Made available in DSpace on 2016-06-02T19:06:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissGBO.pdf: 1833938 bytes, checksum: 24ceae16595b3b1073dda4958829de16 (MD5) Previous issue date: 2005-08-31 / Currently, some genomas of creatures are being mapping, so enormous amounts of data are being generated. This data is sometimes stored in different data sources and at many times, these sources are heterogeneous and distributed, which results in the necessity of the use of new query techniques and integration of data. After this, the biologists can usufruct greaters and better resources during the research process. This work has the proposal of to build a Bioinformatics environment for the integration of different data sources and their reorganization in a centered source that supports a flexible and efficient manner to build queries. The environment is called as Bio-TIM, which is composed by three layers. The main one is called "Mediator" and it is composed by a connection manager for databases management systems, by wrappers, by a Data Warehouse and by a specific database. / Atualmente, vários genomas de seres vivos estão sendo mapeados gerando enormes quantidades de dados, as quais são armazenadas em diferentes fontes de informações. O fato dos dispositivos de armazenamento de dados serem heterogêneos e distribuídos resulta na necessidade de criação de técnicas de consulta e integração de dados para que os biólogos possam usufruir de maiores e melhores recursos durante o processo de pesquisa. Este trabalho propôs um ambiente de bioinformática para a integração de diferentes fontes de dados e sua reorganização em uma fonte centralizada propiciando consultas flexíveis e eficientes. O ambiente foi denominado Bio-TIM, o qual é composto por três camadas, sendo a principal denominada Mediador . Ela é composta por um gerenciador de conexões a sistemas gerenciadores de bancos de dados, por tradutores, por um Data Warehouse e por um banco de dados específico.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Bioética, 2014. / Submitted by Laís Lorena Barbosa Garcia (lais-lorena@hotmail.com) on 2014-11-06T11:41:15Z No. of bitstreams: 1 2014_IvoneLaurentinodosSantos.pdf: 2106425 bytes, checksum: 0741fb6748ebf03175592770ad10cea4 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-11-06T12:01:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_IvoneLaurentinodosSantos.pdf: 2106425 bytes, checksum: 0741fb6748ebf03175592770ad10cea4 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-06T12:01:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_IvoneLaurentinodosSantos.pdf: 2106425 bytes, checksum: 0741fb6748ebf03175592770ad10cea4 (MD5) / O presente estudo examina o pensamento do educador brasileiro Paulo Freire à luz da Declaração Universal sobre Bioética e Direitos Humanos da Organização das Nações Unidas para a Educação, a Ciência e a Cultura - Unesco . A partir da análise de conteúdo de três obras de Freire, a saber: Pedagogia do Oprimido, Pedagogia da Esperança e Pedagogia da Autonomia - desenvolvida com o auxílio do software ALCESTE (Análise Lexical Contextual de um Conjunto de Segmentos de Texto), a proposta confronta os referenciais e categorias teóricas presentes nas referidas obras com dez dos princípios contidos na Declaração sobre bioética da Unesco e relacionados com as idéias do pedagogo. São eles: Dignidade Humana e Direitos Humanos (art. 3); Autonomia e Responsabilidade Individual (art. 5); Respeito pela Vulnerabilidade Humana e pela Integridade Individual (art. 8); Igualdade, Justiça e Equidade (art. 10); Não-Discriminação e Não-Estigmatização (art. 11); Respeito pela Diversidade Cultural e Pluralismo (art. 12); Solidariedade e Cooperação (art. 13); Responsabilidade Social em Saúde (art. 14); Proteção das Gerações Futuras (art. 16) e Proteção do Meio Ambiente, da Biosfera e da Biodiversidade (art. 17). A inclusão destes artigos direta ou indiretamente relacionados com a área social na dita Declaração, provocou, por um lado, uma significativa ampliação conceitual na bioética, e, por outro, uma mudança profunda na sua agenda para o Século 21, tornando-a mais politizada e comprometida com as populações vulneráveis e excluídas do planeta, que Freire denomina de condenados da terra. O estudo demonstra que, embora não utilizando especificamente a epistemologia bioética, os fundamentos básicos contidos nos princípios da Declaração sobre Bioética da Unesco estão substancialmente representados no discurso de Freire, podendo a sua Ética Universal do Ser Humano ser utilizada como ferramenta na construção de uma Bioética política, plural e interventiva, capacitada a contribuir para o aperfeiçoamento da cidadania; na luta pelo respeito aos direitos humanos universais e no resgate da dignidade humana. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The present study examines the writings of Brazilian educator Paulo Freire in the light of the Universal Declaration on Bioethics and Human Rights of the United Nations Educational, Scientific and Cultural Organization (UNESCO). On the basis of a content analysis of three works by Freire, namely: Pedagogy of the Oppressed, Pedagogy of Hope and Pedagogy of Autonomy - developed with the ALCESTE software (Lexical and Contextual Analysis of a Set of Text Segments), the study seeks to examine and compare referential and theoretical categories present in these works with ten of the principles contained in the UNESCO Declaration on Bioethics that are related to Freire´s ideas. These are: Human Dignity and Human Rights (art. 3); Autonomy and Individual Responsibility (art. 5); Respect for Human Vulnerability and Individual Integrity (art. 8); Equality, Justice and Equity (art. 10); Non-Discrimination and Non-Stigmatization (art. 11); Respect for Cultural Diversity and Pluralism (art. 12); Solidarity and Cooperation (art. 13); Social Responsibility in Health (art. 14); Protection of Future Generations (art. 16) and Environmental Protection, Biosphere and Biodiversity (art. 17). The inclusion of these items directly or indirectly related to the social area in the Declaration caused firstly a significant conceptual expansion in bioethics and, secondly, a profound change in its agenda for the 21st century, effectively rendering it more politicized and committed to the world´s most vulnerable and excluded populations – called by Freire the ‘wretched of the earth’. The study demonstrates that, although not specifically employing bioethics epistemology, the key principles contained in the UNESCO Declaration on Bioethics and Human Rights are substantially represented in Freire´s discourse and show that his Universal Ethics of the Human Being can be used as a tool for building a political, plural and interventional Bioethics, able to contribute to citizenship enhancement, to the struggle for respect for universal human rights and to the emancipation of human dignity.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-12-05T15:27:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE MARCIA FERNANDA ROCHA.pdf: 2613842 bytes, checksum: 7d76b38087a5b0a8f6f29c407458990c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-05T15:27:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE MARCIA FERNANDA ROCHA.pdf: 2613842 bytes, checksum: 7d76b38087a5b0a8f6f29c407458990c (MD5) Previous issue date: 2016-09-14 / CAPES / O impacto de combustíveis sobre o meio ambiente é de grande interesse devido à possibilidade da ocorrência de derramamentos. O objetivo principal deste trabalho foi avaliar a toxicidade e a biodegradação dos combustíveis diesel (D), biodiesel de algodão (B100) e suas misturas (Bx) em meio aquoso. A toxicidade dos combustíveis em diferentes concentrações foi analisada em sementes de alface. Os resultados mostraram que a toxidez está associada ao tipo e à concentração do combustível, sendo o diesel o mais tóxico. Um ensaio preliminar foi realizado para investigar o potencial de biodegradação dos combustíveis-teste (B100, D e B20) pelos micro-organismos Saccharomyces cerevisiae e Pseudomonas aeruginosa não adaptados e adaptados por um período de 12 dias. Foram mensuradas a concentração de células viáveis, pH, DQO, DBO5 e a toxicidade. A eficiência do processo de biodegradação se comportou da seguinte forma: biodiesel (B100) > Mistura B20 > diesel. A P. aeruginosa adaptada apresentou o maior potencial de remoção da matéria orgânica no processo de biodegradação dos combustíveis, e por isso foi o micro-organismo utilizado nos ensaios subsequentes. Ensaios em batelada foram conduzidos em um biorreator do tipo tanque sob condições de agitação (250rpm) e aeração (0,5 vvm), a fim de ser investigada a biodegradação aeróbia do B100 (Ensaio 1 e 2) e do B20 (Ensaio 3) por um período de 62 dias. Os Ensaios 2 e 3 foram realizados com adição suplementar de KNO3 ao 7° dia de processo. Foram mensuradas a concentração de células viáveis, pH, DQO, DBO5, teor de ésteres de ácidos graxos e toxicidade. Os ensaios revelaram que a P. aeruginosa adaptada foi capaz de biodegradar, mas não de mineralizar estes combustíveis. As cinéticas de biodegradação revelaram um perfil cinético de decaimento de reação de primeira ordem e foi observado que o composto com maior número de ligações insaturadas (C18:2) foi o que apresentou um maior coeficiente de biodegradação, levando menor tempo de meia-vida de 18 dias para ser degradado. Em todos os casos ocorreu redução da concentração de células viáveis de 107 UFC.cm-3 para 104UFC.cm-3. Em relação aos ésteres metílicos, observou-se degradação de 37,51% e 34,82% para o C16:0 nos Ensaios 1 e 2, respectivamente. Os demais ésteres apresentaram 100% de degradação. Realizou-se também estudo da degradação do biodiesel por fotólise (abiótico) irradiado (254 nm), variando-se as velocidades de agitação (750 e 2000 rpm), por período de 28.200 segundos dos principais ésteres metílicos palmítico (C16:0), oleico (C18:1) e linoléico (C18:2), resultou numa redução de 87,08% (C18:2), 86,04% (C18:1) e 86,08% (C16:0), para rotação de 2000 rpm e de 100% de redução, para o ensaio à 750 rpm. Observou-se em todos os experimentos (bióticos e abióticos) que houve uma redução do pH e que esta redução está relacionada com as reações de degradação da mistura reagente. / The impact of fuel on the environment is of great interest due to the possibility of the occurrence of spillage. The aim of this study was to evaluate the toxicity and biodegradation of diesel fuel (D), cotton biodiesel (B100) and your mixtures (Bx) in aqueous medium. The toxicity of the fuels in different concentrations was analyzed on lettuce seeds. The results showed that the toxicity is associated with the type and concentration of the fuel being the most toxic diesel. A preliminary test was conducted to investigate the potential for degradation of the test fuel (B100, B20 and D) by microorganism Pseudomonas aeruginosa and Saccharomyces cerevisiae not suited and adapted for a period of 12 days. We measured the concentration of viable cells, pH, COD, BOD 5 and toxicity. The efficiency of the biodegradation process behaved as follows: biodiesel (B100)> B20> Diesel. The P. aeruginosa adapted showed the greatest potential for removal of organic matter in fuel biodegradation process and so was the microorganism used in subsequent trials. Batch tests were conducted in a bioreactor tank-type stirring conditions (250 rpm) and aeration (0,5vvm) to be investigated aerobic biodegradation B100 (Assay 1 and 2) and B20 (Assay 3) a period of 62 days. Runs 2 and 3 were performed with further adding KNO3 to the 7th day process. We measured the concentration of viable cells, pH, COD, BOD5 content of fatty acid esters and toxicity. The tests revealed that the adapted P. aeruginosa was able to mineralize not biodegrade but these fuels. The kinetics of biodegradation showed a kinetic profile of first order reaction decay and it was observed that the compound more unsaturated bonds (C18: 2) showed the higher coefficient of biodegradation, taking shorter half-life 18 days to be degraded. In all cases there was a reduction in the concentration of 107 UFC.cm-3 of viable cells to 104 UFC.cm-3. In relation to methyl ester, there was degradation of 37.51% and 34.82% for C16: 0 in runs 1 and 2, respectively. The remaining esters showed 100% degradation. It also conducted the study of degradation of biodiesel by photolysis (abiotic) irradiated (254 nm) varying the stirring speed (750 to 2000 rpm) for 28.200 seconds period of the main methyl esters palmitic (C16: 0), oleic (C18: 1) and linoleic (C18: 2) resulted in a reduction of 87.08% (C18:2) 86.04% (C18:1) and 86.08% (C16:0) for rotation 2000 rpm and 100% reduction to the test at 750 rpm. It was observed in all experiments (biotic and abiotic) that a reduction of pH and that this reduction is related to the degradation reactions of the reaction mixture.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-07-25T19:10:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Carlos Eduardo Martins Barbosa.pdf: 4171557 bytes, checksum: 916be606f3460c9a1d6bfd4949bcfdb5 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-07-26T22:19:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Carlos Eduardo Martins Barbosa.pdf: 4171557 bytes, checksum: 916be606f3460c9a1d6bfd4949bcfdb5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-26T22:19:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Carlos Eduardo Martins Barbosa.pdf: 4171557 bytes, checksum: 916be606f3460c9a1d6bfd4949bcfdb5 (MD5) Previous issue date: 2017-05-09 / Muitos problemas do mundo real podem ser formulados como problemas de otimização em domínios contínuos. Nos últimos anos, algoritmos bio-inspirados, que fundamentam-se no comportamento dos fenômenos naturais, têm sido cada vez mais empregados para resolver tais problemas. Neste trabalho, são investigados 8 (oito) algoritmos inspirados na natureza: algoritmos genéticos (GA), otimização por colônia de formigas (ACO), otimização por enxame de partículas (PSO), colônia de abelhas artificiais (ABC), algoritmo do vaga-lume (FA), algoritmo de busca do pássaro cuco (CS), algoritmo do morcego (BAT) e algoritmo de busca autoadaptativa do pássaro cuco (SACS). Estes algoritmos são analisados em três tipos de problemas distintos, que compreendem (1) funções de benchmark estudadas comumente em problemas de otimização, (2) previsão da energia eólica a partir da velocidade do vento com dados reais coletados de dois parques eólicos, e (3) clusterização de padrões, necessária na solução de problemas não-supervisionados. Os experimentos realizados com os diferentes algoritmos analisaram as principais vantagens e deficiências dos algoritmos em relação à (1) qualidade das soluções obtidas segundo métricas de desempenho específicas para cada problema, (2) tempo de execução do algoritmo e (3) tempo de convergência para a melhor solução. Uma técnica de ajuste automático dos parâmetros, também bio-inspirada, foi desenvolvida e empregada em todos os problemas e algoritmos, para se determinar os valores ótimos para cada método e permitir uma comparação consistente dos resultados. Os experimentos realizados evidenciaram que o algoritmo do pássaro cuco funciona de forma eficiente, robusta e superior aos outros métodos investigados para a maioria dos experimentos realizados, e que a propriedade de cauda longa da distribuição com voos de Lévy, explorada neste trabalho, é a principal responsável pela eficiência deste algoritmo. / Many real-world problems can be formulated as optimization problems in continuous domains. In the last years, bio-inspired algorithms, whice are based on the behavior of natural phenomena, have been increasingly employed to solve such problems. In this work, 8 (eight) algorithms inspired by nature are investigated: genetic algorithms (GA), ant colony optimization (ACO), particle swarm optimization (PSO), artificial bee colony (ABC), firefly algorithm (FA), cuckoo search algorithm (CS), bat algorithm (BAT) and self-adaptive cuckoo search algorithm (SACS). These algorithms are analyzed in three different types of problems, which comprise (1) benchmark functions commonly studied in optimization problems, (2) prediction of wind energy from wind speed with real data collected from two wind farms, and clustering patterns, required in solving unsupervised problems. The experiments performed with the different algorithms investigated the main advantages and disadvantages of the algorithms concerning (1) the quality of the solutions obtained according to specific metrics for each problem, (2) algorithm execution time and (3) convergence time for the best solution. A bio-inspired technique of automatic parameter tuning was developed and employed in all problems and algorithms in order to determine optimal values for each method and to allow a consistent comparison of the results. The performed experiments showed that the cuckoo search algorithm works efficiently, robustly and superior to the other investigated methods for most of the experiments, and the long tail property of the Lévy Flight distribution, explored in this work, is the main responsible for the efficiency of this algorithm.

Orientador: Laymert Garcia dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Filosofia e Ciencias Humanas / Made available in DSpace on 2018-08-04T18:51:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Monteiro_MarkoSynesioAlves_D.pdf: 14010644 bytes, checksum: 84f93a9c31977e89c8b6246cdca253a9 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: A tese tem por objetivo debater as mudanças atualmente em curso nas concepções modernas do corpo, a partir do impacto das novas tecnologias associadas à genética. Tais concepções, calcadas fortemente na dualidade cartesiana, estariam sendo modificadas pela possibilidade, cada vez mais real, de manipulação da natureza em seu nível molecular. As conseqüências teóricas de transformar o corpo, junto com a própria prática científica, em objetos de analise social, são debatidos. Um estudo de caso, a partir de pesquisa de campo feita em laboratórios de bioinformática na Universidade de São Paulo e no Instituto Ludwig de Pesquisa com Câncer/Hospital do Câncer, fundamenta empiricamente a discussão. Os microarrays, utilizados em pesquisas que buscam estabelecer biomarcadores para câncer de próstata, são analisados como objetos que encarnam as novas visões do corpo, num contexto marcado pelo avanço da biotecnologia. A tese debate também alguns aspectos políticos que se mostram relevantes na compreensão desse avanço tecnológico, como os temores de um ressurgimento da eugenia. Ao final, debatem-se alternativas analíticas e políticas para a compreensão do novo esatuto do corpo e da matéria viva, a partir de pistas dadas por artistas, engajados com a expressão artística através do corpo e da tecnologia, e através de teóricos que buscam repensar as bases nas quais assenta-se a biologia e a pesquisa científica contemporâneas / Abstract: This thesis analyzes transformations in contemporary conceptions of the body under the light of changes brought on by new technologies associated with genetics. These conceptions, strongly marked by a cartesian opposition between mind/matter, are being shifted in the context of the growing possibilities of the manipulation nature in its molecular leveI through technology. The theoretical consequences of tuming the body, as well as the scientific practice of manipulating it, as an object for the Social Sciences, are also debated. A case study, originated ITom field research with done in bioinformatics laboratories at the Universidade de São Paulo (USP) and the Ludwig Center for Cancer Research/Cancer Hospital, provides the empirical basis of the argument. Microarrays, used in the research being developed in the laboratories cited above in research towards the development of molecular markers for prostate cancer, are analyzed as objects that embody the new conceptions of the body that arise in a context of rapid advance in biotechnology. The thesis debates also some political aspects that are relevant for a deeper understanding of these technological developments, such as the fears surrounding a retum of eugenic practices. ln the conclusion some analytical and political altematives are discussed, as a means of pursuing a richer criticism of the new statute of the body and of living matter, using the example of artists that use the body and technology as medium of artistic expression; also through a debate of theorists that are busy rethinking the bases of contemporary biology and of current scientific practices / Doutorado / Doutor em Ciências Sociais

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