Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3396.pdf: 1502102 bytes, checksum: fd6d26f7010be2711e731c2e16e98353 (MD5) Previous issue date: 2010-11-26 / Financiadora de Estudos e Projetos / The São Francisco river comprises one of the largest and most important river basins of Brazil and one of its main characteristics is the variety of fish species. The genus Salminus (Characiformes: Characidae) constitutes a group of migratory fish with great economic importance in fishing and gastronomy. Within this genus, Salminus hilarii (tabarana), due to its high degree of selectivity for the environment and to occupy the top of the food chain, of great importance to the ecosystem and a good indicator of environmental impacts. Many studies on conservation and population genetics have been conducted using molecular markers such as microsatellites, which can provide data on the genetic processes that are acting in a given population. These markers have relatively conserved flanking sequences, which allows the use of primers that were originally designed for other phylogenetically related species. In this study, nine polymorphic microsatellite loci isolated from Salminus franciscanus were used to assess the genetic variation of S. hilarii collected in three localities in the upper São Francisco river basin, aiming to evaluate the level of genetic variation and identify evidence of population structure, providing support for conservation of this group of fish and contributing effectively to maintain the biodiversity of this ecosystem. The cross amplification results were efficient and were able to identify a relatively high level of genetic variation. Moreover, it was possible to observe the absence of genetic structure between populations, suggesting the occurrence of gene flow between them enough to maintenance of the genetic homogeneity of this populations. These results are important tools, since they can provide information for understanding the behavior and biology of these fish to fisheries management and conservation programs. / O Rio São Francisco compõe uma das maiores e mais importantes bacias hidrográficas do território brasileiro e uma de suas principais características é a variedade da ictiofauna. O gênero Salminus (Characiformes: Characidae), constitui um grupo de peixes migradores com grande importância econômica, na pesca esportiva e na gastronomia. Dentro desse gênero, destaca-se Salminus hilarii (tabarana), devido ao seu alto grau de seletividade pelo ambiente e por ocupar o topo da cadeia alimentar. Isso confere à espécie uma grande importância para o ecossistema e a coloca na posição de uma boa indicadora de impactos ambientais. Muitos estudos sobre genética da conservação e de populações têm sido realizados utilizando marcadores moleculares, tais como os microssatélites, capazes de fornecer dados sobre os processos genéticos que estão atuando em uma determinada população. Esses marcadores possuem sequências flanqueadoras relativamente conservadas, o que permite a utilização de primers que foram desenhados originalmente para outra espécie em espécies filogeneticamente próximas. Assim, utilizando nove locos polimórficos de microssatélites isolados de Salminus franciscanus, o objetivo do presente estudo foi analisar a variação genética de S. hilarii coletados em três localidades na bacia do alto São Francisco e identificar evidências de estruturação populacional, produzindo conhecimentos genéticos aos estudos de conservação deste grupo de peixes e contribuindo de maneira efetiva para a manutenção da biodiversidade desse ecossistema. Os resultados obtidos evidenciaram que a amplificação heteróloga foi eficiente e permitiu identificar uma variação genética relativamente alta na espécie em estudo. Além disso, foi possível observar a ausência de estrutura genética entre as populações, indicando a ocorrência de fluxo gênico entre as populações suficiente para manter a homogeneidade genética entre elas. Esses resultados constituem ferramentas importantes, uma vez que contribuem para o entendimento do comportamento e biologia desses peixes, e para programas de manejo de pesca e conservação da tabarana.

Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2016-09-27T12:23:30Z No. of bitstreams: 1 TeseAGN.pdf: 2192797 bytes, checksum: e995724f0c22f92176dd1473070b69a6 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T20:09:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseAGN.pdf: 2192797 bytes, checksum: e995724f0c22f92176dd1473070b69a6 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T20:09:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseAGN.pdf: 2192797 bytes, checksum: e995724f0c22f92176dd1473070b69a6 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-27T20:09:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseAGN.pdf: 2192797 bytes, checksum: e995724f0c22f92176dd1473070b69a6 (MD5) Previous issue date: 2015-08-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / The Salminus genus is characterized by predatory fish medium to large, migratory and ichthyophagi, very appreciated in fisheries and gastronomy. Among these stands out the Salminus hilarii species, popularly known as tabarana and considered top of the food chain, due to its high degree of selectivity for environments with rich water oxygen which constitutes a good environmental indicator. This species occurs in the São Francisco basins, Paraná basins and Jaguaribe river, and depends on specific hydrological conditions to carry out their reproduction. In this context and because of intense anthropogenic interference that such river systems have suffered, population's study of tabaranas in the upper Paraná basin can contribute to a better understanding of aspects related to its population structure and conservation of their populations. Thus, the aim of this study was to characterize the population genetic structure of S. hilarii at different periods in rivers of the Upper Paraná basin, in order to better understand the population dynamics of fish and effectively contribute to their conservation. It was used for molecular analysis 15 polymorphic microsatellite loci and mtDNA (D-loop). The results revealed the existence of population differentiation among the rivers sampled. Nevertheless, individuals sampled in the Jacaré-pepira river and Cubatão showed no genetic difference, indicating the occurrence of gene flow between populations sufficient to maintain the genetic homogeneity. Moreover, it was possible to identify the temporal structure into the Turvo and Jacaré-pepira river. A high genetic diversity was found in populations of Upper Paraná basin sampled rivers. The D-loop analysis showed no population structure between samples, but indicated the occurrence of a high diversity. The contradictory results may be due to mutational rates of the markers used, since microsatellites have high mutational rate. These results are important for understanding the behavior and biology of these fish, and also to establish fisheries management programs and conservation S. hilarii in the upper Paraná basin. / O gênero Salminus é caracterizado por peixes predadores de médio à grande porte, migradores e ictiófagos, muito apreciados na pesca e na gastronomia. Dentre esses, destaca-se a espécie Salminus hilarii, conhecida popularmente como tabarana e considerada topo de cadeia alimentar, devido ao seu alto grau de seletividade por ambientes com águas ricas em oxigênio o que torna a espécie uma bom indicador ambiental. Essa espécie ocorre nas bacias do São Francisco, alto rio Paraná e do rio Jaguaribe e depende de condições hidrológicas específicas para realizar sua reprodução. Dentro desse contexto e devido à intensa interferência antrópica que tais sistemas hidrográficos vêm sofrendo, estudar populações de tabaranas na bacia do alto Paraná pode contribuir efetivamente para o melhor entendimento de aspectos relacionados à sua estrutura populacional e conservação da espécie. Assim, o objetivo geral deste trabalho foi caracterizar a estrutura genética de populações de S. hilarii em diferentes períodos em rios da bacia do alto Paraná, com o intuito de compreender melhor a dinâmica populacional desse peixe e contribuir efetivamente para sua conservação. Para as análises moleculares utilizou-se 15 locos polimórficos de microssatélites e o mtDNA (D-loop). Os resultados obtidos revelaram a existência de diferenciação populacional entre os rios amostrados. Apesar disso, os indivíduos amostrados no rio Jacaré-pepira e ribeirão do Cubatão não apresentaram diferença genética entre eles, indicando a ocorrência de fluxo gênico entre as populações suficiente para manter a homogeneidade genética. Além disso, foi possível identificar a estruturação temporal dentro do rio Turvo e do rio Jacaré-pepira. Uma alta diversidade genética foi encontrada nas populações dos rios amostrados da bacia do alto Paraná. As análises do D-loop não evidenciaram estruturação populacional entre as amostragens, mas indicou a ocorrência de uma alta diversidade. A contradição dos resultados deve-se as taxas mutacionais dos marcadores utilizados, uma vez que os microssatélites possuem taxas mutacionais elevadas. Esses resultados são importantes para o entendimento do comportamento e biologia desses peixes e, ainda, para estabelecer programas de manejo de pesca e conservação de S. hilarii na bacia do alto Paraná.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-09-22Bitstream added on 2014-06-13T20:48:50Z : No. of bitstreams: 1 takahashi_elh_me_jabo.pdf: 1262645 bytes, checksum: 7dd065f23c1f6fb1a08fe2fc4ebc4fb4 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O ciclo reprodutivo da Tabarana, Salminus hilarii (VALENCIENNES, 1849) foi estudado no rio Sorocaba, estado de São Paulo. Entre abril de 2004 até março de 2006 foram realizadas coletas mensais totalizando 109 exemplares coletados. O período reprodutivo ocorreu entre os meses de novembro e dezembro e foi determinado pela analise do índice Gonadossomático (IGS) e pela determinação dos estádios gonadais em cada bimestre. A desova do tipo total foi constatada pela da análise microscópica dos ovários e distribuição da freqüência do diâmetro dos ovócitos de ovários maduros. A fecundidade foi estimada em 54.157 (DP ± 19.991) ovócitos com os diâmetros não alcançando não mais que 1428 m. Nos ovários foram observados seis tipos de ovócitos: Cromatina-nucléolo, Perinucleolar, Alvéolo-cortical, Vitelogênico, Maduro e Atrésico. Uma escala de maturidade foi construída baseando-se em observações morfológicas tanto macroscópicas quanto microscópicas e também pelo IGS em quatro estádios distintos: Repouso, Maturação, Maduro e Desovado. Nos testículos foram observados cinco tipos de células: Espermatogônia primária, Espermatogônia secundária, Espermatócito, Espermátide e Espermatozóide. A partir de observações macroscópicas e microscópicas foram identificados testículos em estádio de Maturação, Maduro e Esgotado. / Tabarana´s reproductive cycle, Salminus hilarii (VALENCIENNES, 1849) was studied in Sorocaba River, São Paulo state, Brazil. Between april 2004 until march 2006 collections were carried out monthly and 109 specimens were captured. Spawning period occured between november and dezember and was given by gonadossomatic index (GSI) analysis and through determination of the gonadal stages in each two months. Total spawning was noticied by microscopic analysis of the ovaries and oocyte distribution by size-diameter class from mature ovaries. Fecundity was valued in 54.157 (SD ± 19.991) oocytes, with largest diameter reaching no more than 1428 m. Six types of oocytes were observed in ovaries: Choromatin-nucleolus, Perinucleolar, Alveolus-cortical, Vitellogenic, Ripe and Atresic. A maturity scale has been made based in morphological observations as macroscopic as microscopic an either thorugh GSI in four distinct phases: Recovering, Mature, Ripe and Spawned. In the testis were observed five kinds of cells: primary and secondary spermatogonias, spermatocytes, spermatides and spermatozoa. Mature, Ripe and Empty stages were identificated by macroscoy and microscopy analysis.