Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-23T13:23:40Z No. of bitstreams: 1 Rodrigo Risi Pereira Barreto.pdf: 4263357 bytes, checksum: 758f4258cdf8151b0f0baf5581f7b980 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-23T13:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigo Risi Pereira Barreto.pdf: 4263357 bytes, checksum: 758f4258cdf8151b0f0baf5581f7b980 (MD5) Previous issue date: 2015-08-28 / A great diversity of sharks has been explored by modern fisheries, regularly caught as by-catch and after the decade of 1990’s as target species, mainly due to the high value of their fins in the international market. This species group is characterized by slow growth, late maturity, high longevity, low rates of fertility and productivity that implies in low potential of replacement for most species, resulting in serious implications for the sustainability of populations and also for fishing. Coastal nations of the South Atlantic (Brazil, Uruguay, South Africa and Namibia) have historically (since the 50s) given its ports to traditional longline fleets (mainly from Asia and the European Union) in order to exchange technology to develop their own fleets through a policy known as leasing. Declines of commercial species such as tuna and swordfish elsewhere, moreover divisions of fishing quotas established by the ICCAT, main RFMO in Atlantic, were responsible for the introduction of at least 20 different pelagic longline fleets. Pelagic longline fishing are demonstrably associated with declines in abundance of many species of oceanic sharks in various locations around the world. However information on the South Atlantic is incipient, with few studies focusing on more abundant species such as the blue shark. This thesis gathers information about catches and life history collected from the main monitoring fishing agencies from Brazil, in order to identify population trends and conservation status for main species caught in the South Atlantic. In the first chapter, we address the age and growth of the shortfin mako shark, because growth of this specie had not yet been studied in our study area. In Chapter 2, we discuss the history of fishing as well the different phases of exploitation focused in western and central South Atlantic, resulting in the identification of trends in exploitation and thus, abundances of key species. The third chapter addresses the vulnerability of this group of species through the use of different demographic methods. Overall our results show that most species analyzed are depleted and seriously threatened by pelagic longline fishing, which still lacks adequate monitoring and control in the South Atlantic. / Uma grande diversidade de tubarões vem sendo explorada pelas pescarias modernas, capturados regularmente como by-catch (ou captura incidental) e apos a década de 90 como espécies alvo, principalmente devido ao alto valor de suas nadadeiras no mercado internacional. Este grupo de espécies é caracterizado por crescimento lento, maturação tardia, alta longevidade, baixas taxas de fecundidade e produtividade, conjunto de características que implicam em baixo potencial de reposição para a maioria das espécies, resultando em sérias implicações para a sustentabilidade das populações e também da pesca. Nações costeiras do Atlantico Sul (Brasil, Uruguai, Africa do Sul e Namibia) têm desde a década de 50 cedido seus portos a frotas espinheleiras tradicionais (principalmente da Asia e Uniao Europeia) objetivando intercâmbio de tecnologia para desenvolver suas próprias frotas através de uma politica conhecida como arrendamento. Declinios de espécies comerciais como por exemplo os atuns e os espadartes em outras localidades, assim como as divisões de cotas de pesca estabelecidas pela principal RFMO do Atlantico, a ICCAT, foram responsáveis pela introducao pelo menos 20 diferentes frotas que utilizam espinheis pelágicos. Espinheis pelágicos estão comprovadamente associados a declínios em abundancia de inúmeras espécies de tubarões oceânicos, em diversas localidades do mundo. Entretanto informações sobre o Atlantico Sul sao incipientes, com poucos estudos concentrados em espécies mais abundantes como, por exemplo, o tubarão azul. A presente tese reúne informações sobre captura e historia de vida coletadas junto aos principais órgãos de monitoramento sediados no Brasil, com objetivo de identificar tendências populacionais para as principais espécies capturadas no Atlantico Sul. No primeiro capitulo, abordamos a idade e crescimento do tubarão mako, em virtude de ser a única espécie (em meio as principais) cujo crescimento ainda não tinha sido estudado na área do presente estudo. No capítulo 2, abordamos o histórico da pesca bem como as diferentes fases de exploração em nossa área de estudo, resultando na identificação de tendências na exploração e abundancia das principais espécies. O capitulo 3 aborda a vulnerabilidade deste grupo de espécies através do uso de diferentes métodos demográficos. Nossos resultados apontam que a maioria das espécies analisadas encontram-se depletadas e seriamente ameaçadas pela pesca de espinhel pelágico, que ainda nao dispõe de adequado monitoramento e controle no Atlantico Sul.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-11-06T14:15:59Z No. of bitstreams: 1 Emmanuelly Creio Ferreira.pdf: 1229374 bytes, checksum: dc3465d26e2a298bd119bc96c5a085b6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-06T14:15:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Emmanuelly Creio Ferreira.pdf: 1229374 bytes, checksum: dc3465d26e2a298bd119bc96c5a085b6 (MD5) Previous issue date: 2015-08-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Nurse sharks, Ginglymostoma cirratum, is a coastal species, found on continental shelves and islands in tropical and subtropical waters of the Atlantic Ocean and eastern Pacific Ocean. Despite the relatively high abundance of the nurse shark in coastal waters, their behavior and ecology are poorly studied. Due to their markedly coastal and territorial behavior and habit, one of the techniques most recently used in the study of their movements has been the acoustic telemetry. In this study, the acoustic telemetry was used to evaluate the movements and habitat use by the species in the coast of Recife, in the section between the beaches of Pina and Paiva, area where the sharks are monitored. To this end, 29 acoustic receivers were installed along the shoreline, both within the existing channel parallel to the coastline and outside of it, and four close to shipwrecks positioned to the east and to the north of the coast network of receivers. The catch of animals for labeling was performed using two bottom longlines, 4 km long each, released near the channel in front of the beaches, 6 days a week. The nurse sharks caught were shipped to the sexing procedure, biometrics and marking with surgery, and later released. The number of acoustic detections for each shark in each station was used to investigate site fidelity and the minimum area of dispersion. During 4 consecutive years, 18 nurse sharks were tagged, of which 13 were detected totaling, 9.232 detections. Of the 13 detected sharks, 7 were males, with total length from 118 to 244 cm and 6 were females measuring 147-289 cm. Most detections occurred during the night (5.610 detections; 60%), suggesting that the area of study is a possible feeding ground. The use of active acoustic telemetry, however, is necessary to obtain a better understanding of habitat use and movements of nurse sharks at the study site. / O tubarão-lixa, Ginglymostoma cirratum, é uma espécie de hábitos costeiros, encontrada em plataformas continentais e insulares, em águas tropicais e subtropicais do Oceano Atlântico e no leste do oceano Pacífico. Apesar da abundância relativamente elevada do tubarão lixa em águas costeiras, o seu comportamento e ecologia ainda são pouco estudados. Em razão do seu comportamento marcadamente costeiro e hábito territorialista, uma das técnicas mais utilizadas recentemente no estudo do padrão de movimentação da espécie tem sido a telemetria acústica, tecnologia já empregada no monitoramento de várias espécies de elasmobrânquios. No presente estudo, a telemetria acústica foi utilizada para avaliar os movimentos e uso do habitat pela espécie na costa de Recife, no trecho compreendido entre as praias do Pina e do Paiva, área de monitoramento dos tubarões envolvidos no problema dos ataques no Estado. Com esse fim, 29 receptores acústicos foram instalados ao longo da linha de costa, tanto dentro do canal existente paralelo a linha de costa como por fora do mesmo, além de quatro naufrágios posicionados ao leste e ao norte da rede de receptores da costa. A captura dos animais para marcação foi realizada com a utilização de dois espinhéis de fundo, com 4 km de comprimento cada, lançado próximo ao canal em frente às praias, 6 dias por semana. Os tubarões-lixa capturados foram embarcados para o procedimento de sexagem, biometria e marcação com intervenção cirúrgica, sendo posteriormente liberados. O número de detecções acústicas para cada tubarão e para cada estação monitorada foi usado para definição da fidelidade local e da medida da área mínima de dispersão. Durante 4 anos consecutivos foram marcados 18 tubarões-lixa, dos quais 13 foram detectados totalizando 9.232 detecções. Dos 13 tubarões detectados, 7 eram machos com comprimento total variando de 118 a 244 cm e 6 eram fêmeas medindo de 147 a 289 cm. A maioria das detecções ocorreu durante o período noturno 5.610 detecções (60%), o que sugere que a área de estudo seja um possível espaço de alimentação. O emprego da telemetria acústica ativa se faz, contudo, necessário para se obter uma melhor compreensão acerca do uso do habitat e sobre a movimentação do tubarão-lixa no local de estudo.

Orientador: Fernando Fernandes Mendonça / Banca: Igor Dias Medeiros / Banca: Fábio Fernandes Roxo / Resumo: Até poucas décadas atrás, a captura de tubarões era considerada apenas como incidental e sem efeitos significativos para as suas populações. No entanto, principalmente devido ao grande aumento no valor das nadadeiras e ao declínio das populações de peixes mais tradicionais para o consumo humano, os tubarões passaram a serem alvos das pescarias em praticamente todo o mundo. Destes, o tubarão galha-branca Carcharhinus longimanus apresenta fortes sinais de esgotamento populacional, estando listado atualmente como globalmente "Vulnerável" na Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas da União Internacional para a Conservação da Natureza. Entre os parâmetros básicos para a definição de planos de conservação eficientes, a aquisição de conhecimentos sobre a estrutura genética populacional das espécies é um passo fundamental para o estabelecimento de políticas de conservação eficazes. Dessa maneira, considerando a urgente necessidade de ações para a preservação de diversas espécies de elasmobrânquios e o ainda o restrito conhecimento a respeito de sua biodiversidade e distribuição, sobretudo de seu ponto de vista molecular, este estudo teve como objetivo caracterizar a estrutura genética populacional do tubarão galha-branca Carcharhinus longimanus no Oceano Atlântico e em regiões do Oceano Índico, utilizando sequencias nucleotídicas da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop). A partir de 215 espécimes de C. longimanus, foram obtidos 724 pares de bases analisáveis, identificando nove sítios polimórficos que resultaram em 12 haplótipos distintos. A diversidade nucleotídica total foi de π = 0.0013 e a diversidade haplotípica de h = 0.5953. Estes resultados mostram uma variabilidade genética ligeiramente abaixo da média observada entre outras espécies de tubarões pelágicos. A análise de variância molecular (AMOVA) evidenciou níveis moderados de estrutura populacional (FST = 0.1039, P<0.001)... / Abstract: Until few decades ago, shark catching was considered to be only incidental and with no significant effects on their populations. However, the great increase in the fins market value combined with declining levels of traditional fish population for human consumption, sharks have become targets of the fisheries worldwide. Among these, the whitetip shark Carcharhinus longimanus shows strong signs of population depletion, and is currently listed as globally "Vulnerable" according to the Red List of Threatened Species of the International Union for Conservation of Nature. Regarding conservation plans, acquiring knowledge about the population genetic structure of the species is a fundamental step towards establishing effective conservation policies. Considering the limited information about population dynamics of the oceanic whitetip shark, were used partial sequences of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region to determine its population genetic structure across the Atlantic Ocean and the Indian Ocean. Were sampled 215 specimens of C. longimanus and obtained 724 base pairs (bp), identifying nine polymorphic sites, which resulted in 12 distinct haplotypes. The total nucleotide diversity was π = 0.0013 and haplotype diversity h = 0.5953. These results show a genetic variability slightly below the observed average among other species of pelagic sharks. The Analysis of Molecular Variance (AMOVA) evidenced moderate levels of population structure (FST = 0.1039, P<0.001) with restriction of gene flow between the Western and Eastern Atlantic Ocean with a strong relationship of this latter with the Indian Ocean. Thus, for the expansion of conservation plans of the species, also for the maintenance of their genetic stocks, should be considered at least two populations in the Atlantic Ocean and more attention to areas where the greatest genetic diversity indexes were found. As the acquisition of information about the environmental causes that are... / Mestre

Resumo: No âmbito de um estudo sobre a ecologia e a pesca de tubarões costeiros no litoral centro-sul de São Paulo, foram feitas amostragens semanais junto aos desembarques da frota artesanal sediada na Praia dos Pescadores, no município de Itanhaém. Os barcos operam a uma distância de 2 a 12 milhas náuticas (20 km) da costa, em profundidades de 5 a 30 m, utilizando redes de emalhe. Entre julho de 1996 e dezembro de 2003, foram examinados 14730 exemplares, compreendendo sete famílias, nove gêneros e 18 espécies. A acumulação de espécies em função do número de amostragens apresentou tendência de estabilização a partir de 90 amostragens. Em geral, a diversidade foi menor no outono-inverno e maior na primavera-verão. A captura por unidade de esforço (CPUE) dos tubarões apresentou picos nos meses de início (janeiro e fevereiro), meio (julho e agosto) e final de ano (novembro e dezembro). Essas flutuações estiveram associadas aos padrões de recrutamento, distribuição e ocorrência das espécies mais abundantes. Cinco espécies de Carcharhiniformes utilizam o litoral centro-sul de São Paulo como área de berçário entre o inverno e verão. O tempo de permanência dos neonatos e jovens na área de estudo esteve inversamente relacionado com o tamanho de nascimento das espécies, indicando maior dependência dos filhotes menores por águas mais rasas e, supostamente mais protegidas de predadores. Foi observada uma assincronia seqüencial na atividade de parto das espécies, sugerindo que o estabelecimento de berçários coletivos aumenta as chances de competição e predação entre os filhotes. Pressões seletivas neste sentido parecem levar ao desenvolvimento de táticas reprodutivas que amenizam esses efeitos, reduzindo a mortalidade natural dos filhotes durante os primeiros meses de vida. / Abstract: Ecological aspects of the coastal sharks caught by artisanal fisheries from southeastern Brazil were studied between July 1996 and December 2003. The fishing fleet comprised 12 small motorized boats (4 - 10 m long), using monofilament gill nets with 1500 m length and stretched mesh sizes of 7, 12 and 14 cm on average. The nets are set within an area of 2 - 12 nautical miles from the shore, in waters between 5 and 30 m deep. During the study period, 14730 sharks of seven families, nine genera and 18 species were examined. In general, diversity was highest in spring-summer and lowest in autumn-winter. Catch per unit of effort (CPUE) showed peak in outset (Jan-Feb), middle (Jul- Aug) and, end (Nov-Dec) of the years. Both diversity and CPUE fluctuations were associated with recruitment, distribution and occurrence of the five most abundant species (Rhizoprionodon lalandii, R. porosus, Sphyrna lewini, Carcharhinus brevipinna and C. limbatus), that represented 96% of the total catch. These species use the study area as nursery between winter and summer with a sequence of parturition progressing from the smallest (R. lalandii, 35 cm birth size) to the largest species (C. limbatus, 70 cm birth size). Such pattern was associated with reproductive tactics that may minimize both inter-specific predation and competition among newborns, thereby reducing natural mortality during their first few months of life. / Orientador: Ivan Sazima / Coorientador: Otto Bismarck Fazzano Gadig / Banca: Ricardo Clapis Garla / Banca: Ricardo de Sousa Rosa / Banca: Marcos César de Oliveira Santos / Banca: Roberto Goitein e Otto Bismarck Fazzano Gadig / Doutor

Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: Fernando F. Mendonça / Banca: Diego Teruo Hashimoto / Banca: Paulino Martinez Portella / Resumo: Até poucas décadas atrás, a pesca de tubarões era incidental e sem efeitos significativos para as suas populações. No entanto, devido ao grande aumento no valor de suas nadadeiras na Ásia e ao declínio das populações de peixes mais tradicionais para o consumo humano, os tubarões passaram a ser alvo de pescarias em quase todo o mundo, promovendo a inclusão de diversas espécies na lista de espécies ameaçadas de extinção. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido à sua distribuição em vastas áreas geográficas. Destas, o tubarão mako, Isurus oxyrinchus, com ocorrência circunglobal, está entre as principais espécies que apresentam sinais de vulnerabilidade, com tendência ao esgotamento populacional e, no entanto, avaliações que viabilizem o manejo adequado da pesca ainda são inconsistentes. Estudos relacionados à estruturação genética populacional de peixes têm contribuído substancialmente para a elucidação de questões como a variabilidade genética, distribuição geográfica, padrões de migração, estoques reprodutivos, taxonomia, sistemática e eventos históricos. Tais aspectos são especialmente relevantes para o setor pesqueiro, fornecendo subsídios para o manejo e conservação dos estoques. Considerando a urgente necessidade de controle sustentável da pesca, dificultada principalmente pela falta de informações, este estudo buscou caracterizar a estrutura genética populacional da espécie I. oxyrinchus no Oceano Atlântico, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop). Foram analisados 144 indivíduos e a análise de 729 pares de bases nucleotídicas desta região genômica permitiu a caracterização de 27 haplótipos, sendo que 18 destes haplótipos (67%) estão compartilhados por todas as regiões amostradas. Os resultados indicam a ... / Abstract: Until a few decades ago, shark fishing was only incidental and had no significant effects on their populations. However, due to the large increase in the value of shark's fins in Asia and the decline of more traditional fish populations for human consumption, sharks became target fishing around the world, promoting the inclusion of several species in the list of endangered species. Among the most exploited sharks, the pelagic species exhibit greater complexity in the assessment and monitoring of their populations due to their distribution in broad geographical areas. From these species, the mako shark, Isurus oxyrinchus, of global occurrence, is among the main species that show vulnerability signs, with a trend to deplete population, and however, evaluations that facilitate appropriate management of fisheries are still inconsistent. Studies related to genetic structure of fish populations have contributed substantially to the elucidation of issues such as genetic variability, geographical distribution, migration patterns, reproductive stocks, taxonomy, systematics, and historical events. These aspects are especially relevant to fisheries sector, providing subsidies for the management and conservation of fish stocks. Considering the urgent need for a sustainable control of fisheries, hampered mainly by the lack of information, this study aimed to characterize the population genetic structure of the shark I. oxyrinchus in the Atlantic Ocean, using sequences of mitochondrial DNA control region (D-loop). We analyzed 144 individuals and analysis of 729 nucleotide base pairs of this genomic region allowed the characterization of 27 haplotypes, with 18 of these haplotypes (67%) being shared by all regions sampled. The results indicate the occurrence of a moderate genetic variability (π = 0.004 and h = 0.791 ± 0.029), with high population structure between the northern and southern hemispheres (FST values: ... / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-08-31Bitstream added on 2014-06-13T19:46:41Z : No. of bitstreams: 1 motta_fs_dr_rcla.pdf: 2587305 bytes, checksum: 0ff789362fdf8eb0461ea7ed5c963eeb (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No âmbito de um estudo sobre a ecologia e a pesca de tubarões costeiros no litoral centro-sul de São Paulo, foram feitas amostragens semanais junto aos desembarques da frota artesanal sediada na Praia dos Pescadores, no município de Itanhaém. Os barcos operam a uma distância de 2 a 12 milhas náuticas (20 km) da costa, em profundidades de 5 a 30 m, utilizando redes de emalhe. Entre julho de 1996 e dezembro de 2003, foram examinados 14730 exemplares, compreendendo sete famílias, nove gêneros e 18 espécies. A acumulação de espécies em função do número de amostragens apresentou tendência de estabilização a partir de 90 amostragens. Em geral, a diversidade foi menor no outono-inverno e maior na primavera-verão. A captura por unidade de esforço (CPUE) dos tubarões apresentou picos nos meses de início (janeiro e fevereiro), meio (julho e agosto) e final de ano (novembro e dezembro). Essas flutuações estiveram associadas aos padrões de recrutamento, distribuição e ocorrência das espécies mais abundantes. Cinco espécies de Carcharhiniformes utilizam o litoral centro-sul de São Paulo como área de berçário entre o inverno e verão. O tempo de permanência dos neonatos e jovens na área de estudo esteve inversamente relacionado com o tamanho de nascimento das espécies, indicando maior dependência dos filhotes menores por águas mais rasas e, supostamente mais protegidas de predadores. Foi observada uma assincronia seqüencial na atividade de parto das espécies, sugerindo que o estabelecimento de berçários coletivos aumenta as chances de competição e predação entre os filhotes. Pressões seletivas neste sentido parecem levar ao desenvolvimento de táticas reprodutivas que amenizam esses efeitos, reduzindo a mortalidade natural dos filhotes durante os primeiros meses de vida. / Ecological aspects of the coastal sharks caught by artisanal fisheries from southeastern Brazil were studied between July 1996 and December 2003. The fishing fleet comprised 12 small motorized boats (4 - 10 m long), using monofilament gill nets with 1500 m length and stretched mesh sizes of 7, 12 and 14 cm on average. The nets are set within an area of 2 - 12 nautical miles from the shore, in waters between 5 and 30 m deep. During the study period, 14730 sharks of seven families, nine genera and 18 species were examined. In general, diversity was highest in spring-summer and lowest in autumn-winter. Catch per unit of effort (CPUE) showed peak in outset (Jan-Feb), middle (Jul- Aug) and, end (Nov-Dec) of the years. Both diversity and CPUE fluctuations were associated with recruitment, distribution and occurrence of the five most abundant species (Rhizoprionodon lalandii, R. porosus, Sphyrna lewini, Carcharhinus brevipinna and C. limbatus), that represented 96% of the total catch. These species use the study area as nursery between winter and summer with a sequence of parturition progressing from the smallest (R. lalandii, 35 cm birth size) to the largest species (C. limbatus, 70 cm birth size). Such pattern was associated with reproductive tactics that may minimize both inter-specific predation and competition among newborns, thereby reducing natural mortality during their first few months of life.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-01-06Bitstream added on 2014-06-13T19:05:57Z : No. of bitstreams: 1 garla_rc_dr_rcla.pdf: 1566045 bytes, checksum: 33a6e91849d61d578c9d020171e589af (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente trabalho visa gerar informações básicas sobre a ecologia e a situação populacional do tubarão-cabeça-de-cesto Carcharhinus perezi, lambarú Ginglymostoma cirratum e tubarão-limão Negaprion brevirostris no Arquipélago de Fernando de Noronha, com ênfase na primeira, por ser numericamente dominante. Utilizou-se a combinação de técnicas de marcação e recaptura e de telemetria ultra-sônica para fornecer informações sobre: estrutura populacional, distribuição espacial dos tubarões e de suas áreas de berçário, época de parto, padrões de movimentação e de utilização do hábitat. Amostras de sangue foram analisadas para caracterização sorológica das espécies. Foi implantado um programa de conscientização e educação sobre a necessidade de conservação dos tubarões, e realizou-se um curso de capacitação em Educação Ambiental para os professores do ensino médio e fundamental. A plataforma insular do arquipélago é utilizada como área de parto e de crescimento de jovens pelas três espécies de tubarões. Carcharhinus perezi apresenta maior segregação espacial por tamanho. Não ocorre segregação espacial em Ginglymostoma cirratum e Negaprion brevirostris pois foram observados indivíduos neonatos, jovens e adultos freqüentando a região próxima à linha costeira do arquipélago. Os tubarões utilizam com menor freqüência o trecho da Área de Proteção Ambiental (APA) do arquipélago, o que possivelmente está relacionado à intensificação da utilização humana e a indícios de empobrecimento biológico da região nos últimos anos. O monitoramento por telemetria mostra que: os tubarões jovens são residentes em trechos específicos do arquipélago; eles podem ser ativos a qualquer horário do dia, mas os maiores espaços de atividade e deslocamentos ocorrem à noite; aparentemente não existem variações sazonais... / The aim of the present study is to provide basic data on the ecology and population status of the reef-shark Carcharhinus perezi, nurse-shark Ginglymostoma cirratum and lemon-shark Negaprion brevirostris at Fernando de Noronha archipelago, with special reference to Carcharhinus perezi, due to its numerical dominance. A combination of mark and recapture and ultrasonic telemetry methods were used to gather data on: the population structure, spatial distribution of the sharks, location of the nursery grounds, parturition time, patterns of movement and habitat use. Blood samples were analyzed for a serological characterization of the species. An educational program was established to increase the community awareness about shark conservation, and a capacitating course on Environmental Education was offered to teachers of the local school. The archipelago s insular shelf is used as a parturition and growing ground for young sharks of the three species. Carcharhinus perezi shows size segregation. Size segregation was not observed in Ginglymostoma cirratum and Negaprion brevirostris, and neonate, young and adult sharks of these species were observed to frequent shallow waters of the archipelago. Sharks rarely frequent the archipelago s Environmental Protection Area (EPA), which is probably related to an intensification of human use and evidences of biological impoverishment of this site in recent years. The telemetry monitoring shows that: the young sharks are resident and present site fidelity to specific portions of the archipelago; they may be active at any time of the day, but the larger activity spaces and excursions occur at night; apparently there is no seasonal variation in activity spaces and habitat use; and larger sharks have more extensive activity spaces. The main problems for the management and conservation of the sharks are:... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-09-27Bitstream added on 2014-06-13T19:12:56Z : No. of bitstreams: 1 000749214.pdf: 1021607 bytes, checksum: d716daae1fd7be486189d76347e657ad (MD5) / Até poucas décadas atrás, a pesca de tubarões era incidental e sem efeitos significativos para as suas populações. No entanto, devido ao grande aumento no valor de suas nadadeiras na Ásia e ao declínio das populações de peixes mais tradicionais para o consumo humano, os tubarões passaram a ser alvo de pescarias em quase todo o mundo, promovendo a inclusão de diversas espécies na lista de espécies ameaçadas de extinção. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido à sua distribuição em vastas áreas geográficas. Destas, o tubarão mako, Isurus oxyrinchus, com ocorrência circunglobal, está entre as principais espécies que apresentam sinais de vulnerabilidade, com tendência ao esgotamento populacional e, no entanto, avaliações que viabilizem o manejo adequado da pesca ainda são inconsistentes. Estudos relacionados à estruturação genética populacional de peixes têm contribuído substancialmente para a elucidação de questões como a variabilidade genética, distribuição geográfica, padrões de migração, estoques reprodutivos, taxonomia, sistemática e eventos históricos. Tais aspectos são especialmente relevantes para o setor pesqueiro, fornecendo subsídios para o manejo e conservação dos estoques. Considerando a urgente necessidade de controle sustentável da pesca, dificultada principalmente pela falta de informações, este estudo buscou caracterizar a estrutura genética populacional da espécie I. oxyrinchus no Oceano Atlântico, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop). Foram analisados 144 indivíduos e a análise de 729 pares de bases nucleotídicas desta região genômica permitiu a caracterização de 27 haplótipos, sendo que 18 destes haplótipos (67%) estão compartilhados por todas as regiões amostradas. Os resultados indicam a... / Until a few decades ago, shark fishing was only incidental and had no significant effects on their populations. However, due to the large increase in the value of shark’s fins in Asia and the decline of more traditional fish populations for human consumption, sharks became target fishing around the world, promoting the inclusion of several species in the list of endangered species. Among the most exploited sharks, the pelagic species exhibit greater complexity in the assessment and monitoring of their populations due to their distribution in broad geographical areas. From these species, the mako shark, Isurus oxyrinchus, of global occurrence, is among the main species that show vulnerability signs, with a trend to deplete population, and however, evaluations that facilitate appropriate management of fisheries are still inconsistent. Studies related to genetic structure of fish populations have contributed substantially to the elucidation of issues such as genetic variability, geographical distribution, migration patterns, reproductive stocks, taxonomy, systematics, and historical events. These aspects are especially relevant to fisheries sector, providing subsidies for the management and conservation of fish stocks. Considering the urgent need for a sustainable control of fisheries, hampered mainly by the lack of information, this study aimed to characterize the population genetic structure of the shark I. oxyrinchus in the Atlantic Ocean, using sequences of mitochondrial DNA control region (D-loop). We analyzed 144 individuals and analysis of 729 nucleotide base pairs of this genomic region allowed the characterization of 27 haplotypes, with 18 of these haplotypes (67%) being shared by all regions sampled. The results indicate the occurrence of a moderate genetic variability (π = 0.004 and h = 0.791 ± 0.029), with high population structure between the northern and southern hemispheres (FST values: ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-01-31Bitstream added on 2014-11-10T11:57:44Z : No. of bitstreams: 1 000790592.pdf: 3857602 bytes, checksum: 72b0dbe419ddb3db8e0a9b09acb0bad7 (MD5) / O objetivo principal deste estudo foi determinar a diversidade dos parasitos que ocorrem nas raias e tubarões marinhos no litoral sul e sudeste do Brasil, capturados pela pesca de arrasto-de-parelha e de arrasto de fundo duplo de pequeno e médio porte - pesca do camarão sete-barbas (Xiphopenaeus kroyeri) e pesca do camarão-rosa (Penaeus brasiliensis) respectivamente, e desembarcados nas cidades de Santos e Guarujá-SP. Entre abril de 2012 e abril de 2013, foram necropsiadas quatorze espécies de raias e três espécies de tubarões, totalizando 123 exemplares: 7 tubarões e 116 raias. Como resultados, reporta-se nova ocorrência do nematoda Proleptus acutus em Atlantoraja platana, Rhinobatos percellens, Rhinobatos horkelli, Zapteryx brevirotris, Rioraja agassizii e Atlatoraja cyclophora, e nova ocorrência de Procamallanus (Spirocamallanus) pereirae em Atlantoraja castenaui e Atlatoraja cyclophora, e nova ocorrência do cestoda Rhinoptericola megacantha em Rhinoptera brasiliensis. Reporta-se também ocorrência de seis diferentes espécies de cestóides, ainda não registrados: duas das espécies encontradas (Cestoda gen. sp. 1 e Cestoda gen. sp. 2) pertencem a gêneros ainda não descritos em literatura. Os demais cestoides foram identificados apenas em nível de gênero (Rhodobothrium sp., Cairaeanthum sp., Tiarabothrium sp e Uncibilocularis sp.), pois não se caracterizam nas espécies já descritas dos mesmos / The main objective of this study was to determine the diversity of parasites in marine sharks and rays in the south and southeast coast of Brazil, catches by pair trawls and by bottom trawling of small and medium size– for fishery of shrimp Xiphopenaeus kroyeri and Penaeus brasiliensis, respectively, and landed in the cities of Santos and Guaruja - SP . Between april 2012 and april 2013, fourteen species of stingrays and three species of sharks, totaling 129 animals, were necropsied: 7 sharks and 116 rays. As a result, refers reoccurrence of nematode Proleptus acutus in Atlantoraja platana , Rhinobatos percellens, Rhinobatos horkelli, Zapteryx brevirotris, Rioraja agassizii and Atlatoraja cyclophora, recurrence of Procamallanus (Spirocamallanus) pereirae in Atlantoraja castenaui and Atlatoraja cyclophora, and recurrence the Cestoda Rhinoptericola megacantha in Rhinoptera brasiliensis . It refers also occurrence of six different species of cestodes, not yet recorded: two of the species found (Cestoda sp. gen. 1 and Cestoda gen. sp. 2) belong to genera not yet described in the literature . The other cestodes were identified only at genus level (Rhodobothrium sp., Cairaeanthum sp., Uncibilocularis sp. and Tiarabothrium sp.), because it does not characterize the species already described them

Orientadora : Profa. Dra. Carolina Arruda de Oliveira Freire / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 22/06/2017 / Inclui referências : f. 140-182 / Area de concentração: Zoologia / Resumo: Predadores de topo e mesopredadores são de extrema importância para a saúde e equilíbrio dos ecossistemas onde estão inseridos. Desequilíbrios ambientais que causam disfunção ecológica afetam primeiramente animais que ocupam níveis tróficos mais elevados, sendo estes importantes indicadores (sentinelas) de impacto. Raias e tubarões são constantemente expostos à pressão antropogênica, sendo observada, atualmente, uma redução expressiva das populações em nível mundial. Dentre os impactos antropogênicos com efeitos diretos em elasmobrânquios, a sobrepesca é a atividade mais expressiva, responsável por declínios de até 90% para algumas espécies de grande importância ecológica (e.g. tubarões-branco; tubarões-martelo). Nas últimas décadas, o declínio acentuado de várias espécies de predadores de topo já apresentou efeitos tróficos negativos, através da redução da resiliência de espécies-chave. Adicionalmente, os efeitos das mudanças climáticas na distribuição e resiliência de raias e tubarões já são observados, afetando não apenas o equilíbrio dos ecossistemas, mas também a economia baseada na captura comercial. O uso de ferramentas fisiológicas como método para avaliar a plasticidade e vulnerabilidade é um campo promissor, uma vez que permite uma melhor compreensão da habilidade espécie-específica frente a estressores antrópicos e alterações ambientais. Dessa forma, a fisiologia da conservação pode ajudar a resolver problemas de gestão através da elucidação de processos biológicos básicos moldados evolutivamente, determinando assim como um organismo irá responder à ameaças imediatas. Baseada nesta premisa, esta tese de doutorado teve como objetivo utilizar análises fisiológicas para a análise de mecanismos ativados frente à condições estressoras as quais estes animais são comumente expostos (estresse de captura e manejo; exposição ao ar) ou poderão ser expostos frente à alterações climáticas (alterações térmicas e salinas). Os quarto capítulos iniciais têm como foco de estudo os efeitos deletérios da pesca (comercial e esportiva) em Zapteryx brevirostris (capítulo 1), Galeocerdo cuvier (capítulo 2), Ginglymostoma cirratum (capítulo 3) e Carcharhinus limbatus (capítulo 4) com a utlização de ferramentas fisiológicas (análises plasmáticas e varredura infravermelha) de forma a avaliar os mecanismos fisiológicos ativados frente ao estresse de captura, exposição ao ar e manejo. Os dois capítulos finais da tese objetivam a exploração da plasticidade de Zapteryx brevirostris (capítulo 5) e Sphyrna mokarran (capítulo 6) frente à alterações ambientais previstas pelas mudanças climáticas. Análises plasmáticas e varredura infravermelha também foram utilizadas. Os resultados demonstram que todos os estressores analisados são significativos, alterando os padrões homeostáticos das espécies aqui estudadas, podendo reduzir de forma significativa a resiliência e distribuição das mesmas. Por fim, as análises aqui utilizadas se mostraram eficientes, sendo de fato importantes ferramentas para a fisiologia da conservação do grupo. Palavras-chave: Raias, tubarões, salinidade, temperatura, manejo pesqueiro, fisiologia da conservação. / Abstract: Top mesopredators are of upmost importance for the health and balance of the ecosystems in which they are inserted. Environmental imbalances that cause ecological disruption primarily affect animals occupying higher trophic levels, being sharks and mammal's important indicators (sentinels) of impacts. Elasmobranchs are constantly exposed to anthropogenic pressure, leading to an expressive reduction of populations worldwide. Among the impacts with direct effects on sharks and batoids, overfishing is the most expressive activity, responsible for declines up to 90% for some species of great ecological importance (e.g. white sharks, hammerhead sharks). In the last decades, the marked decline of top predators has already exhibited negative effects at trophic level, reducing the resilience and ability to cope with stress of key species. In addition, the effects of climate change on distribution and survival are already observed, affecting not only the ecosystem balance, but also the economy based on commercial capture. The use of physiological tools as a method to assess plasticity and vulnerability is a promising field, since it allows a deeper understanding of how organisms respond to anthropic stressors and environmental changes. Thus, conservation physiology may help to solve management issues by elucidating basic biological process that were evolutionarily molded and determine how an organism will respond to immediate threats. Based on this premise, this doctoral thesis had as objective to use physiological analyzes to evaluate the mechanisms activated during stressful conditions which these animals are commonly exposed (capture and handling; air exposure) or may be exposed due to climate change (thermal and saline alterations). The first four chapters focus on the deleterious effects of fishing (commercial and recreational) on Zapteryx brevirostris (chapter 1), Galeocerdo cuvier (chapter 2), Ginglymostoma cirratum (chapter 3) and Carcharhinus limbatus (chapter 4) using physiological tools (plasma analysis and infrared scanning) to evaluate the mechanisms activated facing stress of capture, handling and air exposure. The final two chapters of the thesis aim to exploit the plasticity of Zapteryx brevirostris (Chapter 5) and Sphyrna mokarran (Chapter 6) facing environmental alterations predicted by climate changes. Plasma analyzes and infrared scanning were also used. Our results demonstrate that all the stressors analyzed are significant, altering the homeostatic patterns of the species studied here, being able to reduce significantly their resilience and distribution. Finally, the analyzes applied in the present study proved to be efficient, being in fact important tools for conservation physiology. Key-words: Batoids, sharks, salinity, temperature, fishing management, conservation physiology.