Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2015. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2016-04-04T18:11:36Z No. of bitstreams: 1 2015_AbdulrazakBabaIbrahim_Parcial.pdf: 138489 bytes, checksum: 26cc0275768c96350d0f878cb4affd71 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2016-04-05T12:09:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_AbdulrazakBabaIbrahim_Parcial.pdf: 138489 bytes, checksum: 26cc0275768c96350d0f878cb4affd71 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-05T12:09:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_AbdulrazakBabaIbrahim_Parcial.pdf: 138489 bytes, checksum: 26cc0275768c96350d0f878cb4affd71 (MD5) / RNA de interferência (RNAi) é um processo bioquímico potente e específico de silenciamento de genes, que ocorre em uma variedade de organismos como mamíferos, fungos e plantas. O mecanismo atua a nível pós-transcricional, e pode resultar na degradação ou não tradução de RNAs mensageiros (mRNA). Esse mecanismo foi utilizado com o objetivo de silenciar o gene v-ATPase da mosca branca (Bemisia tabaci), que é considerada uma importante peste da agricultura em regiões tropicais e sub-tropicais em todo o mundo. Nesse estudo, um plasmídeo contendo um cassete de interferência para um fragmento de v-ATPase foi desenvolvido e utilizado para transformar cotilédones de alface (Lactuca sativa). Um total de 25 linhagens transgênicas foram geradas, das quais sete foram avaliadas para estudos moleculares. Análise de progênie confirmou a preseça do inserto na geração T1 das sete linhagens assim como a análise de Northern, que permitiu a detecção de siRNAs correspondentes ao gene de v-ATPase. Um estudo de silenciamento da v-ATPase foi feito por meio de um bioensaio no qual plantas das diferentes linhagens foram submetidas à presença de 20 moscas brancas, e a taxa de mortalidade, bem como a alteração de desenvolvimento em diferentes estágios do ciclo de vida da mosca foram avaliados, durante um período de 32 dias. A análise da mortalidade de insetos que se alimentaram em plantas transgênicas demonstrou que, em três dias de alimentação, uma queda de aproximadamente 75% nessa população pôde ser observada quando comparado ao controle (p<0,05). Alterações significativas no ciclo de desenvolvimento de insetos se alimentando em plantas transgênicas também foram observadas (p<0,05). Dessa forma, dados apresentados nesse trabalho funcionam como prova de conceito no desenvolvimento de tolerância à mosca branca mediado por RNAi. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / RNA interference (RNAi) is a potent biochemical phenomenon that targets and silences specific genes in different life forms like mammals, fungi and plants. The process of silencing takes place at post-transcriptional level leading to the degradation of messenger RNAs (mRNAs) or inhibition of their translation. RNAi has been demonstrated to be useful in silencing v-ATPase gene of whitefly (Bemisia tabaci), an important agricultural pest in the tropics and sub-tropic regions of the world. Here, a plasmid containing an interferent cassette designed to generate siRNA molecules that target v-ATPase gene transcript was cloned in a binary vector, which was used to transform cut-pieces of cotyledons from germinating lettuce (Lactuca sativa). A total of 25 transgenic lines were generated, of which seven were selected for further molecular analysis. Progeny analysis confirmed that these lines have passed the inserted character to the next generation (T1). Northern blot analysis detected siRNAs corresponding to the v-ATPase insert. The lines were used to perform a bioassay in order to evaluate the silencing effect of v-ATPase. Plants from these lines were infested with 20 whiteflies and the mortality as well as alterations in growth and development of different stages of the whitefly life cycle was monitored over a period of 32 days. Analysis of mortality showed that within three days of feeding, insects on transgenic plants showed a mortality rate of about 75% higher than those on control plants (p<0.05). Significant alterations in the development of the insects on transgenic plants were also observed (p<0.05). Data presented in this work may function as a proof of concept in the development of plants with tolerance to whitefly via RNAi.

Orientador: Renate-Krause Sakate / Banca: Marcelo Agenor Pavan / Banca: Kelly Cristina Gonçalves Rocha / Banca: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Daiana Bampi / Resumo: A alface pode ser infectada por diferentes tipos de vírus. O Lettuce mosaic virus- LMV foi por muitos anos considerado um dos mais frequentes e amplamente distribuídos mundialmente, podendo ocorrer em infecções simples e/ou mistas com Lettuce mottle virus, LeMoV, um provável sequivirus. A falta de informações a respeito dos aspectos biológicos e moleculares relacionados à classificação taxonômica e à transmissão do LeMoV, motivou a testar sua transmissão com afídeos e por sementes, avançar no sequenciamento do genoma viral e avaliar a incidência do vírus em importantes áreas produtoras de alface no estado de São Paulo. Em 2014, dentre um total de 118 plantas sintomáticas analisadas, 63 (53%) foram positivas para a presença de tospovírus, 11 (9%) foram positivas para LMV e, apenas 6 amostras (5%) foram positivas para LeMoV. Em 2015, 40 plantas (80%) estavam infectadas com tospovírus, e o LMV e LeMoV não foram detectados, indicando que o LeMoV não está limitando a produção de alface, pelo menos não durante o ano de 2014 e 2015. A transmissão desse vírus por sementes não foi verificada nas 832 sementes provenientes de plantas de alface infectadas com LeMoV, o que indica que este vírus provavelmente não seja transmitido por semente. Myzus persicae e Aphis gossypii não foram capazes de transmitir o LeMoV de uma planta de alface para outra. Quase toda a sequencia completa do genoma do LeMoV foi obtida e a presença de domínios conservados verificados na região da capa proteica (CP),... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / eng / Doutor

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. / Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2017-01-30T13:32:48Z No. of bitstreams: 1 2016_CléiaSantosCabral.pdf: 2724884 bytes, checksum: 13ed53ddad55c8137a1e96b9bd0b4b3e (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-10T17:58:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_CléiaSantosCabral.pdf: 2724884 bytes, checksum: 13ed53ddad55c8137a1e96b9bd0b4b3e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T17:58:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_CléiaSantosCabral.pdf: 2724884 bytes, checksum: 13ed53ddad55c8137a1e96b9bd0b4b3e (MD5) / A alface (Lactuca sativa L.) é uma das hortaliças mais importantes no Brasil e no mundo. A murcha de fusário (causada por distintas raças do fungo Fusarium oxysporum f. sp. lactucae – FOLAC) é uma das principais doenças de da alface em regiões tropicais e subtropicais. Devido à dificuldade de implementação de estratégias eficazes de controle químico e cultural, o uso de cultivares com resistência genética é o método mais prático de manejo da doença. Fontes estáveis de resistência à raça FOLAC 1 foram encontradas, mas a base genética dessa característica ainda se encontra mal caracterizada. A integração da seleção assistida por marcadores (SAM) em programas de melhoramento convencional irá acelerar o desenvolvimento e lançamento de cultivares de alface com resistência genética a esse patógeno. O presente estudo teve como objetivos: elucidar os fatores genéticos associados à resistência a murcha de fusário (Capítulo 2) e idenficar marcadores moleculares potencialmente ligados aos fatores de resistência a isolados de FOLAC raça 1 identificados na cultivar ‘Vanda’ (Capítulo 3). O estudo da herança genética da resistência a FOLAC raça 1 foi conduzido com populações segregantes (F2 e F3) obtidas do cruzamento entre um parental suscetível ‘Gizele’ e ‘Vanda’. Populações foram inoculadas com uma suspensão de esporos do patógeno (3 x 106 microconídios/mL) por meio de corte e imersão de raízes e avaliadas quanto à resistência por meio de escala de notas. O DNA genômico das plantas resistentes e suscetíveis foi extraído e usado como molde em diferentes sistemas de marcadores (RAPD, SCAR, DR analogs, SRR e CAPS), visando identificar polimorfismos ligados a essa característica. Com relação à resistência a FOLAC raça 1, os estudos indicaram um controle genético relativamente simples na cultivar ‘Vanda’, com os resultados de segregação indicando um locus monogênico com uma provável combinação de efeitos de dosagem e penetrância incompleta. No entanto, os diferentes sistemas de marcadores moleculares utilizados nessa primeira etapa do trabalho não permitiram encontrar polimorfismos com estreita ligação com o(s) fator(es) de resistência. Desta forma, uma nova etapa do trabalho foi conduzida visando identificar por meio do método genotyping-by-sequencing (GBS) marcadores moleculares ligados a resistência (Capítulo 4). O GBS foi explorado na identificação de SNPs (single nucleotide polymorphisms) empregando DNA extraído dos dois parentais e de um conjunto de 82 indivíduos da população F2 derivados do cruzamento entre ‘Vanda’ x ‘Gizele’. Cada indivíduo foi genotipado utilizando o Illumina Hiseq 3000, que produziu 4,5 milhões de reads por amostra. Um total de 10.017 SNPs foi identificado entre os parentais. Estes SNPs foram avaliados para ligação com o fenótipo de resistência nos 82 indivíduos F2. Os dados genotípicos foram condensados em 1.484 scaffolds ou supercontigs. Um subconjunto de 417 scaffolds contendo polimorfismos foi selecionado para a construção de um mapa de ligação após filtragem baseada em missing data (< 20%), teste de qui-quadrado (3:1 p>0,05) e número de SNPs por scaffold. O mapa foi composto por 17 grupos de ligação, com um comprimento total de 1.132,984 cM. A análise de QTL (quantitative trait loci) para resistência a FOLAC raça 1 foi realizada no mapa de ligação com os conjuntos de dados de severidade da doença obtido nas populações F2 e F3. Dois QTLs de efeito maior foram identificados no cromossomo 9, explicando 30 a 40% da variação fenotípica observada na população F3 e F2, respectivamente. Um QTL de efeito menor foi detectado no cromossomo 4, explicando 0,06% da variação fenotípica na população F3. Desta forma, o presente estudo estabelece a porção mediana do cromossomo 9 como sendo a localização física do principal locus de resistência para FOLAC raça 1 presente na cultivar ‘Vanda’. Portanto, os marcadores moleculares localizados na proximidade desta região genômica são candidatos para o desenvolvimento de ferramentas de SAM em programas de melhoramento genético visando incorporar essa característica em linhagens elite de alface. / Lettuce (Lactuca sativa L.) is one of the most important leafy vegetable crops in Brazil and worldwide. Fusarium wilt (caused by distinct races of the fungus Fusarium oxysporum f. sp. lactucae – FOLAC) is one of the main soil-borne diseases of lettuce in tropical and subtropical regions. Due to the complexity of implementing effective cultural and chemical control, the most practical disease management strategy has been the use of cultivars with genetic resistance. Stable sources of resistance to FOLAC race 1 have been found, but the genetic basis of this trait is yet poorly characterized. The integration of marker assisted selection (MAS) in conventional breeding programs would be an important contribution to accelerate the development and release of lettuce cultivars with genetic resistance to this pathogen. In this context, the present study aimed to elucidate the inheritance of resistance to FOLAC race 1 detected in the cultivar Vanda (Chapter II) and to search for molecular markers linked to FOLAC race 1 resistance factor(s) (Chapter III). Inheritance studies were carried out using segregating populations (F2 and F3 families) derived from the cross between a susceptible cultivar (Gizele) and a FOLAC race 1 resistant cultivar (Vanda). The parental lines and the segregating populations were inoculated via root dipping technique with a conidial suspension adjusted to 3 x 106 microconidia/mL. Reaction to one FOLAC race 1 isolate was evaluated using a disease rating scale ranging from 1 (= no symptoms) to 5 (= dead plant). The studies indicated a simple genetic control of FOLAC race resistance in cultivar Vanda, with segregation results indicating a single gene locus with a likely combination of dosage effects and incomplete penetrance. Genomic DNA of resistant and susceptible plants was extracted and used as a template in PCR assays with different marker systems (RAPD, SCAR, DR Analogs, SSRs and CAPS) aiming to identify polymorphisms linked to the resistant reaction. However, none of the evaluated molecular techniques were able to identify markers in close linkage with the resistance factor(s). Therefore, a new phase of the present study was conducted with the objective of searching for markers linked to resistance through the employment of the genotyping-by-sequencing (GBS) strategy (Chapter IV). The GBS strategy was employed using DNA extracted from the parental lines and 82 phenotyped F2 individuals derived from the same cross between Gizele x Vanda. Each individual was genotyped using the Illumina Hiseq 3000. A total of 4.5 million reads was obtained per sample with 10,017 SNPs being identified among the parental lines as well as among the 82 F2 individuals. Genotypic data were condensed into 1484 scaffolds. Four hundred seventeen (417) scaffolds containing polymorphisms were selected for the construction of the linkage map after filtering based on missing data (< 20%), chi-square test (3: 1 p> 0.05) and number of SNPs per scaffold. The final map consisted of 17 linking groups with a total length of 1,132.984 cM. The QTL analysis for resistance to FOLAC race 1 was performed on the linkage map based upon the disease severity datasets of F2 population and F3 families. Two major effect QTLs were identified on chromosome 9, explaining 30 to 40% of the phenotypic variation observed in the population F3 and F2, respectively. One QTL of minor effect was also identified on chromosome 4, explaining 0.06% of the phenotypic variation in the F3 population. This study establishes the central region of chromosome 9 as the physical location of a major resistance locus to FOLAC race 1 found in Vanda. Molecular markers in close proximity to this genomic region are candidates for the development of MAS tools for breeding programs aiming to incorporate this trait into elite lettuce lines.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2009. / Submitted by Raquel Viana (tempestade_b@hotmail.com) on 2010-03-29T16:57:29Z No. of bitstreams: 1 2009_GlenioGomesNazareno.pdf: 3188511 bytes, checksum: 03ee5a4cfe8b6bab0d7544478f56e417 (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-04-06T21:06:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_GlenioGomesNazareno.pdf: 3188511 bytes, checksum: 03ee5a4cfe8b6bab0d7544478f56e417 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-04-06T21:06:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_GlenioGomesNazareno.pdf: 3188511 bytes, checksum: 03ee5a4cfe8b6bab0d7544478f56e417 (MD5) Previous issue date: 2009-04 / O trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da matéria orgânica no desenvolvimento de nematóides na cultura de alface cv. Verônica. Foram utilizados esterco bovino e cama de frango, dois insumos muito usados pelos olericultores na produção de hortaliças. O experimento foi conduzido na Estação Experimental de Biologia, Universidade de Brasília, em casa de vegetação e utilizando vasos, de julho a novembro de 2008. Foi utilizado o arranjo de parcelas subdividida 3x10 sendo duas raças de M. incognita (raças 1 e 3) e a espécie M. javanica usadas como parcela e os 10 tratamentos como subparcela: 1 – testemunha (sem adubação); 2 – adubação química na dosagem recomendada para a cultura; quatro doses de esterco bovino (3, 4, 5, 6) – com base em 3,0 kg/m2: 3 - 50%, 4 - 100%, 5 – 150% e 6 – 200%; quatro doses de cama de frango (7, 8, 9, 10)– com base em 1,2 kg/m2: 7 – 50%, 8 – 100%, 9 – 150% e 10 – 200%. A inoculação dos nematóides em alface, com aproximadamente 5.000 ovos e eventuais juvenis por planta, foi realizada 15 dias após do transplante. Avaliou-se a produção de massa fresca e seca da parte aérea da planta, a massa fresca da raiz, número de galhas, massa de ovos e ovos, além do fator de reprodução. O nematóide Meloidogyne javanica se mostrou menos afetado, em suas características biológicas, pelos adubos utilizados, sendo mais agressivo para a planta. Meloidogyne incognita raças 1 e 3, por outro lado, se mostraram mais suscetíveis e mais sensíveis ao esterco bovino, um indicativo de que esse esterco possa apresentar efeito supressivo sobre essa espécie. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / This research was carried out aiming to evaluate the effect of organic manure in the control of root-knot nematodes in lettuce cv. Verônica. Organic cattle and chicken manure were evaluated; they are both used for vegetable production in the region. The experiment was carried out at Estação Experimental de Biologia, University of Brasilia, from July to November 2008. The experiment was conducted under the design of subdivided parcels 3x10, represented by two races of M. incognita (races 1 and 3) and M. javanica as parcel, and the 10 treatments as subparcel: 1 – no fertilization; 2 – chemical; four doses of cattle manure (3, 4, 5, 6)– based on 3,0 kg/m2: 3 – 50%, 4 – 100%, 5 – 150% e 6 – 200%; and four doses of chicken manure (7, 8, 9, 10) – based on 1,2 kg/m2: 7 – 50%, 8 – 100%, 9 – 150% e 10 – 200%. The nematode inoculation was performed 15 days after transplanting with 5.000 nematode eggs per vessel. Fresh and dry matter weight for plant and fresh root weight, gals’ number, egg mass and eggs number in the root system and reproduction factor were evaluated. Meloidogyne javanica was less affected in its biological characteristics showing to be more aggressive to the plant compared to the others. Meloidogyne incognita r 1 and 3, on the other hand, were more susceptible to cattle manure, an indication that this type of fertilization can present a suppressive effect over this particular specie of nematodes.

Orientador: Leila Trevisan Braz / Resumo: O míldio da alface, causado por Bremia lactucae, é uma das doenças mais importantes dessa cultura, causando inúmeros prejuízos. O surgimento de novas raças torna seu controle desafio constante para os melhoristas de alface, devido à necessidade de sempre buscar novos genes de resistência para o controle da doença. O objetivo deste trabalho foi monitorar as raças de B. lactucae presentes em regiões produtoras de alface do estado de São Paulo, no ano de 2014, e avaliar a sua distribuição no período de 2003 a 2014, a fim de dar suporte ao programa de melhoramento genético de alface da UNESP - FCAV. Amostras de folhas com sintomas de B. lactucae foram coletadas em regiões produtoras do estado de São Paulo, a partir das quais os esporângios foram multiplicados na cultivar Solaris, para então iniciar a fase de diferenciação das raças. A avaliação das diferenciadoras foi realizada quando houve esporulação na cultivar suscetível Green Towers, sendo atribuídos sinais +, (+), - e (-), de acordo com a esporulação observada. Já em relação à distribuição de B. lactucae no período de 2003 a 2014, foi realizado o levantamento da frequências das raças e dos fatores de virulência identificados nesse período. Em 2014, encontraram-se seis raças: SPBl:13, SPBl:14, SPBl:15, SPBl:16, Bl:21 e SPBl:01. No total, foram identificadas 17 raças no estado de São Paulo, entre 2003 e 2014, nos 33 municípios avaliados. A SPBl:01, ocorreu em 35% dos 514 isolados avaliados. Dos 19 fatores de virulência avalia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The downy mildew of lettuce caused by Bremia lactucae is one of the most important diseases of this crop, causing major damage during the winter season. The occurrence of new races is a constant challenge for lettuce breeders, due the need of always search for new resistance genes for genetic disease control. The aim of this study was to survey the B. lactucae races, in lettuce producing regions in Sao Paulo State in 2014, and its distribution from 2003 to 2014, to support the lettuce genetic breeding program of the UNESP - FCAV. Leaf samples containing symptoms of B. lactucae were collected from producing regions of Sao Paulo State, from which the sporangia were multiplied in Solaris cultivar, and thereafter it was started the stage of races differentiation. The assessment was performed when the differentiating susceptible cultivar Green Towers showed sporulation, being attributed the signs +, (+) - and (-), according to sporulation observed. To assess the distribution of B. lactucae from 2003 to 2014, it was performed a study of the frequency of the races and virulence factors identified in this period. In 2014, it was found six races - SPBl:13, SPBl:14, SPBl:15, SPBl:16, Bl:21 e SPBl:01. In total, 17 races were identified in Sao Paulo State between 2003 and 2014, in 33 municipalities assessed. The race SPBl:01 occurred in 35% of the 514 isolates tested. From the 19 virulence factors assessed, the ones that did not occur in the population of B. lactucae, in Sao Paulo state,... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Leila Trevisan Braz / Banca: Rita de Cassia Panizzi / Banca: Renata Castoldi / Banca: Rinaldo Cesar de Paula / Banca: Pablo Forlan Vargas / Resumo: Conseguiu-se avançar progênies F3 de alface-crespa resistentes a B. lactucae, até conseguirem estabilidade fenotípica nas gerações F5 e F6, por meio da seleção tanto dentro como entre famílias, com base na coloração verde-clara e alta crespicidade das folhas, tamanho grande, ausência de brotações laterais, tolerância ao pendoamento precoce e queima dos bordos. Diante do exposto, os objetivos deste trabalho consistiram em caracterizar as linhagens em geração F5: L1, L2, L3 e L4, e em geração F6: L5, L6, L7 e L8, em relação à resistência às raças SPBl:03, SPBl:04, SPBl:05, SPBl:06, SPBl:07, SPBl:09, SPBl:10, SPBl:11 e SPBl:12 de B. lactucae identificadas no Estado de São Paulo e à mistura delas, assim como selecionar linhagens superiores por seus caracteres agronômicos, adaptabilidade e estabilidade, em diferentes municípios e épocas de cultivo por meio da metodologia REML/BLUP, para possibilitar a recomendação das referidas linhagens. Para a caracterização da resistência, o delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, em esquema fatorial de 10 X 9, determinado pelas nove raças de B. lactucae e a mistura delas, e pelas oito linhagens de alface-crespa e a cultivar Solaris suscetível, em quatro repetições. Cada raça e a mistura delas foram inoculadas isoladamente e avaliaram-se o índice de latência por meio de notas (notas de 0 a 12), dependendo do dia do aparecimento dos primeiros sinais do patógeno, e a porcentagem de plântulas com esporângios em 20 plântulas por parcela. Para avaliar a adaptabilidade e estabilidade das linhagens, o delineamento experimental utilizado foi de blocos ao acaso, em esquema fatorial 10 x 6 x 2, sendo 10 genótipos (oito linhagens, Vanda e Vera), seis áreas de produtores de alface nos municípios de Monte Alto, São Simão, Aramina, Mogi das Cruzes, Biritiba-Mirim e Salesópolis, e duas épocas de cultivo de Outono-Inverno de 2014 e Primavera- Verão de... / Abstract: It was possible to advance progenies F3 of crisp leaf lettuce resistant to B. lactucae, to achieve phenotypic stability in the generations F5 and F6, by selecting individuals from both, within and between families, based on the bright green color and high roughness of the leaves, large size, absence of side buds and tolerance to bolting and tip burn. Thus, the aims of this work consisted of characterize the lineages in generations F5: L1, L2, L3, L4, and in generations F6: L5, L6, L7, L8, related to their resistance to the races SPBl:03, SPBl:04, SPBl:05, SPBl:06, SPBl:07, SPBl:09, SPBl:10, SPBl:11 and SPBl:12 of B. lactucae identified in São Paulo State and to their mixture, as well as to select lineages superiors for their agronomic characters, adaptability and stability, in different municipalities and cropping seasons using the REML/BLUP methodology, in order to enable the recommendation of such lineages. To characterize the resistance, the experimental model was completely randomized in a factorial design of 10 X 9, determined by the nine races of B. lactucae and their mixture, and the eight lineages of crisp leaf lettuce and the susceptible cultivar Solaris, with four replications. Each race and their mixture were separately inoculated and the index latency was evaluated by means of notes (notes from 0 to 12) depending on the day of appearance of the first signs of pathogen and the percentage of seedlings with sporangia, in 20 seedlings per plot. To assess lineages adaptability and stability, randomized blocks in a factorial design of 10 x 6 x 2 was used as experimental model, being 10 genotypes (eight lineages, Vanda and Vera), six areas of lettuce producers in the municipalities of Monte Alto, São Simão, Aramina, Mogi das Cruzes, Biritiba-Mirim and Salesópolis, and two cropping periods autumn-winter 2014 and spring-summer 2014-2015, with four replications; it was assessed the volume (cm3/plant), the total and commercial ... / Doutor

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-20T12:23:14Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1082381 bytes, checksum: 6242eb60325f665605ab15a0ecc4c993 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T12:23:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1082381 bytes, checksum: 6242eb60325f665605ab15a0ecc4c993 (MD5) Previous issue date: 2016-03-24 / A alface (Lactuca sativa L.) é a hortaliça folhosa mais popular, tendo seu consumo bastante difundido em todo o mundo. Uma das principais limitações à sua produtividade é devido ao ataque de insetos sugadores de seiva, em especial o tripes Frankliniella schultzei (Trybom) (Thysanoptera: Thripidae). Entretanto, ainda não existe um plano de amostragem para este inseto em alface que auxilie na tomada de decisão em programas de manejo integrado de pragas. Logo, o objetivo deste estudo foi determinar o plano de amostragem convencional para F. schultzei em cultivos de alface. Este trabalho foi realizado em 30 lavouras comerciais de alface dos Grupos Americana, Lisa e Crespa, de novembro de 2014 a novembro de 2015. As lavouras foram avaliadas durante todos os estádios fenológicos da cultura (antes, durante e após a formação da cabeça). Foram utilizadas as técnicas de amostragem, a contagem direta de insetos e batida de bandeja onde a variável estudada foi a densidade de tripes. De acordo com nossos dados, a densidade de tripes se ajustou ao modelo de distribuição binomial negativa. A técnica amostral mais adequada foi a batida de bandeja plástica, pois obteve menor tempo de execução, menor custo em relação a contagem direta, com erro admitido adequado (< 25%). O plano de amostragem do tripes F. schultzei foi composto por 91 plantas/ lavoura de alface. O estágio de desenvolvimento antes e após a formação de cabeça influenciou diretamente no tempo de amostragem. Cada procedimento de amostragem convencional gastou 46 e 35 minutos para o grupo Americana e para o grupo Crespa 47 e 37 minutos, nos estádios antes e após a formação da cabeça respectivamente. Na alface do Grupo Lisa foram necessários 39 minutos nos dois estádios fenológicos. Os custos dos planos de amostragem antes e após a formação da cabeça foram de R$ 5,13 e R$ 3,92 (Americana); R$ 5,24 e R$ 4,13 (Crespa) e R$ 4,33 e R$ 4,36 (Lisa), respectivamente. Portanto, adoção deste plano convencional de amostragem de tripes deve trazer grandes benefícios aos produtores de alface, porque este plano de amostragem é praticável, de fácil execução e apresenta um baixo custo para o produtor. / The lettuce (Lactuca sativa L.) is the most popular leafy vegetable, having its widespread use throughout the world. A major limitation to productivity is the attack of insects, especially sucking sap, which are of high importance in the conduct of Integrated Pest Management. This group consists of pest thrips Frankliniella schultzei (Trybom) (Thysanoptera: Thripidae). However, it was not yet established a sampling plan for these insects to assist in decision making in integrated pest management programs. Therefore, the aim of this research was to determine the conventional sampling plan for F. schultzei in lettuce crops. This work was conducted in commercial crops containing plants of crisphead, looseleaf and curly groups, conducted from November 2014 to November 2015 in Cha Grande, PE. The crops were divided into two growth stages: lettuce before the formation of the head and during the formation of the head. The techniques of direct counting of insects and tray beat were used. The variable studied was the density of thrips. This study was divided into two parts: the best technical selection for thrips sampling and determining the number of samples composing the sampling plan. Data from thrips density variable set up the negative binomial distribution and the most appropriate sampling technique was the tray beat it got shorter execution time, lower cost compared to direct counting, with suitable angular error (<25%). The sampling plan thrips F. schultzei shall consist of sheets hit 91 lettuce plants in plastic tray. Lettuce crisphead group took 46 and 35 minutes, curly group 47 and 37 minutes in growth stages before and during the formation of the head respectively. In looseleaf lettuce group took 39 minutes in the two growth stages. The costs of sampling plans before the formation of the head were R$ 5.13 (crisphead), R$ 5.24 (curly) and R$ 4.33 (looseleaf) while during the formation of the head were R$ 3.92 (crisphead), R$ 4.13 (curly) and R$ 4.36 (looseleaf). This sampling plan proved to be workable, simple and inexpensive implementation.

Made available in DSpace on 2015-10-06T13:03:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-29. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:18:14Z : No. of bitstreams: 1 000848743_20170701.pdf: 75109 bytes, checksum: 4e73310d731d8cd4155e8befdabcb519 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-07-24T11:34:13Z: 000848743_20170701.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-07-24T11:35:18Z : No. of bitstreams: 1 000848743.pdf: 1219320 bytes, checksum: 860d36a9c731bc409e4f48cae9beb4cf (MD5) / Conseguiu-se avançar progênies F3 de alface-crespa resistentes a B. lactucae, até conseguirem estabilidade fenotípica nas gerações F5 e F6, por meio da seleção tanto dentro como entre famílias, com base na coloração verde-clara e alta crespicidade das folhas, tamanho grande, ausência de brotações laterais, tolerância ao pendoamento precoce e queima dos bordos. Diante do exposto, os objetivos deste trabalho consistiram em caracterizar as linhagens em geração F5: L1, L2, L3 e L4, e em geração F6: L5, L6, L7 e L8, em relação à resistência às raças SPBl:03, SPBl:04, SPBl:05, SPBl:06, SPBl:07, SPBl:09, SPBl:10, SPBl:11 e SPBl:12 de B. lactucae identificadas no Estado de São Paulo e à mistura delas, assim como selecionar linhagens superiores por seus caracteres agronômicos, adaptabilidade e estabilidade, em diferentes municípios e épocas de cultivo por meio da metodologia REML/BLUP, para possibilitar a recomendação das referidas linhagens. Para a caracterização da resistência, o delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, em esquema fatorial de 10 X 9, determinado pelas nove raças de B. lactucae e a mistura delas, e pelas oito linhagens de alface-crespa e a cultivar Solaris suscetível, em quatro repetições. Cada raça e a mistura delas foram inoculadas isoladamente e avaliaram-se o índice de latência por meio de notas (notas de 0 a 12), dependendo do dia do aparecimento dos primeiros sinais do patógeno, e a porcentagem de plântulas com esporângios em 20 plântulas por parcela. Para avaliar a adaptabilidade e estabilidade das linhagens, o delineamento experimental utilizado foi de blocos ao acaso, em esquema fatorial 10 x 6 x 2, sendo 10 genótipos (oito linhagens, Vanda e Vera), seis áreas de produtores de alface nos municípios de Monte Alto, São Simão, Aramina, Mogi das Cruzes, Biritiba-Mirim e Salesópolis, e duas épocas de cultivo de Outono-Inverno de 2014 e Primavera- Verão de... / It was possible to advance progenies F3 of crisp leaf lettuce resistant to B. lactucae, to achieve phenotypic stability in the generations F5 and F6, by selecting individuals from both, within and between families, based on the bright green color and high roughness of the leaves, large size, absence of side buds and tolerance to bolting and tip burn. Thus, the aims of this work consisted of characterize the lineages in generations F5: L1, L2, L3, L4, and in generations F6: L5, L6, L7, L8, related to their resistance to the races SPBl:03, SPBl:04, SPBl:05, SPBl:06, SPBl:07, SPBl:09, SPBl:10, SPBl:11 and SPBl:12 of B. lactucae identified in São Paulo State and to their mixture, as well as to select lineages superiors for their agronomic characters, adaptability and stability, in different municipalities and cropping seasons using the REML/BLUP methodology, in order to enable the recommendation of such lineages. To characterize the resistance, the experimental model was completely randomized in a factorial design of 10 X 9, determined by the nine races of B. lactucae and their mixture, and the eight lineages of crisp leaf lettuce and the susceptible cultivar Solaris, with four replications. Each race and their mixture were separately inoculated and the index latency was evaluated by means of notes (notes from 0 to 12) depending on the day of appearance of the first signs of pathogen and the percentage of seedlings with sporangia, in 20 seedlings per plot. To assess lineages adaptability and stability, randomized blocks in a factorial design of 10 x 6 x 2 was used as experimental model, being 10 genotypes (eight lineages, Vanda and Vera), six areas of lettuce producers in the municipalities of Monte Alto, São Simão, Aramina, Mogi das Cruzes, Biritiba-Mirim and Salesópolis, and two cropping periods autumn-winter 2014 and spring-summer 2014-2015, with four replications; it was assessed the volume (cm3/plant), the total and commercial ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-24Bitstream added on 2014-11-10T11:58:12Z : No. of bitstreams: 1 000794250.pdf: 846086 bytes, checksum: 8551e989e0f837c4ba864fc3bbdc336e (MD5) / A alface é, entre as hortaliças folhosas, a mais importante economicamente para o Brasil. No inverno, com baixas temperaturas e com molhamento foliar, o míldio da alface, doença causada pelo agente etiológico Bremia lactucae, ocorre em praticamente todas as regiões de cultivo desta hortaliça, sendo considerada uma das doenças foliares mais severas da cultura. Visando à obtenção de informações que auxiliem na condução de programas de melhoramento para resistência ao míldio, o objetivo deste trabalho foi identificar as raças de B. lactucae no ano de 2012 e 2013 que ocorreram nas principais regiões produtoras do Estado de São Paulo, como: Ribeirão Preto, Jaboticabal, Pirangi, Catanduva, São José do Rio Preto, Atibaia, Salesópolis, Biritiba Mirim, Mogi das Cruzes, Campinas, Itapira, Mogi Mirim, Cândido Mota, Presidente Prudente, Echaporã, Assis, Marília, Botucatu e Bauru. Durante o mês de julho/agosto de 2012 e 2013, coletaram-se amostras de folhas de alface com sintomas de míldio, sendo que, em cada amostra coletada, as estruturas do patógeno referiram-se a um isolado. Os esporângios foram multiplicados na cultivar suscetível Solaris, com posterior inoculação nas cultivares diferenciadoras, realizando-se as avaliações no 12º dia do aparecimento da primeira esporulação na cultivar suscetível ‘Green Tower’ (Dm-0), conforme o código “Sextet”. Em 2012, os resultados permitiram determinar dois novos códigos, identificando duas novas raças, SPBl:10 (63/31/02/00) e SPBl:11 (63/63/18/00). Em 2013, uma nova codificação foi determinada (63/31/18/00), à qual se propôs a denominação de SPBl:12. Os genes Dm-14e Dm-15, e os fatores de resistênciaR-17, R-18, R-36, R-37 e R-38 conferem resistência a essas novas raças identificadas. Recomenda-se, portanto, em programas de melhoramento genético de alface, a utilização dos fatores R-17, R-18 e R-38 como fontes ... / Lettuce is among the leafy vegetables, economically, the most important to Brazil. In winter, with low temperatures and with leaf wetness, downy mildew of lettuce, a disease caused by the agent Bremia lactucae, occurs in almost all regions of the world where the lettuce is grown, and is considered one of the most severe foliar diseases for the culture. To obtain information to assist breeding programs for resistance to downy mildew, this study aims to report the emergence of races of B. lactucae in 2012 and 2013 that occurred in the main producing regions of São Paulo, such as Ribeirão Preto, Jaboticabal, Pirangi, Catanduva, São José do Rio Preto, Atibaia, Salesópolis, Biritiba Mirim, Mogi das Cruzes, Campinas, Itapira , Mogi Mirim, Cândido Mota, Presidente Prudente, Echaporã, Assis, Marilia, Botucatu and Bauru. During the month of July / August 2012 and 2013,we collected samples of lettuce leaves with symptoms of downy mildew, and in each sample collected, the pathogen structures, referred to a secluded. The sporangia collected were multiplied on susceptible cultivar Solaris, with subsequent inoculation in differential cultivars, performing evaluations on the same day of the 12º appearance of sporulation in the susceptible cultivar 'Green Tower' (Dm-0), according to the code “Sextet”. In 2012, the results showed the two new codes, identifying two new races, SPBl: 10 (63/31/02/00) and SPBl: 11 (63/63/18/00). In 2013, a new code was determined (63/31/18/00), which proposed the name SPBl: 12.Genes Dm-14 and Dm-15 and resistance factors R-17, R-18, R-36, R-37 and R-38 confer resistance to these new races identified. It is recommended, therefore, in breeding programs lettuce the use of factors R-17, R-18 and R-38 as sources of resistance in cultivars developed for the State of São Paulo, because they confer resistance to all 12 races already identified

Orientador: Leila Trevisan Braz / Coorientador: Renata Castoldi / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Pablo Forlan Vargas / Resumo: A alface é, entre as hortaliças folhosas, a mais importante economicamente para o Brasil. No inverno, com baixas temperaturas e com molhamento foliar, o míldio da alface, doença causada pelo agente etiológico Bremia lactucae, ocorre em praticamente todas as regiões de cultivo desta hortaliça, sendo considerada uma das doenças foliares mais severas da cultura. Visando à obtenção de informações que auxiliem na condução de programas de melhoramento para resistência ao míldio, o objetivo deste trabalho foi identificar as raças de B. lactucae no ano de 2012 e 2013 que ocorreram nas principais regiões produtoras do Estado de São Paulo, como: Ribeirão Preto, Jaboticabal, Pirangi, Catanduva, São José do Rio Preto, Atibaia, Salesópolis, Biritiba Mirim, Mogi das Cruzes, Campinas, Itapira, Mogi Mirim, Cândido Mota, Presidente Prudente, Echaporã, Assis, Marília, Botucatu e Bauru. Durante o mês de julho/agosto de 2012 e 2013, coletaram-se amostras de folhas de alface com sintomas de míldio, sendo que, em cada amostra coletada, as estruturas do patógeno referiram-se a um isolado. Os esporângios foram multiplicados na cultivar suscetível Solaris, com posterior inoculação nas cultivares diferenciadoras, realizando-se as avaliações no 12º dia do aparecimento da primeira esporulação na cultivar suscetível 'Green Tower' (Dm-0), conforme o código "Sextet". Em 2012, os resultados permitiram determinar dois novos códigos, identificando duas novas raças, SPBl:10 (63/31/02/00) e SPBl:11 (63/63/18/00). Em 2013, uma nova codificação foi determinada (63/31/18/00), à qual se propôs a denominação de SPBl:12. Os genes Dm-14e Dm-15, e os fatores de resistênciaR-17, R-18, R-36, R-37 e R-38 conferem resistência a essas novas raças identificadas. Recomenda-se, portanto, em programas de melhoramento genético de alface, a utilização dos fatores R-17, R-18 e R-38 como fontes ... / Abstract: Lettuce is among the leafy vegetables, economically, the most important to Brazil. In winter, with low temperatures and with leaf wetness, downy mildew of lettuce, a disease caused by the agent Bremia lactucae, occurs in almost all regions of the world where the lettuce is grown, and is considered one of the most severe foliar diseases for the culture. To obtain information to assist breeding programs for resistance to downy mildew, this study aims to report the emergence of races of B. lactucae in 2012 and 2013 that occurred in the main producing regions of São Paulo, such as Ribeirão Preto, Jaboticabal, Pirangi, Catanduva, São José do Rio Preto, Atibaia, Salesópolis, Biritiba Mirim, Mogi das Cruzes, Campinas, Itapira , Mogi Mirim, Cândido Mota, Presidente Prudente, Echaporã, Assis, Marilia, Botucatu and Bauru. During the month of July / August 2012 and 2013,we collected samples of lettuce leaves with symptoms of downy mildew, and in each sample collected, the pathogen structures, referred to a secluded. The sporangia collected were multiplied on susceptible cultivar Solaris, with subsequent inoculation in differential cultivars, performing evaluations on the same day of the 12º appearance of sporulation in the susceptible cultivar 'Green Tower' (Dm-0), according to the code "Sextet". In 2012, the results showed the two new codes, identifying two new races, SPBl: 10 (63/31/02/00) and SPBl: 11 (63/63/18/00). In 2013, a new code was determined (63/31/18/00), which proposed the name SPBl: 12.Genes Dm-14 and Dm-15 and resistance factors R-17, R-18, R-36, R-37 and R-38 confer resistance to these new races identified. It is recommended, therefore, in breeding programs lettuce the use of factors R-17, R-18 and R-38 as sources of resistance in cultivars developed for the State of São Paulo, because they confer resistance to all 12 races already identified / Mestre