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Análise glicômica comparativa de carcinomas mamários primários e metástases axiliares correspondentesFERREIRA, Steffany de Almeida 15 February 2016 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-07-05T17:52:35Z
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Previous issue date: 2016-02-15 / FACEPE / O câncer de mama (CID10 - C50) é uma doença complexa que pode adquirir um caráter mais invasivo e resistente por inúmeras mudanças moleculares que levam a uma exacerbação da proliferação celular e uma instabilidade genética. A pesquisa envolvendo linfonodos axilares comprometidos é de grande importância para o reconhecimento e compreensão dos mecanismos iniciais relacionados ao processo de metastatização. Evidências histoquímicas demonstram que a sialilação de superfícies de células tumorais bem como a expressão de glicanos truncados está associada a um fenótipo de tumor metastático, porém, o estudo deste perfil na metástase linfonodal é pouco explorada. O objetivo deste estudo foi comparar o perfil de sialilação e a expressão dos antígenos carboidratos não sialilados associados ao tumor mamário e nos linfonodos correlacionando com as características clínico-patológicas e biomarcadores clássicos para câncer de mama. O padrão de sialilação e a expressão de glicanos truncados foi detectada por histoquímica com lectinas. Utilizou-se imunohistoquímica para detecção das sialiltransferases e dos marcadores de rotina para câncer de mama. Houve expressão de ácido siálico, especialmente na posição α2,6 no tumor primário e no linfonodo axilar o que nos permite pensar na possibilidade de que clones do tumor primário mantiveram suas características fenotípicas, influenciadas pela sialilação, durante a invasão e metástase linfonodal. Não foi verificada diferença significativa entre a expressão de ácido siálico e os biomarcadores clássicos quer seja no carcinoma mamário quer seja no linfonodo axilar correspondente. As análises da expressão de β-galactosideo α2,3 e α2,6 sialiltransferases reforçam esta hipótese. Além disso, houve expressão dos antígenos truncados em ambos os sítios, o antígeno Tn foi mais expresso na metástase linfonodal podendo ser resultante de um resgate deste antígeno para facilitar a sua fixação no novo microambiente. A monitorização do perfil de sialilação bem como dos glicanos truncados não sialilados pode ser importante para o diagnóstico de metástases de tumores. / Breast cancer (ICD10 - C50) is a complex disease that can acquire a more invasive and resistant nature of many molecular changes that lead to the exacerbation of cell proliferation and genetic instability. Research involving compromised axillary lymph nodes is of great importance to the recognition and understanding of the mechanisms related to early metastasizing process. Histochemical evidence demonstrates that sialylation of tumor cell surfaces and the truncated glycan expression is associated with a metastatic tumor phenotype, however, the study of lymph node metastasis in profile is little explored. The aim of this study was to compare the sialylation profile and the expression of non sialylated carbohydrate antigens associated with breast tumor and lymph nodes correlated with clinicopathological features and classic biomarkers for breast cancer. The pattern of sialylation and expression of truncated glycans was detected by lectin histochemistry. Immunohistochemistry was used to detect the sialyltransferases and routine markers for breast cancer. There was sialic acid expression, especially in the α2,6 position in the primary tumor and axillary lymph node which allows us to think about the possibility that the primary tumor clones maintained their phenotypic characteristics, influenced by sialylation during the invasion and lymph node metastasis. There was no significant difference between sialic acid expression and classic biomarkers either in breast carcinoma either in the corresponding axillary lymph node. The analyzes of β-galactoside expression α2,3 and α2,6 sialyltransferases reinforce this hypothesis. Furthermore, there was expression of antigens truncated at both sites, Tn antigen was expressed on most lymph node metastasis can be due to a rescue of the antigen to facilitate their attachment to the new microenvironment. Monitoring of sialylation profile as well as truncated sialylated glycans may not be important for the diagnosis of tumor metastasis
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Investigação das causas da queda da incidencia de gemeos em uma população brasileiraHerrera, Haroldo Villarroel 12 August 2018 (has links)
Orientador : Bernardo Beigueiman / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-12T00:01:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1992 / Resumo: o presente trabalho foi realizado com base em um levantamento de dados feito na Maternidade de Campinas, havendo.coleta de informações a respeito da incidência de partos gemelares, sexo dos gêmeos e dos recém-nascidos de parto único, idade materna, cor da pele, número de gestações, paridade, número de abortos, número de prematuros, número de recém-nascidos a termo, natimortalidade,data de nascimento dos recém-nascidos e idade de inicio da menarca das parturientes. A coleta de dados dos anos de 1925 a 1939 foi obtida sem intervalos, mas entre 1940 e 1965 os dados foram colhidos em intervalos de cinco anos. As informações a respeito de 1990 foram obtidas sem solução de continuidade. AS principais conclusões que podem ser extraídas do presente trabalho são as seguintes: 1. A incidência de gêmeos está correlacionada Pósitivamente à idade materna, à paridade', ao número de gestações e à porcentagem de mães negróides na população, sendo responsavel por essa correlação a freqüência de pares dizigóticos. 2. As mães negróides têm, maior probabilidade de gerar gêmeos do que as caucasóides, em todas as faixas etárias e.em qualquer grau de paridade ou de gestação, sendo os gêmeos mais provavelmente dizigóticos. 3. A incidência de gêmeos durante o período entre 1925 e 1990 baixou 60, 5% (de 20 por mil em 1925 a 1929 para 7,9 por mil em 1990), sendo essa diminuição conseq"ência' da qu_ da da taxa de dizigóticos entre os recém-nascidos. 4. Contribuiram para o declÍnio da incidência de gêmeos nesse período: 4.1 - A gradativa e acentuada diminuição das mu1heres negróides entre as parturientes. Assim, nos anos de 1925, a 1929 a ,porcentagem das mulheres negróides entre as parturientes era igual a 24%, enquanto que em 1984 havia 7,8% dessas mulheres. 4.2 - A diminuição gradativa e acentuada da par! dade média das mulheres, a qual já vinha sendo acusada antes do advento dos métodos anticoncepcionais eficientes (1950 a 1965). Assim, o valor da paridade média, que era 3,04 em 1925 a 1949, caiu para 2,87 em 1950 a 1965, e diminuiu para 2,05 em 1990. o número médio de gestações mostrou-se altamente corre1acionado com a paridade média. 4.3 - A diminuição da média da idade materna. 5. As mães de gêmeos mostraram, em todos os pe riodos analisados, menor taxa de abortos e de natimortos que as mães de concepto único. 6. As mães de gêmeos sempre apresentaram idade mêdia mais elevada do que as mães de concepto único. 7. As mães de gêmeos iniciam a menarca em idade inferior à das mães de concepto único. 8. A razão de sexo entre os gêmeos recém-nascidos foi inferior à observada entre os recém-nascidos de parto único. Assim, nos períodos de 1925-1949, 1950-1965 e 1970-1990 a razão de sexo foi! respectivamente igual a 101,1:100, 92,3:100 e103,8:100 entre os gêmeos e 109,5:100, 107,7:100 e 105,5:1.00 entre os recém-nascidos de parto único. 9. Não foi possível detectar natimortalidade preferencial quando os gêmeos foram classificados em pares masculinos (MM), femininos (FF) e di_ cordantes quanto ao sexo (MF), nem quando os dados a respeito dos gêmeos de sexo idêntico (MM + FF) foram reunidos. 10. Atualmente a taxa de natimortos dos gêmeos de Campinas não difere daquela,observada entre os conceptos de parto único,sendo baixíssima em ambos os casos. Em 1990 não.foram constatados natimortos entre os gêmeos nascidos na Maternidade de Campinas, sendo que entre os nascidos de parto único a taxa dos que não sobreviveram por esse tipo de,óbito foi igual a 2 por mil. 11. Apesar de Campinas não apresentar diferenças muito marcantes entre as estações do ano, constatou-se, surpreendentemente, que a incidência de gêmeos mostra variação sazonal, com aumento nos meses de verão e de inverno, à custa da elevação da incidência de pares monozigóticos / Abstract: Not informed. / Doutorado / Genetica / Doutor em Ciências Biológicas
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O papel da dispersão do teosinte na domesticação do milhoTorreão, Ana Beatriz Ferreira 23 September 1991 (has links)
Orientador : William Jose da Silva / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T00:43:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1991 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas
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Caracterización de las regiones determinantes de resistencia a antimicrobianos de cepas de Bartonella bacilliformis aisladas de zonas endémicas del PerúEspinoza Culupú, Abraham Omar January 2014 (has links)
Bartonella bacilliformis, agente causal de la Enfermedad de Carrión transmitida por insectos flebotominos del género Lutzomyia y otros, es una endemia ancestral que afecta especialmente a la población más pobre de nuestros valles interandinos. En el Perú está presente en 12 de 25 departamentos. Es endémica en Ancash, Cajamarca, Amazonas, Cusco, La Libertad y Piura. Pocas son las investigaciones acerca de la susceptibilidad in vitro a antimicrobianos de Bartonella bacilliformis, no se cuenta con una prueba estandarizada de antibiograma para esta bacteria, como tampoco se conocen los mecanismos de resistencia ni las secuencias de los genes asociados a dicha resistencia. Por consiguiente, se ha planteado evaluar la resistencia antimicrobiana in vitro de cepas de Bartonella bacilliformis aisladas de zonas endémicas, mediante métodos convencionales y métodos moleculares, con la finalidad de conocer la resistencia a drogas de las cepas circulantes en las zonas endémicas.
En el presente trabajo se obtuvieron muestras sanguíneas de 47 pacientes procedentes de Piura, Cusco y Ancash las cuales se sembraron en placas de agar sangre e incubaron a 30°C con 5% CO2. Se ha estandarizado un método de difusión por disco (para el antibiograma) y la prueba de Épsilon (para determinar la concentración mínima inhibitoria) para el estudio in vitro de la susceptibilidad antimicrobiana de B. bacilliformis, empleando los aislados clínicos y una cepa del Instituto Pasteur de Francia. Luego se procedió a extraer el DNA genómico, amplificar los genes mencionados, secuenciarlos y analizarlos mediante herramientas bioinformáticas.
Se obtuvieron 3 cultivos positivos. Las cepas fueron sensibles a la ciprofloxacina, gentamicina, rifampicina, eritromicina, cloranfenicol, ceftriaxona y amoxicilina y resistentes al ácido nalidíxico. Del análisis de las secuencias aminoacídicas de las proteínas de GyrA, GyrB, ParC y ParE de B. bacilliformis, asociados a la resistencia de las quinolonas (ciprofloxacina, ácido nalidíxico) se concluye que presentan diferencias aminoacídicas de Ser por Ala, en comparación con las secuencias de las proteínas respectivas de E. coli K12 MG1655. Esta diferencia probablemente confiera resistencia al ácido nalidíxico pero no a la ciprofloxacina en B. bacilliformis. Se determinó que las QRDR de las proteínas GyrA, GyrB, ParC y ParE de B. bacilliformis están comprendidas entre los aminoácidos 74 a 124, 428 a 426, 67 a 118, y 473 a 530, respectivamente. Para el antibiótico rifampicina se determinó la RRDR en el gen rpoB comprendida entre los aminoácidos 521 a 547, y para el gen rplD de la proteína L4 relacionado con resistencia a eritromicina reportamos la ERDR nunca antes mencionado y comprende los aminoácidos 60 a 79, siendo el primer reporte para este gen en Bartonella bacilliformis. Finalmente en el modelamiento de las estructuras terciarias de las regiones determinantes de resistencia se apreciaron cambios en las posiciones de Ser por Ala, y estos cambios permiten una débil interacción con la droga. Al evaluar los perfiles de hidrofobicidad de los aminoácidos pertenecientes a la región determinante de resistencia, nos permitió inferir que los cambios de aminoácidos con propiedades diferentes como Ser por Ala contribuyen a la resistencia.
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Detección de SNP en genes CYP2C8 de pacientes con cáncer de mama que reciben paclitaxel en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas de marzo a diciembre 2013Flores Fernández, Carol Nathali January 2014 (has links)
El objetivo de este estudio fue detectar la frecuencia de los polimorfismos de nucleótido simple (SNP) CYP2C8*2 y CYP2C8*3 en genes CYP2C8 de pacientes con cáncer de mama que recibieron quimioterapia neoadyuvante con paclitaxel en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN). Además, se asoció la presencia de estos SNP con la respuesta terapéutica y la toxicidad. Se incluyó en el estudio 39 mujeres con diagnóstico reciente de cáncer de mama localmente avanzado que acudieron al consultorio de oncología médica del INEN entre marzo y diciembre del 2013, quienes firmaron el consentimiento informado previo a la ejecución del estudio. Se tomaron muestras de sangre venosa para extraer el ADN genómico y se amplificaron regiones específicas del gen CYP2C8 mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con cebadores diseñados para detectar el SNP CYP2C8*2 en el exón 5 y el SNP CYP2C8*3 en el exón 8. Los productos amplificados fueron cortados con las enzimas de restricción BClI y PdmI (XmnI) para CYP2C8*2 y CYP2C8*3 respectivamente. La información clínica y patológica de las pacientes se obtuvo de las historias almacenadas en el archivo de historias clínicas del INEN mediante una ficha de recolección de datos. El SNP CYP2C8*2 no fue detectado en la población estudiada. El SNP CYP2C8*3 fue encontrado en 3 pacientes (7,7 %), dos homocigotos y un heterocigoto, con una frecuencia alélica de 6,4 %. Así mismo, se encontró que 56,5 % de las pacientes presentó neuropatía; 10,3 % leucopenia; 20,5 % anemia; 2,6 % trombocitopenia; 66,7 % incremento de los niveles de TGP y 46,2 % incremento de los niveles de TGO. No se encontró asociación entre el genotipo CYP2C8*3 y el riesgo de neuropatía inducida por paclitaxel (p>0,05). Las pacientes que presentaron el genotipo AA para el SNP CYP2C8*3 (1196 A>G) mostraron diferencias significativas en la reducción del tamaño clínico del tumor y del compromiso ganglionar después de la quimioterapia con paclitaxel (p<0,05). Sin embargo, las pacientes con los genotipos AG y GG para este SNP, no mostraron diferencias significativas. / --- The aim of this study was to detect the frequency of CYP2C8*2 and CYP2C8*3 single nucleotide polymorphisms (SNP) in CYP2C8 genes of patients with breast cancer who received neoadjuvant chemotherapy with paclitaxel at the National Institute of Neoplastic Diseases (INEN). Furthermore, the presence of these SNP with therapeutic response and toxicity were associated. In the study were included 39 women with newly diagnosed of locally advanced breast cancer who attended the oncology doctor’s office of the INEN between March and December 2013. All the patients signed informed consent before study entry. Venous blood samples were taken to extract the genomic DNA and specific regions of the CYP2C8 gene were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) with primers designed to detect the CYP2C8*2 SNP in exon 5 and CYP2C8*3 SNP in exon 8. The amplified products were cut with restriction enzymes BclI and PdmI (XmnI) for CYP2C8*2 and CYP2C8*3, respectively. Clinical and pathological information of the patients was obtained from the medical records stored at the INEN. The CYP2C8*2 SNP was not detected in the study population. The CYP2C8*3 SNP was found in 3 patients (7.7%), two homozygotes and one heterozygote, with an allele frequency of 6.4%. Also, it was found that 56.5% of patients had neuropathy; 10.3% leukopenia; 20.5% anemia; 2.6% thrombocytopenia; 66.7% increase in ALT levels and 46.2% increase in AST levels. No association between CYP2C8*3 genotype and risk of paclitaxel induced neuropathy (p> 0.05) was found. The patients who had the AA genotype for CYP2C8*3 (1196 A>G) showed significant differences in the reduction of clinical tumor size and nodal involvement after chemotherapy with paclitaxel (p <0.05). However, patients with AG and GG genotypes for this SNP showed no significant differences.
Keywords: Breast cancer, CYP2C8 gene, SNP, PCR-RFLP.
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Obtenção, manutenção e caracterização de células-tronco embrionárias equinas /Dores, Camila Bianco das. January 2009 (has links)
Orientador: Fernanda da Cruz Landim Alvarenga / Banca: Rogério Martins Amorim / Banca: José Antonio Visintin / Resumo: A característica inerente às células-tronco embrionárias de se manterem estáveis durante longos períodos de cultivo possibilita que um grande número de células indiferenciadas sejam utilizadas em procedimentos terapêuticos ou realização de pesquisas. Aproximadamente 97 doenças genéticas equinas têm alta homologia com defeitos genéticos de humanos. O estudo de CTE de animais ungulados é útil no estudo de biofarmacos, engenharia genética e elucidação da embriogênese. Trabalhos sobre o isolamento, cultivo e caracterização do perfil genético de CTE equinas são escassos na literatura. No presente estudo, três diferentes métodos do isolamento da MCI foram testados em blastocistos equinos, avaliando o potencial de derivação de linhagens e a expressão do gene Oct-4: 1) separação mecânica (n=26), 2) imunocirurgia (n=6), 3) aspiração por micromanipulação (n=4). Todas as MCI foram cultivadas nas mesmas condições: monocamada de fibroblastos inativadas, meio DMEM/F12 suplementado com LIF, soro fetal bovino, aminoácidos não essenciais, sódio piruvato, l-glutamina e 2-mercaptoetanol. A eficácia do isolamento da MCI e o estabelecimento de linhagens foram avaliados quanto à adesão, aspectos morfológicos dos agregados celulares e velocidade de crescimento. As linhagens estabelecidas foram caracterizadas pela expressão do gene Oct-4 e Nanog. Nenhuma das MCI isoladas do grupo 3 aderiram à placa, e todas morreram entre 48 e 72 horas de cultivo. No grupo 1, uma MCI apresentou crescimento satisfatório apenas durante o cultivo primário. Colônias foram estabelecidas no grupo 2 e, após a segunda passagem, as células foram avaliadas e congeladas. Utilizou-se a RT-PCR para a detecção da expressão dos genes Oct-4 e Nanog em amostras de CTE, anel coriônico e fibroblastos fetais equinos. Todas as amostras expressaram o gene Oct-4, mostrando que o gene é expresso... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The ability of Embryonic Stem cells to be maintained during extended culture periods would support the existence of large pools of undifferentiated stem cells for therapeutic and research applications. Approximately 97 equine genetic diseases have high homology to human genetic defects. ES cell lines from domestic ungulates would also be useful for disease resistance, for biopharming, and in genetic engineering. Studies of the isolation of equine embryonic stem cells and their genetic expression are quite limited. In the present study three different experimental approaches were used for ICM isolation from day 8 blastocysts and further ES cell line derivation and OCT-4 and Nanog expression: 1. Mechanical Process (26), 2. Immunosurgery (6) and 3. Aspiration of the ICM (4). All the ICM were maintained at the same conditions: under inactivated murine fibroblast feeder support in medium supplemented with Leukemia Inhibitor Factor, Fetal Calf Serum, Non essential amino acids, Sodium Pyruvate, L-Glutamine and 2-Mercaptoethanol changed every 24 hours. The colonies were evaluated by attachment, size and shape, type of cells and rate of growth. In addition, established ES cell colonies were characterized by OCT-4 expression. Only ICM outgrowths and colonies containing circular, small, and high ratio nucleo:cytoplasm cells were considered and passaged. None ICM from group 3 attached and all died after 48 to 72 hours after isolation. In group 1, one ICM had successful development but died after the first passage. Colonies were established from group 2. And after proliferation for 2 passages the cells were analyzed and frozen. RT-PCR was performed to evaluate the OCT-4 expression from ES cells, fetal fibroblast and day 32-34 chorionic girdle samples. All samples were positive for OCT-4 expression, showing that the OCT-4 is expressed in both ICM cells and the trophectoderm derived cells... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Avaliação temporal dos efeitos de estresse de contenção no frio sobre os comportamentos relacionados a ansiedade e depressão em duas linhagens de camundongos fêmeasMarchette, Renata Cristina Nunes 05 December 2013 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Farmacologia, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T22:25:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1
319044.pdf: 1473086 bytes, checksum: 8f37126b335d853e6b2fe17d517f609c (MD5) / A resposta de estresse tem valor adaptativo na sobrevivência das espécies, porém quando há uma falha na regulação destas respostas ou uma incapacidade do organismo em se adaptar, as respostas fisiológicas se tornam exacerbadas e causam prejuízos ao organismo, assim como ocorre quando há persistência do estressor por um período prolongado. Essa falha na regulação da resposta de estresse pode se manifestar sistemicamente (úlceras gástricas, supressão imunológica, etc) ou no âmbito comportamental, onde pode causar ou desencadear transtornos ansiosos, depressivos e de dependência. Fatores individuais também influenciam a resposta ao estressor, entre eles a idade, o sexo e fatores genéticos, sendo que mulheres são mais propensas a desenvolver transtornos relacionados ao estresse. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar as influências genéticas e da persistência de um estressor sobre as respostas comportamentais de camundongos. Fêmeas de três meses de idade das linhagens heterogênica Swiss e isogênica C57BL/6J (B6) foram submetidas a seis protocolos de estresse por contenção no frio, sendo três agudos (30 min, uma, seis ou 24h antes do teste comportamental) e três repetidos (3, 10 e 21 dias). Após o período indicado no estresse agudo os animais foram avaliados no teste de sobressalto acústico. Após os protocolos de estresse repetido os animais foram avaliados nos seguintes testes: sobressalto acústico, labirinto em cruz elevado (LCE), e consumo de sacarose. O comportamento dos animais não estressados (naïve) diferiu entre as linhagens em todos os testes, conforme o esperado, indicando a influência de fatores genéticos nos comportamentos observados. Também observamos a influência de fatores genéticos nos animais submetidos ao estresse, sendo que a linhagem B6 apresentou alterações comportamentais em todos os testes realizados, mas somente no protocolo de 21 dias. Já a linhagem Swiss apresentou uma redução na resposta de sobressalto acústico após o protocolo de estresse agudo 1h antes do teste. Esses resultados indicam a importância de fatores genéticos nos comportamentos relacionados à ansiedade e à depressão na presença ou ausência de um estressor. Sugerimos ainda que a comparação entre dados presentes na literatura deve sempre observar a linhagem utilizada, assim como a determinação da linhagem a ser utilizada deve levar em consideração o objetivo do estudo em questão <br> / Abstract: The stress response has an adaptative value on thespecies survival. However, when there is a failure onthe regulation of these responses or an impairedcoping, the physiological responses becomeoverstated and cause damage to the body, as well aswhen there is a persistence of the stressor. This failureon the regulation of stress response can result insystemic injuries (peptic ulcers, immunologicalsuppression, for example) or behavioral impairments,leading to anxiety, mood disorders and drug addiction.Individual features such as age, sex and geneticbackground can bias the stress response, beingwomen more likely to develop stress-related diseases.Therefore, the aim of this study was to evaluate theinfluence of genetic background and stressorendurance on mice behavior. To reach this aim 3monthsold outbred Swiss and inbred C57BL/6J femalemice underwent 6 cold restraint stress protocols,being 3 acute (1, 6 and 24h prior the test) and 3repeated (3, 10 and 21 days). Afterwards, the animalswere exposed to the acoustic startle response,elevated plus maze and sucrose consumption tests.The behavior of naive animals differed in all testsindicating a genetic background control of thesebehaviors. When animals were exposed to the 21 daysrepeated protocol, C57BL/6J mice displayed behavioralterations in all of the tests whereas Swiss miceshowed a reduction of the startle response after the1h acute stress protocol. These results indicate thegenetic background importance on anxiety anddepression-related response, in the presence orabsence of a stressor. It also suggests that a specialattention must be given to the strain used when comparing results presented in literature and the
choice of which strain use in a future work should take in account its goal.
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Perfil genômico do carcinoma de células escamosas de laringe e seu fronte de invasãoAmbrosio, Eliane Papa [UNESP] 31 March 2010 (has links) (PDF)
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ambrosio_ep_dr_botib.pdf: 788460 bytes, checksum: 18c7bc4e895b27a25ad6c61e3df95d08 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O câncer de laringe ocorre em 25% dos carcinomas de cabeça e pescoço e compreende 2% de todas as doenças malignas. É comum o aparecimento de segundos tumores primários e, aproximadamente, 5% dos pacientes apresentam cânceres sincrônicos. Há várias evidências indicando que a população celular presente no fronte de invasão possui características moleculares diferentes das áreas tumorais superficiais, tornando esta região importante para avaliação prognóstica. Neste estudo foram investigadas por CGH cromossômico de alta resolução (HR-CGH) as alterações genômicas na área superficial e no fronte de invasão de carcinomas de laringe e selecionadas regiões específicas para serem avaliadas por outras metodologias para a confirmação dos resultados. O componente superficial e o fronte de invasão de 33 carcinomas de laringe fixados em formalina e em blocos de parafina foram avaliados por HR-CGH. Foram detectadas alterações comuns aos dois componentes assim como alterações exclusivas a cada um deles. Adicionalmente, foi investigada e confirmada a expressão aumentada da proteína ciclina D1 o gene CCND1 esta mapeada em 11q13) por análise de expressão em plataformas de microarranjos de tecidos contendo as areas do tumor e do fronte de invasão. Foi realizada também a análise de marcadores polimórficos de microssatélites mapeados em 3q e 18q em um grupo independente de 33 amostras (DNA tumoral e do sangue periférico) cujos resultados confirmaram as perdas encontradas nestas regiões cromossômicas. A expressão do gene CTTN (mapeada em 11q13) e de sua proteína foram avaliadas e revelaram que os altos níveis de expressão proteica foram correlacionados com invasão perineural nas células do fronte de invasão, sugerindo que esta área pode ser considerada como ferramenta prognóstica em carcinomas de laringe. Foram investigados os ganhos detectados... / Laryngeal cancer occurs in 25% of head and neck carcinomas and comprises 2% of all malignant diseases. The appearance of secondary tumors is common and approximately 5% of patients present concurrent cancers. Preliminary evidence indicates that the cell population present at the source of the invasion front possesses distinct molecular characteristics to surface tumor areas, making this an important region for prognostic evaluation. In this study, genomic alterations in superficial areas and the invasion front of laryngeal carcinomas were investigated by high resolution chromosomal comparative genomic hybridization (HR-CGH) and specific areas were selected for evaluation by other methodologies to confirm the results. The superficial and invasion front components of 33 laryngeal carcinomas fixed in formalin and embedded in paraffin blocks were analyzed by HR-CGH. Alterations common to both components and those exclusive to each area were detected. Additionally, increased ciclin D1 (gene is mapped at 11q13) protein expression was confirmed through immunohistochemistry analysis of tissue microarray platforms containing superficial tumor and invasion front tissues. Polymorphic microsatellites markers mapped at 3q and 18q was also performed on an independent group of 33 samples (tumor and peripheral blood DNA); the results confirmed the losses verified in these chromosomal regions. Expression of the gene CTTN (mapped at 11q13) and its protein were evaluated revealing that high levels of protein expression were correlated with perineural invasion in invasion front cells, suggesting that this area could be considered a prognostic tool in laryngeal carcinomas. The gains detected at 2q24 by HR-CGH were confirmed by FISH and transcript analysis by qRT-PCR. It was found an association between copy number gains of ACVR1 and its overexpression with increased overall survival in laryngeal... (Complete abstract click electronic access below)
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Alterações epigenéticas em adenocarcinomas de próstataAlves, Flávia Cilene Maciel da Cruz [UNESP] 26 May 2009 (has links) (PDF)
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alves_fcmc_dr_botfm.pdf: 1089125 bytes, checksum: 9611b9c1532f063a91add4577e898f7f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / As alterações epigenéticas desempenham funções críticas na regulação de vários genes, funções celulares e conseqüentes mudanças no controle do ciclo celular. Estas modificações têm sido associadas ao desenvolvimento tumoral. Em câncer de próstata, muitos genes hipermetilados foram descritos e indicados como potenciais marcadores diagnósticos, incluindo RARB, RASSF1A, SFN e CDH1. O presente estudo tem como objetivo avaliar a freqüência da hipermetilação dos genes SFN, RARB, RASSF1A e CDH1 nos adenocarcinomas de próstata (CaP) e correlacionar essas alterações com a expressão gênica e proteica e com parâmetros clínicos e histopatológicos. O padrão de metilação dos genes SFN, RARB, RASSF1A e CDH1 foi determinado por PCR-metilação específica em 68 amostras de CaP e em 27 amostras de próstata não neoplásicas (PNN). Expressão dos transcritos RARB e RASSF1A foram avaliados por RT-PCR quantitativo em 73 amostras de CaP, 15 amostras de tecidos prostáticos adjacentes não neoplásicos (PAdj) e dois tecidos prostáticos normais (N). A expressão das proteínas foi avaliada por imunohistoquímica em 141 amostras de CaP, 40 PAdj e dois N. Os resultados foram correlacionados com parâmetros clinico-histopatológicos. A expressão proteica de E-caderina também foi investigada em uma série de 39 CaP e 27 PNN. Os genes RARB e RASSF1A apresentaram-se hipermetilados em CaP (P<0,0001 e P = 0,0017, respectivamente), mas nenhuma diferença foi detectada para SFN. Os níveis dos transcritos e proteínas RASSF1A foram semelhantes entre amostras de CaP e PAdj. Entre os tumores foi detectada a diminuição dos níveis de transcritos de RAR (P=0,001) e da proteína (P=0,0007). Níveis diminídos do mRNA foram associados com a hipermetilação de RARB. A expressão proteica de RAR era nuclear e citoplasmática nos tecidos tumorais. A análise multivaria... / Epigenetic alterations play critical roles in regulation of several genes and cellular functions and their deregulation may disrupt the cellular control leading to tumor development. In prostate cancer (PCa), many hypermethylated genes have been described and indicated as potential prostate cancer diagnostic markers, including RARB, RASSF1A, SFN and CDH1. The current study aimed to evaluate SFN, RARB, RASSF1A, and CDH1hypermethylation frequencies in prostate carcinoma (PCa) and to correlate these alterations with down-regulations at transcriptional and protein levels and with clinical outcome. Methylation pattern of SFN, RARB, RASSF1A and CDH1 were determined by methylationspecific PCR (MSP) in 68 PCa samples and 27 non-neoplastic prostate tissues (NNP). RARB and RASSF1A transcripts expression were evaluated by quantitative RT-PCR in 73 PCa, 15 adjacent nonneoplastic prostate tissues (AdjP) and two normal prostate (N). Methylation and mRNA analysis for RARB and RASSF1A were done in matched samples from 30 PCa and 10 AdjP. Protein expression assessed by immunohistochemistry was evaluated in an independent cohort of 141 PCa, 40 AdjP and two normal prostate tissues. Paired E-cadherin protein and methylation analysis was also investigated in 33 PCa and 20 NNP. The findings were correlated with clinicopathological parameters. RARB and RASSF1A genes were hypermethylated in PCa (P <0.0001 and P = 0.0017, respectively), but no difference was detected for SFN. RASSF1A mRNA and protein levels were similar in PCa and AdjP samples. Down-expression of RAR in transcript (P=0.001) and protein (P=0.0007) levels were detected in tumors. Lower mRNA levels were associated with RARB hypermethylation. Nuclear and cytoplasmic RAR protein expression was detected in tumor tissues. Multivariate analysis demonstrated that cytoplasmic RAR immunostaining was independently associated with decreased... (Complete abstract click electronic access below)
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Validação de descritores, caracterização e diversidade genética de cultivares de espécies comerciais e silvestres de maracujazeiroFonseca, Kenia Gracielle da 24 February 2017 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-06-01T18:25:17Z
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Previous issue date: 2017-08-11 / A variabilidade genética existente no maracujazeiro pode ser utilizada para diversificar o sistema de produção com a obtenção de produtos tecnológicos. Para a proteção de novas cultivares exige-se a utilização de descritores mínimos e ensaios de distinguibilidade, homogeneidade e estabilidade (DHE). Neste trabalho, objetivou-se caracterizar cultivares e matrizes de maracujazeiro azedo (Passiflora edulis Sims) e espécies e cultivares de maracujazeiro silvestre (Passiflora spp.) mediante a utilização de descritores morfoagronômicos e marcadores moleculares visando observar a capacidade dessas ferramentas em diferenciar as cultivares estudadas. Outro objetivo do trabalho foi validar os descritores propostos pelo Serviço Nacional de Proteção de Cultivares (SNPC). A caracterização morfoagronômica foi realizada na Embrapa Cerrados, Planaltina - DF; em propriedades rurais de Sobradinho - DF, Planaltina - GO, Núcleo Rural Tabatinga - DF e Núcleo Rural Pipiripau - DF e em dois viveiros localizados em Planaltina - DF. Utilizou-se uma lista com 33 descritores morfoagronômicos para a espécie silvestre Passiflora cincinnata, e para seis cultivares de maracujazeiro silvestre (BRS Pérola do Cerrado, BRS Estrela do Cerrado, BRS Rubiflora, BRS Roseflora, BRS Céu do Cerrado e BRS Rosea Púrpura) e 25 descritores morfoagronômicos para três cultivares de maracujazeiro azedo (BRS GA1, BRS SC1 e BRS RC) e para as cinco matrizes que deram origem à essas cultivares (CPMSC1, CPGA1, CPMGA2, BRSMR1 e CPACMJM08). Os descritores morfoagronômicos categóricos foram analisados por meio da distribuição de frequência e análises multivariadas e os quantitativos por análises de variância e comparação entre médias das cultivares. Foram também utilizados na caracterização das cultivares marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) e SSR (Simple Sequence Repeats). Os descritores morfoagronômicos foram eficientes para a caracterização dos maracujazeiros e para a quantificação da variabilidade genética entre as cultivares ou espécies. Verificou-se diferentes taxas de validação dos descritores devido a variações na classificação fenotípica ocasionadas pela influência ambiental. Os marcadores moleculares foram úteis na diferenciação das cultivares e na quantificação da variabilidade genética existente. No presente estudo, foram sugeridos alguns ajustes (inclusão de termos, classes fenotípicas e características, exclusão de algumas características) no documento orientador do MAPA (Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento) a fim de minimizar os equívocos e aumentar a precisão e acurácia dos descritores na diferenciação das cultivares. / The genetic variability in passion fruit can be used to diversify the crop system with new
technological products. The use of minimum descriptors and distinctness, uniformity and stability
(DUS) tests are required for the intellectual protection of new varieties. The purpose of this work
was to characterize varieties and matrices of sour passion fruit (Passiflora edulis Sims) and wild
passion fruit species and varieties (Passiflora spp.) using morphoagronomic descriptors and
molecular markers to observe the ability of these tools to differentiate the varieties studied.
Another goal was to validate the descriptors proposed by the Brazilian Plant Variety Protection
Office (SNPC). The morphoagronomic characterization was performed at Embrapa Cerrados,
Planaltina - Federal District; on farms at Sobradinho - Federal District, Planaltina - GO, Núcleo
Rural Tabatinga - Federal District and Núcleo Rural Pipiripau - Federal District and in two
seedlings farms located in Planaltina - Federal District. A list of 33 morphoagronomic descriptors
was used for Passiflora cincinnata and other six wild passion fruit varieties (BRS Pérola do
Cerrado, BRS Estrela do Cerrado, BRS Rubiflora, BRS Roseflora, BRS Céu do Cerrado and BRS
Rosea Púrpura) and 25 morphoagronomic descriptors were used for three varieties of sour
passion fruit (BRS GA1, BRS SC1 and BRS RC) and for the five matrices that gave origin to these
varieties (CPMSC1, CPGA1, CPMGA2, BRSMR1 and CPACMJM08). The categorical
morphoagronomic descriptors were analyzed by frequency distribution and multivariate analysis.
The quantitative descriptors were evaluated by analysis of variance and comparison among
averages of the varieties. Molecular markers RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), ISSR
(Inter Simple Sequence Repeats) and SSR (Simple Sequence Repeats) were also used for the
characterization of varieties. The morphoagronomic descriptors were efficient for characterization
of passion fruit and to quantify the genetic variability among varieties or species. Different
validation rates for descriptors were observed because of variations in the phenotypic
classification due to environmental influence. Molecular markers were useful to differentiate the
varieties and to quantify the genetic variability among passion fruit species and varieties. In this
study, some adjustments (inclusion of terms, phenotypic categories and characteristics, exclusion
of some characteristics) were suggested in the MAPA (Brazilian Ministry of Agriculture Livestock
and Food Supply) guiding document in order to minimize the misunderstandings and increase the
differentiation among passion fruit varieties.
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