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Caracteriza??o qu?mica e testes de atividade biol?gica in vitro em abacaxizeiros silvestresPaix?o, Juliana Azevedo da 23 March 2016 (has links)
Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2017-11-20T21:56:50Z
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DISSERTA??O JULIANA PAIX?O-2016.pdf: 2113185 bytes, checksum: 9e5f3d0a2c6c528f026640900a5db77a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-20T21:56:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2016-03-23 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado da Bahia - FAPEB / Chemical characterization and biological activity tests of plants are important approaches to drug discovery, rational use of elements of our biodiversity in view of the variety of plants reflects the diversity of their secondary metabolites and therapeutic potential. Brazil is an invaluable source of natural resources to obtain drugs, however, little study has been done on the pharmacological potential of native species. The Bromeliaceae family includes about 58 genera and about 3,352 species. Brazil comprises about 40% of the total species with Ananas comosus being the best known. Some plants of this family are used for the treatment of various diseases and there are reports on the presence of secondary metabolites such as triterpenoids, steroids, flavonoids, glycerols, cinnamic acid derivatives and others. This study aimed to know the chemical composition and biological activities of accessions and hybrids of different botanical varieties of Ananas genus in partnership with (EMBRAPA). The leaves of the harvested specimens were dried, ground, and subjected to an extraction procedure with methanol and were pre-selected via the screening and biological screening in order to obtain the best species profile. Three accessions and one hybrid were selected, they were subjected to extraction with methanol, then partitioned with solvents of different polarities. Artemia salina lethality, antioxidants and acetylcholinesterase activity tests were performed. The chromatographic fractionation of the species with better chromatography profile was performed using different techniques. The results revealed that 21 collected accessions have different secondary metabolites, and a wide variation among themselves showing no standard. In relation to biological testing several accessions showed lethality to Artemia salina, antioxidants and acetylcholinesterase activity. The results indicate that extracts of accessions contain active constituents that present such activities confirming its biological potential. As a result of preliminary studies the accessions BGA-739, BGA-804, BGA-820 and hybrid HE were selected for further study, and biological tests were conducted. The BGA- 804 access, chloroform fractions (CL) and ethyl acetate (ACT) has been shown to have high potential antioxidant represented by the EC50 in ?g.ml-1 804-CL (203,5?0,528) e 804-ACT 192,5?0,193, lethality represented by the LC50 in ?g.ml-1 804-CL (69,3?0,47) and 804-ACT (87,7?0,49) and inhibition of the enzyme cholinesterase in % 804-ACT (53.230 ? 4,44). Fractionation, chemical profile by HPLC / DAD and chemical characterization of the BGA-804 access, resulted in the finding of the presence of phenolic compounds, flavonoids and the isolation and identification of daucosterol originating from 804 CL fraction. / Caracteriza??o qu?mica de plantas e testes de atividades biol?gicas s?o abordagens importantes na descoberta de novos medicamentos e para o aproveitamento racional de elementos de nossa biodiversidade, tendo em vista que a variedade de plantas reflete a diversidade dos seus metab?litos secund?rios e seu potencial terap?utico. O Brasil ? fonte inestim?vel de recursos naturais para obten??o de farm?cos, contudo as esp?cies nativas t?m sido pouco estudadas quanto ao potencial farmacol?gico. A fam?lia Bromeliaceae inclui aproximadamente 58 g?neros e cerca de 3.352 esp?cies. O Brasil abriga cerca de 40% do total de esp?cies, sendo a mais conhecida o Ananas comosus. Algumas plantas desta fam?lia s?o utilizadas para tratamento de diversas afec??es e existem relatos da presen?a de metab?litos secund?rios, como: triterpenos, esteroides, flavonoides, glicer?is, derivados do ?cido cin?mico e outros. Este estudo teve como objetivo conhecer a composi??o qu?mica e as atividades biol?gicas de acessos e h?bridos de diferentes variedades bot?nicas do g?nero Ananas, em parceria com (EMBRAPA). As folhas dos esp?cimes coletadas foram secas, mo?das, submetidas ao procedimento de extra??o com metanol e pr?-selecionadas via screening e triagem biol?gica, com a finalidade de obter esp?cies com o melhor perfil. Foram selecionados 3 acessos e 1 h?brido, estes foram submetidos a extra??o com metanol, posteriormente particionados com solventes de diferentes polaridades e realizados testes de letalidade frente ? letalidade frente ? Artemia salina, atividade antioxidantes e anticolinester?sica, o fracionamento cromatogr?fico das esp?cies com melhor perfil foi realizado utilizando diferentes t?cnicas de cromatografia. Os resultados revelaram que os 21 acessos coletados apresentam diferentes metab?litos secund?rios e uma varia??o grande entre si, n?o apresentando nenhum padr?o. Com rela??o aos testes biol?gicos v?rios acessos mostraram letalidade frente ? Artemia salina, atividade antioxidantes e anticolinester?sica. Os resultados obtidos indicam que os extratos dos acessos cont?m constituintes ativos que apresentam tais atividades, confirmando seu potencial biol?gico. Como resultado dos estudos preliminares os acessos BGA- 739, BGA-804, BGA-820 e h?brido HE foram selecionados para continua??o dos estudos, sendo realizado os testes biol?gicos. O acesso BGA-804, fra??es clorof?rmio (CL) e acetato de etila (ACT) demonstrou ter alto potencial antioxidante representado pela EC50 em ?g.ml-1 804-CL (203,5?0,528) e 804-ACT 192,5?0,193, letalidade representado pela LC50 em ?g.ml-1 804-CL (69,3?0,47) e 804-ACT (87,7?0,49) e inibi??o da enzima colinesterase em % 804-ACT (53.230 ? 4,44). O fracionamento, perfil qu?mico por CLAE/DAD e a caracteriza??o qu?mica do acesso BGA-804, resultou na verifica??o da presen?a de compostos fen?licos, flavonoides e no isolamento e identifica??o do daucosterol oriundo da fra??o 804 CL.
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Descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (GH3) por metagenômica de solo de manguezal / Description and characterization of a novel ?-N-acetylhexosaminidase (GH3) by metagenomic mangrove soilSoares Júnior, Fábio Lino 25 August 2015 (has links)
Bactéria e fungos são as principais fontes de enzimas envolvidas na transformação de compostos chave para o fluxo de carbono em solos de manguezal, caracterizado por alta prevalência de anaerobiose, salinidade e elevado teor de matéria orgânica. A decomposição de plantas ou resíduos de animais nestas condições é muito lenta, devido à pressão seletiva sobre a evolução de enzimas envolvidas nos processos de mineralização de nutrientes. A metagenômica, permiti o acesso a grande maioria da diversidade microbiana no ambiente, por meio da geração de bibliotecas de clones, o que resulta em um cenário promissor para bioprospecção de novas atividades enzimáticas. Neste estudo, foi relatada a descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (EC 3.2.1.52) da família GH3, envolvida na degradação da matéria orgânica em solo de manguezal contaminado por derramamento de óleo localizado no município de Bertioga-SP, por meio de uma triagem de 12.960 clones metagenômicos. O clone positivo para a atividade celulolítica foi sequenciado e um total de 1.175.586 reads foram gerados com tamanho médio de 198 pb. As sequencias foram trimadas com base na qualidade de índice PHRED >= 30.0, e remoção de sequencias do hospedeiro (E. coli) e do vetor (fosmídeo), originando um contig final com 39.586 Kb. Entre as ORF\'s anotadas a partir do contig gerado, uma sequencia de 1.065 nucleotídeos foi identificada como codificante para a enzima ?-N-acetil-hexosaminidase, evidenciando baixa similaridade (32 %) com as demais encontradas no bancos de dados comparativos. A enzima foi expressa e purificada, onde uma banda isolada foi visualizada por SDS-PAGE com massa molecular prevista de 43 kDa. Por fim, as atividades ótimas da enzima (30 °C; pH 5.0; 0.5 M de NaCl; diminuição de atividade após 3hs de incubação) foram caracterizadas por meio do indicador p-nitrophenol (pNP) ligados aos substratos GlNac, GalNac e Glc. A detecção da enzima por meio da metagenômica, evidenciou que os manguezais são reservatórios de novas enzimas com características diferenciadas e altos potenciais de aplicabilidades biotecnológicas / Bacteria and fungi are major sources of enzymes involved in the transformation of key compounds for the carbon fluxes on mangrove soils, characterized by the high prevalence of anaerobiosis salinity and high content of organic matter. The decomposition of plant or animals residues under these conditions is very slow, acting as a selective pressure on the evolution of enzymes involved in the mineralization process of nutrients. Metagenomics has provided access to the vast majority of the microbial diversity in the environment through the generation of fosmid libraries, resulting in a promising scenario for bioprospection enzymatic activities. In this study, we report the description and characterization of a novel ?-N-acetylhexosaminidase (EC 3.2.1.52) of GH3 family, involved in the degradation of organic matter in mangrove soils contaminated by oil spill located in the city of Bertioga-SP through of a screening of 12.960 metagenomic clones. The positive clone for cellulolytic activitie was sequenced and a total of 1.175.586 reads were generated with measuring size 198 bp. The sequences were trimmed based on the index of quality PHRED >= 30.0 and removing the sequences to host (E. coli) and vector (fosmid) resulting in a contig of 39.586 Kb. Between the anoted ORF\'s from generated contig a sequence of 1.065 nucleotides was identified coding for a ?-N-acetylhexosaminidase showing low similatrity (32 %) with the other found in comparatives databases. The enzyme was expressed and purified where an isolated band can be visualized by SDS-PAGE with molecular mass of 43 kDa. Finally, as optimum activity of the enzyme (30 °C; pH 5.0; 0.5M NaCl; decreased activity after 3 h incubation) were characterized by the indicator p-nitrophenol (pNP) linked to the substrates GlNac, GalNac and Glc. The detection of the enzyme through metagenomics indicated that mangroves are reservoirs of novel enzymes with different characteristics and high potential for biotechnological applicability
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Descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (GH3) por metagenômica de solo de manguezal / Description and characterization of a novel ?-N-acetylhexosaminidase (GH3) by metagenomic mangrove soilFábio Lino Soares Júnior 25 August 2015 (has links)
Bactéria e fungos são as principais fontes de enzimas envolvidas na transformação de compostos chave para o fluxo de carbono em solos de manguezal, caracterizado por alta prevalência de anaerobiose, salinidade e elevado teor de matéria orgânica. A decomposição de plantas ou resíduos de animais nestas condições é muito lenta, devido à pressão seletiva sobre a evolução de enzimas envolvidas nos processos de mineralização de nutrientes. A metagenômica, permiti o acesso a grande maioria da diversidade microbiana no ambiente, por meio da geração de bibliotecas de clones, o que resulta em um cenário promissor para bioprospecção de novas atividades enzimáticas. Neste estudo, foi relatada a descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (EC 3.2.1.52) da família GH3, envolvida na degradação da matéria orgânica em solo de manguezal contaminado por derramamento de óleo localizado no município de Bertioga-SP, por meio de uma triagem de 12.960 clones metagenômicos. O clone positivo para a atividade celulolítica foi sequenciado e um total de 1.175.586 reads foram gerados com tamanho médio de 198 pb. As sequencias foram trimadas com base na qualidade de índice PHRED >= 30.0, e remoção de sequencias do hospedeiro (E. coli) e do vetor (fosmídeo), originando um contig final com 39.586 Kb. Entre as ORF\'s anotadas a partir do contig gerado, uma sequencia de 1.065 nucleotídeos foi identificada como codificante para a enzima ?-N-acetil-hexosaminidase, evidenciando baixa similaridade (32 %) com as demais encontradas no bancos de dados comparativos. A enzima foi expressa e purificada, onde uma banda isolada foi visualizada por SDS-PAGE com massa molecular prevista de 43 kDa. Por fim, as atividades ótimas da enzima (30 °C; pH 5.0; 0.5 M de NaCl; diminuição de atividade após 3hs de incubação) foram caracterizadas por meio do indicador p-nitrophenol (pNP) ligados aos substratos GlNac, GalNac e Glc. A detecção da enzima por meio da metagenômica, evidenciou que os manguezais são reservatórios de novas enzimas com características diferenciadas e altos potenciais de aplicabilidades biotecnológicas / Bacteria and fungi are major sources of enzymes involved in the transformation of key compounds for the carbon fluxes on mangrove soils, characterized by the high prevalence of anaerobiosis salinity and high content of organic matter. The decomposition of plant or animals residues under these conditions is very slow, acting as a selective pressure on the evolution of enzymes involved in the mineralization process of nutrients. Metagenomics has provided access to the vast majority of the microbial diversity in the environment through the generation of fosmid libraries, resulting in a promising scenario for bioprospection enzymatic activities. In this study, we report the description and characterization of a novel ?-N-acetylhexosaminidase (EC 3.2.1.52) of GH3 family, involved in the degradation of organic matter in mangrove soils contaminated by oil spill located in the city of Bertioga-SP through of a screening of 12.960 metagenomic clones. The positive clone for cellulolytic activitie was sequenced and a total of 1.175.586 reads were generated with measuring size 198 bp. The sequences were trimmed based on the index of quality PHRED >= 30.0 and removing the sequences to host (E. coli) and vector (fosmid) resulting in a contig of 39.586 Kb. Between the anoted ORF\'s from generated contig a sequence of 1.065 nucleotides was identified coding for a ?-N-acetylhexosaminidase showing low similatrity (32 %) with the other found in comparatives databases. The enzyme was expressed and purified where an isolated band can be visualized by SDS-PAGE with molecular mass of 43 kDa. Finally, as optimum activity of the enzyme (30 °C; pH 5.0; 0.5M NaCl; decreased activity after 3 h incubation) were characterized by the indicator p-nitrophenol (pNP) linked to the substrates GlNac, GalNac and Glc. The detection of the enzyme through metagenomics indicated that mangroves are reservoirs of novel enzymes with different characteristics and high potential for biotechnological applicability
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Desenvolvimento de ferramentas de análise de desempenho de atletas em 3 diferentes modalidades = Handebol, Provas Combinadas e Salto com Vara / Development of tools for performance analysis of athletes in three different modalities : handball, combined events and pole vaultRussomanno, Tiago Guedes, 1979- 18 August 2018 (has links)
Orientador: René Brenzikofer / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação Física / Made available in DSpace on 2018-08-18T23:16:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2011 / Resumo: O esporte de alto rendimento não se limita mais à relação entre o técnico e o atleta. A simples observação e percepção subjetiva do técnico e sua intervenção não é mais suficiente como referência para corrigir ou melhorar o nível de desempenho de um atleta. Sendo assim a utilização da tecnologia pode ajudar a melhorar a qualidade das informações referentes ao desempenho de um atleta. Sendo assim o objetivo principal deste trabalho concentra-se na utilização de métodos de avaliação em biomecânica e engenharia de computação, através da integração de diferentes metodologias e no desenvolvimento de métodos de análise de desempenho de atletas, em situações competitivas em três diferentes modalidades: handball, provas combinadas e salto com vara. No handebol foi abordado o problema do rastreamento automático de jogadores, no qual foi proposto e avaliado um detector Boosting em cascata treinado automaticamente, baseado em segmentação morfológica para rastreamento de jogadores de handebol. O método proposto foi capaz de detectar corretamente 84% dos jogadores quando testado no segundo tempo do mesmo jogo onde foi treinado e 74% quando testado em um jogo diferente. Mostrando-se uma ferramenta útil para o rastreamento em modalidades coletivas com perspectivas e possibilidades de ser utilizada em outras modalidades de quadra ou campo. Nas provas combinadas foi abordado um novo sistema de pontuação que avalia uniformemente o desempenho de atletas do decatlo e heptatlo o método apresentado utiliza uma função logaritmo espelhado normalizado que facilita a livre escolha do gradiente (velocidade de crescimento) de acordo com as necessidades da competição. O método é simples, interpretável, uniforme em todos os eventos e pode ser utilizado em diferentes provas combinadas. No salto com vara foi realizada uma análise individual com objetivo de descrever a biomecânica do salto com vara da melhor atleta brasileira e confrontar com as melhores atletas da modalidade focando na energia mecânica do salto com vara, avaliando variáveis cinemáticas e parâmetros energéticos utilizando um sistema de análise cinemática tridimensional. A altura máxima atingida pelo centro de massa da atleta mostrou correlação significativa com a energia Final total (r= 0,82, P<0,01). A energia muscular da atleta brasileira foi de 1,18 ± 0,87 J/kg, enquanto para as atletas durante a final do salto com vara feminino em Sydney foi de 5,74 ±1,63 J/kg. Apesar dos baixos valores de energia muscular a atleta apresenta altos valores de E_Initial e E_Final, com valores médios, respectivamente de 45,96 ± 0,82 J/kg e 47,14 ± 0,71 J/kg. Quando comparada com outras saltadoras com vara que figuram na elite da modalidade, a atleta brasileira é uma das mais velozes, com altos valores de E_Final e E_Initial, o que lhe confere resultados expressivos no circuito mundial e a coloca entre as 5 melhores atletas atuais na modalidade. Em todas as modalidades analisadas levou-se em consideração a especificidade de cada modalidade e as variáveis mais importantes para a avaliação do desempenho dos atletas tendo como foco principal a utilização de recursos computacionais para melhorar a análise do desempenho nessas modalidades / Abstract: The high performance sport is no longer limited to the relation between coach and athlete. Simple observation and subjective perception of the coach and his intervention is no longer sufficient as a reference to correct or improve the performance of an athlete. Therefore the use of technology can help to improve the quality of information about the performance of an athlete. The main objective of this work is the use of evaluation methods in biomechanics and computer engineering through the integration of different methodologies and the development of methods of performance analysis of athletes in competitive situations in three different sports: Handball, combined events and pole vault. In handball was approached the problem of automatic tracking of players, which was proposed and evaluated a detector Boosting cascade automatically trained, based on morphological segmentation for tracking handball players. The proposed method was able to correctly detect 84% of the players when tested in the second half of the same game where he was trained and 74% when tested in a different game. Proved to be a useful tool for tracking in a team sports with prospects and possibilities to be used in other types of court or field games. For combined events we developed a new scoring system that uniformly evaluates the performance of athletes in the decathlon and heptathlon. Our method uses a normalized mirrored-logarithmic function which facilitates the free choice of its gradient (growth speed) according to competition needs.The method is simple, interpretable and even in all events and can be used in different combined events. In the pole vault was made an individual analysis in order to describe the biomechanics of the best Brazilian pole vault athlete and to compare with the best athletes in the world focusing on the mechanical energy of the pole vault, evaluating kinematic variables and energy parameters using a three-dimensional kinematic analysis system. The maximum height reached by the athlete's center of mass showed significant correlation with the final total energy (r = 0.82, P <0.01). The Brazilian athlete's muscle power was 1.18 ± 0.87 J / kg, while for the athletes during the final of the women's pole vault in Sydney was 5.74 ± 1.63 J / kg. Despite the low values of the muscular energy, the athlete has high values of E_Initial and E_Final with mean values of respectively 45.96 ± 0.82 J / kg and 47.14 ± 0.71 J / kg. When compared with other pole vaulter appearing in the elite of the sport, the Brazilian athlete is one of the fastest, with high values of E_Final and E_Initial, which places it among the five best athletes in the sport today. In all modalities analyzed we took into account the specificity of each modality and the most important variables for evaluating the performance of athletes with the main focus the use of computing resources to improve the analysis of performance in these modalities / Doutorado / Biodinamica do Movimento Humano / Doutor em Educação Física
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