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Comercio de aves silvestres en mercados del Perú 2007-2012Villena Arboccó, Mirella Esperanza January 2015 (has links)
El presente estudio examina el estado del comercio ilegal de aves silvestres en mercados de 11 departamentos del Perú. Para tal objetivo se realizaron 863 visitas a 26 mercados ubicados en los departamentos de Tumbes, Piura, Lambayeque, La Libertad, Loreto, Ucayali, Huánuco, Lima, Ica, Arequipa y Puno. Entre abril del 2007 y setiembre del 2012 se identificaron 139 especies de aves; el departamento y mercado que presentaron mayor oferta de especies fueron Lima y Belén (Loreto), con 76 y 69 especies respectivamente. La familia más comercializada fue Psittacidae y Brotogeris versicolurus la especie de mayor demanda, observándose en el 73.0% (630/863) de las visitas. Por otro lado, se determinó que el departamento de Lima presentó el mayor número de individuos de aves de la misma especie registrada por cada mercado en los días visitados (MNID) durante todo el estudio, seguido de Loreto y Ucayali y, que el 2008 fue el año con mayor registro de aves. Las aves provenientes de la selva fueron más comercializadas que las de otras regiones y más del 44% de las especies identificadas en este estudio fueron cazadas de manera ilegal. En relación al estado de conservación, se registraron especies amenazadas, categorizadas por el Estado Peruano, entre ellas Brotogeris pyrrhoptera (EN), Leucopternis occidentalis (EN), Ara chloropterus (VU), Ara macao (VU), Ara militaris (VU) y Forpus xanthops (VU); además se identificaron especies no reportadas para el Perú como Amazona aestiva, Brotogeris chiriri, Forpus passerinus y Paroaria coronata y especies endémicas como Atlapetes nationi, Piezorhina cinerea y Forpus xanthops. Este estudio reporta la existencia de aves silvestres que están siendo comercializadas de manera ilegal en diferentes departamentos del Perú lo cual representa una amenaza a la conservación de avifauna que habita en nuestro país. Palabras clave: comercio ilegal, aves silvestres, mercados, tráfico, conservación. / --- This study describes the illegal trade of wild birds in 11 departments of Perú. A total of 863 visits were made to 26 markets within the departments of Tumbes, Piura, Lambayeque, La Libertad, Loreto, Ucayali, Huánuco, Lima, Ica, Arequipa and Puno. Throughout the study 139 bird species were identified, between April 2007 and September 2012; the department and the market that showed more species were Lima and Belén (Loreto) with 76 and 69 species respectively. Psittacidae was the most marketed family of birds and Brotogeris versicolurus was the species with more demand observed in 73.0% (630/863) of the visits. Furthermore, Lima had the highest number of individuals of the same species of birds recorded each market day visited (MNID) in the study, followed by Loreto and Ucayali, and the year with the registration of the highest number of birds was 2008. The geographical distribution of the birds showed that the ones from the jungle were more commercialized than the birds from other regions and that more than 4% of the identified species were marketed illegally. Considering the list of classification and categorization of endangered bird species according to the Peruvian Govermment, we recorded Brotogeris pyrrhoptera (EN), Leucopternis occidentalis (EN), Ara chloropterus (VU), Ara macao (VU), Ara militaris (VU) and Forpus xanthops (VU); also non-native species were identified as Amazona aestiva, Brotogeris chiriri, Forpus passerinus, Paroaria coronata as well as endemic species of Peru as Atlapetes nationi, Piezorhina cinerea and Forpus xanthops. This study reports the existence of the illegal trade in wild birds in different departments of Perú which represents a threat to the conservation of birds that inhabit our country. Key words: Illegal trade, wild birds, markets, traffic, conservation.
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Detecção e caracterização de coronavirus aviário em aves silvestres de cativeiro / Molecular detection and characterization of avian coronavirus in samples from captive birdsSimão, Raphael Mausbach 10 March 2017 (has links)
As aves silvestres são consideradas importantes reservatórios de diversos vírus aviários que podem afetar aves comerciais. Dessa forma, o monitoramento das aves silvestres é fundamental para garantir a sanidade dos plantéis avícolas brasileiros. Nos últimos anos, o número de espécies de aves nas quais os coronavírus aviários foram encontrados aumentou vertiginosamente em diversos países. Contudo, poucos estudos envolvendo a detecção de coronavírus aviários em aves de cativeiro e aves silvestres ou sinantrópicas foram realizados no Brasil. Assim, o presente estudo teve como objetivo identificar a presença dos coronavírus aviários em aves silvestres no Brasil e caracterizá-los molecularmente. As amostras foram testadas através do teste de RRT-PCR para detecção do gene UTR do IBV, bem como uma nested-PCR para detecção do gene S1 dos coronavírus aviários. O sequenciamento de alto desempenho foi utilizado para caracterizar os vírus detectados. No total, foram testadas 300 amostras de aves silvestres (147 suabes orofaringeanos e 153 suabes cloacais). No total, 27 amostras foram positivas pelo teste RRT-PCR. Duas amostras de Anseriformes das amostras positivas no teste de RRT-PCR foram selecionadas para sequenciamento de alto desempenho. Em ambas as amostras sequenciadas foi constatada a co-infecção pelos vírus da bronquite infecciosa e vírus da doença de Newcastle. A análise das amostras demonstrou alta identidade com vírus vacinais, o que demonstra que estirpes vacinais utilizadas na imunização de aves de produção circulam em aves silvestres e de produção de subsistência. / Wild birds are an important reservoir of different viruses that can affect poultry. Viral surveillance in wild birds is, thus, extremely important to ensure the poultry heal in Brazil. In recent years, the number of species of birds in which avian coronaviruses have been found skyrocketed in several countries. However, few studies involving the detection of avian coronaviruses in captive wild birds or wild life birds were conducted in Brazil. Thus, the present study aimed to identify the presence of avian coronaviruses in Brazil and characterize them molecularly. Samples were tested by RRT-PCR test for detection of the UTR gene of IBV, as well as a nested-PCR for detection of S1 gene. In total, 300 samples of wild birds (147 oropharyngeal swabs and 153 cloacal swabs) were tested. In total, 27 samples were positive in RT-PCR assay. Two positive samples in RRT-PCR assay were selected for Next-generation sequencing. In both sequenced samples, co-infection with infectious bronchitis virus and Newcastle disease virus was found. The analysis of samples showed identity with vaccinal strains used in immunization of commercial flocks circulate in wild birds and subsistence flocks.
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Detecção e caracterização moleculares dos paramixovírus aviários tipo 1 em materiais provenientes de aves silvestres utilizando testes para a detecção dos vírus da família viral Paramyxoviridae / Molecular detection and characterization of avian paramyxovirus type I in samples from wild birds by using molecular tests for detection of viruses from Paramyxoviridae familySilva, Renata Khodair 04 February 2016 (has links)
As aves silvestres são importantes reservatórios de vírus que podem acometer as aves domésticas. O monitoramento da circulação viral em aves silvestres é de extrema importância para garantir a sanidade dos plantéis avícolas. O presente estudo teve como objetivo 1) comparar dois testes moleculares de RT-PCR para a detecção dos vírus da família Paramyxoviridae em aves silvestres e sinantrópicas; 2) caracterizar os vírus detectados nestas amostras. Dois testes de RT-PCR e testes específicos de RT-PCR em tempo real (RRT-PCR) para o vírus da doença de Newcastle (NDV) e o metapneumovírus aviário (aMPV) foram utilizados para comparar o limite de detecção entre as amostras. As amostras de aves silvestres foram testadas por dois testes de RT-PCR. Um pequeno fragmento da região do sítio de clivagem do gene F das amostras positivas foi sequenciado. Os testes de RT-PCR foram validados com sucesso, mas apresentaram diferenças entre os limites de detecção quando comparados aos testes específicos de RRT-PCR utilizando diferentes vírus. No total, 100 amostras de aves (suabes) foram testados pelo teste RT-PCR que apresentou um limite de detecção similar entre os diferentes agentes virais. O teste selecionado foi capaz de detectar duas amostras de aves silvestres que foram também detectadas pelo testes específico para NDV e relacionadas às amostras de NDV vacinais do genótipo II da classe II referentes aos vírus de NDV lentogênico (113RQGR ↓ L117). Nosso estudo demonstra a deficiência na biosseguridade adotada pelos sistemas avícolas por permitir a saída dos vírus vacinais para as aves silvestres / Wild birds are important reservoirs of viruses can affect poultry. Surveillance of circulating viruses in wild birds is of the most importance tool to ensure the poultry health. The present study aimed to 1) compare two molecular tests for detection of family Paramyxoviridae viruses in wild and feral birds; 2) characterize the detected viruses in those samples. Two RT-PCR techniques and specific real time RT-PCR (RRT-PCR) assays for detection of Newcastle disease virus (NDV) and avian metapneumovirus (aMPV) were used to compare the limit of detection among them. Wild bird samples were tested by using two RT-PCR tests. A small fragment of cleavage site region in F gene from positive samples was sequenced. The RT-PCR were successfully validated, however they had differences in the limit of detection when compared to specific RRT-PCR assays using different viruses. In total, 100 wild bird samples (swabs) were tested by the selected RT-PCR with similar limit of detection between tested viruses. Two samples were positive by this test and they were also detected by the specific RRT-PCR for NDV. These samples were closed related to vaccinal NDV strains belonging to genotype II class II. Deduced amino acid sequences of cleavage site region from detected samples were characterized as lentogenic NDV strains (113RQGR ↓ L117). Our study demonstrates the poor biosafety used by poultry industry allowing the vaccinal escape to wild bird species
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Perícia de maus-tratos a aves silvestresReis, Sérvio Túlio Jacinto. January 2018 (has links)
Orientador: Noeme Sousa Rocha / Resumo: Uma das principais demandas para peritos médicos veterinários é a investigação forense dos crimes contra a fauna. No Brasil, grande parte dos crimes contra a fauna está relacionada ao tráfico de animais silvestres, cujas condutas envolvem a captura, transporte e comércio ilegais de indivíduos. Todas essas atividades implicam também em diversas formas de maus-tratos aos animais. O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de entender como os policiais ambientais percebem o combate a crimes contra animais silvestres, adequar e padronizar o exame de corpo de delito aplicado às aves da fauna silvestre nativa, e desenvolver um aplicativo móvel que facilite as coletas de dados dos exames realizados em campo. Como resultado, foi desenvolvido o Protocolo de Exame em Bem-estar Animal de Aves Silvestres (PEBEA – Aves Silvestres). O protocolo inclui um formulário de avaliação do bem-estar de aves silvestres composto por 26 indicadores, representando as Cinco Liberdades, subdivididos nas categorias nutricional, de conforto, de saúde e comportamental. Os resultados obtidos demonstram que o protocolo permite a identificação de pontos críticos e o auxílio nas ações de fiscalizações e investigações policiais de casos suspeitos de maus-tratos, contribuindo, assim, para a redução do sofrimento e o incremento da qualidade de vida dos animais envolvidos. / Doutor
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Detecção e caracterização moleculares dos paramixovírus aviários tipo 1 em materiais provenientes de aves silvestres utilizando testes para a detecção dos vírus da família viral Paramyxoviridae / Molecular detection and characterization of avian paramyxovirus type I in samples from wild birds by using molecular tests for detection of viruses from Paramyxoviridae familyRenata Khodair Silva 04 February 2016 (has links)
As aves silvestres são importantes reservatórios de vírus que podem acometer as aves domésticas. O monitoramento da circulação viral em aves silvestres é de extrema importância para garantir a sanidade dos plantéis avícolas. O presente estudo teve como objetivo 1) comparar dois testes moleculares de RT-PCR para a detecção dos vírus da família Paramyxoviridae em aves silvestres e sinantrópicas; 2) caracterizar os vírus detectados nestas amostras. Dois testes de RT-PCR e testes específicos de RT-PCR em tempo real (RRT-PCR) para o vírus da doença de Newcastle (NDV) e o metapneumovírus aviário (aMPV) foram utilizados para comparar o limite de detecção entre as amostras. As amostras de aves silvestres foram testadas por dois testes de RT-PCR. Um pequeno fragmento da região do sítio de clivagem do gene F das amostras positivas foi sequenciado. Os testes de RT-PCR foram validados com sucesso, mas apresentaram diferenças entre os limites de detecção quando comparados aos testes específicos de RRT-PCR utilizando diferentes vírus. No total, 100 amostras de aves (suabes) foram testados pelo teste RT-PCR que apresentou um limite de detecção similar entre os diferentes agentes virais. O teste selecionado foi capaz de detectar duas amostras de aves silvestres que foram também detectadas pelo testes específico para NDV e relacionadas às amostras de NDV vacinais do genótipo II da classe II referentes aos vírus de NDV lentogênico (113RQGR ↓ L117). Nosso estudo demonstra a deficiência na biosseguridade adotada pelos sistemas avícolas por permitir a saída dos vírus vacinais para as aves silvestres / Wild birds are important reservoirs of viruses can affect poultry. Surveillance of circulating viruses in wild birds is of the most importance tool to ensure the poultry health. The present study aimed to 1) compare two molecular tests for detection of family Paramyxoviridae viruses in wild and feral birds; 2) characterize the detected viruses in those samples. Two RT-PCR techniques and specific real time RT-PCR (RRT-PCR) assays for detection of Newcastle disease virus (NDV) and avian metapneumovirus (aMPV) were used to compare the limit of detection among them. Wild bird samples were tested by using two RT-PCR tests. A small fragment of cleavage site region in F gene from positive samples was sequenced. The RT-PCR were successfully validated, however they had differences in the limit of detection when compared to specific RRT-PCR assays using different viruses. In total, 100 wild bird samples (swabs) were tested by the selected RT-PCR with similar limit of detection between tested viruses. Two samples were positive by this test and they were also detected by the specific RRT-PCR for NDV. These samples were closed related to vaccinal NDV strains belonging to genotype II class II. Deduced amino acid sequences of cleavage site region from detected samples were characterized as lentogenic NDV strains (113RQGR ↓ L117). Our study demonstrates the poor biosafety used by poultry industry allowing the vaccinal escape to wild bird species
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Detecção e caracterização de coronavirus aviário em aves silvestres de cativeiro / Molecular detection and characterization of avian coronavirus in samples from captive birdsRaphael Mausbach Simão 10 March 2017 (has links)
As aves silvestres são consideradas importantes reservatórios de diversos vírus aviários que podem afetar aves comerciais. Dessa forma, o monitoramento das aves silvestres é fundamental para garantir a sanidade dos plantéis avícolas brasileiros. Nos últimos anos, o número de espécies de aves nas quais os coronavírus aviários foram encontrados aumentou vertiginosamente em diversos países. Contudo, poucos estudos envolvendo a detecção de coronavírus aviários em aves de cativeiro e aves silvestres ou sinantrópicas foram realizados no Brasil. Assim, o presente estudo teve como objetivo identificar a presença dos coronavírus aviários em aves silvestres no Brasil e caracterizá-los molecularmente. As amostras foram testadas através do teste de RRT-PCR para detecção do gene UTR do IBV, bem como uma nested-PCR para detecção do gene S1 dos coronavírus aviários. O sequenciamento de alto desempenho foi utilizado para caracterizar os vírus detectados. No total, foram testadas 300 amostras de aves silvestres (147 suabes orofaringeanos e 153 suabes cloacais). No total, 27 amostras foram positivas pelo teste RRT-PCR. Duas amostras de Anseriformes das amostras positivas no teste de RRT-PCR foram selecionadas para sequenciamento de alto desempenho. Em ambas as amostras sequenciadas foi constatada a co-infecção pelos vírus da bronquite infecciosa e vírus da doença de Newcastle. A análise das amostras demonstrou alta identidade com vírus vacinais, o que demonstra que estirpes vacinais utilizadas na imunização de aves de produção circulam em aves silvestres e de produção de subsistência. / Wild birds are an important reservoir of different viruses that can affect poultry. Viral surveillance in wild birds is, thus, extremely important to ensure the poultry heal in Brazil. In recent years, the number of species of birds in which avian coronaviruses have been found skyrocketed in several countries. However, few studies involving the detection of avian coronaviruses in captive wild birds or wild life birds were conducted in Brazil. Thus, the present study aimed to identify the presence of avian coronaviruses in Brazil and characterize them molecularly. Samples were tested by RRT-PCR test for detection of the UTR gene of IBV, as well as a nested-PCR for detection of S1 gene. In total, 300 samples of wild birds (147 oropharyngeal swabs and 153 cloacal swabs) were tested. In total, 27 samples were positive in RT-PCR assay. Two positive samples in RRT-PCR assay were selected for Next-generation sequencing. In both sequenced samples, co-infection with infectious bronchitis virus and Newcastle disease virus was found. The analysis of samples showed identity with vaccinal strains used in immunization of commercial flocks circulate in wild birds and subsistence flocks.
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Aves silvestres como portadoras de agentes infecciosos para humanos no município de Goiânia - Goiás / Wild birds as carriers of infectious agents to humans in Goiania, Goias, BrazilRAMOS, Talita Silva 27 April 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:29:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2011-04-27 / The narrowing between humans, domestic and wild animals has increased the dissemination of infectious agents for new hosts. The result of this interaction has lead to zoonosis. Among these animals are birds, which are natural reservoirs, carriers and disseminators of several infectious agents, potentially transmissible to humans. This dissemination can occur through direct and indirect contact with migratory birds originated from smuggling of wild animals. The objective was to detect viral, bacterial and fungal agents with zoonotic
potential in wild birds in the county of Goiânia, Goiás. It was carried out a systematic review to assess the State of Goiás in relation to the performance of wild birds as carries of infectious agents to humans. Blood samples and cloacal
swabs were collected from 88 different species of birds, as most of them were originated from smuggling and sent to CETAS-IBAMA in Goiânia in the first semester of 2010. The collects were analyzed in the Laboratory of Animal Virology at Federal University of Goiás (UFG) and the bacteriological and fungal analyses were done in the Laboratory of Microbiology at National Service of Industrial Education (SENAI) in Anápolis, Goiás. The blood was stored in tubes without anticoagulant in order to obtain serum and it was carried out a research with Enzyme-Linked Immunosorbent to search for the antibody of influenza virus and the cause of Newcastle disease. In order to isolate and identify filamentous fungus, Candida spp, bacteria, Salmonella sp and Escherichia coli,
samples were collected from cloacal excretion through swabs. In the systematic review, three articles were selected using two tests of Relevance. From the interpretation of these studies, it was proved the role of migratory birds as
carriers and disseminators in short and long distances of several pathogenic virus to humans. Furthermore, there are no records or even systematic studies about this process in the state of Goiás. From 88 analyzed samples, none of them presented antibodies for the two researched virus. The analysis of samples from cloacal swabs indicated a positivity of 9,1% for Candida tropicalis , 9,1% for Salmonella sp, 1,1% for Aspergillus fumigatus, 11,4% for Candida albicans, 12,5% for Candida krusei, 27,3% for Candida spp, and 43,2% for
Escherichia coli. The literature review suggests that further researches should be carried out as the distribution of this zoonosis can possibly be wider, even in the State of Goiás. Regarding the negative results for the viral agents, they
indicate that part of the wild birds in Goiânia-Goiás did not have contact with influenza and Newcastle viral antigens yet. Therefore they are not carriers of these photogenes. In relation to presumptive identifications of pathogenic
bacteria and fungal agents in wild birds, they confirm the possibility of transmission of these agents among animals and to humans. Besides, this study also reinforces that researches about zoonosis transmitted by wild birds in the state of Goiás are still recent and incipient, highlighting the need of continuation of these studies in the region. / O estreitamento entre a população humana e os animais domésticos com animais silvestres aumentou a disseminação de agentes infecciosos para novos hospedeiros, sendo uma importante consequência, as zoonoses. Entre estes animais, estão as aves, que são reservatórios naturais, portadores e
disseminadores de diversos agentes infecciosos, potencialmente patogênicos transmissíveis aos humanos. A disseminação pode ocorrer por meio de contato direto ou indireto com aves migratórias e provenientes do tráfico de animais silvestres. O objetivo foi detectar agentes virais, bacterianos e fúngicos, com potencial zoonótico em aves silvestres no município de Goiânia-Goiás. Foi conduzida uma revisão sistemática para avaliar com ênfase, o Estado de Goiás
em relação a atuação das aves silvestres como portadoras de agentes infecciosos para humanos. Amostras de sangue e de swabs cloacais foram coletadas em 88 aves de distintas espécies, sendo a maioria, proveniente do tráfico e encaminhadas ao CETAS-IBAMA de Goiânia. As coletas foram
realizadas em cinco incursões ao CETAS no primeiro semestre de 2010. As análises virais foram realizadas no Laboratório de Virologia Animal da UFG e as análises bacteriológicas e fúngicas no Laboratório de Microbiologia do SENAI em Anápolis. O sangue foi coletado em tubos sem anticoagulante para obtenção de soro e com o ensaio imunoenzimático indireto pesquisou-se anticorpos para os vírus influenza e causador da doença de Newcastle. As amostras de excreção cloacal foram coletadas por meio de swabs e realizouse
o isolamento e identificação de fungos filamentosos, Candida spp, Salmonella sp e Escherichia coli. Na revisão sistemática, três artigos foram selecionados por meio de dois Testes de Relevância e a partir da interpretação destes estudos foi comprovado o papel das aves silvestres como portadoras e
disseminadoras, a curta ou longa distância, de vários agentes infecciosos aos humanos e que não existem registros ou estudos sistemáticos sobre este processo no Estado de Goiás. Das 88 amostras analisadas, nenhuma apresentou anticorpos para os dois vírus pesquisados. As análises das amostras procedentes de swabs cloacais houve uma positividade de 9,1% para Candida tropicalis, 9,1% para Salmonella sp, 1,1% para Aspergillus fumigatus, 11,4% para Candida albicans, 12,5% para Candida krusei, 27,3% para Candida spp e 43,2% para Escherichia coli. Na revisão observou-se que novos estudos devem ser realizados, pois a distribuição destas zoonoses, possivelmente deve ser mais ainda mais ampla, inclusive em relação ao Estado de Goiás. Quanto aos resultados negativos para os agentes virais, estes sugerem que uma parcela das aves silvestres circulantes em Goiânia, ainda não entrou em contato com os agentes virais influenza e Newcastle, não sendo, portanto, portadoras destes patógenos. Em relação às identificações presuntivas de agentes bacterianos e fúngicos, em aves silvestres, estas
confirmam a possibilidade da transmissão destes agentes entre os animais, incluindo os humanos. Além disso, este estudo reforça que ainda são incipientes as investigações desenvolvidas na área de zoonoses transmitidas por aves silvestres no Estado de Goiás, ressaltando a necessidade da
continuidade destes estudos na região.
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Caracterização molecular e sorológica da Influenza A isoladas de aves residentes, silvestres e migratórias no estado de São Paulo. / Molecular and serological characterization of influenza A isolated from wild, migratory and resident birds in the state of São Paulo.Kawamoto, Adélia Hiroko Nagamori 13 June 2013 (has links)
O Vírus de Influenza aviária pertence à família Orthomyxoviridae. Nos últimos anos vários subtipos da gripe aviária de baixa patogenicidade têm causado surtos e epidemia em humanos e aves domésticas. As aves selvagens e migratórias participam da manutenção e transmissão interespécie dos 16 subtipos de hemaglutinina e 9 subtipos de Neuraminidase na natureza. Nosso estudo teve como objetivo subtipar as amostras positivas através de teste sorológico de inibição da hemaglutinação (HI) e técnica de Biologia Molecular. Foram positivas as amostras das espécies: Elaenia mesoleuca (2), Sporophila lineola (1) Sporophila caerulescen (1), Vireo olivaceus (3), Columbina talpacoti (3), Paroaria dominicana (2), foram coletadas das reservas experimentais de campo localizadas no estado de São Paulo-Brasil,durante os anos de 1997 e 1998. Tais amostras foram identificadas por teste preconizado HI(de acordo com WHO) usando 20 soros imunes anti-influenza do tipo A e um do tipo B e análise de RT-PCR com sequenciamento do gene Hemaglutinina e Neuraminidase. O teste HI demonstrou que 12 amostras apresentou estreita afinidade com com soros imune A/HongKong/1/68 (H3N2), A/Equine/Miami/63 (H3N8) and A/Duck/Ukraine/63 (H3N8). As análises de sequenciamento do gene hemaglutinina e Neuraminidase desses isolados revelaram uma alta homologia com os do subtipos H3N2. As análise filogenética e variabilidade genética em comparação com as seqüências de Genbank representando diversos países, mostraram que nossas amostras apresentou estreita homologia com os vírus do subtipos que circularam em Victoria (1990), Siena (1991) e Beijim (1989). A análise de amino ácido indicou que há mutações não sinônimas no gene da Hemaglutinina exclusiva de nossas amostras e as mutações da Neuraminidase são sinônimos, quando comparadas com amostras de AIV de outros paises. Nossas Amostras quando análisadas a NA, não apresentaram mutações nos aminoácidos y285t e r297n que conferem resistencia aos inibidores da Neuminidase. / Avian Influenza virus belongs to Orthomyxoviridae family. The last years several low pathogenic avian influenza subtypes have caused outbreaks and epidemic in human and poultry. The wild and migrating birds may be participating of maintenance and interspecies transmission of the sixteen subtypes of the Hemagglutinina and nine Neuraminidase in nature. Our study was aimed to subtype the positive samples for influenza A isolated from migrating and wild birds by molecular technique and Haemagglutination inhibition test (HI). The samples from species Elaenia mesoleuca (2), Sporophila lineola (1) Sporophila caerulescens (1), Vireo olivaceus (3), Columbina talpacoti (3), Paroaria dominicana (2), were collected in reserves and experimental field stations located in the São Paulo State - Brazil, during the years 1997 and 1998. The samples were identified by HI test (according WHO) using the 20 antibody patterns anti-influenza A type and one for the influenza type B and RT-PCR and Sequence analysis of Hemaglutinina and Neuraminidase gene. The HI test demonstrated that 12 samples presented an antigenic close relationship with A/HongKong/1/68 (H3N2), A/ Equine/Miami /63 (H3N8) and A/Duck/ Ukraine/ 63 (H3N8) antiserum.The sequencing analyses of Hemaglutinin and Neuraminidase gene of these 12 isolates revealed a high homology with H3N2. Phylogenetic analysis and genetic variability compared with genbank sequence representing several countries, showed that our current samples submitted close homology to that circulated in Victoria (1990), Siena (1991) and Beijim (1989). Amino acid analysis compared our samples with representative genbank samples all of mutation are synonymous.
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Utilização de tomografia por ressonância magnética nuclear para sexagem de aves silvestres sem dimorfismo sexual / Utilization of nuclear magnetic resonance tomography for sex identification in wild birds without sexual dimorphismGrando, Angélica Paula 05 August 2002 (has links)
O rápido declínio da vida silvícola do planeta tem levado inúmeros pesquisadores a discutirem diferentes estratégias de conservação, tanto com a manutenção dos animais em seus próprios habitats naturais, como pela propagação em cativeiro. A reprodução de aves em cativeiro é dificultada quando esses animais não apresentam dimorfismo sexual (ausente em muitas espécies, especialmente em psitacídeos), requerendo a realização de métodos de sexagem para a formação de casais. Dessa forma, foi estudado o uso da tomografia por ressonância magnética nuclear (TRMN) para a sexagem de aves silvestres sem dimorfismo sexual, por meio da visualização de seus órgãos reprodutivos. Dez animais da espécie Aratinga leucophthalmus foram anestesiados e submetidos a exames tomográficos. Nas imagens tomográficas adquiridas, pôde-se visualizar os testículos determinando o sexo masculino em aves sexualmente maduras. Entretanto, nas fêmeas, o formato anatômico do ovário esquerdo (provavelmente imaturo) não permitiu que ele fosse caracterizado com precisão por esse método. Para a confirmação dos resultados dos exames tomográficos, foram realizadas análises de polimorfismo de DNA. / The fast decline of wild life on the planet has led innumerable researchers to discuss different conservation strategies by both maintaining animals in their own natural habitat and reproducing in captivity. Reproduction in captivity becomes difficult when these animals do not present sexual dimorphism (absent in many species, specially in psittacines), requiring the use of methods for sex identification to form couples. Thus the use of magnetic resonance imaging (MRI) to identify the sex of birds without sexual dimorphism through the visualization of their reproductive organs has been studied. Ten animals of the Aratinga leucophthalmus species were anaesthetized and subject to tomographic exams. In the tomographic images obtained it was possible to visualize the testicles identifying the male sex in sexually mature birds. However, in the females, the left ovary (possible immaturity) could not be precisely characterized by this method, due to its anatomical shape. To confirm the results of the tomographic exams, analyses of DNA polimorphism were performed.
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Detecção de fatores de virulência de Escherichia coli isoladas de psitacídeos com diferentes manifestações clínicas / Detection of Escherichia coli virulence factors isolated from psittacines with varied clinical signsSaidenberg, André Becker Simões 18 February 2009 (has links)
Os fatores de virulência presentes em Escherichia coli (E. coli) patogênicas vêm sendo estudados em diversas espécies animais devido à importância de algumas cepas. Estas podem ser classificadas em sorotipos ou mais recentemente através de patotipos, de acordo com algumas técnicas de biologia molecular. Os patotipos mais conhecidos atualmente incluem as ETEC, STEC, EPEC, EIEC, UPEC e APEC. Vários patotipos encontrados causando doenças em animais têm também afetado gravemente seres humanos. Diversas espécies de aves também revelaram possuir patotipos de E. coli capazes de causar infecções zoonóticas. Além do aspecto zoonótico, infecções por bactérias Gram-negativas em aves silvestres têm especial importância, pois o Taxon Psittacidae contém muitas das espécies que mais estão ameaçadas de extinção, e sua manutenção e reprodução em cativeiro é comprometida por infecções bacterianas constantes, em especial por E. coli. Nesse estudo 174 amostras de swabs cloacais de aves sintomáticas e assintomáticas e de casos de necropsias foram testadas através da técnica da PCR para a detecção de fatores de virulência e a classificação em grupos filogenéticos. Detectaram-se 93 amostras (53.45%) positivas para associações de fatores de virulência, em especial para os patotipos EPEC, APEC e UPEC e a classificação de grande parte das amostras de necropsias no grupo filogenético A. O gene iss foi encontrado com maior freqüência, sendo esta de 51.7% (n=30) nas aves sintomáticas e 23.2% (n=23) naquelas assintomáticas. Os resultados demonstraram serem de interesse não apenas com relação ao potencial zoonótico dessas aves em cativeiro, mas também para programas de conservação que visem à liberação de aves no meio selvagem. / Virulence factors of pathogenic Escherichia coli (E.coli) have been studied in several animal species due the importance of certain strains. These strains can be classified in serotypes and more recently in pathotypes using molecular biology techniques. The mostly known pathotypes nowadays include ETEC, STEC, EPEC, EIEC, UPEC and APEC. Several pathotypes causing disease and found in animals are also linked to severe disease in humans. A number of bird species are also known to possess pathotypes able to cause zoonotic infections. Besides de zoonotic aspect, infections by Gram-negative bacteria have a special importance as the Taxon Psittacidae includes many of the most threatened species and their maintenance in captivity is compromised by constant bacterial infections, especially E.coli. In this study, 174 samples from cloacal swabs of asymptomatic and symptomatic birds and necropsy cases were tested employing the PCR technique to detect virulence factors and to classify among phylogenetic grups. Ninety three positive samples were detected for virulence factors associations, mostly EPEC, APEC and UPEC, and most of the necropsy samples for the phylogenetic group A. The iss gene was detected with a higher frequency in symptomatic birds (51.7%, n=30) and 23.2%, (n=23) in asymptomatic ones. The results reveal to be of interest not only to the zoonotic potential of the isolates but also for conservation programs that intend to release these birds into the wild.
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