Le cancer épithélial de l’ovaire (CEO) est la forme de cancer gynécologique la plus létale. Ainsi, la compréhension des changements moléculaires associés à ce cancer métastatique ovarien peut mener à l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques essentielles. La glycosylation, une modification post-traductionnelle, joue un rôle important dans de nombreuses fonctions cellulaires. Cette glycosylation participe à des événements physiopathologiques majeurs durant la progression tumorale. De plus, il a été prouvé que l’expression aberrante des structures glycanes interfère avec des mécanismes cellulaires comme l’adhésion, la migration et la prolifération des cellules. Dans ce contexte, notre laboratoire a récemment montré que le gène codant pour la protéine N-acétylgalactosaminyltransférase 3 (GALNT3), membre de la famille des GalNAcTransférases (GalNAc-Ts), est hypométhylé et que la protéine GALNT3 est plus fortement exprimée dans les tumeurs CEO dont la sévérité est de grade élevé (“high-grade (HG) serous”), en comparaison avec des tumeurs à potentiel malin faible (“low malignant potential (LMP) ”) et des tissus ovariens normaux. Ces observations indiquent un fort potentiel oncogénique pour le gène GALNT3 dans les stades avancés du CEO. Ces premières constatations suggèrent également que la surexpression de GALNT3 peut jouer un rôle important dans la tumorigenèse du CEO en augmentant sa dissémination via une O-glycosylation de type mucine aberrante. Ces glycosylations anormales peuvent donc être impliquées dans la carcinogenèse ovarienne et nécessitent une étude approfondie. Dans ce projet de recherche, nous proposons d’approfondir les observations déjà obtenues in vitro en utilisant un modèle in vivo chez la souris, afin d’élucider le rôle fonctionnel de la GALNT3 et d’autres membres de cette famille dans la progression du CEO. A partir d’une étude de glycoprotéomique indépendante de la masse, qui a permis d’identifier des glycopeptides intacts ou métaboliquement marqués, ce projet de recherche a rendu possible la définition précise du rôle de GALNT3 dans la O-glycosylation des cibles de type mucine au sein des cellules CEO. Ainsi, via une recherche ciblée dans la base de données « SwissProt » du protéome humain, nous avons trouvé plusieurs centaines de glycoprotéines et glycopeptides uniques, différemment exprimés dans les clones cellulaires dépourvus en iv GALNT3 KD. Par la suite, nous avons identifié les gènes codant pour ces glycoprotéines et glycopeptides. Nous avons notamment trouvé, parmi la liste, un groupe de gènes impliqués dans le métabolisme cellulaire dont les modifications post-traductionnelles sont, de manière intéressante, principalement supprimées dans les clones GALNT3 KD. De plus, nous nous sommes intéressés aux autres membres de la famille des GalNAc-Ts dans le CEO et nous avons montré que de multiples membres et pas uniquement GALNT3 peuvent jouer un rôle important dans la dissémination et la progression du CEO. De plus, une découverte très intéressante fut la redondance possible des rôles joués par certains membres de la famille des GalNAc-Ts dans le CEO. Ainsi, nous avons identifié GALNT6 qui serait, à l’image de GALNT3, impliquée dans la dissémination et la progression du CEO. Cette implication du GALNT6 est supportée par le fait que cette protéine a les mêmes fonctions que GALNT3, suggérant un effet compensatoire de GALNT6 en absence de GALNT3. Pour tester cette hypothèse, nous avons abolie l’expression des deux protéines GALNT3 et GALNT6, in vivo, et nous avons observé une effet significatif sur la formation des tumeurs et la survie des animaux. Pour la suite de ce projet, nous proposons d’analyser la structure glycane des différentes glycoprotéines identifiées dans les cellules cancéreuses, afin de déterminer les altérations des modifications O-glycanes suite à la perte d’expression de GALNT3 et d’autres membres de la famille des GalNAc-Ts. En conclusion, notre étude contribue à comprendre la participation du glycoprotéome dans la tumorigenèse du CEO et à identifier d’autres cibles de type mucine ou des O-glycoprotéines dont l’expression aberrante serait modulée dans le CEO. Ainsi, pris dans son ensemble, ce projet de recherche montre la possibilité de discriminer entre des cellules cancéreuses et des cellules contrôles via les glycosylations de leurs protéines et permet d’entrevoir la glycobiologie comme une voie prometteuse pour l’identifier de nouveaux biomarqueurs pour le diagnostic du CEO. / Epithelial ovarian cancer (EOC) is the most lethal gynecologic malignancy, thus understanding the molecular changes associated with ovarian cancer metastasis could lead to the identification of essential therapeutic targets. Glycosylation is a post-translational modification (PTM) of proteins playing a major role in various cell properties. Glycosylation participates in major pathophysiology events during tumor progressions, and the aberrant expression of glycan structures was shown to interfere with cell properties such as cell adhesion, migration, and proliferation. The lab has previously identified the polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 (GALNT3) gene, a member of the GalNAc-Transferases (GalNAc-Ts) gene family, as hypomethylated and overexpressed in high-grade (HG) serous EOC tumors, compared to low malignant potential (LMP) EOC tumors and normal ovarian tissues. Taken together, the data obtained were indicative of a strong oncogenic potential of the GALNT3 gene in advanced EOC and suggest that GALNT3 overexpression might contribute to EOC dissemination through aberrant mucin O-glycosylation, thus specifying some of the putative mechanisms of abnormal glycosylation implicated in ovarian carcinogenesis, which warrant further investigation. The current research project focused on expanding the in vitro observations obtained by using animal models to investigate in vivo the functional significance of GALNT3 and other close members of the GalNAc-Ts gene family in serous EOC progression. Moreover, by applying a mass-independent chemical glycoproteomics platform to characterize intact, metabolically labeled glycopeptides, this project more profoundly characterized the role of GALNT3 in aberrant O-glycosylation of mucin-like targets in EOC cells. Isotopically recorded ions were searched against the Swiss-Prot human proteome; and data obtained were indicative of hundreds of unique glycoproteins and glycopeptides that were differentially expressed upon GALNT3 KD. Related gene groups were identified, and interestingly, genes implicated in mechanisms of cellular metabolic functions, and PTMs were found to be predominantly suppressed in GALNT3 KD clones. In accordance, we also investigated the role of other members of the GalNAc-T family in EOC and we showed that multiple members and not only GALNT3 can play an important role in EOC cancer dissemination and progression. One very interesting finding was the redundant role some members of the GalNAc-T family members play in EOC. We investigated the compensatory functions of GALNT3 and GALNT6, and we were able to demonstrate these two genes can impose that synthetic backup. Furthermore, we found that and their ablation can affect animal survival and tumor formation as observed both in vivo and in vitro. In continuation of this work, this project will focus on analyzing the glycan structures of those differentially expressed glycoproteins, to further examine the specific O-glycans alterations associated with the GALNT3 and other members of the GalNAc-Ts upon gene knockout (KO). Fully elaborated glycopeptides can reveal structural details of the glycoproteome, thus our results could give important information on the glycome in EOC cells, and the identification of other O-glycoproteins/mucin-like targets whose aberrant expression may be modulated by these in EOC. Taken together, the ability to mark differences in the glycosylation of proteins between cancer cells and control cells can emphasize glycobiology as a promising field for potential biomarker identification.

Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2006-2007 / Le récepteur Bj (RBi) des kinines émerge présentement comme une cible thérapeutique de choix pour le traitement de l'inflammation et de la douleur inflammatoire. Bien que les mécanismes régissant l'expression du RBi en conditions pathologiques soient relativement bien documentés au niveau transcriptionnel, peu de données sont disponibles sur sa régulation post-traductionnelle. Les travaux présentés dans cette thèse, principalement basés sur des modèles cellulaires exprimant des RBi recombinants ou naturels, de même que sur des essais de contractilité exploitant des vaisseaux sanguins isolés, visaient à améliorer notre connaissance du RBi et de ses ligands à l'échelle moléculaire. La première partie des études traite des processus enzymatiques qui affectent négativement la puissance de divers ligands peptidiques du RBi dans l'aorte de lapin. L'identification de l'aminopeptidase N exprimée par les cellules musculaires lisses en tant que voie d'inactivation majeure des ligands peptidiques du RBi, a mené à la synthèse de nouveaux antagonistes résistants au métabolisme de cette enzyme. Un prototype d'une nouvelle classe de médicaments inhibant à la fois le RBi et l'aminopeptidase N a aussi été découvert. Le deuxième volet des travaux a démontré que le RBi exprimé à la surface cellulaire est instable et rapidement internalisé en absence de stimulation par l'agoniste. De plus, la démonstration que de nouveaux antagonistes non peptidiques du RBi peuvent agir comme chaperons pharmacologiques en optimisant la maturation du récepteur, a permis de mettre en lumière l'existence d'une forme hautement glycosylée et sensible à l'agoniste du RBi. De façon globale, ces travaux ont mis en évidence l'instabilité moléculaire du RBi et de ses ligands. Les études de pharmacologie moléculaire présentées dans cette Thèse soulèvent aussi plusieurs questions, et ouvrent la voie à de nouvelles investigations sur la régulation du RBi des kinines dans un modèle cellulaire humain.

La méthode d’auto-assemblage développée au Laboratoire d’Organigénèse Expérimentale (LOEX) est très efficace afin de produire des substituts cutanés autologues absents d’agents exogènes. Une adaptation possible de cette méthode permet d’obtenir un substitut cutané présentant un phénotype psoriasique. L’objectif de ce travail a été de poursuivre la validation du modèle de substitut cutané produit par la méthode d’auto-assemblage en évaluant la capacité métabolique des substituts via l’emploi de molécules antipsoriasiques comme le tazarotène. Pour ce faire, des tests de perméabilité cutanée combinés à une détection par chromatographie ultra performante ont été envisagés afin d’évaluer d’une part les structures adéquates des peaux reconstruites et d’autre part d’établir des liens avec ces résultats et les capacités de métabolisation du modèle. Les résultats obtenus démontrent une capacité métabolique chez les substituts cutanés. De plus, des différences au niveau de la perméabilité sont observées entre les différents types de peau utilisés, confirmant que le modèle est de plus en plus représentatif. / The self-assembly method developed at the LOEX is very effective to produce autologous skin substitutes free of exogenous agents. A possible adaptation of this method allows the reconstruction of a skin substitute having many features of a psoriatic phenotype. The objective of this work was to follow the validation of the skin substitutes produced by the self-assembly method by the evaluation of the skin substitutes metabolism using antipsoriatic molecules like tazarotene. Percutaneous absorption combined with an ultra performance liquid chromatography has been selected in order to evaluate on one hand the appropriate structures of the reconstructed skins and on the other hand, to establish some links with these results and their capacity of metabolism. Results obtained from shown that metabolization has been detected in skin substitutes. Moreover, permeability differences have been observed of each kind of skin used on this study. This confirms that our skin model is more and more representative.

Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2006-2007 / La présente étude visait l'identification des déterminants psychosociaux et liés à la famille associés à l'intention des élèves de cinquième année du primaire à faire des activités physiques régulièrement. Pour l'enquête, un questionnaire a été élaboré sur un support informatique (ordinateur de main POCKETPC) afin de mesurer les variables d'un cadre théorique intégrateur. Au total, 93,5% des élèves rencontraient les standards émis par Kino-Québec concernant la quantité requise d'activité physique chez les jeunes. Selon un modèle d'analyse de régression linéaire multiple, les résultats indiquent que l'intention des enfants est prédite par la capacité à surmonter les barrières, l'identité personnelle, l'attitude positive et le comportement passé. Les variables reliées à l'influence sociale et familiale et aux caractéristiques sociodémographiques des enfants ne se sont pas avérées significatives. En conclusion, la présente étude a permis d'identifier des pistes d'intervention pouvant servir à promouvoir la pratique de l'activité physique auprès de cette population.

La douleur peut exercer un effet inhibiteur sur l'excitabilité corticospinale. L'anticipation de la douleur et la douleur elle-même semblent également avoir des bases neuronales communes. Ce projet visait donc à caractériser l'effet de la douleur et de son anticipation sur l'excitabilité corticospinale. La stimulation magnétique transcrânienne a été utilisée pour mesurer l'excitabilité corticospinale chez 15 sujets sains. Cinq conditions expérimentales ont été testées à l'aide d'une thermode, soit une condition neutre, deux conditions d'anticipation (chaleur et douleur), ainsi que deux conditions d'application (chaleur et douleur). Seule la condition de douleur a produit une inhibition significative de la voie corticospinale. L'anticipation de la douleur n'a pas modifié de façon significative l'amplitude des réponses musculaires évoquées par la TMS. Le fait que la douleur faible et de courte durée puisse induire une inhibition motrice suggère que la douleur modérée peut interférer avec une fonction motrice optimale.

Comparativement aux personnes moins sédentaires, les personnes qui accumulent le plus de temps en position assise ont un risque plus élevé de mortalité prématurée ainsi qu’un risque plus élevé d’avoir des maladies chroniques ainsi qu’une santé métabolique détériorée. La diminution des comportements sédentaires semble procurer des effets bénéfiques sur la santé et le bien-être des gens. Peu d’études ont investigué les effets de la diminution de la position assise sur le bien-être au travail des employés. Le potentiel des réunions actives sur ergocycle a été mesuré auprès de 30 employés de l’Université Laval grâce à un devis semi-expérimental. Les résultats montrent qu’il est possible de réaliser une réunion active à une intensité variant entre faible et modérée sans affecter l’attention ni la concentration. Les réunions actives d’une durée de 60 minutes semblent avoir particulièrement le potentiel de diminuer le stress perçu lors de l’effort cognitif. Il serait dans l’intérêt de la santé publique de s’attarder davantage aux types d’interventions qui permettent de diminuer les comportements sédentaires dans les milieux de travail. / Sedentary behaviors are associated with a higher risk of mortality as well as deteriorated metabolic health. Interruption of sedentary behavior appears to have beneficial effects on health and well-being of people. Few studies have examined the effects of alternatives to sitting on well-being of employees at work. Using semi-experimental protocol, the potential of active meetings on ergocycle have been quantified and evaluated with 30 employees of Université Laval. The results showed that it is possible to perform an active meeting of 60 minutes at an intensity varying between low and moderate without reducing the quality of work. Active meetings seem to have the potential to reduce perceived stress during cognitive effort, without compromising productivity. In our opinion, it would be in the interest of public health to focus more on interventions that reduce sedentary behavior in workplace.

This thesis attempts to provide an encompassing account for the centuries-old question concerning how aspect and modality are grammaticalized in the verbal system in Biblical Hebrew. To this end, the semantics of the three verb forms qatal, yiqtol, and qotel are investigated by means of a theory-unbiased observation on the Biblical text. It is argued that Biblical Hebrew has an aspectual opposition of the perfective and the imperfective and that the two aspects are encoded by the verb forms qatal and qotel, respectively. Concerning the modal system in Biblical Hebrew, it is suggested that the Biblical Hebrew broadly distinguishes the realis and irrealis and that the irrealis is marked by a single verb form yiqtol. Finally, the verbs occasioned in the Book of Isaiah 52:13-53:12 are thoroughly examined in the light of the present study. The examination on the Isaiah passage consequently ascertains that the present study largely removes the existing obstacles in understanding Biblical Hebrew verb conjugations and lays the significant grounds toward the proper linguistic understanding of the Biblical text. / text

This dissertation investigates the verbal system of Persian and is focused on the interaction of modality, tense, aspect and negation in this language. The dissertation challenges the idea that the syntactic structure maps on to the semantic interpretation or vice-versa.It is argued that modals are raising constructions in some languages (Wurmbrand 1999). Modals in Persian, which do not have subject-raising constructions, show different behavior. First, the root complex modals are generally syntactic control in Wurmbrand's (1998, 2001) proposal. There are just a few gaps with respect to dynamic root modals. Second, all epistemic modals which are either defective auxiliary modals or complex modals take default agreements and are pseudo-raising constructions. Third, the syntactic structures of modals show that there is no one-to-one correspondence between the structural positions and semantic interpretations of modals in Persian except in the auxiliary modal bâyad 'must'.The second contribution of this dissertation is that the class of restructuring verbs varies across languages. German semantic control verbs are instances of restructuring constructions (Wurmbrand 2001) while the only case of restructuring in Persian is the functional restructuring which appears in auxiliary modals such as bâyad 'must' and šâyad 'may' since they are mono-clausal and do not have a CP.This dissertation also investigates the structure of complex verbal forms in Persian. It is argued that Persian future tense is an instance of Serial Verb Constructions. However, progressives which are bi-clausal constructions are Aspectual Complex predicates.In the case of the structural analysis of the interaction of Persian modals and negation, this dissertation shows that the syntactic structure maps on the semantic interpretation or vice-versa. There are just a few gaps with respect to the scope possibilities of particular modals.The final contribution of this dissertation is related to the problem of the word order of NV elements and LV within complex predicates. This research provides three suggestions regarding the clausal complement position in complex predicates, and suggests that the vP remnant movement is the most reasonable one, since it is compatible with the recent trends of syntactic theories and suggested for some other languages (Mahajan 2003).

This thesis presents a feature-based approach to aspect. I argue that both viewpoint aspect and lexical aspect are generated from the presence of functional properties that operate at three levels of syntactic structure: lexical, predicate, and clausal. The same aspectual feature has a different effect on the aspectual properties of the clause as a whole depending on the level at which it is active and the contrasts in which it participates. I illustrate this for English and Japanese, showing that a small number of syntactic features can capture the differences and similarities between the aspectual systems. I propose that aspect in English is determined by two functional heads: AspQ, which encodes quantity (i.e., telicity), and AspA, which encodes atomicity (i.e., punctuality). AspQ may either be a root modifier, lexically encoding quantity, or head a separate functional projection within the vP system, where it is licensed by a quantized argument. AspA may also be a root modifier, lexically encoding atomicity; it may also appear in the inflectional domain, where it encodes clausal non-atomicity (i.e., imperfective aspect). I propose that Japanese is like English in that AspA may be active at the root level; however, it differs from English in that AspA may also be active at the vP level, where it encodes the fact that the predicate is represented as a single unit. Japanese also differs from English in that it does not make use of the feature AspQ, meaning that Japanese has no quantity distinction, and makes use of the feature State, which heads a functional projection where light verbs such as iru ‘be’ are merged. Thus, the differences in the aspectual systems of English and Japanese are attributed to a few features that are active at different levels of syntactic structure.

This thesis presents a feature-based approach to aspect. I argue that both viewpoint aspect and lexical aspect are generated from the presence of functional properties that operate at three levels of syntactic structure: lexical, predicate, and clausal. The same aspectual feature has a different effect on the aspectual properties of the clause as a whole depending on the level at which it is active and the contrasts in which it participates. I illustrate this for English and Japanese, showing that a small number of syntactic features can capture the differences and similarities between the aspectual systems. I propose that aspect in English is determined by two functional heads: AspQ, which encodes quantity (i.e., telicity), and AspA, which encodes atomicity (i.e., punctuality). AspQ may either be a root modifier, lexically encoding quantity, or head a separate functional projection within the vP system, where it is licensed by a quantized argument. AspA may also be a root modifier, lexically encoding atomicity; it may also appear in the inflectional domain, where it encodes clausal non-atomicity (i.e., imperfective aspect). I propose that Japanese is like English in that AspA may be active at the root level; however, it differs from English in that AspA may also be active at the vP level, where it encodes the fact that the predicate is represented as a single unit. Japanese also differs from English in that it does not make use of the feature AspQ, meaning that Japanese has no quantity distinction, and makes use of the feature State, which heads a functional projection where light verbs such as iru ‘be’ are merged. Thus, the differences in the aspectual systems of English and Japanese are attributed to a few features that are active at different levels of syntactic structure.