Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000397838-Texto+Completo-0.pdf: 1192704 bytes, checksum: 7ccf2868b7a0051ab601e134c300c5e9 (MD5) Previous issue date: null / Although the neotropical region is considered the richest in number of freshwater fish species in the world, few studies have attempted to understand genetic diversity in widely distributed species. From the perspective of genetic variation, these species may be excellent models to understand the historical relationship between the river basins. Molecular genetic markers were used to determine the characteristic patterns of genetic variation in the populations of H. malabaricus in the hydrographic basins of Rio Grande do Sul and neighboring basins (RAPD= 136 samples and SNPs= 48 samples), and three clades were defined among the populations: the first with animals from the Uruguay River basin – BHRU (except for the Upper Uruguay) and a point in Argentina; the second with animals in the Patos Lagoon –BHLP Hydrographic Basin, and the Tramandaí River-BHRT Basin, and the third clade with the animals of the Upper Uruguay, BHLP and BHRT. The Brazilian coast samples, included for comparison, were a separate group, except for the samples from São Paulo and Paraná, which were the second clade. As to the methodology used, it was found that both achieved similar results, but the SNPs proved more sensitive in forming the groups. / Embora a região neotropical seja considerada como a mais rica em número de espécies de peixes de água doce do mundo, poucos estudos objetivaram a compreensão da diversidade genética em espécies de ampla distribuição. Analisadas sob uma perspectiva de variação genética, estas espécies podem ser ótimos modelos para compreensão da relação histórica entre as bacias hidrográficas. Com o objetivo de determinar os padrões característicos da variação genética nas populações de H. malabaricus nas bacias hidrográficas do Rio Grande do Sul e bacias vizinhas, foram utilizados marcadores genéticos moleculares (RAPD=136 amostras e Seqüenciamento SNPs= 48 amostras) e definidos três clados entre as populações: o primeiro com animais da Bacia Hidrográfica do Rio Uruguai -BHRU (exceto Alto Uruguai) e um ponto da Argentina; o segundo, com animais da Bacia Hidrográfica da Lagoa dos Patos-BHLP e Bacia Hidrográfica do Rio Tramandaí-BHRT e o terceiro clado com os animais do Alto Uruguai, BHLP e BHRT. As amostras do litoral brasileiro, que foram incluídas com o intuito de estabelecer comparações, fizeram um grupo à parte, com exceção das amostras de São Paulo e Paraná que constituíram o segundo clado. Em relação à metodologia utilizada, verificou-se que ambas mostraram uma semelhança nos resultados obtidos, porém o Seqüenciamento mostrou-se mais sensível na elaboração dos agrupamentos.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-06T11:34:26Z No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-12T17:14:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-12T17:14:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / CNPq, FAPESB / A Bacia do Recôncavo Sul está localizada entre os rios Paraguaçu e de Contas, em área quase inteiramente contida na região Baixo Sul do Estado da Bahia. As principais drenagens desta bacia são Jaguaripe, Jequiriçá, Una e das Almas. A Bacia do Recôncavo Sul está inserida no bioma Mata Atlântica, ambiente caracterizado pelo seu alto grau de endemismo, alta diversidade biológica, elevados índices de ocupação humana e degradação ambiental. Análises da literatura e de coleções ictiológicas nacionais revelam que a ictiofauna de água doce da região é quase completamente desconhecida. O presente trabalho teve como objetivos realizar estudo taxonômico das espécies de peixes de água doce das drenagens da Bacia do Recôncavo Sul e examinar em maior detalhe as espécies do gênero Characidium encontradas. Foram realizadas cinco expedições de campo e o material coletado foi identificado até o menor nível taxonômico possível. Um total de 41 espécies de peixes foi registrado, pertencentes a 28 gêneros, 12 famílias e seis ordens (18 Characiformes, 13 Siluriformes, cinco Perciformes, duas Cyprinodontiformes, duas Gymnotiformes e uma Synbranchiformes). Foram encontradas quatro espécies reconhecidamente novas, além de nove possivelmente novas, três espécies consideradas, até o momento, como endêmicas da área de estudo, quatro exóticas e uma ameaçada de extinção. São apresentados comentários sobre problemas taxonômicos e distribuição de alguns táxons e uma chave de identificação para as espécies amostradas na área de estudo foi elaborada. A drenagem do rio das Almas é sugerida como de grandeimportância para conservação. Neste trabalho, duas espécies novas são descritas, ambas pertencentes ao gênero Characidium. / Salvador

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:42:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000434409-Texto+Completo-0.pdf: 489532 bytes, checksum: 6d9ad85140ac1052e70482873df7cc50 (MD5) Previous issue date: 2011 / The 2,3,7,8-tetrachlorodibenzeno-p-dioxin (TCDD) is a member of a group of environmental contaminants known as polychlorinated aromatic hydrocarbon and can be formed during the chlorine bleaching process used by pulp and paper and as a byproduct of the manufacture of certain chemicals. Once associated with ligands such as TCDD, the aryl hydrocarbon receptor (AHR) is translocated into the nucleus where it will form a dimer with nuclear translocator aryl hydrocarbon receptor (ARNT). The heterodimer AHR/ARNT formed, regulates the expression of a number of genes involved in cellular response to environmental changes and development conditions. Among the genes, is the coding for an ecto-ATPase (NTPDase2). Thus, it becomes important to assess the acute exposure (in vivo) of TCDD on the hydrolysis of ectonucleotidases in zebrafish brain membranes. The ectonucleotidases are enzymes capable of hydrolyzing the nucleotides and inactivating the signaling mediated by extracellular nucleotides. Among the ectonucleotidases, there are the NTPDase and ecto-5'-nucleotidase. The NTPDase activity showed no significant difference in the hydrolysis of ATP and ADP, as well as in AMP in menbranes of zebrafish. These findings seem to be important to reinforce the idea that NTPDase2 gene induction cannot be a general pathogenic factor in TCDD toxicity. However, further studies using either higher doses of TCDD and long-term exposure are required. / A 2,3,7,8-tetraclorodibenzeno-p-dioxina (TCDD) é membro de um grupo de contaminantes ambientais conhecido como hidrocarboneto aromático policlorinato e pode ser formada durante o processo de branqueamento com cloro, utilizado por fábrica de celulose e papel e como um subproduto da fabricação de determinados produtos químicos. Uma vez associado a ligantes como a TCDD, o receptor de hidrocarboneto arila (AHR) é translocado para o núcleo onde irá formar um dímero com o translocador nuclear do receptor hidrocarboneto arila (ARNT). O heterodímero AHR/ARNT formado regula a expressão de uma série de genes envolvidos na resposta celular a mudanças ambientais e a condições de desenvolvimento. Entre os genes, está o que codifica para NTPDase2 (previamente conhecida como ecto-ATPase). Com isso, torna-se importante avaliar a exposição aguda (in vivo) da TCDD sobre a hidrólise de ectonucleotidases em membranas cerebrais de zebrafish. As ectonucleotidases são enzimas capazes de hidrolisar os nucleotídeos e inativar a sinalização mediada pelos nucleotídeos extracelulares. Entre as ectonucleotidases, destacam-se as NTPDases e a ecto-5’-nucleotidase. A atividade de NTPDase demonstrou que não houve diferença significativa na hidrólise de ATP e de ADP, bem como de AMP em membranas cerebrais de zebrafish. Estas descobertas parecem ser importantes para reforçar a idéia de que a indução do gene que codifica à NTPDase2 pode não ser um fator geral da toxicidade de TCDD. No entanto, mais estudos utilizando doses mais elevadas de TCDD e exposição a longo prazo são necessárias.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-06T03:02:24Z No. of bitstreams: 1 PRISCILA_DEFINITIVO.pdf: 4663589 bytes, checksum: 895f668d6b5c418042e955376b7dfcd2 (MD5) / Approved for entry into archive by Vilma Conceição(vilmagc@ufba.br) on 2013-09-09T14:42:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PRISCILA_DEFINITIVO.pdf: 4663589 bytes, checksum: 895f668d6b5c418042e955376b7dfcd2 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-09T14:42:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PRISCILA_DEFINITIVO.pdf: 4663589 bytes, checksum: 895f668d6b5c418042e955376b7dfcd2 (MD5) / FAPESB, CAPES, CNPq / As drenagens costeiras do Estado da Bahia fazem parte da bacia do Leste do Brasil, uma área com alto grau de endemismo e de grande significado biogeográfico para sua ictiofauna. O conhecimento taxonômico e biogeográfico desta fauna, no entanto, é incipiente, considerando a ausência de inventários taxonômicos abrangentes e de estudos detalhados de taxonomia, filogenia e distribuição da maioria dos táxons. O presente trabalho teve como objetivos principais inventariar a composição da fauna de peixes de água doce de drenagens costeiras do Estado da Bahia, analisar aspectos biogeográficos da ictiofauna destas bacias e descrever algumas espécies novas. As amostragens foram realizadas entre 2004 e 2009 e o material obtido foi identificado até o menor nível taxonômico possível. Além disso, material da coleção ictiológica do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, referente às drenagens de interesse, foi analisado. Um total de 164 espécies de peixes de água doce nativas foi listado, sendo um gênero e 18 espécies ainda não descritos, 77 espécies são endêmicas, 27 não se enquadram em descrições existentes e carecem de estudos taxonômicos mais detalhados e 10 encontram-se na lista de peixes ameaçados de extinção. Seis descrições de espécies novas dos gêneros Astyanax (4), Cyphocharax (1) e Hyphessobrycon (1) são aqui apresentadas. A análise biogeográfica foi realizada utilizando o método de Análise de Parcimônia de Endemismo para propor hipóteses de relacionamento entre as drenagens e incluiu 18 rios e 64 espécies de peixes de água doce. Dois diagramas de áreas igualmente parcimoniosos foram obtidos e o diagrama de consenso estrito indica a existência de três agrupamentos de bacias ao longo da costa da Bahia. Estes são aqui denominados grupo Centro-Norte (sete drenagens entre o rio Real e rio de Contas, incluindo estas), grupo Centro-Sul (cinco drenagens entre os rios Cachoeira e Jequitinhonha, incluindo estas) e grupo Extremo-Sul (seis drenagens entre os rios Buranhém e Mucuri, incluindo estas). A análise de algumas filogenias, em conjunto com dados de padrões de distribuição e informações geomorfológicas disponíveis, indica história biogeográfica relativamente complexa para as bacias estudadas. A composição ictiofaunística atual parece ter evoluído após eventos vicariantes e/ou capturas de bacias, que envolveram, especialmente, os complexos hidrográficos do rio São Francisco e de outros rios que compõem a bacia do Leste. / Salvador

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:11:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000425634-Texto+Completo-0.pdf: 11636772 bytes, checksum: 2b2fc72ae18a9abf8e4b116ae7903ff8 (MD5) Previous issue date: 2010 / The historical biogeography involves studies on the distribution patterns of animals and plants by allowing us to understand evolutionary processes. This study aimed to analyze and implement two methods (parsimony analysis of endemism – PAE and panbiogeography) with distributional data from freshwater fishes of the Neotropical region, compare them with other studies, and emphasize the power of the biogeography as a conservation tool based on recent studies of biogeography in this region. In the first study was made an assimilation between them using data from ten studies that have been published with an emphasis on conservation and observed that both the parsimony analysis of endemism and the panbiogeographic methods are effective in helping to combat biodiversity loss when indicated areas to conserve. The PAE method is used mainly with quadrats, and in the track analysis the nodes are treated as hotspots of ecological biogeography. In the second moment, a parsimony analysis of endemism was made including 131 species and 44 geographical operational units where there was a connection of the pre-established areas as ecoregions of freshwater fish. The strict consensus cladogram resulted in the tree with 275 steps, with consistency index 0. 47 and a retention index 0. 51. It was observed congruences compatible with historic features and ecological geographical units, based on the drainage systems that characterize the ecoregions utilized. In the third study, it was applied the track analysis in five species of the genera included in Siluriformes and Characiformes (Auchenipterichthys, Auchenipterus, Boulengerella, Cetopsis and Roeboides). From the individual tracks of each species were obtained nine generalized tracks, and two nodes that can be designated as conservation locals, as they are in already detected areas of great biodiversity. Comparisons were made with other studies in panbiogeography and similarities in some tracks were identified. Based on analysis carried out with fish and comparisons made between the two methods, this study concludes that historical biogeography is an important and effective tool for conservation in the Neotropical region using different taxonomic groups. / A biogeografia histórica envolve estudos acerca dos padrões de distribuição dos seres vivos permitindo-nos compreender processos evolutivos. Este estudo objetivou aplicar e analisar dois métodos (análise de parcimônia de endemismo - PAE e panbiogeografia) com dados de peixes de água doce da região Neotropical e comparar com outros estudos, além de salientar o poder da biogeografia como ferramenta conservacionista baseada em levantamento de estudos biogeográficos recentes da região. Em um primeiro momento foi feito um trabalho usando dados de dez artigos recentes publicados com ênfase em conservação e observou-se que tanto a análise de parcimônia de endemismo quanto a panbiogeografia são métodos biogeográficos eficientes no auxílio ao combate da perda de biodiversidade quando indicadas áreas para se conservar. No método PAE usa-se principalmente quadrículas, e no método panbiogeográfico os nós são equiparados como hotspots da biogeografia ecológica. No segundo estudo foi feita uma análise de parcimônia de endemismo incluindo 131 espécies e 44 unidades geográficas operacionais onde se obteve a relação entre áreas pré estabelecidas como ecoregiões de peixes de água doce. No cladograma de consenso encontrado contendo 275 passos, índice de consistência 0,47 e índice de retenção 0,51 observaram-se congruências compatíveis com características históricas e ecológicas das unidades geográficas, baseadas nos sistemas de drenagens que caracterizam as ecoregiões utilizadas. No terceiro estudo aplicou-se a análise de traços para espécies de cinco gêneros incluídos em Siluriformes e Characiformes (Auchenipterichthys, Auchenipterus, Boulengerella, Cetopsis e Roeboides).A partir dos traços individuais de cada espécie obtiveram-se nove traços generalizados, e dois nós panbiogeográficos que podem ser indicados como região para conservação, visto que são em áreas já detectadas como de grande biodiversidade. Comparações foram feitas com outros estudos de panbiogeografia e semelhanças em alguns traços foram apontadas. Baseado nas análises realizadas com peixes e comparações realizadas entre as duas metodologias, este estudo conclui que a biogeografia histórica é uma ferramenta importante e eficaz no auxílio da conservação de grupos taxonômicos diversos da região Neotropical.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000388533-Texto+Completo-0.pdf: 1663288 bytes, checksum: a5e772faa45de50473359445af45907f (MD5) Previous issue date: 2007 / The Neotropical genus Eurycheilichthys is endemic to the southern Brazilian plateau, with two described species: E. pantherinus, which occurs in the upper Uruguay River basin, and E. limulus, that is found in the upper Jacuí River microbasin, which is part of the Guaíba Lake drainage. Seven new species are being described based on morphological characters and they are all endemic to the upper Taquari-Antas River microbasin, which is also part of Guaíba Lake drainage. We conducted the first molecular analysis concerning the phylogenetic relationships and phylogeography of the whole genus Eurycheilichthys using two mtDNA genes (COI and ND2). The phylogenetic trees and the network are structured by basin and microbasin and presented both described species as monophyletic. However, only three of the new species were monophyletic for these genes while some species showed several clades with restrict geographical distribution which could perhaps indicate other highly endemic cryptic species or the non-monophyly may be caused by incomplete lineage sorting. The origin of the Taquari-Antas clade was estimated around 0. 5-1. 0 million years ago while the divergence time among the species from this microbasin may have occurred around half a million years ago. Population analyses showed signals of a recent population growth for most of the species. The disjunct distribution among the river basins likely happened between the late Pliocene and the early Pleistocene, with the origin of the Uruguay basin. The high diversity and degree of endemicity of this group in the Taquari-Antas microbasin may be explained by its high declivity associated with the ecological restriction of the group. / A fauna de peixes de água doce da América do Sul é uma das mais ricas e, ao mesmo tempo, uma das menos conhecidas do mundo. O gênero Eurycheilichthys é endêmico do sul do Brasil, possuindo apenas duas espécies descritas na literatura. Eurycheilichthys pantherinus ocorre na Bacia do Uruguai, enquanto E. limulus ocorre somente na microbacia do alto Jacuí, na bacia do Guaíba. Atualmente, sete novas espécies estão sendo descritas com base na morfologia, as quais ocorrem na microbacia do Taquari- Antas, também na bacia do Guaíba. A área de ocorrência é restrita ao platô dos estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, acima de 600 m de altitude. O presente trabalho estuda a filogenia e a filogeografia das espécies de Eurycheilichthys utilizando evidências moleculares. Foram seqüenciados os genes mitocondriais COI e ND2 de 126 indivíduos sendo os dados concatenados para as análises, totalizando 1208pb. A filogenia sugere estruturação entre as bacias hidrográficas, assim como para as microbacias. Das espécies novas, notadamente ficaram monofiléticas apenas aquelas três com distribuição restrita a pequenos rios, enquanto as espécies de ampla ocorrência ficaram não-monofiléticas. Quando estimado o tempo de divergência entre as espécies, utilizando duas taxas evolutivas (0,9% e 1,8% por milhão de anos), percebe-se que o processo de diferenciação das novas espécies foi recente (entre 0. 5-1. 0 Mya), sugerindo que a não-monofilia das espécies pode ser causada por compartilhamento de linhagens ancestrais, uma vez que é possível notar que existe uma expansão quase simultânea de todas espécies novas. A distribuição do gênero nessas bacias hidrográficas deve ter sido modulada por vicariância, com a formação da bacia do Uruguai, datada do Plioceno.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-09T09:55:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Valéria N. Machado.pdf: 6227045 bytes, checksum: daa60637c6165a01a66fa67d94271829 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-09T09:56:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Valéria N. Machado.pdf: 6227045 bytes, checksum: daa60637c6165a01a66fa67d94271829 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-09T09:56:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Valéria N. Machado.pdf: 6227045 bytes, checksum: daa60637c6165a01a66fa67d94271829 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-09T09:56:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Valéria N. Machado.pdf: 6227045 bytes, checksum: daa60637c6165a01a66fa67d94271829 (MD5) Previous issue date: 2016-11-10 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Serrasalmidae is a family of Neotropical fishes with exclusive natural occurrence in the South American continent. These fishes are distributed in the main drainage basins of the continent, being abundant in the Amazon and Orinoco, but also occurring in the Paraná-Paraguay system and São Francisco River Basin. It inhabits a wide variety of water bodies, including the main channel of the rivers, lakes, the flooded forest and rapids or waterfalls environments in the headwaters of rivers. Many species of Serrasalmids, mainly from the genera Piaractus, Colossoma and Mylossoma, are economically important, representing a significant proportion of commercial fishing in the Amazon and used in aquaculture. Other species are important for the ornamental fish market as the species of the genus Metynnis. Some representative species of Mylesinus, Myleus and Tometes genera are among the most important species of fish for feeding in Amazonian indigenous communities. While the monophyly of this group is already defined, some pacus genera as Tometes, Mylesinus, Myleus and Myloplus, and piranha species as Serrasalmus rhombeus and Pristobrycon striolatus remain problematic taxonomically. As a result of uncertainty in the positioning of these taxa, the current status of the structure and genetic variability of populations of many species of Serrasalmidae is unknown yet. In order to contribute for resolve this problem, we use the DNA barcode methodology and performed a phylogeographic analysis by sequencing of the mitochondrial DNA genes [control region and cytochrome gene c oxidase (COI)] with the aim of evaluate the real diversity of piranhas and pacus in the Amazon; and also to perform a comparative analysis of some Serrasalmids taxa widely distributed in the Amazon. For diversity analysis were used 1,036 sequences of the COI gene from 68 species and morphotypes of Serrasalmids. For the phylogeographic analysis were used concatenated sequences of COI gene and control region from 74 individuals of S. rhombeus, 35 of Pygocentrus nattereri, 26 of Myloplus schomburgkii and 26 of Myleus setiger. The results indicate high levels cryptic diversity within Serrasalmids. From a total of 68 morphological species analyzed, 82 species were molecularly identified. The largest number of intraspecific lineages was observed within the pacus of the Myleus, Myloplus and Mylesinus genera; and within the piranhas of Serrasalmus and Pygocentrus genera. This wide intraspecific divergence occurs exactly in the genera with higher taxonomic uncertainties and wider distribution of its species. The results also show that S. rhombeus, P. nattereri, M. schomburgkii and M. setiger not behave like panmitic populations within their occurrence areas, showing structured lineages with divergence time dating from the Pliocene. Vicariant events during this period appear to be responsible for the current structure of these lineages in the Amazon. / Serrasalmidae é uma família de peixes neotropicais com ocorrência natural exclusivamente no continente Sul-Americano. Esses peixes estão distribuídos nas principais bacias de drenagens desse continente, sendo abundantes no Amazonas e Orinoco, porém ocorrem também no sistema Paraná-Paraguaia e na bacia do rio São Francisco. Habita uma grande variedade de corpos de água, incluindo o canal principal dos rios, os lagos, a floresta alagada até ambientes de corredeiras e cachoeiras nas cabeceiras dos rios. Muitas espécies de Serrasalmídeos, principalmente dos gêneros Piaractus, Colossoma e Mylossoma são economicamente importantes, representando uma importante fração da pesca comercial no Amazonas e também são utilizados na aqüicultura. Outras espécies são importantes para o mercado de peixes ornamentais como as espécies do gênero Metynnis, e representantes dos gêneros Mylesinus, Myleus e Tometes estão entre as espécies de peixes mais importantes para alimentação nas comunidades indígenas amazônicas. Embora a monofilia desse grupo já seja definida, alguns gêneros de pacus como os gêneros Tometes, Mylesinus, Myleus e Myloplus e as espécies de piranha Serrasalmus rhombeus e Pristobrycon striolatus ainda permanecem problemáticas taxonomicamente. Em consequência da indefinição no posicionamento desses táxons, o estado atual da estrutura e variabilidade genética das populações de muitas espécies de Serrasalmidae não é conhecido. Nesse sentido nós utilizamos a metodologia do DNA barcode pra analisar a diversidade desses peixes na América do Sul e também foi realizada uma análise filogeográfica através do sequenciamento dos genes do DNA mitocondrial (região controle e o gene citocromo c oxidase (COI)), com o objetivo de avaliar a real diversidade de piranhas e pacus na Amazônia e também analisar comparativamente a distribuição de alguns táxons de Serrasalmideos com ampla distribuição na Amazônia. Para a análise de diversidade foram usadas 1.036 sequências do gene COI de 68 espécies e morfotipos de Serrasalmídeos e para a análise filogeográfica foram usadas de forma concatenada, 71 sequências do gene COI e região controle de S. rhombeus, 35 de Pygocentrus nattereri, 26 de Myloplus schomburgkii e 26 de Myleus setiger. Os resultados indicam altos níveis de diversidade críptica dentro dos Serrasalmídeos. De 68 espécies morfológicas analisadas, foram identificadas molecularmente 82 espécies. O maior número de linhagens intraespecíficas foi observado dentro dos pacus dos gêneros Myleus, Myloplus e Mylesinus e das piranhas dos gêneros Serrasalmus e Pygocentrus. Essa grande divergência intraespecífica ocorre justamente nos gêneros com maiores incertezas taxonômicas e com mais ampla distribuição geográfica de suas espécies. Os resultados mostram ainda que S. rhombeus, P. nattereri, M. schomburgkii e M. setiger não se comportam como populações panmíticas dentro de suas áreas de ocorrência apresentando linhagens estruturadas com divergência datando do Plioceno. Eventos vicariantes nesse período parecem ser os responsáveis pela estrutura atual dessas linhagens na Amazônia.

A ordem Characiformes compreende cerca de 1700 espécies formalmente descritas que habitam a região Neotropical e com três famílias exclusivas da região da Etiópica subsaariana. Possui formas herbívoras, carnívoras e detritívoras, sendo uma ordem com hábitos ecológicos diversos. A classificação formal das famílias da ordem é baseada quase que estritamente em caracteres osteológicos e poucos caracteres de outras naturezas são utilizados para estabelecer hipóteses filogenéticas no grupo. Dessa maneira, o estudo do complexo morfológico encefálico preencheu essa lacuna representada pela ausência de novos caracteres de outra natureza morfológica que contribuam para o melhor entendimento das relações de parentesco entre os Characiformes. O presente estudo teve como objetivos principais a descrição e ilustração da macro morfologia encefálica de representantes das famílias de Characiformes e o levantamento de caracteres filogeneticamente informativos relacionados a esse complexo morfológico. Foram examinados 52 táxons terminais e 42 caracteres encefálicos. Adicionalmente a matriz de dados encefálicos, foram incoporados 126 caracteres osteológicos que definem os principais agrupamentos de Characiformes. O comportamento dos caracteres encefálicos foi mapeado através de uma análise de parcimônia, dessa maneira auxiliando a sustentar vários arranjos filogenéticos. Alguns arranjos filogenéticos novos foram obtidos, tais como, a relação de grupo-irmão entre Hemiodontidae + Chalceidae; Cynodontidae + Acestrorhynchidae como clado-irmão de Erythrinoidea; Gasteropelecidae + Triportheidae + Bryconidae sendo mais relacionados entre si; Crenuchidae como grupo-irmão de Characidae. Além dessas relações, corroborramos a elevação de algumas subfamílias de Characidae para o status de família, como Acestrorhynchidae, Bryconidae, Cynodontidae, Iguanodectidae e Triportheidae. A família Characidae tendo Heterocharacinae como ramo basal e sustentada principalmente por caracteres osteológicos tendo adicionalmente, um caráter exclusivo encefálico. Aphyoditeinae + Aphyocharacinae + Cheirodontinae mais relacionados e a subfamília Characinae como um grupo monofilético. / Characiformes comprises about 1.700 formally described species inhabiting the Neotropical region and three exclusives families of sub-Saharan Etiopic. The species of the order have herbivorous, carnivorous and detritivores feeding habits, being an order of several ecological habits. The formal classification of the families of the order is based almost exclusively on osteological characters and very few of characters of other types are used to establish phylogenetic hypotheses in the group. Thus, the present study of brain morphological complex aims to fill this gap represented by the absence of new morphological characters of another nature that might contribute to a better understanding of the relationships among the Characiformes. Thus, the present study had as main objectives the description and illustration of external brain morphology of representatives of all the families of Characiformes and the searching for phylogenetically informative encephalic morphological characters. For this, 52 terminal taxa and 42 brain characters were examined, in addition of brain data set, have been examined 126 osteological characters that define the main groups of Characiformes. The behavior of brain characters was mapped through a parsimony analysis, thus helping to sustain several phylogenetic arrangements of Characiformes. Some new phylogenetic arrangements were obtained, such as: the sister-group relationship between Hemiodontidae + Chalceidae; Cynodontidae + Acestrorhynchidae as clade-sisters of Erythrinoidea; Gasteropelecidae + Triportheidae + Bryconidae forming a monophyletic group; Crenuchidae as sister group of Characidae. In addition to these relationships, we corroboratethe elevation of some subfamilies of Characidae to family status, such as Acestrorhynchidae, Bryconidae, Cynodontidae, Iguanodectidae and Triportheidae. The Characidae family having Heterocharacinae as the most basal clade and sustained mainly by osteological characters, plus an exclusive character of brain nature. Aphyoditeinae + Aphyocharacinae related to Cheirodontinae and, Characinae subfamily as a monophyletic group.

A tribo Glandulocaudini inclui os gêneros Lophiobrycon, Glandulocauda e Mimagoniates e dez espécies, distribuídas em ambientes de água doce do leste e sul do Brasil, no Paraguai e nordeste do Uruguai. São peixes neotropicais de pequeno porte, cujo grau de especialização morfológica e comportamental, bem como os padrões de distribuição das espécies, constituem interessante modelo para estudos evolutivos e para o entendimento de padrões biogeográficos de peixes de água doce na América do Sul. Embora os trabalhos sobre sistemática e biogeografia realizados recentemente representem avanço considerável no conhecimento de Glandulocaudini, nenhum foi embasado fundamentalmente em evidências moleculares. Além disso, amostragens recentes revelaram aspectos inéditos relativos à distribuição de populações alopátricas das espécies Glandulocauda melanopleura e Mimagoniates microlepis e estes novos dados indicaram a necessidade de estudos mais aprofundados em nível populacional, envolvendo a análise combinada de dados moleculares e morfológicos. A presente tese aborda estas questões, e para isto está dividida em três capítulos. No primeiro capítulo foi realizada uma análise filogenética com base em sequências gênicas do mtDNA e nuDNA para a tribo Glandulocaudini, que representa a primeira hipótese de relações proposta com base em dados moleculares para o grupo. No segundo e o terceiro capítulos foram realizadas análises filogenéticas, filogeográficas, de demografia histórica, e análises morfológicas das populações alopátricas de Mimagoniates microlepis e Glandulocauda melanopleura, respectivamente. / The tribe Glandulocaudini comprises three genera, Lophiobrycon, Glandulocauda and Mimagoniates, and ten species, distributed in freshwater environments of eastern and southern Brazil, Paraguay, and northeastern Uruguay. Its members include small Neotropical fishes, whose degree of morphological and behavioral specialization, as well as the distributional patterns of the species are of great value for evolutionary studies and understanding of biogeographical patterns of South American freshwater fishes. Although studies on systematics and biogeography carried out recently represent considerable progress on the knowledge of Glandulocaudini, none was grounded in molecular evidence. Furthermore, recent samples revealed unknown aspects concerning the allopatric distributions of populations of Glandulocauda melanopleura and Mimagoniates microlepis, and this new data indicates the need of more deep studies at population levels, combining both molecular and morphological analysis. This thesis addresses such issues and for this purpose it is divided in three chapters. In the first chapter, a phylogenetic analysis of the tribe Glandulocaudini, based on mtDNA and nuDNA data was performed, representing the first hypothesis of relationship for the group based on molecular data. In the second and third chapters, analysis of phylogeny, phylogeography and historical demography were performed, as well as morphological studies on allopatric population of Mimagoniates microlepis and Glandulocauda melanopleura, respectively.

Orientador: Maria Stela Maioli Castilho Noll / Banca: Carlos Iglesias Frizzera / Banca: Denise de C. Rossa-Feres / Banca: Fabrício Barreto Teresa / Banca: Raoul Henry / Resumo: Neste estudo foi avaliada a importância das características limnológicas locais e da predação por peixes na estrutura das comunidades zooplanctônicas, sendo os objetivos e resultados apresentados em dois capítulos distintos: Capítulo 1. Tem por objetivo avaliar a influência dos pulsos de inundação na estrutura funcional e taxonômica das comunidades de microcrustáceos em lagoas marginais. Para atingir o objetivo proposto, foram determinadas a estrutura funcional e taxonômica das assembleias de microcrustáceos coletadas em lagoas marginais ao Rio Turvo em três estações distintas: seca, intermediária e chuvosa. Os resultados encontrados foram comparados entre lagoas e entre estações; também foram comparadas a estrutura das asssembléias das lagoas marginais com amostras de microcrustáceos provenientes de ambientes lênticos com diferentes regimes hidrológicos. Neste estudo também foi avaliado se um período longo de estiagem pode influenciar as dinâmicas sazonais dos microcrustáceos. A estrutura das assembleias dos microcrustáceos com base na classificação funcional e taxonômica apresentaram variações entre lagoas e estações, assim como ambientes aquáticos que não sofrem influência dos pulsos de inundação apresentam uma maior uniformidade funcional. A dinâmica sazonal das assembleias foi afetada pelo período prolongado de estiagem, onde as variações na estrutura das comunidades que existem entre estações foram menos intensas no período de estiagem quando comparado ao ano chuvoso... / Abstract: In this study, the importance of local characteristics and predation by fish in the zooplankton community structure was evaluated. The objectives and results were separated in two distinct chapters: Chapter 1. Its objective is to evaluate the influence of flood pulses on the functional and taxonomic structure of microcrustacean communities in oxbow lakes. For the proposed objective, the functional and taxonomic structure of the microcrustacean assemblages from oxbow lakes to the Rio Turvo was determined in three seasons: dry, intermediate and rainy. The results were compared between oxbow lakes and between seasons, as well as between samples from environments with different hydrological regimes. In this study, it was also evaluated if a long period of drought can influence the seasonal dynamics of microcrustaceans. The structure of the microcrustacean assemblages based on the functional and taxonomic classification showed variations between oxbow lakes and seasons; a greater functional uniformity was found on the aquatic environments not influenced by the flood pulses. The seasonal dynamics of the assemblages was affected by the prolonged period of drought, where the variations in the structure of communities between seasons were less intense in the drought year when compared to the rainy year. Our results show the influence of flood pulses on limnological characteristics and on the functional and taxonomic assemblages of microcrustaceans in the oxbow lakes; we also observed ... / Doutor