Os crustáceos do gênero Aegla, endêmicos da América do Sul, são os únicos decápodes anomuros que vivem em ambientes de água doce. A descoberta de fósseis em sedimentos marinhos deixou poucas dúvidas sobre a origem do grupo. Diversos estudos taxonômicos, morfológicos e de distribuição geográfica têm sido realizados sobre os eglídeos. Entretanto, informações filogenéticas baseadas na morfologia do grupo limitam-se, basicamente, aos trabalhos sobre a posição da família Aeglidae na infraordem Anomura e a um trabalho pioneiro, no qual os autores propuseram um cladograma para sete espécies com ocorrência no Chile. A partir de revisões taxonômicas e de uma análise cladística, com base em caracteres morfológicos, das espécies de Aegla que ocorrem nas bacias hidrográficas do Alto Paraná e Alto Uruguai, obteve-se: 1. O não-monofiletismo do clado Alto Paraná-Alto Uruguai; 2. Aegla leptochela relacionada filogeneticamente com outras espécies do Alto Ribeira; 3. Aegla marginata é uma espécie parafilética e forma um complexo com Aegla quilombola n. sp.; 4. Aegla franca e A. perobae são espécies irmãs; 5. Aegla lata, entre outras espécies, aparecem relacionadas com populações de diferentes bacias hidrográficas demonstrando tanto a falta de caracteres derivados dentro de Aeglidae, bem como a possibilidade de existirem mais complexos de diferentes espécies nessa família; 6. A invasão ao ambiente subterrâneo ocorreu mais de uma vez ao longo do tempo e espécies estigobiontes não são irmãs recíprocas exclusivas; 7. Aegla paulensis trata-se de um complexo de sete espécies distintas: Aegla paulensis s. str., A. rosanae, A. lancinhas, A. japi n. sp., A. jaragua n. sp., A. jundiai n. sp. e A. vanini n. sp. Além disso, análises em microscopia eletrônica de varredura dos tubos sexuais de machos de 39 espécies de Aegla, revelaram dois principais tipos, o longo estreito e o curto largo e, ainda, que cada espécie possui um conjunto de características específicas para essa estrutura, podendo, então, ser utilizada como caráter diagnóstico em descrições taxonômicas / The South American endemic genus Aegla represents the only anomuran decapod crustaceans strictly living in freshwaters. Marine fossil records left no doubts regarding the origin of the group. A number of studies on taxonomy, morphology and geographical distribution of aeglid have been carried out. Nevertheless, morphology based phylogenetic information about the group is limited to studies of the positioning of Aeglidae into the Anomuran infraorder and one pioneer work which presented a cladogram for seven species from Chile. Through cladistic analysis based on morphological characters of Aegla species occurring in the upper Paraná and upper Uruguay hydrographic basins the following results were obtained: 1. The non-monophyletic condition of the upper Paraná-upper Uruguay clade; 2. Aegla leptochela phylogenetically related to other species from Alto Ribeira; 3. Aegla marginata is paraphyletic, constituting a complex with Aegla quilombola n. sp.; 4. Aegla franca and A. perobae are sister species; 5. Aegla lata and other species were related with populations from different hydrographic basins, showing the lack of derived characters in Aeglidae and the possibility of existence of other species complexes in this family; 6. Invasion to the underground environments occurred more than once and the stygobiont species are not exclusive reciprocal sisters; 7. Aegla paulensis is a species complex encompassing seven species: Aegla paulensis s. str., A. rosanae, A. lancinhas, A. japi n. sp., A. jaragua n. sp., A. jundiai n. sp. e A. vanini n. sp.. In addition, scanning electron microscopy revealed two main types of sexual tubes (long and narrow; short and wide) in males from 39 Aegla species. Each species has a specific set of characters for this structure, hence indicating it can be used as diagnostic character in taxonomic descriptions

Lucinidae é a maior e mais diversa família dentre os Lucinoidea contendo atualmente 355 espécies válidas divididas em mais de 40 gêneros distribuídos por todos os oceanos. A família, apesar de bem conhecida por características como valvas arredondadas, brancas, cicatriz do músculo adutor anterior dorso ventralmente alongada e químio-simbiose nas brânquias, padece com dificuldades na identificação de espécies. Além disso, é notável a discrepância entre a quantidade de informações conquiliológica e molecular quando comparado às anatômicas. A generalização de caracteres diagnósticos associados a grande quantidade de espécies distribuídas globalmente torna não só a identificação problemática, mas também a elucidação de linhagens internas. Na costa brasileira é comum que o número de espécies varie de 10 a 13, sendo caracterizadas apenas por dados conquiliológicos. Com isso objetivou-se uma revisão taxonômica e caracterização conquilio-morfológica das espécies de Lucinidae de ocorrência na costa brasileira e, de maneira inédita, utilizando os dados anatômicos obtidos juntamente a outras 25 espécies de Lucinidae de outras localidades, testar a monofilia do gênero Parvilucina, um pequeno gênero de Lucinidae cuja distribuição limita-se ao continente americano. Foram encontradas e caracterizadas morfologicamente 15 espécies de Lucinidae na costa brasileira, sendo 12 divididas entre cinco superfamílias e três Incertae Sedis: Superfamília Codakiinae: Codakia orbicularis, \"Ctena\" sp. nov.. nov. nov. e Ctena orbiculata; Superfamília Divaricellinae: Divalinga quadrisulcata; Superfamília Lucininae: Pleurolucina sombrerensis; Superfamília Luciniscinae: Clathrolucina costata, Radiolucina amianta, \"Lucinisca\" muricata e Parvilucina pectinella; Superfamília Leuscosphaerinae: \"Dulcina\"lens, Phacoides pectinatus e Lucinoma sp. nov.; Incertae Sedis: Cavilinga blanda, Miltha childreni e Myrtina prestiphora. Destas \"Ctena\" sp. nov.. nov. e Lucinoma sp. são espécies novas. Foi determinado o primeiro registro do gênero Lucinoma e de Myrtina prestiphora para a costa brasileira. O gênero Parvilucina é monofilético e composto por duas espécies: P. tenuisculpta e P. pectinella. A filogenia obtida utilizou 98 caracteres entre informações conquiliológicas e anatômicas, e encontrou seis grandes radiações e duas sub-radiações em Lucinidae: radiações Myrteinae, Leucosphaerinae, Lucininae, Luciniscinae, Divaricellinae e Codakiinae e a sub-radiações Luciniscini, Parvilucini e Pillucini / Lucinidae is the biggest and most diverse family among the Lucinoidea, currently holding 355 valid species divided in more than 40 genus distributed in all oceans. The family, besides being well knowed by showing characters as rounded valves, white color, anterior adductor muscle elongated dorso ventrally and chemosymbiosis on gills, it experiences difficulties on species identification. Moreover, is notable the discrepance between quantity of shell and molecular information when compared to anatomical ones. The generalization of diagnostic characters associated a wide distribution makes not only the species identification a problematic task, but the elucidation of internal lineages too. At Brazilian coast is common that the species number oscillate between 10 to 13, being those species characterized only by shell features. Thus, the aims of this work comprehends and taxonomical revision and a shell and anatomical characterization of the Lucinidae species that occurs at Brazilian coast, and, in an unprecedent way, use this anatomical data, associated with more 25 Lucinidae species from diverse localities, to test the monophyly of genus Parvilucina, an small Lucinidae genus whose distribution is limited to American continent. Were diagnosticated and morphologically characterized 15 Lucinidae species, being 12 distributed among five superfamilies while three are considered Incertae Sedis: Superfamily Codakiinae: Codakia orbicularis, \"Ctena\" sp. nov.. nov. nov. e Ctena orbiculata; Superfamily Divaricellinae: Divalinga quadrisulcata; Superfamily Lucininae: Pleurolucina sombrerensis; Superfamily Luciniscinae: Clathrolucina costata, Radiolucina amianta, \"Lucinisca\" muricata e Parvilucina pectinella; Superfamily Leuscosphaerinae: \"Dulcina\"lens,, Phacoides pectinatus e Lucinoma sp. nov.; Incertae Sedis: Cavilinga blanda, Miltha childreni e Myrtina prestiphora. Of these, \"Ctena\" sp. nov.. nov. and Lucinoma sp. are new species. Was diagnosed the first register of genus Lucinoma and Myrtina prestiphora to Brazilian coast. The genus Parvilucina is monophyletic and composed by two species: P. tenuisculpta e P. pectinella. The phylogeny used 98 characters among shell and anatomical characters, and found six great radiations and two sub-radiations in Lucinidae: radiations Myrteinae, Leucosphaerinae, Lucininae, Luciniscinae, Divaricellinae e Codakiinae and sub-radiations Luciniscini, Parvilucini e Pillucini

Muriquis, genus Brachyteles Spix, 1823, are the largest of the extant New World primates, and they are one of the three extant genera of the subfamily Atelinae along with Ateles (spider monkeys) and Lagothrix (wooly monkeys). The taxonomy of Brachyteles has constantly changed since its first description in the 19th century. First treated as a monotypic genus, and after several modifications in the number of species, Brachyteles currently contains two species, B. arachnoides (Southern muriqui) and B. hypoxanthus (Northern muriqui). The morphological evidence for this taxonomic arrangement relies on two diagnostic characters: the occurrence of a black-pigmented face and the absence of the first digit (thumb) in Southern muriqui populations vs. mottled face and fully-developed thumb in Northern muriqui populations. In addition, the phylogenetic relationship between atelines is disputed: on the one hand, the molecular evidence suggests an (Ateles (Brachyteles + Lagothrix)) clade and, on the other, most morphological evidence supports a clade (Lagothrix (Ateles + Brachyteles)) based on the high degree of postcranial and locomotory resemblances between Ateles and Brachyteles. My aims here are: 1) to verify how many taxa at the species level group there are in Brachyteles, and 2) to estimate the phylogenetic relationships among Atelinae using morphological characters. To achieve these goals, I have performed a qualitative analysis of external morphological characters as the presence or absence of the thumb, pelage coloration, and face pigmentation to test sexual dimorphism or dichromatism and intrapopulational variation. I also performed linear and geometric morphometrics analyses to test sexual dimorphism and geographical variation in both size and shape of the skull. Finally, I carried out a morphological phylogeny using 74 discrete morphological characters, two ecological and one karyological. This analysis includes 11 species of extant and fossil atelids and the outgroup was composed of Sapajus nigritus and Callicebus personatus. The analysis of the pelage coloration reveals that there is no sexual dimorphism or dichromatism in Brachyteles; besides, the pelage presents a high degree of individual variation. The development of the thumb and the facial pigmentation do not exhibit uniformity; thus, they have no taxonomic meaning. Linear and geometric morphometrics failed on to discriminate between sexes and populations based on the size and shape of the skull. For these reasons, I consider Brachyteles as a monotypic genus with no subspecies. Lastly, the morphologic phylogenetic analysis shows that Brachyteles is more closely related to Lagothrix than to Ateles, suggesting that the postcranial similarities between muriquis and spider monkeys could be a plesiomorphic condition in Atelidae, and the arboreal quadrupedalism of Alouatta and Lagothrix evolved convergently in alouattines and atelines. / Os muriquis ou monos-carvoeiros, gênero Brachyteles Spix, 1823, são os maiores primatas existentes do Novo Mundo, fazendo parte da subfamília Atelinae, juntamente com os gêneros Ateles (macaco-aranha) e Lagothrix (macaco-barrigudo). A taxonomia de Brachyteles tem sofrido constantes alterações desde sua primeira descrição no século XIX. Inicialmente foi tratado como um gênero monotípico, entretanto, após diversas alterações no número de espécies, atualmente considera-se composto por duas espécies, B. arachnoides (muriqui-do-sul) and B. hypoxanthus (muriqui-do-norte). O suporte para este arranjo taxonômico baseia-se em dois caracteres diagnósticos: a ocorrência de face com coloração preta e a ausência do primeiro dígito (polegar) nos muriquis-do-sul vs. face com manchas e polegar totalmente desenvolvido em populações de muriquis-do-norte. Adicionalmente, as relações filogenéticas entre os atelinos é contestada: por um lado, a evidência molecular sugere o clado formado por (Ateles (Brachyteles + Lagothrix)), por outro, a evidência morfológica suporta o clado (Lagothrix (Ateles + Brachyteles)), baseando-se na grande similaridade pós-craniana e locomotora. Desta forma, o meus objetivos neste trabalho são: 1) verificar quantos taxa do grupo da espécie existem em Brachyteles, e 2) estabelecer as relações filogenéticas entre os Atelinae utilizando caracteres morfológicos. Para isso, analisei qualitativamente os caracteres morfológicos externos, como a presença ou ausência de polegar, a coloração da pelagem, e a pigmentação facial, a fim de testar a ocorrência de dimorfismo sexual ou dicromatismo e a variação intraespecífica. Além disso, realizei análises morfométricas lineares e geométricas para testar o dimorfismo sexual e a variação geográfica do tamanho e forma do crânio. Por fim, realizei uma filogenia morfológica utilizando 74 caracteres morfológicos, dois ecológicos e um cariotípico. Estas análises incluíram 11 espécies de atelídeos viventes e fósseis e um grupo-externo composto por Sapajus nigritus e Callicebus personatus. A análise da coloração da pelagem revela que não há dimorfismo sexual ou dicromatismo em Brachyteles; além disso, a pelagem apresenta um alto grau de variação individual. O desenvolvimento do polegar e a pigmentação facial não apresentam uniformidade, assim, não tem relevância taxonômica. A morfometria linear e geométrica falharam em discriminar entre os sexos e as populações com base no tamanho e forma do crânio. Finalmente, as análises filogenéticas mostraram que Brachyteles está mais estreitamente relacionado com Lagothrix do que com Ateles, sugerindo que a similaridade pós-craninana entre os muriquis e os macacos-aranha poderia ser uma condição plesiomórfico dos atelídeos, e o quadrupedalismo arborícola de Alouatta e Lagothrix teria evoluído convergentemente em alouatíneos e atelíneos.

Os caranguejos anomuros da família Lithodidae são exclusivamente marinhos, habitantes predominantemente de águas frias vivendo, geralmente, em águas profundas. Via de regra são animais de grande tamanho, sendo que das 124 espécies atualmente conhecidas (distribuídas em 10 gêneros), algumas são de grande importância comercial. O monofiletismo da família Lithodidae e dos gêneros que a compõe, assim como as relações filogenéticas em Lithodidae ainda são obscuros e têm recebido muito pouca atenção. Diante da complexidade do esqueleto gástrico nos crustáceos Decapoda, neste trabalho nós investigamos em detalhe as características morfológicas dos ossículos do esqueleto gástrico em Lithodidae com vistas a sua descrição, interpretação e como fonte de dados morfológicos para servir de base a uma análise filogenética de Lithodidae, cujo objetivo precípuo foi testar a hipótese de monofiletismo de Lithodidae e acessar as relações internas na família. A partir do estudo de 185 estômagos foi descrita e ilustrada a morfologia dos ossículos do esqueleto gástrico de 66 espécies: 52 espécies (dos 10 gêneros de Lithodidae), 8 espécies (dos 5 gêneros de Hapalogastridae) e 6 espécies de outros Decapoda representantes do grupo externo (Birgus latro, Petrochirus diogenes, Pagurus bernhardus, Homarus americanus, Nephrops norvegicus e Thalassina anomala). A análise cladística de Lithodoidea foi realizada no programa TNT. Foram utilizados 126 caracteres binários e 63 caracteres multiestado obtidos da morfologia do esqueleto gástrico, relacionados com o tamanho, forma, grau de calcificação, grau de fusão de ossículos e morfologia dos dentes gástricos. O esqueleto gástrico em Lithodoidea está composto por 44 ossículos. Um novo ossículo foi reconhecido, o parapterocardíaco, associado com o ossículo pterocardíaco. A maioria dos ossículos exibem um padrão uniforme com variações menores e elementos morfológicos característicos. Nossa análise cladística resultou em 10 árvores igualmente parcimoniosas com 1802 passos. Nosso estudo mostra que a superfamília Lithodoidea é monofilética, porém o monofiletismo de Lithodidae e Hapalogastridae não pode ser recuperado. Os gêneros de Lithodidae, Cryptolithodes e Lopholithodes são monofiléticos, enquanto que Lithodes, Neolithodes, e Paralomis são polifiléticos. Paralithodes é parafilético. Os gêneros monoespecíficos de Lithodidae (Glyptolithodes, Phyllolithodes, Rhinolithodes e Sculptolithodes) são bem caracterizados por autapomorfias. Em consequência de nossos resultados, alterações na classificação interna de Lithodoidea são necessárias, afim de refletir as relações evolutivas. / The king crabs of the family Lithodidae (Anomura) are all marine and inhabit predominantly cold, deep waters. The lithodids currently comprise 124 species, some of which attain large sizes and are of great commercial importance. The interrelationships of the lithodids and even their monophyly and some of the constituent genera are yet to be solved. The great complexity of the decapod gastric mill prompted us to study the morphology of the gastric ossicles in the Lithodidae as a source of characters to assess its phylogenetic interrelationships and its monophyletic status as well as that of its constituent genera. We described and illustrated herein the morphology of the gastric ossicles from 66 species. A total of 186 stomachs were obtained as follows: 52 lithodid species (from all the 10 genera currently included in the Lithodidae), 8 hapalocarcinid species (from all the 5 genera of the Hapalogastridae) and 6 species from other groups of decapods representing the outgroup (Birgus latro, Petrochirus diogenes, Pagurus bernhardus, Homarus americanus, Nephrops novegicus e Thalassina anomala). The cladistic analysis of the Lithodoidea, was performed using the program TNT. 126 binary and 63 multistate characters from the morphology of the gastric ossicles related to size, shape, degree of calcification and fusion between ossicles, were used. The stomach of the Lithodoidea consists of 44 ossicles. A new ossicle is recognized herein, the para-pterocardiac, associated with pterocardiac ossicle. Most of the ossicles are conservative in shape, with few variations and distinctive morphological elements. The cladistic analysis resulted in 10 equally parsimonious trees with 1802 steps. Our study show that the superfamily Lithodoidea is monophyletic, whereas the lithodids and hapalogastrids were not recovered as monophyletic groups. The lithodid genera Cryptolithodes and Lopholithodes was recovered as monophyletic, while Lithodes, Neolithodes and Paralomis are polyphyletic; Paralithodes is paraphyletic. The monospecific lithodid genera are well characterized by a number of autoapomorphies each. As a result, the internal classification of the Lithodoidea requires further elaboration in order to reflect evolutionary relationships.

As algas calcárias crostosas ou CCA (do inglês Crustose Coralline Algae) têm como principal característica a impregnação de carbonato de cálcio em suas paredes celulares. Este grupo é formado atualmente por três ordens, Corallinales, Hapalidiales e Sporolithales, cuja taxonomia é historicamente problemática por se basear na fase tetrasporofítica, fundamental para qualquer identificação até mesmo em nível de ordem. Em virtude disso, diversos estudos, principalmente nos últimos 10 anos, têm incluído ferramentas moleculares como auxílio à taxonomia morfoanatômica deste grupo. O objetivo deste estudo foi investigar a diversidade e a distribuição das CCA ao longo da costa Brasileira, através de dados moleculares e morfoanatômicos. Para isso, foram utilizados quatro marcadores moleculares, UPA, rbcL-3P, COI-5P e psbA, aliados à imagens de microscopia óptica e microscopia eletrônica de varredura, que resultaram na identificação de pelo menos 37 espécies entre Corallinales, Hapalidiales e Sporolithales. Os resultados obtidos a partir das análises de agrupamento dos quatro marcadores demonstraram que as ordens Corallinales e Sporolithales são monofiléticas, e Hapalidiales constitui um grupo não-monofilético (com exceção do marcador psbA, que resolveu a ordem como grupo monofilético). Os resultados também revelaram existência de uma grande diversidade de espécies e gêneros destas ordens no Brasil, além de espécies novas e ao menos um potencial gênero novo para ciência. O estudo também revelou relações filogeográficas entre espécies do Brasil e do Golfo do México e do Indo-Pacífico. Considerando as três ordens de CCA (Corallinales, Hapalidiales e Sporolithales), este estudo representa a primeira tentativa de desvendar de forma mais ampla a diversidade de espécies CCA encontradas ao longo da costa brasileira, utilizando dados moleculares / The Crustose Coralline Algae (CCA) has as a main distinguishing characteristic the calcium carbonate impregnation in their cell walls. This group currently encompasses three orders, the Corallinales, Hapalidiales and Sporolithales, whose taxonomy is historically problematic because it is based on the tetrasporophytic phase, fundamental to any classification, even at the ordinal level. Therefore, many studies, especially in the last 10 years, have included molecular tools to assist the morphological taxonomy of this group. This study aims to investigate the diversity and distribution of the CCA along the Brazilian coast, through molecular and morphoanatomical data. In order to achieve this aim, four markers were used, UPA, rbcL-3P, COI-5P and psbA, allied to light and scanning electron microscopy, that resulted in the identification of at least 37 species between Corallinales, Hapalidiales and Sporolithales. The results of the cluster analyses of the four markers showed that Corallinales and Sporolithales are monophyletic, and Hapalidiales comprises a non-monophyletic group (with the exception of psbA, which resolved the order as a monophyly). Our results also revealed a great diversity of species and genera of these three orders in Brazil, as well as putative new species and at least a new genus. This study also revealed phylogeographic relationships between Brazilian species and species from Gulf of Mexico and from Indo-Pacific oceans. Considering all the three orders of CCA, this study represents the first broad attempt and effort to unveil the diversity of CCA species found on the Brazilian coast using molecular data

Os camarões do gênero Palaemon Weber, 1795 possuem ampla variedade morfológica, ecológica e reprodutiva. Estudos baseados em dados moleculares indicam que o gênero pode não ser monofilético. Por outro lado, análises cladísticas baseadas em dados morfológicos recuperam Palaemon como um grupo natural. Além de questões em nível genérico, a validade de algumas espécies com ocorrência no Brasil também é questionada. Nesse contexto, foi utilizada uma abordagem molecular (genes COI, 16S, H3 e 18S) e morfológica com ampla amostragem taxonômica para 1) avaliar a hipótese de monofilia do gênero Palaemon; 2) avalia a hipótese de que padrões biogeográficos, de ocupação de hábitat, reprodutivos e morfológicos acompanham as relações filogenéticas entre as espécies de Palaemon; 3) avaliar o status taxonômico das espécies com ocorrência no Brasil. A filogenia recuperada indica que as espécies de Palaemon estão distribuídas em três linhagens distintas e caracteres morfológicos permitem a identificação de pelo menos quatro grupos monofiléticos. Os resultados indicam a necessidade de criação de dois novos gêneros e revalidação de Alaocaris Holthuis, 1949. A provável colonização da América e Europa ocorreu em mais de um momento em cada região e o ancestral comum mais recente da maioria das espécies de Palaemon, Macrobrachium Spence Bate, 1868 e gêneros próximos provavelmente foi uma linhagem anfídroma. A análise conjunta de dados moleculares e morfológicos demonstram a existência de nove espécies de Palaemon no Brasil, oito previamente descritas (P. argentinus, P. carteri, P. ivonicus, P. mercedae, P. northropi, P. octaviae, P. paivai, P. pandaliformis) e uma espécie nova (P. yuna). / Shrimps of the genus Palaemon Weber, 1795 have wide morphological, ecological and reproductive variability. Studies based on molecular data indicate that the genus might not be monophyletic. On the other hand, cladistics analyses based on morphological data recover Palaemon as a natural group. Besides generic level issues, the validity of some species from Brazil is questioned. In that context, we used a molecular (COI, 16S, H3 and 18S genes) and morphological approach with broad taxonomic sampling in order to 1) evaluate the hypothesis of monophyly of the genus Palaemon; 2) evaluate the hypothesis that biogeographical, habitat occupation, reproductive and morphological patterns follow the phylogenetic relationships among the species of Palaemon; 3) evaluate the taxonomic status of the species of Palaemon from Brazil. The recovered phylogeny indicates that the species of Palaemon are distributed into three distinct lineages. Morphological characters allow the identification of at least four monophyletic groups. The results indicate that the erection of two new genera and re-erection of Alaocaris Holthuis, 1949 is needed. The colonization of America and Europe probably took place more than once in each continent. The more recent common ancestor of the majority of the species of Palaemon, Macrobrachium Spence Bate, 1868 and closely related genera probably was an amphidromous lineage. The molecular and morphological approach indicates that there are nine species of Palaemon in Brazil, eight of them previously described (P. argentinus, P. carteri, P. ivonicus, P. mercedae, P. northropi, P. octaviae, P. paivai, P. pandaliformis) and one new species (P. yuna).

Theages Walker, 1855 é um gênero estritamente Neotropical constituído por 12 espécies bastante similares entre si quanto aos caracteres cromáticos, revelando-se uma considerável confusão taxonômica e nomenclatural. No presente trabalho, sob uma pespectiva de morfologia comparada, buscou-se reconhecer e elucidar o número de táxons nominais pertencentes ao gênero, bem como propor uma hipótese de relacionamento evolutivo entre eles. A análise cladística contou com 17 terminais (11 do grupo interno e seis do grupo externo) e 41 caracteres morfológicos. A busca exaustiva de pesos iguais resultou em uma única árvore mais parcimoniosa (l=142) e a de busca por pesagem implícita também gerou uma única árvore mais parcimoniosa (l=143). O gênero teve sua monofilia sustentada por oito sinapomorfias, sendo cinco únicas e três homoplásticas. Foram propostos ainda dois complexos de espécies para o gênero: (T. xanthura (T. leucophaea, T albidius)) e (T. pinasi (T. griseatum, T. hoffmanni)) (T. occultus (T. flavicaput, Theages sp. nov.))). Adicionalmente, com base na topologia obtida são fornecidos subsídios para o entendimento da evolução dos caracteres sexuais secundários encontrados no gênero. A revisão taxonômica, por sua vez, permitiu o reconhecimento de 11 espécies válidas, com a inclusão de uma espécie nova para a Colômbia e Equador. Uma sinonímia também foi proposta para o gênero: T. bricenoi torna-se sinônimo júnior subjetivo de T. flavicaput. Todas as espécies são redescritas, ilustradas e tiveram suas distribuições geográficas mapeadas e discutidas. Uma chave de identificação também é fornecida. / Thaeges Walker, 1855 is a strictly Neotropical genus composed of 12 species very similar amongst themselves regarding chromatic characters, thus revealing a considerable taxonomic and nomenclatural confusion. In the present study, under the perspective of comparative morphology, the recognition and elucidation of the number of nominal taxa belonging to this genus was aimed, as well as proposing an evolutionary relationship hypothesis between them. The cladistic analysis comprised 17 terminals (11 from the ingroup and six from the outgroup), and 41 morphological characters. The exhaustive search for equal weights resulted in a single most parsimonious tree (I=142) and the implicit weight search also yielded a single most parsimonious tree (I=143). The genus\' monophyly was well supported by eight synapomorphies, five being unique and three homoplastic. In addition, two species complexes were proposed for the genus: (T. xanthura (T. leucophaea, T albidius)) and (T. pinasi (T. griseatum, T. hoffmanni)) (T. occultus (T. flavicaput, Theages sp. nov.))). Furthermore, based on the topology obtained, subsidies for the understanding of the evolution of the male secondary sexual characters found in the genus were provided. On the other hand, the taxonomic revision enabled the recognition of 11 valid species with the inclusion of a new species for both Colombia and Ecuador. Additionally, a synonym was also proposed to the genus: T. bricenoi becomes a junior subjective synonym of T. flavicaput. All species were redescribed, illustrated, and their geographical distributions mapped and discussed. An identification key was also provided.

A comprehensive phylogenetic hypothesis for the predominantly Neotropical American genus Baccharis is necessary to test its monophyly and clarify the infrageneric relationships within the genus. Given its great morphological diversity and wide geographic distribution, phylogenetic studies based on molecular data to test the monophyly of the genus and investigate the relationships of its infrageneric groups are here proposed, allowing the recognition and taxonomic revision of smaller and monophyletic taxa. Therefore, a phylogenetic hypothesis for Baccharis is provided based on 248 species sampled, four molecular regions (ETS, ITS, trnH-psbA, trnL-F) and Bayesian analyses. The results confirm subtribe Baccharidinae as a monogeneric group, and support a wide definition of Baccharis s.l., monophyletic and including all genera that were previously segregated from it. Comprehensive lists of infrageneric taxa and taxa accepted at species level were compiled to move towards a phylogeny-based infrageneric classification of Baccharis. Seven main lineages were recovered, treated here at subgeneric level, and in this process all subgenera recognized before had to be recircumscribed to constitute monophyletic taxa. Four subgenera roughly match previous subgeneric concepts, while two subgenera are synonyms. Two earlier segregated genera and two formerly existing sections are moved to the subgeneric rank. The survey of names published in the ranks of sections and series accounted 68 sections and 13 series; four new sections are described and three new statuses at the rank of section are proposed to accommodate taxa not corresponding to any previously described section, while 22 sections were considered synonyms. This procedure allowed the recognition of 47 sections, though this number is supposed to decrease after future studies are accomplished with a larger sampling. The names accepted at species level totalize 433 taxa that were here assigned to the most inclusive infrageneric category possible in the light of the data currently available. Baccharis subgen. Tarchonanthoides Heering, a group restricted to the southeastern South American grasslands and savannas, was chosen as a good target to first tackle for a taxonomic revision, due its small size, restricted area of occurrence when compared to the remaining subgenera, and morphological distinctiveness. This is the first attempt to provide a taxonomic revision of a subgenus of Baccharis according to a phylogenetic framework, and under no geographic constraint. The recircumscription of Baccharis subgen. Tarchonanthoides involves the synonymization of Lanugothamnus, and the exclusion of one section in order to keep the subgenus monophyletic. Other taxonomic and nomenclatural actions necessary are designation of lectotypes, a new status and new combinations, new synonymizations and clarification of the species concepts formerly misapplied to some names. Two recircumscribed sections and 13 species are accepted within the taxonomically revised B. subgen. Tarchonanthoides, which diversified mainly in open vegetations from southeastern South America in Brazil, Paraguay, Uruguay and Argentina. General morphological descriptions of the infrageneric taxa are provided, as well as a taxonomic key, descriptions, data on etymology, distribution and habitats, phenology, conservation status, etnobotany and vernacular names, and a list of specimens examined, line drawings, pictures and maps of distribution for all accepted species within this subgenus. Alongside the main goals, exploratory fieldwork and study of herbaria specimens allowed the description of eight new species: B. dichotoma, B. hemiptera, B. magnifica, B. napaea, B. nebularis, B. obdeltata, B. simplex and B. umbellata / Uma hipótese filogenética abrangente sobre Baccharis, um gênero Americano predominantemente Neotropical, é necessária para testar seu caráter monofilético e esclarecer suas relações infragenéricas. Devido a sua grande diversidade morfológica e ampla distribuição geográfica, estudos filogenéticos com base em dados moleculares para testar o monofiletismo do gênero e investigar as relações de seus grupos infragenéricos foram aqui conduzidos, permitindo o reconhecimento e a revisão taxonômica de táxons menores e monofiléticos. Desta forma, uma hipótese filogenética sobre Baccharis é aqui apresentada, com base em 248 espécies amostradas, quatro regiões do genoma (ETS, ITS, trnH-PSBA, trnL-F) e análises Bayesianas. Os resultados confirmam a subtribo Baccharidinae como um grupo monogenérico e sustentam uma definição ampla de Baccharis s.l. monofilético e incluindo todos os gêneros que foram previamente segregados dele. Listagens abrangentes de táxons infragenéricos e de táxons aceitos ao nível de espécie foram compiladas com o objetivo de direcionar uma classificação infragenérica baseada nas relações filogenéticas de Baccharis. Sete linhagens principais foram reconhecidas e são tratadas aqui no nível taxonômico de subgênero, e neste processo todos os subgêneros anteriormente reconhecidos tiveram que ser recircunscritos para constituírem táxons monofiléticos. Quatro subgêneros correspondem imprecisamente a conceitos subgenéricos aplicados anteriormente, enquanto que dois subgêneros são sinônimos. Dois gêneros segregados anteriormente de Baccharis e duas seções previamente existentes no gênero são realocadas em nível subgenérico. O levantamento de nomes publicados nas categorias taxonômicas de seção e série totalizaram 68 seções e 13 séries, quatro novas seções e três novos posicionamentos ao nível de seção são propostos para acomodar táxons que não correspondiam a qualquer das seções previamente descritas, enquanto que 22 seções foram sinonimizadas. Estes procedimentos permitiram reconhecer 47 seções, embora seja esperado que esse número diminua com a realização de futuros estudos baseados em maior amostragem. Os nomes aceitos ao nível de espécie totalizaram 433 táxons que foram posicionados na categoria infragenérica mais inclusiva possível à luz dos dados disponíveis atualmente. Baccharis subgen. Tarchonanthoides Heering, um grupo restrito aos campos e savanas do sudeste da América do Sul, foi definido como um alvo adequado para uma revisão taxonômica precursora devido ao número reduzido de espécies, área de ocorrência restrita quando comparado aos demais subgêneros e distinção morfológica. Esta é a primeira tentativa de proceder a revisão taxonômica de um subgênero de Baccharis em concordância com um sistema filogenético e livre de qualquer limitação geográfica. A recircunscrição de Baccharis subgen. Tarchonanthoides envolve a sinonimização de Lanugothamnus, e a exclusão de uma seção do subgênero, no sentido de torná-lo monofilético. Outras ações nomenclaturais e taxonômicas são necessárias como a designação de lectótipos, a proposição de um novo status, novas combinações, novas sinonimizações e o esclarecimento de conceitos de espécie previamente aplicados de forma equivocada para alguns nomes de espécies. Duas seções recircunscritas e 13 espécies são aceitas nesta revisão taxonômica de B. subgen. Tarchonanthoides, um grupo diversificado nas vegetações abertas do Sudeste da América do Sul, ocorrendo no Brasil, Uruguai, Argentina e Paraguai. Descrições morfológicas dos táxons infragenéricos são fornecidas, assim como uma chave taxonômica, descrições, dados sobre etimologia, distribuição e habitats, fenologia, estado de conservação, nomes em vernáculo e listas de espécies examinados, pranchas em nanquim, fotografias e mapas de distribuição para todas as espécies aceitas no subgênero. Paralelamente aos objetivos principais, expedições exploratórias a campo e o estudo de espécimes em herbários possibilitaram a descrição de oito novas espécies: B. dichotoma, B. hemiptera, B. magnifica, B. napaea, B. nebularis, B. obdeltata, B. simplex e B. umbellata

Terebeliformes e sabelídeos, são grupos de poliquetas sedentários, bastante abundantes e diversificados em ambientes marinhos. Embora sejam abundantes e geralmente conspícuos, o conhecimento taxonômico sobre esses animais no litoral brasileiro ainda é muito limitado. Entretanto, a maioria dos registros de espécies de poliquetas para o Brasil provém de estudos realizados nas regiões Sudeste e Sul, enquanto em outras regiões, a fauna de poliquetas ainda é praticamente desconhecida, como o litoral nordestino, limitando-se a alguns estudos conduzidos por pesquisadores estrangeiros ao longo da costa brasileira durante a década de 70. Além disso, há muitos habitats praticamente ainda não exploradas ao longo do litoral do Brasil, como bancos de algas calcárias (bancos de rodolitos) e principalmente em ambientes de águas profundas, uma vez que poucos estudos sobre a fauna bentônica foram realizadas na região da plataforma continental (abaixo de 50 m) e menos ainda entre estas e talude continental (∼ 3.000 m). Neste contexto, o presente trabalho é um dos primeiros estudos de cunho taxonômico tratando especificamente dos Terebelliformia (Terebellidae, Thelepodidae, Polycirridae e Trichobranchidae) e Sabellidae que ocorrem ao longo da costa brasileira, abrangendo diversos tipos de substratos, desde consolidados e não consolidados, até substratos biológicos, como recifes de coral e bancos de rodolitos. Além disso, é o primeiro conduzido no país abrangendo também ambientes bentônicos de águas profundas. Foram analisados aproximadamente 5.500 indivíduos, pertencentes a 51 espécies, sendo 6 representantes de Polycirridae, 15 de Terebellidae, 7 de Thelepodidae, 5 de Trichobranchidae, e finalmente, 18 espécies de Sabellidae. Dentre as espécies encontradas, 26 são novas espécies para a ciência, além da ocorrência de dois gêneros de Terebellidae nunca antes registrado em águas brasileiras, Neoleprea e Lanicola. Além disso, material brasileiro anteriormente identificado como pertencente a algumas espécies de Terebelliformia e Sabellidae consideradas cosmopolitas, tais como Loimia grubei, L. medusa, Eupolymnia nebulosa, Pseudopotamilla reniformis, Parasabella microphthalma, Polycirrus plumosus e Amaeana trilobata, foi aqui descrito como diferentes táxons, novos para a ciência. / Terebeliforms and sabelids are sedentary polychaetes, very abundant and diverse in marine environments. Although are abundant, and often conspicuous worms, the knowledge of fauna of terebeliforms and sabellids occurring off the Brazilian coast is still poor. However, those studies are concentrated mostly on the southern/southeastern regions, while in others regions of the Brazilian coast the polychaete fauna occurring there is virtually unknown, as the northeastern coast, with few studies conducted by foreign researchers during the 70s. In addition, there are many habitats virtually still unexplored along the litoral of Brazil, as banks of calcareous algae (rhodolith beds) and mainly in deep-water environments, once few studies on the benthic fauna were conducted in the continental shelf region (below 50 m) and even fewer between the latter and the continental slope (∼3.000 m). In this context, this thesis is one of the first taxonomic studies dealing specifically with Terebelliformia (Terebellidae, Thelepodidae, Polycirridae and Trichobranchidae) and Sabellidae occuring along the Brazilian coast, from Sao Paulo to Paraíba, considering several types of substrates, from consolidated and unconsolidated, to biological substrates such as coral reefs and rhodolith beds. Moreover, it is the first conducted in the country covering terebelliformes and sabellids from deep waters. In total, approximately 5,500 were analyzed, belonging to 51 species, being 6 species of Polycirridae, 15 of Terebellidae, 7 species of Thelepodidae, 5 of Trichobranchidae and finally 18 are Sabellidae species. Among the species found, 26 are new to science, besides the occurrence of two genera of Terebellidae never before recorded in Brazilian waters, Neoleprea and Lanicola. In addition, Brazilian material previously identified as belonging to some species of Terebelliformia and Sabellidae considered cosmopolitan, such as Loimia grubei, L. medusa, Eupolymnia nebulosa, Pseudopotamilla reniformis, Parasabella microphthalma, Polycirrus plumosus and Amaeana trilobata, described herein as different taxa, new to science.

Em 2016, descobrimos que o material-tipo de 10 das 15 espécies de planárias terrestres (Platyhelminthes, Tricladida, Geoplanidae) brasileiras descritas por Schirch (1929) não estava perdido, mas sim depositado no Museu Nacional do Rio de Janeiro (MNRJ). Schirch somente descreveu a morfologia externa destas espécies. Originalmente no gênero Geoplana, as 15 espécies sofreram revisão taxonômica e atualmente são conhecidas como Issoca ezendei, Obama itatiayana, Pasipha plana, Paraba goettei, Pseudogeoplana arpi, Ps. bonita, Ps. blaseri, Ps. bresslaui, Ps. cardosi, Ps. doerdeleini, Ps. lumbricoides, Ps. obscura, Ps. riedeli, Ps. theresopolitana e Ps. wetzeli. Ainda, Geoplana maximiliani sensu Schirch, 1929 foi renomeada como Ps. schirchi Ogren & Kawakatsu, 1990. Pseudogeoplana foi proposto para espécies de Geoplaninae cuja morfologia interna se desconhece, especialmente a do aparelho copulador, órgão fundamental para a determinação inequívoca das espécies. Neste trabalho fizemos uma revisão taxonômica das espécies cujo material-tipo ainda existe, ou seja, Pasipha plana, Pseudogeoplana arpi, Ps. bonita, Ps. blaseri, Ps. bresslaui, Ps. doerdeleini e Ps. wetzeli. Excluímos do estudo Obama itatiayana por não atender aos requisitos de análise adotados (existência de material-tipo maduro e espécie não revisada anteriormente) e Issoca rezendei por ser objeto de estudo de outra dissertação. Estudamos o material-tipo e espécimes adicionais coletados recentemente de algumas das espécies. Obtivemos os dados morfológicos a partir de preparações histológicas e, quando viável, a partir de cortes virtuais obtidos por microtomografia computadorizada de raios-X (mCT), técnica que não destrói os espécimes. Esta abordagem resultou na preservação do corpo inteiro de, pelo menos, um parátipo de cada espécie e do holótipo, por monotipia, de Ps. bresslaui. Os espécimes-tipo de algumas espécies são jovens, sem aparelho copulador desenvolvido (Ps. arpi, Ps. doederleini e Ps. wetzeli); os de outra espécie não pode ser estudado em detalhe por conta da preservação deficiente (Ps. doederleini, Capítulo 1). Nesta revisão taxonômica, propomos a mudança de gênero para duas espécies: Paraba bresslaui (Capítulo 1) e Imbira bonita (Capítulo 2). Dadas as semelhanças entre Geoplana goetschi Riester, 1938 e I. bonita (Capítulo 2), também foi estudado o material tipo e espécimes adicionais de G. goetschi. O estudo levou à conclusão de que G. goetschi é sinônimo júnior de I. bonita (Capítulo 2). Por último, também descrevemos uma espécie nova de Imbira, simpátrica com I. marcusi, e propomos uma nova diagnose para este gênero (Capítulo 2). A mCT foi uma técnica valiosa para o estudo sistemático de várias espécies de Schirch sem destruir os espécimes-tipo. / In 2016, we found that the type-material of 10 of the 15 Brazilian land planarians (Platyhelminthes, Tricladida, Geoplanidae) described by Schirch (1929) were not lost but deposited in the Museu Nacional do Rio de Janeiro (MNRJ). Schirch only described the external morphology of these species. Originally in the genus Geoplana, the 15 species underwent taxonomic revision and their current names are Issoca rezendei, Obama itatiayana, Pasipha plana, Paraba goettei, Pseudogeoplana arpi, Ps. bonita, Ps. blaseri, Ps. bresslaui, Ps. cardosi, Ps. doerdeleini, Ps. lumbricoides, Ps. obscura, Ps. riedeli, Ps. theresopolitana. Also, Geoplana maximiliani sensu Schirch, 1929 was renamed as Ps. Schirchi Ogren & Kawakatsu, 1990. Pseudogeoplana was proposed for species of Geoplaninae whose internal morphology is unknown, especially that of the copulatory apparatus, organ essential for the unequivocal determination of the species. In this work we carried out a taxonomic revision of the species having type-material available, namely Pasipha plana, Pseudogeoplana arpi, Ps. bonita, Ps. blaseri, Ps. bresslaui, Ps. doerdeleini and Ps. wetzeli. We excluded from the work Obama itatiayana for it does not fulfill the requirements adopted (both existing mature type-material, and species not revised previously) and Issoca rezendei, since this species is currently being studied elsewhere. We studied the type-material and additional specimens collected recently, of some of the species. We obtained the morphological data from histological preparations and, when feasible, from virtual sections obtained through X-ray computed microtomography (mCT), a technique that does not destroy the specimens. This approach resulted in the preservation of the entire body of, at least, one paratype of each species, and the holotype, by monotypy, of Ps. bresslaui. The type specimens of several species are young, without copulatory apparatus (Ps. arpi, Ps. doederleini and Ps. wetzeli), or are poorly preserved, and hence could not be studied in detail (Chapter 1). As a result of the taxonomic revision, we propose the transfer of two species to other genera: Paraba bresslaui (Chapter 1) and Imbira bonita (Chapter 2). Given the similarities between Geoplana goetschi Riester, 1938 and I. bonita (Chapter 2), we also studied the type-material and additional specimens of G. goetschi. The study led us to the conclusion that G. goetschi is a junior synonym of I. bonita (Chapter 2). Finally, we also describe a new species of Imbira, sympatric with I. marcusi, and propose a new diagnosis for this genus (Chapter 2). mCT was a valuable technique for the systematic study of several type-specimens of Schirch\'s species without destroying them.