CAPES / A análise genética é uma ferramenta que pode auxiliar na busca de melhores índices zootécnicos na ovinocultura leiteria. Há muitos anos as curvas de lactação e a estimação dos componentes de variância dos parâmetros calculados a partir delas, vêm sendo utilizadas nas estratégias de manejo em fazendas leiteiras, pois é possível alterar o formato da curva de lactação por meio da seleção. No Brasil, há uma grande lacuna sobre conhecimento técnico relacionado aos ovinos leiteiros no país. A estimação dos parâmetros da curva de lactação e posterior estimação dos componentes de variância permitem um melhor entendimento dos componentes genético e ambiental que afetam a produção, antecipando as informações necessárias para a tomada de decisão sobre o direcionamento do manejo genético dos rebanhos. O objetivo do trabalho foi estimar os componentes de variância e os parâmetros genéticos dos componentes da curva de Wood em um rebanho de ovinos da raça Lacaune. Foram utilizadas 3558 informações de ovinos da raça Lacaune, e estimados os componentes de variância e os parâmetros genéticos dos parâmetros para a produção inicial (a), acréscimo até o pico (b), decréscimo após o pico (c), dia do pico (d), produção no pico (p), persistência (ln(s)) e produção total (y) da curva de Wood via estimação Bayesiana por meio do método de amostragem de Gibbs. A média estimada para os parâmetros a, b, c, d, p, ln(s) e y foram 0,362; 0,135; 0,032; 3,911; 1,703; 4,049; 76,249, respectivamente. As herdabilidades médias estimadas foram 0,41 (a), 0,47 (b), 0,50 (c), 0,11 (d), 0,30 (p), 0,36 (ln(s)) e 0,002 (y). As correlações fenotípicas e genéticas entre o parâmetro a e as demais variaram de -0,13 a 0,39 e -0,06 a 0,24, respectivamente. No parâmetro b variaram de - 0,002 a 0,17 e 0,04 a 0,15, parâmetro c de -0,01 a 0,11 e 0,04 a 0,10, parâmetro d de - 0,13 a 0,39 e -0,02 a 0,11, parâmetro p de -0,15 a 0,39 e -0,12 a 0,24, parâmetro ln(s) de -0,15 a 0,39 e -0,12 a 0,11, e para o parâmetro y variaram de -0,002 a 0,33 e 0,04 a 0,08. As repetibilidades identificadas foram 0,81 (a), 0,94 (b), 0,98 (c), 0,22 (d), 0,60 (p), 0,71 (ln(s)) e 0,003 (y). Conclui-se que as estimativas médias de herdabilidade e correlações identificadas evidenciaram um forte efeito ambiental afetando a expressão da característica produção de leite e baixas correlações genéticas entre os parâmetros da curva e a produção, indicando que a seleção pela produção de leite trará pouco ganho genético. Por outro lado, a seleção considerando todos os parâmetros da curva pode ser mais conveniente. Além disso, fica evidenciada a necessidade da padronização do manejo do rebanho. Devem ser elaborados estudos mais detalhados que permitam entender a relação dos parâmetros. O banco de dados pode ser trabalhado em outros períodos de lactação para um melhor conhecimento das estimativas dos componentes de variância. Seria de grande valia estudos sobre componentes principais e análise de trilha para posterior utilização no método de índice de seleção, para corroborar com a seleção que considera todos os parâmetros da curva. / Genetic analysis is a tool that can help in the search for better zootechnical indexes in dairy sheep breeding. For many years the lactation curves and the estimation of variance components of the parameters calculated from them have been used in management strategies in dairy farms since it is possible to change the shape of the lactation curve through selection. In Brazil, there is a large gap regarding technical knowledge related to dairy sheep in the country. The estimation of lactation curve parameters and subsequent estimation of the components of variance allow a better understanding of the genetic and environmental components that affect production, anticipating the information necessary for decision making on the direction of the genetic management of the herds. The aim of this work was to estimate the components of variance and the genetic parameters of the components of the Wood curve in a herd of Lacaune sheep. We used 3558 information from Lacaune sheep, and estimated the variance components and genetic parameters of the parameters for initial production (a), increase to peak (b), decrease after peak (c), peak day (d), peak production (p), persistence (ln (s)), and total production (y) of the Wood curve via Bayesian estimation using the Gibbs sampling method. The estimated mean for parameters a, b, c, d, p, ln (s) and y were 0.362, 0.135, 0.032, 3.911, 1.703, 4.049, 76.249, respectively. The estimated mean heritabilities were 0.41 (a), 0.47 (b), 0.50 (c), 0.11 (d), 0.30 (p), 0.36 (ln (s)) and 0.002 (y). The phenotypic and genetic correlations between parameter a and the others ranged from -0.13 to 0.39 and -0.06 to 0.24, respectively. In parameter b ranged from -0.002 to 0.17 and 0.04 to 0.15, parameter c of -0.01 to 0.11 and 0.04 to 0.10, parameter d of -0.13 to 0.39 and - 0.02 to 0.11, parameter p of -0.15 to 0.39 and -0.12 to 0.24, parameter ln (s) of -0.15 to 0.39 and -0.12 to 0.11, and for the parameter y ranged from -0.002 to 0.33 and 0.04 to 0.08. The repeatability identified were 0.81 (a), 0.94 (b), 0.98 (c), 0.22 (d), 0.60 (p), 0.71 (ln (s)) and 0.003 (y). It was concluded that the average estimates of heritability and correlations showed a strong environmental effect affecting the expression of the characteristic milk production and low genetic correlations between the parameters of the curve and the production, indicating that the selection by milk production will bring little genetic gain. On the other hand, the selection considering all parameters of the curve may be more convenient. In addition, the need for standardization of herd management is evidenced. More detailed studies should be developed to understand the relationship of the parameters. The database can be worked on in other lactation periods for a better understanding of the variance component estimates. It would be of great value studies on main components and track analysis for later use in the selection index method, to corroborate with the selection that considers all parameters of the curve.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-10T18:44:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 437834 bytes, checksum: a9362b709e4bab8e60ce9fbd5d55af52 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-10T18:44:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 437834 bytes, checksum: a9362b709e4bab8e60ce9fbd5d55af52 (MD5) Previous issue date: 2002-02-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho utilizou dados simulados pelo programa GENESYS, com o objetivo de verificar o efeito das diferentes combinações de fatores de ponderação sobre características de alta, média e baixa herdabilidade, utilizando-se BLUP, seleção individual e índice de seleção. Nesse sentido, foi simulado um genoma constituído de três características quantitativas, governadas por 250 locos por característica, distribuídos em 20 pares de cromossomos de tamanho aleatório. A partir deste genoma, foi simulada uma população-base, constituída de 1.000 animais (500 machos e 500 fêmeas), considerando-se três características, com herdabilidades alta (0,60), média (0,30) e baixa (0,10). Dessa forma, a população inicial foi constituída de 10 machos, 100 fêmeas e 5 filhos/fêmea tomados ao acaso da população. Nesta população iniciou-se o processo de avaliações genéticas, utilizando os três métodos de seleção por 10 gerações de seleção. O processo de seleção foi repetido para cada método 10 vezes, com o propósito de avaliar o efeito da flutuação genética atribuída à amostragem gamética. Foram avaliadas as combinações de fatores de ponderação para as características de alta, média e baixa herdabilidade: 0,00-0,00-1,00; 0,05-0,05-0,90; 0,10-0,10- 0,80; 0,10-0,20-0,70; 0,20-0,30-0,50; e 0,33-0,33-0,34. Os resultados de ganhos fenotípicos para a característica de baixa herdabilidade, obtidos através do índice de seleção, revelou aumento de até 615% quando a seleção focalizou somente essa característica, características; de média e alta herdabilidade apresentaram perdas em seus ganhos fenotípicos de 97 e 92%, respectivamente. As variações observadas para ganhos e perdas por fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis foram relativamente pequenas e atribuídas, possivelmente, às oscilações gênicas. Da mesma forma, a redução na variabilidade genética foi mais acentuada para as combinações estudadas ao final das 10 gerações de seleção. A seleção individual também apresentou acréscimos nos ganhos fenotípicos à medida que maiores valores foram atribuídos às características. Os valores fenotípicos observados foram altos para a característica de baixa herdabilidade quando o BLUP foi utilizado. A maior variação, de 445%, foi verificada entre as combinações 0,10-0,10-0,80 e 0,10-0,20-0,70. O estudo também revelou que grande parte dos ganhos fenotípicos na característica de baixa herdabilidade foi perdida para as demais características apenas pela perda de uma unidade no fator de ponderação para esta característica. Comparando os três métodos de seleção dentro de cada combinação de fatores de ponderação, verificou-se a superioridade do BLUP na maioria dos casos, para todas as características estudadas. / The data simulated by the “Genesys” program in the present study were used to verify the effects from different combinations of the weighing factors on the traits for high, medium and low heritabilities, by using the BLUP, individual selection, and selection index methods. So, a simulation was performed for a genome consisting of three qualitative traits each one governed by 250 loci distributed into 20 pairs of randomly sized chromosomes. A base-population constituted by 1.000 animals (500 males and 500 females) was simulated from this genome, by considering three traits with high (0.60), medium (0.30) and low (0.10) heritabilities. Thus, the initial population consisted of 10 males, 100 females and 5 offsprings/female randomly taken from the population. The genetic evaluation process was began in this population, by using those three selection methods for each 10 selected generations. The selection process was repeated 10 times for each method in order to evaluate the effects of the genetic fluctuations attributed to the gamete sampling. The combinations of the weighing factors, that is, 0.00- 0.00-1.00; 0.05-0.05-0.90; 0.10-0.10-0.80; 0.10-0.20-0.70; 0.20-0.30-0.50, and 0.33-0.33-0.34 were evaluated for the traits of high, medium, and low heritabilities. The results of the phenotypic gains for low heritability, obtained through selection index, showed an increase up to 615% when the selection focused only upon this trait, while the medium and high heritabilities presented losses of 97% and 92% in their phenotypic gains, respectively. The variation observed in the gains and losses by fixation of both favorable and unfavorable alleles were relatively low and probably is due to gene oscillations. After 10 selected generations, a higher reduction occurred in the genetic variability. The individual selection also presented increments in the phenotypic gains as higher values were attributed to the traits. High phenotypic values were observed for low heritability, when using the BLUP method. The highest variation (445%) was found among the combinations 0.10-0.10-0.80 and 0.10-0.20-0.70. This study also showed that a great part of the phenotypic gains in the trait of low heritability was lost for the other traits, just due to a lost unit in the weighing factor for this trait. When comparing those three selection methods within each combination of the weighing factors, the superiority of the BLUP method was shown in most cases for all studied traits. / Tese importada do Alexandria

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T17:47:45Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 277590 bytes, checksum: 771d4c385412e18fcc7725b22b7aff0f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T17:47:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 277590 bytes, checksum: 771d4c385412e18fcc7725b22b7aff0f (MD5) Previous issue date: 2003-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Com o intuito de avaliar o efeito da heterogeneidade de variâncias na avaliação genética de animais da raça Pardo-Suíça no Brasil, foram utilizados registros de produção de leite e gordura do leite, para estimação de componentes de variâncias, e valores genéticos dos reprodutores, por meio do programa MTDFREML. Para tanto, foram utilizados três modelos, sem e com interação reprodutor x rebanho ou reprodutor x rebanho-ano, que consideravam como efeitos fixos, grupo genético, estação de parto e classe de rebanho-ano, e como aleatórios, os efeitos de animal, de ambiente permanente, de interação, quando considerada no modelo, e do erro, em análises de características únicas e múltiplas. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para verificar a efetividade da inclusão dos efeitos de interação nos modelos. No estudo do efeito da interação reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano sobre a avaliação genética de reprodutores, modelos de características múltiplas, para produção de leite e gordura, foram utilizados. Os componentes de variâncias praticamente não alteraram e os coeficientes de herdabilidades foram próximos entre si. A estimativa de herdabilidade foi de 0,40 para ambas características e, a correlação genética entre as características de 0,94, exceto quando o modelo considerou o efeito da interação reprodutor x rebanho, onde para produção de gordura, a herdabilidade foi de 0,39, e a correlação genética entre as características de 0,95. O logaritmo natural da função de verossimilhança aumentou (P< 0,01) quando se incluiu os efeitos de interação nos modelos. As correlações de Pearson e Spearman entre os valores genéticos obtidos pelos diferentes modelos foram superiores a 0,99, para produção de leite e gordura, e acima de 0,90, entre as características avaliadas. Deste modo, as interações reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano não causaram mudanças na classificação dos reprodutores, não havendo necessidade de considerá-las nos modelos de avaliação genética. A fim de analisar a importância da heterogeneidade de variâncias entre rebanhos e a efetividade da inclusão da interação reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano como fator de ajustamento para a mesma, os dados foram estratificados em duas classes com base no desvio-padrão fenotípico dos rebanhos, para produção de leite, ajustada a duas ordenhas diárias, a 305 dias de lactação e a idade adulta da vaca. Os componentes de variâncias, para produção de leite e gordura, foram obtidos em análises de característica única geral, em análises de característica única, em cada classe de desvio-padrão e em análises de características múltiplas, em que a característica em cada classe de desvio-padrão fenotípico foi considerada como característica diferente. Os componentes de variâncias genética aditiva e residual foram maiores na classe de alto desvio-padrão fenotípico, e reduziram ou praticamente não variaram, com a inclusão dos efeitos de interação no modelo. Nas análises de características múltiplas, em geral, os componentes de variâncias genéticas foram maiores que os obtidos em análises de características únicas, resultando em estimativas de herdabilidades maiores (0,34 a 0,39). Correlações genéticas entre as duas classes de desvio-padrão foram iguais a 1,0, em todas as análises. Quando os efeitos de interação foram considerados nas análises, as correlações entre os valores genéticos praticamente não alteraram. O logaritmo natural da função de verossimilhança aumentou (P<0,01), para produção de gordura, em análises de características múltiplas, quando se incluiu o efeito da interação no modelo. Assim, verifica-se que as interações reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano não foram eficientes para corrigir a heterogeneidade de variância, e apesar de serem observadas variâncias heterogêneas, estas poderiam ser desconsideradas nas avaliações genéticas, sem afetar a acurácia dos valores genéticos dos animais. / Aiming to evaluate the effect from the variance heterogeneity in the genetic evaluation of the Brown Swiss animals in Brazil, the registers of the milk and milk fat production were used to determine either the variance components and the sire’s genetic values, by using through the MTDFREML program. So, three models were used, without and with interaction of either sire x herd or sire x herd-year, where the genetic group, season of calving, and herd -year class were considered as fixed effects, whereas the effects from the animals, permanent environment, the interaction when considered in the model, and the error were considered as random ones, in the univariate and multitrait analyses. The likelihood ratio test was applied to verify the effectiveness in including the interaction effects into the models. When studying the effects from the interaction of sire x herd and the sire x herd-year upon the genetic evaluation of sires, multitrait models for milk and fat production were used. The variance components practically did not alter and the heritability coefficients were close to each other. The heritability estimate went of 0,40 to both characteristics, and the genetic correlation among the characteristics of 0,94, except when the model considered the effect of the xiiinteraction sire x herd, where for fat production, the heritability went of 0,39, and the genetic correlation among the characteristics of 0,95. The natural logarithm of the likelihood function increased (P<0,01), when the interaction effects were included into models. Pearson and Spearman correlations among the genetic values obtained by these different models were superior to 0.99, for milk and fat production, and above 0.90 between the appraised characteristics. Therefore, the interactions of sire x herd and the sire x herd- year caused no changes in the classification of the sires, and there was no need for considering them into the genetic evaluation models. In order to analyze the importance of the variance heterogeneity between herds and the effectiveness in including the interaction of sire x herd and sire x herd-year as an adjust factor for this heterogeneity, the data were stratified into two classes, based on the phenotypic standard deviation of the herds, for milk production, adjusted to two daily milkings, to a lactation period of 305 days, and the cow’s adult age. The components of variance for milk and fat production were obtained in general univariate analyses, in univariate analyses, in each class of standard deviation and in multitrait analyses, in that the characteristic in each class of the phenotypic standard deviation was considered to be a different characteristic. The components of the genetic addictive and residual variances were higher in the class of high phenotypic standard deviation, and they reduced or practically did not vary with the inclusion of the interaction effects into the model. In the multitrait analyses, the components of the genetic variance were generally higher than those obtained in the univariate analyses, so resulting into higher heritability estimates (0,34 a 0,39). The genetic correlations between both standard deviation classes were equal to 1.0 in all analyses. When considering the interaction effects in the analyses, the correlations among the genetic values practically did not change. When including the effect into the model, the natural logarithm of the likelihood function increased (P<0,01) for fat production in the multitrait analyses. Therefore, it was found that the interactions of sire x herd and sire x herd-year were not efficient to correct the variance heterogeneity, and although the xiiiheterogeneous variances was observed, these might be disregarded in the genetic evaluations without affecting the accuracy of the animals’ genetic values.

O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos relacionados ao peso à emergência, comprimento corporal, comprimento e largura do abdome, peso, diâmetro e volume de espermateca e peso dos ovários de rainhas Apis mellifera L. (Hymenoptera: Apidae) africanizadas. Os dados analisados se referem a pesagem corporal e medidas do comprimento e largura do abdome de 1056 rainhas, mensurações do comprimento corporal de 102 rainhas, peso da espermateca de 830 rainhas, diâmetro e volume da espermateca de 813 rainhas e peso dos ovários de 970 rainhas, totalizando 1133 animais na matriz de parentesco. Os efeitos fixos considerados foram família, época e mini-recria e os efeitos aleatórios, o genético aditivo e o resíduo. As análises foram realizadas por meio da inferência Bayesiana utilizando o modelo animal. Foram realizadas análises unicarater e bicarater para todas as características. Em análise unicarater, a proporção da variância genética aditiva foi responsável por mais de 50% da variância fenotípica total e as herdabilidades apresentaram estimativas de magnitudes médias a altas para todas as características, sendo 0,46 para peso à emergência, 0,59 para comprimento do abdome, 0,56 para largura do abdome, 0,80 para comprimento corporal total, 0,62 para peso da espermateca, 0,55 para diâmetro da espermateca, 0,64 para volume da espermateca e 0,62 para peso dos ovários. Correlações genéticas favoráveis de magnitudes entre 0,46 a 0,86 foram encontradas para as associações entre peso à emergência, comprimento corporal e comprimento e largura do abdome. Quando avaliadas as relações entre peso à emergência, comprimento corporal e comprimento e largura do abdome com peso, diâmetro e volume de espermateca e peso dos ovários, a maior correlação genética foi entre peso à emergência e peso dos ovários de 0,49. Correlação genética de 0,46 foi encontra para peso à emergência e comprimento do abdome, 0,86 para peso à emergência e largura do abdome e 0,70 para peso à emergência e comprimento corporal. Todas as características avaliadas em análise unicarater apresentam potencial de seleção e, as correlações genéticas entre o peso da rainha à emergência e características da espermateca e peso dos ovários são determinados, em parte, pelo mesmo conjunto de genes, indicando que essas associações podem ser utilizadas em programas de melhoramento genético de abelhas africanizadas, visando o maior potencial reprodutivo de rainhas A. mellifera africanizadas. / The objective of this study was to estimate the genetic parameters the weight at emergence, body length, length and width of abdomen, weight, diameter and volume the spermathecae and weight of ovaries of queen bees Apis mellifera L. (Hymenoptera: Apidae) africanized. The data analysed refer to weighing the body and length and width of abdomen measures of 1056 queen bees, measurements of body length the of 102 queen bees, weight of spermathecae of 830 queen bees, diameter and volume of spermathecae of 813 queen bees and weight of ovaries of 970 queen bees, amounting 1133 animals in the matrix parentage. The effects fixed considered were family, epoch and mini-recreates and the random effects, genetic aditive and the residual. The analyses realized were through the inference Bayesian using the animal model. Were conducted analyses unicharacter and bicharacter for all characteristics. In analyses unicharacter, the proportion the variance genetic aditive was responsible for more than 50% the total phenotypic variance and the heritabilities have submitted estimates of medium to high magnitudes the for all characteristcs, being 0.46 for weight at emergence, 0.59 for length abdomen, 0.56 for width of abdomen, 0.80 for body length, 0.62 for spermathecae weight, 0.55 for spermathecae diameter, 0.64 for spermathecae volume and 0.62 for weight of ovaries. Genetic correlations favorable of magnitude between 0.46 to 0.86 were found for the associations between weight at emergence, body length and length and width abdomen. When evaluated the relationship between the emergence weight, body length and width and length abdomen with weight, diameter and volume of spermatheca and ovarian weight, the greater genetic correlation was between the weight at emergence and weight of ovaries of 0.49. Genetic correlation of 0.46 was found for the emergence weight and length of the abdomen, 0.86 for weight at emergence and abdomen width and 0.70 for the emergence weight and body length. That all characteristics evaluated in analysis unicharacter have potential of selection and, genetic correlation the weight at emergence and characteristics of spermathecae and weight of ovaries are determined, in part, the same set of genes, indicating that these associations can be used in breeding programs of bees africanized, for the greater reproductive potential of queen bees A. mellifera africanized .

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseSPM.pdf: 427428 bytes, checksum: 2d8a973a6fe346d539a557589437a9d2 (MD5) Previous issue date: 2004-06-30 / Financiadora de Estudos e Projetos / Genetic parameters for body weight at weaning (PD), at twelve months of age (P12), at first calving (PPP) and at adult age (PAD), condition score at calving (ECP) and at first calving (EPP), growth curve parameters A (asymptotic weight) and k (maturation rate), age at first calving (IPP), culling age (TPR, days in herd), number (ND10) and kilograms (QD10) of calves weaned up to ten years of age, total number (NDT) and total kilograms (QDT) of calves weaned during herd life, kilograms of calves weaned per year in herd (QTPR), and the ratios weaning weight of calf/weight of cow at calving (RPP) and weaning weight of calf/weight of cow at first calving (RPPP) of females of a Canchim (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) beef cattle herd were estimated by Bayesian inference. The average values of heritability were 0.38 (PD), 0.40 (P12), 0.51 (PPP), 0.54 (PAD), 0.18 (ECP), 0.36 (EPP), 0.60 (A), 0.54 (k), 0.12 (IPP), 0.22 (TPR), 0.22 (ND10), 0.24 (QD10), 0.23 (NDT), 0.23 (QDT), 0.32 (QTPR), 0.16 (RPP) and 0.40 (RPPP), indicating that these traits have enough genetic variability to show response to mass selection, with the exception of IPP. The genetic correlations of TPR, ND10, QD10, NDT, QDT and QTPR with the body weights (PD, P12 and PD) suggest that selection of females based on weaning and 12-month body weights should not reduce the produtivity traits studied; however, increasing females adult body weight would reduce the number of calves weaned by the cow up to ten years of age. The genetic correlations of TPR, ND10, QD10, NDT, QDT, QTPR, PAD, A and k with IPP, PPP and EPP suggest that selection to reduce age at first calving, in general, should improve longevity and productivity traits of females, but the increase in body weight at first calving would reduce some of the productivity traits. The genetic correlations of IPP, EPP, PD and P12 with RPPP suggest that selection to reduce age at first calving should improve the productivity trait of the females. / Estimaram-se, pela inferência Bayesiana, parâmetros genéticos dos pesos à desmama (PD), aos doze meses de idade (P12), ao primeiro parto (PPP) e à idade adulta (PAD), dos escores da condição corporal ao parto (ECP) e ao primeiro parto (EPP), dos parâmetros A (peso assintótico) e k (taxa de maturação) da curva de crescimento, da idade ao primeiro parto (IPP), da idade de descarte (TPR), do número (ND10) e quilogramas (QD10) de bezerros desmamados em até dez anos de idade, do número total (NDT) e quilogramas total (QDT) de bezerros desmamados durante todo o tempo de permanência no rebanho, do quilogramas de bezerros desmamados por ano de permanência no rebanho (QTPR), e das relações de peso do bezerro à desmama pelo peso da vaca ao parto (RPP) e ao primeiro parto (RPPP), de fêmeas de um rebanho da raça Canchim. As médias das estimativas de herdabilidade, obtidas de análises unicaráter, foram iguais a 0,38 (PD); 0,40 (P12); 0,51 (PPP); 0,54 (PAD); 0,18 (ECP); 0,36 (EPP); 0,60 (A); 0,54 (k); 0,12 (IPP); 0,22 (TPR); 0,22 (ND10); 0,24 (QD10); 0,23 (NDT); 0,23 (QDT); 0,32 (QTPR); 0,16 (RPP) e 0,40 (RPPP) indicando que as características possuem variação genética aditiva suficiente para apresentar boa resposta à seleção massal, com exceção de IPP. As correlações genéticas de TPR, ND10, QD10, NDT, QDT e QTPR com os pesos (PD, P12 e PAD) sugerem que a seleção de fêmeas com base nos pesos à desmama e aos 12 meses de idade não deve prejudicar as características de longevidade e de produtividade estudadas; porém, o aumento do peso adulto poderá resultar em menos bezerros desmamados pela vaca em até os dez anos de idade. As correlações genéticas de TPR, ND10, QD10, NDT, QDT, QTPR, PAD, A e k com IPP, PPP e EPP, sugerem que a seleção para reduzir a idade ao primeiro parto deve, em geral, melhorar a longevidade e as características de produtividade das fêmeas, porém, o aumento do peso ao primeiro parto poderá prejudicar algumas das características de produtividade. As correlações genéticas de IPP, EPP, PD e P12 com RPPP sugerem que a seleção para reduzir IPP deve melhorar RPPP.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissFMC.pdf: 515984 bytes, checksum: 2b8e7dbc0a347d243d0892e741a63c79 (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / Universidade Federal de Sao Carlos / In beef cattle genetic evaluation programs, the existence of genotype x environment interaction is of special interest when merit of the animals depends on the environment they are evaluated, that is, when a genotype is superior in one environment but not in others. The objective in this study was to evaluate the existence of genotype x environment interaction for weight (WW) and scrotal circumference (SC) at weaning in Canchim cattle, using data belonging to herds from Southeast and Mid West regions of Brazil. Herds were grouped according to two criteria: (1) by geographical region, considering animals born in Southeast and Mid West regions of Brazil; (2) by homogeneous production regions, considering only animals born in the State of São Paulo. Data on 29,367 WW and 8,800 SC were used for analyses in criterion 1, and 15,041 WW for analyses in criterion 2. The region in which the calf was born and raised was considered as the environment, and two methods were used to evaluate the interaction by both criteria. In method 1, genetic correlation between the same trait among the environments, in two (criterion 1) and three-trait (criterion 2) analyses, was estimated, considering the trait in each region as a different trait, using the derivative free restricted maximum likelihood method, with a statistical model which included the fixed effects of contemporary group (breeder-owner-year and season of birth-sex-genetic group of dam-feeding regime) and the covariates age of dam (linear and quadratic effects) and age of calf (linear effect; only for SC), and the additive direct and maternal, permanent environmental and residual random effects. Spearman rank correlations for breeding values of bulls in different regions were also calculated. In method 2, for both criteria, one-trait analyses using two similar models were done, but one with and the other without the uncorrelated sire-region random effect, and the difference between them was tested by the likelihood ratio test. In criterion 1, the genetic correlations between WW and SC in Southeast and Mid West regions were equal to 0.78 and 0.97, respectively, while in criterion 2, the genetic correlations between WW in West of São Paulo - Paraná and Araraquara regions, West of São Paulo - Paraná and Leiteira regions, and Araraquara and Leiteira regions were 0.87, 0.69 and 0.76, respectively. The rank of bulls according to their breeding values changed from one region to the others, and the models with and without sire-region effect were different, for all traits. These results suggest the existence of genotype x environment interaction for the traits in the studied population. / Nos programas de avaliação genética de bovinos de corte, a existência de interação genótipo x ambiente é de especial interesse quando o mérito dos animais depende do ambiente no qual são avaliados, ou seja, quando um genótipo apresenta superioridade em determinado ambiente e não apresenta a mesma superioridade em outros ambientes. O objetivo neste trabalho foi avaliar a existência de interação genótipo x ambiente para peso (PD) e perímetro escrotal (PE) à desmama em bovinos da raça Canchim pertencentes a rebanhos das regiões Sudeste e Centro-Oeste do Brasil. Para tanto, os rebanhos foram agrupados segundo dois critérios: (1) por região política, considerando animais nascidos e criados nas regiões Sudeste ou Centro-Oeste do Brasil; (2) por regiões homogêneas de produção, considerando apenas animais nascidos dentro do estado de São Paulo. Foram utilizados dados de 29.367 PD e 8.800 PE, pelo critério 1, e de 15.041 PD, pelo critério 2. Em ambos os casos, foram utilizadas duas metodologias para avaliar a existência de interação genótipo x ambiente. Na metodologia 1, foram estimadas as correlações genéticas entre a mesma característica em ambientes diferentes, em análises bicaráter (critério 1) e tricaráter (critério 2), considerando a característica em cada região como sendo uma característica diferente, utilizando o método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas, com modelo estatístico que incluiu os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (criador - proprietário - ano e época de nascimento - sexo - grupo genético da mãe - regime alimentar) e da covariável idade da vaca (efeitos linear e quadrático) e idade do bezerro (efeito linear; apenas para PE), além dos efeitos aleatórios aditivos direto e materno, de ambiente permanente e residual. Foram também calculadas as correlações de Spearman para os valores genéticos dos touros nas várias regiões. Na metodologia 2, foram feitas análises unicaráter utilizando-se dois modelos idênticos ao anterior, mas um com e outro sem o efeito aleatório não correlacionado de touro-região, para ambos os critérios, e a diferença entre os dois modelos foi verificada pelo teste de razão de verossimilhança. No critério 1, as correlações genéticas entre PD e PE nas regiões Sudeste e Centro-Oeste foram iguais a 0,78 e 0,97, respectivamente. No critério 2, as correlações genéticas entre PD nas regiões Oeste de São Paulo-Paraná e Araraquara, Oeste de São Paulo-Paraná e Leiteira, e Araraquara e Leiteira, foram iguais a 0,87; 0,69 e 0,76, respectivamente. Houve mudança na classificação dos touros quanto a seus valores genéticos de uma região para outra e os modelos com e sem o efeito de touro - região foram diferentes, para todas as características. Estes resultados sugerem a existência de interação genótipo x ambiente para as características nas populações estudadas.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6501.pdf: 1672444 bytes, checksum: 64754c3f12e26620a22bf55af9f8d5ff (MD5) Previous issue date: 2014-08-13 / The Brazilian cattle industry is presented as highlighted on the world stage and the significant participation of this productive sector in the economy means that there is concern with production losses, among which stands out those caused by infestation of Rhipicephalus (Boophilus) microplus, main ectoparasite vector cattle and various diseases. The genetic variability for resistance to the cattle tick shows that this trait can be genetically improved. For the execution of this work, it was used a study of genome wide association (GWAS) for resistance to Rhipicephalus (Boophilus) microplus, performed by Dr. Fernando Flores Cardoso, with 260 Hereford and 500 Braford animals. The monitoring of the infestation was accomplished by counting tick females larger than 4.5 mm from one of the animal's body side, and the degree of infestation was evaluated for each animal by averaging at least two consecutive counts, with intervals of approximately thirty days, in the months of highest incidence of the parasite. The animals were genotyped using a 50K SNP chip, and it was found a total of 37,346 SNPs that passed in quality test. Among these markers, 178 showed significant effects and allowed the mining of 175 genes in these regions, at an interval of 200 Kb (100 Kb for each side of each marker). Most of these polymorphisms associated with the trait is located in regions without defined functions (intronic and intergenic), and only one of them is located in the splicing region. The most significant regions of the GWAS were identified on chromosomes 7, 21 and 23, which were found 72 genes in linkage disequilibrium with the molecular markers. Therefore, a functional annotation of the genes on these 3 chromosomes was performed, allowing the choice of 11 candidate genes for the study of various metabolic pathways in which they are inserted. Among these pathways, the most important are those related to immune responses, secretion and intracellular transport, calcium influx and epidermal growth and differentiation. / A bovinocultura brasileira apresenta-se como destaque no cenário mundial e a expressiva participação deste setor produtivo na economia faz com que haja preocupação com as perdas produtivas, dentre as quais destaca-se aquelas causadas pela infestação do carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus, principal ectoparasita de bovinos e vetor de diversas doenças. A variabilidade genética observada para a resistência dos bovinos ao carrapato permite que essa característica seja melhorada geneticamente, como forma alternativa de controle desses ectoparasitos. Para a execução do presente trabalho, foi utilizado um estudo de associação genômica ampla (GWAS) para a resistência ao carrapato R. microplus, o qual foi realizado pela equipe do Dr. Fernando Flores Cardoso (Embrapa Pecuária Sul), com 260 animais da raça Hereford e 500 animais da raça Braford. O monitoramento das infestações foi realizado por meio da contagem de fêmeas do carrapato com tamanho superior a 4,5 mm em um dos lados do corpo do animal, e o grau de infestação de cada animal foi avaliado pela média de pelo menos duas contagens consecutivas, com intervalos de aproximadamente trinta dias, conduzidas no sobreano, nos meses de maior incidência do parasito. Os animais foram genotipados com utilização de um chip de SNPs de 50 K e, após a realização do GWAS, verificou-se que um total de 37.346 SNPs passou nos teste de qualidade. Dentre esses marcadores, 178 SNPs apresentaram efeitos significativos e permitiram a mineração de 175 genes nessas regiões, em um intervalo de 200 Kb (100 Kb para cada lado de cada marcador). A maioria dos polimorfismos associados com a característica está localizada em regiões sem funções determinadas (intergênicas e intrônicas), apenas um deles encontra-se em região de splicing. Sendo assim, estes marcadores podem constituir mutações não causais que se encontram em desequilíbrio de ligação com mutações funcionais. As regiões mais significativas do GWAS foram identificadas nos cromossomos 7, 21 e 23, onde foram identificados 72 genes em desequilíbrio de ligação com os marcadores moleculares. Portanto, foi realizada uma anotação funcional dos genes localizados nesses 3 cromossomos, o que permitiu a seleção de 11 genes candidatos para um estudo mais aprofundado das vias metabólicas nas quais eles estão inseridos. Verificou-se que esses genes participam de processos importantes em vias já relacionadas com a resistência a carrapatos, tais como apresentação de antígenos, transporte e secreção intracelular e diferenciação da epiderme.