La dégradation des protéines, appelée protéolyse, est un mécanisme essentiel pour le fonctionnement et la survie cellulaire. Elle se fait en grande partie grâce à l’ubiquitination des protéines qui permet au protéasome de les reconnaître et de les cliver. Dans le cadre de ce projet, et ce, à partir de deux cas cliniques, j’ai étudié le rôle la protéine F-box/WD repeat-containing protein 4 (FBXW4) dans ce processus de dégradation. Les patients étaient tous deux atteints d’un syndrome polymalformatif caractérisé par une ectrodactylie appelé split hand/split foot malformation de type 3 (SHFM3) et par une insuffisance rénale chronique. Ils étaient aussi tous deux porteurs d’une mutation P376Q dans FBXW4. Comme on suspectait déjà que FBXW4 appartienne à un complexe d’ubiquitination, nous avons émis l’hypothèse que la mutation affectait l’assemblage de ce complexe et causait ainsi les désordres cliniques identifiés. J’ai donc reproduit cette mutation in vitro ainsi que d’autres à cette position pour en étudier les effets dans le système d’expression des ovocytes de Xenopus laevis. J’ai constaté que FBXW4 était organisé en homomères et que la nature du résidu 376 jouait un rôle dans cet assemblage. J’ai aussi observé que la nature du résidu 376 affectait aussi la liaison de FBXW4 avec Skp1, une autre protéine qui se retrouve dans le complexe. Ces travaux ont ainsi permis d’en arriver aux conclusions suivantes : 1) la mutation des patients affecte l’assemblage oligomérique de FBXW4, 2) elle est donc fort possiblement causale, et 3) elle entraînerait la maladie dû à un désordre de l’ubiquitination de certaines protéines durant le développement. / Protein degradation, also known as proteolysis, is essential for cell function and survival. It is most often achieved through the ubiquitination of proteins, a process that allows the proteasome to recognize and cleave such proteins. In this project, I studied two clinical cases in which the protein F-box/WD repeat-containing protein 4 (FBXW4) was believed to play a role. Both patients suffered from a polymalformative syndrome characterized by an ectrodactyly called type 3 split hand/split foot malformation (SHFM3) and chronic renal failure. Both patients also bore a P376Q mutation in FBXW4. As previous studies was consistent with the possibility that FBXW4 was part of an ubiquitination complex, we hypothesized that the mutation affected the assembly of this complex and resulted in the observed clinical disorders. I therefore reproduced the mutation in vitro among others at this location and characterized the effects of such mutations in Xenopus laevis oocyte expression system. I found that FBXW4 was organized in homooligomers and that the nature of the residue of position 376 played a role in assembly of the FBXW4 containing complex. I also found that the nature of residue 376 affected the binding of FBXW4 to another protein in the complex, that is, to Skp1. These results allow us to draw the following conclusions: 1) the mutation identified affects the oligomeric assembly of FBXW4, 2) it is thus very likely to be causative, and 3) it could cause an ubiquitination disorder in which certain proteins are not properly degraded during development

Avec les constantes avancées du séquençage de nouvelle génération (NGS), la quantité de données disponibles devient massive. En parallèle, les méthodes de détection au cancer demeurent très spécifiques et peu efficaces. De plus, le taux de survie des patients est directement relié à la progression tumorale et par conséquent, aux méthodes de détection. Malgré des avancées technologiques très importantes dans les dernières années, le taux de mortalité du cancer ne cesse d’augmenter. L’importance de développer des nouvelles méthodes de détection applicables à tous les types de cancer devient une nécessité. Jusqu’à présent, il n’existe aucun modèle permettant d’utiliser le séquençage de nouvelle génération qui permet la prédiction de caractéristiques cancéreuse (ex : récurrence, résistance, etc.). Les sections suivantes démontrent la création d’un modèle utilisant des mutations somatiques et germinales pour prédire la récurrence et son applicabilité au travers de tous les types de cancers (et même différentes maladies). En utilisant des signatures géniques (combinaisons de gènes) spécifiques à chaque cancer, nous avons été en mesure d’obtenir une précision de 90% (et plus) pour le groupe où le cancer est récurrent. De nos connaissances, ceci est la première tentative de développement de modèle permettant de prédire le pronostic du patient en utilisant le NGS. Ceci amène un nouvel aspect pour la médecine personnalisée et spécialement pour le dépistage du cancer. / With the constant progress in neext generation sequencing, the quantity of data available for investigation becomes massive. In parallel, cancer detection methods and treatments remain very specific and barely accurate. Moreover, the patients survival rate are directly linked with tumoral progression and therefore, to cancer detection methods. Despite continual technological advances in recent years, the global cancer mortality rate keeps rising. The creation of new detection methods accessible to all cancer types becomes a necessity. As of now, there is no model available that using sequencing data to predict cancer traits (ex: recurrence, resistance, etc.). The following sections demonstrate the creation of such model using somatic and germline mutations to predict recurrence and its applicability across all cancer types (and even across different diseases). By using gene signatures specific to each cancer types, we were able to obtain an accuracy of 90% (and more) for the cohort where the cancer was recurrent. To our knowledge, this is the first attempt to develop a model that can predict the patient’s prognosis using genome sequencing data. This will affect future studies and improve personalized medicine as well as cancer detection methods.

The general transcription factor IIH (TFIIH) is a multi-subunit complex involved in basal transcription as well as nucleotide excision repair. Consequently, mutations in several TFIIH subunits, including the helicase XPD, can lead to defective nucleotide excision repair (NER) and decreased basal transcription. In humans, germline mutations in XPD can lead to xeroderma pigmentosum (XP), trichothiodystrophy (TTD), and Cockayne syndrome and go along with reduced NER capacity. However, while XP patients suffer from a highly increased risk of skin cancer, including melanoma, TTD patients have developmental defects but no predisposition to cancer. To better understand the reason for the lack of tumorigenic potential, in this study, cell culture models of normal and TTD-mutant melanoma cells containing the TTDA mutants (TTDA-M1T, TTDA-L21P, and TTDA-R56X) and XPD-R722W mutation were developed. This study shows that the generation of TTD-mutant melanoma cell clones was possible, thus revealing that TTD mutations are generally compatible with melanoma cell growth. Both TTDA mutants and XPD-R722W melanoma cells were more sensitive to UV irradiation than control cells. Furthermore, proliferation and migration of TTD (XPD-R722W) cells were substantially reduced compared to control cells, demonstrating that the TTD-causing mutation affects tumorigenic features beyond UV sensitivity. To identify factors mediating this tumor-suppressive effect, comparative RNA sequencing of control and XPD-R722W melanoma cells was performed in this study. Ddit4l was identified as the topmost upregulated gene in XPD-mutant mouse melanoma cells. REDD2 protein, encoded by DDIT4L, has been previously implicated in the inhibition of mTOR - a pathway that is activated in most melanomas. Interestingly, it was found that high REDD2 expression is predictive of enhanced overall survival of skin cutaneous melanoma patients, and melanoma cell lines exhibit very low or even undetectable amounts of REDD2, implying that it might fulfill a tumor-suppressive role in melanoma. Functional studies revealed that REDD2 expression leads to delayed tumorigenic abilities such as proliferation in melanoma cells and suppresses the phosphorylation of the mTORC1 targets and translation regulators p70-S6K and 4EBP1. In summary, this study reveals that the mTOR inhibitor REDD2 is involved in the suppression of melanoma cells expressing TTD-causing XPD mutations. / Der Transkriptionsfaktor IIH (TFIIH) ist ein aus mehreren Untereinheiten bestehender Komplex, der sowohl die basale Transkription als auch die Nukleotid-Exzisions-Reparatur (NER) katalysiert. Erbliche Keimbahn-Mutationen in verschiedenen TFIIH-Untereinheiten wie der Helikase XPD führen dementsprechend zu einer verminderten NER-Kapazität und in manchen Fällen auch zu einer beeinträchtigten Transkription. Dieses kann zu den seltenen Erkrankungen Xeroderma pigmentosum (XP), Trichothiodystrophie (TTD) und Cockayne Syndrom führen, welche alle mit einer geringeren NER-Kapazität assoziiert sind. Während XP Patienten jedoch ein stark erhöhtes Risiko für Hauttumoren inklusive dem Melanom aufweisen, treten bei TTD-Patienten zwar Entwicklungsstörungen auf, jedoch wurde bei ihnen kein erhöhtes Krebsrisiko festgestellt. Um die Gründe für die fehlenden pro-tumorigenen Eigenschaften zu verstehen, wurden in dieser Arbeit Zellkulturmodelle von normalen und TTD-mutierten Melanomzellen entwickelt. Mit TTDA-M1T, TTDA-L21P, TTDA-R56X und XPD-R722W wurden beschriebene TTD-Mutationen in TTDA und XPD, zwei verschiedene Gene des TFIIH Komplexes, eingeführt. Es zeigte sich, dass die Generierung aller TTD-mutierten Melanomzellen möglich war, so dass eine TTD Mutation per se mit dem Wachstum von Melanomzellen vereinbar ist. Sowohl die TTDA-mutierten auch die XPD-R722W-mutierten Melanomzellen waren deutlich sensitiver gegenüber UV-Strahlung als die Kontrollzellen. Interessanterweise führte die XPD-R722W Mutation auch zu einer verminderten basalen Proliferation und Migration von Melanomzellen. Dieses zeigt, dass TTD-Mutationen selbst in Abwesenheit von UV-Stress tumorsuppressive Eigenschaften aufweisen können. Um zu untersuchen, wie es zu diesen anti-tumorigenen Effekten kommt, wurden Kontrollen und XPD-R722W mutierte Melanomzellen hinsichtlich charakteristischer Unterschiede mittels RNA-Sequenzierung untersucht. Dabei wurde die stärkste Expressionsänderung aller exprimierten Gene in unabhängigen R722W-Klonen für das Gen Ddit4l nachgewiesen. Ddit4l kodiert für das Protein REDD2, einem Inhibitor des mTOR-Signalweges, der in Melanomen einen große pro-tumorigene Rolle spielt. Interessanterweise geht eine hohe REDD2 Expression mit einem verbesserten Gesamtüberleben von Melanompatienten einher, was die Hypothese einer Tumorsuppressorfunktion von REDD2 unterstützt. Entsprechend wird REDD2 in kultivierten Melanomzellen entweder gar nicht oder nur sehr schwach exprimiert. Funktionale Studien, in denen REDD2 entweder herabgeknockt oder heraufreguliert wurde, zeigten, dass REDD2 die Phosphorylierung der mTORC1 Targets 3 und Translations-Regulatoren S6K und 4EBP1 herabreguliert sowie Proliferation von Melanomzellen beeinträchtigt. Zusammengefasst zeigt diese Arbeit, dass TTD-Mutationen eine anti-tumorigene Wirkung im Melanom haben, die durch die Deregulierung des mTOR Inhibitors REDD2 vermittelt werden kann.

Les canaux sodiques dépendants du voltage (Nav) sont des protéines transmembranaires largement exprimées au sein de l’organisme. Ils sont responsables de l’initiation des potentiels d’action au niveau des cellules excitables et régissent ainsi de nombreuses fonctions physiologiques telles que les fonctions cognitives et sensorielles, les fonctions motrices et la fonction cardiaque. Au niveau du coeur, le sous-type Nav1.5 est majoritairement exprimé à la surface des cardiomyocytes. Leurs dysfonctions sont traditionnellement associées à de nombreux troubles électriques cardiaques. Des mutations de ces canaux ont récemment été reliées au développement d’un phénotype clinique complexe associant diverses arythmies et la cardiomyopathie dilatée (DCM), une atteinte morphologique. L’objectif de mon doctorat a donc été l’identification mais aussi la caractérisation d’un potentiel défaut biophysique commun à l’ensemble des mutations Nav1.5 associées au développement de ce phénotype clinique atypique. Premièrement, nous nous sommes intéressés à deux mutations des canaux Nav1.5 retrouvées chez des patients atteints de DCM, et dont les altérations biophysiques ont été décrites comme divergentes. L'étude parallèle de ces deux mutants nous a amenés à identifier une caractéristique commune : la création d’une nouvelle voie de perméation alternative au sein des canaux Nav1.5, le pore oméga. Dans un second temps, nous avons souhaité consolider l’association entre la création du pore oméga et le développement pathologique. Cette seconde étude portant sur deux autres mutants Nav1.5 a permis de confirmer l’apparition d’un pore oméga et ainsi d’accroître la suspicion du caractère délétère de ce pore oméga. Finalement, à l’aide d’une cinquième mutation des canaux Nav1.5, nous avons investigué les conséquences physiopathologiques de la création d’un pore oméga. Cette étude, a clairement démontré les conséquences néfastes d'un tel pore au niveau de l’homéostasie ionique cellulaire. Ces perturbations se répercutent par la suite sur les signaux électriques, les propriétés morphologiques mais aussi fonctionnelles des cardiomyocytes. Les études menées lors de mon doctorat ont ainsi abouti à l'identification du pore oméga comme étant une caractéristique biophysique commune aux mutations des canaux Nav1.5 associées au développement des arythmies et de la dilatation cardiaque. / Voltage gated sodium channels (Nav) are broadly expressed in the human body. They are responsible for the initiation of action potentials (AP) in excitable cells. They underlie several physiological processes such as the cognitive, the sensitive, the motor and the cardiac functions. Nav1.5 channel is the main Nav expressed in the heart. Their dysfunctions are usually associated to the development of pure electrical disorders. However, mutations of Nav1.5 have recently been linked to the development of an atypical clinical phenotype combining complex arrhythmias and dilated cardiomyopathy (DCM). The main objective of my thesis has been to identify and characterize a common biophysical defect for all Nav1.5 mutations located in the channel’s voltage sensitive domains (VSDs) and associated with the atypical clinical phenotype. We were first interested in the case of two families of patients who displayed the same clinical phenotype although they carried two different Nav1.5 mutations, which have been reported to induce divergent biophysical defects. We identified a new alternative permeation pathway (called omega pore or gating pore) in the VSD of mutant Nav1.5 channels. This omega pore might constitute a common biophysical defect for all Nav1.5 mutations located in the channel’s VSDs. The second axe consisted in strengthening the association between mutations in the VSD of Nav1.5 and the creation of a gating pore. This research, based on the study of two other Nav1.5 mutations, confirmed the creation of an omega pore and increased the suspicion of the cardiovascular pathogenic potential of such an alternative permeation pathway. Finally, we studied a fifth Nav1.5 mutation. We used this mutation to characterize the pathological consequences of the creation of an omega pore. This study revealed that the creation of an omega pore disrupts the ionic homeostasis of cardiomyocytes. This homeostatic imbalance then affects electrical signals, cell morphology and also the function of cardiac myocytes. The studies of my thesis permitted to identify the omega pore as a potential common biophysical defect of Nav1.5 mutations located in the channel’s VSDs and associated to the arrhythmias and DCM. Furthermore, we also identified the pathological mechanism linking these mutations and the observed atypical clinical phenotype.

Les canaux sodiques sont des protéines membranaires d'une importance primordiale. Ils sont impliqués dans le déclenchement des potentiels d'action et sont nécessaires à l'excitabilité des cellules. Ils participent à la contraction des muscles striés squelettiques, cardiaques et lisses. Des dysfonctionnements de ces canaux, dûs à des mutations, peuvent engendrer de graves pathologies et atteintes cardiaques telles que le syndrome du QT long, le syndrome de Brugada, ou la cardiomyopathie dilatée. L'étude de ces mutations constitue un enjeu essentiel dans la compréhension des mécanismes de ces canaux et du développement des pathologies associées. Plus les connaissances avancent et plus il devient alors possible d'envisager des études précises sur le développement des traitements appropriés. Cette étude se concentre sur l'analyse de deux nouvelles mutations du gène SCN5A codant pour le canal Nav1.5, et a permis de mettre en évidence les caractéristiques biophysiques dysfonctionnelles de ces mutants et de confirmer le diagnostic médical. / Sodium channels are important transmembrane proteins. They are involved in the upstroke of action potential and they are necessary for the cardiac cell excitability. Their dysfunctions caused by mutations can lead to serious pathologies and cardiac impairments such as long QT syndrome, Brugada syndrome, dilated cardiomyopathy and even sudden death. The study of these mutations is a key step toward the comprehension of the pathophysiological mechanisms involved. The knowledge progress allows to lead accurate studies on drug development. This study focused on the analysis of two novel SCN5A mutations and allowed to highlight the dysfunctional biophysic characteristics of these mutants and to confirm the medical diagnosis.

La duplication de gènes est l’un des plus importants mécanismes évolutifs pour la génération de diversité fonctionelle. Lorsqu’un gène est dupliqué, la nouvelle copie partage toutes ses fonctions avec la copie ancestrale car elles encodent pour des protéines identiques. Donc, les deux protéines, appelées paralogues, auront le même réseau d’interactions physiques protéine-protéine. Cependant, dans le cas de la duplication des gènes qui codent des protéines qui interagissent avec elles-mêmes (homomères), la nouvelle protéine interagira aussi avec la copie ancestrale, ce qui introduit une nouvelle interaction (heteromère) (Kaltenegger and Ober, 2015; Pereira-Leal et al., 2007). Puisque ces interactions peuvent avoir des différents motifs de rétention et de fonction (Ashenberg et al., 2011; Baker et al., 2013; Boncoeur et al., 2012; Bridgham et al., 2008), il est important de mieux comprendre comment ces états sont atteints et quelles forces évolutives les favorisent. Dans ce memoire, je cible ces questions avec des simulations in silico de l’évolution des protéines suite à la duplication de gènes en travaillant avec des structures crystallographiques de haute qualité, provenant de la Protein Data Bank (Berman et al., 2000; Dey et al., 2018). Les simulations montrent que les sous-unités et interfaces partagées entraînent une forte corrélation entre les trajectoires évolutives de ces complexes. Ainsi, les simulations prédisent que la préservation de seulement les deux homomères ou seulement l’hétéromère ne devrait pas être fréquente. Toutefois, la simulation qui applique la sélection seulement sur un homomère montre que l’homomère neutre est destabilisé plus rapidement que l’hétéromère neutre. Nous avons comparé ces prédictions avec des résultats expérimentaux du réseau d’interactions protéine-protéine de la levure. Comme suggéré par les simulations, les patrons d’interactions les plus fréquents ont été la formation des trois complexes (deux homomères et un hétéromère) ou la formation de seulement un homomère. Les patrons correspondants à deux homomères sans hétéromères ou un hétéromère sans homomères sont rares. Nos résultats démontrent l’extension de l’hétéromérisation entre paralogues dans le réseau d’interactions physiques protéine-protéine de la levure, les mécanismes sous-jacents et ses implications. / Gene duplication is one of the most important evolutionary mechanisms for the generation of functional diversity. When a gene is duplicated, the new copy shares all of the ancestral copy’s functions because they encode identical proteins. Therefore, the two proteins, called paralogs, will have the same protein-protein interaction network. However, in the case of the duplication of genes encoding proteins that self-interact (homomers), the new protein will also interact with the ancestral copy, introducing a novel interaction (heteromer) (Kaltenegger and Ober, 2015; Pereira-Leal et al., 2007). As these interactions can have different retention and functional patterns (Ashenberg et al., 2011; Baker et al., 2013; Boncoeur et al., 2012; Bridgham et al., 2008), it is important to understand better how these states are reached and what evolutionary forces favor each of them. In this thesis, I approach these questions by means of in silico simulations of protein evolution after gene duplication by working with high-quality crystal structures from the Protein Data Bank (Berman et al., 2000; Dey et al., 2018). The simulations show that the shared subunits and interfaces lead to these complexes having highly correlated evolutionary trajectories. Thus, the simulations predict that the preservation of only the two homomers or only the heteromer is not likely to happen often. Nevertheless, simulating evolution with selection on only one homomer shows that the neutral homomer is destabilized faster than the neutral heteromer. We compared these predictions against experimental results from the yeast protein-protein interaction network. As suggested by the simulations, the most abundant interaction patterns were either the formation of all three complexes (two homomers and one heteromer) or the formation of only one homomer, with motifs corresponding to two homomers without a heteromer or a heteromer without homomers being rare. Our results highlight the extent of heteromerization between paralogs in the yeast protein-protein interaction network, the underlying mechanisms, and its implications

In the presence of selection and mutation, the genealogy of a given sample configuration can be described by two classes of ancestral processes, namely the coalescent-in-a-random-background model of Kaplan et al. (1988) and the dual process with typed lines of Etheridge and Griffiths (2009). These two processes are based on the same forwards population genetics model. However, in the former model, selection is reflected in the ancestral frequencies in the population, while in the latter model, there are branching events that generate virtual ancestral lines. We simulate the dual processes with typed lines and derive the limits of the two ancestral processes under strong selection and under selection-mutation balance to address the question of to what extent the genealogy is distorted. The two ancestral processes generate the same limiting genealogy. In a two-allele population under strong selection, the disfavoured individuals in the sample are instantaneously converted to a random number of favoured individuals, and the limiting genealogy is governed by the usual Kingman’s coalescent. Under selection-mutation balance, all disfavoured individuals in the sample are instantaneously converted to the favoured type, and the limiting genealogy is determined by a time-changed Kingman’s coalescent. The proofs of these limiting processes are based on the convergence result of Mohle (1998, Lemma 1). The studies of selection-mutation balance are then extended to an additive selection model, where each individual is composed of L diallelic loci. In the corresponding dual process with typed lines, the evolution of the virtual lines on a faster timescale can be approximated by a deterministic process, while the evolution of the real lines is independent of the virtual lines. The structure in the limiting genealogy collapses to Kingman’s coalescent. We also let L tend to infinity, and obtain a full description of the limiting genealogy in the background selection model.

To further facilitate mitochondrial DNA (mtDNA) sequence analysis for human identity testing, a better understanding of its mutation rate is needed. Prior to the middle 1990's the mutation rate applied to a forensic or evolutionary analysis was determined by phylogenetic means, This method involved calculating genetic distances as determined by amino acid or DNA sequence variability within or between species. The mutation rate as determined by this method ranged from 0.025-0.26 nucleotide substitutions/ site/ myr (million years). With the recent advent of mtDNA analysis as a tool in human identity testing an increased number of observations have recently come to light calling into question the mutation rate derived from the phylogenetic method. The mutation rate as observed from forensic analysis appears to be much higher than that calculated phylogenetically. This is an area that needs to be resolved in human identity testing. Mutations that occur within a maternal lineage can lead to a possible false exclusion of an individual as belonging to that lineage. A greater understanding of the actual rate of mutation within a given maternal lineage can assist in determining criteria for including or excluding individuals as belonging to that lineage. The method used to assess the mutation rate in this study was to compare mtDNA sequences derived from the HVI and HVII regions of the D-loop from several different maternal lineages. The sequence information was derived from five unrelated families consisting of thirty-five individuals. One intergenerational mutational event was found. This derives to approximately 1.9 nucleotide substitutions/ site/ myr. This mutation rate was very consistent with several other similar studies. This increased mutation rate needs to be considered by forensic testing laboratories performing mtDNA sequence analysis prior to formulating any conclusive results.

Hypochondroplasia (MIM 146000) is a skeletal dysplasia characterized by disproportional dwarfism with rhizomelic or mesomelic shortening of the upper and lower extremities, with variable severity. Patients often have macrocephaly with normal facial features. Hypochondroplasia is a disease with autosomal dominant inheritance. In some patients it is caused by germline mutations in the FGFR3 gene, in others the cause of the disease remains unknown . The FGFR3 gene encodes a tyrosine kinase receptor. This receptor negatively regulates the conversion of cartilage to bone. FGFR3 gene mutations that cause hypochondroplasia lead to constitutive activation of the receptor and inhibit the growth of long bones. In this study, we analysed selected regions (exons) of the FGFR3 gene in 98 patients with disproportional dwarfism and clinical diagnosis of hypochondroplasia. Eighteen patients from 12 families had familial and 80 patients had sporadic form of the disease. All patients were previously tested negative for frequent germline mutations in exon 13 (codon 540) and exon 15 (codon 650). Genomic DNA was isolated from patient's peripheral blood leukocytes. The examination was conducted with the informed consent of the patient or his legal representative. We performed mutational analysis by direct sequencing of...

La conservation des zones fragiles est désormais considérée comme étant une mesure urgente à mettre en œuvre pour les stratégies nationales et intergouvernementales. Ce travail essaye d’entreprendre une approche progressive permettant de contempler une zone humide typique « Sebkhat El Kelbia ». Plusieurs lignes de recherches sont adoptées. La première se consacre à la délimitation des principaux déterminants naturels responsables de la construction paysagère de cette zone. La deuxième concerne des lectures paysagères permettant de révéler les éléments de réversibilité et d’irréversibilité des paysages. Alors que la troisième ligne de recherche met en évidence l’existence de véritables vestiges de centuriation qui couronnent la sebkha. Une recherche analytique basée sur plusieurs outils transdisciplinaires, notamment la carto-interprétation, les délimitations de zonages naturels et paysagers, la restitution archéo-paysagère démontre l’importance de la zone d’étude sur les plans écologiques, patrimonial et de ses véritables potentialités paysagères. La caractérisation des entités paysagères met en exergue la présence, dans la région du Sahel tunisien, des faciès plutôt du type « vase d’eau » et d’autres faciès du type « parcelle en mutation irréversible ». Le premier peut atteindre jusqu’à 80 % du territoire en année humide et seulement une occupation rétrécie à 10 % en année sèche. Notons, que le faciès agraire de la zone d’étude est typique comme le prouve sa traçabilité à partir de la centuriation, où des usages patrimoniaux laissent présager des savoirs faires antiques en termes de maitrise des sols, de l’eau et du végétal. L’analyse de ce territoire considéré à tort « marginal » montre que les différentes interventions (politique, forestière et agraire) interagissent entre elles et agissent d’une façon directe sur les formes de paysages et constituent un passage obligé pour toute planification et/ou une réorganisation territoriale. Des paramètres de géomédiation paysagiste sont aussi proposés, et qui s’articulent sur la densification de la végétalisation du type halophyte et fourragère en rapport avec les applications paysannes de la région. L’implication de la gestion différentielle du type hybride « arridiculture - agri-loisir d’une zone humide » sera une autre ressource pour la valorisation des territoires menacés. / Conservation of sensitive areas is now seen as an urgent measure to implement national strategies and intergovernmental organizations. This paper seeks to undertake a phased approach to contemplate a wetland typical “Sebkhat El Kelbia”. Several lines of research are adopted. The first is devoted to the delineation of the major determinants responsible for building natural landscape of this area. The second relates readings landscape to reveal elements of reversibility and irreversibility landscapes. While the third line of research highlights the existence of genuine remains of centuriation crowning the sabkha. Analytical research tools based on several transdisciplinary, including cartographic interpretation, zoning boundaries and natural landscape, restitution archaeological landscape demonstrates the importance of the study area in terms ecological heritage and its true potential landscape. Characterization of landscape entities highlights the presence in the Sahel region of Tunisia, facies rather like "water tank" and other facies type "plot irreversible change." The first can achieve up to 80% of the land in a wet year and only one occupation narrowed to 10% in a dry year. Note that the agrarian facies in the study area is typical as evidenced by its traceability from centuriation which uses proprietary suggest knowledge in terms of faires ancient masters of the soil, water and vegetation. The analysis of this territory wrongly considered "marginal" shows that different interventions (policy, forest and land) interact and act in a way direct forms of landscapes and are a must for any planning and / or a territorial reorganization. Geomediation landscape settings are also available, which are based on the densification of the halophyte vegetation type and feed applications in connection with farming in the region. The implication of the differential management of hybrid "arridiculture - agri-leisure of a wetland" is another resource for the recovery of threatened areas.