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Análise de complexos DNA-ligantes com aplicações na construção de carreadores de fármacos / Analysis of DNA-bindings complexes with applications in drug carriers formation

Silva, Eduardo Ferreira da 21 February 2018 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-06-28T12:59:05Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1975487 bytes, checksum: b9aa66d7efaefa5e006f60d3dea374a3 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-28T12:59:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1975487 bytes, checksum: b9aa66d7efaefa5e006f60d3dea374a3 (MD5) Previous issue date: 2018-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Neste trabalho, fizemos experimentos de estiramentos em moléculas únicas com pinça óptica e apoiamos nossas análises e conclusões nas técnicas de Eletroforese em Gel, Microscopia de Força Atômica e Espalhamento Dinâmico de Luz. Usamos este aparato para estudarmos inte- rações do DNA com alguns ligantes, incluindo proteína, surfactante, fármaco antitumoral (do- xorrubicina) e complexos formados com a união de dois destes ligantes e o DNA. Os ligantes, proteína e surfactante, foram escolhidos devido a suas possíveis funcionalizações como trans- portadores de fármacos ou material genético para o interior celular (carreadores). Estes dois são agentes condensantes do DNA e a condensação é um processo de fundamental importância na formação de carreadores. O fármaco antitumoral foi estudado por ser um material interessante a ser transportado para o interior celular. As propriedades mecânicas dos complexos em função da concentração do ligante foram diretamente determinadas a partir das medidas de estiramento, através do ajuste de curvas de força por extensão, no qual empregamos o modelo da cadeia ver- miforme (WLC) para polímeros semiflexíveis. Além disso, os parâmetros físico-químicos da interação DNA-doxorrubicina foram extraídos a partir de dados do comprimento de contorno, usando o modelo estatístico de ajuste pelo comprimento de contorno, previamente desenvol- vido pelo grupo de Física Biológica da UFV. Este modelo nos permitiu a obtenção da isoterma de ligação e particularmente, detectamos a interação típica de intercalantes para o fármaco do- xorrubicina, desvendando peculiaridades dessa interação a partir da autoagregação da droga em diferentes condições iônicas. Também coletamos dados da interação da proteína C 4 S 10 K 12 com o DNA que ajudam a evidenciar o processo de ação pelo qual a proteína C 4 S 10 K 12 condensa o DNA. Estudamos também a interação do surfactante catiônico DTAB com o DNA, como outro agente condensante do DNA, observando alguns aspectos importantes deste processo de condensação. / In this work, we performed single molecules stretching experiments with optical tweezers, and we supported our analysis and conclusions with the techniques of Gel Electrophoresis, Atomic Force Microscopy and Dynamic Light Scattering. We used these apparatus to study interactions of DNA with various ligands, including: protein, surfactant, an antitumoral drug (doxorubicin) and complexes formed from the link-up of two of these substances and DNA. The binders, pro- tein and surfactant, were chosen because of their possible functionalisations as drug or genetic material carriers for the cellular interior (carriers). These two are DNA-condensing agents and the DNA condensation is a fundamental process in carriers formation. The antitumor drug was studied because it is an interesting material to be transported into cells. The complexes’ mecha- nical properties as a function of ligand concentration were directly determined from stretching measurements by fitting the force extension curves to the worm-like chain model (WLC) of semi-flexible polymers. In addition, the physicochemical parameters of the DNA-doxorubicin interaction were extracted using a statistical model-fitting approaches by the contour length previously developed by the group of Biological Physics of UFV. These models allowed us to obtain the binding isotherms and particularly we detected the typical interaction of intercalators for the doxorubicin drug, unraveling peculiarities of this interaction, from drug self-aggregation, in different ionic conditions. Also, we collected data of the C 4 S 10 K 12 -DN A interaction that help to evidence the action process throughout which the protein C 4 S 10 K 12 condenses DNA. We also have studied the interaction between DNA and the cationic surfactant DTAB, as another DNA condensing agent, in which we observed some important aspects from this condensation process.
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Áreas verdes e clima urbano: a função socioambiental dos imóveis de proteção de áreas verdes na cidade - Recife/PE, Brasil

NASCIMENTO, Karina Barros Freitas 31 January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T16:26:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1960_1.pdf: 7342726 bytes, checksum: 15a03e133cb02113cc01709ab23ebdee (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Historicamente, a grande maioria das administrações de cidades modernas vem envidando esforços para a preservação de áreas verdes urbanas, considerando que elas têm importante função na elevação da qualidade de vida urbana. Mais recentemente, passou-se a enfatizar, também, o papel dessas áreas frente à questão do aquecimento global, seja diminuindo a contribuição das cidades para esse fenômeno, seja para o enfrentamento dos eventos climáticos que já se apresentarão nos dias atuais. A capacidade de exercer essas importantes funções urbanas fundamenta ações e regulamentações que visam à proteção dessas áreas, públicas ou privadas, em cidades de todo o mundo. Embora essa argumentação esteja bastante presente no discurso do planejamento urbano-ambiental, a efetiva proteção de áreas verdes urbanas no Brasil enfrenta uma série de dificuldades, algumas típicas da gestão urbana no país e outras referentes à própria produção de conhecimento sobre o assunto. Essas dificuldades se evidenciam nas lacunas na literatura, destacando-se os pouquíssimos estudos sobre os instrumentos de planejamento e gestão urbana propostos e implantados no país e sua eficácia na proteção das áreas verdes urbanas. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a situação atual dos IPAVs abordando sua eficácia como instrumento de planejamento urbano, dada a relevância da sua manutenção como proteção de áreas verdes no Recife/PE, no nordeste do Brasil, para que elas cumpram suas funções ambientais relativas ao planeta e à cidade. A pesquisa abrangeu os 63 IPAVs existentes na cidade, buscando verificar a eficácia desse instrumento de proteção através de estudo de base cartográfica, onde se observa a evolução entre os anos de 1986 e 2007. Essa metodologia gerou informações imprescindíveis para a avaliação desse instrumento pioneiro de proteção ao verde urbano, enfatizou sua importância e fragilidades na sua gestão, permitindo apontar formas para seu aperfeiçoamento, além de criar uma base que poderá ser usada para o seu monitoramento e avaliação permanentes
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Gestão de áreas verdes em ambientes urbanos : (uma contribuição á análise e resolução de conflitos sócioambientais)

ANDRADE, Aline Clemente de 31 January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T16:27:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2131_1.pdf: 1771486 bytes, checksum: acb872979d42f382855eb69cafa4d4c8 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / O presente estudo discute os problemas relacionados a gestão de áreas verdes em ambientes urbanos, tendo como enfoque a ocorrência de conflitos ambientais correlatos. Para isso consideram-se as características da cidade contemporânea diante do processo de reestruturação do capital e as implicações desta reestruturação na dinâmica de produção do espaço urbano. Assim, ressalta-se a necessidade de internalização da componente ambiental em todos os setores do Estado, com vistas à negociação de conflitos entre as distintas esferas do Poder Público. Dessa forma, as políticas sociais, econômicas, de saúde, entre outras, também seriam políticas ambientais. Tendo em vista a diversidade de atores sociais envolvidos em problemas de uso e ocupação do solo envolvendo a gestão de áreas verdes protegidas em cidades, aponta-se para a importância da utilização de metodologias que auxiliem o processo de negociação de conflitos, como forma de se alcançar uma solução consensual que contemple as diferentes demandas relacionadas. Para tanto, partiu-se do exemplo do Manguezal do Pina (Recife/PE), em que foi possível realizar a análise, estruturação e simulação da resolução de conflitos que ali eclodiram. Então, foi possível a aplicação da metodologia Abordagem da Escolha Estratégica , com o objetivo principal de avaliar a sua efetividade como ferramenta de apoio ao processo de tomada de decisão em situações de conflito, de maneira a estimular formas estruturadas de gestão participativa para a resolução de problemas ambientais
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Excesso de peso em mulheres de uma comunidade de baixa renda

DINEGRI, Letícia 16 February 2017 (has links)
Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-07-27T19:41:11Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Letícia Dinegri.pdf: 4813495 bytes, checksum: ad142742a4f48bc4ec9308cb9cf8c9b4 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-07T22:42:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Letícia Dinegri.pdf: 4813495 bytes, checksum: ad142742a4f48bc4ec9308cb9cf8c9b4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-07T22:42:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Letícia Dinegri.pdf: 4813495 bytes, checksum: ad142742a4f48bc4ec9308cb9cf8c9b4 (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / FACEPE / CAPES / O excesso de peso deixou de ser um problema de saúde predominante entre as classes socioeconômicas mais favorecidas tornando-se universal. As mulheres em idade fértil são um grupo vulnerável aos determinantes sociais, demográficos e reprodutivos que promovem o excesso de peso. No entanto, são escassas as informações sobre a saúde e nutrição das mulheres em idade reprodutiva que vivem em comunidades de baixa renda (favelas). O presente estudo teve por objetivo investigar a prevalência de excesso de peso e seus fatores associados nas mulheres em idade reprodutiva residentes em uma comunidade de baixa renda. A amostra consistiu de 663 mulheres, na faixa etária de 15 a 49 anos, domiciliadas na comunidade dos Coelhos no município de Recife – PE. O excesso de peso para mulheres dos 15 aos 19 anos foi definido pela relação Índice de Massa Corporal/idade (IMC/I) utilizando-se o programa Anthro Plus da OMS onde valores iguais ou superiores a +1 escore Z foram classificados como excesso de peso. Para as mulheres com idade ≥ 20 anos o excesso de peso foi definido com IMC ≥25 Kg/m2. A análise da regressão de Poisson foi utilizada para verificar o efeito ajustado das variáveis explanatórias no excesso de peso. A prevalência do excesso de peso foi observada em dois terços das mulheres (66,3%). Os resultados da análise multivariada mostraram risco significantemente maior para excesso de peso nas mulheres com o avançar da idade, que apresentaram menarca precoce (<12 anos), que tiveram 3 ou mais gestações, que coabitavam com o companheiro e se autodenominaram com cor preta ou cor branca. Fatores biológicos e socioeconômicos influenciaram na ocorrência do excesso de peso em mulheres em idade reprodutiva, porém para melhor explicar a complexidade da relação entre os fatores envolvidos neste processo são necessários novos estudos longitudinais que abranjam fases mais precoces da vida nos ambientes de pobreza. / Overweight is no longer a predominant health problem among the most favored socioeconomic classes making it universal. Women of childbearing age are a vulnerable group to the social, demographic and reproductive determinants which promote overweight. However, there is scarce information on the health and nutrition of women of reproductive age living in slum areas. The present study aimed to investigate the prevalence of overweight and its associated factors in women of reproductive age living in a low income community. The sample consisted of 663 women, aged 15 to 49 years, living in the Coelhos’s neighborhood at Recife city – State of Pernambuco. The definition of overweight for women aged 15-19 was Body Mass Index (BMI) for age using the Anthro Plus program of WHO, where values equal to or greater than +1 Z score was classified as overweight. For women aged ≥ 20 years, overweight was defined as BMI ≥25 kg/m2. Poisson regression analysis was used to verify the adjusted effect of the explanatory variables on overweight. The prevalence of overweight was observed in two thirds of women (66.3%). The results of the multivariate analysis showed a significantly higher risk for overweight among the older women, those who had early menarche (<12 years), had 3 or more pregnancies, cohabited with the partner and called themselves black or white. Biological and socioeconomic factors influenced the occurrence of overweight in women of reproductive age, but to better explain the complexity of the relationship between the factors involved in this process further longitudinal studies are required to cover earlier stages of life in poor environments.
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Ecological drivers of tree diversity and ecosystem functioning during succession in Amazon: forest resilience after indigenous shifting cultivation

Villa, Pedro Manuel 05 April 2018 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-08-14T17:36:33Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3902930 bytes, checksum: 31f39024e5a42e2fdd5858bf9c02e292 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-14T17:36:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3902930 bytes, checksum: 31f39024e5a42e2fdd5858bf9c02e292 (MD5) Previous issue date: 2018-04-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A floresta Amazônica vem sendo ameaçada pelas mudanças no uso da terra para a expansão da fronteira agrícola, provocando uma simplificação taxonômica e funcional, e em consequência gerando impactos negativos na relação da biodiversidade e funcionamento dos ecossistemas. Assim, o objetivo principal desta pesquisa foi avaliar os efeitos dos modeladores ecológicos sobre a diversidade taxonômica e funcional (alfa e beta) e sua relação com funcionamento ecossitêmico durante a sucessão secundária de uma floresta Amazônica, no estado Amazonas, Venezuela. Por este motivo, esta pesquisa foi dividida em sete capítulos, dois capítulos para descrever os efeitos do padrão de uso da terra sobre a recuperação da diversidade e perda da resiliência florestal, dois capítulos para explicar os efeitos dos modeladores ambientais e antropogênicos sobre a diversidade taxonômica e funcional (alfa e beta) e os efeitos sobre o funcionamento ecossitêmico durante a sucessão, e três capítulos como recomendações para o manejo e conservação de florestas da Amazônia. Utilizamos dados de inventário de plantas de 63 parcelas (1000 m 2 , 20 x 50 m) em seis locais com florestas secundárias de cinco e 10 anos de regeneração depois de um até seis ciclos de agricultura itinerante para avaliar o efeito de diferentes intensidades de uso da terra, bem como a fertilidade do solo na recuperação da diversidade e estrutura da floresta. Também analisamos as mudanças na diversidade e composição das espécies arbóreas após um único ciclo de agricultura itinerante, utilizando dados de 45 parcelas distribuidas em quatro florestas secundárias (5, 10, 15, e 20 anos de idade após do cultivo) e uma floresta madura (> 100 anos). Dentro de cada área de amostragem se estabeleceram três parcelas de 1000 m 2 (20 x 50 m para árvores com DAP > 5 cm). Em cada área foi coletada uma amostra de solo a diferentes profundidades (0-10 cm, 10-30 cm). Assim, analisamos padrões ecológicos e modeladores ambientais da diversidade taxonômica e funcional (alfa e beta), e os efeitos do tempo de sucessão e qualidade do solo (fertilidade e textura) sobre a estocagem de biomassa acima do solo através da diversidade funcional e dominância funcional durante a sucessão secundária. Usamos diferentes métodos estatísticos e tipos de modelos para testar estas relações ecológicas. Neste estudo, demostramos como a intensidade do uso da terra induz uma perda de resiliência florestal, de forma contrária se evidencia que com disturbios intermediários depois de um único ciclo de agricultura ocorre uma rápida recuperação da diversidade, atingindo aproximadamente um 70% da riqueza de uma floresta madura depois de 20 anos. No entanto, a recuperação da composição das espécies nesse mesmo período atingiu uma média de 25% em relação à floresta madura. Nosso estudo mostra que a diversidade beta explica até 70% da variação na riqueza total de espécies entre os sítios, provavelmente devido a que as manchas desmatadas estão inseridas dentro de uma matriz de floresta madura. Este contexto ecológico também justifica o elevado turnover taxonômico durante a sucessão. Assim, a diversidade funcional foi menor do que a diversidade beta taxonômica, provavelmente devido a um menor turnover funcional em comparação com o turnover taxonômico. Nossos resultados proporcionam importantes evidências sobre relação biodiversidade-função ecossistêmica durante a sucessão secundária de uma floresta tropical Assim, os modelos de equação estruturais testados sobre dominância funcional e diversidade funcional, permitiram explicar variações na biomassa acima do solo de forma individual. O tempo de sucessão foi o melhor preditor para explicar variações da biomassa acima do solo em todos os modelos SEM explorados, seguidamente da textura solo que teve afeitos significativos positivos sobre a biomassa acima do solo, em comparação à fertilidade do solo que apresentou efeitos negativos e não significativos. Nosso estudo contribui no entendimento da relação BEF ao longo da sucessão secundária, e pode ajudar a predizer como as florestas tropicais respondarão aos cenários futuros de mudanças climáticas. Por esse motivo, discutimos que para aumentar a eficiência na implementação de estratégias REDD+ em florestas da Amazônia, é necessário compreender simultaneamente a relação de padrões e processos dos ecossistemas florestais com o sistema sócio-ecológico, através da análise de preditores biofísicos e antropogênicos, a partir de um nível local para uma escala regional. / The Amazon forest is being threatened by land use changes for the agricultural expansion, causing a taxonomic and functional simplification, and consequently generating negative impacts on the relation of biodiversity and ecosystem functioning. Thus, the main objective of this research was to evaluate the effects of ecological drivers on taxonomic and functional diversity (alpha and beta) and their relationship with ecosystem functioning during the secondary succession of an Amazon forest, in Amazonas state, Venezuela. For this reason, this research was divided into seven chapters, two chapters to describe the effects of the land use pattern on the recovery of diversity and loss of forest resilience, two chapters to explain the effects of environmental and anthropogenic drivers on taxonomic diversity and functional (alpha and beta) and effects on ecosystem functioning during the succession, and three chapters as recommendations for the management and conservation of Amazonian forests. We used plant inventory data from 63 plots (1000 m 2 , 20 x 50 m) at six sites with five and 10 year regeneration secondary forests after one to six cycles of shifting cultivation to evaluate the effect of different intensities of use land, as well as soil fertility in the recovery of forest diversity and structure. We also analyzed changes in the diversity and composition of tree species after a single cycle of shifting cultivation, using data from 45 plots distributed in four secondary forests (5, 10, 15, and 20 years old after cultivation) and a mature forest (> 100 years). Within each sampling area three plots of 1000 m2 (20 x 50 m for trees with DBH> 5 cm) were established. In each area a soil sample was collected at different depths (0-10 cm). Thus, we analyzed ecological and environmental drivers and patterns of taxonomic and functional diversity (alpha and beta), and the effects of stand age and soil quality (fertility and texture) on the storage of above-ground biomass through functional diversity and functional dominance during the secondary succession. We use different statistical methods and types of models to test these ecological relationships. In this study, we show how the intensity of land use induces a loss of forest resilience. On the contrary, it is evident that with intermediate disturbances after a single cycle of agriculture a rapid recovery of diversity occurs, reaching 70% of the richness of one mature forest after 20 years. However, the recovery of the species composition in the same period reached an average of 25% in relation to the mature forest. Our study shows that beta diversity accounts for up to 70% of the variation in total species richness among sites, probably because deforested patches are embedded within a mature forest matrix. This ecological context also justifies the high taxonomic turnover during the succession. Thus, the functional diversity was lower than the taxonomic beta diversity, probably due to a lower functional turnover in comparison to the taxonomic turnover. Our results provide important evidence on the relation between biodiversity and ecosystem function (BEF) during the secondary succession of a tropical forest. Thus, the structural equation models (SEM) tested on functional dominance and functional diversity allowed to explain variations in the above-ground biomass individually. The succession time was the best predictor to explain above- ground biomass variations in all SEM models, followed by soil texture that had significant positive effects on above-ground biomass compared to soil fertility that had negative effects and not significant. Our study contributes to the understanding of the BEF relationship throughout the secondary succession, and may help predict how tropical forests will respond to future scenarios of climate change. For this reason, we have argued that in order to increase the efficiency in the implementation of REDD+ strategies in Amazonian forests, it is necessary to simultaneously understand the relationship of patterns and processes of forest ecosystems with the socio-ecological system, through the analysis of biophysical and anthropogenic predictors, from a local level to a regional scale. / Tese não possui título em português.
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Estudo da interação do intercalante doxorrubicina em condensados de DNA via espectroscopia de força / tudy of the interaction of doxorrubicin intercalant in condensed DNA via spectroscope of force

Lima, Carlos Henrique Moreira 05 April 2018 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-07-09T18:20:53Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 4630685 bytes, checksum: a420e25091cd9c312ab493f5e2bf056f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-09T18:20:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 4630685 bytes, checksum: a420e25091cd9c312ab493f5e2bf056f (MD5) Previous issue date: 2018-04-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Iniciamos este trabalho estudando o pinçamento óptico que foi a técnica experimental fundamental para realização desse projeto. A pinça Optica Trata-se de uma técnica de micromanipulação bastante utilizada para estudar partículas e sistemas biológicos com tamanho na escala de micrômetro. Através da técnica caracterizamos via espec- troscopia de força as interações do DNA e albumina do soro bovino (BSA) mostramos o processo de compactação do DNA por interação de depleção, em seguida estudamos interações DNA-ligantes que constitui um campo interdisciplinar de conhecimento, com importância fundamental tanto no entendimento de vários processos intracelulares ba- sicos (divisão celular, transcrição, tradução) bem como na aplicação em tratamento de doenças humanas (quimioterapias, terapias gênicas). Neste sentido, farmacos intercalantes desempenham papel central devido a sua larga aplicação em diversos tipos de quimioterapias. Os intercalantes modificam a estrutura mecânica da dupla hélice da molécula de DNA ao interagirem com o mesmo, de forma que as características físico- químicas da interação podem ser estudadas via ensaios mecânicos, como por exemplo em experimentos de estiramento de moléculas únicas de DNA realizados por pinças óticas ou magnéticas. Entretanto, quase totalidade dos trabalhos disponíveis na literatura a respeito das interações de intercalantes com o DNA foram realizados com este último disperso em solução, numa conformação muito diferente da encontrada no interior das células, onde o DNA está fortemente compactado formando a cromatina. Na segunda parte do trabalho estudamos a influência da histona linker H1 para dinâmica da cromatina e sua importância para regulação da cromatina ao interagir com fármaco doxorrubicina. / The study of optical tweezers technique initiates this thesis work on account of being underlying to this project accomplishment. The optical tweezer is a technique of micro- manipulation very useful to work with biological systems and particles in the microme- ter size scale. By using this technique we characterized per force spectroscopy the DNA and bovine sorum albumin (BSA) interactions, featuring the process of DNA compac- tation by depletion interaction, then the DNA-binders interactions were studied, this last concerns an interdisciplinary field of knowledge being fundamental to understand a lot of basic intracellular processes (cell division, transcription, translation) as well as the treatment of human diseases (chemotherapies, gene therapies). In this sense, DNA intercalator drugs play the main role owing to its large application in many kinds of chemotherapies, this drugs modify the mechanical structure of the double helix in the DNA molecule during the interaction, so the physicochemical features of this interac- tions can be studied by mechanical essays as in the single molecule DNA stretching realized by optical or magnetic tweezers. However, almost every available work in the literature about the interactions between DNA and intercalators were done with the suspended molecule wich differs a lot from the intracellular medium, were there are found tightly compacted forming the chromatin. In the second part of this work the H1 histone linker influence for the chromatin dynamics were studied and its importance to regulate the chromatin during the interaction with the doxorrubicin were discussed.
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LÓGICA FUZZY NA DETERMINAÇÃO DE FRAGMENTOS FLORESTAIS PARA COLETA DE SEMENTES

PELUZIO, T. M. O. 17 February 2017 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-01T22:56:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10575_TESE - TELMA MACHADO DE O PELUZIO20170427-100034.pdf: 4653580 bytes, checksum: b48472a2c74f493bb4224d6392b8df73 (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / A floresta tropical brasileira encontra-se fragmentada em decorrência da grande exploração no processo de colonização do país. Para manutenção e proteção dos diferentes ecossistemas foram adotados uma série de instrumentos legais, que quando associados ao ferramental tecnológico e matemático, em especial a lógica Fuzzy, possibilita a adoção de critérios mais próximos do pensamento humano. No presente trabalho, objetivou-se selecionar fragmentos florestais potenciais com maior grau de conservação para a coleta de sementes que atendam as exigências legais, por meio da utilização e associação da ecologia da paisagem à lógica Fuzzy. O estudo foi realizado na bacia hidrográfica do rio Itapemirim no estado do Espírito Santo, por meio das seguintes etapas: obtenção da imagem de satélite Landsat 8; fotointerpretação e classificação dos fragmentos florestais por classe de tamanho em que: A menor que 5 ha, B entre 5,1 e 50 ha, C entre 50,1 e 300 ha, e D maior que 300 ha; avaliação da dinâmica dos índices de métricas da paisagem de área, densidade e tamanho, forma, borda, área central e proximidade; aplicação da lógica Fuzzy e as suas respectivas funções de pertinência Small e Large, e a função de sobreposição Gamma; seleção de fragmentos florestais potenciais com maior grau de conservação das sementes para coleta e; avaliação da estrutura, riqueza florística, diversidade de Shannon Wiener, equabilidade de Pielou, dissimilaridade de Bray-Curtis, qualidade e sanidade do fuste conforme norma da Sociedade Florestal Brasileira e o índice de Payandeh para avaliar o padrão de distribuição espacial entre fragmentos florestais classificados como alto e baixo potencial para coleta de sementes. Foram determinados 7.515 fragmentos florestais, ocupando 19,21% da área de estudo. A classe de tamanho A possui menor área territorial, maior número de fragmentos e risco de extinção devido ao aumento da borda. A classe D possui menor número de fragmentos, maior área e melhor condição para a coleta de sementes, mesmo com o aumento da borda. Foram selecionados dois fragmentos classificados, respectivamente, como de alto (Fragmento 1) e baixo (Fragmento 2) potencial para coleta de sementes florestais. No fragmento 1 foram amostrados 1.670 indivíduos, correspondendo a 172 espécies, 103 gêneros e 40 famílias botânicas. No fragmento 2 amostraram-se 1.526 indivíduos, 135 espécies, 92 gêneros e 40 famílias botânicas. O fragmento 1 apresentou menor valor para os índices de diversidade de Shannon-Wiener, Pielou e Jackknife; maior área basal e número de indivíduos por hectare, melhor qualidade e sanidade do fuste entre os indivíduos arbóreos e melhor distribuição espacial que o fragmento 2. A análise dos dados de campo permite confirmar que a lógica Fuzzy foi eficaz na determinação de fragmentos potenciais para coleta de sementes florestais com maior grau de conservação, baseada na determinação da riqueza dos fragmentos. O fragmento 1 possui maior riqueza, maior área basal, menor diversidade, melhor qualidade e sanidade do fuste, e melhor distribuição espacial que o fragmento 2. A metodologia pode ser adaptada para outras zonas e diferentes biomas do planeta. Palavra-chave: Áreas degradadas, Conservação da natureza, Geotecnologia ambiental, Floresta Atlântica, Sistemas de Informações Geográficas.
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Medidas mitigadoras de ocorrência de movimentos de massa e plano de revegetação de uma encosta no município de São Sebastião/SP / Mitigating measures of occurence of mass movements and plan of vegetation renewal of a hillside in the municipality of São Sebastião/SP

Marco Antonio Alves Garcia 11 March 2005 (has links)
Este estudo foi realizado em uma clareira, um fragmento de Mata Atlântica de 4,8 hectares localizado no município de São Sebastião - SP, de propriedade da Universidade São Marcos, com o objetivo de fornecer subsídios sobre as atividades de sua recomposição vegetal, de modo que possa prevenir e/ou reduzir os riscos de escorregamentos na encosta. As metodologias disponíveis e mais adequadas para diagnóstico de áreas frágeis e com risco de escorregamento foram expressas em cartas geotécnicas. Outro aspecto metodológico que mereceu destaque refere-se à análise dos elementos (fisiográficos e antrópicos) que compõem o terreno analisado. Para a etapa de compartimentação do terreno existem duas abordagens básicas: a paramétrica e a fisiográfica. Na primeira foram feitas associações de temas representados em mapas específicos (por exemplo, mapas de relevo, geológico, geomorfológico). A abordagem fisiográfica foi avaliada quanto a suscetibilidade à ocorrência de movimentos de massa. A modelagem para o reflorestamento é o plantio heterogêneo, que consiste na prática de se plantar o conjunto de diferentes espécies numa mesma área, recriando condições, mais próximos possível da mata atual. Assim, foi realizado um levantamento fitossociológico no fragmento de entorno da clareira à fim de subsidiar a seleção de espécies para a recomposição vegetal. A seleção de espécies (50% de crescimento rápido) foi feita visando a interrupção do processo de erosão e, conseqüentemente, como medida de prevenção ao escorregamento da encosta. Com a proposta aqui realizada pretende-se ainda que, o modelo resulte como potencial de extrapolação para outras áreas de floresta ombrófila densa de encosta. / This study was carried out in an opening, a 4.8 hectares fragment of Mata Atlântica located in the municipality of São Sebastião-SP and owned by the University São Marcos, with the goal of providing subsidies about the vegetation renewal activities in such a way that the risk of hillside sliding can be avoided. The available and most appropriate methodologies for the diagnosis of fragile areas with a sliding risk were explained in the geotechnical charters. Another note-worthy methodological aspect is the analysis of the elements (physiographical and anthropic) which are part of the analyzed terrain. There are two basic approaches for the compartmentalization phase of the terrain: the parametric and the physiographic. In the first, the correspondence of topics represented in specific maps (for example, relief, geological and geomorphological maps) was made. The physiographic approach was evaluated for its susceptibility to the occurrence of mass movements. The modeling for the reforestation is heterogeneous planting, which consists in planting a set of different species in the same area, recreating conditions most like the current vegetation. Thus, a phytosociological survey was carried out in the fragment surrounding the opening in order to give subsidies for the selection of species for plant renewal. The species were selected (50% rapid growing species) with the goal of interrupting the erosion process and, as a result, as preventive measure against hillside sliding. The intention is this proposal can be has potential to be extrapolated to other dense ombrophylous forests in cliffs.
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Avaliação do comportamento geoquímico do chumbo em uma área urbana - Taboão da Serra - análise crítica das ações empresariais em questões de contaminação ambiental. Estudo de Caso / Evaluation of the geochemical behavior of lead in an urban area -Taboao da Serra - Critical analysis of corporate actions on issues of environmental contamination. Case Study

Thiago Henrique Dantas Pereira 27 March 2014 (has links)
A área de estudo situada no município de Taboão da Serra, Região Metropolitana de São Paulo, possui histórico de ocorrências anômalas de chumbo na água subterrânea, frequentemente reportando concentrações acima dos valores orientadores da CETESB. Verifica-se que em muitos casos de contaminação ambiental por metais de forma geral, e principalmente o chumbo, os procedimentos realizados não são suficientes para que seja feita uma análise mais apurada da contaminação das águas subterrâneas, fazendo com que, em muitos casos a fonte da contaminação seja atribuída, erroneamente, ao material geológico. A presente dissertação teve como objetivo analisar a metodologia de investigação empregada pela empresa bem como avaliar o comportamento do chumbo na água subterrânea local quanto aos fatores geológicos e físico -químicos que produziram a sua ocorrência e presença na forma solúvel em meio aquoso. Dessa forma, para atender os objetivos acima, foram realizados estudos de caracterização hidrogeológica e hidroquímica. Os métodos hidrogeológicos foram realizados de forma a se obter dados básicos como, carga hidráulica, potenciometria, direção e velocidade da água no aquífero local. Os métodos hidroquímicos seguiram com a coleta de dados em campo como sondagem para coleta de solo, amostragem de águas subterrâneas, medidas de parâmetros físico-químicos e análises laboratoriais. Com relação aos dados dos parâmetros físico-químicos, o pH verificado para a área apresentou valores entre 5,43 a 9,7. A análise das concentrações históricas do íon chumbo no meio aquoso em relação ao diagrama de especiação, sugere que as formas mais estáveis do chumbo na faixa de pH encontrada corresponde, em porcentagem, as espécies: \'Pb POT.2+\' (20%) e \'Pb(OH) POT.+\' (20%). O restante, 60% pode ser identificado no diagrama Pb-S-C-O-H. Como a variação do pH nas campanhas de amostragem ficaram entre 6 e 9, e as condições de Eh positivas, a principal forma estável nesse contexto é o \'PbCO IND. 3\' . Entretanto, por conta do baixo carbono orgânico total COT em torno de 1%, o chumbo tende a se manter na matriz do solo ligado a fração argilosa em minerais como a caulinita, muscovita ou oxi-hidróxidos de ferro e alumínio presentes no solo segundo os resultados obtidos por Difração de Raio X. Dessa forma verifica-se que a avaliação da contaminação por chumbo pode estar relacionada com sua interação química com outros compostos no sistema aquífero. O que em termos das ações empresariais em caso ambiental sugere um levantamento mais amplo da investigação analisando a matri z do solo e as condições de solubilidade de seus principais constituintes. / The study area is located in the county of Taboão da Serra, São Paulo Metropolitan Region, has a history of anomalous occurrences of lead in groundwater, often reporting concentrations above the guideline values by CTESB. It is noted that in many cases of environmental contamination by metals, and especially lead, the procedures are not sufficient for a more accurate analysis of groundwater contamination is made, so that in many instances the source contamination is wrong attributed to the geological material. This thesis aims to analyze the research methodology employed by the company as well as evaluating the behavior of lead in local groundwater as the geological and physical- chemical factors that produced its occurrence and presence in soluble form in aqueous. Thus to meet the above objectives method of hydrogeological and hydrochemical characterization were performed. Hydrogeological methods were performed in order to obtain basic data as hydraulic load, potentiometry, direction and speed of the water at aquifer. The hydrochemical methods followed by collecting field data as probing for collecting soil, groundwater sampling, measures of physical-chemical parameters and laboratory analyses. According the data of physico-chemical parameters, pH checked for the area showed values between 5.43 to 9.7. The analysis of historical concentrations of lead ion in the aqueous in relation to the speciation diagram suggests that the most stable forms of lead in the pH range found corresponds in percentage species: \'Pb POT.2+\' (20%) and \'Pb (OH) POT.+\' (20%). The remaining 60% can be identified in the diagram Pb-S-C-O-H. As the pH variation in the sampling campaigns were between 6 and 9, and the conditions of positive Eh, the main stable in this context is \'PbCO IND.3\' . However, due to the low total organic carbon TOC around 1 %, lead tends to remain in the soil matrix bound to clay fraction minerals such as kaolinite, muscovite or oxy-hydroxides of iron and aluminum in the soil according to the results obtained by X-ray Diffraction. Thus it appears that the evaluation of lead contamination may be related to its chemical interaction with other compounds in the aquifer. In according of corporate actions in environmental cases suggests a broader survey of research analyzing the soil matrix and conditions of solubility of its main constituents.
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Aspectos epidemiológicos de Histoplasma capsulatum em morcegos em áreas urbanas do estado de São Paulo / Epidemiologic Aspects of Histoplasma capsulatum in bats from urban areas of State of São Paulo

Maria Adelaide Galvão Dias 02 December 2009 (has links)
A histoplasmose, uma micose sistêmica, é um importante problema de saúde pública, de distribuição mundial e uma infecção muito comum em regiões endêmicas. A infecção é causada pelo fungo dimórfico Histoplasma capsulatum varo capsulatum, que cresce como fungo filamentoso em solo, guano de morcegos e aves, ou como uma levedura parasitária intracelular. A ocorrência de morcegos é relatada em quase todo o mundo e estes contribuem para manutenção deste fungo na natureza. Na cidade de São Paulo, Brasil, morcegos ocorrem em todas as regiões e em várias situações: usando sótãos e forro de telhado como abrigos ou adentrando residências, entre outras. Entre agosto de 2003 a dezembro de 2008, foram encaminhados ao Setor de Micologia do Centro de Controle de Zoonoses da cidade de São Paulo 2427 morcegos. Amostras de fígado e baço desses morcegos foram removidos em condições estéreis e inoculados, ambos, em Agar infusão de cérebro e coração (BHI) e em Agar Sabouraud Dextrose, incubados a 25°C e 37°C. As colônias suspeitas foram reincubadas em Agar Mycosel e identificadas pela morfologia e pela reversão em ML-gema (Mueller Hinton Broth com L-cisteína e gema de ovo) a 37°C. O objetivo deste estudo foi estabelecer a prevalência do H. capsulatum em morcegos presentes na cidade de São Paulo e em outras cidades do Estado. Os 87 isolados de H. capsulatum (3,58%) foram todos de morcegos da família Molossidae, de hábito alimentar insetívoro, pertencentes a quatro gêneros e cinco espécies sendo 74 Molossus molossus, 10 Nyctinomops macrotis, 1 Tadarida brasiliensis, 1 Molossus rufus e 1 Eumops glaucinus. Para 3 espécies (Molossus rufus, Nyctinomops macrotis e Eumops glaucinus) trata-se do primeiro relato. Dos 2427 morcegos, 1728 morcegos eram procedentes da cidade de São Paulo (71,2%) e 699 morcegos eram originários de cidades do Estado de São Paulo (28,8%). Cinco cidades apresentaram espécimes positivos: 70 procedentes da cidade de São Paulo (80,5%) e 17 de outros municípios do Estado (19,5%): 4 de Jundiaí, 10 de Guarulhos, 2 de Osasco e 1 de Mogi Mirim. Para a análise das 61 amostras de fezes de morcegos recebidas, foram utilizadas as técnicas de inoculação em camundongo e semeadura em placa de Petri contendo meio de Agar Mycosel incubadas a 37°C. Uma amostra positiva para H. capsulatum foi isolada do Agar Mycosel. Os resultados mostram que o H.capsulatum esta presente na população de morcegos presentes em áreas urbanas do Estado de São Paulo. Este fato é importante, porque morcegos contaminados podem ser fonte de disseminação e risco para pessoas ou animais adquirirem a infecção. O conhecimento da história natural da histoplasmose em áreas urbanas pode ter um importante papel no estabelecimento de estratégias de prevenção. / Systemic histoplamosis is an important health problem worldwide and a very common infection in endemic areas. Its causative agent, the thermodimorphic fungus Histoplasma capsulatum varo capsulatum, grows in bat guano or bird droppings rich soils as filamentous fungi, or as parasitic intracellular yeast cells in hosts. Bats can be found in almost ali the world and contribute to the maintenance of this fungus in nature. In many cities in Brazil, bats are found in urban areas and in many situations: house basements and/or roofs, fallen in the soil or even inside the houses, among others. Between August 2003 and December 2008, 2,427 bats, 1,728 from São Paulo City (71.2%) and 699 from other cities from São Paulo State, were sent to the Micology Section of Centro de Controle de Zoonoses of São Paulo City. The purpose of this work was to establish the prevalence of H.capsulatum in bats of São Paulo City and other cities from São Paulo State. Samples of spleen and liver from the animais were removed in sterile conditions and inoculated in Brain Heart Infusion Agar and in Sabouraud Dextrose Agar, incubated at 25°C and 37°C. The suspicious colonies were inoculated in Mycosel Agar and were identified by the morphology, as well as by the temperature¬reversion after incubation in ML-egg yolk (Mueller Hinton Broth, with L-cysteine and hen egg yolk) at 37°C. Ali 87 positive samples (3.58%) were isolated from insectivorous bats from Molossidae family, belonging to four genus and five species: 74 samples were from the specie Molossus molossus, 10 from Nyctinomops macrotis, 1 from Molossus rufus, 1 from Tadarida brasiliensis, and 1 from Eumops glaucinus. For three of these species (Nyctinomops macrotis, Molossus rufus and Eumops glaucinus) this is the first report of H. capsulatum isolation. Seventy positive bats were from São Paulo (80.5%), ten from Guarulhos City, four from Jundiaí City, two from Os asco City and one from Mogi Mirim City. Sixty-one samples of feces were analised by mouse inoculation test and inoculation in Petri dishes containing Mycosel Agar. Our results showed that the H. capsulatum is present in bat populations Iiving in urban areas. This is an important fact since H. capsulatum contaminated bats can be a source of contamination for people or animais in contact with them. The knowledge of the natural history of histoplasmosis in urban areas may be important for the establishment of prevention strategies.

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