Orientador: Paulo Yoshio Kageyama / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-06T16:20:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Catharino_EduardoLuisMartins_D.pdf: 11425633 bytes, checksum: 3537186c284e1de05deb8190cc2b7f56 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A Reserva Florestal do Morro Grande localiza-se em Cotia, SP, Brasil, no Planalto de Ibiúna, nos rebordos do Planalto Paulistano, aproximadamente entre os paralelos 23o35 -50 S e 46o50 - 47ºWG. Situada entre cerca de 850-1.050 m de altitude, mantém importante manancial d água da metrópole paulistana e cerca de 10.000 ha de florestas em um grande mosaico sucessional. A maior parte da região possui embasamento cristalino, com xistos e gnaisses pré-cambrianos. Possui atualmente clima temperado com inverno menos seco (Cfb, Köppen), estando localizada em transição climática oceano-continente, nas bordas da bacia terciária de São Paulo. Segundo alguns autores, a região foi recoberta originalmente por florestas atlânticas mistas com pinheiro-do- Paraná. Para outros, faz parte do complexo interiorano da floresta estacional semidecidual. O presente trabalho teve como objetivos gerais caracterizar a RFMG e caracterizar fitogeograficamente as florestas regionais, como subsídios ao seu zoneamento, e como objetivos específicos: i) levantar a composição principal do estrato arbóreo das florestas da Reserva; ii) comparar as florestas secundárias e maduras existentes; iii) verificar as séries sucessionais da regeneração secundária tardia e possíveis espécies indicadoras dos diferentes estágios; iii) servir de testemunha para comparações com fragmentos florestais em áreas contíguas; iv) inferir sobre a importância da conservação das áreas florestais da RFMG. A floresta foi amostrada aplicando o método de pontos quadrantes. Amostraram-se 2.400 árvores em seis diferentes locais. Em cada local amostrou-se 400 árvores em quatro blocos de 25 pontos-quadrante ou 100 indivíduos, distantes 200 m uns dos outros. Três das áreas escolhidas foram localizadas em regiões de florestas secundárias e outras três buscando trechos de florestas maduras, com menor evidência de perturbações antrópicas recentes ou mais conservadas. Foram abertas duas picadas em cada área, totalizando 12 picadas de amostragem, seis em áreas predominantemente secundárias e seis em áreas predominantemente originais ou aparentemente menos degradadas. Posteriormente à escolha das áreas efetuou-se mapeamento da vegetação da Reserva evidenciando-se o mosaico sucessional e as taxas de cobertura de vegetação secundária em estágio médio/avançado ou avançado/primitivo. Os resultados revelaram diferenças entre as áreas e blocos amostrados, relacionadas às alterações antrópicas passadas, realçando a presença de áreas secundárias em estádio médio-avançado e áreas maduras, embora em porções restritas da RFMG. Das 260 espécies arbóreas encontradas, 12 foram amostradas nas seis áreas. A riqueza encontrada foi alta quando comparada a outros levantamentos. Os índices de diversidade de Shannon (H ) situaram-se entre os maiores para as florestas paulistas: 4,75 nats/ind. para a amostragem total; 4,25 para as três áreas secundárias; e 4,54 para as três áreas maduras. A amostra estratificada permitiu verificar a variação interna da floresta, revelando diferenças em riqueza e abundância entre as áreas e os blocos de amostragem, em particular diferenciando as áreas secundárias e maduras, realçadas pelas análises de agrupamento e ordenação. A DCA mostrou-se útil na detecção de espécies características dentro do gradiente sucessional. A floresta pode ser classificada como Floresta Ombrófila Densa Montana atlântica, com presença de espécies de florestas mistas, estacionais semideciduais e cerradão, o que parece confirmar a existência, no local, de um antigo refúgio alto-montano sob condições de climas mais secos no passado, assim como o caráter ecotonal das florestas da região. A riqueza e mistura de elementos de várias floras denotam a importância da conservação da RFMG. Espera-se que este trabalho possa contribuir para o entendimento da flora regional e a conservação da diversidade biológica, fornecendo subsídios para o estabelecimento do plano de manejo da RFMG, além de servir como base em considerações de cunho fitogeográfico e ecológico sobre as florestas do Planalto Paulistano e de Ibiúna / Abstract: The Morro Grande Forest Reserve is located in the municipality of Cotia, state of São Paulo, Brazil, in the Ibiúna Plateau, on the borders of the Paulistano Plateau (ca. 23o35 -50 S and 46o50 - 47ºWG). The Reserve protects an area of 10,000 ha of forest formed by patches of varying successional stages, in an altitude that ranges between 850-1.050 masl. The Reserve is also an important water source for the city of São Paulo. Most of the region is on crystalline basement, with per-Cambrian schist and gneisses. The Reserve is in the ocean-continent climatic transition, in the borders of the tertiary basin of São Paulo, and the local climate is temperate with less dry winter (Cfb, Köppen). According to some authors the region was originally occupied by mixed Atlantic Forest with Araucaria angustifolia. Other authors consider the region part of a seasonal semi deciduous forest complex. This study had the main objective of characterizing the Reserve and the regional forests. Specific objectives were: i) study the tree species composition; ii) compare the old-growth forest patches with successional patches; iii) study late successional stages and characteristic species of different stages; iii) work as a basis for comparison with smaller forest fragments in the region; iv) discuss the importance of the Reserve as a preservation area. Sampling was done using the quadrant method. Two thousands and four hundred trees were sampled in six different sites. In each site four hundred trees were sampled in four blocks of 25 quadrant points or one hundred trees, with 200 m from neighboring blocks. Three sites were located in second growth forest patches while three were located in mature patches. The vegetation was then mapped howing the different successional patches. Results showed differences in sites and blocks, related to human past disturbances. Two hundred and sixty species were found, twelve of them in all six sites. The forest was found to be very species rich. Shannon index (H ) for the different sites was ound to be among the highest for the forest of the state: 4,75 nats/ind. for the Reserve; 4,25 for the hree second growth sites; and 4,54 for the mature sites. Stratified sampling showed the diversity within the forest, showing differences in richness and abundance between sites and blocks, and pecially showing the difference between second growth and mature sites, highlighted by grouping analyses and ordination. A DCA showed the characteristic species within the successional gradient. The forest can be considered as Ombrophyllous Dense Montane Forest, with some species from mixed and seasonal semi deciduous forests and cerradão, which suggests the region as an old high montane refuge under a past drier climate, as well as an ecotone character. The species diversity and the mixture of species of different forest types show the importance of the conservation of the Reserve. This work contributes to the understanding of the regional flora and to biodiversity conservation, to the development of a management plan for the Reserve, and to the understanding of the phytogeographic and ecologic aspects of the Ibiúna and Paulistano Plateaus / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Lichens are the result of an symbiotic interaction between fungus, the mycobiont, and one or more photosynthetic components, the photobionts, which can be a green algae and/or a cyanobacteria. This study aimed to compare the species richness and composition of corticolous crustose lichens in two forest types, Caatinga and Brejo de Altitude, in relation to the influence of biotic and abiotic parameters such as light, bark pH and diameter at breast height (DBH) of the host, and elevation. To collect the lichens two transects of 300 m each were delimited, one per site. Along these transects, sampling points were marked every 10 m, in a total of 30 points per site and 60 points for the whole work. For each of the points, the nearest tree was selected which had a lichen cover at the height of 0.5 m to 1.50 m from the ground on the tree trunk. The species richness and composition for each area were analyzed. Altogether, 576 samples were collected, totaling 96 species of corticolous microlichens. There was no significant difference in species richness between the two areas. With respect to the species composition, the areas were different, but with some common species between them. Comparing the species richness of corticicolous lichens with biotic and abiotic factors, only the diameter at breast height (DBH) of the selected host presented a significant relationship. Relating the composition and biotic and abiotic factors, we had elevation, DBH and vegetation types, canopy openness, influencing the species composition. Thus, the results presented in this study are intended to contribute to the ecological knowledge of lichenized fungi, and enhancing the ecological and lichenological knowledge on Caatinga and Brejo de Altitude. / Os liquens surgem a partir da interação simbiótica entre um fungo, o micobionte, e um ou mais componentes fotossintéticos, fotobiontes, que podem ser algas verdes e, ou cianobactérias. Este trabalho teve como objetivo comparar a riqueza e composição de liquens corticícolas crostosos em duas fitofisionomias, Caatinga e Brejo de Altitude, no semiárido brasileiro, verificando se a riqueza e composição de espécies destes liquens são influenciadas pelos fatores bióticos e abióticos, como luminosidade, pH da casca e diâmetro na altura do peito (DAP) do hospedeiro, e altitude. Para a coleta dos liquens, foram demarcados dois transectos de 300 m, um em cada área de estudo. Ao longo destes transectos foram demarcados pontos a cada 10 m, sendo 30 pontos para cada área, perfazendo um total de 60 pontos. Para cada ponto demarcado, foram adotados como critério de escolha do hospedeiro a maior proximidade do ponto e a presença de talos liquênicos na altura de 0,5 m até 1,50 m em relação ao solo no tronco da árvore. Foram analisadas a riqueza e composição de espécies para cada área. Ao todo, foram coletadas 576 amostras, totalizando 96 espécies de microliquens corticícolas. Não houve uma diferença significativa na riqueza entre as duas áreas. Com relação à composição de espécies, as áreas apresentaram diferença, porém com algumas espécies comuns para as duas áreas. Comparando a riqueza de liquens corticícolas com os fatores bióticos e abióticos, apenas o diâmetro à altura do peito (DAP) do hospedeiro selecionado, apresentou-se de forma significativa em relação à riqueza de espécies de liquens corticícolas. Relacionando a composição de espécies e os fatores bióticos e abióticos, tivemos elevação, DAP e fitofisionomias (local), abertura do dossel, e riqueza influenciando a composição. Desta forma, os resultados apresentados neste estudo visam contribuir para o conhecimento ecológico dos fungos liquenizados, assim como se torna subsídio para outras pesquisas que venham a aprimorar e enriquecer o conhecimento ecológico e liquenológico da Caatinga e Brejos de Altitude.

Made available in DSpace on 2016-02-26T14:53:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MarinaSDalzochio_introducao.pdf: 1819981 bytes, checksum: e9362e59183514801fbdc64609645a51 (MD5) Previous issue date: 2009-03-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The biggest obstacles for the conservation of tropical biodiversity are the lack of information, arising mainly from the lack of inventories of fauna in many areas. Data on distribution and species richness generated in these inventories, can subsidize these conservation plans and management of ecosystem with environmental protection, allowing the establishment of priorities and concentrating efforts on practical actions. These studies have been done particularly to estimates of species richness in highly diverse groups such as the insects. In this context, Odonata has been increasing in recent years as a tool to assess the health of aquatic ecosystems once its wide distribution within the water and it spends long periods in immature stage at the aquatic environment con help in the stability of the community measurement. The Odonata include insects known as dragonflies and generally have about 6 thousand species worldwide. But only 29% of Brazilian territory present data on the wealth of this group. In the state of Mato Grosso do Sul the known fauna of Odonata is about 60 species, with most information on the region of the Pantanal. Unlike other areas of similar importance in the state are poorly known. Serra da Bodoquena is one of the priority areas for conservation in the state of Mato Grosso do Sul, it has the largest natural forests in the State, but little explored yet. In the region, studies with Odonata, are to present a work that showed 55 species of the group associated at northern portion of Serra da Bodoquena. The current work shows the composition and species richness of Odonata in four other lotic systems that bathe the Serra da Bodoquena. These data enhance information about regional Odonata and can support future conservation and management works in the area. Thirty-three species of Odonata were collected and related to patterns of geographical distribution and wealth within the rivers sampled. The data were correlated and subjected to the method of estimation of wealth Jackniffe to 2nd order. Seventeen new records were found, especially five new species. The richness of species ranged between times of collection, sample areas and rivers. The results suggest that the Serra da Bodoquena presents a fauna of Odonata species with heterogeneous distribution of different origins. Also suggest that much of the richness of Odonata is influenced by the diversity of microhabitat for the immature / Um dos maiores obstáculos para a conservação da biodiversidade tropical é a falta de informações, advinda principalmente da ausência de inventários de fauna em muitas áreas. Os dados sobre distribuição e riqueza de espécies gerados destes inventários subsidiam planos de conservação e de manejo em ecossistemas de proteção ambiental, possibilitando o estabelecimento de prioridades e a concentração de esforços em ações práticas. Esses estudos têm sido particularmente em relação a estimativas de riqueza de espécies em grupos altamente diversificados, como por exemplo, os insetos. Neste contexto, Odonata vem se destacando nos últimos anos como ferramenta para se avaliar a saúde de ecossistemas aquáticos já que sua ampla distribuição dentro dos corpos d´água e sua permanência por longos períodos em fase imatura dentro do ambiente aquático permitam mensurar a estabilidade da comunidade. Os Odonata compreendem insetos geralmente conhecidos como libélulas e apresentam cerca de 6 mil espécies em todo mundo. Porém apenas 29% do território brasileiro apresentam dados sobre a riqueza deste grupo. No estado do Mato Grosso do Sul a fauna conhecida de Odonata é de cerca de 60 espécies, com maior parte das informações sobre a região do Pantanal. Ao contrário, outras áreas de semelhante importância no estado são pouco conhecidas. A Serra da Bodoquena é uma das áreas prioritárias para a conservação no Estado do Mato Grosso do Sul, pois abriga a maior extensão de florestas naturais do Estado do Mato Grosso do Sul e pouco explorada neste sentido. Na região, estudos com Odonata, contam até o presente com um trabalho de que indicou 55 espécies do grupo, associados a porção norte da Serra da Bodoquena. O trabalho atual apresenta a composição e riqueza de espécies de Odonata em quatro outros sistemas lóticos que banham a Serra da Bodoquena. Esses dados incrementam informações sobre Odonata regional e podem subsidiar futuros trabalhos de conservação e manejo na área. Trinta e três espécies de Odonata foram coletadas e relacionadas com padrões de distribuição geográfica e de riqueza dentro dos rios amostrados. Os dados obtidos foram relacionados e submetidos ao método de estimativa de riqueza Jackniffe de 2ª ordem. Dezessete novos registros foram detectados, sobretudo cinco novas espécies. A riqueza de espécies variou entre épocas de coleta, áreas amostrais e rios. Os resultados sugerem que a Serra da Bodoquena apresenta uma fauna de Odonata heterogênea com espécies de diferentes origens de distribuição. Sugerem também que grande parte da riqueza de Odonata está influenciada pela diversidade de microhábitats para os imaturos.

As áreas protegidas, tanto públicas quanto privadas, e suas áreas de entorno têm desempenhado um papel relevante na sobrevivência de diversas espécies de mamíferos de médio e grande porte. Por essa razão, este estudo teve como primeiro objetivo estimar a riqueza de espécies de mamíferos de médio e grande porte no interior de três áreas de estudo com diferentes níveis de proteção, assim como nas suas respectivas áreas de entorno. Em segundo, e como principal objetivo deste trabalho, foi estimar as probabilidades de ocupação () e detecção (p) de uma espécie ameaçada, o tamanduá-bandeira (Myrmecophaga tridactyla), assim como avaliar se a ocorrência e o período de atividade dessa espécie são afetados pela presença humana. Todos os dados foram coletados por armadilhas fotográficas em três áreas de estudo no nordeste do Estado de São Paulo. A riqueza de mamíferos de médio e grande porte na região de estudo não é diferente entre as áreas com diferentes níveis de proteção ou entre interior e entorno. Quanto às análises de ocupação (uso), todas as covariáveis que influenciaram foram associadas com atividades humanas, positivamente para estradas e para áreas protegidas, e negativamente para proporção de área urbana. A relação positiva com estradas não pavimentadas é inesperada e pode sugerir que a espécie prefere mover-se ao longo da paisagem usando estradas para minimizar o tempo de viagem ou maximizar o forrageamento em paisagens alteradas. A presença humana não afetou positivamente ou negativamente o uso do espaço pelo tamanduá-bandeira, já que ambos ocorreram de maneira independente um do outro ( = 1). Este achado sugere que a falta de influência resulta em parte das características da paisagem de estudo (pressão de caça aparentemente baixa e uma razoável proporção de habitats nativos ainda presentes e protegidos), do desenho amostral empregado (concentrado em áreas protegidas e nas suas zonas de amortecimento) e, provavelmente, da baixa sobreposição nos períodos de atividades encontrada entre ambas espécies. Portanto, esses resultados indicam que tanto a sobrevivência da comunidade de mamíferos como, especificamente, do tamanduá-bandeira na região de estudo é fortemente dependente tanto das unidades de conservação (UC) como das áreas de vegetação nativas existentes em propriedades privadas protegidas pelo Código Florestal Brasileiro, além dos habitats perturbados no entorno dos grandes remanescentes. Todos os resultados encontrados são importantes para embasar a criação de novas áreas protegidas, assim como para o estabelecimento e manejo de zonas de amortecimento, pois indicam que estas têm papel chave na redução dos efeitos das atividades humanas sobre as UCs e na manutenção de populações viáveis das espécies presentes na região. / Protected areas, both public and private areas, and their surroundings have played an important role in the survival of several species of medium and large mammals. For this reason, this study aimed firstly to estimate the species richness of medium and large mammals within three study areas with different levels of protection, as well as their respective surrounding areas. Second, as the main goal of this study, it was to estimate occupancy () and detection (p) probability of an endangered species, the giant anteater (Myrmecophaga tridactyla), also assess if the occurrence and activity period of this species are affected by human presence. All data were collected by camera traps in three study areas in the northeast of São Paulo state. The species richness is not different between areas with different levels of protection or between interior and surroundings. Regarding occupancy analysis (use), all covariates that influenced giant anteater use were associated with human activities, positively to unpaved roads and protected areas, and negatively to proportion of urban area. The positive relationship with unpaved roads is unexpected and may suggest that giant anteater prefers to move along landscape using roads, perhaps to minimize travelling time or maximize foraging in altered landscapes. The human presence did not affect positively or negatively the use of space by giant anteater, since both species occurred independently of each other ( = 1). This finding suggests that lack of influence results in part from the landscape features of study area (apparently low hunting pressure and a reasonable proportion of native habitats still present and protected), the sampling design applied (focused on protected areas and their buffer zones) and probably due to low overlap between activity periods of both two species. Overall, results indicate that both mammals community and, specifically, giant anteater survivorship in the study region are strongly dependent upon the existence of nature reserves and areas of native vegetation existing in private properties which area protected by the Brazilian Forest Code, as well as the disturbed surrounding. All findings are important to support the creation of new protected areas, as well as the establishment and management of buffer zones, because they indicate that these zones have a key role in reducing the effects of human activities on protected areas and in the maintenance of viable species populations in the region.

A destruição de florestas tropicais é intensa e pode levar à extinção de espécies sensíveis à fragmentação. Na Mata Atlântica, mamíferos com importantes funções no equilíbrio do ecossistema, como Panthera onca (onça-pintada), já estão ausentes em grande parte do bioma. Logo, é de extrema urgência compreender os processos que influenciam na permanência dessas espécies em uma área, para evitar futuras extinções locais. Assim, o objetivo geral deste estudo foi analisar as influências das características ambientais sobre a riqueza e ocorrência de mamíferos terrestres de médio e grande porte e as relações espaço-temporais entre o predador de topo, mesopredadores e presas em uma área de Mata Atlântica contíngua ao Parque Estadual da Serra do Mar com recente histórico de perturbação (Parque das Neblinas, Bertioga, SP). A coleta de dados foi realizada por armadilhamento fotográfico, durante 90 dias em 2013 e 2014, em 27 pontos amostrais, distantes 1 km entre si. As características ambientais avaliadas foram altitude, densidade de drenagem, precipitação média, temperatura média, número de palmitos (Euterpe edulis) e presença de trilhas naturais. Para analisar as influências do ambiente sobre a riqueza e ocorrência de espécies (com mais de três registros por ano) foram utilizados Modelos Lineares Generalizados. Para as demais análises, as espécies foram agrupadas em predador, mesopredadores, presas de grande, médio e pequeno porte. O período e sobreposição de atividade destes grupos foram estimados por meio da densidade de Kernel. A abundância foi estimada para mesopredadores e presas, através de modelos N-mixture. Para analisar a probabilidade de ocupação e detecção do predador de topo foram usados modelos de ocupação single-season. Foram amostrados 18 mamíferos terrestres de médio e grande porte, dos quais nove estão ameaçados de extinção ((Cabassous unicinctus (tatu-de-rabo-mole), Cuniculus paca (paca), Leopardus guttulus (gato-do-mato-pequeno), Leopardus pardalis (jaguatirica), Leopardus wiedii (gato-maracajá), Pecari tajacu (cateto), Puma concolor (onça-parda), Puma yagouaroundi (gato-mourisco) e Tapirus terrestris (anta)). A riqueza de espécies foi positivamente influenciada pelo maior volume de chuvas e a ocorrência da maioria das espécies (C. unicinctus, Dasypus novemcinctus (tatu-galinha), P. concolor, Sylvilagus brasiliensis (tapiti) e T. terrestris) foi influenciada pela densidade de drenagem em 2013. Em 2014, a riqueza não foi explicada por nenhuma característica e apenas quatro espécies sofreram influência de alguma característica ambiental. O predador de topo registrado foi catemeral, os mesopredadores e presas de grande porte mostraram-se mais noturnos e presas de médio e pequeno porte foram mais diurnas. Presas menores apresentaram a maior sobreposição total com o predador (Δ1=0,72). A influência sobre a probabilidade de ocupação da área pelo predador variou entre os anos, tendo sido pela abundância de presas de grande e pequeno porte, em 2013, e pela abundância de presas de médio porte, em 2014. A detecção foi influenciada apenas em 2014, de forma negativa pelas ocasiões. A partir destes resultados foi possível identificar as características ambientais que devem ser mantidas na área, como a disponibilidade de recursos hídricos e abundância de presas, a fim de conservar das espécies resilientes. / The destruction of tropical forests is alarming and may lead to the extinction of species susceptible to fragmentation. In the Atlantic Forest, mammals with important functions in the ecosystem balance, such as Panthera onca (jaguar), are already absent in part of the biome. Therefore, it is urgent to understand the processes that influence the permanence of these species in an area, in order to prevent future local extinctions. Thus, this study aimed to analyze the influence of environmental characteristics on the richness and occurrence of terrestrial mammals of medium and large size; as well as the spatio-temporal relationship between the top predator, mesopredator and preys, in the Atlantic foreste area continuos continuous with Serra do Mar State Park, with recent degradation history (Neblinas Park, Bertioga, State of São Paulo). Sample data was collected by camera trapping for 90 days in 2013 and 2014, 27 sampling points 1km distant from each other. The environmental characteristics were altitude, drainage density, average rainfall, average temperature, number of palm hearts (Euterpe edulis) and the presence of nature trails. Generalized Linear Models were used to analyze the environmental influences on the richness and occurrence of species (with more than 3 records per year). For the other analyses, species were grouped into predator, mesopredators, preys of large, medium and small size. The period and overlap activity of these groups were estimated by the Kernel density. Abundance was estimated for mesopredators and prey through N-mixture models. Single-season occupancy models were used to analyze the probability of occupancy and detection of top predators. A total of 18 terrestrial mammals of medium and large size were sampled, with nine of them being threatened with extinction: Cabassous unicinctus (naked-tailed armadillo), Cuniculus paca (paca), Leopardus guttulus (oncilla), Leopardus pardalis (ocelot), Leopardus wiedii (margay), Pecari tajacu (collared peccary), Puma concolor (cougar), Puma yagouaroundi (jaguarundi) and Tapirus terrestris (tapir). In the 2013, the species richness was positively influenced by the largest volume of precipitation and the species occurrence (C. unicinctus, Dasypus novemcinctus (tatu-galinha), P. concolor, Sylvilagus brasiliensis (tapiti) e T. terrestris) was interfered by the drainage density. In 2014, richness was not explained by any of the environmental characteristics mentioned and only four species have suffered influence of them. The top predator recorded was catemeral, the mesopredator and large prey were mainly nocturnal and prey of medium and small size were mainly daylight. Smaller prey had the highest total overlap with the predator (Δ1=0.72). The influence on the probability of occupancy of the area by the predator varied between the years: in 2013 it was the abundance of large and small preys, and in 2014, the influence was the abundance of medium preys. The detection was negatively influenced by the occasion only in 2014. Our findings showed the environmental characteristics that should be maintained in the area, such as water resources and abundance of prey, for conservation of Atlantic Forest and its fauna community.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-04-01T11:36:22Z No. of bitstreams: 1 thaysdeoliveiradias.pdf: 1461234 bytes, checksum: 9479b441e689c9ee5ebd5d297e617460 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-04-24T03:00:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 thaysdeoliveiradias.pdf: 1461234 bytes, checksum: 9479b441e689c9ee5ebd5d297e617460 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-24T03:00:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 thaysdeoliveiradias.pdf: 1461234 bytes, checksum: 9479b441e689c9ee5ebd5d297e617460 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 / O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento malacológico e investigar a presença, distribuição e avaliar a possibilidade de infecção por Fasciola hepatica em moluscos da espécie Pseudosuccinea columella, em coleções hídricas na microrregião de Juiz de Fora, Minas Gerais, Brasil, nos anos de 2009, 2011 e 2012. O primeiro capítulo apresenta os resultados sobre a composição da malacofauna, com a lista de espécies encontradas e informações sobre a sua distribuição. Foram realizadas coletas em 22 localidades na microrregião de Juiz de Fora, sendo os moluscos coletados através de uma metodologia de coleta direta. Foram encontradas na microrregião de Juiz de Fora 9 espécies de gastrópodes: Melanoides tuberculatus (Müller, 1774) (Thiaridae); Biomphalaria tenagophila (d´Orbigny, 1835); (Planorbidae), Pseudosuccinea columella (Say, 1817) (Lymnaeidae); Stenophysa marmorata (Guilding, 1828), Haitia acuta (Draparnaud, 1805) e Afrophysa brasiliensis (Küster, 1844) (Physiidae); Pomacea sp. (Perry, 1810) (Ampullariidea), Gundlachia sp. (Pfeiffer, 1849) Ancylidae e o pulmonado estilomatóforo Omalonyx sp. (d´Orbigny, 1937) (Succineidae). Um total de 719 moluscos foram coletados, sendo que 29,6% H. acuta, 0,97% S. marmorata, 0,83% A. brasiliensis, 56,8% P. columella, 5,14% B. tenagophila, 5% Gundlachia sp., 0,13% Melanoides tuberculatus e 1,39% Pomacea sp. Dentre estas, quatro são espécies exóticas: M. tuberculatus, P. columella, S. marmorata e H. acuta. No segundo capítulo é registrada a ocorrência de S. marmorata e A. brasiliensis no município de Juiz de Fora, com informações sobre a distribuição e um estudo morfológico detalhado das espécies. O terceiro capítulo apresenta o estudo que teve por finalidade investigar a presença e distribuição e avaliar a possibilidade de infecção por F. hepatica em moluscos da espécie P. columella. As coletas foram realizadas em 22 ecossistemas aquáticos lóticos e lênticos. Foram coletados 409 espécimes em 04 dos 22 pontos de coleta que incluíram córregos, represas, lagos, lagoas e valas de irrigação. O estudo morfológico dos espécimes permitiu a identificação específica P. columella. A pesquisa por formas larvais de trematódeos foi realizada através da técnica de exposição à luz artificial. Nenhum molusco examinado estava infectado. A ocorrência da fasciolose está ligada à presença de moluscos do gênero Lymnaea, neste sentido, é de extrema importância a realização de estudos com o objetivo de monitorar as diferentes regiões do Brasil, onde haja a presença de hospedeiros intermediários e, consequentemente, o potencial para a instalação da doença. O presente trabalho constitui o primeiro estudo sobre a composição da malacofauna límnica na microrregião de Juiz de Fora, Minas Gerais. O levantamento da malacofauna límnica da região é de fundamental importância para o maior conhecimento da ocorrência e distribuição das espécies nativas, além do reconhecimento da presença e distribuição de espécies exóticas e hospedeiras de helmintos, servindo de ponto inicial para o desenvolvimento de estratégias de controle. / The aim of this study was to realize a malacological survey and to investigate the presence, distribution of Fasciola hepatica so as to evaluate the presence of infected individuals of Pseudosuccinea columella in water collections at the micro region of Juiz de Fora, Minas Gerais, Brazil, in the years 2009, 2011 and 2012. In the first chapter, results of species composition are presented, with a list of these species and information about its distribution. The collections were made in 22 localities, being the snails collected by direct collections. It were found 9 gastropod species in Juiz de Fora microregion: Melanoides tuberculatus (Müller, 1774) (Thiaridae); Biomphalaria tenagophila (d´Orbigny, 1835); (Planorbidae), Pseudosuccinea columella (Say, 1817) (Lymnaeidae); Stenophysa marmorata (Guilding, 1828), Haitia acuta (Draparnaud, 1805) e Afrophysa brasiliensis (Küster, 1844) (Physiidae); Pomacea sp. (Perry, 1810) (Ampullariidea), Gundlachia sp. (Pfeiffer, 1849) Ancylidae and the pulmonate stylommatophora Omalonyx sp. (d´Orbigny, 1937) (Succineidae). It were collected 719 snails, being 29,6% H. acuta, 0,97% S. marmorata, 0,83% A. brasiliensis, 56,8% P. columella, 5,14% B. tenagophila, 5% Gundlachia sp., 0,13% Melanoides tuberculatus and 1,39% Pomacea sp. Among these, four are alien species: M. tuberculatus, P. columella, S. marmorata and H. acuta. In the second chapter it was registered the occurrence of S. marmorata and A. brasiliensis in Juiz de Fora, with information on distribution and a detailed morphological study of the species. The third chapter presents a study that aimed to investigate the presence, distribution and to evaluate the possibility of infection by F. hepatica in the freshwater snail P. columella. The collections were realized in 22 in lotic and lentic aquatic ecossystems. It were collected 409 specimens in 04 of 22 collections points that comprised streams, dams, lakes, lagoons and irrigation ditches. The morphological studies of specimens allowed the identification of P. columella. The research of larval forms of trematodes was realized by exposure to artificial light. No infected snails were found. The occurrence of fasciolosis is related to the presence of snails of the genus Lymnaea, in this way, it is important to realize studies in order to monitoring different regions of Brazil were intermediate hosts are found, that are potential areas to the establishment of the disease. The present study is the first study of freshwater malacological composition in the microregion of Juiz de Fora, Minas Gerais. The survey of this fauna in this region is of fundamental importance to the knowledge of occurrence and distribution of native species, besides the recognition of the presence and distribution of native and alien species and helminth hosts, serving as threshold for the development of control strategies.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-09-22T17:41:38Z No. of bitstreams: 1 diegoraymundonascimento.pdf: 613480 bytes, checksum: ce7302e00fa6e5a096bea4bfecad0439 (MD5) / Rejected by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br), reason: Corrigir idioma on 2017-09-27T13:39:48Z (GMT) / Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-09-27T14:00:09Z No. of bitstreams: 1 diegoraymundonascimento.pdf: 613480 bytes, checksum: ce7302e00fa6e5a096bea4bfecad0439 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-09-27T15:21:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 diegoraymundonascimento.pdf: 613480 bytes, checksum: ce7302e00fa6e5a096bea4bfecad0439 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-27T15:21:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 diegoraymundonascimento.pdf: 613480 bytes, checksum: ce7302e00fa6e5a096bea4bfecad0439 (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / A construção de barragens é uma das principais formas em que o ser humano altera os ecossistemas. Entender como reservatórios advindos da barragem afetam florestas tropicais secas é essencial, uma vez que essas florestas estão localizadas em áreas de alto impacto de barragens no mundo. Nosso objetivo foi avaliar até que ponto reservatórios podem afetar mudanças na estrutura, diversidade taxonômica e componentes da diversidade funcional de florestas secas após 10 anos da construção de uma barragem. Em fragmentos de florestas tropicais secas nós apresentamos dados de dinâmica temporal de 120 parcelas permanentes que estavam longe (>700 m) do curso de água antes do represamento, e agora estão na borda (0 to 60 m) do reservatório. Parcelas mais próximas ao reservatório apresentaram um maior aumento na diversidade funcional, mas não apresentaram relações significativas na diversidade taxonômica. Parcelas próximas ao reservatório também apresentaram uma maior diminuição em densidade de madeira (relacionado com alta disponibilidade de água) e uma maior diminuição em área foliar específica e maior aumento de indivíduos com folhas compostas (possivelmente relacionado à maior disponibilidade de luz, criada pela borda do reservatório). Nossos resultados sugerem que reservatórios podem alterar a funcionalidade de florestas tropicais secas ao longo do tempo e evidencia a importância de mais estudos que relacionem essas mudanças com processos demográficos. / Reservoir construction is one of the main ways humans alter ecosystems by damming rivers. Understanding how reservoir dams affect forests is essential once they are usually in the highest impact areas of the world. We aimed to evaluate to what extent an artificial reservoir affected changes in the structure, species diversity and components of functional diversity of a tropical dry forest after 10 years of the dam construction. In the patches of the tropical dry forest we present dynamic data of 120 permanent plots that were far (> 700 m) from the watercourse before damming and are now on the edge of it (0 to 60 m). We evaluated how changes in community structure, taxonomy diversity and functional components were related with distance of the reservoir shorelines. Plots closer to the reservoir showed higher increase in functional diversity but do not showed significant relationships with taxonomy diversity. Plots closer to the reservoir also showed higher decrease in wood density (related to high water availability), higher decrease in specific leaf area, and increase in compoundness (possible due to increase in light incidence due to reservoir edge). Our results suggest that reservoirs can alter functionality of tropical dry forests over time and highlight the importance of more studies relating these changes with demographic process.

Increasing human population size is increasing the demand for resources like timber, oil, tea, coffee, and other crops. Plantation crops mimic some aspects of native habitats, and there are studies that report the presence of some native anuran biodiversity in plantations. I focused on tea plantations in the Western Ghats-Sri Lanka Biodiversity Hotspot and studied the diversity and health of anurans in different habitats found within a tea cultivation area, near Munnar region in the Western Ghats, India. The landscape includes tea bushes, native evergreen shola forest patches, and eucalyptus forest stands. I reviewed 40 studies comparing amphibian species richness in plantations and primary forests. The age of the plantation, type of plantation, presence in a biodiversity hotspot, number of species in the dominant plantation type, number of species in the paired forest habitat, and latitudinal zone of the study, did not correlate with species richness, but plantations that had periodic harvesting had higher species richness than plantations that practiced clear-cut harvesting. I tested different methods of standard amphibian sampling in the field season 2012 in Munnar, and found that Visual Encounter Surveys (VES) in the shola habitat and Stream Transects (ST) were the most efficient. Using the VES and ST methods, I sampled amphibians in three upland habitats (tea, shola, and eucalyptus) at four different sites, and 150m of stream transects at each site, for two consecutive monsoon seasons. Fourteen species were encountered in both years and the community structure was similar across the years. The community structure at the four sites that was driven by the presence of exclusive species at each site and species composition in streams was similar across the landscape and was driven by the presence of similar species in streams across the four sites. Two hundred and sixteen anurans of 17 species, were tested for the presence of the lethal fungus Batrachochytrium dendrobatidis. The preliminary results from the Polymerase Chain Reactions were negative. My study provides baseline data for anuran diversity, composition, and health in the Munnar region of India and results of this project can be compared with tea plantations around the world.

Do thermal barriers limit biotic composition and community similarity, potentially helping to shape biodiversity patterns at continental scales? Are environmental variables responsible for broad-scale patterns of species endemism? Are these patterns predictable? And, how can patterns of endemism can inform global conservation strategies? These are some of the questions that I attempted to answer during my doctoral research. In the first chapter, I tested one of the most contentious hypotheses in ecology: Do thermal barriers, which grow stronger along elevational gradients across tropical mountains, create a dispersal barrier to organisms and consequently contribute to the isolation and divergence of species assemblages? If so, do patterns potentially generated by this mechanism detectably relate to dissimilarity of biotic assemblages along altitudinal gradients across the mountains in the Americas? We found that mountain passes are not only higher in tropical realms, as initially thought by Janzen (1967), and extensively popularized and assumed in further research, but they are also present in temperate regions along the western coast of North America. We also found that the stronger the thermal barrier, the higher the dissimilarity between communities. However, the variance explained was low, suggesting thermal barriers play a minor role in creating and maintaining patterns of biodiversity. The second chapter raises the question of why are there more small-ranged species in some places than in others. I tested four macroecological hypotheses (H1: climate velocity; H2: climate seasonality; H3: climate distinctiveness or rarity; and, H4: spatial heterogeneity in contemporary climate, topography or habitat) to predict broad-scale patterns of species endemism, using a cross-continental validation approach. We found that there is no empirical reason, from the standpoint of model fitting, parameter estimates, and model validation, to claim that any of these hypotheses creates and maintains broad-scale patterns of endemism. Although we found statistically significant relationships, they failed stronger tests of a causal relationship, namely accurate prediction. That is, the hypotheses did not survive the test of cross-continental validation, failing to predict observed patterns of endemism. Climate velocity was dropped from some models, suggesting that early correlations in some places probably reflect collinearity with topography. The effect of richness on endemism was in some cases negligible, suggesting that patterns of endemism are not driven by the same variables as total richness. Despite low explained variance, spatial heterogeneity in potential evapotranspiration was the most consistent predictor in all models. The third chapter is aimed to evaluate the extent to which global protected areas (PAs) have included endemic species (species with small range size relative to the median range size). We measure the relative coverage of endemic species by overlapping species geographic ranges for amphibians, mammals, and birds, with the world database of PAs (1990-2016). Then we measure the rate of expansion of the global PA network and the rate of change in endemic species coverage. We found that ~30% of amphibian, ~6% of bird and ~10% of mammal endemic species are completely outside PAs. Most endemic species’ ranges intersect the PA network (amphibian species = 58%; birds = 83%; mammals = 86%), but it usually covers less than 50% of their geographic range. Almost 50% of species outside the PA network are considered threatened (critically endangered, endangered and vulnerable). We identified that ecoregions in tropical Andes, Mesoamerica, Pacific Islands (e.g., New Guinea, Solomon), Dry Chaco, and Atlantic forests are major conservation priorities areas. The historic rates of new PAs added every year to the network is between ~6,000 to ~15,000. In contrast, we found that rates of including endemic species within the PA network have been fairly slow. Historic data shows that every year, the entire geographic range of 3 (amphibians) to 6 (birds and mammals) endemic species is 100% included inside the PA network (amphibians = from 162 to 233; mammals = 10 to 84; and, amphibians = 16 to 99). Based on these trends, it is very unlikely PAs will include all endemic species (14% total endemic species, that is ~1,508 out of 11,274) currently outside the PA network by 2020. It will require five times the effort made in the last two decades. However, projections also showed that is very likely that some portions of the geographic ranges for all endemic birds and mammals, but not for all endemic amphibians, will be covered by the future PA network. I sum, I found that none of the hypotheses tested here can explain broad-scale patterns of total species richness and total species endemism. My main contribution on this research area is clearly rejecting these hypotheses from potential candidates that may explain biodiversity patterns. By removing them, we advance in this field and open possibilities to test new hypotheses and evaluate their mechanisms. I proposed that other drivers and mechanisms (whether biotic and biotic) acting at local scales, and escaping the detection of macroecological approaches, might be responsible for these patterns. Finally, in terms of conservation planning, I proposed that the international community has an opportunity to protect a great number of endemic species and their habitats before 2020, if they strategically create new PAs.

A key challenge in biodiversity is: How many species are there on earth? This issue is especially acute in poorly surveyed regions with high diversity, particularly Southeast Asia that also experiences many limitations such as lack of funds, documents and experts. To help meet this challenge, I have developed a five-tiered approach for diversity measurement of freshwater fish for use in Thailand. This is: (1) the creation of a newly updated species inventory that uses existing data; (2) exploration of the patterns of species richness, endemism, and uniqueness; (3) estimation of the total species richness; (4) investigation of patterns of rarity; and (5) integration of this knowledge into conservation practice. The system should be applicable to other regions and other taxa where a similar challenge exists. My work shows that eight hundred and seventy-two species in 17 orders, 55 families and 255 genera of freshwater fishes, accounting for roughly 10% of the world's freshwater fish diversity, have been reported for Thailand to date. This number was derived from information in the museum collections, literature and all other available sources, including reports written in Thai as well as in English. During this work I uncovered many gaps in biodiversity information, in terms of taxonomic and spatial records, though some families and basins are better represented than others. Taxonomic uncertainty also continues to be a challenge for taxonomists and users. The high diversity of freshwater fishes in Thailand is the result of both high alpha (α) diversity (diversity within a particular locality) and beta (β) diversity (diversity differences between localities). I concluded that the substantial beta diversity I detected is associated with the geographical separation of the six river basins in Thailand. For example, the species composition of freshwater fishes in the Salween Basin dramatically differs from all other basins of Thailand. In contrast, the Chao Phraya Basin and the Mekong Basin contain the greatest number of shared species. Approximately 55% of species have a wide distribution range (being reported from more than two basins), whereas 45% are highly restricted within a single basin. Analyses using species richness estimators suggest that the figure of 872 species is an underestimate and that there may be between 1000 and 1300 fish species in Thailand, in other words an increase of between 14.7% and 49.1% over the list I compiled (which is itself an increase of 52.2% over the last report in 1997). Freshwater fish have become increasingly vulnerable to anthropogenic activities. Of the 872 Thai fish species, 6.8% and 15.1% are globally and nationally threatened, respectively. Nonetheless, a striking feature of the database is that the conservation status of the vast majority of species has not so far been assessed, either globally or nationally. Scientists and policy makers will find these results useful in appreciating the magnitude of the tasks involved in surveying, describing and conserving the country's freshwater fish biota. My work highlights localities and taxa where conservation is a priority and is thus an important resource for policy makers and conservation planners concerned with the management of freshwater fish in Thailand.