La thématique des maladies infectieuses représente un réel enjeu politique, économique et de santé publique. Les objectifs de mes travaux de thèse étaient de développer des approches protéomiques pour identifier, détecter, caractériser et/ou quantifier des protéines et de les appliquer à l’étude de maladies infectieuses pour lesquelles des données de protéomique pourraient ouvrir à de nouvelles approches thérapeutiques et/ou diagnostiques. Les stratégies d’identification et de détection des protéines développées pour l’étude de la maladie de Lyme ont permis de prouver la faisabilité du diagnostic par spectrométrie de masse et de proposer des protéines candidates-vaccin. Les stratégies de quantification mises en place pour l’étude de la toxoplasmose ont permis d’identifier et de quantifier un complexe protéique clef. Les stratégies de caractérisation du N-terminome pour l’étude du paludisme ont permis d’apporter des preuves expérimentales des processus de maturation et d’adressage des protéines. / Infectious diseases represent a real challenge in terms of politic, economic and public health. The purposes of my thesis works were to develop proteomic approaches able to identify, to detect, to characterize and/or to quantify proteins and to apply these approaches to the study of infectious diseases for which proteomic data cou Id open to new therapeutic and/or diagnostic strategies. Identification and specific detection strategies developed in the study of Lyme's disease allowed to prove the feasibility of diagnosis by mass spectrometry and to propose new vaccine-candidate proteins. Quantification strategies developed in the study of toxoplasmosis allowed us to identify and to quantify a key protein complex of the parasite. N-terminome characterization strategy developed in the study of malaria allowed us to bring experimental proofs of proteins processing and trafficking.

La dispersion est définie comme le mouvement d'un individu entre le site de naissance et le premier site de reproduction ou entre deux sites de reproduction. La dispersion se traduit par des échanges d'individus et des flux de gènes entre les populations et est donc reconnue comme un trait d'histoire de vie clé de part son rôle déterminant sur de nombreux processus écologiques et évolutifs comme la dynamique ou la génétique des population, la répartition spatiale des espèces ou encore la capacité des espèces à faire face aux changements brutaux induits par les activités humaines. Pourtant les conséquences de la dispersion en terme de valeur sélective individuelle restent mal connues malgré leur importance dans l'évolution de la dispersion. Le but de cette thèse est d'identifier plus précisément les conséquences de la dispersion en terme de valeur sélective individuelle en utilisant à la fois des approches corrélative et expérimentale dans une population sauvage de passereaux migrateurs, le gobe mouche à collier (Ficedula albicollis). Grâce à des données à long terme comprenant plus de 20 ans de suivi, des différences entre les individus dispersants et philopatriques ont pu être mises en évidence à la fois à l'échelle de la vie des individus et à l'échelle annuelle, celle de l'événement de reproduction. Les résultats mettent en évidence des effets de la dispersion dépendant à la fois des conditions et du phénotype des individus et soulignent donc le fait que la balance entre les coûts et les bénéfices est le résultat d'interactions subtiles entre l'environnement et les caractéristiques de l'individu. D'autre part, l'expérience de dispersion forcée a permis de démontrer clairement l'existence de coûts liés à l'établissement dans un environnement non familier que seuls certains individus sont capables de surmonter. Enfin, l'absence de différence dans les décisions majeures de reproduction une fois les individus établis, suggère que la dispersion doit majoritairement être adaptative, une fois les coûts de l'installation surmontés / Dispersal is commonly defined as the movement of an individual from its natal or previous breeding site to a new breeding site. Because dispersal involves movements of individuals and genes among populations, it is widely recognized as a key life history trait with strong effects on many ecological and evolutionary processes, such as population dynamics and genetics but also species spatial distribution or response to brutal environmental variations induced by human activities. Yet, the consequences of dispersal in terms of individual fitness remain poorly understood despite their crucial importance in the understanding of the evolution of dispersal. The aim of this PhD is to get better insights in the fitness consequences of dispersal using both correlative and experimental approaches at different scales, i.e. annual and lifetime scales, in a wild patchy population of migratory passerine bird, the collared flycatcher (Ficedula albicollis). Using a long term data set encompasses more than 20 years of data, differences between dispersing and philopatric individuals were showed both at a lifetime and annual scale. The results highlighted strong phenotypic- and condition-dependent effects of dispersal and underline that the balance between the costs and benefits of dispersal is likely to be the result of subtle interactions between environmental factors and individuals’ phenotype. Moreover, the experiment of forced dispersal demonstrated that dispersal might entail costs linked with settlement in a new habitat, which only some individuals may overcome. Nevertheless, the absence of difference in major fitness related decisions after settlement suggests that dispersal is mostly adaptive for individuals overcome such costs

Ces travaux s’intéressent au choix des tratégies de création de valeur dans des pays pétroliers. Ils cherchent à offrir des outils à un décideur pour améliorer la compréhension du problème et procéder au choix de stratégies sous des contraintes de coûts. La thèse s’articule autour d’un processus d’aide à la décision adapté au contexte pétrolier et de trois questions de recherche : 1. Comment modéliser les valeurs durables apportées par des projets complexes dans un pays hôte ? 2. Comment outiller une entreprise d’une méthode d’estimation des valeurs créées localement en tenant compte des effets indirects et induits ? 3. Comment aider à la décision pour la sélection de stratégies agissant sur de multiples systèmes ? Pour y répondre, nous avons pris en compte les spécificités du contexte du contenu local dans le domaine pétrolier. Nous y avons apporté des méthodes de génie industriel et d’aide à la décision multicritère. Nous aboutissons à une proposition de modélisation de la valeur apportée à un pays hôte. Celle-ci nous permet d’introduire une méthodologie d’estimation des impacts d’une stratégie. Enfin, nous proposons une procédure pour réaliser des recommandations à un décideur. / Our research focus on the problem of choosing among value-creation strategies in the context of Oil and Gas development project. The objective is to offer tools to a decision maker to improve his understanding of the problem and to aid to decision. The thesis is structured around a decision-making process adapted to the Oil and Gas context and three research questions: 1. How to model the sustainable values brought by complex projects in a hostcountry? 2. How to furnish to a company a method to estimate local values brought, taking into account indirect and induced effects? 3. How to aid to select among strategies that impact multiple systems? To answer, we took into account the specificities of local content in the Oil and Gas. We brought metholodologies from industrial engineering and multicriteria decision aid. We propose a modeling of the value-added brought to a host country. This allows us to introduce an estimation methodology for the impacts of a strategy. Finally, we suggest a procedure for making recommendations to a decision maker.

Lien vers le GitHub contenant tous les outils programmés dans le cadre du mémoire : https://github.com/neurok8050/eda-optimisation-processing-tool / L’activité électrodermale (EDA), particulièrement la skin conductance response (SCR), est un signal psychophysiologique fréquemment utilisé en recherche en psychologie et en neuroscience cognitive. L’utilisation de l’EDA entraîne son lot de défis particulièrement son prétraitement. En effet, encore très peu de recherches effectuent un prétraitement adéquat. Notre objectif est donc de promouvoir l’utilisation du prétraitement du signal SCR et de proposer des recommandations pour les chercheurs en fournissant des données sur l’impact du prétraitement sur la capacité à discriminer les SCR entre deux conditions expérimentales. En utilisant des travaux similaires, nous avons testé les effets de combinaisons de prétraitement utilisant différentes méthodes de filtrage, différentes méthodes de remise à l’échelle, l’inclusion d’une étape de détection automatique des artefacts de mouvement et en utilisant différentes métriques opérationnalistes (le peak-scoring (PS) et l’aire sous la courbe (AUC)) et d’approches par modèle. Enfin, nous avons testé si une seule combinaison de filtrage pourrait être utilisée avec différents jeux de données ou si le prétraitement devrait plutôt être ajusté individuellement à chaque jeu de données. Nos résultats suggèrent que 1) l’inclusion d’une étape de détection automatique des artefacts de mouvements n’affecte pas significativement la capacité à discriminer entre deux conditions expérimentales, 2) l’approche par modèle semble être un peu meilleure à discriminer entre deux conditions expérimentales et 3) la meilleure combinaison de prétraitement semble variée en fonction du jeu de données utilisé. Les données et outils présentés dans ce mémoire devraient permettre de promouvoir et faciliter le prétraitement du signal SCR. / Electrodermal activity (EDA), particularly the skin conductance response (SCR) is a psychophysiological signal frequently used in research in psychology and in cognitive neuroscience. Nevertheless, using EDA comes with some challenges notably in regard to its preprocessing. Indeed, very few research teams adequately preprocess their data. Our objective is to promote the implementation of SCR preprocessing and to offer some recommendations to researchers by providing some data on the effect of preprocessing on the SCR ability to discriminate between two experimental conditions. Based on similar work, we have tested the effect of preprocessing combinations using different filtering methods, different rescaling methods, the inclusion of an automatic motion detection step while using different operationalist metrics (peak-scoring (PS) and area under the curve (AUC)) and different model-based approach metrics. Finally, we tested if only one combination could be used across different datasets or if the preprocessing should be optimized individually to each dataset. Our results show that 1) the inclusion of the automatic motion detection step did not significantly impact the ability to discriminate between two experimental conditions, 2) the model-based approach seems to be slightly better at discriminating between two experimental conditions and 3) the best combination of preprocessing seems to vary between different datasets. The data and tools presented in this master thesis should promote and facilitate SCR signal preprocessing.

La présente thèse cherche à démontrer que, face aux limites de l’approche abolitionniste dans l’appréhension du travail de l’enfant, approche véhiculée principalement par l’Organisation internationale du travail (OIT), il est possible d’explorer d’autres voies en vue de la protection des droits de l’enfant travailleur, au nombre desquelles figure l’application d’une approche basée sur les droits de l’enfant et du travail décent adapté à l’enfant. Cette démonstration repose principalement sur deux points. Dans un premier temps, il s’est agi de démontrer que l’approche abolitionniste, fondée essentiellement sur une définition négative du travail de l’enfant et sur le seul critère de l’âge, présente des limites parmi lesquelles le confinement de l’enfant travailleur dans l’illégalité et le risque d’abus d’une part et, d’autre part, la non implication de ce dernier dans la mise en œuvre de ses droits notamment par le biais de la participation comme le stipule l’article 12 de la Convention relative aux droits de l’enfant. Dans un second temps, la combinaison de l’approche basée sur les droits de la personne et du concept de travail décent s’est avéré une avenue prometteuse en ce sens que cette approche, proche de la théorie de droits de l’enfant, est susceptible de permettre une participation efficience de l’enfant travailleur dans la mise en œuvre de ses droits tant substantifs que procéduraux grâce à un travail reconnu et adapté à sa condition. L’ensemble de ces éléments de démonstration est basé sur l’analyse de diverses sources, dont les instruments internationaux portant sur le phénomène de travail de l’enfant et sur les droits de l’enfant, la doctrine pertinente, les pratiques et politiques des institutions internationales, les commentaires généraux des organes de mise en œuvre des droits de la personne en général et des droits de l’enfant en particulier, etc. En conclusion, il est possible d’affirmer qu’une approche basée sur les droits de l’enfant, supportée par un travail décent adapté au travail de l’enfant, est à même de contribuer efficacement à la protection de l’enfant travailleur.

Cette étude porte sur la communication entre le personnel enseignant et les familles immigrantes albertaines. De nombreux auteurs ayant souligné les difficultés de communication école-familles, nous nous sommes intéressé aux solutions susceptibles de favoriser cette dernière. Ce faisant, nous avons adopté une approche innovatrice tant au niveau du contenu que des participants concernés. L'approche bioécosystémique (Bronfenbrenner et Morris, 1998) de plus en plus utilisée dans les études traitant des questions relatives à la famille et à l'école (Beckman, 2003) nous est apparue comme un cadre théorique approprié, puisque les différences d'origine entraînent nécessairement des différences d'ordre macrosystémique et que la communication école-familles constitue un mésosystème de première importance pour la réussite scolaire des enfants (Bhattacharya, 2000). Adoptant une approche socioconstructiviste, nous avons donné la parole aux principaux intéressés, soit des membres du personnel d'écoles albertaines et des parents dont les enfants fréquentent ces écoles, en recueillant nos données dans le cadre de trois groupes de discussion, composés l'un d'enseignants et d'enseignantes, l'autre de parents et le troisième regroupant les deux catégories de participants. Nos résultats indiquent que tous souhaitent un rapprochement : le groupe du personnel enseignant a proposé des solutions pratiques, immédiates, axées sur l'école et la communauté, celui des parents a surtout envisagé des solutions politiques et le groupe mixte s'est davantage penché sur la qualité de la communication comme telle. Tous et toutes ont vivement souhaité l'implication des organismes communautaires et des associations ethniques ainsi que la formation du personnel enseignant à l'interculturalité. Bien que le discours des participants ait été assez consensuel, nous avons noté quelques divergences d'opinion liées à leurs valeurs culturelles : qu'ils soient enseignants ou parents, les immigrants ont davantage supporté le recours à la communication orale, au réseautage et aux messages en langues étrangères que les enseignants natifs du Canada.

Objectif : Le but de l'étude est de développer une typologie de la protection féminine afin de poser un diagnostic de protection, diagnostic aujourd'hui absent du système de santé. Conception : Le concept de la protection se réfère au cadre théorique plus général du paradigme de la salutogenèse. Il rassemble un ensemble de facteurs salutogènes et existentiels qui concourent, dans la phase critique du cancer du sein, à expliciter la façon de penser des femmes et le maintien de la santé en situation extrême. Méthodologie : La recherche est basée sur une approche exploratoire intensive avec mesures répétées, une méthode mixte de recherche (Creswell, 2008), le recours à la triangulation lors du recueil de données (enquête - questionnaire - entretiens) et une approche analytique et systémique pour saisir la structure et la dynamique interne des différents types de femmes. Résultats principaux : La série d'analyse réalisée a mis en évidence trois types de protection. : (1) une protection dite opérante, c'est-à-dire propre à être faiblement stressée, à faire preuve de discernement, à s'engager résolument, à croire en elle et en un contrôle de l'évolution du cancer. Une protection qui agit face aux événements, a une perspective de santé positive et devient plus philanthrope; (2) une protection dite mixte (qui produit deux effets différents) qui a comme propriétés essentielle d'être impressionnée, dans la vie quotidienne, face aux figures d'autorité, et de ce fait, est confuse et se désengage. Une protection qui a comme attributs de nier le diagnostic de cancer, de s'attribuer une part de responsabilité dans la survenue de la maladie, de s'affirmer progressivement et de se réaliser face à l'autorité morale du cancer et, de ce fait, a une perspective de santé plus positive ; et (3) une protection dite inopérante (G1), c'est-à-dire qui a comme particularités d'être faiblement stressée, confuse et désengagée face à l'autorité. Une protection qui a comme propriétés essentielles une attribution causale interne, une croyance moyenne en elle et une dénégation de l'état de malade. Une protection qui cesse de se battre, a une perspective de santé négative, recherche une tranquillité d'esprit après avoir perçu la gravité de la maladie et s'être souvenue qu'il vaut mieux, face à toute autorité morale et à celle du cancer en particulier, faire preuve de prudence et se soumettre. En somme, dans la population à l'étude une femme sur deux atteinte d'un cancer du sein rencontre des difficultés pour s'en protéger et une sur quatre n'y parvient pas. Conclusion: Une approche salutogène intégrée et systémique peut permettre aux professionnels de santé de repérer, d'une manière systématique et standardisée, les femmes qui se protègent et ainsi être apte à bien répondre à leurs attentes et à leurs difficultés. Une telle approche promeut la santé en situation de cancer du sein.

Cette thèse présente un traitement inspiré du fonctionnement du système auditif pour améliorer la reconnaissance vocale. Pour y parvenir, le signal de la parole est filtré par un banc de filtres et compressé pour en produire une représentation auditive. L'innovation de l'approche proposée se situe dans l'extraction des éléments acoustiques (formants, transitions et onsets ) à partir de la représentation obtenue. En effet, une combinaison de détecteurs composés de neurones à décharges permet de révéler la présence de ces éléments et génère ainsi une séquence d'événements pour caractériser le contenu du signal. Dans le but d'évaluer la performance du traitement présenté, la séquence d'événements est adaptée à un système de reconnaissance vocale conventionnel, pour une tâche de reconnaissance de chiffres isolés prononcés en anglais. Pour ces tests, la séquence d'événements agit alors comme une sélection de trames automatique pour la génération des observations (coefficients cepstraux). En comparant les résultats de la reconnaissance du prototype et du système de reconnaissance original, on remarque que les deux systèmes reconnaissent très bien les chiffres prononcés dans des conditions optimales et que le système original est légèrement plus performant. Par contre, la différence observée au niveau des taux de reconnaissance diminue lorsqu'une réverbération vient affecter les données à reconnaître et les performances de l'approche proposée parviennent à dépasser celles du système de référence. De plus, la sélection de trames automatique offre de meilleures performances dans des conditions bruitées. Enfin, l'approche proposée se base sur des caractéristiques dans le temps en fonction de la nature du signal, permet une sélection plus intelligente des données qui se traduit en une parcimonie temporelle, présente un potentiel fort intéressant pour la reconnaissance vocale sous conditions adverses et utilise une détection des caractéristiques qui peut être utilisée comme séquence d'impulsions compatible avec les réseaux de neurones à décharges.

Le but de cette thèse est de développer un absorbant acoustique à base de panic érigé, sur le principe du développement durable, dans le but de l'utiliser pour des applications acoustiques en intérieur et d'être une alternative à la laine de verre. Ainsi, les questions environnementales, économiques et sociétales sont à prendre en compte. Autrement dit, le produit devra être fabriqué localement avec des ressources renouvelables tout en minimisant le transport et l'énergie nécessaire pour son cycle de vie au complet. L'utilisation du panic érigé est une avenue dans la mesure où cette plante pousse sans apport particulier de l'homme et fournit une quantité de paille abondante (c.-à-d.. quatre fois plus que le blé). Son implantation permettrait de valoriser les terrains peu cultivables des agriculteurs. Une extension de la méthode des matrices de transfert a été proposée afin de simuler non plus des empilements de matériaux acoustiques en série (c.-à-d.. l'un derrière l'autre) mais en parallèle (c.-à-d.. l'un à côté de l'autre). Cette méthode permet, ainsi, de modéliser l'empilement de tiges de panic érigé dans une configuration dite ``longitudinale'' par rapport à la propagation sonore et de prédire la réponse de systèmes acoustiques assemblés en parallèle (p. ex. résonateurs quart d'onde) qui peuvent donner naissance à de potentiel concept en panic érigé. Ainsi, le projet se découpe en deux étapes majeures : la caractérisation acoustique de la plante et sa modélisation puis l'élaboration (c.-à-d.. modélisation, fabrication et optimisation) d'un concept acoustique à partir de cette plante.

Le mémoire de maîtrise intitulé Religion et développement : étude de cas sur le mouvement indien Swadhyay Parivar présente une description approfondie d'un mouvement socio-religieux, dont la vision de développement personnel et communautaire s'enracine dans le patrimoine culturel et spirituel de l'Inde. Il vise à démontrer que le développement endogène, qui tire pleinement partie [i.e. parti] des ressources matérielles et spirituelles locales peut constituer une option très viable en matière de développement. Cette recherche lance un double défi : celui de prendre en compte les multiples avantages du développement conçu par et pour les principaux bénéficiaires, en égard des modèles de développement importés de l'Occident.Le second défi consiste à reconnaître que le développement peut avoir intérêt à intégrer la dimension spirituelle et religieuse de la collectivité visée, moyennant une mise à jour du système religieux traditionnel dont certains éléments peuvent se révéler dysfonctionnels.