Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Arquitetura e Urbanismo, Programa de Pós-Graduação em Arquitetura e Urbanismo, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-06-13T12:47:36Z No. of bitstreams: 1 2013_CaioFredericoeSilva.pdf: 8239045 bytes, checksum: 19b3f54b53f63ad2d13a99173175bbd7 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-06-14T12:19:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_CaioFredericoeSilva.pdf: 8239045 bytes, checksum: 19b3f54b53f63ad2d13a99173175bbd7 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-14T12:19:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_CaioFredericoeSilva.pdf: 8239045 bytes, checksum: 19b3f54b53f63ad2d13a99173175bbd7 (MD5) / Na escala microclimática, o conforto térmico urbano é um dos parâmetros mais importantes para avaliar o grau de qualidade ambiental proporcionado pela configuração urbana. Neste sentido, o objetivo desta tese é compreender a relação entre o gabarito e a distância entre edifícios e o seu impacto no conforto térmico urbano microclimático. Para isto, apresenta-se uma avaliação computacional para o clima da cidade de Brasília, classificado como tropical de altitude. Discute-se aqui qual o grau de fechamento ou abertura dos espaços urbanos, assim como qual a melhor relação entre altura e distância entre edifícios que geram espaços urbanos mais confortáveis. Este grau de fechamento e abertura é controlado por diferentes alturas (height) e afastamentos (wide) das edificações que conformam uma fração do cânion urbano, nesta tese denominada de cavidade urbana. Esta cavidade urbana tem o seu nível de conforto térmico condicionado pelas variáveis: orientação do conjunto edificado, pelo grau de sombreamento projetado pelos edifícios e pelos materiais conformadores da base da cavidade. Para isso, o método de avaliação é apoiado em simulações computacionais desenvolvidas no software ENVI-met, no qual se utilizou o índice do voto médio predito – PMV de conforto para uma análise comparativa entre 42 (quarenta e dois) cenários hipotéticos de cavidades urbanas. As conclusões do trabalho definem para o clima de Brasília três categorias de cavidades urbanas (CVU): CVU1, CVU 2 e CVU3, segundo o seu valor de W/h e o conforto térmico gerado. São recomendados para o clima de Brasília cavidades urbanas com relação W/h entre 1 e 7, respectivamente, as cavidades urbanas 2 e 3. Por fim, destaca-se a efetiva contribuição dos materiais de revestimento do solo para a geração de conforto térmico. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In microclimatic scale, the thermal comfort is a commonly used parameter to assess the level of environmental quality provided by urban configuration. This thesis aims to investigate the relationship between the height and the distance between buildings and their impact on thermal comfort urban. In this regard, this thesis presents a computer evaluation of Brasilia’s climate, classified as tropical of altitude. It is argued which degree of openness or closure of urban spaces, as well as the best relationship among height and distance between buildings can generate more comfortable urban spaces. This degree of openings and closures is controlled by different heights of buildings that engender a fraction of the urban canyon, called in this work as urban cavity. This cavity has its urban level of thermal comfort conditioned by the following variables: orientation of the buildings, the degree of shadowing by buildings or designed with conforming material of the base of the cavity. The evaluation method used is based on computer simulations developed in freeware ENVI-met (developed in University of Bochum by Michael Bruse team), which was used in the index of predicted medium vote (PMV) and forty-two hypothetical types of urban cavity were developed. The conclusions define three categories of urban cavity (CVU) to Brasilia’s climate (CVU 1, CVU 2 e CVU 3), according to their comfort levels and W/h ratio. Finally, presents the contribution of different urban materials in order to improve thermal comfort. _______________________________________________________________________________________ RESUMEN / En escala microclimática, el confort térmico urbano es uno de los parámetros más importantes para evaluar el grado de calidad ambiental proporcionada por el entorno urbano. El objetivo de esta tesis es evaluar la relación entre la altura y la distancia entre los edificios y su impacto en el confort térmico urbano. En este sentido, se presenta una evaluación de cálculo digital para el clima de la ciudad de Brasilia, que se clasifica como tropical de altitud. Aquí se plantea que el grado de apertura o cerramiento de los espacios urbanos, así como la mejor forma de relación entre la altura y la distancia entre los edificios son los responsables por la creación de espacios urbanos más cómodos. Este grado de apertura y cierre se controla mediante diferentes alturas (height) y anchura (wide) de los edificios que componen una fracción del cañón urbano, en esta tesis se llama cavidad urbana. Esta cavidad tiene su nivel de confort térmico urbano definido por las siguientes variables condicionantes: la orientación de los edificios, su grado de sombra proyectada, o materiales de configuración urbana. Para ello, el método de evaluación se apoya en simulaciones por ordenador desarrollados por software ENVI-met, que fue utilizada en el índice PMV (Predicted Medium Vote) para un análisis comparativo de 42 (cuarenta y dos) tipos hipotéticos. Las conclusiones del trabajo para definir el clima de Brasilia tres categorías de cavidades urbanas (CVu 1, CVU 2 e CVU 3), de acuerdo a su grado de confort térmico y su relación W/h. Además se presenta de la contribución de los diferentes materiales urbanos para el confort térmico.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Mecânica, 2006. / Submitted by Alexandre Marinho Pimenta (alexmpsin@hotmail.com) on 2009-11-17T10:01:12Z No. of bitstreams: 1 2006_MarcosMartinsMelo.pdf: 8565470 bytes, checksum: 9c31e01c3283d48d2c5adadf43caa40e (MD5) / Approved for entry into archive by Carolina Campos(carolinacamposmaia@gmail.com) on 2009-11-18T18:28:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_MarcosMartinsMelo.pdf: 8565470 bytes, checksum: 9c31e01c3283d48d2c5adadf43caa40e (MD5) / Made available in DSpace on 2009-11-18T18:28:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_MarcosMartinsMelo.pdf: 8565470 bytes, checksum: 9c31e01c3283d48d2c5adadf43caa40e (MD5) Previous issue date: 2006-07 / O objetivo desta dissertação é implementar uma ferramenta de CAD para a descrição e simulação de Redes de Petri (RdPs) baseadas em software livre, chamada de SimRP. Esta ferramenta de CAD possibilitará a descrição e simulação de diversas RdPs, ou seja, Ordinárias, Temporais, Temporizadas e Interpretadas, além disso, O SimRP disponibilizará a opção de geração de código VHDL (uma linguagem de descrição de hardware), a partir de um modelamento de uma RdP interpretada. Adicionalmente o SimRP permite a verificação de diversas propriedades tais como rede marcada reiniciável, rede marcada viva, rede não pura e detecção de conflitos/deadlocks. Uma característica importante do SimRP é sua flexibilidade, Os usuários poderão descrever uma RdP Ordinária e mais tarde converte-la para outro tipo de rede estudada neste trabalho. Deste modo, os usuários poderão acrescentar atributos a uma RdP ordinária para representar e simular uma RdP Temporal (por exemplo). Estes atributos são facilmente adicionados e deletados pela interface gráfica. O SimRP foi desenvolvido na arquitetura cliente-servidor para garantir a melhor usabilidade/portabilidade. Tanto a instalação quanto a configuração são feitas no servidor. Neste caso, o SimRP necessita apenas de um browser na sua estação de trabalho.O simulador foi desenvolvido baseado na licença GPL, isto permite acesso ilimitado a todas funções do sistema e código fonte, permitindo que os usuários modifiquem e adaptem o sistema de acordo com sua necessidade, sem necessitasse de licença. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this dissertation is to implement a description and simulation CAD tool for Petri Nets (PNs) based on open source, called SimRP. This CAD tool will be able to describe and simulate several PNs namely Ordinary, Temporal, Temporized and Interpreted types. Besides this, SimRP provides an option to generate VHDL code (a hardware description language), taking a model of an Interpreted PN. Additionally, SimRP allows several properties verification such as Restartable PN, Marked-alive PN, Not-pure PN and conflicts/deadlocks detection. An important feature of SimRP is its flexibility, since users can describe an ordinary PN and afterwards converts it to another type of network studied here. Thus, users can add certain attributes to an ordinary PN in order to represent and simulate a Temporal PN (for example). These attributes are easily added/deleted through a graphical interface. The SimRP was developed in client-server architecture in order to guarantee the best usability/portability. Both system installation and configuration are made on a server. In this case, a SimRP user needs only a browser in his/her workstation. Given that the simulator was developed under GPL license, this provides an unlimited use to all of its resources, including source code, allowing any user to use, modify, and adapt it to their needs without license requires.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Decanato de Pesquisa e Pós-Graduação, Instituto de Ciências Biológicas, Instituto de Física, Instituto de Química, 2009. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2010-03-24T18:48:50Z No. of bitstreams: 1 2009_JanduiFariasMendes.pdf: 10236475 bytes, checksum: e23062813e1b7a0359d2def15139dd6d (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-04-23T23:14:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_JanduiFariasMendes.pdf: 10236475 bytes, checksum: e23062813e1b7a0359d2def15139dd6d (MD5) / Made available in DSpace on 2010-04-23T23:14:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_JanduiFariasMendes.pdf: 10236475 bytes, checksum: e23062813e1b7a0359d2def15139dd6d (MD5) Previous issue date: 2009-03 / Este trabalho apresenta os resultados de uma pesquisa sobre a integração entre teoria, simulação computacional com o software Modellus e atividades experimentais, em tópicos de Mecânica. A pesquisa foi realizada com quatro grupos de estudantes do ensino médio. O primeiro grupo realizou somente atividades experimentais e o segundo grupo somente simulação computacional. Nenhuma intervenção foi aplicada ao terceiro grupo (grupo controle) e o último grupo realizou ambas as intervenções (atividades experimentais e simulação computacional). Testes foram aplicados antes e depois das intervenções e questionários de opinião somente depois. Os resultados indicam que para alguns tipos de problemas de Mecânica, as atividades experimentais são mais eficientes no processo de aprendizagem. Em outros tipos de problemas a simulação computacional mostrou-se mais eficiente. Porém, de maneira geral, a combinação de atividades experimentais e simulação computacional mostraram-se mais efetivas no processo de aprendizagem. Os resultados indicam que as atividades com experimentos quando simultaneamente simulados no computador com o software Modellus podem se completar proporcionando, na maioria dos casos, uma evolução conceitual e o aumento na curiosidade e motivação dos estudantes. ________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This work presents results of a research about the integration between theory, computational simulation with Modellus software and experiment, in topics of Mechanics. The research was applied for four high school students groups. The first group carried out only experimental activities and the second group carried out computational simulation. No intervention was applied on the third group (control group) and the last group carried out both interventions (experimental activities and computational simulation). Tests were applied before and after interventions and opinion questionnaires only after. The results indicate that for some problems of Mechanics, the experimental activities can be more efficient. In others problems the computational simulation was more efficient. But, in general, the combination of experimental activities with computational simulation showed to be more significant in the learning process. The set of results indicate that the combination between experimental activities and computational simulation through the use of the Modellus software can promote, in most of the cases, a conceptual evolution and awake the curiosity and motivation of the pupils.

Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Programa de Pesquisa e Pós-Graduação, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-01-23T15:37:14Z No. of bitstreams: 1 2011_MilenaSampaioCintra.pdf: 7094811 bytes, checksum: e7da6430b3340146672ff9568c06e8a1 (MD5) / Approved for entry into archive by Elzi Bittencourt(elzi@bce.unb.br) on 2012-01-26T14:27:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_MilenaSampaioCintra.pdf: 7094811 bytes, checksum: e7da6430b3340146672ff9568c06e8a1 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-01-26T14:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_MilenaSampaioCintra.pdf: 7094811 bytes, checksum: e7da6430b3340146672ff9568c06e8a1 (MD5) / Esta dissertação tem como objetivo investigar a influência de variáveis arquitetônicas no desempenho da iluminação natural, mais especificamente a profundidade dos ambientes e as proteções solares, através de estudos realizados com simulações computacionais dinâmicas, considerando o contexto territorial brasileiro. Assim, este trabalho visa contribuir para as boas práticas na arquitetura, permitindo o desenvolvimento de projetos que garantam um desempenho mínimo da luz natural em edificações residenciais. Os resultados aqui apresentados geraram indicações relativas à bonificação de iluminação natural presentes no Regulamento Técnico da Qualidade do Nível de Eficiência Energética de Edificações Residenciais – RTQ-R (BRASIL,2010). Para isso, o método utilizado incluiu 336 simulações com a ferramenta de simulação dinâmica Daysim,desenvolvidas em duas etapas. Na primeira etapa foram feitas 160 simulações, para 11 cidades, nas orientações norte, sul, leste e oeste, foi definido o desempenho mínimo da luz natural em ambientes residenciais e identificada a profundidade limite do ambiente para garantir estas condições de desempenho. Na segunda etapa foram desenvolvidos três modelos com um tipo de proteção solar cada, para verificar a influência das proteções solares na profundidade limite do ambiente. Os resultados encontrados passaram por uma verificação de sua aplicabilidade, onde os valores da profundidade limite foram examinados em 40 ambientes reais de edificações residenciais localizadas em Florianópolis e Brasília. Os resultados apontam que ambientes com área de abertura de 1/6 da área de piso, sem proteção solar e com refletâncias internas no padrão utilizado na arquitetura (teto 84%, paredes 58% e piso 30%), devem ter uma profundidade limite de 2,57 vezes a altura da janela para garantir uma iluminância 60 lux apenas com iluminação natural, em 70% das horas do ano com luz natural, em 70% da área do ambiente. No caso de ambientes com proteção solar, a profundidade limite do ambiente reduz-se em média 17,9%, passando, portanto, para no máximo 2,11 vezes a altura da janela. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / This dissertation aims to investigate architectural variables that influence on daylight performance, specifically room depth and solar protection, through studies using dynamic computer simulations, considering the Brazilian territorial context. The work aims to contribute to best practices in architecture, allowing the development of projects to ensure a minimum performance of daylight in residential buildings. The results presented here led to the statements concerning the daylight bonus of The Technical Regulation for Energy Efficiency Labelling of Residential Buildings (RTQ-R) (BRAZIL, 2010). The method included 336 computer dynamics simulations with software DaySim that were developed in two stages. In the first stage 196 simulations were made to 11 cities in North, South, East and West orientations, defined minimum daylight performance in residential rooms and identified room depth limit to ensure the conditions for minimum daylight performance. In the second stage three models were developed with different solar protection types, to check the influence of solar protections in the room depth. The applicability of the results have been verifyedin 40 real room of residential buildings located in Florianópolis and Brasília. The results suggest that rooms with aperture area of 1/6 of the floor area without solar protection and standard internal reflectances used in the architecture (84% ceiling, walls 58%, and floor 30%) should have a depth limit of 2,57 times the height of the window to ensure 60 lux with daylight, in 70% of the year with daylight and 70% of the area's room. For rooms with solar protection the depth limit is reduced on average 17,9%, resulting in a maximum depth limit of 2,11 times the height of the window.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Elétrica, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-12-02T12:31:23Z No. of bitstreams: 1 2013_DayalMachadoBrito.pdf: 4276085 bytes, checksum: 9cc971ac74345c3ce4dcff5109e21a24 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-02-21T16:25:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_DayalMachadoBrito.pdf: 4276085 bytes, checksum: 9cc971ac74345c3ce4dcff5109e21a24 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-21T16:25:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_DayalMachadoBrito.pdf: 4276085 bytes, checksum: 9cc971ac74345c3ce4dcff5109e21a24 (MD5) / O presente trabalho se propõe a explorar técnicas que deem um caráter mais dinâmico e inteligente aos protocolos de roteamento ou engenharia de tráfego que existem e são amplamente utilizados no mercado, em razão de seu comportamento um tanto quanto estático frente a mudanças nas condições da rede. Geralmente é necessária a intervenção de um operador humano, o que nem sempre ocorre de forma rápida ou eficaz. Portanto, constitui-se um objeto de estudo válido o acréscimo de inteligência artificial a esses sistemas de modo a avançar nesse sentido. Este trabalho teve como objetivo aplicar um algoritmo de aprendizado por reforço ao protocolo RSVP-TE de modo a permitir a escolha dinâmica e automática do caminho com menor atraso até o roteador de borda de saída da sessão, dentre um grupo de caminhos pré-configurados explicitamente. A ferramenta desenvolvida foi testada em ambiente de simulação e comparada com um algoritmo clássico de roteamento adaptativo, com bons resultados. Mostrou-se que a solução é válida e promissora, podendo passar por ajuste fino de parâmetros para que se consiga um desempenho otimizado e condizente com cada cenário. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The present work has the goal to explore techniques that may add adaptive and intelligent characteristics to the existing routing protocols and traffic engineering tools of today s commercial networks. As these protocols don t generally respond well to changes in the network s performance and quality of service, the intervention of an engineer is often needed. It may not happen, however, in the fastest or most efficient way possible. Thus an interesting subject rises to be studied: the adding of Artificial Intelligence in today s protocols to reach the aimed dynamic response. It was intended in this work to apply a reinforcement learning algorithm to the RSVP-TE protocol to implement a scheme that allows the automatic and dynamic choice of the best path to the edge router at the end of the session, among a pre-configured group of paths. The end-to-end delay in each path is the considered performance parameter. The solution was tested and presented good results, remaining a promising tool for problems of traffic engineering after a fine adjustment of the parameters involved.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Mecânica, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2014-01-14T13:24:54Z No. of bitstreams: 1 2013_LuisAramisdosReisPinheiro.pdf: 16357694 bytes, checksum: 332232d7b814fa243b57d886ead0e6c1 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-02-17T11:58:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LuisAramisdosReisPinheiro.pdf: 16357694 bytes, checksum: 332232d7b814fa243b57d886ead0e6c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-17T11:58:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LuisAramisdosReisPinheiro.pdf: 16357694 bytes, checksum: 332232d7b814fa243b57d886ead0e6c1 (MD5) / O bioma Cerrado ocupa toda a região do Brasil Central e é o ecossistema do tipo savana mais rico do mundo em biodiversidade. Consiste de um mosaico de habitats variados, compreendendo campos abertos, florestas densas e florestas secas. Entretanto, o processo de ocupação humana também o transformou em um dos biomas mais ameaçados com crescentes taxas anuais de desmatamento da ordem de 0,7 % ao ano de 2002 a 2008. Dentre as perturbações ao cerrado destaca-se a cultura do Eucalyptus para fins energéticos e demais usos como aplicações na construção civil, que vem crescendo nos últimos anos, inclusive com incentivos governamentais. No entanto, esses usos causam impactos sobre os fluxos hídricos e de calor dos ambientes alterados. Este trabalho tem por objetivo a caracterização dos fluxos de energia e da evolução da Camada Limite Atmosférica (CLA) para capturar feedbacks entre solo-vegetação-atmosfera. A metodologia se baseou na implementação de estudos de laboratório e campo para estudar os efeitos da substituição da floresta de cerrado por Eucalyptus na dinâmica de trocas de energia entre biosfera e atmosfera a partir da medição de fluxos turbulentos de calor sensível e latente. Foram utilizados para estudos de correlações da resistência estomática, estimada pela equação combinada para cálculo de fluxo de calor latente, com o déficit de vapor de pressão (VPD). Modelos de camadas foram utilizados pra estudar o desencadeamento de chuvas convectivas com análise do cruzamento da altura da CLA (hBL) e do nível de condensação de vapor (hLCL), e da evolução da CLA sobre as florestas. No que concerne a regulação estomática da transpiração notou-se forte correlação entre resistência estomática e VPD nas estações seca e úmida estudadas, especialmente nesta última. Para estação seca, foram observados os maiores valores de resistência ao fluxo devido a estresse hídrico. Observou-se que a evolução e o cruzamentos de hBL e hLCL seguidas de precipitação, caracterizando precipitação do tipo convectiva (com maior influência das condições da superfície), ocorreram nos períodos de transição entre estações de maneira mais consistente que nas estações bem estabelecidas. Sendo assim, fases de transição são mais suscetíveis a serem afetadas a alterações do uso da terra de cerrado para Eucalyptus. Resultados preliminares do modelo indicam que a implantação de Eucalyptus tem efeito na redução da temperatura e altura da CLA e um aumento da razão de mistura de vapor de água na mesma. De modo geral, os modelos apresentaram-se promissores no estudo da evolução da CLA e nos fluxos de calor. Os resultados dos modelos sugerem que a mudança do uso da terra na região com a substituição de cerrado nativo por silviculturas, no caso por Eucalyptus, pode ter influência relevante no comportamento da Camada Limite Atmosférica e na micro-meteorologia local, alterações estas que devem ser consideradas na elaboração de políticas públicas a respeito do tema. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Cerrado biome occupies the entire region of Central Brazil. It is the richest savanna type ecosystem in terms of biodiversity in the world. Consists of a mosaic of different habitats, including open grasslands, dense forests and dry forests. However, due to human occupation process, it also became one of the most threatened biomes with increasing annual deforestation rates of 0.7 % per year from 2002 to 2008. Among the disturbances to cerrado, the culture of Eucalyptus for energy and other uses such as construction, is increasing rapidly even with government incentives. Nonetheless, these uses have impacts on the hydrology and energy exchange of the area. This study aims to characterize the energy flows and the evolution of Atmospheric Boundary Layer (CLA) to capture textit feedbacks between soil-vegetation-atmosphere. The methodology was based on the implementation of laboratory and field studies to investigate the effects of the displacement savanna in favor of Eucalyptus forest in the dynamics of energy exchange between the biosphere and atmosphere from the measurement of turbulent fluxes of sensible and latent heat. The data was used to study correlations of stomatal resistance to latent heat flux (estimate with the use of the combination equation) to the vapor pressure deficit (VPD) through a textit big leaf model. Atmospheric Boudary Layer slab model were used to study the onset of convective rainfall with an analysis of the intersection of the height of CLA (hBL) and the lifting condensation level (hLCL), and evolution of CLA in the forests. Regarding the stomatal regulation of transpiration, it was noted strong correlation between stomatal resistance and VPD in dry and rainy seasons studied, especially for the latter. For the dry season, stomatal resistance was greater due to water stress. It was observed that the evolution and crossings hBL and hLCL, followed by precipitation, characteristic of convective precipitation (with more influence from surface condition), occurred more consistently during transitions between seasons then the well established seasons. So, transitions would be more prone to be affected by the replacement of cerrado to Eucaliptus. Preliminary model results suggest that the implementation of Eucalyptus have the effect of reducing the temperature and height of CLA and an increase in CLA water-vapor mixing ratio. In general, the models have shown to be promising in the study of the evolution of CLA and energy and mass exchange. Model results suggest that the land-use change with the replacement of native cerrado for Eucalyptus, can have a significant impact in the Atmospheric Boundary Layer behavior and in the local micro-meteorology, which should be accounted in elaborating public policies in this field.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-graduação em Biologia Molecular, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-04-11T15:30:57Z No. of bitstreams: 1 2013_MarxGomesVanderLinden.pdf: 9956920 bytes, checksum: f23ee1a3a019a055fc303b9a6d469e9d (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-04-25T12:05:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_MarxGomesVanderLinden.pdf: 9956920 bytes, checksum: f23ee1a3a019a055fc303b9a6d469e9d (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-25T12:05:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_MarxGomesVanderLinden.pdf: 9956920 bytes, checksum: f23ee1a3a019a055fc303b9a6d469e9d (MD5) / Há muito tempo se sabe que estruturas tridimensionais de proteínas são determinadas por suas respectivas sequências de aminoácidos, entretanto as possíveis regras que associam sequências a estruturas continuam em larga medida desconhecidos. A construção de um algoritmo geral para predição ab initio de estruturas proteicas, isto é, uma metodologia que determine computacionalmente a estrutura nativa de qualquer proteína com base em sua sequência de aminoácidos, é possivelmente o maior desafio teórico atual da Biofísica computacional. Esta tese parte da hipótese inovadora de que a única informação dependente de sequência necessária para se determinar a conformação nativa de uma proteína é a distância de cada um de seus átomos até o centro geométrico da estrutura, uma medida que denominamos enterramento atômico. O objetivo principal do trabalho é avaliar a aplicabilidade dessa hipótese através da construção da primeira versão de um método computacional para predição ab initio que utilize os enterramentos como único intermediário informacional entre sequência e estrutura proteica. Nossa metodologia está dividida em duas partes principais: a primeira descreve a construção de um método computacional capaz de realizar predições de enterramentos atômicos a partir de sequências de aminoácidos; a segunda trata de simulações computacionais do enovelamento que utilizam as predições obtidas na primeira parte para obter estruturas terciárias próximas à nativa para algumas proteínas selecionadas. O método computacional que foi desenvolvido neste trabalho para prever os enterramentos atômicos de proteínas a partir de suas sequências de aminoácidos é um algoritmo de aprendizado supervisionado baseado em um modelo oculto de Markov (Hidden Markov Model - HMM). Análises informacionais realizadas sobre os resultados alcançados pelo HMM implementado revelaram que suas predições são ótimas, no sentido de que elas são capazes de extrair praticamente toda a informação sobre enterramentos disponível na sequência, de acordo com o modelo de dados adotado. Na segunda parte do trabalho, um método de dinâmica molecular com um potencial simplificado, que não inclui nenhuma informação derivada da estrutura nativa e utiliza as predições de enterramentos atômicos como base para o único termo dependente de sequência do potencial, foi aplicado a três proteínas pertencentes a diferentes classes estruturais, selecionadas entre os melhores resultados de predição alcançados na etapa anterior. Nos três casos, o algoritmo foi capaz de obter e distinguir a conformação nativa correta em simulações do enovelamento que partiram de conformações completamente estendidas. Os resultados obtidos demonstram que, ao menos para algumas classes de proteínas, os enterramentos atômicos podem de fato atuar como os únicos intermediários informacionais entre sequência e estrutura, fornecendo um novo arcabouço conceitual que esperamos contribuir para a compreensão dos fundamentos do enovelamento proteico e para a investigação do problema da predição estrutural de proteínas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / It has been long known that the three-dimensional structures of proteins are determined by their respective amino acid sequences. The possible rules, however, that associate protein sequences to structures remain at large elusive. The development of an ab initio general algorithm for protein structure prediction, that is, a computational methodology that should be able to determine the native structure of any protein from its amino acid sequence, is possibly the greatest theoretical challenge of current computational biophysics. The premise of this work is based on the innovative hypothesis that the only sequence-dependent information needed to determine the native conformation of a protein is the distance of each of its atoms to the geometric center of the structure, a measure we call atomic burial. Our main objective is to evaluate the applicability of this hypothesis through the development of the first version of a computational method for ab initio prediction that employs burials as the only informational intermediate between protein sequence and structure. Out methodology is divided in two main parts: the first part describes the construction of a computational method to produce atomic burial predictions from amino acid sequences; the second part refers to folding simulations that employ the previously obtained predictions to obtain tertiary structures that are close to the native configuration for selected proteins. The computational method that was developed in this work for atomic burial prediction from amino acid sequences is a supervised learning algorithm based in a Hidden Markov Model (HMM). Informational analyses performed on the HMM results revealed that its predictions are optimal, in the sense that they are capable of extracting almost the totality of the information about burials that is available in amino acid sequences, according to the data model that was adopted. In the second part of this work, a molecular dynamics method with a simplified potential, which does not include any information derived from the native structure and employs atomic burial predictions as its only sequence-dependent term, was applied to three proteins belonging to different structural classes, selected among the best prediction results achieved in the previous step. In all three cases, the algorithm was capable of obtaining and distinguishing the native conformation in folding simulations that started from fully extended conformations. The results achieved in this work demonstrate that, at least for some protein classes, atomic burials are in fact able to act as the sole informational intermediates between sequence and structure, providing a new conceptual framework that we expect to be able to contribute for our knowledge of the fundamentals of protein folding and to the problem of protein structure prediction.

Made available in DSpace on 2018-08-02T00:00:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_3857_DissertacaoMestradoRodrigoStangeTessinari.pdf: 2287913 bytes, checksum: a9148f5a3776cfa58158fe18f66e9858 (MD5) Previous issue date: 2011-08-03 / O cenário atual das redes de telecomunicações, principalmente das redes ópticas, é de mudanças rápidas. Novas tecnologias apresentam um desafio considerável para os pesquisadores envolvidos com a nova geração de redes de alto desempenho, principalmente no que se refere à otimização da infraestrutura atual de fibras ópticas disponíveis nos backbones. As Redes Ópticas de Transporte (OTN – Optical Transport Network), baseadas em multiplexação WDM (Wavelength-Division Multiplexing) e no SONET/SDH (Synchronous Optical NETwork/ Synchronous Digital Hierarchy), consolidam-se como uma tecnologia capaz de responder a esse cenário, cabendo à ITU-T (International Telecommunication Union – Telecommunication Section) fornecer a padronização aos fabricantes de equipamentos e de soluções de redes de transporte. Em suma, devido aos elevados custos envolvidos no desenvolvimento e implantação de novas tecnologias, torna-se essencial o uso de ferramentas de simulação, permitindo reproduzir e comparar resultados de diferentes frentes de pesquisa com maior facilidade. Esta dissertação tem como objetivo geral prover a extensão, adaptação e integração de trabalhos anteriores e em atual desenvolvimento pelo grupo de pesquisa do Laboratório de Telecomunicações (LabTel) na UFES. Esses trabalhos englobam diversas áreas relacionadas com as redes ópticas de transporte, como plano de controle, plano de transporte e a funcionalidade de descoberta automática.

Made available in DSpace on 2018-08-02T00:01:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_2820_TeseDoutoradoWanderleyCardosoCeleste.pdf: 13996359 bytes, checksum: 9fa4cc8db24ddca9e0158dc64bf6e253 (MD5) Previous issue date: 2009-08-05 / Esta tese propõe um sistema autônomo para navegação de cadeiras de rodas robóticas como solução para o problema de locomoção enfrentado por pessoas com deciência motora severa. Ele consiste de um sistema de controle, de um sistema para geração de referências, e de um sistema supervisório. O sistema de controle é formado por um conjunto de controladores cinemáticos responsáveis por realizar tarefas especícas de controle de uma Cadeira de Rodas Robótica (CRR), além de uma compensação dinâmica capaz de adaptar-se a variações do comportamento dinâmico, comuns em CRRs, e de garantir a robustez frente a perturbações não modeladas. É vericado formalmente que todos os controladores envolvidos garantem a estabilidade do sistema como um todo, mesmo quando um dos controladores é trocado por outro (comutação). É possível, assim, a realização de tarefas mais complexas, sob a coordenação do sistema supervisório, tais como seguir um caminho de referência, desviando de possíveis obstáculos, e orientando-se no destino. Tais tarefas são realizadas com o cuidado de preservar a segurança e o conforto do usuário. É proposto, também, um modelo dinâmico parametrizado que descreve a dinâmica do sistema formado pela CRR e seu usuário. Tal modelo permite a formulação de uma lei de compensação que leva em conta uma possível variação da dinâmica do sistema. Resultados de simulações e de experimentos realizados em um protótipo de CRR comprovam o bom desempenho do sistema quando submetido a tais variações. Verica-se, também, que o sistema se comporta muito bem frente a perturbações provenientes de fontes diversas, justicando a existência de uma compensação dinâmica adaptativa e robusta para CRRs.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-07-10T12:41:41Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5721265 bytes, checksum: bf0ae9188b744f67d47948995f8c9cb7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-10T12:41:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5721265 bytes, checksum: bf0ae9188b744f67d47948995f8c9cb7 (MD5) Previous issue date: 2018-03-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Desde a síntese do grafeno em 2004, materiais bidimensionais têm atraído a atenção da comunidade científica e têm sido apontados como promessas para aplicações tecnológicas em diversas áreas. Neste trabalho, aplicamos diferentes métodos teóricos para investigar propriedades estruturais de dobras/bordas e furos de materiais bidimensionais. Desenvolvemos modelos elásticos capazes de descrever a resposta de dobras e bordas de materiais bidimensionais à deformação mecânica. O ajuste do modelo aos dados experimentais permite determinar a energia de coesão entre camadas de materiais bidimensionais (que é um desafio do ponto de vista teórico e experimental) e a dependência da rigidez flexural em função do número de camadas do material. Aplicamos métodos de primeiros princípios baseados na teoria do funcional da densidade e investigamos as propriedades estruturais de furos em grafeno, nitreto de boro hexagonal e em estruturas híbridas destes dois materiais. Mais especificamente, fizemos: (i) a comparação da estabilidade energética de furos em grafeno e nitreto de boro (observando que furos em nitreto de boro são mais estáveis que em grafeno); (ii) a investigação da dependência da energia de formação com o tamanho e forma dos furos (observando que a energia de formação tem uma dependência linear com o perímetro dos furos); (iii) a investigação da energia de formação de grafeno dopado com nitreto de boro hexagonal em grafeno furado (explicando a diminuição linear da energia de formação da monocamada dopada em relação a energia de formação a partir do grafeno perfeito usando um modelo de ligação); e (iv) a investigação dos efeitos de passivação/dopagem de bordas de furos em grafeno por N, B, BN e C- H (observando que a tetravacância dopada com N é mais estável que a tetravacância nativa em grafeno, que a estabilidade da tetravacância é aumentada pela adição de N quaternários e que furos terminados em N são mais estáveis que os passivados com H). Desenvolvemos um modelo de ligação capaz de reproduzir com boa concordância a energia total obtida por cálculos de primeiros princípios em furos em grafeno e nitreto de boro. Este modelo requer uma fração extremamente pequena do tempo requerido para a obtenção da energia via cálculos de primeiros princípios, o que possibilita a investigação da estrutura de furos em uma rede hexagonal usando métodos de Monte-Carlo. / Since the synthesis of graphene in 2004, two-dimensional materials have attracted the attention of the scientific community and have been singled out as promises for technological applications in many areas. In this work, we apply different theoretical methods to investigate structural properties of folds/edges and holes of two-dimensional materials. We developed elastic models capable of describing the response of folds and edges of two-dimensional materials to mechanical deformation. Such models agree quantitatively with results of molecular dynamics and with results obtained by our experimental collaborators through scanning probe microscopy for talc and graphene. The adjustment of the model to the experimental data allows to determine the cohesion energy between layers of two-dimensional materials (which is a challenge from a theoretical and experimental point of view) and the dependence of flexural stiffness as a function of the number of layers of the material. Applying first principles methods based on density functional theory we investigated the structural properties of holes in graphene, hexagonal boron nitride and in hybrid structures of these two materials. More specifically, we have done: (i) comparing the energy stability of holes in graphene and boron nitride (noting that holes in boron nitride are more stable than in graphene); (ii) investigation of the energy dependence of formation with the size and shape of the holes (noting that the formation energy has a linear dependence with the perimeter of the holes); (iii) the investigation of energetic conversion of graphene doped with hexagonal boron nitride into bored graphene (explaining the linear decrease of the conversion energy with respect to formation from the perfect graphene using a bonding model); and (iV) investigating the passivation/doping effects of graphene borehole edges by N, B, BN, and CH (noting that N-doped tetravacavity is more stable than native graphene Stability of the tetra-vacancy is increased by the addition of quaternary N and that N-terminated holes are more table than those with H). We have developed a bonding model capable of reproducing with good agreement the total energy obtained by calculations of first principles in holes in graphene and boron nitride. This model requires an extremely small fraction of the time required to obtain the energy through first principles calculations, which makes it possible to investigate the structure of holes in a hexagonal lattice using Monte Carlo methods.