Les résines végétales sont des sécrétions de végétaux qui ont été utilisées par l’homme de l’Antiquité à nos jours dans de nombreuses applications (pharmaceutique, cosmétique et artistique). Ces exsudats sont composés majoritairement de terpènes. L'identification et la quantification de l'ensemble de ces composés dans les extraits végétaux reste un défi du fait de leur très grande diversité structurale. L’objectif de ce travail a été de développer de nouvelles approches analytiques pour identifier et quantifier les composés terpéniques présents dans ce matériel végétal afin d’en assurer le contrôle qualité et la certification. Deux méthodes séparatives ont été sélectionnées: la TLC et la GC. Pour ces deux techniques on s’est intéressé à toutes les potentialités de leur couplage avec la spectrométrie de masse. Le développement en TLC-1D et TLC-2D a permis le « screening » rapide des résines végétales et la faisabilité du couplage avec le MALDI-TOF-MS a été mise en évidence pour l’identification des marqueurs majoritaires (acides triterpéniques). La GC a permis une caractérisation plus aboutie des résines en mettant en place une méthode d’analyse exhaustive des terpènes des plus volatils au non-volatils. L’optimisation des différentes étapes de la méthodologie GC-MS s’est effectuée en se basant sur la méthode des plans d’expérience ainsi que sur des analyses statistiques tels que l’ACP et la CAH. Dans un souci d’apporter des éléments plus précis pour distinguer les résines les plus proches, la quantification de leurs marqueurs majoritaires a été établie après une validation complète de la méthode GC. L’ensemble de ce travail a permis de développer des outils pour une caractérisation rapide des extraits de résines permettant de différencier les espèces même les plus proches. / Resins are hydrocarbon secretions of many plants and well known for their protective benefits. They have been used as raw materials for a wide range of applications (pharmaceutic, cosmetic and artistic). Plant resins are complex mixtures of organic substances mainly terpenoid compounds which constitute the most abundant and structurally diverse group of plant secondary metabolites. The chemical characterization of this material results in long and difficult separation due to the wide range of polarity and volatility of its constituents. The aim of this work was to develop new analytical approaches to improve the identification of resins certifying their origin and ensuring the quality control. For that purpose two analytical methods were selected: TLC and GC approaches hyphenated to mass spectrometry. TLC-1D and TLC-2D allow a rapid screening and first visual differences of resins. The innovating TLC coupling to MALDI-TOF-MS gives a clear identification of major markers (triterpenic acids). In order to have complementary information about the composition of resins, a gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) method was developed to analyze volatile to non-volatile compounds. The various stages of optimization were based on experimental design and statistical (PCA and HAC) approaches. For closely related resins, a quantitative approach was investigated based on a complete validation for major markers. This work allows the development of two complementary techniques that give a powerful approach for fast and reliable differentiation of various resins even the closest ones.

No description available.

No description available.

El análisis de las heces es una herramienta fundamental para el trabajo de campo, especialmente para identificar la presencia de una determinada especie en un área. Los ácidos biliares fecales y su concentración relativa siguen patrones que son especie-específicos, y pueden ser caracterizados por Cromatografía en Capa Fina (TLC) y Cromatografía Líquida de Alta Performance (HPLC). Estas técnicas han sido utilizadas para diferenciar heces de varias especies de mamíferos, pero nunca en Xenarthra. En esta tesis se identificaron, mediante dichas técnicas, los perfiles de ácidos biliares fecales de 11 especies de Xenarthra, a partir del análisis de 107 heces de diferentes individuos: Zaedyus pichiy (n=10), Chaetophractus vellerosus (n=5), Chaetophractus villosus (n=57), Dasypus hybridus (n=4), Priodontes maximus (n=2), Tamandua tetradactyla (n=14), Myrmecophaga tridactyla (n=4), Tolypeutes matacus (n=8), Euphractus sexcinctus (n=1), Choloepus didactylus (n=1) y C. hoffmanni (n=1). Se encontraron diferencias entre los patrones de ácidos biliares para todas las especies, pero no entre machos y hembras, ni entre animales de cautiverio y silvestres de la misma especie. La TLC resultó ser una técnica útil, de costo relativamente bajo y rápida para el análisis de los perfiles de ácidos biliares fecales. Sin embargo, presentó ciertas limitaciones en la resolución de los ácidos biliares tauroconjugados. La HPLC demostró ser una técnica más resolutiva y sensible que la TLC, permitiendo la separación e identificación de los ácidos biliares tauroconjugados, y de otros compuestos no visualizados por TLC. El 90% o más de los ácidos biliares fueron del tipo VI, con estructura C24. Todas las especies presentaron DHCA, UDCA, CA, GCA, TCA, TDCA y LCA. Los valores de similitud entre los patrones de ácidos biliares fecales reflejaron, en su mayoría, las relaciones filogenéticas establecidas para el Superorden Xenarthra. Se demostró para Xenarthra que la determinación cromatográfica de los ácidos biliares fecales es un método preciso para la identificación específica de heces, por lo que resultaría una valiosa herramienta ecológica. Estos resultados son los primeros para Xenarthra y podrían ser importantes para futuros estudios acerca de la fisiología, ecología y conservación del grupo. / The analysis of feces is a fundamental tool for field work, especially to identify the presence of certain species in an area. Fecal bile acids and their relative concentration follow patterns that are species-specific, and can be characterized by Thin Layer Chromatography (TLC) and High Performance Liquid Chromatography (HPLC). These techniques have been used for differentiating feces of several mammal species; however, it has never been used for Xenarthra species. In this thesis we identified, by those techniques, the fecal bile acid profile of 11 Xenarthra species, by the analysis of 107 feces from different individuals: Zaedyus pichiy (n=10), Chaetophractus vellerosus (n=5), Chaetophractus villosus (n=57), Dasypus hybridus (n=4), Priodontes maximus (n=2), Tamandua tetradactyla (n=14), Myrmecophaga tridactyla (n=4), Tolypeutes matacus (n=8), Euphractus sexcinctus (n=1), Choloepus didactylus (n=1) and C. hoffmanni (n=1). There were differences between the bile acid patterns of all the species, but not between males and females, nor between wild and captive animals of the same species. TLC was a useful, low cost and rapid technique to analyze fecal bile acid profiles. However, it showed some limitations in the resolution of tauroconjugated bile acids. HPLC was more resolute and sensitive than TLC, allowing separation and identification of tauroconjugated bile acids and of other compounds which were not visualized by TLC. 90% or more of the bile acids were of the type VI, with a structure C24. All species presented DHCA, UDCA, CA, GCA, TCA, TDCA and LCA. Similitude values among fecal bile acid profiles of all species reflected, in a great majority, phylogenetic relationships established for the Superorden Xenarthra. We established, for Xenarthra, that chromatographic determination of fecal bile acids is a precise method for specific identification of feces, being a useful ecological tool. These results are the first for Xenarthra and would be important for future studies about the physiology, ecology and conservation of the group.

Darbo tikslas: Optimizuoti plonasluoksnės chromatografijos ir efektyviosios skysčių chromatografijos metodikas, tinkamas alprazolamo, kodeino ir paracetamolio kokybiniam įvertinimui. Tyrimo objektas ir metodai: Optimizuojant PC metodiką, analizuoti etaloniniai 0,2 mg/ml koncentracijos alprazolamo, kodeino, paracetamolio trichlormetaniniai tirpalai ir jų mišinys. Tirpiklių sistemoms buvo naudoti etanolis, trichlormetanas, eteris, 25% amonio hidroksidas, acetonas, izobutanolis. Dėmių ryškinimui naudota UV šviesos (254nm; 365nm) lempa arba Dragendorfo reagentas (modifikuotas pagal Munjė). Optimizuotos metodikos pritaikytos tiriant trichlormetaninius darbinius tirpalus, pagamintus iš vaistinių preparatų „Xanax“, „Paracetamolis Sanitas“ ir „Ultracod“. Siekiant pritaikyti ESC metodiką tiriamųjų junginių analizei, buvo tirti etaloniniai 0,1 mg/ml koncentracijos alprazolamo, kodeino ir paracetamolio metanoliniai tirpalai bei jų mišinys. Medžiagų atskyrimui ir identifikavimui naudotas chromatografas Waters 2695 su fotodiodų matricos detektoriumi Waters 996 (210 – 400 nm bangų ilgio diapazonas). Chromatografavimui naudoti metanolis, 3% acto rūgšties vandeninis tirpalas. Optimizuota ESC metodika pritaikyta tiriant metanolinius darbinius tirpalus, pagamintus iš vaistinių preparatų „Xanax“, „Ultracod“ ir „Solpadeine“. Rezultatai ir išvados: Tinkamiausios tirpiklių sistemos alprazolamo, kodeino ir paracetamolio mišinio kokybiniam vertinimui PC metodu – TS-D (trichlormetanas: acetonas:... [toliau žr. visą tekstą] / Aim: To optimize thin-layer chromatography and high-performance liquid chromatography methods for alprazolam, codeine, paracetamol and their mixture qualitative analysis. Object and methods: For TLC method optimization alprazolam, codeine, paracetamol and their mixture stock solutions (0,2 mg/ml) in trichlormetan were analysed. For mobile phase were used: ethanol, trichlormetan, ether, 25% ammonia hydroxide, acetone, isobutanol. For spots development were used UV light lamp (254nm; 365nm) or Dragendorff reagent (modified by Munje). Optimized methods were tried with pharmaceutical products “Xanax”, “Paracetamolis Sanitas” and “Ultracod” solutions. For HPLC method optimization alprazolam, codeine, paracetamol and their mixture stock solutions (0,1 mg/ml) in methanol were analysed. Chromatograph Waters 2695 with photo diode array detector Waters 996 (210-400 nm wave length) were used for qualitative determination. Analysis was made by using methanol and 3% acetic acid aqueous solution. Optimized method was applied in analysis of pharmaceutical products “Xanax”, “Ultracod” and “Solpadeine” solutions. Results: The best mobile phases for alprazolam, codeine and paracetamol mixture qualitative analysis using TLC is TS-D (trichlormetan: acetone: concentrated ammonia hydroxide (55:40:5)) and TS-F (trichlormetan: ether: isobutanol: concentrated ammonia hydroxide (50:30:15:5)). TS-D and TS-F mobile phases are suitable for examined substances qualitative analysis in mixture and... [to full text]

La plupart des bactéries ont un unique chromosome circulaire. Lors de la réplication de l’ADN, la circularité lie topologiquement les deux chromatides sœurs résultant de la réplication (caténanes et dimères). Ces liens topologiques doivent être résolus afin de permettre une bonne ségrégation de l’information génétique entre les deux cellules filles au cours de la division cellulaire. Les bactéries possèdent une machinerie très conservée: les recombinases à tyrosines XerC et XerD, capables de résoudre les dimères et une partie des caténanes, en catalysant un crossover au site spécifique dif situé dans la région Ter du chromosome. Lors de ce processus elles réalisent successivement deux échanges de brins. La réaction Xer est spatio-temporellement contrôlée par une protéine du divisome: FtsK. FtsK est une translocase qui pompe l’ADN à travers le septum de division. Lorsqu’elle rencontre une synapse constituée de deux sites dif chargés de XerC et XerD, elle active la catalyse de XerD pour initier le premier échange de brins. Dans un second temps XerC catalyse un second échange de brins indépendamment de FtsK. A ce jour le mécanisme d’activation de XerD n’est pas bien compris. Certains éléments mobiles résolvent leur états multimériques (tels que les plasmides) ou intègrent leur génome dans celui de leur hôte en détournant les recombinases XerCD. On parle d’IMEXs (integrative Mobile Element using Xer). Les éléments mobiles étudiés avant ma thèse utilisaient tous des voies de recombinaison initiées par la catalyse de XerC et ne nécessitant pas l’activation de XerD. Au cours de ma thèse j’ai étudié dans un premier temps le mécanisme d’intégration / excision d’une nouvelle classe d’IMEXs en utilisant comme modèle le phage TLCphi de Vibrio cholerae, la bactérie responsable du choléra. Par des approches de génétique j’ai démontré que TLCphi utilise une voie de recombinaison initiée par la catalyse de XerD et indépendante de FtsK. Mes travaux ont également montré que l’excision du phage participe à l’évolution des souches pandémiques de V.cholerae. Dans une seconde partie, j’ai identifié un facteur phagique qui permet à TLCphi de contourner le contrôle de FtsK sur l’activation de XerD. Ce facteur était une protéine de fonction inconnue présentant un domaine HTH et un domaine DUF3653. Ce dernier est retrouvé dans de nombreux IMEXs. Par des approches de biologie moléculaire j’ai étudié le mécanisme d’action de cette protéine. J’ai reproduit la réaction de recombinaison in vitro et démontré qu’elle active XerD en interagissant directement avec elle. Enfin dans un troisième temps, nous nous sommes intéressés aux disparités observées entre la recombinaison Xer chez E.coli et V.cholerae. En particulier, la recombinaison Xer semble agir seulement sur les dimères chez E.coli alors qu’elle est active également sur les monomères chez V.cholerae. Nous avons démontré que ces divergences de comportement ne viennent pas des Xer elles-mêmes, ni de leurs propriétés d'activations par FtsK. Elles résultent des différentes chorégraphies de ségrégation des chromosomes entre ces deux bactéries et dépendent également des vitesses de croissance. / Most of bacteria have a single circular chromosome. During replication of DNA, this circularity can lead to two sister chromatids topologically linked (catenanes and dimers). These topological links have to be solved in order to allow good segregation of genetic information between the two daughter cells during cell division. Bacteria possess a highly conserved machinery: the tyrosine recombinases XerC XerD that are capable to resolve dimers and some catenanes, by catalyzing a crossover at the specific site dif located in the Ter region of the chromosome. During this process they realize two sequentialstrand exchanges.The Xer reaction is spatiotemporally controlled by a protein of the divisome: FtsK. FtsK is a pump that translocates DNA through the septum of division. When FtsK meets a synapse that consists of two dif loaded by XerC and XerD, it activates XerD catalysis that initiates first strand exchange. Secondly XerC catalyzes a second strand exchange independently of FtsK. To date the activation mechanism of XerD is not well understood. Some mobile elements solve their multimeric states (like plasmids) or integrate their genome into the chromosome of their host by using XerCD recombinases. Such integrative elements are named IMEXs (Integrative Mobile Element using Xer). The mobile elements studied before my thesis all used recombination pathways initiated by catalysis of XerC and not requiring activation of XerD .During my PhD I studied at first the integration mechanism / excision of a new class IMEXs using as a model the TLC phage Vibrio cholerae, the bacterium responsible for cholera. By genetic approaches I demonstrated that TLCphi uses a recombination pathway initiated by XerD catalysis and independently of FtsK. My work has also shown that the phage excision participates in the evolution of pandemic strains of V. cholerae. In the second part, I identified a phage factor that allows TLC to bypass the activation of XerD by FtsK. This factor was a protein of unknown function with a HTH domain and a DUF3653 domain. DUF3653 are found in many IMEXs. Using molecular biology approaches, I studied the mechanism of action of this protein. I reproduced the recombination reaction in vitro and demonstrated that this factor activates XerD by directly interacting with it. Finally, we were interested to study disparities between Xer recombination in E.coli and V.cholerae. In particular, the Xer recombination seems to act only on dimers in E.coli while it is also active on monomers in V.cholerae. We have demonstrated that these differences in behaviors do not come from Xer themselves or their activation by FtsK. They result from different choreographies of chromosome segregation between these two bacteria and are also dependent on growth rates.

Les enzymes et leur diversité d’actions sont appréciées dans des domaines d’applications variés allant del’agroalimentaire à la thérapeutique. Ainsi, une attention toute particulière est portée à leur étude afin d’améliorer uneaction (contre le vieillissement de la peau, antivirale, anticancéreuse…) ou un procédé de synthèse. Ce projet derecherche s’inscrit dans une démarche de développement d’outils analytiques basés sur la spectrométrie de masse,permettant le suivi rapide et sensible d’interactions enzyme-ligand.Dans une première étude, l’approche TLC couplée à une détection par UV a été évaluée pour la déterminationde constantes enzymatiques de l’enzyme invertase. Cette approche couplée à un MALDI/TOF MS a permis d’identifierdes substrats spécifiques de l’invertase au sein d’extraits de plantes. Pour preuve de concept, l’interactioncellobiohydrolase II–ligand est présentée dans le cadre de l’identification d’inhibiteur par TLC-MALDI/TOF et TLCENALDIMS.En seconde étude, nos travaux ont porté sur la caractérisation directe de différentes enzymes kinases, puis auxsuivis des réactions de phosphorylation de nucléosides /tides endogènes. Ces études, basées sur des approches « offline» (Flow Injection Analysis, FIA) et « on-line » (Frontal Affinity Chromatography, FAC) couplées à unspectromètre de masse haute résolution, ont été réalisées au moyen de ces kinases libres et immobilisées. Dans le cadrede la recherche de nouveaux candidats médicamenteux antiviraux, le suivi d’une phosphorylation spécifique desmolécules de synthèse, au regard de souches humaine ou virale de kinase, a également été évalué par ces deuxméthodologies. / Enzymes are very appreciated and useful in various application fields from agri-business to therapeutic due to theirdiversity of actions. Therefore, their action mechanisms are widely studied in order to enhance an action (anti-aging ofskin, antiviral, antitumorous) or a synthesis process. This research project is part of the approach to propose analyticaltools based on mass spectrometry, allowing rapid and sensitive follow-up of enzyme-ligand interactions.In a first study, the Thin-Layer Chromatography (TLC) approach coupled with UV detection was evaluated forthe determination of invertase kinetic constants. This approach coupled with a MALDI / TOF-MS led to theidentification of invertase substrates in plant extracts. As a proof of concept, the cellobiohydrolase II - ligand interactionwas presented in the framework of the identification of inhibitor by TLC-MALDI / TOF and TLC-ENALDI MS.In the second study, our work aimed at developing a direct method for the determination of kinetic parametersof kinases and following-up the phosphorylation reactions of endogenous nucleosides / tides. These studies, based on“off-line” (Flow Injection Analysis, FIA) and “on-line” (Frontal Affinity Chromatography, FAC) approaches coupledwith a high-resolution mass spectrometer, were carried out using free and immobilized kinases. In the context of thesearch for new antiviral drug candidates, a specific phosphorylation of synthetic molecules regards to human or viralkinase was also evaluated by these both approaches.

Poco se ha estudiado sobre la adquisición de tejidos para la fabricación de prendas en Perú, pese a ser una actividad fundamental dentro del sector. En este sentido, no se ha abordado antes el análisis de los factores decisorios para su compra; por lo que consideramos relevante la realización del presente estudio. Para contextualizar nuestro tema, en el primer capítulo, se analiza el desarrollo y evolución del sector textil a nivel mundial; las importaciones de tejidos desde China a Perú, particularmente la subpartida nacional 6004100000; y la situación actual del Tratado de Libre Comercio con China y sus implicancias para la subpartida en cuestión. En el segundo capítulo, se propone una investigación de método inductivo bajo un enfoque cualitativo, en donde se exponen los objetivos, problemas e hipótesis de esta; así como también, los grupos de actores considerados: importadores, proveedores y/o fabricantes; sector público; expertos y gremios. Como parte del levantamiento de información, se realizaron entrevistas semiestructuradas. En el tercer capítulo, se detallan y analizan los resultados de las entrevistas. En el cuarto capítulo, presenta el procesamiento de la información levantada y se exponen los hallazgos. También, se especifican las limitaciones y brechas de información en la investigación, y las futuras líneas de estudio que nacen a partir de ella. Finalmente, en el quinto capítulo, se concluye que los principales determinantes en la decisión de compra son la mayor variedad de tejidos y precios más competitivos de China; además, se presentan las recomendaciones de la investigación. / Little has been studied on fabric acquisition for garment manufacturing in Peru, despite being a fundamental activity within the sector. In this sense, the analysis of the decision factors for its purchase has not been addressed before; reason why we consider the realization of this study relevant. To contextualize our topic, in the first chapter, we analyze the development and evolution of the textile sector worldwide; fabric import from China to Peru, particularly the national subheading 6004100000; and the current situation of the Free Trade Agreement with China and its implications for the subheading in question. In the second chapter, an inductive research method is proposed under a qualitative approach, and its objectives, problems and hypotheses are exposed; as well as, the groups of relevant actors: importers, suppliers and/or manufacturers; public sector, experts and guilds. As part of the information gathering, semi-structured interviews were conducted. In the third chapter, the interviews’ results are detailed and analyzed. In the fourth chapter, we present the information processing. Limitations and information gaps on this study are specified; as well as, future research opportunities based on it. Finally, in the fifth chapter, it is concluded that the main determinants in the purchase decision are the larger variety of fabric and the more competitive prices from China; besides, the recommendations of the investigation are presented. / Tesis

This research was initiated after a 100-year flood caused an oil spill on the San Jacinto River (Houston, Texas) in October of 1994. After the floodwaters subsided the released petroleum floating on the water was deposited on the surrounding lands. The petroleum spill was used as an opportunity to research intrinsic petroleum biodegradation in a 9-acre petroleum impacted estuarine wetland. The first phase of this research (Phase I) began in December 1994, approximately 1.5 months after the spill of opportunity and involved the study and quantification of in-situ petroleum biodegradation. The second phase of the research (Phase II) began in March 1996 with a controlled oil release to study and evaluate the success of two bioremediation treatments versus natural biodegradation. The study of in-situ petroleum hydrocarbon degradation and the evaluation of bioremediation amendments were successfully quantified using GC-MS analytical techniques. However, the GC-MS technique is limited to the analyses of hydrocarbon compounds, a disadvantage that precludes the overall characterization of petroleum degradation. The research presented here details an analytical technique that was used to provide a full characterization of temporal petroleum biodegradation. This technique uses thin layer chromatography coupled with flame ionization detection (TLC-FID) to characterize the saturate and aromatic (hydrocarbon) fractions and the resin and asphaltene (non-hydrocarbon, polar) fractions. Other analysis techniques, such as HPLC-SARA analysis, are available for the full characterization of the four petroleum fractions. However, these techniques do not lend themselves well to the application of large sample set analysis. A significant advantage of the TLC-FID analysis to other petroleum analysis techniques is the ability to analyze several samples concurrently and quickly with relative ease and few resources. For the purposes of the Phase I and Phase II research the TLC-FID analysis method was evaluated, refined and applied to quantify the temporal biodegradation and bioremediation of petroleum. While the TLC-FID analysis produces a full characterization, it cannot supplant the GC-MS analysis for petroleum bioremediation research. However, it can be used in conjunction with the GC-MS to expand the knowledge of petroleum bioremediation and remediation strategies.

none