Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-01-15T14:47:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 336711.pdf: 582019 bytes, checksum: 7b50dc130e2dd49d075cc47ca5311391 (MD5) Previous issue date: 2015 / A ostra nativa Crassostrea gasar tem grande potencial para cultivo, no entanto a literatura sobre este assunto ainda é escassa. O objetivo do trabalho foi comparar o crescimento da ostra C. gasar cultivada em dois sistemas de cultivo suspensos. Exemplares foram submetidos a seis tratamentos: Um suspenso flutuante (sempre submerso) e cinco suspensos fixos (submerso em marés maiores ou iguais a 0,9 m, a 0,7 m, a 0,5 m, a 0,3 m e a 0,1 m). O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com três repetições. Mensalmente, de cada unidade experimental, 30 ostras eram amostradas para a biometria. Foram aferidos peso vivo total (g), altura (mm), comprimento (mm) e largura (mm). Ao final de sete meses de cultivo, para todas as dimensões avaliadas, os melhores resultados foram obtidos nos tratamentos suspenso flutuante e suspenso fixo submerso em marés maiores ou iguais a 0,1 m, não havendo diferença estatística entre os mesmos. As ostras atingiram nestes tratamentos, respectivamente, médias de 16,72 ± 1,7 g e 16,41 ± 0,90 g de peso vivo total, e 45,96 ± 0,23 mm e 49,78 ± 2,15 mm de altura. Conclui-se que as ostras Crassostrea gasar apresentam melhor crescimento quando cultivadas em sistema flutuante e em nível de maré abaixo de 0,1 m.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-01-15T14:50:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 336710.pdf: 2137586 bytes, checksum: 86eed8efe6681fe490176eaa75997f67 (MD5) Previous issue date: 2015 / A suplementação dietética de probióticos autónes na produção animal vem se consolidando como medida alternativa ao uso de antibióticos, os quais podem ocasionar problemas econômicos, sanitários e ambientais quando utilizados de forma indevida. Diante disto, o objetivo deste trabalho foi isolar e selecionar uma bactéria autóctone com potencial probiótico para rã-touro Lithobates catesbeianus e posteriormente suplementar este micro-organismo em dietas para girinos desta espécie. Inicialmente, foram isoladas 20 cepas de bactérias autóctones. Entretanto, apenas nove cepas foram selecionadas e submetidas aos testes in vitro. Ao final dos testes, contatou-se que a cepa de L. plantarum apresentou maior potencial probiótico dentre as avaliadas. Dessa forma, realizou-se a suplementação dietética deste micro-organismo em dietas comercial para girinos. O ensaio experimental foi composto por dois tratamentos: grupo sem suplementação e grupo suplementado com L. plantarum. Os animais que receberam dieta suplementada apresentaram maior ganho de peso, maior concentração de bactéria ácido-lática no intestino e menor conversão alimentar. A cepa L. plantarum foi capaz de produzir diversas enzimas digestivas, colonizar a ração e o trato intestinal dos girinos, mantendo-se em alta concentração 107 e 106 UFC·g-1, respectivamente. A cepa L. plantarum exibiu potencial probiótico para girinos de rã-touro.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-03-15T04:00:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337776.pdf: 1325936 bytes, checksum: 9e8d04013b0cf9ab85311c3d86d3530e (MD5) Previous issue date: 2015 / O objetivo do trabalho foi avaliar os índices produtivos do camarão marinho na fase de berçário submetido a diferentes densidades de estocagem (3000, 4000, 5000 e 6000 PL·m-3) e à presença ou ausência de substrato artificial. Foram realizados dois experimentos, primeiramente foram avaliadas diferentes densidades de estocagem com substrato tipo mosquiteiro. O segundo experimento avaliou a presença ou ausência de substrato artificial do tipo needlona®. O primeiro experimento teve duração de 38 dias, foram povoados 24 tanques com camarões de 0,013±0,010 g e o segundo durou 35 dias iniciando com camarões de 0,037±0,002 g povoados em seis tanques. Semanalmente foram feitas biometrias para reajustar a quantidade da ração. Os sólidos suspensos totais foram maiores para a densidade 6000 PL·m-3 (p=0,0003) e no tratamento com substrato tipo mosquiteiro (p=0,0103). O peso final (p=0,0002) e a taxa de crescimento específica (p=0,0001) foram maiores nos tratamentos com substrato tipo mosquiteiro. Contudo, a sobrevivência foi significativamente menor com uso deste substrato (p=0,0020). A produtividade foi significativamente maior na densidade de 6000 PL·m-3 (p=0,0001). O substrato tipo needlona® não influenciou sobre os índices produtivos nem sobre as variáveis de qualidade da água. Mas esse substrato artificial tipo needlona® tem potencial de reduzir a produção de lodos. Esses resultados indicam que é possível cultivar camarão no berçário com até 6000 PL·m-3 em sistema de bioflocos; e que o substrato do tipo needlona® diminui a produção de lodo no sistema.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia / Made available in DSpace on 2013-06-25T21:33:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 309618.pdf: 309275 bytes, checksum: f08ac80d14f76cfd53c16fb4fc2b4fd5 (MD5) / A Atrazina e muito utilizada no controle de erva-daninhas em cultivos agricolas, e como consequencia de seu uso, tem sido detectada no solo, aguas superficiais e subterraneas. Peixes tem sido muito utilizados como modelos em estudos de ecotoxicologia, indicando o risco biologico de exposicao a contaminantes. O objetivo desse trabalho foi identificar e validar genes diferencialmente transcritos no figado de Poecilia vivipara expostos a ATZ (100ug/L). Para tanto, foi realizada uma primeira exposicao com 100ug/L de ATZ a peixes P. vivipara oriundos de bioterio e empregado o metodo de hibridizacao subtrativa supressiva (SSH). A identificacao destes genes foi realizada por homologia com o banco de dados NCBI (Blastx), resultando em 34 sequencias que aparentemente tiveram uma repressao na transcricao e 61 dos genes que apresentaram um aumento na transcricao. Visando a analise de alguns genes provenientes da biblioteca subtrativa, uma segunda exposicao foi realizado com peixes proveninentes de ambiente natural e expostos a concentracoes crescentes de ATZ (2, 10 e 100 ug/L) por 24h. Os genes selecionados foram fibrinogenio gama e beta, inibidor de BAX, vitelogenina A, componente complemento C3 e C9 e ligante de acidos graxos. Os genes C9 e Fibrinogenio Beta aparentemente mostraram um aumento na transcricao nos tratamentos de 10 e 100 ug/L de ATZ em relacao ao grupo controle; e Vitelogenina A apresentou um aumento na transcricao nos animais do tratamento de 10ug/L de ATZ em relacao ao controle. Entretanto, os dois primeiros foram identificados na biblioteca dos genes reprimidos por ATZ. De forma similar, o gene Inibidor Bax-1 apresentou uma diminuicao em sua transcricao no figado dos animais tratados com 10ug/L de ATZ, apesar de estar presente na biblioteca dos genes induzidos. Tais discrepancias podem ser atribuidas a possiveis alteracoes populacionais, uma vez que o experimento preparatorio para a subtracao foi realizado com animais provenientes de cultivo no bioterio da FURG-RS e os experimentos de validacao foram realizados com populacoes de animais de ambiente natural em Florianopolis - SC.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura. / Made available in DSpace on 2013-07-15T23:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 222772.pdf: 609219 bytes, checksum: 7fb71450ba859e22632c8839aed52a42 (MD5) / Para estudar a taxa de assentamento e metamorfose do mexilhão Perna perna e melhor densidade de larvas (2, 3 e 4 larvas mL-1), foram realizadas três séries de experimentos. As duas primeiras foram conduzidas em tanques retangulares de 1,5L e 50L usando placas de PVC como coletores e, a última, em tanques cilíndricos de 80L e coletor de tela (200mm). As larvas utilizadas em todos os ensaios eram provenientes da mesma larvicultura, sendo que as larvas da terceira série permaneceram 3 dias na geladeira a 10º C. Os tanques cilíndricos com coletor de tela mostraram-se mais eficientes, apresentando uma taxa de assentamento de 71% e metamorfose de 43,5% ao final de 15 dias, o maior período analisado. Os tanques de 1,5L não apresentaram a mesma dinâmica que os tanques de 50L e as placas de PVC, apesar de permitirem uma contagem mais precisa, não proporcionaram uma adesão suficientemente forte, o que provocou ressuspensão de larvas já assentadas durante o manejo. Nos experimentos 1 e 2, o número de larvas assentadas aumentou em função do tempo, mas a taxa de assentamento foi maior nos primeiros 5 dias. As densidades de 3 e 4 larvas mL-1 foram consideradas melhores. A manutenção de larvas na geladeira é uma opção viável para um curto período de tempo (3 dias). Tais resultados indicam que é possível assentar larvas em condições de laboratório no período de 5 dias, obtendo taxa de metamorfose favorável.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:39:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 341967.pdf: 1223562 bytes, checksum: ea3f2bcb8e8e7c0014ae64710106fd98 (MD5) Previous issue date: 2016 / Para manter o crescimento da atividade de produção de ostras e atender a demanda do mercado, o desenvolvimento de novas tecnologias para produção de pré-sementes de Crassostrea gigas em laboratório faz-se necessário. Desde o surgimento da indústria na década de 1960 não houve um incremento tecnológico relevantes na produção de sementes recém-assentadas. No sistema de leito fluidizado que em síntese, consiste na produção de sementes em alta densidade com fluxo de água e alimentação controladas, mantendo as sementes recém-assentadas em suspensão, todo material excretado pelos animais são direcionados para fora do cultivo, priorizando a qualidade da água. Com a utilização dessa tecnologia é possível maximizar a produção, utilizando áreas de cultivo em laboratório menores e, consequentemente, reduzindo o tempo de manejo, além de reduzir o volume de água utilizado. Neste estudo comparou-se o crescimento, a sobrevivência e consumo de alimento de diferentes tamanhos das sementes de Crassostrea gigas em sistema de leito fluidizado e upwelling. Para o sistema de leito fluidizado também foram comparadas densidades visando avaliar o comportamento das sementes sob diferentes condições de densidade de cultivo. Os parâmetros físico-químicos se mostraram, em ambos os experimentos, dentro do padrão estabelecido para a espécie. No experimento de densidade foi possível obter um crescimento volumétrico 1.316%, durante os oito dias do período experimental, no tratamento com 4.877,21 pré-sementes por cm². No experimento de comparação entre os sistemas, para sobrevivência, não houve diferença entre os tratamento e sistemas obtendo uma sobrevivência média de 95,48±2,76%. Da mesma forma, para o consumo de microalgas não foi observado diferença significativa entre os sistemas, contudo houve diferenças entre os tratamentos, T1000, T710 e T500. Neste caso, observou-se a redução do consumo de microalgas com a redução do tamanho médio das pré-sementes. Em relação ao crescimento altimétrico e volumétrico, o sistema de upwelling foi superior quando comparado ao sistema de leito fluidizado. Entre os tratamentos do sistema de upwelling não foi observado diferença estatística para as variáveis de crescimento, entretanto para os tratamentos do sistema de leito fluidizado, o tratamento TL1000 levou a melhores resultados. Esses estudos propiciaram entender um pouco mais sobre a produção de pré-sementes de C. gigas em sistema de leito fluidizado, todavia novos estudos devem ser executados para otimizar a produção de pré-sementes de C. gigas.<br> / Abstract : To keep the growth of oyster production and reach the market demand, the development of new technologies for Crassostrea gigas spats production is necessary. Since the beginning of the industry, in the 1960s, there have been significant technological advances in the production of newly settled spats. The fluidized bed system is the high-density production of spats in water flow and feeding control that keeps the spats in suspension and directs the excreted material out of the system, prioritizing the quality of the water. To use this technology, it is possible to maximize the production, using smaller growth areas, and consequently, reducing the working time and the amount of water used. This study compared the growth, survival and food intake for different sizes spats of Crassostrea gigas in upwelling and fluidized bed systems. Densities were also compared in fluidized bed system. The physical and chemical parameters in both experiments were within the pattern established for the species. In the density experiment we found a volumetric growth of 1,316% in the trait of 4,877.21 spats per cm². There were no differences between survivals and intake of microalgae when we compared the systems; the general average was of 95.48±2.76%. However, we found differences in intake within systems; there were a reduction of the microalgae intake by reduction of the average size of spat. Altimetry and volumetric growth was superior in the upwelling when compared to the fluidized bed system. In upwelling system, there was not statistical difference in the growth variables; however, for the fluidized bed treatment system, TL1000 trait showed better results. These studies allowed understanding of the production of C. gigas spats in a fluidized bed system; however, further studies will be needed to optimize the production of C. gigas spats.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-10-19T13:21:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 340613.pdf: 1486631 bytes, checksum: e54be906578e663ab10e08e337ba1e56 (MD5) Previous issue date: 2015 / Foram determinados os coeficientes de digestibilidade aparente (CDA) dos aminoácidos essenciais, proteína, energia e matéria seca das farinhas de resíduo do processamento de salmão (FRS), de vísceras de aves (FVA), de carne e ossos e de penas hidrolisadas, além do concentrado proteico (CPS) e farelo de soja e glútens de milho e trigo para juvenis de jundiá, Rhamdia quelen (peso médio: 160 g). A dieta referência e as dietas teste (compostas por 69,9% da dieta referência, 30% de um dos ingredientes teste e 0,1% de óxido de ítrio) foram ofertadas (10 e 16 h) aos peixes e as coletas das fezes foram realizadas a cada 5 h (23, 4 e 9 h), após sedimentação em tubos coletores. Os resultados dos CDA?s mostraram que o jundiá aproveitou melhor os ingredientes vegetais frente aos animais. Entre os ingredientes avaliados, destaca-se o CPS, a FVA e a FRS, que além de serem bem digeridos, atenderam adequadamente às exigências em aminoácidos essenciais do jundiá. A partir dos valores de nutrientes digestíveis desses ingredientes, foram formuladas cinco dietas contendo diferentes relações de energia digestível:proteína digestível (ED:PD = 12, 11, 10, 9 e 8 kcal/g), as quais foram empregadas na avaliação do desempenho de jundiás com peso médio de 31 g. Cada dieta foi fornecida até a saciedade aparente a três grupos de 25 peixes às 9 e 16 h por 75 dias, sendo os mesmos submetidos a biometrias quinzenais. A sobrevivência foi de 100% em todos os tratamentos e as análises de regressão mostraram que as diferentes ED:PD afetaram (P<0,05) todas as variáveis de desempenho zootécnico e econômico, assim como a deposição de gordura corporal e o índice hepatossomático. As dietas contendo 12 e 8 kcal/g proporcionaram desempenho inferior, enquanto as dietas com ED:PD entre 9 e 11 kcal/g favoreceram maior ganho em peso diário (GPD), as melhores taxas de retenção proteica (TRP) e conversão alimentar (CA), proporcionando menores custos de alimentação (CMA) e acúmulo de gordura corporal. Com base no GPD e CA, a melhor ED:PD foi estimada em 9,08 kcal/g (38,28% e 3437,5 kcal/g) e 9,58 kcal/g (36,07% e 3125 kcal/g), respectivamente. Já as ED:PD ótimas para TRP e CMA foram 10,34 kcal/g (32,29% e 3229 kcal/g) e 10,4 kcal/g (33,38% e 3200 kcal/g), respectivamente.<br> / Abstract : Apparent digestibility coefficients (CDA) for essential amino acids, protein, energy and dry matter of salmon fishmeal (FRS), poultry byproduct meal (FVA), meat and bone meal, poultry feather meal hydrolyzed feathers, soybean protein concentrate (CPS), soybean meal, corn gluten meal and wheat gluten meal were evaluated for juvenile jundiá, Rhamdia quelen (185 g, average body weight). A reference diet and seven test diets (comprised of 69.9% reference diet, 30% test ingredient, and 0.1% yttrium oxide) were fed to fish at 10 and 16 h. Following tank cleaning, feces were collected by sedimentation, every 5 h (23, 4 and 9 h). Our CDA results showed that jundiá valued plant over animal ingredients. Among the assessed ingredients, CPS, FVA and FRS showed to be well digested and able to meet fish?s essential amino acid requirements. Subsequently, five diets were formulated, considering the digestible values of these ingredients, to have different energy to protein ratios (ED:PD = 12; 11; 10; 9 and 8 kcal/g), and were fed to jundiá (31 g average weight). Each diet, were fed twice daily (9 and 16 h) to three groups of 25 fish, during 75 days. Fish weight was evaluated every 15 days. Survival rates was 100% for all diet groups and regression analysis showed that the different dietary ED:PD ratios affected (p<0.05) all performance and economic variables, as well as the deposition of body fat. Diets containing 12 and 8 kcal/g yielded poorer performances, whereas diets containing ED:PD from 9 to 11 kcal/g favored weight gain (GPD), protein retention rates (TRP) and feed conversion (CA), also allowing for better feeding costs and less body fat buildup. Considering the variables GPD and CA, the best dietary ED:PD was estimated to be 9.08 kcal/g (38.28% and 3437.5 kcal/g) and 9.58 kcal/g (36,07% and 3125 kcal/g), respectively. However, when pondering on TRP and CMA, optimal dietary ED:PD was 10.34 kcal/g (32.29% and 3229 kcal/g) and 10.4 kcal/g (33.38% and 3200 kcal/g), respectively.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-01-17T03:14:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 343432.pdf: 865729 bytes, checksum: a78ad697de2a1466652e220d97e9443f (MD5) Previous issue date: 2016 / O Brasil apresenta uma vasta rede hídrica que apresenta condições de atender à crescente demanda mundial por produtos de origem pesqueira por meio da aquicultura. Além disso, o país apresenta grande diversidade de espécies nativas de peixes, sendo muitas aptas a piscicultura. O objetivo desse trabalho foi avaliar o crescimento de juvenis de uma dessas espécies, Steindachneridion scriptum, em diferentes densidades de estocagem em sistema de recirculação de água. Para tanto foram utilizados 320 juvenis (22,3 ± 3,3g; 13,0 ± 0,6cm) estocados em 16 tanques-rede circulares com volume útil de 80 L dentro de um sistema de recirculação de água. Foram utilizadas quatro densidades de estocagem como tratamentos: 100, 200, 300 e 400 peixes/m³ (8, 16, 24, 32 peixes/tanques-rede), com quatro repetições. Os peixes foram alimentados até a saciedade aparente duas vezes ao dia com ração comercial contendo 40% de proteína bruta. Os parâmetros de qualidade da água (oxigênio dissolvido, temperatura, pH, salinidade, condutividade elétrica, amônia, nitrito, dureza e alcalinidade) se mantiveram dentro dos limites aceitáveis e não apresentaram diferenças significativas entre os tratamentos. A sobrevivência, o ganho em comprimento, a conversão alimentar aparente e a biomassa total apresentaram regressão linear significativa (P<0,05) com o aumento da densidade de estocagem, enquanto o ganho em peso, a taxa de crescimento específico, o fator de condição e o consumo de alimento não apresentaram diferença significativa (P>0,05). S. scriptum apresentou boa adaptação ao sistema de recirculação de água e suportou densidade de estocagem de 400 peixes/m³ sem prejuízo do seu desempenho.<br> / Abstract : Brazil has a vast water network that has conditions to meet the growing global demand for fishery products through aquaculture. Moreover the country presents a large diversity of native species with potential for fish culture. The aim of this study was to evaluate the growth of juveniles of one of these species, Steindachneridion scriptum, in different stocking densities in a recirculating aquaculture system. For that reason 320 juveniles (22.3 ± 3.3g; 13.0 ± 0.6cm) were stocked in 16 circular cages with useful volume of 80 L in a recirculating aquaculture system. Four stocking densities were used as treatments: 100, 200, 300 and 400 fish/m³ (8, 16, 24 and 32 fish/cages), with four repetitions. Fish were fed ad libitum twice a day with commercial diet with 40% of crude protein. The water quality parameters (dissolved oxygen, temperature, salinity, conductivity, pH, alkalinity, hardness, nitrite and ammonia) were monitored. Water quality parameters were within the acceptable range for fish culture and no significant differences among treatments were registered. The survival, length gain, food conversion and total biomass gain presented a significant linear regression (P<0.05) with stocking density, whereas no significant linear regression (P>0.05) was found to weight gain, specific growth rate, condition factor and feed intake. S. scriptum presented good adaptation to the system used and stocking density as high as 400 fish/m³ did not impact negatively the growth performance.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Gradução em Aqüicultura, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-02-07T03:09:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 343943.pdf: 1670125 bytes, checksum: 081714863d2e66b2f8674a0e7759a2b2 (MD5) Previous issue date: 2016 / Para investigar os efeitos da densidade de estocagem sobre a engorda do robalo flecha Centropomus undecimalis, em tanques-rede costeiros, em ambiente marinho, foram realizados 2 ciclos de cultivo, pré-engorda e engorda, com três densidades de estocagem, 10, 20 e 40 peixes.m-³. Na pré-engorda, juvenis com peso médio de 72,0±7,1 g e comprimento total de 21,2±0,7 cm, foram cultivados durante 270 dias (20/dez/2013 a 18/set/2014). Na engorda, peixes com peso médio de 204,6±25,7 g e comprimento total de 29,2±1,3 cm foram cultivados durante 202 dias (30/set/2014 a 20/abr/2015). A temperatura e salinidade media foram de 24,28ºC e 34,5 psu, respectivamente. Os peixes foram alimentados com ração comercial para peixes carnívoros uma vez ao dia. Os resultados ao final do período de engorda mostraram que os pesos totais médios dos peixes, da menor para maior densidade, foram de 329,2 ± 38,2b, 364,7 ± 104,6a e 315,4 ± 63,1b gramas. Os peixes no grupo de media densidade cresceram significativamente mais rápido do que aqueles nos grupos de alta densidade (P<0,05). As produções totais por unidade de área (kg/m3) e a sobrevivência (%) foram maiores na densidade de 40, 11,681 kg/m3 e 93 % respectivamente. O ensaio da viabilidade econômica foi simulado para 20 tanques-rede de volume individual de 225 m³ (7,6 m de diâmetro), com juvenis de 10 g a serem comercializados com 500 g. Foram considerados o custo operacional efetivo (COE), custo operacional total (COT) e o custo total de produção (CTP). Os índices para a avaliação da rentabilidade foram a Taxa Interna de Retorno (TIR) e o Valor Presente Líquido (VPL). O investimento total foi de R$ 1,2 milhões. O CTP foi de R$ 1,2 milhões/ano, com um custo por quilo de peixe de R$ 26,49. Para este trabalho, e nas condições econômicas do momento, foi considerada uma TIR ideal de 23% a.a. A partir do alto custo de produção obtido, as cinco análises de sensibilidade realizadas mostraram que esforços na melhoria contínua dos parâmetros avaliados acarretam de maneira positiva nos índices econômicos do projeto. O aumento no volume útil dos tanques-rede, a partir do aumento da altura das redes, mostrou-se ser de grande impacto no aumento da TIR do investimento, passando de 14,59% (225 m³), para 22,88 % (325 m³). Projetos de engorda de robalo em tanques-rede marinhos de médio volume, deverão considerar o uso de estruturas de flutuação com materiais alternativos ao PEAD, de menor custo, a fim de tornar viável e mais rentável o investimento.<br> / Abstract : To investigate the effects of stocking density in cage farming of common snook Centropomus undecimalis in the coastal marine environment, two farming periods were tested: juvenile and grow-out, with three stocking densities, 10, 20 and 40 fishes.m-3. In the juvenile period, fish reached an average weight of 72.0 ± 7.1 g and total length of 21.2 ± 0.7 cm within 270 days (20/Dec/2013 to 18/Sep/2014). In the grow-out period, fishes attained an average weight of 204.6 ± 25.7 g and total length of 29.2 ± 1.3 cm within 202 days (30/Sep/2014 to 20/Apr/2015). The water temperature and average salinity were 24.28 ºC and 34.5 psu, respectively. The fish were fed with commercial feed for carnivorous fish once a day. The results at the end of the grow-out period showed that the average total weights of fish, at low, medium and high density, were 329.2 ± 38.2b, 364.7 ± 104.6a and 315.4 ± 63.1b grams respectively. Fish farmed in the medium density grew significantly faster than those in the higher density (P <0.05). The total yield per unit area (kg.m-3) and survival rate (%) was higher in density 40, with 11.681 kg. m-3 and 93% respectively. An economic viability analysis was simulated for 20 cages with individual volume of 225 m³ (7.6 m diameter), starting with 10 g juveniles and harvesting snook with 500g. The effective operational cost (EOC), total operating cost (TOC) and total cost of production (TCP) were identified. Indices for assessing the profitability were the Internal Rate of Return (IRR) and Net Present Value (NPV). The total investment was R$ 1.2 million. The TCP was R$ 1.2 million/year, with a cost of R$ 26.49/kg. For this work, under the present economic conditions, an ideal IRR of 23% was considered. Considering the high production cost observed, five sensitivity analyzes indicated that the continuous improvement of these parameters could contribute to obtain better economic indices in snook farming. The increase in the useful cage volume, adjusting the net height, proved to be of great economic impact, improving investment IRR to 14.59% (225 m³) and 22.88% (325 m³). Common snook farming in medium volume cage should consider the use of alternative materials to HDPE in the cage construction, in order to reduce costs and to obtain better profit in this investment.

Dissertação (mestrado) - Univesidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-02-07T03:09:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 343939.pdf: 2144518 bytes, checksum: 0409fa15111c9e032fff249eda4f6ba4 (MD5) Previous issue date: 2016 / Peptídeos antimicrobianos (AMPs) são moléculas essenciais do sistema imune de diversos organismos, participando eficientemente no combate a uma ampla variedade de microrganismos patogênicos. Em camarões, quatro principais famílias de AMPs foram descritas, dentre as quais se destacam as crustinas. Essa família encontra-se distribuída em diversas espécies de crustáceos e apresenta atividades antimicrobianas e antiproteolíticas. Classicamente, as crustinas estão divididas em 5 principais grupos, referidos como Tipos I a V. No camarão Litopenaeus vannamei, apesar de terem sido reportadas crustinas dos Tipos II, III e IV, até o presente ainda não foram descritas crustinas do Tipo I. Neste contexto, o objetivo do presente trabalho foi identificar e caracterizar, em nível molecular e transcricional, crustinas do Tipo I em L. vannamei. Sequências de crustinas do Tipo I foram buscadas em bancos transcriptômicos não anotados de L. vannamei (GenBank), submetidas a reconstruções filogenéticas para confirmação de sua autenticidade e usadas no desenho de iniciadores para análises de expressão gênica. Doze sequências de L. vannamei foram resgatadas utilizando-se 41 sequências de crustinas do Tipo I de 22 espécies de crustáceos como referência. As análises filogenéticas indicaram a existência de, pelo menos, dois Subtipos de crustinas do Tipo I em L. vannamei: LvCrus Ia (10 sequências) e LvCrus Ib (2 sequências). Os dois subtipos compartilharam uma alta identidade aminoacídica (>80%) e uma estrutura condizente com as crustinas do Tipo I: um peptídeo sinal seguido de um peptídeo maduro contendo doze resíduos de cisteína, oito dos quais compondo o domínio conservado WAP (Whey Acidic Protein), característico desses AMPs. As análises moleculares mostraram um ponto isoelétrico teórico de 5,01-5,64 para LvCrus Ia (massa molecular de 9,6 kDa) e 7,66 para LvCrus Ib (massa molecular de 11,5 kDa). A expressão de crustinas do Tipo I mostrou um perfil similar de expressão em diferentes tecidos dos animais após um estímulo bacteriano. Interessantemente, LvCrus Ia e LvCrus Ib mostraram-se altamente expressos nas brânquias de animais estimulados e não estimulados, mas não nos hemócitos que são as células imuncompetentes de camarões. Para fins comparativos, a distribuição das demais crustinas de L. vannamei também foi investigada. As crustinas do Tipo II (IIa e IIb) mostraram uma distribuição idêntica, estando presentes em hemócitos e brânquias e as crustinas dos Tipos III e IV foram unicamente hemocitárias. Os níveis transcricionais deLvCrus Ia foi analisado no intestino médio de animais 48 horas após uma infecção experimental por dois patógenos de camarões: o vírus da síndrome da mancha branca (WSSV) ou a bactéria Vibrio harveyi. A expressão de LvCrus Ia apresentou um aumento superior a 50 vezes em animais inoculados com água do mar estéril e com a bactéria V. harveyi, mas não houve diferença entre esses dois tratamentos. Analogamente, não houve modulação na expressão de LvCrus Ia após o desafio viral. Nos hemócitos, apenas as crustinas do Tipo IV (LvSLPI) foram induzidas após a infecção bacteriana. As crustinas do Tipo I de camarões peneídeos compõem, portanto, um grupo diverso de AMPs tanto em termos de estrutura primária, características bioquímicas e no perfil de expressão gênica. Ademais, este trabalho representa o primeiro relato de crustinas aniônicas e de um grupo de AMPs não hemocitários em L. vannamei.<br> / Abstract : Antimicrobial peptides (AMPs) are essential molecules of the immune system of different organisms, participating effectively in the combat to a wide range of pathogenic microorganisms. In shrimp, four main AMP families were described, including the crustins. This AMP family is largely distributed among crustaceans and displays both antimicrobial and antiproteolytic activities. Crustins are classically divided in 5 groups, referred as Types I to V. In L. vannamei shrimp, despite the report of crustins from Types II, III and IV, Type I crustins were not still identified in this species. In this context, the aim of the present study was to identify and characterize at molecular and transcriptional levels Type I crustins in L. vannamei. Sequences coding for Type I crustins were searched in non-annotated transcriptomic libraries from L. vannamei (available in GenBank), submitted to phylogenetic reconstructions for the confirmation of their authenticity and then used for the design of specific primers for gene expression analyses. Twelve sequences were identified in L. vannamei libraries by using as query 41 Type I crustin sequences from 22 crustaceans. Phylogenetic analysis indicated the presence, at least, of two Subtypes of Type I crustins in L. vannamei: LvCrus Ia (10 sequences from nerve cord libraries) e LvCrus Ib (2 sequences from hemocyte libraries). The two Subtypes shared a high amino acid identity (>80%) and a primary structure consistent with other Type I crustins: a leader sequence followed by a mature peptide containing twelve cysteine residues, eight of them comprising a conserved WAP (Whey Acidic Protein) domain, typical of this AMP family. Molecular analysis showed a theoretical isoelectric point of 5.01-5.64 for LvCrus Ia (molecular weight = 9.6 kDa) and 7.66 for LvCrus Ib (molecular weight = 11.5 kDa). The gene expression of both Type I crustins showed to be similar in the different tissues of bacterial-challenged shrimp. Interestingly, LvCrus Ia and LvCrus Ib showed to be highly expressed in gills of both stimulated and non-stimulated animals, but not in hemocytes that are the shrimp immunocompetent cells. For comparative purposes, the gene expression distribution of other L. vannamei crustins was also evaluated. The gene expression distribution of Type II crustins (IIa and IIb) were identical, which were detected in hemocytes and gills, whereas the expression of crustins from Types III and IV showed to be restrict to hemocytes. The transcriptional levels of LvCrus Ia were analyzed in the midgut at 48 hours after an experimental infection with two shrimp pathogens: the White Spot Syndrome Virus(WSSV) or the Gram-negative Vibrio harveyi. The expression of LvCrus Ia increased more than 50-fold in seawater-injected shrimp and animals infected with V. harveyi, but no differences were observed between treatments. Besides, no differences in gene expression modulation were observed for LvCrus Ia in response to the viral infection. In hemocytes, only the expression of Type IV crustins (LvSLPI) was induced in response to the bacterial infection. Type I crustins from penaeid shrimp comprise a diverse group of AMPs in terms of primary structure, biochemical features and gene expression profile. Additionally, the present study represents the first report of anionic crustins and the first identification of non-hemocytic AMPs in L. vannamei.