1 |
Caracterização das unidades produtivas com tomate estaqueado na bacia do Rio das Pedras (Moji Guaçu/SP)Pereira, Leda Belitardo de Oliveira 03 August 2018 (has links)
Orientador: Mauro Jose Andrade Tereso / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-08-03T16:36:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Pereira_LedaBelitardodeOliveira_M.pdf: 198528 bytes, checksum: e9639acf0f2c79e3c49e6af1e0e53ba5 (MD5)
Previous issue date: 2001 / Mestrado
|
2 |
Purificação e serologia do virus do mosaico dourado do tomateiro (VMDT)Garcia, Sara Polido 18 December 1980 (has links)
Orientador : Avelino Rodrigues de Oliveira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T17:34:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Garcia_SaraPolido_M.pdf: 2495523 bytes, checksum: abc0b1d0f7ad966722417f684c3d617d (MD5)
Previous issue date: 1980 / Resumo: Cinco técnicas de purificação do vírus do mosaico dourado do tomateiro (VMDT) foram testadas, visando obter antígenos para o preparo de antissoros específicos. As técnicas empregadas foram xilol, tetracloreto de carbono, eliminação dos cloroplastos e polietilenoglicol. A avaliação da eficiência dessas técnicas, através de testes de infectividade das frações finais, observações ao microscópio eletrônico e testes serológicos comos antissoros preparados, mostrou que polietilenoglicol é técnica adequada para os fins propostos. Frações do VMDT purificado segundo a técnica do polietilenglicol mostraram-se ativas biologicamente nos testes de inoculação mecânica em plantas de Nicotiana glutinosa L. e N. tabacum L. e exibiram alta concentração de partículas com diâmetro em torno de 14 nm. Antissoros preparados com essa fração apresentaram, em testes de dupla difusão em agar, linha de precipitação que permite diagnosticar a presença do VMDT em hospedeiras de N. glutinosa e N. tabacum / Abstract: In order to prepare specific antisera to the tomato golden mosaic virus (TGMV), a whytefly-transmitted agent, five purification methods were tried. The techiques used in this work were: xylol, carbon tetrachloride, butanol, chloroplasts elimination, and polyethylene glycol. Bio-assays and serological tests have shown that the polyethylene glycol technique was the best for purification. It was carried out, as follows: infected leaves of Nicotiana glutinosa L. And N. Tabacum L. Were homogenized in 0.02M potassium phosphate buffer at pH 7.0 plus 0.02M Na2SO3; the clarification was carried out with 7% chloroform combined with n-butanol and TGMV precipitated with 10% PEG (Carbowax-6.000)-0.25M NaC1, followed by low-speed centrifugation. TCMV is an immunogenic virus type and double diffusion tests performed with purified preparations against their antisera showed a precipitin line (line b), seen in Fig. 5,6 / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Ciências Biológicas
|
3 |
Características agronômicas e alterações bioquímicas do tomateiro em funções do uso de Bacillus subtilis em sistema de cultivo orgânicoObrzut, Vanessa Vani January 2016 (has links)
Orientador : Prof. Dr. Átila Francisco Mógor / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Defesa: Curitiba, 13/07/2016 / Inclui referências : f. 19-23;49-51 / Área de concentração: Produção vegetal / Resumo: O tomate (Solanum lycopersicum L.) ocupa posição importante no setor de olericultura, tem demanda frequente e mundial e retorno econômico considerável. Também existe a busca dos consumidores por produtos mais saudáveis, ou seja, cultivados em sistemas sustentáveis sem ou com o mínimo resíduo químico possível. Como opção para atender a esses requisitos associam-se as bactérias como métodos alternativos aos agroquímicos e nesse estudo, especificamente, a espécie Bacillus subtilis que já mostrou resultados promissores em sistema de produção orgânica. Foram conduzidos dois experimentos na Área de Olericultura Orgânica da Universidade Federal do Paraná (UFPR), no município de Pinhais - PR em duas safras 2013/2014 e 2014/2015. Utilizou - se duas cultivares de tomate tipo italiano, Cardyna e Trinidade, em ambos os experimentos. O primeiro experimento teve com objetivo avaliar a influência de B.subtilis em crescimento inicial e o delineamento experimental foi totalmente casualizado em arranjo fatorial com 3 formas de aplicação da bactéria: semente; rega; testemunha que não recebeu aplicação; nas duas cultivares de tomate tipo italiano. Foram avaliadas as variáveis massa fresca e seca de folhas, caules e raízes também parte área. O segundo experimento teve como objetivo avaliar a influencia da bactéria na produção e as alterações bioquímicas no tomateiro, o delineamento experimental foi totalmente casualizado em arranjo fatorial em 4 formas de aplicação da bactéria: rega; pulverização foliar; rega + pulverização foliar; testemunha sem aplicação; nas duas cultivares de tomate tipo italiano. As variáveis de produção analisadas das plantas adultas foram: diâmetros equatorial e longitudinal dos frutos, massa média de frutos e produção média por planta. As análises bioquímicas foram: clorofila, açúcares, aminoácidos, compostos fenólicos, flavonoides, proteínas, fenilalanina amônia-liase, quitinase e ? 1,3 glucanases. Os resultados demonstram que B.subtilis estimulou o crescimento inicial de plantas de tomateiro incrementando valores de massa fresca, seca e parte aérea quando aplicado como rega, apresentando interações com o genótipo de cultivares utilizadas. A bactéria B.subtilis, não influenciou a produção das cultivares 'Cardyna' e 'Trinidade' em safras sucessivas. Entretanto estimulou a produção de pigmentos relacionados com a fotossíntese, clorofila a, b, total e carotenoides, apresentando interações com os genótipos quanto ao acúmulo de açúcares redutores e não redutores e proporcionou o incremento das enzimas fenilalanina amônia-liase, quitinase e ? 1,3 glucanases, relacionadas à defesa das plantas sem que houvesse custos na produção. As formas de aplicação apresentaram interação com o genótipo e com a variável analisada. Palavras chave: Solanum lycopersicum L, bactérias promotoras do crescimento de plantas, biofertilizantes, sustentabilidade. / Abstract: Tomato (Solanum lycopersicum L.) occupies an important position in the horticulture industry, has frequent and global demand and considerable economic returns. There is also the search consumers for healthier products, cultivated in organic systems without or with minimum chemical residue. As an option to meet these requirements there are bacterias as alternative methods to pesticides and this study specifically, the Bacillus subtilis species that has shown promising results in organic production system. Two experiments were conducted in the Organic Vegetable Crops Area of the Federal University of Paraná (UFPR), in the city of Pinhais - PR in two seasons 2013/2014 and 2014/2015. It used two Italian type tomato cultivars, Cardyna and Trinidade, in both experiments. The first experiment was to evaluate the influence of B. subtilis in initial growth and the experimental design was completely randomized in a factorial arrangement with 3 application forms of bacteria: seed; irrigation; control who did not receive the application; the two Italian type tomato cultivars. The variables fresh and dry weight of leaves, stems and roots also aerial parts were evaluated. The second experiment was to evaluate the influence of bacteria in the production and biochemical changes in the tomato, the experimental design was completely randomized in a factorial arrangement 4 application forms of bacteria: irrigation; foliar spray; Irrigation + foliar spray; control without application; the two italian type tomato cultivars. Production variables of adult plants were equatorial and longitudinal diameters of fruit, average fruit weight and average yield per plant. Biochemical analyzes were chlorophyll, sugars, amino acids, phenolic compounds, flavonoids, proteins, phenylalanine ammonia-lyase, chitinase and ?-1,3-glucanases. The results showed that B. subtilis stimulated the initial growth of tomato plants increasing values of fresh, dried weight when applied as irrigation, showing interactions with the genotype used cultivars. The B. subtilis bacteria did not influence the production of the cultivars 'Cardyna' and 'Trinidade' in successive seasons. However it stimulated the production of related pigments with photosynthesis, chlorophyll b, and total carotenoid, showing interactions with the genotypes for the accumulation of reducing sugars and non-reducing and provided increased enzyme phenylalanine ammonia-lyase, chitinase and ?-1 , 3-glucanases, related to the protection of plants without there costs in production. The forms of application presented interaction with the genotype and the variable analyzed. Keywords: Solanum lycopersicum L, plant growth promoting bacteria biofertilizers, sustainability.
|
4 |
Uso da bactéria promotora do crescimento vegetal, bacillus amyloliquefaciens SUBSP, plantarum FZB-42, tomateiro em cultivo orgânicoZecchin, Vivian Jaskiw Szilagyi January 2016 (has links)
Orientador : Prof. Dr. Átila Francisco Mógor / Coorientador : Profª. Drª. Lucimeris Ruaro / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Defesa: Curitiba, 14/06/2016 / Inclui referências: f 24-28;31-32;42-45;53-55;68-71;84-88;93-95 / Área de concentração: Produção vegetal / Resumo: O tomateiro é uma cultura amplamente difundida, seus frutos podem ser utilizados in natura ou industrializados. Portanto possui relevância econômica e importância social pois seus derivados passam por uma extensa cadeia produtiva que gera inúmeros empregos. Atualmente com uma maior conscientização ambiental e também visando a saúde, o uso de tecnologias biológicas que incrementem a produtividade sem aditivos químicos, são alternativas desejáveis. Neste contexto o uso de bactérias promotoras de crescimento vegetal vem de encontro a estas necessidades. A bactéria Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum FZB42, que já tem caracterizada algumas habilidades de interesse agronômico, foi o alvo utilizado no estudo da interação planta x bactéria. Sendo assim, os objetivos deste estudo foram: (i) investigar na bactéria características relacionadas à promoção do crescimento vegetal; (ii) verificar alterações morfométricas das plantas de tomateiro inoculadas com FZB42 na germinação de sementes, na produção de mudas e no crescimento das plantas até 60 dias em sistema orgânico em diferentes doses (1,5x109; 6,0x1010; 2,4x1011 bactérias mL-1); (iii) analisar alterações bioquímicas e nutricionais em plantas de tomateiro; (iv) avaliar a produção de tomates mediante inoculação da bactéria nas doses (1,5x109; 6,0x1010). FZB42 apresentou resultados positivos para produção de sideróforos e compostos indólicos com e sem suplementação de triptofano. Sementes inoculadas não tiverem seu percentual de germinação alterado. Na produção de mudas, a dose de 6,0x1010, foi a mais estimuladora do crescimento vegetal, com incrementos na parte aérea das cultivares Cereja 261, Santa Clara I-5300, Santa Cruz Kada Gigante e Serato F1, bem como aumentou os teores de clorofila. As mudas das duas últimas cultivares, na mesma dose, também tiveram o sistema radicular estimulado e os teores de açúcares solúveis e proteínas solúveis aumentados. A dose de 1,5x109 reduziu o crescimento das mudas. Plantas com 60 dias após semeadura, de 'Cereja 261', 'Santa Clara I-5300' e 'Serato F1' apresentaram-se com maior parte aérea e raízes quando inoculadas com 6,0x1010. Plantas de 60 dias submetidas a 1,5x109 tiveram estímulos mais discretos e quando inoculadas com 2,4x1011 os aspectos biométricos foram diminuídos. Nesta etapa o perfil metabólico dos cultivares não seguiu um padrão, pois estavam sujeitos às variação morfométricas devido às diferenças de estadio fenológico. O cultivar Serato F1 foi conduzido à campo em cultivo protegido. Aos 135 dias após plantio (em plena frutificação) apresentou, nas folhas, açúcares solúveis totais e aminoácidos livres totais em maiores quantidades nas plantas inoculadas com as doses de 1,5x109 e 6,0x1010. Já os frutos maduros das plantas inoculadas, também colhidos no mesmo momento, apresentaram mais proteínas solúveis totais e aminoácidos livres totais. Neste mesmo período a análise de macro e micro nutrientes revelou que plantas inoculadas tinham maiores teores de nitrogênio, ferro e manganês. A dose de 6,0x1010 diminuiu os níveis de cobre e aumentou zinco. Quanto aos aspectos produtivos, todos os tratamentos com plantas inoculadas apresentaram cerca de quarto frutos a mais por planta, sendo estes frutos de maior calibre e mais pesados que o controle não inoculado. Isso refletiu em uma produção de cerca de 1 kg a mais por planta, o que considerando 12,820 plantas ha-1, representa um incremento de 11,76 e 13,23 ton ha-1 nas doses de 1,5x109 e 6,0x1010, respectivamente. Portanto, FZB42 na dose de 6,0x1010 foi mais adequado para estímulo ao crescimento vegetal na fase de produção de mudas. Em termos de produtividade ambas as doses 1,5x109 e 6,0x1010 foram eficazes. Sendo assim, FZB42 na dose de 6,0x1010 bactérias mL-1 foi efetivo na promoção de crescimento durante todo o ciclo do tomateiro e com isso demonstrou potencial como inoculante ou bio-fertilizantes proporcionando alterações metabólicas e nutricionais. Palavras-chave: Bactérias promotoras de crescimento vegetal. Inoculante. Bio-fertilizante. Produtividade. Bacillus amyloliquefaciens. Solanum lycopersicum. / Abstract: The tomato is a widespread crop, its fruits can be used as a raw material for processed food. Therefore it has economic relevance and social importance because is the basis of an extensive production chain that generates numerous jobs. Currently greater environmental awareness and also aimed at health, the use of biological technologies that increase productivity without chemical additives, are desirable alternatives. In this context the use of plant growth promoting bacteria comes to attend these needs. The bacteria Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum FZB42, which already has characterized some desirable agronomically desirable effects, was the aim at this study of plant x bacteria interaction. Thus, the objectives of this study were: (i) investigate the bacteria characteristics related to the promotion of plant growth; (ii) verify morphometric changes of tomato plants inoculated with FZB42 on seed germination, in the production of seedlings, and plant growth to 60 days after sowing in organic system at different doses (1.5x109; 6.0x1010; 2.4x1011 bacteria mL-1); (iii) analyze biochemical and nutritional changes in tomato plants; (iv) evaluate the production of tomatoes by inoculation of bacteria in doses (1.5x109; 1,6x105). FZB42 tested was positive for siderophore production and indolec compounds with and without tryptophan supplementation. Inoculated seeds have not changed their germination percentage. In the production of seedlings, the dose of 1.6x105 was the most stimulating plant growth, with increases in the shoots of 'Cherry 261', 'Santa Clara I-5300', 'Santa Cruz Kada Gigante' and 'Serato F1', as well as increased levels of chlorophyll. The last two cultivars seedlings at the same dose also had their roots stimulated and showed increaes in total soluble sugars and total soluble proteins. The dose of 2.4x1011 reduced seedling growth. Plants 60 days after sowing, the 'Cherry 261,' 'Santa Clara I-5300' and 'Serato F1' were improved their shoots and roots growth when inoculated with 6.0x1010. Plants with 60 days inoculates with 1.5x109 had more discrete stimuli and when inoculated with 2.4x1011 the growth were diminished. At this stage the metabolic profile of cultivars did not follow a pattern because they were subject to the morphometric variation due differences in phenological stages. The cultivar Serato F1 was cultivated in greenhouse. At 135 days after planting (in full fruiting) the leaves presented total soluble sugars and total free amino acids in a larger amount in the plants inoculated with doses of 1.5x109 and 6.0x1010. In addition, the ripe fruits of inoculated plants, harvested at this time, had more total soluble protein and total free amino acids. In the same period, the analysis of macro and micronutrients on leaves showed that inoculated plants had higher levels of nitrogen, iron and manganese. The dose of 6.0x1010 decreased copper and increased zinc levels. All inoculated plants showed the increment of around four fruits per plant, which fruits with greater caliber and heavier than uninoculated control. This reflected in an increasing of about 1 kg at more per plant, considering that 12,820 plants ha-1, representing an increase of 11.76 tons ha-1 and 13.23 tons ha-1 at the doses of 1.5x109 and 6.0x1010 respectively. Therefore, Bacillus amyloliquefaciens FZB42 at 6.0x1010 dose was more efficient for stimulating plant growth in seedling production. In terms of yield, both 1.5x109 and 6.0x1010, doses were effective. Thus, FZB42 at a dose of 6.0x1010 bacteria mL-1 was effective in promoting growth throughout the tomato cycle and it showed potential as inoculant or bio-fertilizer providing nutritional and metabolic changes. Key-words: Plant growth promoting bacteria. Inoculation. Biofertilizers. Productivity. Bacillus amyloliquefaciens. Solanum lycopersicum.
|
5 |
Bactérias extremófilas facultativas : efeito na promoção de crescimento de plantas de tomate e na supressão de Ralstonia solanacearumRezende, Adriana Magali de Freitas Alves 23 June 2010 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2010. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2011-04-26T15:32:22Z
No. of bitstreams: 1
2010_AdrianaMagaliFreitasARezende.pdf: 928655 bytes, checksum: 0debcd6b5dcfb890f32d2dadf1072dca (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2011-04-29T00:16:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2010_AdrianaMagaliFreitasARezende.pdf: 928655 bytes, checksum: 0debcd6b5dcfb890f32d2dadf1072dca (MD5) / Made available in DSpace on 2011-04-29T00:16:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2010_AdrianaMagaliFreitasARezende.pdf: 928655 bytes, checksum: 0debcd6b5dcfb890f32d2dadf1072dca (MD5) / O tomateiro comum (Solanum lycopersicum L.) é uma olerícola de grande importância econômica e social, se destacando no Brasil, pelas extensas áreas agrícolas cultivadas. O Brasil é o sexto maior produtor de tomate no mundo. No entanto, a murcha bacteriana, causada pela bactéria Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi está entre as doenças de maior importância e de difícil controle, não existindo ainda medidas adequadas que possam ser recomendadas. Com objetivo de determinar um controle biológico eficaz, comparado às outras bactérias antagonistas e com comportamentos semelhantes contra muitos fitopatógenos, foi escolhido o estudo com
bactérias extremófilas facultativas para verificar seu efeito na promoção do crescimento das plantas de tomate e ao mesmo tempo estudar a supressão da murcha bacteriana. Foram coletadas diferentes amostras de solos, no município de Brazlândia, em Brasília, DF, Brasil. Obteve-se um total de trinta e oito isolados os quais foram submetidos aos testes de temperaturas (45, 55, 65 e 75 ºC), pH (3, 4, 5, 9, 10 e 11) e salinidade (5, 10 e 15 % de NaCl). Onze isolados foram selecionados para caracterização bioquímica e identificação baseada nas sequências 16S DNAr. Verificou-se que em todas as amostras de solos determinaram-se quatro grupos de bactérias, sendo que em cada um observou a presença de isolados crescendo nas condições mais extremas. Dos onze isolados selecionados, todas as bactérias foram Gram negativa, podendo separá-los em três grupos distintos, com base nas reações positivas para as características bioquímicas: o primeiro grupo formado, com base no teste oxidação/fermentação da glicose, obteve-se
sete isolados pertencendo à família Enterobacteriaceae; o segundo grupo com base no crescimento em meio King-B, obteve-se dois isolados de Pseudomonas sp.; e o terceiro grupo não relacionados taxonomicamente, com dois isolados, Giesbergeria sp. e Chryseobacterium sp. Estes onze isolados selecionados e identificados foram avaliados, em casa de vegetação, no estudo da promoção do crescimento das plantas de tomate. Foram montados três experimentos: (1) com aplicação individual, (2) com combinação
de dois e (3) com combinação de três e com todos isolados simultaneamente, com dois
sistemas orgânicos, composto (CO) e bokashi (BK). A aplicação individual dos isolados
mostrou ser mais eficiente na promoção do crescimento das plantas, o isolado UnB
1327, no sistema CO apresentou maiores incrementos para altura, peso matéria fresca e seca de 233,9%, 55,9% e 24,2%, respectivamente maiores que a testemunha (100%). No estudo da supressão de R. solanacearum, no experimento 1, os isolados UnB 1321 no sistema BK e UnB 1326 e UnB 1322 no sistema CO, mostraram ser eficientes na
supressão da bacteriose, destacando-se com 100% de controle. O experimento 2, mostrou ser mais eficiente na supressão da murcha bacteriana, independendo do tipo de sistemas avaliados. No experimento 3, no sistema BK, a testemunha diferenciou significativamente de todos os tratamentos, inclusive da combinação UnB 1329 + UnB 1322 + UnB 1330 apresentando 87% e 27%, respectivamente, de plantas mortas. No sistema CO, houve alta percentagem da doença em todos os tratamentos, no entanto nenhum tratamento diferenciou da testemuha que apresentou 60% de plantas mortas. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The common tomato (Solanum lycopersicum L.) is a crop of great economic importance and social, standing out in Brazil due to largest agricultural areas cultivated. Brazil is the sixth largest tomato producer in the world. However, bacterial wilt caused
by the bacterium Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi is one of the most important and difficult to control disease, with no further appropriate measures as may
be recommended. This work aimed to establish an effective biological control, compared to other antagonists bacteria and with similar behavior for many plant pathogens, was chosen the study with facultative extremophiles bacteria for its effect on
promoting growth of tomato plants and the suppression of bacterial wilt. To this end,
several soil samples were collected in the municipality of Brazlândia, near Brasília,
Federal District, Brazil. A total of 38 isolates were submitted to temperature tests (45, 55, 65 and 75 ºC), pH tests (3, 4, 5, 9, 10 and 11) and salinity tests (5, 10 and 15 % of NaCl). Eleven isolates were selected for biochemical characterization and identification based on the 16S DNAr sequences. It was confirmed that in all the soil samples four groups of bacteria were categorized, and in each one the presence of isolates growing in highly extreme conditions was observed. Of the 11 selected isolates, all the bacteria were Gram-negative, and these could be separated into three distinct groups, based on their positive reactions to biochemical characteristics. From the first group, based on the glucose oxidation/fermentation test, we obtained seven isolates belonging to the family Enterobacteriaceae; from the second group, based on growth in King-B medium, we
obtained two isolates of Pseudomonas sp.; the third, taxonomically unrelated group,
showed two isolates, Giesbergeria sp. and Chryseobacterium sp. These eleven isolates
identified were selected and evaluated in a greenhouse in the study of growth promotion
of tomato plants. Three experiments were carried out: (1) with individual application,
(2) with a combination of two and (3) with a combination of three and all isolates
simultaneously, with both systems, compound (OC) and bokashi (BK). Applying individual isolate was more efficient in promoting plant growth, the isolate UnB 1327, on conventional treatment showed more increase for height, fresh and dry weight of 233,9%, 55,9% and 24,2% respectively higher than the control 2 (100%). In the study of suppression of R. solanacearum, in experiment 1, isolates UnB 1321 in the BK system and UnB 1326 and UnB 1322 in the CO system were seen to be efficient in the
suppression of bacteriosis, at 100% difference from the control. Experiment 2 was efficient in suppressing bacterial wilt, independently of the type of system being
evaluated. In experiment 3, in the BK system, the control was significantly different from all the treatments, including from the UnB 1329 + UnB 1322 + UnB 1330
combination, presenting 87% and 27% dead plants, respectively. In the CO system,
there was a high percentage of the disease in all treatments, but no treatment differed
from the control, which presented 60% dead plants.
|
6 |
Efeito de isolados de Fusarium oxysporum não patogênicos na redução da severidade da Murcha-de-Fusário do tomateiroSilva, Juliano Cesar da [UNESP] 04 1900 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2003-04Bitstream added on 2014-06-13T20:58:39Z : No. of bitstreams: 1
silva_jc_me_botfca.pdf: 186787 bytes, checksum: 6b00fb1158e56a1f4a6f91be11738372 (MD5) / A cultura do tomateiro é severamente atacada por diversas doenças, entre elas pode-se destacar a Murcha-de-Fusário. O objetivo do presente trabalho foi o de avaliar a eficiência de isolados de Fusarium oxysporum não patogênicos (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, originários da Universidade de Torino, Itália, no controle da Murcha-de-Fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici raças 1 e 2 (Fol). Os isolados patogênicos CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), bem como os isolados não patogênicos, foram cultivados em meio de cultura BD (batata-dextrose) durante 10 dias à 25ºC, com agitação constante de 150rpm. Para se obter estruturas de resistência do fungo 500 ml de inóculo líquido de cada isolado de Fnp foram adicionados em 1000 g de talco e incubados durante 30 dias. Com o intuito de verificar a patogenicidade dos isolados CA4A, C-21A, TO11 e TO245, plântulas de tomateiro cv. Viradoro foram transplantadas para substrato infestado com inóculo líquido nas concentrações de Fol de 103, 104, 105 e 106 conídios mL-1. Após 35 dias do transplante, as mudas foram avaliadas quanto a severidade da doença (Notas variando entre 1 a 6, onde: 1 planta sadia e 6 planta morta), a altura e as massas secas do sistema radicular e da parte aérea das plantas. As concentrações de 106 e 105 conídios mL-1 dos isolados de Fol promoveram a maior severidade da doença, quando comparadas com a testemunha não inoculada. Após determinar a concentração do patógeno, verificou-se a atividade não patogênica dos isolados de Fnp em plantas de tomateiro onde, raízes foram imersas em uma suspensão de conídios dos... . / The tomato is severely is affected by several diseases, among them may be detached the Fusarium wilt. The objective this present research was to evaluate the efficacy of the nonpathogenic Fusarium oxysporum strains (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, from the University of Torino, Italy, on the control of Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) races 1 and 2. The pathogenic strains CA4A race 1, C-21A race 2, TO11 race 2 and TO245 race 2, as well the nonpathogenic strains were growing in liquid media PD (potato-dextrose) during 10 days at 25ºC, with constant agitation at 150 rpm. To obtain resistant structure of the fungi 500 mL of the liquid inoculum with each the Fnp strain were mixed in 1000 g of talc and incubated for 30 days. To evaluate the pathogenic activity of the strains: CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), tomato seedlings cv. Viradoro susceptible to race 2 of the pathogen were transplanted into the infested substrate with inoculum suspension in the concentrations of Fol 103, 104, 105 e 106 conidia mL-1. After 35 days of the seedlings transplantation were evaluated the disease severity (Notes between 1 and 6, where: 1 health plant e 6 died plant), the height plants and the weight dry material of the root system and aerial part of the plants. The concentrations 106 e 105 conidia mL-1 of the strains de Fol increased the higher severity, when compared with non inoculated plants. After determination the concentration of the pathogen, observed the nonpathogenic activity of the Fnp strains in tomato plants where, roots were dipped in a conidial suspension in the concentration of the 106 conidia mL-1. The plants were growing into pots for the 500 mL capacity of the substrate and after 35 days of the growing in greenhouse were realized the evaluations. The plant... (Complete abstract, click electronic address below).
|
7 |
Efeito de isolados de Fusarium oxysporum não patogênicos na redução da severidade da Murcha-de-Fusário do tomateiro /Silva, Juliano Cesar da, 1977. January 2003 (has links)
Orientador: Wagner Bettiol / Resumo: A cultura do tomateiro é severamente atacada por diversas doenças, entre elas pode-se destacar a Murcha-de-Fusário. O objetivo do presente trabalho foi o de avaliar a eficiência de isolados de Fusarium oxysporum não patogênicos (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, originários da Universidade de Torino, Itália, no controle da Murcha-de-Fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici raças 1 e 2 (Fol). Os isolados patogênicos CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), bem como os isolados não patogênicos, foram cultivados em meio de cultura BD (batata-dextrose) durante 10 dias à 25ºC, com agitação constante de 150rpm. Para se obter estruturas de resistência do fungo 500 ml de inóculo líquido de cada isolado de Fnp foram adicionados em 1000 g de talco e incubados durante 30 dias. Com o intuito de verificar a patogenicidade dos isolados CA4A, C-21A, TO11 e TO245, plântulas de tomateiro cv. Viradoro foram transplantadas para substrato infestado com inóculo líquido nas concentrações de Fol de 103, 104, 105 e 106 conídios mL-1. Após 35 dias do transplante, as mudas foram avaliadas quanto a severidade da doença (Notas variando entre 1 a 6, onde: 1 planta sadia e 6 planta morta), a altura e as massas secas do sistema radicular e da parte aérea das plantas. As concentrações de 106 e 105 conídios mL-1 dos isolados de Fol promoveram a maior severidade da doença, quando comparadas com a testemunha não inoculada. Após determinar a concentração do patógeno, verificou-se a atividade não patogênica dos isolados de Fnp em plantas de tomateiro onde, raízes foram imersas em uma suspensão de conídios dos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: The tomato is severely is affected by several diseases, among them may be detached the Fusarium wilt. The objective this present research was to evaluate the efficacy of the nonpathogenic Fusarium oxysporum strains (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, from the University of Torino, Italy, on the control of Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) races 1 and 2. The pathogenic strains CA4A race 1, C-21A race 2, TO11 race 2 and TO245 race 2, as well the nonpathogenic strains were growing in liquid media PD (potato-dextrose) during 10 days at 25ºC, with constant agitation at 150 rpm. To obtain resistant structure of the fungi 500 mL of the liquid inoculum with each the Fnp strain were mixed in 1000 g of talc and incubated for 30 days. To evaluate the pathogenic activity of the strains: CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), tomato seedlings cv. Viradoro susceptible to race 2 of the pathogen were transplanted into the infested substrate with inoculum suspension in the concentrations of Fol 103, 104, 105 e 106 conidia mL-1. After 35 days of the seedlings transplantation were evaluated the disease severity (Notes between 1 and 6, where: 1 health plant e 6 died plant), the height plants and the weight dry material of the root system and aerial part of the plants. The concentrations 106 e 105 conidia mL-1 of the strains de Fol increased the higher severity, when compared with non inoculated plants. After determination the concentration of the pathogen, observed the nonpathogenic activity of the Fnp strains in tomato plants where, roots were dipped in a conidial suspension in the concentration of the 106 conidia mL-1. The plants were growing into pots for the 500 mL capacity of the substrate and after 35 days of the growing in greenhouse were realized the evaluations. The plant... (Complete abstract, click electronic address below). / Mestre
|
8 |
Ultradiluições de Natrum muriaticum no desempenho agronômico do tomateiro-cereja submetidos a estresse salino /Dandaro, Priscila Aparecida Faitanini, 1990. January 2017 (has links)
Orientador: Filipe Pereira Giardini Bonfim / Banca: Anastácia Fontanetti / Banca: Isabela Cristina Gomes Honorio / Resumo: A utilização de preparados homeopáticos tem se tornado crescente na agricultura em especial nas plantas. Vários segmentos como a germinação, a produção de mudas, o controle de pragas e doenças de planta, o aumento de princípios ativos, desintoxicação de plantas por meios contaminantes e no metabolismo tem sido abordados através dos conceitos de Homeopatia. Os procedimentos que permitem reverter o quadro de estresse salino são pouco conhecidos, os custos são elevados e os recursos não são renováveis, tornando-se necessárias a adoção de novas tecnologias. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de preparados homeopáticos no desempenho agronômico e parâmetros fisiológicos em tomateiro-cereja submetido a estresse salino. O delineamento estatístico utilizado foi inteiramente casualizado, com oito tratamentos e cinco repetições. Foram avaliadas diferentes dinamizações de Natrum muriaticum (3CH; 5CH; 7CH; 9CH; 11CH; 13CH), e as testemunhas (água destilada e etanol 70%). As características avaliadas foram: altura (cm), diâmetro do colo (mm), número de folhas, número de flores por cacho, número de frutos, número de frutos por cachos, fluorescência da clorofila A, condutância estomática, teor relativo de água, potencial hídrico, determinação da área foliar, determinação de fitomassa fresca de frutos (gramas), teor de sólidos solúveis (°Brix) e teor de prolina do tomateiro-cereja. A aplicação da Ultradiluição de Natrum muriaticum promoveu incremento em todas as variáveis avaliada... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The use of homeopathic preparations has become increasing in agriculture, especially in plants. Several segments such as germination, production of seedlings, pest control and plant diseases, increased raw material assets, detoxification of plants by contaminating means and at metabolism had been reached by the concepts of Homeopathy. The procedures that allow the reversal of the salinity stresses are little known, the costs are high and the resources are not renewable, becoming necessary the adoption of new technologies. The objective of this work was to evaluate the effect of homeopathic preparations on agronomic performance and physiological parameters on cherry tomatoes submitted to saline stress. The statistical design was completely randomized, with eight treatments and five replicates. Different dynamizations of Natrum muriaticum (3CH; 5CH; 7CH; 9CH; 11CH; 13CH) and the controls (distilled water and 70% ethanol) were evaluated. The evaluated characteristics were: height (cm), lap diameter (mm), number of leaves, number of flowers per cluster, number of fruits, number of fruits per bunches, chlorophyll A fluorescence, stomatal conductance, relative water content, hydric potential, leaf area determination, fresh fruit phytomass determination (grams), soluble solids content (° Brix), and proline content of tomato-cherry. The application of the ultradilution of Natrum muriaticum promoted the increase in all evaluated variables related to the agronomic performance of the tomato. Natrum muriaticum 11CH and 13CH acts positively on vegetative and reproductive development of cherry tomatoes submitted to saline stress ... / Mestre
|
9 |
Biofertilizantes: nutrição e desenvolvimento de tomate orgânico / Nitrogen x potassium balance it dynamics in the potential of resistance against diseases in tomato (solanum lycopersicum)Moreira, Claudia Araujo [UNESP] 26 January 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2012-01-26Bitstream added on 2015-03-03T12:07:19Z : No. of bitstreams: 1
000813750.pdf: 1582411 bytes, checksum: 7ff1f57450a47f80a22bcf5746f1ad44 (MD5) / O consumo de tomate orgânico tem crescido nos últimos anos devido à maior exigência dos consumidores em qualidade nutricional e à preocupação com a saúde humana e do ambiente. No cultivo do tomate orgânico, o equilíbrio entre o nitrogênio e o potássio pode proporcionar melhor qualidade sanitária e nutricional, melhorando a produção do tomateiro. O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de avaliar cinco relações entre N e K, sobre a nutrição e a produção, em duas cultivares de tomate cultivado sob o manejo orgânico, em campo, em duas épocas de cultivo. Os experimentos foram realizados na Fazenda Nossa Senhora Aparecida, em Hidrolândia – GO. O delineamento foi em blocos ao acaso com cinco repetições e seis tratamentos, compostos por cinco proporções (1 – 100% de Bio 6 e 0 % de Bio 9; 2 – 75% de Bio 6 e 25% de Bio 9; 3 – 50% de Bio 6 e 50% de Bio 9; 4 -25% de Bio 6 e 75% de Bio 9 e; 5 - 0% de Bio 6 e 100% de Bio 9) de dois biofertilizantes, um mais rico em nitrogênio, o Bio 06, e outro mais rico em potássio, o Bio 9, e testemunha. As plantas foram avaliadas quanto à massa de matéria seca, produção, teores de nutrientes e nutrientes extraídos. As análises químicas foram realizadas em uma planta por parcela aos 28, 43, 56, 71 e 84 dias após o transplante, para determinar a marcha de absorção e exportação de nutrientes. Observou-se que as relações N:K afetaram significativamente a massa de matéria seca das folhas, hastes e total, sendo os melhores tratamentos: o 3, para folhas e, total e o 1, para hastes. Não obteve-se diferenças para produção. Com relação aos teores de nutrientes, nas folhas, foram obtidas diferenças para o S e B e para as épocas, em todos os nutrientes, sendo que houve efeito de interação entre os tratamentos e as épocas para P, Ca e B. Nas hastes, houve diferenças para K e Zn, não houve efeito de época para P, Mg ... / The consumption of organic tomato has grown in recent years due to increased consumer demand for nutritional quality and concern for human health and the environment. In the cultivation of organic tomatoes, the balance between nitrogen and potassium can provide better quality health and nutrition, improving the production of tomato. The present study was designed to evaluate five relations between N and K, on nutrition and production in two tomato cultivars grown under organic management in the field in two cropping seasons. The experiments were conducted at Fazenda Nossa Senhora Aparecida, in Hidrolândia - GO. The experimental design was a randomized block design with five replications and six treatments in five proportions (1 – 100% of Bio 6 and 0 % of Bio 9; 2 – 75% of Bio 6 and 25% of Bio 9; 3 – 50% of Bio 6 and 50% of Bio 9; 4 - 25% of Bio 6 and 75% of Bio 9 e; 5 - 0% of Bio 6 and 100% of Bio 9), for two biofertilizers, one richer in nitrogen, the Bio 06, and the other richer in potassium, the Bio 9, and control. Plants were evaluated for dry matter, production, nutrients content and nutrients extracted. Chemical analyzes were conducted on a plant per plot after 28, 43, 56, 71 and 84 days after the transplant, to determine the absorptions and export nutrients. It was observed that the relationship N: K significantly affected the dry matter of leaves, rods and all, being the best treatments: the 3, sheet and full and 1 for rods. No differences were obtained for production. With respect to nutrient content in leaves, differences were obtained for S and B, and for seasons, in all nutrients, and there was an interaction effect between treatments and times for Ca, P and B. In rods, there were differences for K and Zn, there was no effect of time for P, Mg and Zn, and there was an interaction effect between treatments and times, for Mg and Mn. In fruits, it was observed that there were ...
|
10 |
Identificação de vírus em tomateiro através de análise por sequenciamento de alto desempenho / Identification ofviruses in tomato by next generation sequencingMartins, Thais Pereira 18 October 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2017-02-03T14:00:48Z
No. of bitstreams: 1
2016_ThaisPereiraMartins.pdf: 1887975 bytes, checksum: 70c34a740639c7a34264c3c76f0c3839 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-14T19:07:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2016_ThaisPereiraMartins.pdf: 1887975 bytes, checksum: 70c34a740639c7a34264c3c76f0c3839 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T19:07:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2016_ThaisPereiraMartins.pdf: 1887975 bytes, checksum: 70c34a740639c7a34264c3c76f0c3839 (MD5) / O tomateiro é uma solanácea cultivada em várias partes do mundo, com fruto rico em compostos com propriedades antioxidantes e anticancerígenas. A tomaticultura está sujeita a várias doenças que podem limitar sua produção, diversos vírus têm sido descritos e estão amplamente disseminados nos campos de produção. As viroses estão dentre as doenças de maior importância, pois são de difícil controle e não existem produtos anti-virais disponíveis no mercado. A diagnose das espécies virais é realizada comumente por técnicas tradicionais e modernas, testes sorológicos como o ELISA e testes moleculares como a RT-PCR e a PCR são utilizados para detecção de patógenos previamente caracterizados. As limitações dessas técnicas aparecem quando se trata da detecção e identificação de um novo vírus. Identificar o agente causador de uma nova doença, onde não se tem informações sobre a morfologia, composição ou características químicas e físicas do patógeno, utilizando tais técnicas juntamente com microscopia eletrônica constitui uma tarefa difícil que pode demorar meses ou anos. Devido a essas dificuldades, novas abordagens para melhorar a identificação dos agentes causadores de novas doenças foram desenvolvidas. A abordagem metagenômica utilizando o método de Sanger gerou uma série de realizações importantes, porém, ao final do século XX, o sequencimento de alto desempenho (Next generation sequencing – NGS) foi lançado para suprir as limitações desse método. O sequenciamento de alto desempenho sequencia massalmente a população de ácidos nucleícos presentes em uma amostra, gerando sequências curtas de uma ou de ambas as extremidades, conhecidas como reads. O advento dessa forma de sequenciar transformou os estudos metagenômicos de grande escala em procedimentos práticos e de baixo custo. Com o objetivo de conhecer a população viral (viroma) e de obter genomas virais completos ou parciais, o sequenciamento de alto desempenho foi implementado para detectar patógenos virais em tomateiros de Brazlândia (DF), Campinas (SP) e Araguari (MG). Amostras de tomateiros que apresentavam sintomas típicos de infecções virais foram coletadas e agrupadas em cinco amostras compostas: BRAZ, com plantas de Brazlândia e AHOL, TOCA1, TOCA2, com plantas de Campinas e CAM-RNY2, com plantas de Araguari. As amostras compostas foram submetidas ao processo de semi-purificação de partículas virais, à extração de RNA e posteriormente foram enviadas para sequenciamento na plataforma Illumina HiSeq2000, na Macrogen (Coréia do Sul). Diversos vírus de ocorrência habitual nos campos de produção brasileiros foram detectados: os tospovírus Groundnut ringspot virus, o Tomato spotted wilt virus; o tobravírus Pepper ringspot virus; o crinivírus Tomato chlorosis virus; os begomovírus Sida micrantha mosaic virus e o Tomato severe rugose virus; o tymovírus Tomato blistering mosaic virus; e os potyvírus Pepper yellow mosaic virus e Potato virus Y. O Pepper mild mottle virus foi detectado como um resultado inesperado, devido à predominância de tobamoviroses causadas por Tomato mosaic virus em tomateiro. Dois contigs da amostra BRAZ geraram suspeitas de existência de uma nova espécie de ilarvírus, devido a sua baixa identidade com Ageratum latent virus e Parietaria mottle virus. O amalgavírus Southern tomato virus foi detectado em todas as bibliotecas e dois genomas semi-completos foram montados (STV-DF e STV-MG). Esses genomas mostraram alta identidade de nucleotídeos entre si e com os demais isolados de STV depositados no banco de dados. O STV é um vírus de RNA fita-dupla de aproximadamente 3,5 Kbp, pertencente ao gênero Amalgavirus, que foi descrito na América do Norte (Estados Unidos e México). Não há evidências de transmissão mecânica ou por enxertia desse vírus, porém, estudos anteriores confirmaram elevadas taxas de transmissão vertical (70% – 90%). Os relatos desse vírus têm crescido nos últimos anos, foi relatado também na França, na Espanha, na China, na Itália e em Bangladesh. A detecção sempre em co-infecção com outros vírus e a ausência de sintomas em plantas positivas para o vírus gerou dúvidas a respeito de sua patogenicidade, porém sua alta taxa de transmissão vertical e a expansão de sua distribuição gerou preocupações para a indústria do tomate. Maiores estudos são necessários para definir o efeito de sua presença em lotes de sementes comerciais e o seu potencial de patogenicidade. Com o objetivo de caracterizar o isolado de STV encontrado no Brasil, a presença desse vírus foi confirmada e foi realizado um estudo filogenético, além da detecção por RT-PCR em plantas coletadas no campo e em sementes comerciais de tomateiro utilizando dois pares de primers. Todas as amostras compostas originais testadas apresentaram resultados positivos para RT-PCR, com ambos os primers. A clonagem e sequenciamento de fragmento gerado a partir da amostra BRAZ possibilitou a obtenção dos nucleotídeos faltantes na sequência STV-DF. A análise filogenética da RNA polimerase pelo método da máxima verossimilhança, mostrou agrupamento dos isolados de STV-DF e STV-MG com as demais sequências de STV. Os isolados de STV permaneceram próximos a outros vírus pertencentes à família Amalgaviridae, que se mostraram mais próximos dos vírus da família Partitiviridae que do vírus pertencente à família Totiviridae. O vírus foi detectado em amostras coletadas em Brazlândia e Taquara (DF), em São José do Rio Preto (SP), em Corúmba de Goiás, Morrinhos e Goianápolis (GO) e em Reserva (PR) As plântulas testadas das cultivares Predador, Santa Clara, H-9992 e H-9553 também apresentaram resultados positivos para infecção por STV. A alta similaridade entre os isolados de STV encontrados e os existentes e a detecção desse vírus em plântulas de sementes comerciais indicam uma provável introdução do vírus através de materiais vegetais importados. Aproximadamente um sétimo dos vírus de plantas conhecidos são transmitidos por sementes de pelo menos uma espécie vegetal por ele infectada. A detecção desse vírus em plântulas oriundas de sementes comerciais demonstra a fragilidade do controle do material vegetal que entra no país. Quatorze países exportam sementes de tomate para o Brasil sem a análise de risco de pragas por estarem autorizados pelo MAPA. Embora a importação seja importante para a economia do país, a ineficiência das medidas fitossanitárias para autorizar a entrada das sementes pode trazer consequências desastrosas para agricultura brasileira. / The tomato is a solanaceous plant, rich in substances with antioxidant properties, and which is cultivated in several regions of the world. Susceptible to infection by different viruses, the tomato production has serious risks that limit its production. Viruses are among the most important diseases because of the difficulty in their control. The diagnosis of viral species is commonly carried out by traditional and modern techniques, such as serological and molecular tests such as PCR or RT-PCR, which are used to detect previously characterized pathogens. These tools have limitation in cases when there is a need for detection and identification of unknown viruses. The identification of the etiological agent of a new disease, i.e. without information on particle morphology, genome composition and chemical and physical properties, starting from electron microscopy, is a difficult task that can take months or years to accomplish. To circumvent these difficulties, new techniques were developed. The metagenomics approach, using the Sanger method, has generated a number of important achievements, but at the end of the 21st century, high-performance sequence was launched to overcome the limitations of this method. The Next generation sequencing (NGS) strategy enables the determination of sequences of the whole population of nucleic acids present in a sample, by generating sequences of one or both ends (named reads). The advent of this sequencing technique has transformed metagenomic studies of large-scale practical and with a low cost. In order to determine the viral population (virome) and assemble the complete or partial viral genomes present in tomato plants, high-performance sequencing has been implemented in plants collected in the regions Brazlândia (DF), Campinas (SP) and Araguari (MG). Tomato samples with typical symptoms of viral infections were collected and grouped into five composite samples: BRAZ, containing plants collected in Brazlândia; AHOL, TOCA1, TOCA2 from Campinas; and CAM-RNY2 from Araguari. The composite samples were subjected to the process of semi-purification of viral particles, extraction of RNA and sequencing on Illumina platform HiSeq2000 at Macrogen, Inc. (South Korea). Several viruses commonly found in Brazilian production fields were detected, such as tospovírus Groundnut ringspot virus and Tomato spotted wilt virus; the tobravírus Pepper ringspot virus; the crinivírus Tomato chlorosis virus; the begomovírus Sida micrantha mosaic virus and Tomato severe rugose virus; the tymovírus Tomato blistering mosaic virus; and the potyvírus Pepper yellow mosaic virus and Potato virus Y. The tobamovirus Pepper mild mottle virus was also detected, though this result was not expected due to the predominance of Tomato mosaic virus in tomato. Two contigs generated from BRAZ sample showed a proximity to the ilarvirus Ageratum latent virus and Parietaria mottle virus suggesting the presence of a new ilarvirus in the plants. The amalgavirus Southern tomato virus (STV) was detected in all libraries and two semi-complete genomes (STV-DF and STV-MG) were assembled. These genomes showed high nucleotide identity each other and among other STV sequences deposited in nucleotide databases. STV is a double-stranded RNA virus of approximately 3.5 kbp, belonging to the genus Amalgavirus, which was described in North America (United States and Mexico). There is no evidence for mechanical transmission or by grafting of this virus, however, previous studies have confirmed high vertical transmission rates (70% - 90%). The reports of this virus have increased in the last years, being reported in France, Spain, China, Italy and Bangladesh. Questions regarding its pathogenicity properties are unanswered since they are usually detected in co-infection with other viruses and because of the absence of symptoms in positively infected plants. Its high rate of vertical transmission and the expansion of its worldwide spread are of big concerns for the tomato industry. Further studies are needed to define the effect of their presence in batches of commercial seeds and its potential for pathogenicity. In order to characterize the STV isolates found in Brazil, the presence of this virus has been confirmed and we performed a phylogenetic study, in addition to the RT-PCR using two primer sets, detection in plants collected in the field and in commercial tomato seeds. The original composite test samples were all positive for RT-PCR with both primer sets. The gap on the STV NGS-sequence from Brazlândia was filled by cloning and sequencing of an RT-PCR amplified fragment. The phylogenetic analysis of the RNA-dependent RNA polymerase gene by the maximum likelihood method showed grouping of STV-DF and STV-MG sequences with other STV sequences reported throughout the world. The STV sequences were closely related to viruses of other genus within the family Amalgaviridae, and to those of Partitiviridae than to those of Totiviridae. The virus was detected in new samples from Brazlândia and Taquara (DF), in São José do Rio Preto (SP), in Corumba de Goiás, Morrinhos and Goianápolis (GO), and Paraná (PR). Seedlings tested for the detection of STV of the cultivars Predator, Santa Clara, H-9992 and H-9553 were positive. The high identity among the isolates and the high incidence rate of STV in seeds indicate a possible introduction of the virus from the tomato seeds. Approximately one in seven known plant viruses is transmitted by seeds of at least one plant species. The detection of this virus in commercial seed seedling demonstrates the fragility in the control system of importation of plant materials. Fourteen countries export tomato seeds to Brazil without the need of risk analysis of pests because they are authorized by MAPA. Although this importation is important for the tomato production chain, the inefficiency of phytosanitary regulation system by authorizing the entry of contaminated seeds can have disastrous consequences for the Brazilian agriculture.
|
Page generated in 0.076 seconds