Submitted by Hélio Braga (hmartins@ufpa.br) on 2018-03-07T15:53:41Z No. of bitstreams: 1 Tese_AnaliseModelagemDendezeiro.pdf: 13065970 bytes, checksum: 39024bb2921578cca1d8d28f277187f7 (MD5) / Approved for entry into archive by Hélio Braga (hmartins@ufpa.br) on 2018-03-07T16:02:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_AnaliseModelagemDendezeiro.pdf: 13065970 bytes, checksum: 39024bb2921578cca1d8d28f277187f7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-07T16:02:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_AnaliseModelagemDendezeiro.pdf: 13065970 bytes, checksum: 39024bb2921578cca1d8d28f277187f7 (MD5) Previous issue date: 2016-01-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A política nacional dos biocombustíveis se propõe a mitigar os processos de mudanças climáticas mediante a redução das emissões de CO2, usufruir do mercado de Carbono, reduzir o desmatamento e promover a inclusão social, principalmente na área rural. Na Amazônia esta mobilização é pela palma de óleo (dendezeiro) por apresentar as melhores condições edafoclimáticas para esta cultura e dispor de uma grande quantidade de áreas consideradas “degradadas”, prioritárias para a implantação desta atividade. Assim, o objetivo deste estudo foi analisar as condições de desenvolvimento do polo do dendezeiro no Pará, mediante o uso de indicadores de sustentabilidade, o apoio do Geoprocessamento e a formulação de modelos de mudanças de uso da terra, com vistas a auxiliar no planejamento de territórios sustentáveis. Trata-se de uma pesquisa interdisciplinar que utilizou metodologias complementares para abordar as dimensões ambientais e sociais da sustentabilidade do território. Os resultados mostram que: (i) há diferenças nos índices de desenvolvimento nos municípios de Acará, Cametá, Concórdia do Pará, Igarapé-Açu, Moju, Tailândia e Tomé-Açu, no polo do dendê do Estado do Pará, os quais, sem possuir dinamismo suficiente, permanecem na condição de cidades locais; (ii) houve, de 2008 a 2013, um aumento de aproximadamente 82% (de 80.272 ha para 146.611 ha) das áreas de dendezeiros, sendo a localização preferencial destes monocultivos às imediações da região metropolitana de Belém e nos municípios de Moju, Tailândia, Acará e Tomé-Açu; (iii) os trinta e sete municípios do polo do dendê apresentam condições de desenvolvimento entre o regular e o estágio crítico e que, nesta etapa do programa do biodiesel, mais de 60% das empresas ligadas a dendeicultura foram implantadas em áreas com boas condições socioeconômicas, parecendo uma contradição já que uma das metas do programa é reduzir as desigualdades no meio rural (capitalizar a agricultura familiar); (iv) haverá um aumento de cerca de 2.110 km² de dendezeiros em 2025, não chegando a preocupar posto que não representa 5% do polo do dendê, mas a questão a ser levantada é onde ocorrerão as mudanças e em que condições. Esse conjunto de resultados é útil para o planejamento territorial a partir de um amplo debate sobre o desenvolvimento sustentável em todos os aspectos (social, econômico e ambiental). Territórios Sustentáveis para a dendeicultura pressupõem um conjunto de ações gerenciadas de forma integrada, capazes de favorecer a expansão de tais cultivos na região, sem comprometer a conservação da biodiversidade, os processos ecológicos e a melhoria nas condições socioeconômicas. Para que a expansão da palma de óleo seja conduzida para um cenário de sustentabilidade, deve ser criado um ambiente institucional favorável à melhor governança, possibilitando identificar as fragilidades e potencialidades de cada região como estratégia para solucionar os descompassos do desenvolvimento existentes no polo do dendê. Pelo observado até o momento, parece que ainda é necessário percorrer um longo caminho para que a expansão sustentável do dendezeiro ocorra no Estado do Pará. / The national policy of biofuels to propose mitigate climate change by reducing CO2 emissions, make use of the carbon market, reduce deforestation and promote socialinclusion, especially in rural areas. In Amazon area this mobilization for palm oil (dendezeiro) is justified by presenting the best soil and climate conditions for this crop and have a huge amount of areas considered "degraded" which are priority for expansion of this crop. The objective of this study was to analyze the conditions of development of the palm oil area ("polo do dendezeiro") in Pará state, through the use of sustainability indicators, the support of GIS tools and the formulation of models of land use change, in order to assist in planning sustainable territories. It is an interdisciplinary research that used complementary methodologies to address the environmental and social dimensions of sustainability of the territory. The results show that: (i) there are differences in levels of development of the municipalities of Acará, Cametá, Concórdia do Pará, Igarapé-Açu, Moju Tailândia and Tomé-Açu in the "polo do dendê". Those municipalities without having sufficient conditions to promote their development, still remain as local and isolated towns; (ii) there was, from 2008 to 2013, an increase of approximately 80,272 ha to 146,611 ha (respectively) in the areas of oil palm, being the preferred location of these monocultures to the metropolitan area of Belém and in Moju Tailândia, Acará and Tomé –Açu munipalities; (iii) the most of thirty-seven municipalities in the "polo do dendê" have development conditions between regular and critical levels that are related to low economic diversification and social and environmental grievances accumulated with the development proposals that disregarded the particular region; (iv) there will be an increase of about 2.110km² oil palm in 2025 if it continues this trend of expansion, not getting worried since it does not represent 5% polo palm oil, but the question to be raised is where occur the changes and under what conditions. This results is useful for territorial planning from a broad debate on sustainable development in all aspects (social, economic and environmental). Territories for palm oil involves a set of actions managed in an integrated approach, able to promote the development of such crop in the region, without compromising conservation of biodiversity efforts, maintaining the ecological processes and improving the socioeconomic conditions. It seems that it is still necessary to go a long way for the sustainable expansion of oil palm occurs in the state of Pará.

Submitted by Hélio Braga (hmartins@ufpa.br) on 2018-06-13T15:12:30Z No. of bitstreams: 1 Tese_DinamicaTransmissaoMalaria.pdf: 2733471 bytes, checksum: 2ee646d376814de0553d402e03197cb0 (MD5) / Approved for entry into archive by Hélio Braga (hmartins@ufpa.br) on 2018-06-13T15:15:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_DinamicaTransmissaoMalaria.pdf: 2733471 bytes, checksum: 2ee646d376814de0553d402e03197cb0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-13T15:15:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_DinamicaTransmissaoMalaria.pdf: 2733471 bytes, checksum: 2ee646d376814de0553d402e03197cb0 (MD5) Previous issue date: 2016-04-20 / A malária é uma parasitose de ocorrência mundial, concentrando-se principalmente em localidades de clima tropical e subtropical. No Brasil, na região da Amazônia Legal, apresenta-se como uma endemia, sendo responsável por mais de 99% dos casos que acontece no país. Sua manutenção na região é de caráter multifatorial, entre eles socioeconômicos, demográficos e ambientais, sendo que variáveis como temperatura do ar, precipitação e desmatamento interferem na dinâmica da doença. O objetivo geral do estudo foi compreender a dinâmica de transmissão da malária na Amazônia Legal e os nove Estados que a compõem (Acre, Amapá, Amazonas, Maranhão, Mato Grosso, Pará, Rondônia, Roraima e Tocantins), estabelecendo relações dos indicadores da endemia com a variabilidade climática regional e taxas de desmatamento. O trabalho compõe-se de cinco capítulos. O primeiro capítulo é a introdução, com a conceituação da temática e das variáveis envolvidas no estudo, objetivo e apresentação da estruturação dos capítulos seguintes. O segundo capítulo aborda a análise do Plano de Intensificação das Ações de Controle da Malária na Amazônia Legal, com base em dados secundários de malária na Amazônia Legal, de 1981 a 2015 e 1990 a 2012 (por Estados). Foi elaborado um modelo de análise de intervenção na série temporal com a utilização de variáveis dummy, que definiu as médias de ocorrências do Índice Parasitário Anual (IPA) antes e depois da intervenção. O IPA médio (após intervenção) apresentou uma redução de 48% entre as médias dos dois períodos. Entre os Estados o efeito foi diferenciado, tendo maior impacto na redução da malária em Mato Grosso, Tocantins, Roraima e Maranhão. O terceiro capítulo analisou a dinâmica espacial da incidência de malária na Amazônia Legal, de 2003 a 2012, e sua associação com o desmatamento e precipitação a partir da aplicação de estatística espacial com uso do índice de Moran global e local através do programa GeoDa. O índice global de Moran entre as variáveis confirmou a dependência espacial para IPA, precipitação e desmatamento entre os Estados. Foi identificado os Estados que apresentaram alta prioridade (Acre, Amazonas e Roraima) e baixa prioridade (Maranhão, Tocantins e Pará) para as políticas de intervenção da malária. O quarto capítulo abordou a modulação da precipitação e temperatura sobre a incidência de malária, no contexto atual e em cenários de clima futuro, no enfoque da sazonalidade, com resultados diferenciados para os Estados que compõe a Amazônia Legal. O quinto capítulo baseou-se na proposta de um modelo para malária e as variáveis envolvidas trimestralmente no estudo (precipitação, desmatamento, TSM dos oceanos), e para o modelo final foi necessário a exclusão da variável desmatamento, sendo significativo para o modelo as outras variáveis envolvidas. As políticas de prevenção manifestaram impactos na série, que apresenta uma tendência de decréscimo no número de casos. Os Estados exercem influência entre eles no padrão da ocorrência da endemia, sendo a relação com as variáveis ambientais diferenciadas para cada Estado. Os resultados apontam que o efeito das fronteiras nos casos de malária na porção oeste da Amazônia Legal tem contribuído com os valores da endemia. É necessário outras estratégias de abordagem para definições da gestão do controle da malária na região e alocação de recursos para seu combate. / Malaria is a worldwide parasite, concentrating mainly in tropical and subtropical locations. In Brazil, in the Legal Amazon region, it is characterized as an endemic disease, and it is responsible for more than 99% of the cases in the Nation. Its presence in the region has a multifactorial character, such as socioeconomic, demographic and environmental influences, and also some variables such as temperature, precipitation and deforestation. All of them influence the dynamics of the disease. The aim of this study was to comprehend the dynamics of malaria transmission in the Legal Amazon and the nine States that comprise of this region (Acre, Amapá, Amazonas, Maranhão, Mato Grosso, Pará, Rondônia, Roraima and Tocantins), establishing relations between the endemic indicators and the regional climate variability and deforestation rates. This study has 5 chapters. The first chapter contains the introduction, where there is the conceptualization of the theme and of the variables that are analyzed in the study, objective and the presentation of the structure of the following chapters. The second chapter talks about the analysis of the Plan of Intensification of Malaria Control Actions (PIACM) in the Legal Amazon, based in secondary data about malaria in the Legal Amazon from 1981 to 2015, and from 1990 to 2012 (by States). It was developed an intervention analysis model in time series with the use of dummy variables that established the Annual Parasite Index (API) average of occurrence before and after the intervention. The average API (after the intervention) had a 48% reduction between the averages from two time periods. Among the States the effect was differentiated, showing the highest impact in the reduction of Malaria in Mato-Grosso, Tocantins, Roraima and Maranhão. The third chapter analyzed the spatial dynamics of the incidence of malaria in the Legal Amazon, from 2003 to 2012, and its association with deforestation and precipitation using the spatial statistic techniques and also the local and global Moran’s index through the GeoDa Program. The global Moran’s index confirmed the spatial dependence for API, precipitation and deforestation among the States. It was identified the States that presented high priority (Acre, Amazonas and Roraima) and low priority (Maranhão, Tocantins and Pará) for the malaria intervention policies. The fourth chapter talked about the modulation of the precipitation and temperature over the incidence of malaria, in both current and in future climate scenarios, focusing on the seasonality, with different results for the States that are part of the Legal Amazon. The fifth chapter was based on the proposal of a model for malaria and quarterly variables involved in the study (precipitation, deforestation, SST of the oceans), and for the final model it was necessary to exclude the variable deforestation, being more significant for the model to utilize the other variables involved. The prevention policies expressed impacts on the series, which showed a decreasing tendency in the number of cases. The States exert influence among themselves on the pattern of Malaria occurrence, being the relations with the environmental variables differentiated in each State. The results indicate that the effects of the borders in the malaria cases in the western portion of the Legal Amazon has contributed to the values of this endemic disease. It is necessary to develop other strategies in order to control the management settings of malaria in the region and the allocation of resources to fight against this disease.

Submitted by Socorro Albuquerque (sbarbosa@ufpa.br) on 2018-06-04T16:08:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ FluxoCO2Cultivo.pdf: 3745307 bytes, checksum: c20e8c71fc53b6e185150e5d2068f3f0 (MD5) / Approved for entry into archive by Socorro Albuquerque (sbarbosa@ufpa.br) on 2018-06-04T16:09:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ FluxoCO2Cultivo.pdf: 3745307 bytes, checksum: c20e8c71fc53b6e185150e5d2068f3f0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-04T16:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ FluxoCO2Cultivo.pdf: 3745307 bytes, checksum: c20e8c71fc53b6e185150e5d2068f3f0 (MD5) Previous issue date: 2017-03-27 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os ecossistemas terrestres são importantes para compreender as trocas de CO2 entre superfície e atmosfera. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a variação diária e sazonal do fluxo de CO2 em cultivo de palma de óleo com híbrido interespecífico (Elaeis guineensis Jacq. x Elaeis oleifera (Kunth) Cortés) no leste da Amazônia. O estudo foi realizado na empresa Marborges Agroindústria S.A., Moju – Pará, onde foi instalada uma torre micrometeorológica para obtenção de dados meteorológicos e de CO2 no período de janeiro-dezembro/2015. O período chuvoso (1.974 mm) abrangeu os meses de janeiro-junho e dezembro (P > 150 mm mês-1) e o período menos chuvoso (345 mm) incluiu os meses de julho-novembro (P < 150 mm mês-1). Os valores médios diurnos da concentração de CO2 [CO2] foram menores e os valores médios noturnos foram maiores, principalmente nos níveis abaixo do dossel (5,8; 2,1; 0,5 m). Os valores médios diurnos de absorção de CO2 atingiram o máximo por volta do meio dia, com 22,3 (± 0,98) μmol m-2 s-1 no período chuvoso e 21,0 (± 0,47) μmol m-2 s-1 no período menos chuvoso. Houve pouca variação noturna nos valores médios de emissão de CO2, 5 (± 0,20) μmol m-2 s-1, em ambos os períodos, pelo cultivo de palma de óleo com híbrido interespecífico. Em geral, o ciclo diário de troca de CO2 apresentou leve diferença entre o período chuvoso e menos chuvoso, mesmo em ano de seca no leste da Amazônia. / Terrestrial ecosystems are important for the CO2 exchange between surface and atmosphere. The objective of this paper was to characterize the daily and seasonal variation of CO2 flux in oil palm cultivation with interspecific hybrid (Elaeis guineensis Jacq. x Elaeis oleifera (Kunth) Cortés) in eastern Amazonia. The study was carried out at Marborges Agroindústria S.A., Moju - Pará, where a micrometeorological tower was installed to obtain meteorological and CO2 data from January to December of 2015. The wet season (1.974 mm) covered the months of January-June and December (P > 150 mm month-1) and the dry season (345 mm) included the months of July-November (P < 150 mm month-1). The average daily values of CO2 concentration [CO2] were lower and average night values were higher, mainly at levels below the canopy (5.8; 2.1; 0.5 m). The average daily values of CO2 uptake peaked at noon, with 22.3 (± 0.98) μmol m-2 s-1 in the wet season and 21.0 (± 0.47) μmol m-2 s-1 in the dry season. There was little nocturnal variation in the average values of CO2 emission, 5 (± 0.20) μmol m-2 s-1, in wet and dry seasons, by oil palm cultivation with interspecific hybrid. Generally, the daily CO2 exchange cycle presented a slight difference between the wet and dry season, even in drought year in eastern Amazonia.

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-09-11T18:08:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Sílvia_de_Pinho.pdf: 2440725 bytes, checksum: 0f35b4a66052c13674ec5fb447b060f8 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-09-11T18:09:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Sílvia_de_Pinho.pdf: 2440725 bytes, checksum: 0f35b4a66052c13674ec5fb447b060f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-11T18:09:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Sílvia_de_Pinho.pdf: 2440725 bytes, checksum: 0f35b4a66052c13674ec5fb447b060f8 (MD5) Previous issue date: 2018-04-20 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As interações biológicas têm um papel importante na regulação e manutenção das populações naturais. Assim como a maioria destas interações, o parasitismo pode ser influenciado pelo ambiente, com as mudanças causadas pelas atividades antrópicas podem afetar profundamente o equilíbrio das assembleias dos organismos hospedeiros. Diante disto, nosso trabalho procurou descrever, a composição e riqueza dos hemoparasitos de anuros presentes em dois ambientes, inseridos no Bioma Amazônico, no leste do Pará, Brasil. Caracterizamos os grupos de hemoparasitos mais frequentes, e se o tipo de infecção hemoparasitária está relacionada com hábitat do anuro (arborícola ou terrestre). Coletamos 128 anuros nos dois ambientes, em duas expedições realizadas nos períodos de abril de 2016 e 2017, que correspondem a estação de chuva na região. No laboratório foram realizados esfregaços sanguíneos e imprint do fígado para identificação do parasito. No total foram registrados sete táxons distintos de hemoparasitos em 55 anuros (43%). Nas áreas de plantação haviam mais espécimes infectados e com infecções mistas que em áreas de floresta. Parasitos do gênero Trypanosoma foram os mais frequentes, ocorrendo em 67% dos anuros infectados nos dois ambientes, com a identificação de seis grupos morfológicos distintos, encontrados principalmente em anuros terrestres. Foram identificados dois grupos distintos de Hemogregarinas em seis espécimes de anuros mais parasitados, encontradas principalmente nos de hábito terrestre. Registramos a presença de um parasito do Filo Apicomplexa não identificado em espécimes de Trachycephalus typhonius, que provavelmente se trata de um táxon novo e será estudado a posteriori. / Biological interactions play an important role by maintaining and regulating natural populations. As most interactions, parasitism may be influenced by the environment, with anthropogenic changes caused by humans strongly affecting the equilibrium in biological assemblages of their hosts. Herein, we described and analyzed the hemoparasites richness and composition in anurans from oil palm crops and surrounding forest fragments in the eastern Amazon, Brazil. In addition, we analyzed which hemoparasites are most frequent and whether the type of infection is related with anurans habits (terrestrial or arboreal). We collected 128 anurans in both environments (forest and oil palm plantations) during rainy season, in April 2016 and 2017. In the laboratory, we collected blood samples from each individual, and carried out smear and imprint methods of their livers to identify the parasites. We found seven hemoparasites groups in 55 individuals (43%) in both habitats. In oil palm plantations, there were more infected specimens and more mixed infections than in forests. Parasites of the genus Trypanosoma were the most frequent, found in 67% of infected anurans in both environments. Besides, we identified six distinct morphological groups, mainly in terrestrial anurans. We found two distinct Haemogregarines groups in six anurans, most terrestrial. In addition, we found an Apicomplexa parasite in specimens of Trachycephalus typhonius, which is probably a new taxon and will be studied a posteriori.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-05-22T15:00:55Z No. of bitstreams: 2 Andréa Araújo Arana.pdf: 11629380 bytes, checksum: 6ed68bb35bb082b890cd7b6dc4c27f1b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-22T15:00:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Andréa Araújo Arana.pdf: 11629380 bytes, checksum: 6ed68bb35bb082b890cd7b6dc4c27f1b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-05-01 / This work showed the complexity of the organic and inorganic composition of aerosol from Amazônia e its interactions with biogenic processes in the forest. We investigated the sources and processes that regulate the organic and inorganic components of aerosol particles from Amazônia based on long term continuous measurements in two regions: one perturbed by land use change, in Porto Velho/RO, and one of pristine tropical rainforest, Rebio Cuieiras/AM. For the first time, the elemental concentration of the aerosol from Amazônia was obtained using energy dispersive x-ray fluorescence – EDRF. A careful calibration and optimization of the EDXRF Epsilon 5, PANalytical, was performed. This task involved the production of calibration standards for element P, besides the use of commercially available standards from MicroMatter. A new methodology was developed to calculate the detection limit for each element based on a non-linear fit of the standard deviation for different masses, and was compared to the usual method using the background noise in blank filter measurements. Both methods gave similar detection limits, with higher values around 45 ng cm -2 (Na, Mg e Cd), most values below 10 ng cm -2 , and some very low values as 3 ng cm -2 (P, S, Cl, K, Ca, Cr, Fe e Cu). A detailed and extensive comparison with other EDXRF spectrometers, one from Antwerp University and another from CETESB, and other analytical methods, PIXE and Ion Chromatography, was performed. The comparison between PIXE and EDXRF showed statistically significant regressions for most elements, as well as the comparison with the other EDXRF, thus indicating that the calibration and fine-tuning of the LFA EDXRF were appropriate. The comparison with the Ion Chromatography from PUC-Rio was used to quantify the particle self-attenuation corrections necessary for light elements. About the seasonal variation of aerosol mass concentration at Rebio Cuieiras, the average concentration was very low, 9.5 ± 4.7 μg m -3 (wet season) and 13.4 ± 4.9 μg m -3 (dry season), with a very clear seasonal cycle. The equivalent BC showed a stronger seasonality with high concentrations in the fine mode, 0.57 ± 0.38 μg m -3 , during the dry season, and very low, 0.05 ± 0.02 μg m -3 , during the wet season. In Porto Velho, average PM10 was 8.8 ± 4.2 μg m -3 (wet) and 45 ± 42 μg m -3 (dry), but with mean values reaching as high as 200 μg m -3 as during the dry season of 2010, when EBC reached values of 3.6 ± 3.6 μg m -3 . During the wet season, the EBC average concentration was 0.5 ± 0.4 μg m -3 . That means that, even in the absence of large scale biomass burning, land use change and local pollution interfere on the concentration of aerosol in anthropogenic impacted Amazon regions, as observed by Artaxo et al. (2013). For measuring the carbonaceous aerosols, the EUSAAR_2 was chosen after an comparison exercise. For validating the measurements, a comparison with the University of Ghent, Belgium, was performed and showed that our calibration with sucrose, the determination of the transit time and the data processing is correct. The average concentration of OC at Rebio Cuieiras was 6.3 ± 3.1 μ g m -3 (dry) e 1.8 ± 0.7 μ g m -3 (wet), and for EC it was 0.6 ± 0.3 μg m -3 (dry) and 0.18 ± 0.08 μg m -3 (wet). In general, our results indicate that this area is still pristine but with some impact of long range biomass burning transport during the dry season. At Porto Velho, the average OC concentration was 12 ± 5 μg m -3 (dry) and 5.0 ± 0.5 μg m -3 (wet), and for EC was 0.9 ± 0.5 μg m -3 (dry) e de 0.5 ± 0.3 μg m -3 (wet). The presence of anomalous brown carbon absorption was analyzed but it was not possible to quantify its presence in the atmospheric aerosol in the Amazon region. The increase in mean atmospheric concentrations of OC and EC from the wet to the dry season was studied for each volatility level. Results showed a higher increase of the OC2, OC3, EC2 and EC3 (intermediate volatility) at Rebio Cuieiras, while at Porto Velho there was a higher increase of OC1 and EC1, as it is more subject to fresh biomass burning. Using positive matrix factorization and absolute principal factor analysis, a source apportionment of particulate matter was performed. The novelty in this study was the inclusion of the organic and inorganic components (and not only the elemental composition). The PMF analysis did not show self-consistent results and, indeed, there is a scientific debate nowadays on the source apportionment tools by the European Comission / Joint Research Centre. / Este trabalho mostrou a complexidade da composição orgânica e inorgânica do aerossol da Amazônia e sua interação com processos biogênicos da floresta. Investigamos as fontes e processos que regulam as componentes orgânica e inorgânica dos aerossóis atmosféricos na Amazônia, a partir de medidas contínuas e de longo prazo em duas regiões: uma área perturbada por mudanças no uso do solo, Porto Velho/RO e uma área com floresta tropical não perturbada, Rebio Cuieiras/AM. Pela primeira vez, a concentração elementar do aerossol da Amazônia foi determinada utilizando a técnica de fluorescência de raios X por dispersão de energia – EDXRF. Foi realizado um trabalho de calibração e otimização do instrumento de EDXRF Epsilon 5, da PANalytical, que envolveu a produção própria de padrões de calibração para o elemento P, além da utilização de padrões comerciais da MicroMatter. Um novo procedimento foi desenvolvido para calcular os limites de detecção para cada elemento utilizando o ruído de fundo em medidas amostradas com método alternativo de regressão não linear. Os resultados da comparação entre as concentrações medidas pelos sistemas PIXE e EDXRF se mostraram estatisticamente significantes para a maioria dos elementos, assim como a comparação com a CETESB e Universidade de Antuérpia, Bélgica, indicando que a preparação dos padrões e o procedimento de calibração desenvolvidos neste trabalho foram apropriados. A comparação entre as medidas do LFA EDXRF e Cromatografia Iônica da PUC-Rio foi utilizada para a derivação das correções de autoabsorção de partículas para elementos leves. Sobre os ciclos sazonais e interanuais das concentrações em massa do aerossol na região Amazônica, na Rebio Cuieiras, a concentração média de PM 10 foi muito pequena, 9,5 ± 4,7 μg m -3 durante a estação chuvosa e 13,4 ± 4,9 μg m -3 na estação seca. O EBC (black carbon equivalente) apresentou uma forte sazonalidade, com elevadas concentrações na fração fina de 0,57 ± 0,38 μg m -3 (seca) e de 0,05 ± 0,02 μg m -3 (chuvosa). Em Porto Velho, o PM 10 foi de 8,8 ± 4,2 μg m -3 (chuvosa) e 45 ± 42 μg m -3 (seca), podendo chegar a 200 μg m -3 , como na estação seca de 2010. A presença de EBC chegou a valores de 3,6 ± 3,6 μg m -3 . Na estação chuvosa a concentração média foi 0,5 ± 0,4 μg m -3 . Mesmo na ausência das queimadas em larga escala, as mudanças no uso do solo e a polução local interferem nas concentrações do aerossol em regiões impactadas antropicamente na Amazônia, como observado na literatura. Para medidas do aerossol carbonáceo, o protocolo escolhido foi o EUSAAR_2, por ser mais indicado ao estudo de aerossóis remotos. A intercomparação com o instrumento da Universidade de Ghent, Bélgica, conclui que nosso processo de calibração externo com sacarose, determinação do transit time e o processamento dos dados estão corretos. A concentração média de OC (carbono orgânico) na Rebio Cuieiras foi de 6,3 ± 3,1 μg m -3 (seca) e 1,8 ± 0,7 μg m -3 (chuvosa), para EC (carbono elementar) foi de 0,6 ± 0,3 μg m -3 (seca) e 0,18 ± 0,08 μg m -3 (chuvosa). De maneira geral, os resultados demonstram que esta é uma área ainda sob condições preservadas, porém com algum impacto de transporte a longa distância de emissões de queimadas durante a estação seca. Em Porto Velho, a concentração média de OC foi de 12 ± 5 μ g m -3 (seca) e 5,0 ± 0,5 μ g m -3 (chuvosa), e EC foi de 0,9 ± 0,5 μg m -3 (seca) e de 0,5 ± 0,3 μg m -3 (chuvosa). Analisou-se a questão da presença de absorção de radiação anômala por brown carbon, mas não foi possível quantificar a sua presença no aerossol atmosférico da região amazônica, em parte devido às incertezas inerentes nas medidas. Avaliou-se o aumento da concentração atmosférica média durante a estação seca para cada nível de volatilidade do carbono e os resultados mostraram um aumento maior das componentes OC2, OC3, EC2 e EC3 (volatilidade medida) na Rebio Cuieiras enquanto em Porto Velho a estação de queimadas trouxe um aumento das componentes OC1 e EC1, caracterizando queima de biomassa fresca, pela sua baixa volatilidade. Por meio da PMF (fatorização de matriz positiva) e APFA (análise de fatores principais absoluta) foram identificadas as fontes do material particulado. A diferença deste estudo está no fato de que o carbono orgânico e carbono elementar (e não apenas a composição química elementar) foram incluídos. O modelo PMF não atendeu às expectativas de ser um modelo de fácil utilização e robusto, ao contrário do APFA. Na Rebio Cuieiras foram identificados três fatores: fator (1) emissão de queimadas, com os elementos traçadores S, K, Br associados ao PM10, EBC, OC e EC; fator (2) poeira do solo proveniente do deserto do Saara, devido aos elementos traçadores, Al, Si, Ca, Ti, Fe e fator (3) indicou uma mistura de aerossol biogênico, elementos P, e sal marinho, elemento Cl. Em Porto Velho, o fator (1) com a emissão de solo associado ao EC, o fator (2) traçadores característicos de queimada, e o fator (3) emissão biogênica.

Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2017-05-29T14:42:30Z No. of bitstreams: 2 Tese_Inaura_Santos.pdf: 2446013 bytes, checksum: 3d710c9454abaf6ac4e4a6fa8ffa7bdd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-29T14:42:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Inaura_Santos.pdf: 2446013 bytes, checksum: 3d710c9454abaf6ac4e4a6fa8ffa7bdd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-06-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The destruction of natural landscapes has intensified ecological and conservation studies of soil fauna. Arthropods are often used as a model for studies on integrity and functioning of terrestrial ecosystems. Using two collection methods, we investigated the spatial distribution pattern and the sample sufficiency of edaphic springtails to create one collection protocol in different vegetation types in the Amazon. Standardized samples were taken by RAPELD system in the years 2011, 2012 and 2013 in three forests in the Amazon. In each area, 30 plots of 250 m, spaced 1 km from each other were used. The depth of the litte, the clay and phosphorus contente were used to assess the ecological relationships with the community of springtails. In Reserva Ducke the inventory was carried out in 2011 using the Berlese-Tullgren apparatus. In total, 4,126 individuals, 28 species of three families springtails were recorded. The reduction in sampling effort by the similarity with the maximum effort composition in reduced effort was efficient (rP> 0.6), but the maintenance of ecological responses was not showed because the the ecological relathionship captured with the maximum effort was not recovered in reduced efforts. Therefore, the reduction of the sampling effort-with the Berlese method was possible only for research taxonomic aspects. In 2012 we conducted a survey in Maracá Ecological Station with two collection methods, Berlese-Tullgren and pitfall and evaluated the cost- benefit of these two techniques. Combining the methods, there were 4,453 individuals and 15 species. The methods, Berlese-Tullgren and Pitfall, detect different species compositions without overlapping information. However, using only Pitfall, the ecological pattern captured with the two combined methods is recovered. We concluded that the use of only one method of collection is viable, enabling the pitfall as an effective method for sampling springtails. In the years 2012 and 2013 we carried out surveys in Ducke, Maraca and Viruá National Park using Pitfall. In total, 10,295 springtails and 20 species were recorded in the three forests. The community of springtails edaphic was influenced by environmental factors in the three areas. The species composition changes according to the litter gradient in Ducke and Maraca with the clay content in the Ducke and Viruá, and the fóforo content of the soil in Viruá. The reduction from 10 to five subsamples per plot was efficient to sample the three areas, since the reduced effort recorded high similarity in species composition and recovered the ecological pattern recorded with the maximum effort. We concluded that the reduction of subsamples was effective with Pitfall in three areas in the Amazon. Reduction of sampling effort provides the protocol simplification that require less effort in the field and laboratory in terms of time and cost, contributing with data to the maintenance of biodiversity. / A destruição das paisagens naturais tem intensificado estudos ecológicos e conservacionistas da fauna edáfica. Os artrópodes são usados frequentemente como modelo para estudos sobre integridade e funcionamento dos ecossistemas terrestres. Usando dois métodos de coleta, investigamos o padrão de distribuição espacial e a suficiência amostral de colêmbolos edáficos, para a criação um protocolo de coleta em diferentes fitofisionomias na Amazônia. Três áreas de florestas na Amazônia. Em cada área, foram usadas 30 parcelas de 250 m, espaçadas 1 km entre si. A profundidade da serrapilheira, o teor de argila e de fósforo do solo foram usados para avaliar as relações ecológicas com a comunidade de colêmbolos. Na Reserva Ducke foi realizado um inventário em 2011 utilizando o aparelho de Berlese- Tullgren. Foram obtidos 4.126 indivíduos, 28 espécies de três famílias colêmbolos. A redução do esforço de coleta através da similaridade da composição do esforço máximo em comparação com esforços reduzidos foi eficiente (rP > 0,6), porém, a redução para manutenção das respostas ecológicas não foi comprovada, pois o padrão ecológico capturado no esforço máximo não foi recuperado no esforço reduzido. Portanto, sugerimos que a redução do esforço amostral com o método de Berlese-Tullgren é possível apenas para pesquisas de cunho taxonômico. Em 2012 foi realizado um inventário na Estação Ecológica de Maracá com dois métodos de coleta (Berlese-Tullgren e Pitfall) e avaliado o custo- beneficio dessas duas técnicas. Combinando os métodos, foram registrados 4.453 indivíduos e 15 espécies. Os métodos, Berlese-Tullgren e Pitfall, detectaram composições diferentes de espécies, sem sobreposição de informação. Porém, usando apenas o Pitfall, o padrão ecológico capturado com os dois métodos combinados é recuperado. Assim, concluímos que a utilização de apenas um método de coleta é viável, capacitando o Pitfall como um método eficaz na amostragem de colêmbolos. Nos anos de 2012 e 2013 foram realizados inventários na Ducke, em Maracá e no Parque Nacional do Viruá, utilizando Pitfall. Foram coletados 10.295 colêmbolos e 20 espécies nas três áreas de proteção. A comunidade de colêmbolos edáficos foi influenciada pelos fatores ambientais nas três áreas. A composição de espécies muda em função do gradiente de serrapilheira na Ducke e em Maracá, com o teor de argila na Ducke e em Viruá, e com o teor de fósforo do solo em Viruá. A redução de 10 para cinco subamostras por parcela foi eficiente para amostrar as três áreas, uma vez que no esforço reduzido registramos alta similaridade na composição de espécies e da recuperação dos padrões ecológicos registrados no esforço máximo. Desse modo, a redução de subamostras foi eficaz com o pitfall nas três áreas. A redução do esforço amostral propicia a simplificação do protocolo que demandará menor esforço no campo e laboratório em termos de tempo e custos, contribuindo com dados para a manutenção da biodiversidade.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-06-19T12:32:37Z No. of bitstreams: 2 EduardoPrata_Tese2017.pdf: 59763452 bytes, checksum: 7280d67b335a3969443e85d5e75212c8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-19T12:32:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 EduardoPrata_Tese2017.pdf: 59763452 bytes, checksum: 7280d67b335a3969443e85d5e75212c8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-10-14 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Species complexes are groups in which species limits and hence species numbers are unclear. Untangling species limits within species complexes can be challenging, but is the basis for investigating the processes underlying species differentiation and the discovery of new species. The Pagamea guianensis species complex is one of the most widespread and common taxa in the Amazonian white-sand flora. Previous analysis suggested the occurrence of ten species within this group, but species limits remain unclear due to poor sampling, morphological overlap and low molecular resolution. Here we present the most comprehensive sampling of individuals across the geographical distribution of the P. guianensis complex in order to: test the monophyly of this species complex; clarify species limits within it; reconstruct the spatio-temporal history of the white-sand specialist Pagamea guianensis complex in order to investigate where, when and how diversification events took place. Using a high-throughput DNA sequencing approach, we sequenced 431 loci (>34 M bases) for 179 individuals. We applied phylogenetic and species tree analyses to resolve phylogenetic relationships among the sampled individuals. Species delimitation was estimated based on molecular data, and we subsequently tested whether these hypothesized species could be differentiated by morphological and/or NIR spectroscopy data, and whether they have different ecological niches. Ancestral habitat were reconstructed for the variables vegetation structure, flooding and annual precipitation. We run admixture analysis in order to analyze population structure within the most widely distributed species: Pagamea angustifolia, P. guianensis and P. pilosa. We also run an isolation-by-distance model to investigate the correlation between geographic distance and cophenetic distance among individuals of the clade P. angustifolia+P. guianensis distributed around the Guiana Shield in a ring-like distribution. Our results confirmed the monophyly of the P. guianensis complex and our integrative approach using evidences from independent datasets show 15 distinct and well-supported lineages, here circumscribed as 14 species and one subspecies (six species and one subspecies newly described and one species with new status). All diversification events took place during the Pleistocene (last 2.5 Ma). The ancestral area of the Pagamea guianensis complex was inferred in the Western Amazon around 2.5 Ma, from where it started to disperse eastward reaching the Atlantic Coast on the Guiana Shield around 1.3 Ma and the Northeastern Brazilian Atlantic Coast (Bahia State) the Last Interglacial (~130,000 years). The ancestor was in tall forests over dry soils, with subsequent diversification to lower or open vegetation and to moist or flooded soils. We found a gradient of species diversity following the west-east dispersal route, with higher diversity in the Western and Northwestern Amazon (7 and 5 spp), intermediate in Central Amazon (4) and few species in the Eastern Amazon and Atlantic Forest (1). Population structure analysis revealed more genetic structure in the North of the Amazonas River than in the South region. Populations from the P. angustifolia+P. guianensis clade in the Eastern Guiana Shield follow an isolation-by-distance model with strong correlation among cophenetic and geographical distances around the ring, a pattern never detect before for plants in the Amazon. Finally, in this work we were able to delimit and discover new species using advanced techniques of DNA sequencing and phylogenetic inferences from multiple markers, combining with independent analysis from morphological, spectral and ecological datasets. After species delimitation, we finally could reconstruct a more detailed and less uncertain biogeographic history for the P. guianensis complex. / Complexos de espécies são grupos onde os limites entre as espécies não são claros e, portanto, o número de espécies é incerto. Desvendar limites entre espécies em complexo de espécies é atualmente um dos maiores desafios da taxonomia moderna, especialmente a partir do uso de técnicas moleculares avançadas de seqüenciamento do DNA e de inferências filogenéticas e de árvores de espécies. Além disso, complexos de espécies são grupos ideais para o entendimento dos processos evolutivos geradores da diversidade de espécies na Amazônia. O complexo Pagamea guianensis é um dos táxons mais comuns e amplamente distribuídos em vegetação sobre solos arenosos na Amazônia, como as campinas, campinaranas e igapós. Trabalhos anteriores sugerem a ocorrência de dez espécies nesse grupo, mas o limite entre algumas espécies permanece incerto em função da baixa amostragem, da sobreposição morfológica e da baixa resolução na filogenia molecular. Neste trabalho, realizamos a mais completa amostragem de indivíduos ao longo da distribuição geográfica do complexo Pagamea guianensis com os objetivos de: testar a monofilia do grupo; resolver os limites entre as espécies e; reconstruir a história espaço-temporal do complexo Pagamea guianensis para entender onde, quando e como se deram os eventos de diversificação na Amazônia. Seqüenciamos 431 loci (>34 M bases) de um total de 179 indivíduos. A delimitação das espécies foi estimada a partir de árvores filogenéticas e de espécies e, em seguida, testamos se as espécies hipotetizadas podem ser diferenciadas a partir de variáveis morfológicas, ecológicas e espectrais. Reconstruímos a história evolutiva, o habitat ancestral e analisamos a estrutura genética populacional das espécies mais amplamente distribuídas Pagamea angustifolia, P. guianensis e P. pilosa. Para testar o efeito das terras altas do Escudo das Guianas como barreira para populações de P. angustifolia+P. guianensis, utilizamos um modelo de isolamento por distância. Nossos resultados confirmam a monofilia do complexo P. guianensis, e nossa abordagem utilizando evidências a partir de dados independentes revelou 15 linhagens distintas e bem suportadas, aqui circunscritas em 14 espécies e uma subespécie (sendo seis espécies e uma subespécie novas e uma espécie com novo status). Todos os eventos de diversificação se deram no Pleistoceno e a área ancestral do complexo P. guianensis foi inferida para o oeste da Amazônia há ca. 2.5 milhões de anos, de onde as populações começaram a dispersar em direção leste, alcançando a costa Atlântica do Escudo das Guianas por volta de 1.3 milhões de anos atrás. A divergência entre populações de P. guianensis da Amazônia e da Mata Atlântica do Nordeste do Brasil foi datada em aproximadamente 1 milhão de anos, mas é provável que as populações tenham alcançado a região costeira da Bahia passando pela região da Chapada Diamantina na Bahia, durante o último Interglacial há aproximadamente 130 mil anos. O ancestral provavelmente habitava florestas altas sobre solos arenosos não inundáveis no oeste da Amazônia. A riqueza de espécies segue um gradiente oeste-leste, com sete espécies no Oeste, cinco no Noroeste, quatro na Amazônia Central e uma espécie no Nordeste da Amazônia e Mata Atlântica. As populações ao norte do Rio Amazonas apresentaram maior estrutura genética em relação as do sul. Populações do clado P. angustifolia+P. guianensis do leste da Amazônia distribuídas ao redor do Escudo das Guianas seguiram um modelo de isolamento por distância com forte correlação entre a distância cofenética e a distância geográfica, seguindo um padrão de distribuição em anel, um padrão nunca detectado antes em plantas na Amazônia. Por fim, neste trabalho mostramos como o uso de técnicas avançadas de seqüenciamento do DNA e inferências filogenéticas a partir de múltiplos marcadores, combinado com análises de dados morfológicos, espectrais e ecológicos, possibilitaram a delimitação de espécies no complexo P. guianensis, incluindo a detecção e descrição de novas espécies. A partir da delimitação taxonômica, pudemos reconstruir uma história biogeográfica mais detalhada e com menos incertezas para o complexo P. guianensis.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-06-19T12:46:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_RaquelSousaChaves (1).pdf: 1444636 bytes, checksum: 918739925dc3231e88828ba5be4bf976 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-19T12:46:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_RaquelSousaChaves (1).pdf: 1444636 bytes, checksum: 918739925dc3231e88828ba5be4bf976 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Manioc (Manihot esculenta Crantz) is the main agricultural crop in Amazonia, with great economic and cultural importance, as it is the basis of the diet of rural and urban populations, especially traditional and indigenous communities that manage a large number of manioc varieties. Ecological, socioeconomic and cultural factors, such as soil type, soil fertility and market orientation, influence the forms of management and the diversity of cassava varieties cultivated by different cultural groups. This study investigates how different soil types (especially anthropogenic soils and adjacent soils) and market orientation influence the selection of manioc varieties managed by smallholder farmers in the Resex Tapajós-Arapiuns, lower Tapajós River, Pará, Brazil. Sixty-one fields of 30 family farms were studied in three riverside communities, with different soil types and different degrees of market orientation. A total of 41 manioc varieties were found (36 bitter manioc, 3 sweet manioc and 2 manicuera varieties). Six varieties are cultivated in all communities, 6 are unique to Enseada do Amorim, 8 to Parauá and 10 to Surucuá. The different soil types were grouped into three categories, defined according to soil fertility, color and presence of ceramic artifacts: Terra preta, with high fertility, dark brown or black color and abundant ceramic fragments; transitional soils, with high levels of phosphorous, organic matter and aluminum, light brown color and occasional occurrence of ceramics; adjacent soils, with low fertility, light color and without ceramic artifacts. Twenty five varieties are cultivated in all soils, with seven common to the three soil types, 2 exclusive to Terra preta, eleven to transitional and three to adjacent soils. Farmers prefer to grow short cycle varieties in the most fertile soils and long cycle varieties in less fertile soils. Terra preta are managed more intensively, with a shorter fallow period (4.0±1.2 years) and more consecutive productive cycles (3.6±0.5); transitional soils have intermediate fallow durations (6.0±1.6 years) and number of consecutive production cycles (2.9±0.4), while adjacent soils have longer fallows (10.0±1.2 years) and fewer consecutive production cycles (2.0±0.0). The market orientation of manioc flour production is related to the size of fields and the area occupied by "commercial varieties". Farmers that allocate between 50 and 80% of the market produce areas of 1.65 ± 0.49 ha, each with 0.66 ± 0.20% of the area occupied by commercial varieties; Families that destine more than 80% manage larger areas, 2.61 ± 1.07 ha, and commercial varieties occupy 0.73 ± 0.17% of the area of the plantations. In contrast, families that allocate less than 50% of cassava flour production to the market manage smaller areas, 0.58 ± 0.12 ha and commercial varieties proportionally occupy a smaller area 0.49 ± 0.19%. In conclusion, the composition of manioc varieties, as well as the management of family farming systems in the Lower Tapajós River region are influenced by soil type. The orientation of production to the market influences the characteristics of the cropping system, as well as the size of the area managed and the proportion of area in the fields occupied by commercial. / A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é o principal cultivo agrícola da Amazônia, com grande importância econômica e cultural, pois é à base da dieta da população rural e urbana, com destaque para as comunidades tradicionais e indígenas que manejam um grande número de variedades de mandioca. Considerando que fatores ecológicos, socioeconômicos e culturais influenciam as formas de manejo e a diversidade de variedades de mandioca cultivada por diversos grupos culturais, o presente trabalho objetivou determinar como diferentes tipos de solo (em particular os solos antrópicos e solos adjacentes) e a orientação para o mercado influenciam na escolha das variedades de mandioca manejadas por agricultores tradicionais na Resex Tapajós-Arapiuns, baixo rio Tapajós, Pará, Brasil. Foram estudadas 61 roças de 30 famílias em três comunidades ribeirinhas, em diferentes tipos de solo e diferentes graus de orientação da produção para o mercado. Foram encontradas 41 variedades de mandioca (36 mandiocas, 3 macaxeiras e 2 manicueras). Seis variedades são cultivadas em todas as comunidades, 6 são exclusivas de Enseada do Amorim, 8 de Parauá e 10 de Surucuá. Os diferentes tipos de solo amostrados foram agrupados em três categorias, definidas de acordo com a fertilidade, coloração e presença de artefatos cerâmicos: Terra Preta de Índio - TPI, com elevada fertilidade, coloração marrom escura ou preta e abundantes fragmentos cerâmicos; solos de transição com altos níveis de fósforo, matéria orgânica e alumínio, coloração marrom clara e ocorrência ocasional de cerâmica; solos adjacentes (Latossolo e Argissolo), com baixa fertilidade, coloração clara ou amarelada e sem artefatos cerâmicos. Vinte e cinco variedades são cultivadas em todos os solos, sendo sete comuns para os três tipos, 2 exclusivas de TPI, 11 de “solos de transição” e 3 de solos adjacentes. Os agricultores têm preferência por variedades de ciclo curto em solos mais férteis e variedades de ciclo longo em solos menos férteis. As TPI são manejadas mais intensivamente, como menor período de pousio (4,0±1,2 anos) e mais ciclos produtivos consecutivos (3,6±0,5) antes do pousio; solos de transição apresentam valores intermediários, tanto em relação ao tempo de pousio (6,0±1,6 anos) quanto ao número de ciclos produtivos (2,9±0,4); Latossolo e Argissolo apresentam um pousio longo (10,0±1,2 anos) e o número de ciclos produtivos consecutivos é menor (2,0±0,0). O direcionamento da produção de farinha de mandioca para o mercado está relacionado com o tamanho das roças e com a área ocupada com “variedades comerciais”. Famílias que destinam ao mercado entre 50 e 80% da produção manejam áreas de 1,65 ± 0,49 ha, cada uma com 0,66 ± 0,20% da área ocupada por variedades comerciais; famílias que destinam mais de 80% manejam áreas maiores, 2,61 ± 1.07 ha, e as variedades comerciais ocupam 0,73 ± 0,17% da área das roças. Em contraste, famílias que destinam menos que 50% da produção de farinha de mandioca para o mercado manejam áreas menores 0,58 ± 0,12 ha e as variedades comerciais ocupam proporcionalmente uma área menor 0.49 ± 0.19%. Em conclusão, a composição de variedades de mandioca, bem como o manejo dos sistemas agrícolas familiares na região do baixo rio Tapajós são influenciados pelo tipo de solo. A orientação da produção para o mercado influencia as características do sistema de cultivo, bem o tamanho da área manejada e a proporção de área nas roças ocupada por “variedades comerciais”.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-06-19T13:07:43Z No. of bitstreams: 2 DissertaçãoFinal_GabrielaMaia.pdf: 1805210 bytes, checksum: 64dc18a71d2c15aadb86e18ca66e57ee (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-19T13:07:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DissertaçãoFinal_GabrielaMaia.pdf: 1805210 bytes, checksum: 64dc18a71d2c15aadb86e18ca66e57ee (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-07-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / In the Amazon basin, the distribution of many vertebrate species is delimited by large rivers, which are frequently considered as biogeographical barriers strongly related to the origin and maintenance of the elevated biodiversity found in the region. However, few are the phylogeographical investigations evaluating the effect of such barriers on multiple classes of genotypic and phenotypic characters. To date, no multicharacter investigation has been dedicated to a study system involving the Tapajos River, which delimit areas of endemism in the biome. In this study we tested the effectiveness of this river barrier in the genetic, acoustic and morphological variability in populations of the frog Allobates tapajos (Dendrobatidae). For this, we sampled populations throughout the known distributional range of the species on both margins of the middle and lower sections of the river. We obtained fragments of mitochondrial (16S) and nuclear (RAG1) genes, as well as external morphometric measurements and advertisement call acoustic parameters of 48 individuals from six localities. While the nuclear marker was monomorphic across the geographic distribution of A. tapajos, the mitochondrial fragment revealed low genetic distances accompanied of high spatial structuring, with no haplotype sharing between opposite river margins. Cladogenetic events were concentrated on Pleistocene, epoch proposed to the establishment of the Tapajós river drainage. Acoustic parameters diverged between river margins, a pattern not observed in relation to the morphological markers analyzed. Additionally, there was no correlation in the variability pattern of the different classes of characters between them or in relation to linear geographic distance among populations. When taken together, the set of obtained results support the current specific status of the populations from both margins of the Tapajós River and reveal an early stage of an allopatric speciation process related to the transposition of this riverine barrier. / Na bacia Amazônica, a distribuição de muitas espécies de vertebrados terrestres é delimitada por grandes rios, os quais são frequentemente considerados barreiras biogeográficas fortemente relacionadas à origem e manutenção da alta biodiversidade encontrada na região. No entanto, são poucas as investigações filogeográficas que avaliam o efeito dessas barreiras em múltiplas classes de caracteres genotípicos e fenotípicos. Até o momento, nenhuma investigação multicaráter foi dedicada a um sistema de estudo envolvendo o Rio Tapajós, o qual delimita áreas de endemismo do bioma. Neste estudo testamos a atuação dessa barreira fluvial sobre a variabilidade genética, acústica e morfológica em populações do anuro Allobates tapajos (Dendrobatidae). Para isso, amostramos populações ao longo de toda a área de ocorrência conhecida da espécie em ambas as margens das porções média e baixa do rio. Foram obtidos fragmentos de genes mitocondrial (16S) e nuclear (RAG1), bem como medidas morfométricas externas e parâmetros acústicos do canto de anúncio a partir de 48 indivíduos provenientes de seis localidades. Enquanto o marcador nuclear se mostrou monomórfico ao longo da distribuição de A. tapajos, o fragmento mitocondrial revelou baixas distâncias genéticas acompanhadas de elevada estruturação espacial, com ausência de compartilhamento de haplótipos entre margens opostas do rio. Os eventos cladogenéticos estiveram concentrados no Pleistoceno, época proposta para o estabelecimento da drenagem do rio Tapajós. Houve divergência em parâmetros acústicos entre margens do rio, o que não foi observado em relação aos marcadores morfológicos analisados. Adicionalmente, não houve correlação entre o padrão de variabilidade das diferentes classes de caracteres entre si nem com a distância geográfica linear entre populações. Desse modo, o conjunto de resultados obtidos suporta o atual status específico das populações de ambas as margens do rio Tapajós e revela um estágio incipiente do processo de especiação em alopatria relacionado com a transposição dessa barreira fluvial.

A Amazônia abriga uma grande parcela da biodiversidade mundial, no entanto, existem grandes incertezas sobre os processos de geração e manutenção dessa enorme diversidade, com várias hipóteses propostas até o momento. Diversas características como tamanho pequeno, baixa capacidade de dispersão e fidelidade ao ambiente estritamente florestal fazem de lagartos do gênero Loxopholis (Squamata: Gymnophthalmidae) candidatos ideais para rastrear a história de modificações da paisagem no norte da América do Sul durante o Neogeno. Nesta tese, revisamos a variação morfológica, taxonomia e a distribuição geográfica das espécies do gênero Loxopholis, assim como estimamos as relações filogenéticas e o tempo de divergência entre as espécies com base em sequências de DNA provenientes do genoma mitocondrial e nuclear. Com essa base de dados, construímos um modelo de como ocorreu a história evolutiva de Loxopholis, discutindo os resultados a partir de reconstruções geológicas provenientes da literatura, e fornecendo uma datação independente para eventos geológicos que potencialmente influenciaram a história evolutiva do gênero. Neste estudo, também revelamos que a atual diversidade descrita para Loxopholis está severamente subestimada. Encontramos que a espécie L. osvaldoi representa um complexo de espécies crípticas, contendo de 8 a 14 potenciais espécies novas, com profundas divergências genéticas tanto nos genomas mitocondrial e nuclear, praticamente dobrando a diversidade conhecida no gênero. No entanto, a morfologia em Loxopholis é extremamente conservada, dificultando a diagnose das espécies novas. Finalmente, descrevemos a primeira população bissexual da espécie partenogenética L. percarinatum, discutindo as implicações deste achado para o entendimento relativo a aparição da partenogênese em Loxopholis / The Amazon rainforest houses a significant portion of the world biodiversity, however, there is still a lot of uncertainty about the processes involved in its generation and maintenance, with several hypotheses proposed so far. Loxopholis lizards (Squamata: Gymnophthalmidae) are small-sized; show low vagility, and high fidelity to the humid forest environment, making them ideal to test hypotheses on the history of landscape modifications in Northern South America, during the Neogene. In this thesis, we revise the morphological variation, the taxonomy, and the geographic distribution of Loxopholis species, as well as estimated a phylogenetic hypothesis and divergence times for these species based on sequences from mitochondrial and nuclear DNA. With this dataset, we build a model for the evolutionary history of Loxopholis and compared the results with geologic reconstructions of the Amazon available in the literature, which provided independent time estimates for geological events that potentially affected the evolutionary history of genus. In this study, we also showed that the actual diversity described for Loxopholis was severely underestimated. We found that L. osvaldoi represents a complex of cryptic species with 8-14 potential new species, and strong divergences in both the mitochondrial and the nuclear genomes, virtually doubling the actual diversity in the genus. Finally, we describe the first bisexual population for the parthenogenetic species L. percarinatum, discussing its implications to the origin of parthenogenesis in the genus