Thesis (M.S.)--University of Wisconsin--Madison, 1968. / eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references.

Orientador: Pilar Rodriguez de Massaguer / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-26T03:12:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nakazato_LucianaTaba_M.pdf: 18833154 bytes, checksum: 200ccea6ba6e15f0022da31c46fee43e (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: Têm sido relatadas no exterior, principalmente no Japão, ocorrências de bactérias termófilas esporuladas produtoras de acidez plana em bebidas enlatadas a base de café vendidas a quente (50-60°C). A origem destes esporos estaria no extrato de café utilizado no preparo destas bebidas. Ácidos graxos esterificados com sacarose, como palmitato de sacarose por exemplo, possuem uma grande variedade de funções e propriedades, destacando-se o efeito emulsificante e antimicrobiano. Este estudo teve como objetivo avaliar sua atividade antimicrobiana em extrato de café frente a esporos de Bacillus stearothermophilus isolados de café solúvel. Para isso, uma suspensão de esporos foi preparada mediante esporulação em Caldo Nutriente acrescido de 1,5% de Ágar Nutriente e 5 ppm de MnSO4 seguida de coleta, limpeza e resuspensão dos esporos. Foram avaliadas várias concentrações de palmitato de sacarose (P-1570) entre 10-6000mg/l, produzido pela Mitsubishi Kagaku Foods Co., para ser determinada a Mínima Concentração Inibitória (MCI) no crescimento vegetativo de B. stearothermophilus em extrato de café. Após contagem realizada por plaqueamento em profundidade em meio de TSA (Trypitic Soy Agar - Difco), observou-se que 200 mg/l deste antimicrobiano já se mostrava eficaz na inibição do desenvolvimento de cerca de '10 POT. 4' esporos ativados por mI. Com base neste resultado, prosseguiu-se com a investigação do efeito do P-1570 frente a germinação de esporosde B.stearothermophilus. Os ensaios foram efetuados em Caldo Nutriente (CN pH 6,9), utilizando espectrofotômetro BECKMAN DU 640 ajustado para leitura de absorbância a um comprimento de onda de 590 nm. A partir da suspensão dos esporos diluída em CN pH 6,9 e ativada em água em ebulição pelo tempo ótimo de 20 minutos, a germinação e crescimento pós-germinativo foram acompanhadas durante 12 horas, na presença e ausência do P-1570, revelando uma baixa porcentagem de germinação nos dois tipos de amostra: 2,3; 3,7 e 2,8% com 100, 200 e 300 mg/l de P-1570, respectivamente, e 3,3% com O mg/l de P-1570. Não foi observado crescimento pósgerminativo na presença de 100,200 e 300 mg/l de P-1570. Finalmente, foi investigado o efeito do P-1570 sobre a resistência térmica dos esporos de B. stearothermophilus, a partir de uma suspensão de '10 POT. 6' esporos/mI de extrato de café, com 0 mg/l (controle) e 100 mg/l de P-1570, em tubos TDT. Os tubos TDT foram levados ao banho de óleo a 113, 115 e 118°C por diferentes tempos pré-determinados. ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital. / Abstract: Various canned coffee drinks have been distributed through vending machines at high temperatures (50 - 60°C), mainly in Japan, and naturally thermophilic heat resistant spore forming bacteria such as fiat sour bacteria have occurred. Sugar esters, that are known by their properties as emulsifier and antimierobial, may be used to inhibit growth or to reduce the heat resistanee of thermophilie baeteria. The present study was undertaken to elucidate how the sucrose palnútate P-1570 (Ryoto Sugar Ester - Mitsubishi Kagaku Foods Co.) acts against Bacillus stearothermophilus spores that were isolated from a soluble coffee sample. Suspension of B. stearothermophilus spores originally isolated from soluble coffee was prepared aeeording to method deseribed by Ptlug (1990). The sporulation was carried out in tubes with Nutrient Broth (Difeo) added 1.5% Nutrient Agar (Difeo) plus 5 ppm MnSO4. Several sucrose palmitate (P-1570) concentrations were evaluated (10 - 6000 mg/l) to determine the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for B. stearothermophilus vegetative growth in coffee extract with 6° Brix and pH 5.5 (EC medium) that was prepared in similar conditions of coffee extract are used to produce coffee earned drinks. Diluted samples were plated (pour-plate) on TSA (Tryptie Soy Agar Medium -Difeo) and they were ineubated for 48-72 hours at 55°C. It was observed that 200 mg/l of sucrose palmitate was enough to inhibit the development of '10 POT. 4' activated spores / mI. To determine if sucrose palmitate acts on germination or on outgrowth of B. stearothermophilus spores, these were inoculated in Nutrient Broth (pH 6.9) with and without sucrose palmitate, activated for 20 minutes and incubated for 12 hours at 55°C. Every two hours a sample was taken from the germinating medium and the optical density was measured in a BECKMAN DU 640 spectrophotometer at 590nm Under these conditions, 2.3%, 3.7% and 2.8% of germination were observed for samples with sucrose palmitate at 100, 200 and 300 mg/l respectively, while it was registered 3.3% of germination for sample without sugar ester. No outgrowth was observed with 100, 200 and 300 mg/l of sucrose palmitate indicated by no further increase in optical density in relation to control sample (no sugar ester addition). These results confirmed that effect of sugar esters is mainly related to inhibition of outgrowth. ... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations. / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos

Orientador: Lucia Regina Durrant / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-26T23:54:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kushida_MartaMitsui_M.pdf: 19011123 bytes, checksum: 7c5b2f6dc959d4ed354dc1e18af9a796 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: o interesse pelos biosurfactantes tem aumentado neste final de século, principalmente por suas características superiores aos agentes emulsificantes químicos conVenCIOnaIS, como baixa toxicidade, biodegradabilidade, especificidade e síntese a partir de material renovável e de baixo custo, encontrando larga faixa de aplicações, principalmente em biorremediação, já que sabemos como são graves os problemas como vazamento de óleo que ocorrem durante o transporte dos mesmos para locais de consumo, assim como o despejo de efluentes pelas indústrias. No Laborátório de Sistemática e Fisiologia Microbiana (LSFM) foram selecionadas cepas produtoras de biosurfactantes, sendo que Planococcus citreus (9), Pantoea agglomerans (BIA) e Bacillus sp (B3G) apresentaram uma atividade emulsificante potencial, produzindo biosurfactante quando crescem em óleo de oliva, querosene e óleo de soja, respectivamente. Foram analisadas as propriedades dos biosurfactantes produzidos pelas cepas bacterianas, tais como influência de temperatura, pH, concentração de sais, etc. sobre os agentes emulsificantes. / Abstract: Interest in biosurfactants increased at the end of the 20th century because of their superior qualities to conventional chemical emulsifiers, such as low toxicity, biodegradability, specificity and synthesis from low cost renewable material, finding many applications, principalty in biorremediation, where grave problems, such as oil leaks during transport to points of consumption, as well as the discharging of efluents by industry occur. At the Systematic and Microbial Physiology Laboratory (SMPL) the selected biosurfactant-producing strains Planococcus citreus (9), Pantoea agglomerans (BlA) andBacillus sp (B3G) presented potencial emulsifying activities, producing biosurfactant when grow in olive oil, kerosene and soya oil, respectively. The properties of the biosurfactants produced by the bacterial strains where analyzed, together with the influence of temperature, pH, salt concentration, etc, on the emulsifying agents. / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos

Orientador: Pilar R. de Massaguer / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-19T02:09:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mohallem_MariadeLourdes_M.pdf: 5416429 bytes, checksum: 194b9c9d51d7542051031baf8d942e81 (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: O presente trabalho propôs estabelecer os parâmetros do processamento térmico utilizando-se a nisina como coadjuvante térmico no homogeneizado de cogumelos em salmoura 1,5% {p/v) pH 6,2 (HC). 0 meio HC simula uma conserva comercial não acidificada. O microrganismo alvo da destruição termoquímica foi o Bacillus stearothermophilus FS 1518. Seus esporos foram obtidos à partir de uma solução estoque e produzidos no meio Agar Nutriente {AN) contendo 5 ppm de sulfato de manganês {PFLUG, 1982}. Esta metodologia mostrou-se mais eficaz que aquela preconizada por KIM & NAYLOR (1966) . A ativação ótima para a germinação foi determinada e ficou estabelecida como 5 minutos à temperatura de ebulição nos meios de subcultura estudados. O meio Caldo Nutriente (CN) foi eleito para estudar o efeito da nisina na germinação e no crescimento pó-germinativo porque melhor se adequou ao método espectrofotométrico de redução de absorbância. Constatou-se que a nisina não inibe a germinação destes esporos. Sua inibição é posterior à germinação. Concentrações de nisina maior ou igual a 50 UI/ml inibiram a crescimento pós-germinativo. A Menor Concentração Inibitória (MCI} de nisina para as células de B. stearothermophilus FS 1518, em uma população de 106 UFC/ml, foi de 50 UI/ml. A metade da MCI foi adicionada no meio HC inoculado com os esporos para a determinação da sua resistência térmica. A redução da resistência térmica, empregando-se o meio AN para a subcultura, foi de 19, 36 e 44% nas temperaturas de 125°, 121º e 118ºC respectivamente. O índice de temperatura encontrado foi 11,66 e 9,15 com e sem nisina, respectivamente. O valor de esterilização requerido para causar 5 reduções decimais a partir de uma população de 7000 esporos/250g produto decresceu, aproximadamente, em 36% à temperatura de 121 ºC com a nisina. Estes dados comprovam a sua eficiência na redução da resistência térmica destes esporos, quando inoculados no mexo HC e nos fornece o valor de esterilização requerido para o processamento desta conserva nestas condições / Abstract: The present work intended to establish the microbiological parameters for process using nisin as a thermal adjuvant in a homogenate of mushrooms in brine 1.5 per cent (p/v) pH 6.2 (HM). The HM simulates a low-acid processed product. The target microorganism for the thermo-chemical destruction was Bacillus stearotherraophilus FS 1518. The spore suspension was obtained from a stock suspension and produced in Nutrient Agar (NA) supplemented with 5 ppm of Manganese Sulfate (PFLUG, 1982). This methodology showed to be more efficient than the one standardized by KIM & NAYLOE (1966). It was determined the optimum conditions of activation for germination on the subculture medium studied. It was found that the optimum activation time was 5 minutes at boiling temperature. Nutrient Broth was chosen as the culture medium to study the effect of nisin on the germination and post-germinative growth, because it showed to be the most adequate to the spectrophotometry method of absorbance reduction. It was observed that nisin does not inhibit germination of such spores. Its inhibiting action occurs after the germination phase. Nisin Minimum Inhibitory Concentration (MIC) for B. stearothermophilus FS 1518 in apopulation of 106 CFU/ml was 50 UI/ml. Half of this MIC was added to the HM medium previously innoculated with the spores to determine its thermo-chemical resistance. The thermo-chemical resistance reduction using HA medium for subculturing was 19, 36 and 44 per cent for temperatures of 125, 121 and 118°C, respectively. The Z-value found was 11.66 and 9.15"C with and without nisin, respectively. The sterilization value required (F) to cause 5 decimal reduction on the initial population of 7000 spores per 250 g of product decreased approximately 36 per cent at 121ºC with nisin. These data prove the efficiency of nisin in reducing the thermal resistance of such spores when inoculated in HM medium, and it also provides the F-value for processing the product in the studied conditions. / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos

Orientador: Kil Jin Park / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-19T14:28:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moraes_ReginadeOliveira_M.pdf: 1881913 bytes, checksum: 56e19904486c1a95af0f6ffc590c1a6f (MD5) Previous issue date: 1993 / Resumo: Bacillus thurillgiellsis (Bt), uma bactéria utiJizada em controle biológico de lepidópteros, é produzida através de fermentação submersa ou semi-sólida . Após a fermentação um dos maiores problemas encontrados é a recuperação desse material. Neste trabalho foi estudada a secagem do material fermentado após centrifugação. A pasta foi pré-formulada usando 97% de argila como inerte e 3% de princípio ativo (Bt). A secagem foi feita usando diferentes tipos de secadores, nos quais se estabeleceram os parâmetros de interesse. A comparação entre os processos foi feita através da avaliação da manutenção da atividade microbiana de Bacillus thuringiellsis A secagem realizada em secador convencional a 90 Deapresentou um valor D de 5,86 h. A secagem realizada em atomizador a 120, 150 e 180 Deapresentou respectivamente 9,49 s, 5,88 s e 3,43 s de valor D, e valor z de 135,16 C.A viabilidade relativa foi mantida a 50De e 70De e sofreu redução a 90 De em secador convencional. No atomizador a viabilidade relativa decresceu com elevação da temperatura de 120 C a 180 C / Mestrado / Pre-Processamento de Produtos Agropecuarios / Mestre em Engenharia Agrícola

Orientador: Wagner Bettiol / Banca: Renate Kause Sakate / Banca: Silvia Renata Siciliano Wilcken / Banca: Barbara Eckstein / Banca: Lilian Simara Abreu Soares Costa / Resumo: Microrganismos podem ser utilizados como agentes de promoção de crescimento e biocontrole de fitopatógenos habitantes do solo em diferentes culturas agrícolas. Dentre estes microrganismos, existem relatos que isolados de bactérias do gênero Bacillus podem ser promissores para as duas atividades, podendo, portanto, serem efetivos para a promoção de crescimento e o biocontrole de Thielaviopsis paradoxa e Fusarium verticillioides, importantes patógenos nas culturas da cana-de-açúcar e milho, respectivamente. O objetivo deste trabalho foi selecionar isolados de Bacillus com as características de promover o crescimento das plantas e controlar T. paradoxa e F. verticillioides nas culturas da cana-de-açúcar e milho, respectivamente. Assim, foram realizados estudos in vitro com 162 isolados de Bacillus sp. quanto à assimilação de nitrogênio, solubilização de fosfato e produção de ácido indolacético, ácido cianídrico e sideróforos e também quanto à inibição do crescimento micelial e germinação de esporos de T. paradoxa e no controle da podridão abacaxi e na promoção de crescimento em cana-de-açúcar. Também foram estudados os efeitos de 12 isolados de Bacillus, selecionados de acordo com os melhores resultados da fase descrita anteriormente, bem como resultados obtidos em teste no laboratório e consulta a literatura especializada, para a promoção de crescimento e o biocontrole de F. verticiollioides em milho comum e pipoca, in vitro e in vivo. De acordo com os resultados obtidos foram ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Microorganisms can be used as plant growth promoter and biocontrol agents of soilborn plant pathogens, in several crops. Among these microorganisms, there are reports that isolates from the Bacillus genus can be promising for both these activities and may therefore be effective for the growth promotion and control of Thielaviopsis paradoxa and Fusarium verticillioides, important pathogens in sugarcane and corn crops, respectively. In this study it was selected Bacillus isolates for improving plant growth and controlling T. paradoxa and F. verticillioides. In vitro studies were carried out with 162 Bacillus isolates regarding to the assimilation of nitrogen, phosphate solubilization and production of indolacetic acid, hydrocyanic acid and siderophores, as well as the inhibition of mycelial growth and spores germination of T. paradoxa, control of pineapple rot and growth promotion in sugarcane. Also, the effects of 12 Bacillus isolates, selected according to the previously described phase and literature information, were studied for growth promotion and for the control of F. verticiollioides in corn and popcorn, in vitro and in vivo. According to the results, two isolates, B. velezensis AP-03 and Bacillus sp. AP-210, as growth promoter and biocontrol agents of T. paradoxa and F. verticillioides for sugarcane and corn crops, respectively. Bacillus spp. isolates can be used as plant growth promotion and biocontrol agent in sugarcane and corn in the presence of these soilborn plant ... / Doutor

Orientadores: Fabiana Fantinatti Garboggini, Suzan Pantaroto de Vasconcellos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T14:10:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kimura_GiselleKobata_M.pdf: 1372257 bytes, checksum: 0fad6fec65eb0d479d24daeddec4aeef (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Bactérias e fungos têm sido largamente explorados devido às suas habilidades em produzir uma grande variedade de enzimas, entre elas, as celulases que se destacam devido ao seu potencial em degradar materiais lignocelulósicos em açúcares fermentáveis, que podem então ser convertidos, por exemplo, em biocombustíveis. O presente trabalho visou a bioprospecção de bactérias isoladas a partir do processo de compostagem realizado pela Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP), quanto à produção de enzimas celulolíticas, além da caracterização taxonômica das linhagens de interesse. Para tanto, os micro-organismos oriundos do processo de compostagem da FPZSP foram isolados, preservados e caracterizados macroscopicamente. Dentre as linhagens isoladas, 168 foram testadas numa triagem qualitativa para a produção de celulases, obtendo-se 135 micro-organismos com potencial celulolítico evidenciado pela formação de halos de hidrólise em meio de cultura contendo carboximetilcelulose. Destes, 10 linhagens apresentaram halos translúcidos com diâmetros entre 1,3 cm e 1,9 cm, as quais foram avaliadas quanto a atividade celulotíca em ensaios quantitativos monitorados durante 7 dias, em duas condições de pH distintas: 4,8 e 7,4. Os melhores tempos de incubação verificados foram de sete e cinco dias para os valores de pH 4,8 e 7,4, respectivamente. Em seguida, foram selecionados linhagens para os ensaios de delineamento experimental e otimização das atividades enzimáticas. No planejamento P&B, a melhor atividade celulolítica verificada foi de 3,6392 FPU/mL obtida a partir da linhagem FPZSP 143, no pH 4,8. Esta linhagem foi então selecionada e o planejamento do tipo Delineamento Composto Central Rotacional ¿ DCCR aplicado, promovendo dessa maneira, um aumento 0,4574 FPU/mL em relação ao experimento do planejamento anterior. Posteriormente, o experimento foi validado e o resultado máximo alcançado para atividade celulolítica da linhagem FPZSP 143 foi de 4,6435 FPU/mL. Cinco linhagens selecionadas com atividade celulolítica foram identificadas por análise de sequências do gene RNA ribossomal 16S como membros do gênero Bacillus, bactérias frequentemente encontradas em ambientes da compostagem e que tem sido largamente reportada como produtoras de enzimas celulolíticas. O processo de compostagem demonstrou ser um ambiente em potencial para a produção de celulases de interesse para diversos ramos da indústria, sendo os representantes do gênero Bacillus os melhores produtores de enzimas celulolíticas. Embora as bactérias tenham sido isoladas de um ambiente com pH em torno de 7,4, há um potencial para a produção de celulases em pH mais ácidos, evidenciando sua aplicabilidade em diferentes condições. Essa característica torna-se relevante quando se leva em consideração os processos industriais, onde uma condição diferente e específica é exigida em cada processo, tornando as enzimas celulolíticas oriundas de processo de compostagem grandes aliadas no desenvolvimento e otimização de processos industriais / Abstract: Bacteria and fungi have been extensively explored due to their ability to produce a variety of enzymes, including the cellulases that stand out because of their potential to degrade lignocellulosic materials to fermentable sugars, which can then be converted, for example, in biofuels. The present work aimed bioprospecting of bacteria isolated from the composting process conducted by Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP), for the production of cellulolytic enzymes and the taxonomic characterization of strains of interest. For both, the microorganisms derived from the composting process of FPZSP were isolated, preserved and characterized macroscopically. Among the isolates, 168 were tested for production in a qualitative screening of cellulases, obtaining 135 cellulolytic microorganisms with potential evidenced by the formation of halos of hydrolysis in culture medium containing carboxymethylcellulose. These, 10 strains showed translucent halos with diameters between 1.3 cm and 1.9 cm, which were evaluated for activity in cellulolytic quantitative assays monitored for 7 days under two different pH conditions: 4.8 and 7.4. The best times of incubation recorded were seven and five days to pH 4.8 and 7.4, respectively. Then, strains for testing experimental design and optimization of enzymatic activities were selected. In Planning P&B, the best cellulolytic activity verified was 3.6392 FPU/mL obtained from FPZSP 143, at pH 4.8. This strain was selected and the DCCR applied, thus promoting an increase of 0.4574 FPU/mL compared to the previous experiment planning. Subsequently, the experiment was validated and the maximum score achieved for cellulolytic activity FPZSP 143 strain was 4.6435 FPU/mL. Five strains with cellulolytic activity were identified by sequence analysis of the 16S ribosomal RNA gene as members of the genus Bacillus, bacteria frequently encountered in composting environments and has been widely reported as producing cellulolytic enzymes. The composting process proved to be a potential environment for the production of cellulases of interest for various branches of industry, being the representatives of the genus Bacillus the best producers of cellulolytic enzymes. Although bacteria have been isolated from an environment with a pH around 7.4, there is a potential for the production of cellulases in more acidic pH, indicating their applicability in different conditions. This feature becomes important when one takes into account the industrial processes, where a different and specific condition is required in each case, making the cellulolytic enzymes derived from composting process a good allied in developing and industrial process optimization / Mestrado / Microbiologia / Mestra em Genética e Biologia Molecular

The sequence of the rightmost 4,626 bp of the Bacillus phage φ29 genome is presented and analyzed. Nine large open reading frames (ORF's) have been found. Three of these ORF's are correlated with the late genes 14, 15 and 16. The remaining six ORF's are in the right early region. One of these early ORF's has been identified as gene 17 (g17), the only early gene to have been genetically mapped in this region. The remaining ORF's (16.5, 16.6, 16.7, 16.8 and 16.9) were previously unknown. The biological efficacies of some of these putative early ORF's were demonstrated using an in vitro E. coli transcription-translation system. The primary amino acid sequences, molecular weights, translational initiation sequences and genetic organization of these nine genes are presented and discussed. Gene product 15 (gp15) was found to have strong homology with Salmonella phage P22 gp19, a lysozyme. gp15 also has a lesser but possibly significant homology with T4 gene product e (gpe), also a lysozyme. Using a clone containing φ29 g15 it was shown that gp15 can complement T4 gene e (ge) mutant infections, leading to the conclusion that φ29 g15 encodes a lysozyme. Three transcriptional initiation sites (P(E)3, P(EC)3 and B2) were previously mapped in this region. The sequences of the putative P(EC)3 and B2 promoter sites are presented and shown to have homology with the Bacillus σ⁵⁵ concensus sequence. Sequences having homology to a minor Bacillus sigma factor recognition site, σ³², are also presented and discussed. The region between the last late gene (g16) and the last early gene (ORF-16.5) consists of only 30 bp. Analysis of potential secondary structures of transcripts across this region suggests that the same sequences may be involved in the termination of both late and early transcription.

Thesis (Ph. D.)--University of Missouri--Columbia, 2000. / Typescript. Vita. Includes bibliographical references (leaves 112-121). Also available on the Internet.

published_or_final_version / Microbiology / Master / Master of Medical Sciences