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Avaliação da íris de prótese ocular obtida através de imagem digitalizada impressa em papel fotográfico / Iris evaluation of ocular prosthesis obtained through digitalized image printed in photographic paper

Ricardo Cesar dos Reis 11 April 2008 (has links)
A reprodução fiel da íris do olho remanescente na confecção da prótese ocular é fator fundamental no resultado estético e na dissimulação da perda para os pacientes afetados. Este trabalho apresenta uma nova técnica de confecção da íris protética, substituindo a pintura tradicional da mesma, pela imagem digitalizada da íris remanescente, obtida através de fotografia impressa em papel fotográfico. Decidiu-se avaliar a estabilidade das cores, comparando-se a técnica de pintura com a obtida através da fotografia digital, sob a ação de dois fatores: ação térmica do ciclo de polimerização da resina acrílica na confecção da prótese e a incidência da luz solar, principal agente de fotodegradação que compromete a longevidade das próteses oculares, através de teste de envelhecimento acelerado. Foram assim, confeccionados corpos de prova simulando a íris protética, divididos em dois grupos: pintura e fotografia, nas cores azul, amarelo, preto, marrom e verde. Foi realizada leitura colorimétrica inicial e após submetê-los às condições térmicas de polimerização. Posteriormente os corpos de prova foram testados durante três semanas através de ensaio de envelhecimento acelerado artificialmente com radiação ultravioleta A, com leituras colorimétricas semanais. A análise estatística sugere que, após a polimerização, as cores amarelo e marrom apresentaram diferenças significativas entre os grupos, sendo que, a cor amarelo na amostra pintura apresentou uma degradação um pouco acima do nível clinicamente aceitável. Após o ensaio de envelhecimento, não houve diferença significativa entre as amostras pintura e fotografia para as cores verde e amarelo, com alteração um pouco acima do nível clinicamente aceitável. Para as cores marrom e preto ocorreram diferenças significantes, com variações em níveis clinicamente aceitáveis; para a cor azul em níveis elevados, inviáveis clinicamente tanto na fotografia como na pintura. / The accurate iris reproduction in the making of ocular prosthesis for the remaining eye is a fundamental factor for the loss dissimulation aesthetic result in affected patients. This paper presents a new technique for the making of prosthetic iris that consists in substituting the traditional painting of the prosthesis for a digitalized image of the remaining iris, obtained through a picture printed in a photographic paper. It was decided to evaluate the stability of the colors by comparing the painting technique with the digital picture, for this two factors were considered: thermal conditions of the acrylic resin polymerization cycle in the prosthesis making and incidence of the sun light, which is the main photo degradation agent that affect the longevity of the ocular prosthesis, through the accelerated aging test. Then proof bodies simulating the prosthetic iris were made and divided into two groups: painted (in the colors blue, yellow, black, brown and green) and picture. An initial colorimetric scanning was made before and after submitting the bodies to the thermal conditions of the polymerization process. The proof bodies were then tested artificially for three weeks using the accelerated aging with A-ultraviolet radiation technique and proceeding to colorimetric scans weekly. Statistical analysis suggests that after the temperature action in the polymerization cycle, the yellow and brown color presented significative alteration between both groups and the yellow color in the painted presented degradation slightly above the acceptable clinical level. After the aging test, there was no significant difference between the samples in both groups for the green and yellow colors, however, for the brown and black colors significant differences were observed, with variations in clinically acceptable levels, and for blue color in high levels, clinically impracticable, in both groups.
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Reconhecimento de íris utilizando algoritmos genéticos e amostragem não uniforme / Iris Recognition using Genetic Algorithms and Non- Uniform Sampling,

Carneiro, Milena Bueno Pereira 06 December 2010 (has links)
The automatic recognition of individuals through the iris characteristics is an e±cient biometric technique that is widely studied and applied around the world. Many image processing stages are necessary to make possible the representation and the interpretation of the iris information. This work presents the state of the art in iris recognition systems where the most re- markable works and the di®erent techniques applied to perform each process- ing stage are quoted. The implementations of each processing stage using traditional techniques are presented and, afterwards, two innovator methods are proposed with the common objective of bringing bene¯t to the system. The ¯rst processing stage should be the localization of the iris region in an eye image. The ¯rst method proposed in this work presents an algorithm to achieve the iris localization through the utilization of the called Memetic Algorithms. The new method is compared to a classical method and the obtained results show advantages concerning e±ciency and processing time. In another processing stage there must be a pixels sampling from the iris region, from where the information used to di®erentiate the individuals is extracted. Traditionally, this sampling process is accomplished in an uni- form way along the whole iris region. It is proposed a pre-processing method which suggests a non uniform pixels sampling from the iris region with the objective of selecting the group of pixels which carry more information about the iris structure. The search for this group of pixels is done through Ge- netic Algorithms. The application of the new method improves the e±ciency of the system and also, allows the generation of smaller templates. In this work, a study on the called Active Shape Models is also accomplished and its application to perform the iris region segmentation is evaluated. To execute the simulations and the evaluation of the methods, it was used two public and free iris images database: UBIRIS database and MMU database. / O reconhecimento automático de pessoas utilizando-se características da íris é uma eficiente técnica biométrica que está sendo largamente estudada e aplicada em todo o mundo. Diversas etapas de processamento são necessárias para tornar possível a representação e a interpretação da informação contida na íris. Neste trabalho é apresentado o estado da arte de sistemas de reconhecimento de íris onde são citados os trabalhos de maior destaque e as diferentes técnicas empregadas em cada etapa de processamento. São apresentadas implementações de cada etapa de processamento utilizando técnicas tradicionais e, posteriormente, são propostos dois métodos inovadores que têm o objetivo comum de trazer benefícios ao sistema. A primeira etapa de processamento é a localização da região da íris na imagem. O primeiro método proposto neste trabalho apresenta um algoritmo para realizar a localização da íris utilizando os chamados Algoritmos Meméticos. O novo método é comparado a um método clássico e os resultadosnobtidos demonstram vantagens no que diz respeito à eficiência e ao tempo de processamento. Em uma outra etapa de processamento deve haver uma amostragem de pixels na região da íris, de onde são retiradas as informações utilizadas para diferenciar os indivíduos. Tradicionalmente, esta amostragem é realizada de maneira uniforme ao longo de toda a região da íris. É proposto um método de pré-processamento que sugere uma amostragem não uniforme de pixels na região da íris com o objetivo de selecionar o conjunto de pixels que carregam mais informações da estrutura da íris. A busca por esse conjunto de pixels é realizada utilizando-se Algoritmos Genéticos. A aplicação deste novo método aumenta a eficiência do sistema e ainda possibilita a geração de templates binários menores. Neste trabalho é realizado, ainda, um estudos dos chamados Active Shape Models e a sua aplicação para segmentar a região da íris é avaliada. Para a simulação e avaliação dos métodos, foram utilizados dois bancos de imagens de íris públicos e gratuitos: o banco de imagens UBIRIS e o banco de imagens MMU. / Doutor em Ciências
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Avaliação do efeito de microrganismos probióticos sobre o desempenho zootécnico, hematologia e tolerância ao estresse da truta arco-íris (Onchorhynchus mykiss) / Evaluation of the effect of probiotic microorganisms on growth performance, hematological and stress tolerance in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Daniel Emanoel Torres 25 August 2014 (has links)
Dentre as espécies exóticas de peixes produzidas no Brasil, a truta arco-íris, Oncorhynchus mykiss, tem se destacado. Diante da expansão desse setor, intensifica-se a necessidade de estudos visando à diminuição dos problemas produtivos e sanitários apresentados na piscicultura, assim como a busca por tratamentos alternativos aos controversos antimicrobianos. Nesse contexto, o uso de probióticos, constituídos por microrganismos vivos, que quando consumidos adequadamente beneficiam a saúde do hospedeiro, demonstra ser uma abordagem promissora no aprimoramento na criação de trutas. Deste modo, o presente trabalho buscou contribuir para o desenvolvimento de uma tecnologia alternativa na criação de truta arco-íris, avaliando o efeito de preparações probióticas sobre o desempenho dos animais submetidos às condições convencionais de manejo ou de estresse crônico. O estresse consistiu em aumentar diariamente o adensamento dos tanques de 15k g/m3 para 45 kg/m3 por 90 minutos. O tratamento consistiu na avaliação de um pool de células composto por 4 cepas de Lactobacillus com propriedades probióticas, que foi incorporado à alimentação por meio de veículo oleoso, totalizando 4 x 108 UFC/g de ração. O delineamento experimental consistiu na utilização de 140 trutas com peso médio de 360,8 ± 22,67 g e comprimento de 30,2 ± 0,8 cm, mantidas em tanques de 1500L e distribuídas em 4 grupos, a saber: Grupo NR - ração controle; Grupo ER - estresse de manejo e ração controle; Grupo NP - ração contendo a preparação probiótica; Grupo EP - estresse e ração contendo a preparação probiótica. Foram coletados 8 indivíduos de cada grupo nos dias inicial, 30 e 60 para avaliação das variáveis hematológicas, bioquímicas e de desempenho zootécnico. A possibilidade de incorporação de cepas probióticas, não liofilizadas, na ração extrusada de peixes foi demonstrada. Os resultados mostraram que a suplementação da dieta de truta com probiótico aumentou significativamente (P<0,05) a contagem de eritrócitos e monócitos. Não foram observadas alterações estatisticamente discerníveis nos parâmetros bioquímicos e no desempenho, bem como não ficou comprovado que o tratamento avaliado mitigou as respostas de estresse. / Among the exotic species of fish produced in Brazil, the rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, has excelled. Given the expansion of this sector, intensifies the need for studies to decrease production and health problems presented in aquaculture, as well as the search for alternatives to controversial antimicrobial treatments. In this context, the use of probiotics and consist of live microorganisms, that when properly consumed benefit the health of the host, proves to be a promising approach to the improvement in the creation of trout. Thus, the present study sought to contribute to the development of an alternative technology in creating rainbow trout, evaluating the effect of probiotic preparations on the performance of the animals subjected to conventional management conditions or chronic stress. The stress consisted of daily increasing densification of 15k g/m3 tanks to 45 kg/m3 for 90 minutes. The treatment consisted in evaluating a pool of cells composed of four Lactobacillus strains with probiotic properties, was incorporated by feeding oil vehicle, totaling 4 x 108 CFU/g of feed. The experiment consisted in using 140 trout with an average weight of 360.8 ± 22.67 g and length of 30.2 ± 0.8 cm, kept in tanks of 1500L and divided into 4 groups, namely: NR Group - feed control; CWT - stress management and diet control; NP Group - feed containing probiotic preparation; EP group - stress and diet containing the probiotic preparation. Were collected eight subjects in each group in the initial, 30 and 60 for assessment of hematological, biochemical and growth performance variables. The possibility of incorporating not freeze-dried probiotic strains in extruded fish feed was demonstrated. The results show that dietary supplementation with probiotic trout increased significantly (P <0.05) the erythrocyte count and monocytes. No statistically discernible changes in biochemical parameters and performance were observed, and it was not proven that evaluated treatment mitigated the stress response. Keywords:
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Avaliação do efeito de microrganismos probióticos sobre o desempenho zootécnico, hematologia e tolerância ao estresse da truta arco-íris (Onchorhynchus mykiss) / Evaluation of the effect of probiotic microorganisms on growth performance, hematological and stress tolerance in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Torres, Daniel Emanoel 25 August 2014 (has links)
Dentre as espécies exóticas de peixes produzidas no Brasil, a truta arco-íris, Oncorhynchus mykiss, tem se destacado. Diante da expansão desse setor, intensifica-se a necessidade de estudos visando à diminuição dos problemas produtivos e sanitários apresentados na piscicultura, assim como a busca por tratamentos alternativos aos controversos antimicrobianos. Nesse contexto, o uso de probióticos, constituídos por microrganismos vivos, que quando consumidos adequadamente beneficiam a saúde do hospedeiro, demonstra ser uma abordagem promissora no aprimoramento na criação de trutas. Deste modo, o presente trabalho buscou contribuir para o desenvolvimento de uma tecnologia alternativa na criação de truta arco-íris, avaliando o efeito de preparações probióticas sobre o desempenho dos animais submetidos às condições convencionais de manejo ou de estresse crônico. O estresse consistiu em aumentar diariamente o adensamento dos tanques de 15k g/m3 para 45 kg/m3 por 90 minutos. O tratamento consistiu na avaliação de um pool de células composto por 4 cepas de Lactobacillus com propriedades probióticas, que foi incorporado à alimentação por meio de veículo oleoso, totalizando 4 x 108 UFC/g de ração. O delineamento experimental consistiu na utilização de 140 trutas com peso médio de 360,8 ± 22,67 g e comprimento de 30,2 ± 0,8 cm, mantidas em tanques de 1500L e distribuídas em 4 grupos, a saber: Grupo NR - ração controle; Grupo ER - estresse de manejo e ração controle; Grupo NP - ração contendo a preparação probiótica; Grupo EP - estresse e ração contendo a preparação probiótica. Foram coletados 8 indivíduos de cada grupo nos dias inicial, 30 e 60 para avaliação das variáveis hematológicas, bioquímicas e de desempenho zootécnico. A possibilidade de incorporação de cepas probióticas, não liofilizadas, na ração extrusada de peixes foi demonstrada. Os resultados mostraram que a suplementação da dieta de truta com probiótico aumentou significativamente (P<0,05) a contagem de eritrócitos e monócitos. Não foram observadas alterações estatisticamente discerníveis nos parâmetros bioquímicos e no desempenho, bem como não ficou comprovado que o tratamento avaliado mitigou as respostas de estresse. / Among the exotic species of fish produced in Brazil, the rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, has excelled. Given the expansion of this sector, intensifies the need for studies to decrease production and health problems presented in aquaculture, as well as the search for alternatives to controversial antimicrobial treatments. In this context, the use of probiotics and consist of live microorganisms, that when properly consumed benefit the health of the host, proves to be a promising approach to the improvement in the creation of trout. Thus, the present study sought to contribute to the development of an alternative technology in creating rainbow trout, evaluating the effect of probiotic preparations on the performance of the animals subjected to conventional management conditions or chronic stress. The stress consisted of daily increasing densification of 15k g/m3 tanks to 45 kg/m3 for 90 minutes. The treatment consisted in evaluating a pool of cells composed of four Lactobacillus strains with probiotic properties, was incorporated by feeding oil vehicle, totaling 4 x 108 CFU/g of feed. The experiment consisted in using 140 trout with an average weight of 360.8 ± 22.67 g and length of 30.2 ± 0.8 cm, kept in tanks of 1500L and divided into 4 groups, namely: NR Group - feed control; CWT - stress management and diet control; NP Group - feed containing probiotic preparation; EP group - stress and diet containing the probiotic preparation. Were collected eight subjects in each group in the initial, 30 and 60 for assessment of hematological, biochemical and growth performance variables. The possibility of incorporating not freeze-dried probiotic strains in extruded fish feed was demonstrated. The results show that dietary supplementation with probiotic trout increased significantly (P <0.05) the erythrocyte count and monocytes. No statistically discernible changes in biochemical parameters and performance were observed, and it was not proven that evaluated treatment mitigated the stress response. Keywords:
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Reconhecimento biométrico de íris usando filtro de correlação

Klehm, Volnei da Silva 10 July 2013 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-23T13:37:24Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Volnei da Silva Klehm.pdf: 16125840 bytes, checksum: c35ee4884abb69923aca15bc534eb348 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-23T15:43:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Volnei da Silva Klehm.pdf: 16125840 bytes, checksum: c35ee4884abb69923aca15bc534eb348 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-23T15:41:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Volnei da Silva Klehm.pdf: 16125840 bytes, checksum: c35ee4884abb69923aca15bc534eb348 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-23T15:46:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Volnei da Silva Klehm.pdf: 16125840 bytes, checksum: c35ee4884abb69923aca15bc534eb348 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-23T15:46:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Volnei da Silva Klehm.pdf: 16125840 bytes, checksum: c35ee4884abb69923aca15bc534eb348 (MD5) Previous issue date: 2013-07-10 / Não informada / Naturally, patterns that we wish to recognize occurs in several manners. As example, considering the ordinary human iris, it is often to this pattern to manifest different aspects. When acquired one iris can present, in relation to the original pattern, rotation, translation, lighting distortions or mixed noise. Thus, in some cases, it is necessary to the recognition method to have versatility enough to identify such unexpected forms of pattern occurrences that we wish to recognize. In our particular case, filters for correlation with broader flexibility than the standard SDF and MACE filters, for example, are necessary. A consolidated way to express the variation of a data set can be obtained using the method of Principal Component Analysis (PCA) [1, 2]. The PCA optimally represents a dataset and this fact makes it interesting for combination among ordinary correlation filter design and one possible approach consists of the modification of the design of correlation filters to use principal components as their own detection target. In this dissertation, it is proposed to modify the design of correlation filters SDF and MACE to use Principal Component Analysis to represent the set of occurrences of the pattern of interest. One benefit of this approach resides in the fact that PCA incorporate the changes in the set data providing as a result, more flexible filters. Thus, filters designed in this way would succeed in detecting patterns with small distortions translations and rotations. To validate the proposed method, a recognition system that uses the default human iris was designed and, for this purpose, one consolidate database is used. / Naturalmente, os padrões os quais desejamos reconhecer, ocorrem nas mais diversas formas. Por exemplo, supondo como padrão a íris humana, é natural que este padrão seja adquirido de algumas maneiras possíveis. Quando adquirida a íris pode estar, em relação ao padrão original, com rotação, translação, com efeitos de iluminação ou misturadas a ruídos. Dessa forma, em alguns casos, é necessário que o método de reconhecimento tenha versatilidade suficiente para identificar tais formas não esperadas da ocorrência do padrão os quais desejamos reconhecer. Em nosso caso particular, por exemplo, precisamos de filtros de correlação com flexibilidade mais ampla que os filtros SDF e MACE. Uma forma consolidada de expressar a variação de um conjunto de dados pode ser obtida utilizando-se o método por Análise de Componentes Principais (PCA) [1, 2]. A PCA representa de forma ótima um conjunto de dados e esse fato a torna interessante para combinação com o projeto de filtros e uma possível abordagem consiste em sua modificação para que as próprias componentes principais sejam usadas como padrões alvo. Nesta dissertação, é proposta a modificação do projeto de filtros de correlação SDF e MACE de modo a se utilizar a Análise de Componentes Principais para representar o conjunto das ocorrências do padrão de interesse. Um dos benefícios desta abordagem, reside no fato da PCA incorporar as variações presentes no conjunto de dados proporcionando, como resultado, filtros mais flexíveis. Assim, filtros projetados desta forma teriam sucesso na detecção de padrões com pequenas distorções, translações e rotações. Para validar o método proposto, projetamos um sistema de reconhecimento que utiliza como padrão a íris humana e, para tal, uma base de dados consolidada é utilizada.
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Detecção e rastreamento de íris para implementação de uma interface homem-computador

Fernandes Junior, Valmir 10 August 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2016-03-15T19:37:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valmir Fernandes Junior.pdf: 2218220 bytes, checksum: f12b7829c2024510149ca8f24aa66e26 (MD5) Previous issue date: 2010-08-10 / This paper presents a technique to iris detection and tracking that can be used in a human computer interface which allows people with mobility restricted, including no mobility above the shoulders, can control the mouse pointer only moving their eyes, without using expensive equipments. The unique data input used is an ordinary webcam without optical zoon, special lights or restricting user face mobility. The mouse displacement will occur in a straight way, in other words, the mouse cursor will be positioned at the place estimated by the technique. To the iris detection tests 60 images were used. 90.83% of the iris were identified correctly, there were 4.17% of missing iris and 5% false positives (iris were estimated in a wrong place). Using images generated straight from the webcam the iris were found correctly in 87,5%, no iris were found in 11,11% and in 1,39% the technique found iris in wrong places, the average time between positioning and a click is about 20 seconds. / Este trabalho apresenta uma técnica de detecção e rastreamento de íris para ser utilizada em uma interface homem-computador que permita pessoas com mobilidade restrita, inclusive sem mobilidade nos ombros, possam controlar o cursor do mouse com o movimento dos olhos, sem a necessidade de adquirir equipamentos caros. A única entrada de dados utilizada é uma webcam simples sem auxílio de zoon ótico, iluminação especial ou fixação da face do usuário. A movimentação do mouse dar-se-á de maneira direta, ou seja, o ponteiro do mouse será direcionado para a região estimada pela técnica. Para a realização dos testes de detecção de íris foram utilizadas 60 imagens. Em 90.83% dos casos as íris foram encontradas corretamente, 4.17% dos casos não foram identificados e ocorreram 5% de falsos positivos (casos em que as íris foram estimadas no lugar errado). Com as imagens geradas diretamente pela webcam a identificação das íris ocorreu com sucesso em 87,50% dos casos, erros em 11,11 % e 1,39% de falsos positivos, o tempo médio entre o posicionamento e um clique é de cerca de 20 segundos.
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Método de reconhecimento pessoal através da íris usando funções geoestatísticas / Method of personal recognition through iris texture using geostatistics functions

SOUSA JUNIOR, Osvaldo Silva de 04 December 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-17T14:53:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Osvaldo Junior.pdf: 1458966 bytes, checksum: a19ea3d3a77d6e058740e17388f1c8fa (MD5) Previous issue date: 2006-12-04 / Biometrics identification methods are gaining applications each day and this has motivated a lot of research in this area. This work presents a proposal for a method to identify people through iris texture analysis using geostatistics functions and their combination. To achieve this work objective, it is considered the following phases: automatic localization of the iris, features extraction and classification. In the localization phase, it is used a combination of three techniques: Watershed, Hough Transform and Active Contours. Each technique has an essential function to achieve a good performance. Within the extraction phase, there were used four geostatistics functions (semivariogram, semimadogram, covariogram and correlogram) and a combination of them to extract this features with a good precision. Finally in the phase of classification it is used a Euclidean Distance to determine the similarity degree between the extracted features. The tests were realised for the phases of localization and classification using an iris database called CASIA that has 756 images. The results achieved by the localization method are about 90%. For the classification method, considering the tests realized with the authentication mode, the obtained results has reached a success rate of 97.02% for a false acceptance rate equal to zero and 97.22% for a false acceptance rate equal to a false rejection rate. The tests realized with the identification mode have reached a rate of success of 98.14%. / Os métodos de identificação biométrica estão ganhando espaço em aplicações do dia-a-dia o que vem motivando a pesquisa nessa área. Este trabalho apresenta uma proposta de um método para identificação de pessoas através da análise da textura da íris usando funções geoestatísticas e uma combinação das mesmas. Para realização do trabalho foram consideradas as seguintes fases: localização automática da íris, extração de características e classificação. Na fase de localização foi usada a combinação de três técnicas Watershed, Transformada de Hough e Contornos Ativos, onde cada uma possui uma função essencial para um bom desempenho do processo. Na fase de extração são usadas quatro funções geoestatísticas (semivariograma, semimadograma, covariograma e correlograma) e uma combinação das mesmas para extrair características que discriminem a íris com uma boa precisão. Finalmente, na fase de classificação é usada a distancia Euclidiana para determinar o grau de similaridade entre as características extraídas. Os testes foram realizados, para as fases de localização e classificação, com um banco de dados de íris, denominado CASIA que possui 756 imagens. Na fase de localização o resultado alcançado foi de 90%. Para a fase de classificação, considerando os testes realizados no modo de autenticação, os resultados obtidos chegaram a uma taxa de sucesso de 97.02% para uma falsa aceitação igual a zero e de 97.22% para uma falsa aceitação igual a uma falsa rejeição. Para os testes realizados no modo de identificação a taxa de sucesso chegou a 98.14%.
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Variantes nos genes OCA2 e HERC2 associadas a fenótipos clássicos de pigmentação e estruturas secundárias presentes na íris em amostra miscigenada da população brasileira / Variants within OCA2 and HERC2 genes associated with classical pigmentation phenotypes and iris features in Brazilian admixed population sample

Debortoli, Guilherme 20 June 2018 (has links)
A pigmentação dos olhos, cabelos e pele, bem como presença ou ausência de sardas, está entre os exemplos mais visíveis da variação fenotípica humana. O estudo da diversidade genética em genes de pigmentação tem beneficiado diferentes áreas do conhecimento, como a área da genética e antropologia forense, bem como a área relacionada a saúde e bemestar. Adicionalmente, a presença de estruturas secundárias na íris tem sido reportada como importante fator na percepção de cor de olho observada que um indivíduo pode ter referente a íris e também a fatores de risco para algumas doenças oculares, ainda que as bases genéticas envolvidas nestas características sejam pouco conhecidas. Os genes OCA2 e HERC2 representam dois genes associados à variação normal da pigmentação. Este trabalho avaliou a relação de polimorfismos nas regiões regulatórias e codificantes destes dois genes com os fenótipos de pigmentação e estruturas secundárias presentes na íris encontrados em uma amostra populacional de 340 indivíduos do estado de São Paulo, por meio de sequenciamento de nova geração. Análises de regressão logística e linear para as variáveis qualitativas e quantitativas da cor dos olhos e estruturas secundárias presentes na íris foram realizadas. 170 pontos de variação ao longo das regiões estudadas foram identificados, dos quais 18 estão associadas a pelo menos um fenótipo de pigmentação e estruturas secundárias presentes na íris. Destaca-se a existência de muitos polimorfismos que não se mostrara-se associados quando avaliados independentemente, porém foram associados quando analisados sob a ótica de interações epistáticas, considerada uma possível explicação para a variabilidade encontrada nestes fenótipos, principalmente aqueles intermediários, como a cor dos olhos verdes e mel. O uso de variáveis quantitativas para os olhos revelou pela primeira vez a associação do polimorfismo não sinônimo rs201872292 no gene HERC2 com olhos claros, independente do efeito do polimorfismo rs12913832. Ainda, a associação do polimorfismo rs58358300 localizado em um íntron do gene HERC2 com pigmentação da esclera, o que representa a primeira vez que um polimorfismo é associado a esta característica. Este foi o primeiro estudo no Brasil que se propôs a analisar polimorfismos genéticos em genes candidatos à variação normal da pigmentação humana com estruturas secundárias presentes na íris. Os resultados confirmam a hipótese de que polimorfismos dos genes OCA2 e HERC2 podem contribuir para a formação dos fenótipos clássicos de pigmentação de olhos, pele, cabelos e estruturas secundárias presentes na íris humana dos indivíduos da população brasileira. / The pigmentation of the eyes, hair and skin, as well as the presence or absence of freckles, are amongst the most visible examples of human phenotypic variation. The study of genetic diversity in pigmentation genes has contributed greatly to the fields of forensics genetics, anthropological genetics and public health. In addition, the presence of iris features has been reported to influence the perception of overall iris color and also consists in risk factors for ocular diseases, although very little is known about the genetic basis of these traits. The OCA2 and HERC2 genes have been associated with normal variation of pigmentation in diverse populations. The present study evaluated the relationship of polymorphisms in the regulatory and coding regions of these two genes with the pigmentation phenotypes and iris features found in a population sample of 340 individuals from the state of São Paulo, Brazil, through next-generation sequencing. Logistic and linear regression analyzes for the qualitative and quantitative variables were performed. A total of 170 points of variation throughout the studied regions were identified, of which 18 were associated with at least one pigmentation phenotype when analyzed as qualitative and/or quantitative variables and iris features. It is worth mentioning that many associations that were not observed when evaluated independently, were indeed associated when analyzed from the perspective of epistatic effects, which is considered a possible explanation for the variability found in these phenotypes, especially those presented as intermediate, such as green and hazel eye colors. The use of quantitative variables to evaluate the eye color, acquired from photographs, revealed for the first time the association of the nonsynonymous mutation rs201872292 in the HERC2 gene with light eyes, independently of the effect of the rs12913832 polymorphism. We highlight the association of the polymorphism rs58358300 located in an intron of the HERC2 gene with sclera pigmentation, which was the first time that a polymorphism is associated with this feature. This was the first study in Brazil to analyze genetic polymorphisms in candidate genes related to normal variation of human pigmentation and iris features by next-generation sequencing. The results confirm the hypothesis that OCA2 and HERC2 genes may contribute to classic pigmentation phenotypes of eyes, skin, hair, freckles and iris features in the Brazilian population.
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Estudo comparativo da transformada wavelet no reconhecimento de padrões da íris humana / A comparative study of wavelet transform in human iris pattern recognition

Castelano, Célio Ricardo 21 September 2006 (has links)
Neste trabalho é apresentado um método para reconhecimento de seres humanos através da textura da íris. A imagem do olho é processada através da análise do gradiente, com uma técnica de dispersão aleatória de sementes. Um vetor de características é extraído para cada íris, baseado na análise dos componentes wavelet em diversos níveis de decomposição. Para se mensurar as distâncias entre esses vetores foi utilizado o cálculo da distância Euclidiana, gerando-se curvas recall x precision para se medir a eficiência do método desenvolvido. Os resultados obtidos com algumas famílias wavelets demonstraram que o método proposto é capaz de realizar o reconhecimento humano através da íris com uma precisão eficiente. / This work presents a method for recognition of human beings by iris texture. The image of the eye is processed through gradient analysis, based on a random dispersion of seeds. So, it is extracted a feature vector for each iris based on wavelet transform in some levels of decomposition. To estimate the distances between these vectors it was used the Euclidean distance, and recall x precision curves are generated to measure the efficiency of the developed method. The results gotten with some wavelets families had demonstrated that the proposed methodology is capable to do human recognition through the iris with an efficient precision.
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Expressão da enzima Indoleamina-2,3-dioxigenase em trutas Arco-Íris (Oncorhynchus mykiss) / Expression of the enzyme indoleamine-2,3-dioxygenase in Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss)

Cardoso, Fernanda 03 October 2014 (has links)
A indoleamina 2,3-dioxigenase (IDO) é uma enzima que cataboliza o aminoácido triptofano, levando à inibição da proliferação de linfócitos T, seja pela exaustão desse aminoácido no ambiente, ou pela indução via catabólitos induzindo-os a apoptose. Em mamíferos, esta enzima atua em diversas condições do organismo como a gestação, infecções, inflamações crônicas, transplantes e tumores, sendo reconhecida como uma autêntica reguladora imunológica. Estudos recentes identificaram a presença de moléculas homólogas a IDO em espécies filogeneticamente mais antigas que os mamíferos placentados, sendo que o papel da IDO primitiva não está totalmente elucidada. Sabe-se que em fungos e bactérias a IDO limita-se ao metabolismo do triptofano para obtenção de energia e que em vertebrados inferiores sua função ainda não é bem esclarecida. Desta forma, este estudo teve por objetivo averiguar a presença da IDO em células sanguíneas e órgãos hematopoiéticos de trutas arco-íris, colaborando para o estudo filogenético do sistema imune nos vertebrados, particularmente dos peixes. A expressão de IDO foi observada em todos os órgãos hematopoiéticos estudados incluindo os leucócitos e também foi observada marcação positiva para a enzima em pequenos vasos sanguíneos do rim cefálico, baço e fígado. Os resultados obtidos, apresentando marcações positivas da IDO restritas em leucócitos e tecidos hematopoiéticos de trutas arco-íris, poderiam significar a primeira evidência de que a IDO, à semelhança do que ocorre nos mamíferos, possa estar relacionada ao sistema imunológico nesta espécie. / The indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO) is an enzyme that catabolizes the amino acid tryptophan, leading to inhibition of T lymphocyte proliferation by exhaustion of this amino acid in the environment, or by induction via the catabolites inducing apoptosis. In mammals, this enzyme acts on various conditions such as pregnancy, infections, chronic inflammation, transplantation and tumors, being recognized as an authentic immune regulator. Recent studies have identified the presence of homologous IDO in older phylogenetically related species molecules, the placental mammals, and the role of early IDO is not fully elucidated, it is known that in fungi and bacteria the role of IDO is limited to tryptophan metabolism for energy, and is function in lower vertebrates is still not well understood. This study aims to investigate the presence of IDO in peripheral blood cells and hematopoietic organs of rainbow trout, thereby contributing to the phylogenetic study of the immune system in vertebrates, particularly in fish. The expression of IDO was observed in the inner region of small blood vessels in the head kidney, spleen, liver and peripheral blood cells, mainly in monocytes and lymphocytes. The restricted localized expression of IDO in these tissues and cells, as occurred in mammals, may suggest a first evidence for a putative role of this enzyme in the immune system in rainbow trout.

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