La sélection sexuelle façonne la diversité du vivant par deux voies possibles : la sélection intersexuelle et la sélection intrasexuelle. S'il est bien évident que combiner les études portant sur ces deux voies d'action est le meilleur moyen pour comprendre la sélection sexuelle dans son entièreté, l'étude particulière de chacune d'elles reste une étape cruciale pour rendre compte de ses différents modes d’actions. Mon projet de doctorat suit une approche intégratrice pour répondre à ce besoin en ciblant à la fois les caractères phénotypiques sensés être sous sélection intrasexuelle, et les facteurs populationnels sensés modifier l'intensité de cette sélection. Mes recherches gravitent autour de la compétitivité pour l’accouplement des mâles d'une population sauvage d'un grand mammifère polygyne : le mouflon d'Amérique (Ovis canadensis). Cette population, sous forte sélection sexuelle, est idéale pour ce projet puisqu’elle est l’objet d’un suivi individuel détaillé depuis 1988 fournissant des données morphologiques et démographiques. Cette thèse se compose de quatre chapitres de recherche. Le chapitre 2 se concentre sur le rôle du phénotype dans la compétitivité pour l’accouplement des mâles. De façon indépendante et souvent expérimentale, les études montrent des liens entre le comportement reproducteur des mâles, leur morphologie, leur âge, et leur production de testostérone. Ce chapitre a donc pour objectif d’établir les relations entre ces trois niveaux phénotypiques en ciblant l’établissement du rang social, la longueur des cornes et la masse corporelle, et les concentrations fécales en métabolites de testostérone. Les résultats indiquent que le rang social est plus fortement lié à la production de testostérone qu’à la morphologie. De plus, la relation entre testostérone et rang social varie avec l’âge. Cette étude est un rare exemple d’intégration de plusieurs niveaux phénotypiques en nature dans le cadre de la sélection sexuelle. Le chapitre 3 explore les déterminants populationnels de la sélection intrasexuelle sur la longueur des cornes et la masse. La sélection est relative à un contexte de compétition donné. Or, les conditions de compétition intrasexuelle varient selon la composition des populations. En ciblant le nombre de compétiteurs, le sexe ratio adulte, et la structure d’âge, ce chapitre montre que la fluctuation de la sélection sexuelle, rarement montrée en nature, est déterminée par le seul effet du nombre de compétiteurs. De plus, cette étude montre que la sélection sexuelle est subie différemment selon l’âge. Cette étude est une des rares à établir un déterminisme écologique de la fluctuation de la sélection en nature. Le chapitre 4 replace l’étude de la sélection sexuelle dans le cadre plus large de la sélection totale sur les caractères sexuels secondaires. La valeur sélective est la contribution individuelle au bassin génétique des futures générations et est donc la pierre angulaire de l’évolution par sélection. En ciblant la relation entre phénotype et succès d’accouplement, les analyses de sélection sexuelle ne documentent donc que partiellement la relation entre le phénotype et la valeur sélective. Cette étude montre que des effets paternels peuvent accroitre la survie des descendants et intensifier l’effet de la sélection sexuelle sur les caractères. Le chapitre 5 compare des indices et mesures de sélection sexuelle. Depuis les années 1980, les arguments pour ou contre l’utilisation de mesures approximatives de la sélection sont débattus. L’objectif ce chapitre est de mettre à profit les données du suivi de Ram Mountain pour tester empiriquement des prédictions quant aux relations entre indices et mesures de sélection. Les résultats montrent que la sélection réalisée sur la longueur des cornes ne pourrait pas être correctement approximée par les indices d’asymétrie du succès reproducteur ni l’opportunité pour la sélection. Mes recherches de doctorat contribuent à raffiner la compréhension des mécanismes écologiques et évolutifs de la sélection intrasexuelle. De plus, l’emphase sur le rôle de la structure de la population dans la dynamique évolutive des caractères sexuellement sélectionnés permet de comprendre les mécanismes par lesquels l’exploitation humaine comme la chasse peut modifier les pressions de sélection affectant les populations sauvages.

La globalisation des marchés financiers amène les industries financières québécoises à innover en ce qui concerne la sélection du personnel. Pour concurrencer vis-à-vis la compétitivité des marchés, les entreprises sont à la recherche d’employés performants. Les industries financières recherchent spécifiquement des conseillers financiers performants qui sont à la hauteur des exigences résultant de la globalisation des marchés et des différentes juridictions du domaine de la finance. En effet, la globalisation des marchés occasionne certaines problématiques, entre autres le besoin des entreprises à prédire la loyauté des conseillers envers leur employeur afin de pallier la concurrence et la perte de clients.Plusieurs études ont démontré la possibilité de prédire la performance en emploi à l’aide de diverses méthodes de sélection du personnel. Notamment, la relation entre l’intelligence et la performance en emploi a été corroborée par plusieurs résultats de méta-analyses. Toutefois, parmi la littérature scientifique les chercheurs différencient la performance liée à la tâche de la performance contextuelle. Or l’intelligence aurait une relation plus importante avec la performance liée à la tâche qu’avec la performance contextuelle. Qui plus est, certaines études se sont attardées à l’importance que revêt la personnalité quant à la prédiction de la performance contextuelle. Les chercheurs de ces études mettre en lumière l’apport de la personnalité en ce qui concerne la performance contextuelle en emploi. La personnalité permet d’évaluer la dimension du savoir-être ainsi qu'évaluer et anticiper les comportements d’une personne, et ce, selon diverses situations. Ce qui paraît intéressant dans un contexte où les entreprises financières sont à la recherche de conseillers financiers performants dans diverses situations. La relation entre la personnalité et la performance en emploi a fait l’objet de nombreuses recherches. D’ailleurs, plusieurs méta-analyses corroborent l’existence d’une relation entre ces deux variables. Néanmoins, les chercheurs constatent l’absence de précision en ce qui concerne l’étude de la relation entre la performance et la personnalité. Ils soutiennent que la performance en emploi est un concept variable selon le type d’emploi. Conséquemment, les relations entre les traits de la personnalité varient en fonction du type d’emploi et l’exigence reliée au poste. À cet égard, aucune étude n’a été effectuée sur la relation entre la personnalité et la performance contextuelle en emploi chez les conseillers financiers. La question de recherche est donc la suivante, est-ce qu’il y a une relation entre les cinq grands traits de la personnalité et la performance contextuelle en emploi chez les conseillers financiers? Des régressions multiples ont été effectuées à l’aide d’un échantillon composé de 47 conseillers financiers, afin d’étudier la présence d’une relation entre la personnalité et la performance contextuelle. Les résultats corroborent les hypothèses formulées à la suite d’une recension des écrits. Plus précisément, les régressions multiples avaient pour but de vérifier certaines hypothèses à l’égard des cinq grands traits de la personnalité et la performance contextuelle en emploi. Qui plus est, des régressions multiples ont aussi été effectuées avec les facettes de la personnalité de manière exploratoire. Les résultats révèlent une relation significative entre le trait Conscience et le Score global de performance contextuelle ainsi qu’avec le facteur Coopération de la performance contextuelle. La facette Fiabilité et organisation a une relation significative avec les facteurs Loyauté et Conformité de la performance contextuelle ainsi qu’avec le Score global de la performance. Ensuite, le trait Agréabilité a une association positive avec le facteur Esprit sportif de la performance contextuelle. En outre, la facette Orientation prosociale a une relation significative avec le facteur Altruisme de la performance contextuelle. Enfin, la facette Personnalité artistique a une relation négative avec la performance contextuelle en emploi. Malgré la petite taille de l’échantillon, la présence de coefficients de régressions multiples significatifs tend à démontrer l’existence d’une relation entre la personnalité et la performance contextuelle en emploi chez les conseillers financiers. La présence de relations plus significatives avec les facettes de la personnalité et la performance contextuelle appuient certaines études qui suggèrent une plus grande spécificité de l’influence des facettes sur la performance contextuelle en emploi. Ce mémoire a pour principale faiblesse la petite taille de l’échantillon, mais a pour principale force d’avoir étudié un échantillon composé spécifiquement de conseillers financiers.

Résumé : La capacité de décider parmi plusieurs possibilités d'actions, grâce à l'information sensorielle disponible, est essentielle à un organisme interagissant avec un environnement complexe. Les modèles actuels de sélection d'une action soutiennent que le cerveau traite continuellement l'information sensorielle afin de planifier plusieurs possibilités d'action en parallèle. Dans cette perspective, ces représentations motrices, associées à chaque possibilité d'action, sont en constante compétition entre elles. Afin qu'une alternative puisse être sélectionnée pour le mouvement, une valeur de pondération, intégrant une multitude de facteurs, doit être associée à chacun des plans moteurs afin de venir moduler la compétition. Plusieurs études se sont intéressées aux différents facteurs modulant la sélection de l'action, tels que la disposition de l'environnement, le coût des actions, le niveau de récompense, etc. Par contre, il semble qu'aucune étude n'ait rapporté ce qu'il advient lorsque la valeur de pondération de chacune des actions possibles est identique. Dans ce contexte, quel est l'élément permettant de venir moduler la sélection de l'action? De ce fait, l'objectif principal de mon projet de maitrise est d'investiguer le facteur permettant au cerveau de sélectionner une action lorsque tous les facteurs rapportés dans la littérature sont contrôlés. De récentes données ont montré que les oscillations corticales lentes dans la bande delta peuvent servir d'instrument de sélection attentionnelle en modulant l'amplitude de la réponse neuronale. Ainsi, les stimuli arrivant dans le cortex pendant une phase en delta de forte excitabilité sont amplifiés, tandis que ceux arrivant lors d'une phase en delta de faible excitabilité sont atténués. Ceci dit, il est possible que la phase en delta dans laquelle se trouve le cerveau au moment d'effectuer la sélection d'une action puisse influencer la décision. Utilisant une tâche de sélection de main, cette étude teste l'hypothèse que la sélection de la main est associée à la phase en delta des ensembles neuronaux codant le mouvement de chacune des mains, lorsque tous les facteurs connus influençant la décision sont contrôlés. L'électroencéphalographie (EEG) fut utilisée afin d'enregistrer les signaux corticaux pendant que les participants effectuaient une tâche de sélection de main dans laquelle ils devaient, à chaque essai, atteindre une cible visuelle aussi rapidement que possible en utilisant la main de leur choix. La tâche fut conçue de façon à ce que les facteurs spatiaux et biomécaniques soient contrôlés. Ceci fut réalisé enidentifiant premièrement, sur une base individuelle, l'emplacement de la cible pour laquelle les mains droite et gauche avaient une probabilité équivalente d'être choisies (point d'égalité subjective, PSE). Ensuite, dans l'expérience principale, les participants effectuaient plusieurs mouvements d'atteinte vers des cibles positionnées près et loin du PSE, toujours avec la main de leur choix. L'utilisation de cinq cibles très près du PSE a permis de collecter de nombreux essais dans lesquels la main droite et la main gauche furent sélectionnées en réponse à un même stimulus visuel. Ceci a ainsi permis d'analyser les signaux des deux cortex dans des conditions d'utilisation de la main droite et gauche, tout en contrôlant pour les autres facteurs pouvant moduler la sélection de la main. Les résultats de cette recherche révèlent que l'hémisphère cortical se trouvant dans la phase la plus excitable en delta (près du pic négatif), lors de l'apparition du stimulus, est associé à la fois à la main qui sera sélectionnée ainsi qu'au temps de réaction. Ces résultats montrent que l'excitabilité corticale momentanée (phase du signal) pourrait agir comme un facteur modulant la sélection d'une action. Dans cette optique, ces données élargissent considérablement les modèles actuels en montrant que la sélection d'une action est en partie déterminée par l'état du cerveau au moment d'effectuer un choix, d'une manière qui est indépendante de toutes les variables de décision connues. / Abstract : Action selection is thought to be achieved by competitive interactions between simultaneously co-existing motor representations associated with each potential action. Critically, selection via competition requires biasing signals to enable only one of these alternatives to be selected. Here we use electroencephalography in a unique hand selection task in which all decision variables are controlled, and show that the cortical hemisphere that is in the most excitable phase of delta frequency band at target onset dictates the hand to be selected as well as reaction time. These results demonstrate that the momentary excitability of neuronal ensembles in which motor representations are encoded can bias action selection.

L'identification de marqueurs génétiques liés à des gènes permet une exploration des éventuelles corrélations existant entre leur variabilité génétique et des pressions sélectives portant sur les gènes, aussi bien dans un contexte de populations expérimentales que naturelles. Chez le loup de mer (Dicentrarchus labrax), douze locus associés à des gènes - dont quatre associés aux gènes de l'hormone de croissance (GH), la somatolactine (SL) ou l'IGF-1- et huit locus anonymes ont servi à mener une étude multi-échelle de la différenciation génétique. La structure en trois bassins connue chez cette espèce a été confirmée mais les locus liés aux gènes ont montré une différenciation significativement plus forte que les locus anonymes et impliquant des barrières aux flux géniques nucléaires supérieures à celles admises jusqu'alors. A l'échelle mer-lagune, aucune image cohérente de différenciation génétique n'a pu être obtenue. Parallèlement, une expérience d'acclimatation à l'eau douce a été réalisée. Si les individus soumis à la désalure ont subi une mortalité importante, aucune différence génétique significative n'est observée entre les individus ayant survécu au traitement et ceux restés en eau de mer, excepté pour un locus EIF3E. Ces résultats ont révélé une composante familiale liée à l'expérimentation, mais les déterminismes génétiques sous-jacents restent obscurs. L'utilisation de marqueurs liés à des gènes a permis de révéler l'implication au moins indirecte de certains de ces gènes dans la mise en place d'une structuration génétique de l'espèce, mais également dans la réponse physiologique des individus à un stress environnemental pouvant être rencontré en conditions naturelles. / The identification of gene-linked genetic markers allows the exploration of potential correlations between their genetic variability and selective pressures acting on the genes in both natural and experimental populations. In Sea Bass (Dicentrarchus labrax), twelve gene-associated loci – four of them linked to Growth Hormone gene (GH), Somatolactin (SL) or IGF-1- and height anonymous loci were used in a multi-scale study of the genetic differentiation. The structure in three basins know in this species is well confirmed with gene-linked markers bearing a significantly higher differentiation than anonymous loci implying some stronger barriers to nuclear gene flow than admitted so far. At the open sea-lagoon scale, no coherent picture can be drawn from the different tests performed. A fresh water acclimation experiment was carried out in parallel. If numerous fishes in low-salt conditions died, the survivors are not genetically different from that maintained in salted water except for one locus EIF3E. These results can be partially explained by a family component but the genetic determinism is not elucidated yet. The use of gene-linked markers succeeded in revealing the involvement, at least indirect, of some of the genes in the edification of a genetic structure inside the species but also in the physiological response of the fishes to an environmental stress that can be encountered in natural conditions.

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Worldline, une importante société d’informatique, doit améliorer la qualité de ses projets. Nous avons réalisé un audit sur plusieurs projets de l’entreprise afin d’identifier comment éviter l’échec des projets: aucune conclusion définitive n'en a été tirée. Cependant, il a mis en lumière le besoin d’améliorer l’utilisation des tests. Effectivement, tester chaque partie du code est requis pour éviter l’échec du projet. Dans l’industrie, notamment à Worldline, l’automatisation des tests a commencé dans le but de maîtriser le comportement des applications. Mais, exécuter tous les tests après un changement peut être une coûter plusieurs heures. Le retour sur le code changé est retardé et le développeur perd du temps pour découvrir les potentiels bogues. La solution généralement proposée dans la littérature consiste à réduire le nombre de tests à lancer en sélectionnant seulement ceux relatifs aux derniers changements effectués. L’approche sélectionne un jeu de tests réduit et approprié qui détectera de potentielles régressions dans l’application. Chaque approche de sélection de tests a besoin d’être étudiée dans le contexte de Worldline et adaptée en conséquence pour convenir aux habitudes des développeurs. Avant d’intégrer une telle approche, une étude a été faite pour connaître les habitudes actuelles des développeurs vis-à-vis de la sélection de tests. Grâce à cette étude, nous avons développé un outil pour les développeurs visant à effectuer la sélection des tests. Le but est aussi d’étudier l’impact de cet outil sur leur comportement. Nous espérons que cette approche de sélection de tests apportera des changements dans leur processus de développement. / Worldline, a major IT company, has to increase the quality of its projects. We performed an audit of several projects of the company to identify how to avoid project failure: no final conclusion has been drawn. However, it highlighted a need to enhance testing usage. To test every piece of code is compulsory to avoid project failure. In industry and more specifically in Worldline, automation of tests has begun to ensure the proper behavior of their applications. But, ensuring the execution of all tests after a change can be a costly operation requiring several hours. Feedback on the changed code is delayed and developer has to spent time to discover the potential bugs. The solution generally proposed in literature consists in reducing the number of tests to run by selecting only the ones related to the last changes made by the developer. The approach selects a suitable and small set of tests to detect potential regression in the application behavior.These approaches need to be studied in the context of Worldline and consequently adapted to suit developers’ habits. Before integrating such an adapted test selection approach, a study of the testing behavior of the developers has been done to get their current test selection usage. Based on the study of the Worldline environment, we developed a tool for the developers aiming to perform test selection.The goal is also to study the impact of this tool on their behavior. We hope that the test selection approach that is packaged in a tool adapted to the Worldline developers will bring a change in their developmentprocess.

Les hypothèses qui sous-tendent les modèles de prédiction de la défaillance d'entreprise ont conduit leurs auteurs à privilégier comme méthodes d'élaboration, celles issues de la statistique et de l'analyse de données. Parmi toutes les méthodes employées – analyse discriminante, régression logistique, arbre de décision, etc. – les réseaux de neurones occupent une place privilégiée depuis une vingtaine d'années en raison de leurs propriétés mathématiques intrinsèques, mais aussi à cause des caractéristiques spécifiques qu'ils confèrent aux modèles. Pour autant, la performance d'un modèle numérique, c'est-à-dire sa capacité prédictive, ne dépend pas simplement de la famille de méthode qui l'a produit. Elle dépend des données employées pour son ajustement. Or, les travaux de recherche réalisés jusqu'à présent se sont appuyés essentiellement sur des variables de convenance, choisies parce qu'elles sont présentes dans les échantillons retenus ou parce qu'elles correspondent à des indicateurs traditionnels associés à la « santé financière » d'une entreprise. L'objet de ce travail doctoral s'inscrit dans cette perspective. Il vise à montrer en quoi les méthodes de sélection de variables adaptées aux réseaux de neurones, fondés sur des heuristiques d'énumération, offrent une alternative utile aux choix arbitraires de ces dernières ; ils permettent d'améliorer le degré de précision dans la prévision d'une défaillance et, grâce à une détection des variables pertinentes, d'approfondir la connaissance du problème traité.

Les intéines sont des éléments protéiques qui sont excisés d'une séquence polypeptidique par un processus autocatalytique appelé épissage. Les intéines monomériques ou dimériques effectuent respectivement des réactions d'épissage intra- et intermoléculaires. L'objectif du travail est de mettre au point une technique pour la création de banques de mutants de grandes tailles en combinant deux banques de fragments protéiques. La protéine monomérique est restaurée par épissage d'une intéine dimérique. Comme les déterminants qui permettent l'épissage des intéines ne sont pas encore bien connus, il a été décidé d'étudier l'épissage d'une intéine introduite dans la bêta-lactamase. Des collections de mutants ont été construites et caractérisées par sélection in vivo. Parmi les clones sélectionnés tolérant l'insertion de l'intéine, mais incapables d'épisser, un grand nombre présentent, à la jonction N-terminale, deux cystéines de part et d'autre de la liaison peptidique à cliver. L'hypothèse est que la liaison entre les deux cystéines se trouve dans une conformation non coplanaire permettant ainsi la formation d'un pont disulfure entre ces deux résidus. Cette conformation est probablement imposée par l'intéine de manière à déstabiliser la liaison peptidique et à favoriser ainsi son clivage dans le mécanisme d'épissage. D'autre part, les mutants capables d'épisser possèdent tous une glycine du côté N-terminal de l'intéine et une sérine du côté C-terminal de l'intéine. Ces deux acides aminés sont donc les seuls requis pour permettre un épissage efficace. Afin de déterminer si l'épissage intermoléculaire est possible, une des enzymes sélectionnées a été fragmentée au niveau de l'intéine. Bien qu'aucun produit d'épissage n'ait été détecté par Western Blot, une faible activité bêta-lactamase in vivo permet de supposer que l'épissage a eu lieu.

De la finance à la climatologie, en passant par les processus industriels, nombreux sont les domaines où on rencontre des séries temporelles. L'analyse, la modélisation et la prédiction de séries temporelles constituent aujourd'hui encore des défis, sur le plan scientifique tout comme dans ces nombreux domaines d'applications. En alternative aux modèles linéaires, les modèles non linéaires sont utilisés ici pour l'analyse, la modélisation et la prédiction de séries temporelles. Les modèles non linéaires sont potentiellement plus performants que les modèles linéaires, mais les questions de sélection de structure de modèle, de prédiction à long terme ou de construction des régresseurs sont plus complexes à résoudre dans le cadre non linéaire. Les paramètres de structure de certains modèles et des méthodes de sélection de structure sont d'abord décrits. La sélection de structure par FastBootrap est complétée par un test statistique qui constitue un argument théorique en faveur de l'approximation par régression linéaire du terme d'optimisme du Bootstrap. La Double Quantification Vectorielle (DQV), modèle de prédiction à long terme de séries temporelles, est introduite. La détermination des paramètres est détaillée, pour des séries scalaires et pour des séries multidimensionnelles auxquelles la DQV peut aisément être appliquée. La stabilité de la DQV en prédiction à long terme est établie théoriquement. Les capacités de la méthode sont illustrées sur divers exemples, en prédiction à court terme, à long terme, en scalaire et en multidimensionnel. La construction du régresseur est abordée lors de l'étude du caractère significatif de l'application des méthodes de clustering à des régresseurs. Une méthodologie de comparaison entre reconstructions de l'espace de phase de séries temporelles est décrite et appliquée sur plusieurs séries. Les résultats obtenus illustrent l'importance du délai dans la construction de régresseurs et permettent de prendre position dans un débat scientifique en cours : l'application des méthodes de clustering à des régresseurs a un sens. La construction du régresseur avec sélection d'un délai unique est alors généralisée au cas de plusieurs délais. Des généralisations des critères d'autocorrélation et d'information mutuelle à plus de deux variables sont proposées. Le critère géométrique de Distance à la Diagonale est également introduit. Tous ces critères de sélection de plusieurs délais sont comparés expérimentalement.

En bioinformatique, un des problèmes très étudiés est la reconstitution des événements évolutifs qui transforment un génome A en un autre génome B. L'ordre des gènes dans les génomes est souvent modélisé par des permutations signées. Dans ce travail, nous définissons des liens entre le problème de tri des permutations signées par inversions et la conservation des structures combinatoires communes aux génomes à comparer. En utilisant les arbres des intervalles forts (Bergeron et al. (3)), nous démontrons que même si le calcul d'un scénario parfait et parcimonieux est difficile (Figeac et Varré (11)), il peut se faire d'une façon efficace pour une grande classe de permutations. Nous avons appliqué ces résultats à la comparaison des chromosomes X de l'humain, de la souris et du rat, basée sur les données de l'article de Gibbs et al. (12). ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Génomique comparée, Scénarios d'évolution, Tri par inversions, Intervalles communs.