Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2014-04-30T12:19:00Z No. of bitstreams: 1 2013_PedrodePodestaUchoaAquino.pdf: 2617594 bytes, checksum: 70c22cc82e5e041b0f6bb6d08a1812d8 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-04-30T14:57:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_PedrodePodestaUchoaAquino.pdf: 2617594 bytes, checksum: 70c22cc82e5e041b0f6bb6d08a1812d8 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-30T14:57:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_PedrodePodestaUchoaAquino.pdf: 2617594 bytes, checksum: 70c22cc82e5e041b0f6bb6d08a1812d8 (MD5) / A diversidade de peixes na região Neotropical é fruto de processos históricos e ecológicos intrinsicamente relacionados à evolução geomorfológica dessa região. Eventos de captura de cabeceira apresentam-­se como importantes processos biogeográficos transpondo e isolando populações de peixes entre bacias hidrográficas. O presente trabalho investiga o efeito dessas capturas sobre a diversidade filogenética de peixes de riacho entre o divisor de águas de bacias nas terras altas do Escudo Brasileiro. Foi quantificada a diversidade filogenética de cada bacia, bem como, a diversidade beta filogenética entre as bacias a partir das relações filogenéticas de 69 espécies nativas de peixes. A bacia do Alto Paraná apresentou diversidade filogenética maior do que o esperado ao acaso, evidenciando uma composição de espécies distantes filogeneticamente na composição da ictiofauna. O compartilhamento de espécies e os valores de diversidade beta filogenética não diferiram do esperado ao acaso, evidenciando eventos recentes de trocas de espécies entre as bacias. Ao se combinar os valores de diversidade filogenética com a diversidade beta filogenética, sugere-­se que as bacias do Alto Tocantins e São Francisco possuem comunidades com espécies/linhagens oriundas do Alto Paraná. O trecho estudado da bacia do Alto Paraná mostra-­se mais antigo, com evidencias de ser capturado pelas bacias vizinhas. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Title Headwater captures and the phylogenetic structure of freshwater fish assemblages Aim The astonishing diversity of Neotropical fishes results from historical and ecological processes intrinsically related to the geomorphological evolution of this region. Headwater captures are important biogeographic processes that promote dispersal or isolation of fish populations between watersheds. We investigate the effects of headwater captures on the phylogenetic structure of stream fish assemblages among watersheds in the Brazilian Shield highlands. Location Headwaters of Tocantins, Paraná and São Francisco watersheds, Brazilian Shield, Neotropical region. Methods From the phylogenetic relationships of 69 native fish species, we quantified the phylogenetic diversity of each basin, as well as species richness and the phylogenetic beta diversity between basins. Results The Upper Paraná basin showed higher richness and greater phylogenetic diversity than expected by chance, indicating phylogenetically distant species composition. The number of shared species and phylogenetic beta diversity values not differing from expected by chance indicate recent exchange of species between the basins. Main conclusions Our results suggest that the fish assemblage of the Upper Paraná basin is older and many species colonized recently the neighbouring Upper Tocantins and São Francisco basins via headwater captures.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-09-13T13:52:03Z No. of bitstreams: 2 Edika Sabrina.pdf: 2355352 bytes, checksum: bd199f9d627c46955e2c63cfd52499f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-13T13:52:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Edika Sabrina.pdf: 2355352 bytes, checksum: bd199f9d627c46955e2c63cfd52499f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Cichlids have different morphological, ecological and behavioral adaptations, promoting their adaptation in different environments throughout evolution. This diversity is reflected in the composition of cytogenomics group, which shows disparity in karyotype formula and diploid number of phylogenetically related species. The differences in composition and structure variations of these species are directly related to the repetitive fraction of the genome, since they correspond to most of the genome, and promotes chromosomal rearrangement events that can be observed by fluorescent in situ hybridization technique. Chromosome physical mapping of neotropical amazonian cichlid limited to specific elements that are the main targets of cytogenetic studies, such as non-LTR retrotransposons Rex and ribosomal DNA family. However, other participants in the repetitive portion of the genome have not yet been mapped until this present study. In addition, studies in African cichlids, brother phylogenetic group of neotropical, indicate that repetitive genomic composition of these species is much broader. Thanks to the recent availability of genomic sequencing of males and females of Amazonian species Cichla vazzoleri, Astronotus ocellatus, Pterophyllum scalare and Symphysodon discus, this study has identified, from a small fraction of the total genome of these species, other classes of repetitive elements in order to map them on chromosomes. The repetitive elements were identified as simple repeat and satellites DNA, and different classes of non-LTR retrotransposons LINE-like, LTR retrotransposons ERV-like and transposons Tc1-like. Moreover, it was possible to identify the proportion of each element in genomic sample used and relate the abundance of the number of copies of each element with the phylogeny of the host group, providing preliminary data on the participation of transposable throughout evolution. From this initial approach, the transposable elements more abundant were selected for use as probes in chromosomal physical mapping: retrotransposons non-LTR lines L2, RTE and Dong.R4 and transposons Tc1. The markings were conspicuous and widespread and not restricted to regions of heterochromatin. Some peculiarities were observed, such as retroelement L2 in Astronotus ocellatus, whose markings were mostly conspicuous in the centromeric and terminal regions, with the exception of chromosome pair 10 which showed strong marks scattered throughout the chromosome segment. Further investigation was conducted to identify possible variations of elements used as probes, the technique of in vivo cloning. In general, the sequences are relatively conserved, showing high degree of identity each other. Genomic data of transposable elements combined with its chromosomal mapping and their comparative nucleotide sequences provide preliminary data on the participation in the composition, organization and cytogenomics evolution of neotropical Amazonian cichlids. / Os ciclídeos apresentam diferentes adaptações morfológicas, ecológicas e comportamentais, promovendo sua adaptação em diversos ambientes ao longo da evolução. Essa diversidade é refletida na composição citogenômica do grupo, que apresenta disparidade na fórmula cariotípica e número diploide entre espécies próximas filogeneticamente. As diferenças na composição e estrutura cariotípica dessas espécies estão diretamente relacionadas à fração repetitiva do genoma, pois correspondem à maior parte, e favorecem eventos de rearranjo cromossômico, que podem ser observados pela técnica de hibridização fluorescente in situ. O mapeamento físico cromossômico de ciclídeos neotropicais amazônicos limita-se a elementos pontuais que são os principais alvos de estudos citogenéticos, como os retroelementos não-LTR da família Rex e DNAs ribossomais. Contudo, outros participantes da porção repetitiva do genoma ainda não foram mapeados até o presente estudo. Além disso, estudos em ciclídeos africanos, grupo filogenético irmão dos neotropicais, indicam que a composição genômica repetitiva dessas espécies é muito mais abrangente. Graças à recente disponibilidade do sequenciamento genômico de machos e fêmeas das espécies amazônicas Cichla vazzoleri, Astronotus ocellatus, Pterophyllum scalare e Symphysodon discus, o presente estudo identificou, a partir de uma pequena fração do genoma total destas espécies, outras classes de elementos repetitivos a fim de mapeá-los nos cromossomos. Os elementos repetitivos identificados foram repetições simples e DNA satélites, além de diferentes classes de retrotransposons não-LTRs do tipo LINE, retrotransposons LTRs do tipo ERV e transposons do tipo Tc1. Além disso, foi possível identificar a estimativa da proporção genômica e relacionar a abundância do número de cópias de cada elemento com a filogenia do grupo hospedeiro, fornecendo dados preliminares sobre a participação de transponíveis na evolução. A partir dessa abordagem inicial, foram selecionados os elementos transponíveis mais abundantes para serem utilizados como sondas no mapeamento físico cromossômico: retrotransposons não-LTRs lines L2, RTE e Dong.R4 e o transposon Tc1. As marcações foram conspícuas e dispersas e não se restringiram às regiões de heterocromatina. Algumas peculiaridades foram observadas, como a do retroelemento L2 em Astronotus ocellatus, cujas marcações foram majoritariamente conspícuas nas regiões centroméricas e terminais, com exceção do par cromossômico 10 que apresentou fortes marcações dispersas ao longo de todo o segmento cromossômico. Uma investigação adicional foi realizada a fim de identificar possíveis variações dos elementos utilizados como sondas, pela técnica de clonagem in vivo. De maneira geral, as sequências são relativamente conservadas, apresentando alto grau de identidade entre si. Dados genômicos dos elementos transponíveis combinado ao mapeamento cromossômico e análise comparativa de suas sequências nucleotídicas fornecem dados preliminares sobre a participação na composição, organização e evolução citogenômica de ciclídeos neotropicais amazônicos.

Doenças infecciosas veiculadas pela água são causa comum de enfermidades em seres humanos no mundo inteiro. Dentre os patógenos causadores destas doenças, os vírus merecem destaque, pois possuem a capacidade de sobreviver em ambientes aquáticos e de permanecer infectantes por meses. A avaliação da balneabilidade das águas brasileiras é monitorada através da densidade de coliformes termotolerantes (CT), classificando as águas de recreação em próprias ou impróprias. Este trabalho tem como objetivo detectar e quantificar genomas de Adenovirus (AdV) e Enterovirus (EV) em amostras de água das praias de Ipanema e do Lami em Porto Alegre – RS e avaliar as condições de balneabilidade através da quantificação de CT. A metodologia utilizada foi reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) para os vírus e o método de tubos múltiplos para quantificação de CT. Entre os meses de novembro de 2011 e abril de 2012, foram coletadas 36 amostras de água: 18 amostras de Ipanema e 18 da praia do Lami. Em 30 (83,3%) das 36 amostras coletadas foi detectada a presença de genomas virais. Genoma de AdV foi detectado em 28 (77,8%) amostras, enquanto de EV foi detectado apenas em 8 amostras (22,2%). Em contraste com as baixas concentrações de CT, a pesquisa de AdV e EV demonstrou alta positividade (83,3%), o que demonstra a baixa correlação entre os micro-organismos utilizados como marcadores fecais e a presença de genomas virais em amostras de água. / Waterborne diseases are a common cause of illness in humans worldwide. Among the pathogens causing these diseases, the viruses are noteworthy because they have the ability to survive in aquatic environments and remain infective for months. In Brazil the evaluation of recreational waters is made by monitoring the density of fecal coliform (FC), classifying recreational waters in appropriate or inappropriate. This work aims to detect and quantify genomes of Adenovirus (AdV) and Enterovirus (EV) in water samples from Ipanema and Lami beaches in Porto Alegre - RS and assess the conditions of bathing by quantifying FC. The methodology used was real time polymerase chain reaction (qPCR) for virus and multiple tube technique for FC. Between the months of November 2011 and April 2012 were collected 36 water samples: 18 samples in Ipanema and 18 in Lami. In 30 (83.3%) of the 36 samples the presence of viral genomes was detected. AdV genome was detected in 28 (77.8%) samples, while the EV was only detected in 8 samples (22.2%). In contrast to the low concentrations of FC, research of EV and AdV showed a high positivity (83.3%), which demonstrates the low correlation between micro-organisms used as fecal markers and the presence of viral genomes in water samples.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-03-14Bitstream added on 2014-06-13T21:08:00Z : No. of bitstreams: 1 rinconfilho_g_dr_rcla.pdf: 2989756 bytes, checksum: 1a42dacb7997cea4ab2edc011dd589b3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2008. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2009-09-24T19:34:55Z No. of bitstreams: 1 2008_PedroPodistaUAquino.pdf: 1397318 bytes, checksum: d2f889b196470e404ab4b9070c65d413 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-12-22T19:24:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_PedroPodistaUAquino.pdf: 1397318 bytes, checksum: d2f889b196470e404ab4b9070c65d413 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-12-22T19:24:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_PedroPodistaUAquino.pdf: 1397318 bytes, checksum: d2f889b196470e404ab4b9070c65d413 (MD5) Previous issue date: 2008 / Os padrões de distribuição das comunidades biológicas aquáticas ao longo dos riachos são influenciados por diversas variáveis ambientais que operam em escalas espaciais e temporais. Buscando quantificar a contribuição dos gradientes ambientais, espaciais e temporais na estruturação da taxocenose íctica em regiões de cabeceira, o presente estudo amostrou córregos das sub-bacias do Bananal e Santa Maria/Torto na região hidrográfica do Alto Rio Paraná. Os pontos amostrados encontram-se em uma Unidade de Conservação de Proteção Integral no Distrito Federal (Parque Nacional de Brasília). Seus cursos d’água apresentam bom estado de preservação, evidenciados na integridade de suas características ambientais naturais e na manutenção dos componentes biológicos nativos. Foram coletadas 28 espécies, sendo 12 novas para a ciência. Astyanax sp. e Hyphessobrycon balbus foram as espécies com maior distribuição na área de estudo e Knodus moenkhausii apresentou a maior abundância (64,5% dos indivíduos). Trechos mais largos e com coberturas vegetais menos densas apresentaram maior número de indivíduos e espécies. Ao longo do curso d’água com o aumento do volume e complexidade dos hábitats maior foi a diversidade de peixes encontrada. Repartindo as variações para explicar a composição da taxocenose íctica, entre os gradientes (espacial, ambiental e temporal) e suas interações, foi possível observar forte influência da matriz de dados espaciais contribuindo com 67,4%. A altitude foi a variável espacial que melhor explicou a distribuição das espécies. A matriz dos dados ambientais explicou 38,9% da distribuição dos dados biológicos, sendo o componente ambiental estruturado espacialmente responsável por 31,5% dessa variação. Apesar de pronunciada sazonalidade das chuvas na região, não foi observada variação temporal na estruturação da taxocenose íctica para os córregos de cabeceira das sub-bacias estudadas. Características hidrogeológicas específicas da bacia agem localmente sobre processos de colonização, dispersão e extinção. O pequeno porte e a baixa mobilidade dos peixes isolam populações favorecendo processos de especiação. Os dados do presente trabalho mostram-se bastante valiosos como referência para a região e, assim, podem ser usados na implementação de políticas públicas com apelo a conservação de nascentes e pequenos mananciais. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Aquatic communities distribution patterns are influenced in streams by several environmental variables which operate in spatial and temporal scales. In this study, we sampled streams in the Bananal and Santa Maria/Torto sub-basins at Upper Paraná River. The aim of this study was to quantify the contribution of environmental, spatial and temporal gradients on fish assemblage structure at preserved headwaters. The sampled areas are placed at Brasília National Park (an Integral Protection Conservation Unit) in Federal District, central Brazil. Rivers and streams in this region are well preserved as view for the integrity of natural nvironmental of this area and the maintenance of native biological components. Twenty eight species of fish were collected which 12 are new to science. Astyanax sp. and Hyphessobrycon balbus showed larger distribution in the study area and Knodus moenkhausii was the most abundant (64.5% of individuals). Larger stretches with fewer canopy cover had a greater number of individuals and species. The highest diversity of fish was found along the streams with the increase of habitats volume and complexity. By partitioning the variation to explain the composition of fish assemblage among gradients (spatial, temporal and environmental) and their interactions, it was possible to verify a strong influence of the spatial data matrix, which contributed with 67.4%. Altitude was the main spatial variable for explaining the distribution of fish species. The environmental data matrix explained 38.9% of the biological data distribution, and the spatially structured environmental component was responsible for 31.5% of this distribution. Despite the pronounced rainfall seasonality in the region, temporal variation was not observed in the fish assemblage structure for headwater streams of these sub-basins. Specific hydro- geological characteristics of the basin act locally on colonization, dispersion and extinction processes. The small size and low mobility of isolate populations fishes are characteristics that work in favor of speciation processes. This study results are quite valuable as a reference for the Cerrado region, so as to further implementation of public policies that aim at conserving headwaters and small streams.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-06T11:34:26Z No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-12T17:14:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-12T17:14:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / CNPq, FAPESB / A Bacia do Recôncavo Sul está localizada entre os rios Paraguaçu e de Contas, em área quase inteiramente contida na região Baixo Sul do Estado da Bahia. As principais drenagens desta bacia são Jaguaripe, Jequiriçá, Una e das Almas. A Bacia do Recôncavo Sul está inserida no bioma Mata Atlântica, ambiente caracterizado pelo seu alto grau de endemismo, alta diversidade biológica, elevados índices de ocupação humana e degradação ambiental. Análises da literatura e de coleções ictiológicas nacionais revelam que a ictiofauna de água doce da região é quase completamente desconhecida. O presente trabalho teve como objetivos realizar estudo taxonômico das espécies de peixes de água doce das drenagens da Bacia do Recôncavo Sul e examinar em maior detalhe as espécies do gênero Characidium encontradas. Foram realizadas cinco expedições de campo e o material coletado foi identificado até o menor nível taxonômico possível. Um total de 41 espécies de peixes foi registrado, pertencentes a 28 gêneros, 12 famílias e seis ordens (18 Characiformes, 13 Siluriformes, cinco Perciformes, duas Cyprinodontiformes, duas Gymnotiformes e uma Synbranchiformes). Foram encontradas quatro espécies reconhecidamente novas, além de nove possivelmente novas, três espécies consideradas, até o momento, como endêmicas da área de estudo, quatro exóticas e uma ameaçada de extinção. São apresentados comentários sobre problemas taxonômicos e distribuição de alguns táxons e uma chave de identificação para as espécies amostradas na área de estudo foi elaborada. A drenagem do rio das Almas é sugerida como de grandeimportância para conservação. Neste trabalho, duas espécies novas são descritas, ambas pertencentes ao gênero Characidium. / Salvador

OLIVEIRA, E. R. A. Observações sobre o fitoplâncton de lagoas de estabilização e avaliação de remoção algal via flotação com ar dissolvido. 2013. 100 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil: Saneamento Ambiental) - Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by Marlene Sousa (mmarlene@ufc.br) on 2013-08-14T17:29:17Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_eraoliveira.pdf: 3837601 bytes, checksum: c078c0e656c9fa5cfb1c7d9d016a87b0 (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa(mmarlene@ufc.br) on 2013-08-20T14:36:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_eraoliveira.pdf: 3837601 bytes, checksum: c078c0e656c9fa5cfb1c7d9d016a87b0 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-20T14:36:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_eraoliveira.pdf: 3837601 bytes, checksum: c078c0e656c9fa5cfb1c7d9d016a87b0 (MD5) Previous issue date: 2013-05-08 / The composition, weekly change, and evaluation of removal of phytoplankton biomass by Dissolved Air Flotation with a system of stabilization ponds Station Wastewater Treatment Aquiraz - EC was studied during the period from May to December 2011. Analyzing data removal efficiency of solids, COD, BOD, Turbidity, Coliform and density of organisms. Qualitatively the phytoplankton is composed of 36 specific taxa spread over 14 green algae, 11 euglenoids, 7 cyanobacteria, 2 bacilariofíceas, 1 criptofícea and only one clamidofícea. Although the number of species of green algae, the highlight densidadade and frequency was Planktotrhix agardhii, species known as producing toxins, dominating throughout the study period. This species has been supplanted in a very few weeks a coccoid green algae. Decrease occurred in the number of classes among the ponds along the survey reduction and worsening of species richness among lakes, culminating with the concentration of more than 90% of the composition of organisms belonging to a single species of cyanobacteria. Cyanophyceae were found with averages of 7.9 x105 to 1.6 x 106 org./mL. The results are worrying regarding the toxic potential of the dominant species and is thrown into the River Pacoti plus ponds behave like stock hormogon and replication of these organisms to the environment. In tests of removal, effluent Maturation Pond had 5.7 x 104 ind / mL, 132 NTU turbidity, 4,8 x103 NMP E. coli. The flotation tests with dissolved air show to be promising. After flotation, fell to 291,4 org/L, 2.7 NTU, 102 NMP E. Coli/100mL. The lowest efficiency of BOD, reaching averages of 73%. The COD was removed at 80%. Flotation had to be helped by coagulants. Was removed 98% of the phytoplanktonic organisms, 98.8% of fecal and 98% turbidity. E. coli was reduced by two logarithmic units, resulting in <600 NMP/100mL. The low bacterial concentration allows state after simple disinfection, reuse for irrigation, urban car washing and other uses of human contact restricted. / A composição, variação semanal, e avaliação de remoção de biomassa fitoplanctônica por Flotação com Ar Dissolvido de um sistema de lagoas de estabilização da Estação de Tratamento de Esgoto de Aquiraz – CE foi estudada durante o período de maio a dezembro de 2011. Analisando-se dados de eficiência de remoção de Sólidos, DQO, DBO, Turbidez, Coliformes e densidade de organismos. Qualitativamente o fitoplâncton apresentou-se composto por 36 táxons específicos, distribuídos por 14 clorofíceas, 11 euglenofíceas, 7 cianobactérias, 2 bacilariofíceas, uma criptofícea e apenas uma clamidofícea. Apesar do número de espécies de algas verdes, o destaque em densidadade e frequência foi de Planktotrhix agardhii, espécie conhecida como produtora de toxinas, dominando durante todo o período estudado. Esta espécie foi suplantada em pouquíssimas semanas por algas verdes cocóides. Ocorreu decréscimo do número de classes entre as lagoas ao longo da pesquisa com redução e piora da riqueza de espécies entre as lagoas, culminando com a concentração de mais de 90% da composição dos organismos pertencentes a uma única espécie de cianobactéria. Cyanophyceae foram encontradas com médias de 7,9x105 a 1,6 x 106 org./mL. Os resultados são preocupantes no que tange à potencialidade tóxica da espécie dominante e que é lançada no Rio Pacoti além de as lagoas se comportarem como estoque de hormogônios e replicação desses organismos para o ambiente. Nos ensaios de remoção, o efluente da Lagoa de Maturação B possuía 5,7 x 104 ind/mL, 132 NTU de turbidez, 4,8x103 NMP de E. coli. Os testes de flotação com ar dissolvido mostram-se promissores. Após flotação, caíram para 291,4 org/L, 2,7 NTU, 102NMP de E. Coli/100mL. A menor eficiência foi de DBO, alcançando médias de 73%. A DQO foi removida em 80%. A flotação teve que ser auxiliada por coagulantes. Foi removido 98% dos organismos fitoplanctônicos, 98,8% de coliformes e 98% da turbidez. E. coli foi reduzida em duas unidades logarítmicas, resultando em <600 NMP/100mL. A baixa concentração bacteriana permite indicar, após desinfecção simples, o reúso para fins de irrigação urbana, lavagem de automóveis e outros usos de contato humano restrito.

Doenças infecciosas veiculadas pela água são causa comum de enfermidades em seres humanos no mundo inteiro. Dentre os patógenos causadores destas doenças, os vírus merecem destaque, pois possuem a capacidade de sobreviver em ambientes aquáticos e de permanecer infectantes por meses. A avaliação da balneabilidade das águas brasileiras é monitorada através da densidade de coliformes termotolerantes (CT), classificando as águas de recreação em próprias ou impróprias. Este trabalho tem como objetivo detectar e quantificar genomas de Adenovirus (AdV) e Enterovirus (EV) em amostras de água das praias de Ipanema e do Lami em Porto Alegre – RS e avaliar as condições de balneabilidade através da quantificação de CT. A metodologia utilizada foi reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) para os vírus e o método de tubos múltiplos para quantificação de CT. Entre os meses de novembro de 2011 e abril de 2012, foram coletadas 36 amostras de água: 18 amostras de Ipanema e 18 da praia do Lami. Em 30 (83,3%) das 36 amostras coletadas foi detectada a presença de genomas virais. Genoma de AdV foi detectado em 28 (77,8%) amostras, enquanto de EV foi detectado apenas em 8 amostras (22,2%). Em contraste com as baixas concentrações de CT, a pesquisa de AdV e EV demonstrou alta positividade (83,3%), o que demonstra a baixa correlação entre os micro-organismos utilizados como marcadores fecais e a presença de genomas virais em amostras de água. / Waterborne diseases are a common cause of illness in humans worldwide. Among the pathogens causing these diseases, the viruses are noteworthy because they have the ability to survive in aquatic environments and remain infective for months. In Brazil the evaluation of recreational waters is made by monitoring the density of fecal coliform (FC), classifying recreational waters in appropriate or inappropriate. This work aims to detect and quantify genomes of Adenovirus (AdV) and Enterovirus (EV) in water samples from Ipanema and Lami beaches in Porto Alegre - RS and assess the conditions of bathing by quantifying FC. The methodology used was real time polymerase chain reaction (qPCR) for virus and multiple tube technique for FC. Between the months of November 2011 and April 2012 were collected 36 water samples: 18 samples in Ipanema and 18 in Lami. In 30 (83.3%) of the 36 samples the presence of viral genomes was detected. AdV genome was detected in 28 (77.8%) samples, while the EV was only detected in 8 samples (22.2%). In contrast to the low concentrations of FC, research of EV and AdV showed a high positivity (83.3%), which demonstrates the low correlation between micro-organisms used as fecal markers and the presence of viral genomes in water samples.

Programa de Pós-Graduação em Ecologia de Biomas Tropicais. Departamento de Biodiversidade, Evolução e Meio Ambiente, Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto. / Submitted by Oliveira Flávia (flavia@sisbin.ufop.br) on 2015-03-16T20:54:31Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_DecomposiçãoMacrófitasInvertebrados.pdf: 2981868 bytes, checksum: 8eaf59aebc60a5146b63b4d58e7e579e (MD5) / Approved for entry into archive by Gracilene Carvalho (gracilene@sisbin.ufop.br) on 2015-03-17T19:12:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_DecomposiçãoMacrófitasInvertebrados.pdf: 2981868 bytes, checksum: 8eaf59aebc60a5146b63b4d58e7e579e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-17T19:12:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_DecomposiçãoMacrófitasInvertebrados.pdf: 2981868 bytes, checksum: 8eaf59aebc60a5146b63b4d58e7e579e (MD5) Previous issue date: 2014 / A decomposição de macrófitas é um processo chave em diversos ambientes aquáticos. O estudo teve por objetivo analisar quais grupos de invertebrados se sobressaem durante a decomposição e se estes possuem alguma influência no processo. A colonização de invertebrados durante a decomposição de Eleocharis minima Kunth e de uma mistura representativa de macrófitas contendo E. minima, Egeria najas Planchon e Nymphoides indica Kuntze foi investigada através do método de sacos de litter. Foram confeccionados sacos de litter com tamanhos diferentes de malha (2cm e 500μm) no intuito de permitir diferentes grupos de invertebrados participarem do processo. O local de estudo foi a Lagoa dos Coutos, uma lagoa temporária na serra do Gandarela, no noroeste do Quadrilátero Ferrífero, em Minas Gerais. Um total de 24505 organismos foram coletados e 28 táxons identificados. O grupo de maior abundância foi Acari (74,9%), devido à desproporcional quantidade de Hydrozetes sp em todas as amostras. O segundo grupo de maior abundância foi Chironomidae, com 2258 indivíduos (9,2%), seguido de Naididae, com 974 individuos (3,9%). Caenis fittkaui foi a única espécie de Ephemeroptera encontrada no estudo, com 387 indivíduos (1,5% do total). Os resultados indicaram que a assembleia de invertebrados foi diferente nos sacos com malha diferente e as densidades foram efetivamente menores (P<0,00; P<0,00) nos sacos de 500μm. Entretanto, essa diferença não foi efetiva na taxa de decomposição em nenhuma das macrófitas estudadas (P=0,503; P=0,36). O tempo de decomposição foi um fator significativo na alteração da assembleia de invertebrados (P=<0,00), mas essa diferença foi pouco pronunciada, afetando principalmente Cladocera. A taxa de decomposição de E. minima foi baixa (k =0,0062±0,0007, malha fina; k=0,0065±0,0008, malha larga). A mistura de macrófitas obteve taxas de decomposição maiores do que a de E. mínima (k=0,0082±0,0015, malha fina; k=0,0150±0,0023, malha larga). A assembleia de invertebrados foi indiferente à composição de macrófitas no saco de litter (P=0,22). Os resultados indicam que a assembleia de invertebrados não é um componente funcional determinante do processo de decomposição, não sendo observado um processo de decomposição mais veloz no tratamento controle de invertebrados (malha larga) em comparação com o tratamento de exclusão parcial, ou seleção por tamanho (malha fina); ainda assim, o período de decomposição afetou a sucessão da assembleia de invertebrados. _________________________________________________________________________________________ / ABSTRACT: The macrophyte decomposition is a key process in certain aquatic environments. The study objective was to analyze wich invertebrate groups stand out during decomposition and if these have any influence on the process. The invertebrate colonization during decomposition of Eleocharis minima Kunth and a representative mixture of macrophytes containing E. minima, Egeria najas Planchon and Nymphoides indica Kuntze was assessed trough the litterbag method. The litterbags were made of different mesh sizes (2cm and 500μm) in order to allow different invertebrate groups to participate in the process. The study was carried out in Lagoa dos Coutos, a temporary pond in the Gandarela range, which is part of the Iron Quadrangle in Minas Gerais state, Brazil. A total of 24505 individuals were collected and 28 taxa were identified. The largest group in abundance was Acari (74.9%), due to the disproportional quantity of Hydrozetes sp.in all samples. The second highest abundance group was Chironomidae, with 2258 individuals (9.2%), followed by Naididae, with 974 (3.9%). Caenis fittkaui was the only Ephemeroptera species found, with 387 individuals (1.5%). The results suggest that the assembly was different in the different litterbags mesh and densities were significantly smaller (P<0.00; P<0.00). However, this difference had no effect over the decomposition rates in none of the studied macrophytes (P=0.503; P=0.36). The decomposition time was a significative factor in the variation of the invertebrate assembly (P<0.00), though this difference wasn’t pronounced, affecting mainly Cladocera. The decomposition rate of E. minima was low (k=0.0062±0.0007, fine mesh; k=0.0065±0.0008, coarse mesh). The macrophyte mixture got higher decomposition rates than E. minima (k=0.0082±0.0015, fine mesh; k=0.0150±0.0023, coarse mesh). The invertebrate assembly was unaffected by the macrophyte composition in the litterbag (P=0.22). The results indicate that the invertebrate assembly is not a determinant functional component of the decomposition process, as the control group (coarse mesh) yielded no gains in the decomposition rate in comparison to the partial exclusion experiment. Still, the decomposition state affected the invertebrate assembly succession.

Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-10-11T14:00:06Z No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-21T12:10:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-21T12:10:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-21T12:10:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) Previous issue date: 2016-06-21 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The identification Selenastraceae family organism is performed by optical microscopy only on diacritic characteristics, what has been questioned from recent molecular studies. Conflicts between phylogenetic, morphologic and genetic results were found after analysis of a large number of species Selenastraceae, and misidentification and consequently error in the classification directly leads to that the underestimation of species from Selenastraceae family. An alternative to these errors in identification and classification would be avoided using a polyphasic taxonomic approach to this family, combining to morphology, genetics, physiology and chemotaxonomy. Therefore, the use of fatty acids found in microalgae as an alternative to contribute assist in identification can be feasible. Using this information, this study considered the fatty acids of sixteen strains of microalgae from Selenastraceae family and found specific fatty acids and may differentiate between strains of microalgae and has presented fatty acids indicators from the Selenastraceae families (C18:3ω3 and C18:4ω6), Scenedesmaceae (C18:2ω6, C18:1ω9, C16:2ω6) and Oocystaceae (C18:3ω6) and also genera Monoraphidium (C16:1ω9 and C16:3ω6), Coelastrum (C18:1ω9) and Nephrocytium (C18:3ω6). Among Selenastraceae was detected potential with fatty acids for the production of biofuels (C18:1ω9), to feeding to animals (C16:0) and polyunsaturated for human nutritional supplements (C18:3ω3, C18:2ω6 and C16:4ω3) according the growing stage of these organisms. / A identificação de organismos da família Selenastraceae feita através de microscopia óptica e baseada apenas em características diacríticas vem sendo questionada atualmente a partir de estudos moleculares. Conflitos entre os resultados filogenéticos, morfológicos e os genéticos foram constatados após análises de um grande número de espécies de Selenastraceae, sendo que os erros na identificação e, consequentemente, na classificação dessas espécies implicam diretamente na subestimação da família Selenastraceae. Uma alternativa para que estes fossem evitados seria a utilização de uma abordagem taxonômica polifásica para essa família, aliando morfologia, genética, fisiologia e quimiotaxonomia. Portanto, a utilização dos ácidos graxos presentes nessas microalgas como alternativa para auxiliar na identificação parece viável. Com base nessas informações, o presente trabalho analisou os ácidos graxos de dezesseis cepas de microalgas pertencentes à família Selenastraceae e encontrou ácidos graxos específicos e que podem diferenciar as cepas de microalgas e apresentou ácidos graxos indicadores das famílias Selenastraceae (C18:3ω3 e C18:4ω6), Scenedesmaceae (C18:2ω6, C18:1ω9, C16:2ω6) e Oocystaceae (C18:3ω6) e, também para os gêneros Monoraphidium (C16:1ω9 e C16:3ω6), Coelastrum (C18:1ω9) e Nephrocytium (C18:3ω6). Entre as Selenastraceae foram detectados também ácidos graxos com potencial para a produção de biocombustíveis (C18:1ω9), alimentação de animais (C16:0) e poli-insaturados para a suplementação nutricional humana (C18:3ω3, C18:2ω6 e C16:4ω3), de acordo com a fase de cultivo desses organismos.