnesiano, cloreto de sódio, cloreto de potássio, fosfato bicálcico, fosfato monobicálcico, hidróxido de cálcio, hidróxido de sódio, óxido de cálcio e ureia, na destoxificação das lectinas da torta de mamona, utilizando quatro diferentes volumes de água. As análises de destoxificação foram realizadas através da observação visual e por densitometria de géis de eletroforese, além de ensaios de hemaglutinação. Após verificados resultados satisfatórios dos tratamentos que utilizaram óxido de cálcio e hidróxido de sódio, foram realizadas análises de composição química, fracionamento da proteína bruta, degradação ruminal da matéria seca, proteína bruta e fibra em detergente neutro, além da digestibilidade intestinal da proteína bruta. Em seguida, com o intuito de analisar a viabilidade de uso da torta de mamona destoxificada em rações concentradas, substituindo totalmente o farelo de soja, foram formuladas diferentes rações, buscando estimar os custos máximos de comercialização das mesmas. Verificou-se que os tratamentos químicos alcalinos, óxido de cálcio e hidróxido de sódio, promoveram completa inativação das lectinas das tortas de mamona. A concentração do reagente e o volume de água foram determinantes para a eficácia de tal inativação, sendo a destoxificação eficaz ao se utilizar 60 ou 90 g de hidróxido de sódio em volumes de água iguais ou superiores a 1500 mL/kg de torta de mamona ou óxido de cálcio na concentração de 90 g de reagente com 2500 ou 3000 mL de água/kg de torta de mamona. Os tratamentos químicos de destoxificação influenciaram diretamente o perfil das diferentes frações nitrogenadas que compõe a proteína bruta dietética, assim como os parâmetros de degradação ruminal da matéria seca, proteína bruta e fibra em detergente neutro, bem como a digestibilidade intestinal da proteína bruta não degradável no rúmen. Os tratamentos químicos de destoxificação alteraram o valor nutritivo e o aproveitamento da proteína dietética pelo animal ruminante, observando diminuição do valor nutritivo das tortas e proporcionando alimentos com diferentes características nutricionais. As tortas de mamona tratadas com óxido de cálcio permitiram um nível de substituição do farelo de soja mais elevado, quando comparados às tortas de mamona tratadas com hidróxido de sódio. Em termos econômicos, verificou-se que as tortas tratadas com óxido de cálcio permitiram um maior preço de venda da mesma em relação às tortas tratadas com hidróxido de sódio.
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Laimo ligos sukėlėjo Borrelia burgdorferi sensu lato paplitimas graužikuose ir jų ektoparazituose Ixodes ricinus erkėse / Prevalence of lyme disease agent borrelia burgdorferi sensu lato in rodents and their ectoparasites ixodes ricinus ticks

Šivytė, Eglė 25 June 2014 (has links)
Laimo liga arba Laimo boreliozė yra labiausiai Europoje, Šiaurės Amerikoje, Rusijoje ir Tolimuosiuose Rytuose plintanti, erkių pernešama zoonozė (Masuzawa, 2004, Wang ir kt., 1999, Sinski ir kt., 2006, Barbour, 1998). Tai yra dažniausia Ixodes ricinus erkių pernešama infekcija (Krupka ir kt., 2007, Žakovska ir kt., 2008). Daugiausia jos atvejų užfiksuojama Centrinėje-Rytų Europoje (Derdakova, Lenčakova, 2005). Laimo boreliozė yra vis didėjanti visuomenės sveikatos problema (Piesman, Gern, 2004, Hillyard, 1996). Kasmet tiek Europoje, tiek Šiaurės Amerikoje užfiksuojama tūktančiai ligos atvejų (Wang ir kt., 1999, Ostfeld, Keesing, 2000, Barbour, 1998). Pastaraisiais metais vykstant klimato pokyčiams, žmogui vis labiau keičiant jį supančią aplinką, Ixodes ricinus erkių gausumas Europoje sparčiai auga. To pasėkoje daugėja ir erkių pernešamų susirgimų (Tsao, 2009, Derdakova, Lenčakova, 2005). Gamtoje enzootinį Laimo ligos ciklą sudaro: sukėlėjas – B. burgdorferi sensu lato (s.l.), serkė - vektorius, ir rezervuarinis šeimininkas (Humair, Gern, 2000). B. burgdorferi s.l. tyrimai sukėlėją platinančiose erkėse ir rezervuariniuose šeimininkuose, kaip ir tikslus B. burgdorferi s.l. genotipų nustatymas padėtų tiek suprasti šios ligos ekologiją ir epidemiologiją, tiek nustatyti efektyvias prevencijos priemones (Derdakova, Lenčakova, 2005). Šio darbo tikslas – įvertinti dviejų pagrindinių rezervuarinių šeimininkų geltonkaklės pelės (Apodemus flavicollis) ir rudojo pelėno (Myodes glareolus)... [toliau žr. visą tekstą] / SUMMARY The aim of present study was to assess the importance of two main reservoir hosts A. flavicollis and M. gareolus, and their ectoparasites I. ricinus immature ticks in Lyme disease agent B. burgdorferi s.l. circulation in natural foci. The following research tasks were formulated: 1. To establish the infectivity level of questing immature I. ricinus ticks with B. burgdorferi s.l. and to determine it’s genotypes composition. 2. To investigate the infectivity level of two main Lithuania rodent species A. flavicollis and M. glareolus with B. burgdorferi s.l. and to determine it’s genotypes composition. 3. To estimate prevalence and abundant of infestation with immature I. ricinus ticks in A. flavicollis and M. glareolus species rodents. To calculate any differences between rodents in species, age and sex level. 4. To evaluate transmition efficient of B. burgdorferi s.l. from rodent to feeding I. ricinus larvae. The infectivity level in questing I. ricinus nymphs in fragmented mixed forests of Lithuania was relatively high, and varied in different districts from 14% to 24%. The most prevalent genotype was B. afzelii, and only in one district B. garinii was found. In case of I. ricinus larvae the overall infectivity level with Lyme disease spirochete was 3,5%. In order to establish the infectivity level with B. burgdorferi s.l. in total 302 rodents comprising 3 species - A. flavicollis, M. glareolus and A. agrarius were investigated. The results have showed that in all... [to full text]
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Analysing the genetic diversity of Ixodes ricinus ticks using multilocus sequence typing

Dinnis, Ruth Elizabeth January 2010 (has links)
Ixodes ricinus is the most important human-biting tick in Europe and the principal vector of Lyme borreliosis. In addition, this hard tick species transmits a large number of microbial pathogens that are of importance to animal and human health. Little is known about the diversity and genetic population structure of I. ricinus across Europe. Genetic diversity of these tick populations may have implications on disease transmission. I. ricinus primers were designed for a number of mitochondrial genes and a Multilocus Sequence Typing-like Scheme (MLST) was devised. This was termed mitochondrial MLST (mtMLST). MLST has so far mainly been used for typing microbes, and the development of a MLST scheme for an arthropod vector is novel. Understanding the geographic structure of I. ricinus populations, in combination with studies regarding the migration of tick-borne microbial infections, e.g. Lyme borreliosis, is likely to illuminate important processes in the evolution and spread of tick-borne diseases.
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Population biology of Ixodes ticks

Seelig, Frederik January 2011 (has links)
The hard tick Ixodes ricinus is one of the most important species of disease vectors worldwide. It transmits a variety of pathogens, including spirochaetes that are the causative agent of Lyme borreliosis (LB) in humans. This study aimed at analysing different aspects of the ecology, molecular evolution, and microbial associations of I. ricinus. A novel scheme for the phylogenetic analysis and genotyping of I. ricinus was established as part of this study. Phylogeographic clustering of I. ricinus samples fromdifferent European countries was observed, while samples from two different sites inSouthwest England did not show spatial differentiation. The ecology and host abundance in these two habitats was assessed. Differences in the density of questing ticks and in the abundance of rodent hosts were observed. Both sites exhibited low densities of rodents and of ticks infesting them. A blood meal analysis revealed high proportions of mixed feedings and showed artiodactyls to be a main host group for immature I. ricinus ticks from Britain. The prevalence rates of Wolbachia endobacteria in British I. ricinus samples were higher than rates found in samples from other European countries. The unique endosymbiont Midichloria was detected in all female I. ricinus ticks that were screened. A newly developed multi gene analysis of Midichloria samples from six European countries showed a largely coordinated phylogeography with their tick hosts. Taken together, the findings of this thesis demonstrate that British I. ricinus ticks differ from their European counterparts in several ways, which has implications for the epidemiology of infectious diseases transmitted by this vector.
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Implante de um floculado de resina derivada do óleo de mamona (Ricinus communis) em alvéolo de rato imediatamente após a extração dental. Avaliações histológica e histométrica da biocompatibilidade e da cronologia do reparo ósseo. / Implantation of flakes of castor oil resin (Ricinus communis) in rat alveolus immediately after dental extraction. Histologic and histometric evaluation of biocompatibility and chronology of bone healing.

Romeu Felipe Elias Calixto 06 June 2001 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi testar a biocompatibilidade de um enxerto floculado de resina de mamona (AUG-EX, POLIQUIL ARARAQUARA POLÍMEROS QUÍMICOS LTDA, Araraquara, SP), utilizando-se como modelo experimental o reparo da ferida de extração dental de rato. Para tanto, foram realizadas a avaliação histológica da reação dos tecidos vizinhos ao implante e a análise histométrica da cronologia do reparo ósseo no terço alveolar contíguo ao do material implantado. Imediatamente após a extração dos incisivos superiores direitos, os animais do grupo Implantado tiveram o alvéolo parcialmente preenchido com o enxerto floculado da resina de mamona, misturado em quantidade mínima de soro fisiológico. Nos períodos de 1, 2, 3 e 6 semanas após a extração dental ou extração + implante, as hemi-maxilas direitas dos ratos controles e implantados foram coletadas, fixadas em solução de formol a 10%, a seguir descalcificadas, desidratadas, diafanizadas e incluídas em parafina para obtenção de cortes longitudinais semi-seriados de 6 µm de espessura, que foram corados com hematoxilina e eosina. A fração de volume dos componentes reparacionais da ferida de extração dental (coágulo sangüíneo, tecido conjuntivo e trabéculas ósseas) foi estimada por um método de contagem diferencial de pontos, em imagens histológicas analisadas ao microscópio óptico munido de uma ocular contendo um retículo com 100 pontos eqüidistantes, nos períodos de 2 e 6 semanas após a extração dental. As comparações entre os resultados dos grupos controles e implantados foram realizadas pelos testes estatísticos não-paramétricos de Kruskal-Wallis e Mann-Whitney. O exame histológico mostrou os flocos da resina de mamona, de forma irregular e tamanho variável, localizados entre os terços médio e cervical dos alvéolos dentais; o material mostrou-se biocompatível e capaz de certo grau de osseointegração direta, dentro do período da investigação. Os flocos foram inicialmente circundados por tecido de granulação, com a presença de trabéculas osteóides formando-se em suas proximidades. Com o progresso do reparo, quantidades gradativamente maiores de tecido ósseo em maturação foram observadas entre e ao redor dos flocos da resina, no geral com a presença de um tecido conjuntivo interposto, mas em algumas regiões estabelecendo um aparente contato direto com eles. Comparando com trabalhos anteriores do nosso laboratório, no entanto, parece que o formato irregular dos flocos não se mostrou tão favorável à aderência aos tecidos reparacionais, uma vez que ao redor das superfícies côncavas foram observadas, no geral, áreas sem preenchimento tissular. A presença do material não suscitou uma resposta inflamatória persistente, em que pese a ocorrência de uma quantidade discreta de células gigantes tipo corpo estranho aderidas a sua superfície, em todos os períodos experimentais. Embora apresentando o mesmo padrão de reparo alveolar descrito para os ratos controles, a análise histométrica do terço apical do alvéolo dos ratos implantados comprovou um atraso da ordem de 13% a 20% na neoformação óssea reparacional, com áreas mais extensas da cavidade de extração preenchidas por tecido conjuntivo e/ou remanescentes do coágulo sangüíneo, em todos os períodos experimentais. / The aim of the present study was to evaluate the biocompatibility of a natural resin made from fatty acids extracted from Ricinus communis (AUG-EX, POLIQUIL ARARAQUARA POLÍMEROS QUÍMICOS LTDA, Araraquara, SP), using as experimental model the rat alveolar healing following tooth extraction. The histological analysis of tissue reaction around the resin flakes and the histometric analysis of bone repair in the alveolar third next to the implanted material were carried out. Immediately after extraction of the upper right incisors, the alveoli of the implanted group were partially filled with the resin flakes mixed in a minimal amount of saline. The animals were killed 1, 2, 3, and 6 weeks after tooth extraction or extraction + implant, the right hemi–maxilla of the control and implanted groups were removed, fixed in 10% phormol, decalcified and processed for paraffin embedding. Longitudinal semi-serial 6 mm thick sections were stained with hematoxylin and eosin. The volume fraction of the alveolar healing components (blood clot, connective tissue and bone trabeculae) were estimated by a differential point-counting method, in histological images analyzed with an optical microscope containing a grid with 100 equidistant points, 2 and 6 weeks after tooth extraction. Results of the control and implanted groups were compared by the non-parametric Kruskal–Wallis and Mann–Whitney tests. Histological analysis showed that the material was biocompatible and capable of some degree of direct osteointegration. The resin flakes, exhibiting an irregular shape and a variable size, partially filled the middle/cervical thirds of the dental alveoli. No persistent inflammation was evoked, although a discreet foreign body reaction was observed in all the experimental periods. The material was initially encircled by granulation tissue, with the presence of delicate newly formed bone trabecula in its proximity. Progressive bone formation and maturation were noted among and around the flakes, in some areas establishing an apparent direct contact with its surface. However, it seems that the irregular shape of the flakes did not favor the adherence of biological tissues, since areas with no tissular filling were in general observed around their concave surfaces. The histometric analysis, used to quantify the healing process in the apical third from control and implanted rats, showed a small but significant delay in new bone formation in the later, which showed more extensive areas of the extraction socket filled with connective tissue and/or remaining of the blood clot, in all the experimental periods.
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Implante de um floculado de resina derivada do óleo de mamona (Ricinus communis) em alvéolo de rato imediatamente após a extração dental. Avaliações histológica e histométrica da biocompatibilidade e da cronologia do reparo ósseo. / Implantation of flakes of castor oil resin (Ricinus communis) in rat alveolus immediately after dental extraction. Histologic and histometric evaluation of biocompatibility and chronology of bone healing.

Calixto, Romeu Felipe Elias 06 June 2001 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi testar a biocompatibilidade de um enxerto floculado de resina de mamona (AUG-EX, POLIQUIL ARARAQUARA POLÍMEROS QUÍMICOS LTDA, Araraquara, SP), utilizando-se como modelo experimental o reparo da ferida de extração dental de rato. Para tanto, foram realizadas a avaliação histológica da reação dos tecidos vizinhos ao implante e a análise histométrica da cronologia do reparo ósseo no terço alveolar contíguo ao do material implantado. Imediatamente após a extração dos incisivos superiores direitos, os animais do grupo Implantado tiveram o alvéolo parcialmente preenchido com o enxerto floculado da resina de mamona, misturado em quantidade mínima de soro fisiológico. Nos períodos de 1, 2, 3 e 6 semanas após a extração dental ou extração + implante, as hemi-maxilas direitas dos ratos controles e implantados foram coletadas, fixadas em solução de formol a 10%, a seguir descalcificadas, desidratadas, diafanizadas e incluídas em parafina para obtenção de cortes longitudinais semi-seriados de 6 µm de espessura, que foram corados com hematoxilina e eosina. A fração de volume dos componentes reparacionais da ferida de extração dental (coágulo sangüíneo, tecido conjuntivo e trabéculas ósseas) foi estimada por um método de contagem diferencial de pontos, em imagens histológicas analisadas ao microscópio óptico munido de uma ocular contendo um retículo com 100 pontos eqüidistantes, nos períodos de 2 e 6 semanas após a extração dental. As comparações entre os resultados dos grupos controles e implantados foram realizadas pelos testes estatísticos não-paramétricos de Kruskal-Wallis e Mann-Whitney. O exame histológico mostrou os flocos da resina de mamona, de forma irregular e tamanho variável, localizados entre os terços médio e cervical dos alvéolos dentais; o material mostrou-se biocompatível e capaz de certo grau de osseointegração direta, dentro do período da investigação. Os flocos foram inicialmente circundados por tecido de granulação, com a presença de trabéculas osteóides formando-se em suas proximidades. Com o progresso do reparo, quantidades gradativamente maiores de tecido ósseo em maturação foram observadas entre e ao redor dos flocos da resina, no geral com a presença de um tecido conjuntivo interposto, mas em algumas regiões estabelecendo um aparente contato direto com eles. Comparando com trabalhos anteriores do nosso laboratório, no entanto, parece que o formato irregular dos flocos não se mostrou tão favorável à aderência aos tecidos reparacionais, uma vez que ao redor das superfícies côncavas foram observadas, no geral, áreas sem preenchimento tissular. A presença do material não suscitou uma resposta inflamatória persistente, em que pese a ocorrência de uma quantidade discreta de células gigantes tipo corpo estranho aderidas a sua superfície, em todos os períodos experimentais. Embora apresentando o mesmo padrão de reparo alveolar descrito para os ratos controles, a análise histométrica do terço apical do alvéolo dos ratos implantados comprovou um atraso da ordem de 13% a 20% na neoformação óssea reparacional, com áreas mais extensas da cavidade de extração preenchidas por tecido conjuntivo e/ou remanescentes do coágulo sangüíneo, em todos os períodos experimentais. / The aim of the present study was to evaluate the biocompatibility of a natural resin made from fatty acids extracted from Ricinus communis (AUG-EX, POLIQUIL ARARAQUARA POLÍMEROS QUÍMICOS LTDA, Araraquara, SP), using as experimental model the rat alveolar healing following tooth extraction. The histological analysis of tissue reaction around the resin flakes and the histometric analysis of bone repair in the alveolar third next to the implanted material were carried out. Immediately after extraction of the upper right incisors, the alveoli of the implanted group were partially filled with the resin flakes mixed in a minimal amount of saline. The animals were killed 1, 2, 3, and 6 weeks after tooth extraction or extraction + implant, the right hemi–maxilla of the control and implanted groups were removed, fixed in 10% phormol, decalcified and processed for paraffin embedding. Longitudinal semi-serial 6 mm thick sections were stained with hematoxylin and eosin. The volume fraction of the alveolar healing components (blood clot, connective tissue and bone trabeculae) were estimated by a differential point-counting method, in histological images analyzed with an optical microscope containing a grid with 100 equidistant points, 2 and 6 weeks after tooth extraction. Results of the control and implanted groups were compared by the non-parametric Kruskal–Wallis and Mann–Whitney tests. Histological analysis showed that the material was biocompatible and capable of some degree of direct osteointegration. The resin flakes, exhibiting an irregular shape and a variable size, partially filled the middle/cervical thirds of the dental alveoli. No persistent inflammation was evoked, although a discreet foreign body reaction was observed in all the experimental periods. The material was initially encircled by granulation tissue, with the presence of delicate newly formed bone trabecula in its proximity. Progressive bone formation and maturation were noted among and around the flakes, in some areas establishing an apparent direct contact with its surface. However, it seems that the irregular shape of the flakes did not favor the adherence of biological tissues, since areas with no tissular filling were in general observed around their concave surfaces. The histometric analysis, used to quantify the healing process in the apical third from control and implanted rats, showed a small but significant delay in new bone formation in the later, which showed more extensive areas of the extraction socket filled with connective tissue and/or remaining of the blood clot, in all the experimental periods.

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