Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-10-10T13:11:28Z No. of bitstreams: 1 DissJLO.pdf: 1924288 bytes, checksum: 2b2ce6a9b82a3dfb41ddb5f343fde1b7 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T19:39:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissJLO.pdf: 1924288 bytes, checksum: 2b2ce6a9b82a3dfb41ddb5f343fde1b7 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T19:39:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissJLO.pdf: 1924288 bytes, checksum: 2b2ce6a9b82a3dfb41ddb5f343fde1b7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-20T19:39:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissJLO.pdf: 1924288 bytes, checksum: 2b2ce6a9b82a3dfb41ddb5f343fde1b7 (MD5) Previous issue date: 2014-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / The genus Anastrepha (Tephritidae) has several species of great economic importance due to their impact in fruticulture. We are particularly interested in the evolutionary history of Anastrepha fraterculus, the most relevant species in the closely related group of species fraterculus, which has undergone recent divergence and holds the majority of species of economic importance in the genus. To better understand the differentiation process and identification in the group, we need to find molecular and morphological markers that are involved with the differences between species. Reproductive genes have, in general, been very informative in this regard due to their rapid evolutionary rates, although few of them have been studied and characterized in this species so far. Therefore, the present study focuses on the exuperantia gene (exu), which participates in both oogenesis (localization of bicoid and oskar mRNAs) and spermatogenesis, since exu embryos from mutant mothers are unviable and males are sterile. Thus, the first step was to use Next generation sequencing strategies (RNA-seq) to structurally characterize and define expression patterns of this gene between sexes in the cephalic and reproductive tissues of A. fraterculus. A. fraterculus has similar structural and expression patterns to Drosophila melanogaster in reproductive tissues, in which the transcripts differ between sexes for the 5’ and 3’ untranslated regions (UTRs). We describe for the first time the expression of exu in cephalic tissues, involving a new isoform that is common to both sexes. All these alternative spliced transcripts share a common coding region, resulting in the same protein. We used the exu coding region, along with sequences from several Diptera to investigate the molecular evolution of exu in Cyclorrhapha. This group has experienced an enormous adaptive radiation, associated with molecular and morphological changes, and by comparing the dN/dS ratio between Cyclorrhapha and other Diptera we found that exu was subjected to positive selection in Cyclorrhapha for at least two sites in the coding region. One of the sites is present in the RNA exonuclease-like domain of exu. The second site is located in a not characterized region that is conserved and under purifying selection in Diptera, suggesting that it may be an important region of the protein. The adaptive changes found in exu may reflect an evolutionary gain that allowed its co-option for a new function the gene performs in Cyclorrhapha: the localization of bicoid in the anterior region of the oocyte, since bcd is a gene exclusive of Cyclorrhapha. / O gênero Anastrepha (Tephritidae) é de grande importância econômica devido ao seu impacto na fruticultura nacional. Estudamos aqui a história evolutiva de Anastrepha fraterculus, a espécie mais relevante do grupo fraterculus, o qual sofreu divergência recente e contém a maioria das espécies de importância econômica do gênero. Para entender melhor o processo de especiação nesse grupo, e auxiliar no processo de identificação taxonômica, precisamos estabelecer marcadores morfológicos e moleculares envolvidos com as diferenças entre as espécies. Genes envolvidos com a reprodução têm se mostrado bastante informativos para estes propósitos, devido às rápidas taxas evolutivas que apresentam, embora poucos tenham sido estudados e caracterizados nessas espécies até o momento. Nesse sentido, esse trabalho tem como foco o gene exuperantia (exu), que participa tanto da ovogênese (localização dos mRNAs bicoid e oskar) quanto da espermatogênese, uma vez que embriões formados a partir de fêmeas mutantes exu são inviáveis e machos mutantes exu são estéreis. Assim, o primeiro passo foi caracterizar estruturalmente e definir padrões de expressão desse gene entre os sexos nos tecidos cefálicos e reprodutivos em A. fraterculus. Utilizando sequenciamento de próxima geração (RNA-seq), identificamos um padrão estrutural e de expressão semelhante àquele de Drosophila melanogaster em tecidos reprodutivos: os transcritos diferem nas regiões não traduzidas (UTRs) 5’ e 3’ entre os sexos. Pela primeira vez identificamos a expressão de exu em tecidos cefálicos, envolvendo uma nova isoforma que é igual nos dois sexos. Em todos os casos, as regiões codificadoras são iguais, resultando na sequência proteica. Utilizamos essa região codificadora de exu junto com sequências de outras espécies de Diptera para investigar a evolução molecular de exu em Cyclorrhapha, que sofreu uma grande radiação adaptativa associada com alterações morfológicas e moleculares. Comparando a relação dN/dS entre Cyclorrhapha e outros Diptera, encontramos dois sítios sob seleção positiva em Cyclorrhapha, um deles presente no domínio semelhante à RNA exonuclease de exu. O segundo está presente em uma região não caracterizada para domínios proteicos, mas que é bem conservada e está sob seleção purificadora em Diptera, sugerindo ser uma região importante da proteína. As mudanças adaptativas encontradas em exu podem refletir um ganho evolutivo que permitiu sua co-optação para uma nova função em Cyclorrhapha: a de localização de bicoid na região anterior do ovócito, visto que bcd é um gene exclusivo de Cyclorrhapha.

Submitted by Aelson Maciera (aelsoncm@terra.com.br) on 2017-05-16T18:52:20Z No. of bitstreams: 1 DissMRS.pdf: 2504914 bytes, checksum: 996d118fd641f9218c27c0deeefbb963 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-05-18T20:19:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissMRS.pdf: 2504914 bytes, checksum: 996d118fd641f9218c27c0deeefbb963 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-05-18T20:20:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissMRS.pdf: 2504914 bytes, checksum: 996d118fd641f9218c27c0deeefbb963 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-01T13:02:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissMRS.pdf: 2504914 bytes, checksum: 996d118fd641f9218c27c0deeefbb963 (MD5) Previous issue date: 2011-10-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The fruit flies (Anastrepha sp) are organisms endemic to the Neotropics that are similar morphologically but present some behavioral, reproductive and molecular variations. Among these insects we can highlight the fraterculus group, which consists of a set of cryptic species, between them Anastrepha oblique, that represents threats to national fruit culture. The effective control of this grouping requires the expansion of the few studies concerning to the biology and history of populations which has a very complex systematic. Previous works suggest a high rate of evolution of genes related to reproductive issues and recognition of partners due to the high selective pressures involved in that relationship, hence, we chose to work with the fruitless gene which is recognized for its role in sexual differentiation and male courtship behavior in dipteran insects. Since a small region of this gene was already been amplified in our laboratory, we amplified and described the flanking sequences by RACE-PCR technique which used primers constructed targeting the 5 'and 3' ends. We used cDNA libraries produced from the extraction of mRNAs from different stages of development of these organisms enabling the identification of different isoforms arising from alternative splicing and structural characterization of the coding region (CDS) common to both sexes. We compared the data generated with the corresponding sequences of the fruitless gene in other insect species identifying the rate of similarity for nucleotides and amino acids (identity ratio) which revealed that the éxons coding for specific domains such as BTB and Zinc Fingers tend to remain more conserved in relation to other regions and éxons from Connector Region. Subsequently, we performed positive selection tests through the Relaxed Branch-site test and Strict Branch-site test, which were contrasted by Likelihood Ratio Tests (LRT) which identified 25 new sites evolving under positive selection, corroborating the findings of Sobrinho e de Brito (2010) and suggesting the presence of these forces on specific regions of this important gene linked to reproductive aspects of several major groups of insects. / As moscas-das-frutas (Anastrepha sp) são organismos endêmicos da região neotropical que apesar de serem semelhantes morfologicamente distinguem-se por variações comportamentais, reprodutivas e moleculares. Entre esses insetos podemos destacar o grupo fraterculus o qual é composto por um conjunto de espécies crípticas, entre elas Anastrepha obliqua, que representam ameaças à fruticultura nacional. O controle eficiente deste agrupamento exige a ampliação dos ainda escassos estudos referentes à biologia e história das populações cuja sistemática tem se mostrado bastante complexa. Trabalhos anteriores sugerem uma alta taxa evolutiva agindo sobre genes relacionados a aspectos reprodutivos e reconhecimento de parceiros devido as elevadas pressões seletivas envolvidas nessa relação, para tanto, escolhemos trabalhar com o gene fruitless por sua reconhecida importância na diferenciação sexual e comportamento de corte nos machos nos insetos dípteros. Uma vez que dispúnhamos de uma pequena região já amplificada deste gene em nosso laboratório, amplificamos as sequências flanqueadoras através da técnica de RACE-PCR que utilizou primers construídos e orientados para as extremidades 5´ e 3´. Foram utilizadas bibliotecas de cDNAs produzidas a partir da extração de mRNAs de diferentes estágios de desenvolvimento desses organismos possibilitando a identificação de diferentes isoformas provenientes de splincing alternativo e caracterização estrutural da região codificadora (CDS) comum a ambos os sexos. Comparamos os dados gerados com as sequencias correspondentes do gene fruitless em outras espécies de insetos identificando sua taxa de identidade nucleotídica e de aminoácidos as quais revelaram que os éxons que codificam domínios específicos como BTB e Zinc Fingers tendem a se manter mais conservados em relação às demais regiões e aos éxons da Região Conectora. Posteriormente, realizamos testes de seleção positiva conhecidos como Relaxed Branch-site test e Strict Branch-site test, os quais foram contrastados pelo Likelihood Ratio Test e possibilitaram a identificação de 25 novos sítios evoluindo sob seleção positiva, corroborando as descobertas de Sobrinho e de Brito (2010) e sugerindo a atuação dessas forças sobre regiões específicas deste importante gene ligado aos aspectos reprodutivos de diversos grupos principais de insetos.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-15T10:50:25Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1856190 bytes, checksum: 405040c338d9d0453f53e6b127a24ccd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T10:50:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1856190 bytes, checksum: 405040c338d9d0453f53e6b127a24ccd (MD5) Previous issue date: 2016-03-29 / O Brasil está entre os maiores produtores de frutas do mundo, ocupando a terceira posição no ranking, com produção anual de 40 milhões de toneladas. O Vale de São Francisco manteve em 2014 o patamar de 85% das exportações brasileiras de manga. Entre as frutas, a manga apresenta produção nacional ascendente, com quase 1,2 milhão de toneladas em 2014. Entre os obstáculos, a maior participação do setor no mercado internacional está nos aspectos fitossanitários, principalmente as moscas- das-frutas (Diptera: Tephritidae). O objetivo deste trabalho foi analisar a flutuação populacional de moscas-das-frutas em pomares comerciais de mangueira, bem como estudar a influência dos fatores abióticos na flutuação populacional. A partir dos resultados, discute-se a viabilidade de ampliação do número de propriedades aptas a exportar mangas in natura para países que exigem que os frutos sejam oriundos de Áreas de Baixa Prevalência de Pragas (ABPP). O estudo foi desenvolvido a partir de dados coletados de 2009 a 2014 em 44 pomares comerciais de manga localizados nos Projetos de Irrigação Senador Nilo Coelho, Maria Tereza e Bebedouro, em Petrolina, PE. A espécie exótica Ceratitis capitata (Wiedemann) (Diptera: Tephritidae) foi detectada em todos os pomares estudados, e os dados sugerem que ela tenha deslocado as espécies nativas do gênero Anastrepha (Diptera: Tephritidae). A população apresentou níveis elevados em todas as áreas monitoradas, principalmente de outubro a janeiro, em todos os períodos estudados. A temperatura e a umidade relativa influenciaram fortemente a captura de insetos adultos, em que a temperatura apresentou correlação positiva e a umidade, correlação negativa. A população de C. capitata esteve em níveis acima do admitido para implantação de ABPP, de forma que o aumento de exportações de manga para mercados mais exigentes dependerá grandemente da execução de um programa para supressão da população. / Brazil is a major fruit grower worldwide, occupying the third position and harvesting 40 x 106 ton. In 2014, Sao Francisco Valley responded for 85% of mango exports of the country. Mango production is going through a period of increase in production and approximately 1.2 million tons were harvested in 2014. Phytosanitary measures are major constraints to export, mainly those established to avoid the entry of fruit flies (Diptera: Tephritidae). This work aimed to analyse the population fluctuation of fruit flies in commercial mango orchards, as well as study the influence of abiotic factors in population density. The feasibility of increasing the number of properties certified according to international standards of areas of low pest prevalence (ALPP) is discussed, as this is a measure established by several international markets. Data gathered from 2009 to 2014 for 44 commercial orchards in the districts Senador Nilo Coelho, Maria Tereza, and Bebedouro, in Petrolina, PE, were used. The exotic species Ceratitis capitata (Wiedemann) (Diptera: Tephritidae) was detected in all orchards and data suggest that it may have displaced the native species of the genus Anastrepha (Diptera: Tephritidae). Population density was high in all considered areas, mainly from October to January. Temperature and relative humidity had significant impact on population density, the former showing a positive correlation and the later, a negative one. C. capitata population was higher than the threshold implementation in standards for LPPA so that the increase of mango exports for more restrictive countries will largely depend on the conduction of a suppression program. / Não foi localizado o currículo lattes do autor.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-08-22Bitstream added on 2014-06-13T20:34:27Z : No. of bitstreams: 1 coelho_lr_me_botfca.pdf: 1636844 bytes, checksum: 7fc617dcff6a3039cec91cfdc0f7565a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho teve por objetivos buscar alternativas às tradicionais sacolas de papel manteiga, buscando proteção segura aos ataques de insetos-praga e pássaros, maior facilidade no momento da colheita de pêssegos, e verificando também o custo e a praticidade das embalagens. O trabalho foi realizado no Sítio Santa Maria, no município de São Luis do Paraitinga, SP, durante o período de agosto a novembro de 2006, em um pomar comercial de pêssego do cultivar Aurora 2 , de três anos de idade, conduzido em sistema de vaso moderno e espaçamento de 6 x 4 m. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados, onde cada planta foi considerada um bloco, utilizando-se 15 tratamentos, 8 repetições (blocos) e 10 frutos por tratamento. Os tratamentos foram os seguintes: T1 - Sacolas de TNT branco de 45 Gramaturas por m2 (45G/m2) fechado, T2 - Sacolas de TNT branco de 45 Gramaturas por m2 (45G/m2) aberto, T3 - Sacolas de TNT branco de 20 Gramaturas por m2 (20G/m2) fechado; T4 - Sacolas de TNT branco de 20 Gramaturas por m2 (20G/m2) aberto; T5 - Sacolas de polipropileno microperfurado transparente (furos de 1mm) fechado; T6 - Sacolas de polipropileno microperfurado transparente (furos de 1mm) aberto; T7 - Sacolas de polipropileno microperfurado 2 transparente (furos de 2mm) fechado; T8 - Sacolas de polipropileno microperfurado transparente (furos de 2mm) aberto; T9 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 1mm) fechado; T10 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 1mm) aberto; T11 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 2mm) fechado; T12 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 2mm) aberto; T13 - Sacolas de papel impermeável fechado; T14 - Sacolas de papel impermeável aberto; T15 - Testemunha (sem ensacamento). Os resultados mostraram que o ensacamento não influenciou... / This research aimed to look for alternative bags that could offer protection against fruit-flies and oriental moth attack, offer easy procedure at the harvesting time of peach crops and verify two aspects referred to the bags: the practicability and the cost. The work was conducted at Santa Maria Farm in São Luis do Paraitinga County (São Paulo State), from August to November of 2006, in a tree-year-old peach crop. The cultivar Aurora 2 was conducted in modern vase system with 6m between rows and 4 m between plants. The experimental design followed randomized block, where each plant was considered one block. There were 15 treatments, 8 replications (blocks) and 10 fruits per treatment. The treatments were: T1 - white and closed TNT (tissue non-tissue) bag (45g/m2), T2 - white and opened TNT bag (45g/m2), T3 - white and closed TNT bag (20g/m2), T4 - white and opened TNT bag (20g/m2), T5 - transparent polypropelene microperfurated and closed bag (1mm of diameter), T6 - transparent polypropelene microperfurated and opened bag (1mm of diameter), T7 - transparent polypropelene microperfurated and closed bags (2mm of diameter), T8 - transparent polypropelene microperfurated and opened bag (2mm of diameter), T9 - milky microperfurated polyetilene and closed bag (1mm of diameter), T10 - milky microperfurated polyetilene and opened bag (1mm of diameter), T11 - milky microperfurated polyetilene and closed bag (2mm of diameter), T12 - milky microperfurated polyetilene and opened bags (2mm of diameter), T13 - closed and waterproof paper bag, T14 opened and waterproof paper bag, T15 - check treatment (unbagging fruits). The results showed that bagging did not influenced chemical fruits characteristics, such as, pH, soluble solid contents (SS), titratable acidity (TA), SS/TA ratio, however, produced reasonable bigger and havier fruits. The fruit epiderm color was influenced by baging... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2667.pdf: 1236621 bytes, checksum: 9702ce62be0433e7639201366d6444aa (MD5) Previous issue date: 2009-06-30 / Financiadora de Estudos e Projetos / Species of the fraterculus group are associated to the biggest damages to fruit crops due to the fact that they attack indiscriminately green and ripe fruits, making them pests of great economic importance. These species are hard to tell apart, even showing some potential criptic species. The understanding of the populational structure and biology of this species group is of paramount importance to strategies of management and control of these pests. Here, we investigate variation on the gene yolk em 37 individuals sampled throughout the species distribution in Brazil seeking to better understand the populational structure of this species group in Brazil. Our data indicated existence of recombination, which lead us to analyze three different regions in the gene, 5 , mid, and 3 . These regions show high levels of nucleotide diversity intra and interspecifically for all three gene regions investigated. The use of Nested Clade Phylogenetic Analysis independently used on these regions indicate two main results that occurred more than one throughout our analyses. The first is a range expansion from north-NE populations towards the south, mostly related to specimens of Anastrepha fraterculus. The second common event, detected eight times, is restricted gene flow with isolation by distance (IBD). Dating of such events indicated that they are temporarily congruent which might indicate that the lack of IBD in other levels of the analysis might be caused either by sampling limitations or an excess of local gene flow that tampers out as we move farther in space. Our results of the gene yolk have provided us with a better understanding of the levels of local variation of this marker of for the species that may help us determine the evolutionary processes that shaped the species group current distribution. / Espécies do grupo fraterculus estão relacionadas com os maiores danos a culturas de frutas carnosas por atacar frutos verdes e maduros indistintamente, o que as torna pragas de grande importância econômica. Contudo, estas espécies são de difícil distinção, com a existência potencial de diversas espécies crípticas. Dessa forma, o entendimento da biologia e, particularmente, da estrutura populacional desses insetos-praga tem grande importância para o desenvolvimento de novas estratégias de manejo. Neste trabalho, investigamos a variação no gene yolk em 37 indivíduos ao longo da distribuição do grupo no Brasil para conhecermos melhor o padrão estrutural das espécies do grupo fraterculus. Os dados indicam a existência de recombinação, de forma que analisamos a região amplificada separadamente por regiões distintas: 5 , mid e 3 . Análises de polimorfismos nestas regiões apontaram para altos valores de diversidade nucleotídicas intra e interespecíficas para as três regiões gênicas em questão, sendo estes valores maiores para a região 3 . A metodologia da Análise dos Clados Aninhados (NCPA) foi utilizada para inferências de possíveis relações entre a configuração das redes haplotípicas com o padrão de distribuição geográfica considerando estas três regiões distintas. Através do uso desta metodologia, observamos dois eventos principais que podem estar influenciando a distribuição das espécies do grupo fraterculus no território nacional. A primeira inferência refere-se à expansão populacional no sentido Centro-Sul do Brasil, referente preferencialmente à espécie Anastrepha fraterculus. O segundo evento de inferência indica fluxo gênico restrito com isolamento por distância ao longo da distribuição global dos espécimes amostrados. A datação destes eventos indica uma congruência temporal, o que pode indicar que a não ocorrência de fluxo gênico em clados inferiores possa estar associado a restrições amostrais, uma vez que nossa amostragem é de fato restrita. Além disso, em populações mais próximas, o fluxo gênico pode estar ocorrendo com freqüência suficiente para promover a homogeneização genética das populações. Os resultados obtidos mediante a análise das seqüências do gene yolk nos permitiu um melhor conhecimento àcerca dos níveis de variação referentes a esse marcador, bem como determinar os processos que possam estar envolvidos no padrão de distribuição atual das espécies do grupo fraterculus no território nacional.

Este estudo foi conduzido em áreas remanescentes da Mata Atlântica, Reserva Natural da Companhia Vale do Rio Doce e Floresta Natural de Goytacazes (áreas preservadas), e em pomares comerciais de papaia (áreas alteradas), no município de Linhares, Estado do Espírito Santo. Os principais objetivos foram analisar comparativamente a diversidade, a abundância e o padrão de distribuição das espécies de moscas-das-frutas nesses dois hábitats (alterados e preservados), observando o impacto da mudança ambiental em relação à diversidade de espécies, além disso, verificar a associação das espécies de moscas-das-frutas com as plantas hospedeiras nativas. As moscas-das-frutas foram coletadas em armadilhas plásticas tipo McPhail com atrativo alimentar (proteína hidrolisada) por um período de cinco anos (outubro/2001 a setembro/2006). Nos remanescentes da Mata Atlântica, foram capturados 14 exemplares (machos e fêmeas) de Ceratitis capitata e 6.281 fêmeas de Anastrepha, sendo identificadas 22 espécies, além de cinco espécies possivelmente não-descritas. Nos pomares comerciais de papaia, foram capturados 30 exemplares (machos e fêmeas) de C. capitata e apenas 330 fêmeas de Anastrepha, pertencentes a 14 espécies. A diferença nos valores dos dois parâmetros (riqueza de espécies e abundância) refletiu nos valores do índice de diversidade de Margalef, que diferiram estatisticamente nos dois hábitats. Os resultados sugerem que as mudanças na vegetação nativa para uma área de cultivo provocaram impacto na diversidade, na abundância e na distribuição das comunidades de moscas-das-frutas. O levantamento de plantas hospedeiras de moscas-das-frutas foi realizado na Reserva Natural da Vale do Rio Doce, durante três anos e cinco meses (fevereiro/2003 a julho/2006). Foram coletadas 330 amostras de frutos de plantas nativas, representando 253 espécies de 51 famílias. Myrtaceae foi a família mais diversificada com 55 espécies amostradas. Vinte e oito espécies, pertencentes a dez famílias, foram hospedeiras de dez espécies de Anastrepha e de C. capitata. Entre 33 associações observadas entre moscas-das-frutas e plantas hospedeiras, 23 foram registros inéditos. Além disso, foram detectadas pela primeira vez as plantas hospedeiras de A. fumipennis Lima e de A. nascimentoi Zucchi. / The study was undertaken in the Natural Reserve of Vale do Rio Doce and the Natural Reserve of Goytacazes, remnants of the Atlantic Rain Forest (preserved areas), and in three papaya commercial orchards (disturbed areas), all areas located in Linhares county in the state of Espírito Santo. The main objectives of this study were to compare the diversity, abundance and distribution pattern of fruit fly species in these habitats (preserved and disturbed), observing the impact of environmental modifications in relation to species diversity, besides to find out fruit fly-native host plant associations. Fruit flies were collected with plastic McPhail traps baited with hydrolised protein over a five-year period (October/2001 to September/2006). Fourteen specimens of Ceratitis capitata (males and females) and 6,281 females of Anastrepha belonging to 22 species, besides five probably undescribed ones, were captured in the remnants of the Atlantic Rain Forest. In the papaya commercial orchards, 30 specimens of C. capitata (males and females) and only 330 females of Anastrepha were captured. The difference of the two parameter values, species richness and abundance, reflects on Margalef's index values, which were statistically different in both habitats. Results suggest that modifications of native vegetation in an agricultural area can cause impact on both the diversity and distribution of fruit fly assemblages. An approximately three and a half years' host survey (February/ 2003 to July/ 2006) was undertaken in the Natural Reserve of Vale do Rio Doce. A total of 330 samples of native plant fruits, representing 253 species from 51 plant families was collected. Myrtaceae was the most diversified plant family with 55 species sampled. Twenty eight plant species from ten plant families were found as host-plants of ten species of Anastrepha as well as of C. capitata. Among these 33 associations, 23 were new records. Furthermore, the first records of a host plant for A. fumipennis Lima and A. nascimentoi Zucchi were detected.

Resumo: O presente trabalho teve por objetivos buscar alternativas às tradicionais sacolas de papel manteiga, buscando proteção segura aos ataques de insetos-praga e pássaros, maior facilidade no momento da colheita de pêssegos, e verificando também o custo e a praticidade das embalagens. O trabalho foi realizado no Sítio Santa Maria, no município de São Luis do Paraitinga, SP, durante o período de agosto a novembro de 2006, em um pomar comercial de pêssego do cultivar Aurora 2 , de três anos de idade, conduzido em sistema de vaso moderno e espaçamento de 6 x 4 m. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados, onde cada planta foi considerada um bloco, utilizando-se 15 tratamentos, 8 repetições (blocos) e 10 frutos por tratamento. Os tratamentos foram os seguintes: T1 - Sacolas de TNT branco de 45 Gramaturas por m2 (45G/m2) fechado, T2 - Sacolas de TNT branco de 45 Gramaturas por m2 (45G/m2) aberto, T3 - Sacolas de TNT branco de 20 Gramaturas por m2 (20G/m2) fechado; T4 - Sacolas de TNT branco de 20 Gramaturas por m2 (20G/m2) aberto; T5 - Sacolas de polipropileno microperfurado transparente (furos de 1mm) fechado; T6 - Sacolas de polipropileno microperfurado transparente (furos de 1mm) aberto; T7 - Sacolas de polipropileno microperfurado 2 transparente (furos de 2mm) fechado; T8 - Sacolas de polipropileno microperfurado transparente (furos de 2mm) aberto; T9 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 1mm) fechado; T10 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 1mm) aberto; T11 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 2mm) fechado; T12 - Sacolas de polietileno microperfurado leitoso (furos de 2mm) aberto; T13 - Sacolas de papel impermeável fechado; T14 - Sacolas de papel impermeável aberto; T15 - Testemunha (sem ensacamento). Os resultados mostraram que o ensacamento não influenciou... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This research aimed to look for alternative bags that could offer protection against fruit-flies and oriental moth attack, offer easy procedure at the harvesting time of peach crops and verify two aspects referred to the bags: the practicability and the cost. The work was conducted at Santa Maria Farm in São Luis do Paraitinga County (São Paulo State), from August to November of 2006, in a tree-year-old peach crop. The cultivar Aurora 2 was conducted in modern vase system with 6m between rows and 4 m between plants. The experimental design followed randomized block, where each plant was considered one block. There were 15 treatments, 8 replications (blocks) and 10 fruits per treatment. The treatments were: T1 - white and closed TNT (tissue non-tissue) bag (45g/m2), T2 - white and opened TNT bag (45g/m2), T3 - white and closed TNT bag (20g/m2), T4 - white and opened TNT bag (20g/m2), T5 - transparent polypropelene microperfurated and closed bag (1mm of diameter), T6 - transparent polypropelene microperfurated and opened bag (1mm of diameter), T7 - transparent polypropelene microperfurated and closed bags (2mm of diameter), T8 - transparent polypropelene microperfurated and opened bag (2mm of diameter), T9 - milky microperfurated polyetilene and closed bag (1mm of diameter), T10 - milky microperfurated polyetilene and opened bag (1mm of diameter), T11 - milky microperfurated polyetilene and closed bag (2mm of diameter), T12 - milky microperfurated polyetilene and opened bags (2mm of diameter), T13 - closed and waterproof paper bag, T14 opened and waterproof paper bag, T15 - check treatment (unbagging fruits). The results showed that bagging did not influenced chemical fruits characteristics, such as, pH, soluble solid contents (SS), titratable acidity (TA), SS/TA ratio, however, produced reasonable bigger and havier fruits. The fruit epiderm color was influenced by baging... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Sarita Leonel / Coorientador: Wilson Badiali Crocomo / Banca: Regina Marta Evangelista / Banca: Adriana Mascarette Labinas / Mestre

Made available in DSpace on 2016-04-28T14:57:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Michela Rocha Leal.pdf: 1770488 bytes, checksum: ff08296ce37cf068a0dc9d932b804f1f (MD5) Previous issue date: 2008-07-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The government of Rio de Janeiro State is encouraging the expansion of fruit crops in the northern region of the State. However, data about ecological aspects of these insects necessary to their suitable management are not available for this region. With the introduction of the parasitoid Diachasmimorpha longicaudata in Brazil, open the perspective of biological control of theses flies. In this context, the present work has as general objectives to increase the knowledge about the geographic distribution of the fruit flies and their ecological aspects in the northern region of this state, and to evaluate the potential of D. longicaudata to biological control of theses flies in this region. These approaches were in the Chapters I and II, respectively. In the chapter I, the studies aimed to know the species of fruit flies of occurrence in the northern region of Rio de Janeiro state, their host plants and their parasitoids; to evaluated the susceptibility of guava variety Paluma to infestation by fruit flies; to characterize the population structure of these tephritids to determine the principal species of occurrence and to evaluate their diversity standard; and to determine the times of the year of higher and lower occurrence of these flies in the region. This study was carried out from April/2006 to May/2007 in Campos do Goytacazes, S?o Francisco do Itabapoana and S?o Jo?o da Barra, being the specimens captured by McPhail traps and collected from fruits. From the captured adults, 93% belong to the genus Anastepha (total of 16 species) and 7% of Ceratitis capitata. A. fraterculus, A. obliqua, A. pseudoparallela, A. serpentina, A. sororcula, A. zenildae and C. capitata infested fruits among 12 wild species. A. fraterculus, A. sororcula and A. zenildae infested guavas of variety Paluma. The populations of frui flies present low diversity of species due to presence of three predominant species: A. obliqua, A. fraterculus and A. sororcula, which occurred during all months of the year, with higher population levels between the summer and autumn due to the influence of higher availability of host fruits in these seasons of the year. The native parasitoids were Doryctobracon areolatus and Aganaspis pelleranoi. In the chapter II, the studies aimed to evaluate the survival capacity and action radius of D. longicaudata 24 hours after its release in the field; and to evaluate the recovered possibility of their offspring from guava samples. In May/2008, D longicaudata was released in a guava orchard in S?o Jo?o da Barra. Thereupon this release, 25 parasitism units containing larvae of C. capitata were spread at the guava trees at 10 m and 20 m from the released point. A sample of guavas was collected on the released day, and 24 hours after this release, another sample of guavas was collected at 30 m from this point. After 24 hour of the release, it was observed the visitation of D. longicaudata in the majority of the parasitism units. Male and female descendants of D. longicaudata were recovered form these parasitism units. A. fraterculus and A. sororcula infested the guavas, from which D. longicaudata was not recovered. / O governo do Estado do Rio de Janeiro vem incentivando a expans?o da fruticultura na regi?o norte do Estado, mas esta corre o risco de sofrer s?rios preju?zos devido ao ataque de moscas-das-frutas. Por?m, dados sobre aspectos ecol?gicos desses insetos, necess?rios para seu manejo adequado, n?o est?o dispon?veis para essa regi?o. Com a introdu??o do parasit?ide Diachasmimorpha longicaudata no Brasil, abre-se a perspectiva de controle biol?gico dessas moscas. Nesse contexto, o presente trabalho teve como objetivos gerais aumentar o conhecimento sobre a distribui??o geogr?fica das moscas-das-frutas seus aspectos ecol?gicos no norte fluminense, e avaliar o potencial de D. longicaudata para o controle biol?gico dessas moscas nessa regi?o, sendo esses temas abordados nos Cap?tulos I e II, respectivamente. No cap?tulo I, os estudos tiveram os seguintes objetivos: conhecer as esp?cies de moscas-das-frutas de ocorr?ncia no norte fluminense, suas plantas hospedeiras e seus parasit?ides; avaliar a susceptibilidade da goiaba variedade Paluma ? infesta??o por moscas-das-frutas; caracterizar a estrutura populacional desses tefrit?deos para determinar as principais esp?cies de ocorr?ncia e avaliar seu padr?o de diversidade; e determinar as ?pocas do ano de maior e menor ocorr?ncia dessas moscas na regi?o. Esse estudo foi conduzido de abril/2006 a maio/2007, em Campos dos Goytacazes, S?o Francisco do Itabapoana e S?o Jo?o da Barra, sendo os esp?cimes capturados por armadilhas McPhail e coletados de frutos. Dos adultos capturados, 93% pertencem ao g?nero Anastrepha (total de 16 esp?cies) e 7% ? Ceratitis capitata. A. fraterculus, A. obliqua, A. pseudoparallela, A. serpentina, A. sororcula, A. zenildae e C. capitata infestaram frutos entre 12 esp?cies silvestres. A. fraterculus, A. sororcula e A. zenildae infestaram goiabas da variedade Paluma. As popula??es de moscas-das-frutas apresentaram baixa diversidade devido ? presen?a de tr?s esp?cies predominantes: A. obliqua, A. fraterculus e A. sororcula, que ocorreram o ano todo, com maiores n?veis populacionais entre o ver?o e o outono, pela influencia da maior disponibilidade de frutos hospedeiros nessas esta??es do ano. Os parasit?ides nativos foram Doryctobracon areolatus e Aganaspis pelleranoi. No cap?tulo II, os estudos tiveram os seguintes objetivos: avaliar a capacidade de sobreviv?ncia e raio de a??o de D longicaudata 24 horas ap?s sua libera??o no campo; e avaliar a possibilidade de recupera??o de seus descendentes a partir de amostras de goiaba. Em maio/2008, realizou-se a libera??o de D longicaudata num pomar comercial de goiaba em S?o Jo?o da Barra. Logo ap?s a libera??o, 25 unidades de parasitismo contendo larvas de C. capitata foram distribu?das nas goiabeiras a 10 m e 20 m do ponto de libera??o. Uma amostra de goiabas foi coletada no dia da libera??o, e 24 horas ap?s, coletou-se outra amostra de goiabas a 30 m a partir desse ponto. Ap?s 24 horas da libera??o, verificou-se a visita??o de D. longicaudata na maioria das unidades de parasitismo. Recuperaram-se descendentes machos e f?meas de D. longicaudata a partir dessas unidades. A. fraterculus e A. sororcula infestaram as goiabas, das quais n?o foi recuperado D. longicaudata.

O Brasil é o maior produtor de laranjas do mundo, porém os problemas fitossanitários, como a incidência da mosca-das-frutas, vêm acarretando sérios impactos negativos de ordem sócio-econômica e ambiental. O município de Caraá, RS, está nos perímetros das regiões infestadas pela mosca-das-frutas, sendo a cultura da laranja a mais prejudicada por esse inseto. Para que o manejo da moscas-das-frutas seja eficiente e sustentável é interessante que o mesmo se baseie nos princípios da Agroecologia, requerendo um conhecimento prévio de vários aspectos que possibilitem o diagnóstico dessa praga. Nesse contexto, o presente estudo teve por objetivo contribuir para o controle da mosca-das-frutas nos pomares de laranjeiras do município de Caraá, RS. Para tanto, o trabalho foi dividido em duas grandes etapas. Na primeira etapa realizou-se o diagnóstico da incidência da mosca-dasfrutas nos pomares de laranjeiras do município de Caraá através da caracterização da área de estudo, da cultura da laranjeira e da incidência da mosca-das-frutas, demonstrando a espacialização das principais localidades produtoras de laranja. Utilizaram-se como fontes de pesquisa, bibliografias e entrevistas. Para a segunda etapa foi elaborado e aplicado na área de estudo um Plano de Manejo da mosca-das-frutas baseado na Agroecologia, onde foi proposto: o levantamento das moscas-das-frutas com quatro armadilhas, realizado no pomar experimental da localidade de Rio dos Sinos, Caraá, para identificar suas espécies, bem como para verificar as flutuações populacionais das moscas-das-frutas, estudando as variáveis que poderiam influenciar o tamanho destas populações; a amostragem de frutos nas principais localidades produtoras de laranjas para também identificar as espécies de moscas-das-frutas e/ou seus parasitóides, além de determinar a associação entre as espécies de plantas hospedeiras e as espécies de moscas-das-frutas; a aplicação de práticas de controle, como ensacamento dos frutos, por exemplo, realizado no pomar experimental. Após o período de estudo constatou-se que a variedade de laranja mais produzida no Caraá é a Valência. As principais localidades produtoras de laranjas são: Alto Caraá, Alto Lageadinho, Alto Rio dos Sinos, Fraga, e Rio dos Sinos. A área ocupada para o cultivo de laranjeiras é de aproximadamente 82,5 ha, e a produção média é de 290 toneladas. Em relação ao diagnóstico da incidência da mosca-das-frutas verificou-se que a infestação é resultante de um conjunto de fatores: diminuição dos inimigos naturais, conseqüente do uso desordenado de agroquímicos; precária fiscalização fitossanitária do trânsito de frutas frescas; desmatamento, o que favoreceu a migração dessas moscas para as laranjeiras; e ampla gama de hospedeiros de mosca-das-frutas. Através do monitoramento da mosca-das-frutas com armadilhas no pomar experimental de Rio dos Sinos, no período de 12 meses, foram obtidos apenas exemplares da espécie Anastrepha fraterculus, num total de 1021 fêmeas. O pico da flutuação populacional da A. fraterculus ocorreu no mês de outubro, provavelmente relacionado à oferta de laranjas, pois o período de maior captura coincide com a época de frutificação da laranja Valência. A manutenção dessa mosca nos outros meses do ano pode ser associado à presença de hospedeiros de A. fraterculus próximos ao pomar experimental. A flutuação populacional da mosca não correlacionou com nenhum parâmetro climático analisado. O levantamento dos frutos hospedeiros Psidium guayava (goiaba), Citrus sp. (Laranja-de-Umbigo) e Prunus persica (pêssego) localizados próximos ao pomar experimental permitiu associar tais frutas com a espécie A. fraterculus. No levantamento da mosca-das-frutas através da amostragem de frutos nas principais localidades produtoras de laranjas de Caraá verificou-se: a presença de nove moscas-das-frutas, todas da espécie Anastrepha fraterculus; a associação dessa espécie com as variedades de laranjas, Natal Umbigo e Valência, bem como a ausência de parasitóides nos frutos amostrados. A prática de ensacamento das laranjas realizada no pomar experimental de Rio dos Sinos, Caraá, mostrou-se muito eficiente, uma vez que praticamente todos os frutos ficaram protegidos da mosca, sendo colhidos intactos. / Brazil is the largest producer of oranges of the world, however fitosanitary problems, as the incidence of fruit flies is carting serious negative impacts of socioeconomic and environmental order. The Municipal district of Caraá, RS, is in the perimeters of the areas infested by fruit flies, having the culture of the orange the most prejudiced by this insect. So that the handling of fruit flies is efficient and maintainable needs to base in the beginnings of the Agroecology, requesting a previous knowledge of several aspects to make possible the diagnosis of that curse. In that context the present study had for objective to contribute for the control of fruit fly in the orchards of orange trees of the municipal district of Caraá, RS. For so much, the work was divided in two great stages. In the first stage the diagnosis of the incidence of fruit flies took place in the orchards of orange trees of the municipal district of Caraá through the characterization of the study area, the orange tree culture and the incidence of fruit flies, demonstrating the disposition in the space of the main places producing of orange. Bibliographies and interviews were used as research sources. For the second stage it was elaborated and applied in the study area a Plan of Handling of fruit flies based on Agroecology, where it was proposed: the rising of fruit flies with four traps, accomplished at the experimental orchard in Rio dos Sinos, Caraá, to identify its species, as well as to verify the population flotations of fruit flies, studying the variables that could influence the size of these populations; the sampling of fruits in the main places producing of oranges for also to identify the species of fruit flies and/or their parasitoids, besides determining the association between the species of host trees and the species of fruit flies; the application of control practices, as bagged fruits, for instance, accomplished at the experimental orchard. After the study period it was verified that the orange variety more produced in Caraá is Valencia. The main places producing of oranges are: High Caraá, High Lageadinho, High Rio dos Sinos, Fraga, and Rio dos Sinos. The busy area for the cultivation of orange trees is of 82,5 ha approximately, and the medium production is of 290 tons. In relation to the diagnosis of the incidence of fruit flies it was verified that the infestation is resulting from a group of factors: the natural enemies' decrease, consequent of the disordered use of pesticides; precarious fitosanitary fiscalization of the traffic of fresh fruits; deforestation, what favored the migration of those flies for the orange trees; and wide range of hosts of fruit flies. Through the action of monitoring the fruit flies with traps in the experimental orchard of Rio dos Sinos, in the period of 12 months, they were just obtained copies of the species Anastrepha fraterculus, in a total of 1021 females. The pick of the population flotation of the A. fraterculus happened in the month of October, probably related to the offer of oranges, because, the period of larger capture coincides with the time of fructify of the orange Valencia. The maintenance of that fly in the other months of the year it can be associated to the presence of hosts of A. fraterculus closed to the experimental orchard. The population flotation of the fly didn't correlate with any climatic parameter analyzed. The rising of the fruits hosts Psidium guayava (guava), Citrus sp. (Orange-of-navel) and Prunus persica (peach) located close to the experimental orchard, allowed to associate such fruits with the species A. fraterculus. In the rising of fruit flies through the sampling of fruits in the main places producing of oranges of Caraá was verified: the presence of nine fruit flies, all of the species Anastrepha fraterculus; the association of that species with the varieties of oranges Natal, Umbigo and Valencia, as well as the parasitoids absence in the fruits of sample. The practice of bagging oranges accomplished at the experimental orchard of Rio dos sinos, Caraá, was shown very efficient, once practically all of the fruits were protected of the fly, being picked intact.

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No. of bitstreams: 1 TeseEBC.pdf: 4307606 bytes, checksum: 49ebc853f6c4c152639d651f942f72b8 (MD5) Previous issue date: 2016-04-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Odorant-binding proteins (OBPs) are of great importance for survival and reproduction since they participate in initial steps of the olfactory signal transduction cascade, solubilizing and transporting chemical signals to the olfactory receptors. A comparative analysis of OBPs between closely related species may help explain how these genes evolve and are maintained under natural selection and how differences in these proteins can affect olfactory responses, and consequently lead to species differentiation. We studied OBP genes in the closely related species Anastrepha fraterculus and Anastrepha obliqua, which, albeit generalists, have different host preferences, using transcriptomes and real time quantitative PCR data. We identified 24 different OBP sequences from Anastrepha fraterculus and 25 from A. obliqua, which correspond to 21 Drosophila melanogaster OBP genes. Phylogenetic analysis separated Anastrepha OBPs sequences in four branches that represent four subfamilies: classic, minus-C, plus-C and dimer. We found evidence of positive selection in three classic subfamily genes OBP56h-1, OBP56h-2 e OBP57c and in the plus-C subfamily gene OBP50a, and at least one duplication event that preceded the speciation of these two species. Four positively selected sites putatively resulted in radical changes in amino acid properties. Inferences on tertiary structures of putative proteins from these genes revealed that at least one positively selected change involves the binding cavity (the odorant binding region) in the plus-C OBP50a, which is important because changes in the binding cavity could change OBPs specificity. Differential gene expression analysis at different reproductive stages showed that all nine OBP genes tested were significantly differentially expressed between A. fraterculus and A. obliqua at several reproductive profiles, but OBP56a, OBP56d, OBP57c and both OBP56h paralogs showed the highest differences in expression levels. The results generated in this study indicated that at least seven OBP genes may be involved in the A. fraterculus e A. obliqua differentiation, and in the fraterculus group differentiation as well. / As proteínas ligantes a odores (OBPs – odorant-binding proteins) são de grande importância para a sobrevivência e reprodução, pois participam do passo inicial da cascata de transdução dos sinais olfatórios, solubilizando e transportando os sinais químicos (odores e feromônios) até os receptores olfativos. A análise comparativa dos genes OBPs entre espécies próximas pode ajudar na compreensão de como o repertório desses genes é mantido sob seleção natural, além de fornecer informações acerca de como as diferenças observadas podem afetar as respostas olfatórias e, consequentemente, levar à diferenciação dessas espécies. Estudamos genes OBP em duas espécies-irmãs Anastrepha fraterculus e Anastrepha obliqua, as quais têm preferência por diferentes frutos hospedeiros, usando dados de transcriptomas e de PCR quantitativa. Identificamos 24 sequências OBP para A. fraterculus e 25 para A. obliqua, que corresponderam a 21 genes OBP de Drosophila melanogaster. Análises filogenéticas separaram as OBPs de Anastrepha em quatro ramos, que representam quatro subfamílias dessa família gênica: classic, minus-C, plus-C e dimer. Evidências de seleção positiva foram observadas nos genes da subfamília classic OBP56h-1, OBP56h-2 e OBP57c, e para o gene da subfamília plus-C OBP50a, e pelo menos um evento de duplicação gênica que precede a especiação dessas duas espécies. Quatro sítios selecionados positivamente resultavam em mudanças radicais nas propriedades dos aminoácidos. Inferências utilizando a estrutura terciária predita para essas OBPs revelaram que pelo menos um desses sítios faz parte da cavidade ligante ao odor de OBP50a, sendo que uma mudança nessa região pode alterar a especificidade de uma OBP. Análises de expressão por PCR quantitativa em diferentes estágios reprodutivos das moscas mostraram que todos os nove genes testados possuíam expressão gênica significativamente diferente entre A. fraterculus e A. obliqua para mais de um perfil reprodutivo, sendo que OBP56a, OBP56d, OBP57c e os dois parálogos OBP56h foram os que mais apresentaram diferenças entre as duas espécies. Todos os resultados gerados pelo presente trabalho indicam que pelo menos sete genes OBP podem estar envolvidos na diferenciação entre A. fraterculus e A. obliqua e, potencialmente, na diferenciação do grupo fraterculus. / FAPESP: 2012/17160-8. / CAPES: 99999.004252/2014-04