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Actinobactérias com potencial biotecnológico isoladas da Região Entre-Marés da Ilha do Mél, PR, Brasil

Azuma, Mariana Vieira Porsani 10 February 2012 (has links)
Resumo: Actinobactérias ou actinomicetos são bactérias Gram-positivas com elevado conteúdo de G+C (guanina + citosina) e com alta capacidade de produzir diversos metabólitos secundários. Estas bactérias são comumente isoladas do solo e são muito estudadas pelo grande potencial em produzirem antibióticos. A ocorrência destes micro-organismos nas areias das praias na costa brasileira é raramente descrita na literatura. As comunidades de micro-organismos que estão presentes em regiões entre-marés de ambientes marinhos realizam processos essenciais que contribuem para o funcionamento das zonas costeiras, como por exemplo, a ciclagem do carbono, a transferência de metal e remoção de poluentes orgânicos para níveis tróficos superiores. Portanto, estes micro-organismos podem servir como bioindicadores do ecossistema. As condições da região entre-marés são extremas, devido aos ciclos de maré, resultando em gradientes de umidade, temperatura, a ação das ondas, a radiação UV, nutrientes e salinidade. Tais ondições favorecem o desenvolvimento e a disseminação de determinados micro-organismos com processos fisiológicos e metabólitos particulares. Deste modo, o presente trabalho teve como objetivo realizar a bioprospecção destes micro-organismos, previamente isolados na região entre-marés da Ilha do Mel, PR, principalmente para produção dedrogas antimicrobianas. Amostras de sedimentos superficiais foram coletadas em quinze estações da região entre-marés da Ilha do Mel (situada na entrada do Complexo Estuarino de Paranaguá, Paraná). As coletas foram realizadas nos dias 01 e 02 de fevereiro de 2007. Sub-amostras de sedimentos foram misturadas com água destilada e alíquotas do sobrenadante inoculadas em meio de cultura Czapeck Dox preparado com água destilada e água salina. As actinobactérias foram isoladas e identificadas por macromorfologia e coloração de Gram e por meio da técnica de microcultivo. Foram obtidas 116 actinobactérias e agrupadas em 10 morfotipos, pertencentes aos gêneros Nocardia e streptomyces. Para avaliação da atividade antibacteriana foram realizados ensaios biológicos qualitativos, em triplicata, pelo método dos poços. A ação das actinobactérias foi evidenciada através da produção de halos de inibição ao redor da colônia que sintetiza o metabólito. As cepas padrão utilizadas para os testes de atividade antimicrobiana foram: Staphylococcus aureus (ATCC 25923), Escherichia coli (ATCC 25922), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853) e Candida albicans (ATCC 10231). Os resultados evidenciaram que dos 116 isolados, 79 apresentaram atividade contra pelo menos uma cepa patogênica testada. Aproximadamente 72% das amostras testadas apresentaram atividade contra duas ou mais cepas patogênicas padrão. Sendo que 87% dos isolados testados inibiram C. albicans, 77% S. aureus, 18% P. aeruginosa e 4% E. coli. Na sequência, os isolados que apresentaram potencial antimicrobiano tiveram seus metabólitos caracterizados quimicamente e foi confirmada a identificação ao nível de gênero, por meio da amplificação com oligonucleotídeos específicos do DNA ribossomal 16S. Estes resultados evidenciam a importância do estudo do potencial biotecnológico das actinobactérias isoladas das regiões entre-marés.
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Desenvolvimento e validação de métodos analíticos sustentáveis e triagem para modelo de estudo de polimorfos de cefadroxila monoidratada em cápsulas /

Segatto, Bianca Aparecida de Marco. January 2019 (has links)
Orientador: Hérida Regina Nunes Salgado / Coorientador: Ana Carolina Kogawa / Banca: Felipe Rebelo Lourenço / Banca: Jacqueline Nakau Mendonça / Banca: Marlus Chorilli / Banca: Tais Maria Bauab / Resumo: As infecções são a segunda maior causa de mortalidade mundial e diversos são os motivos que justificam a necessidade de novos estudos de agentes antimicrobianos. A cefadroxila é um antimicrobiano β-lactâmico pertencente ao grupo das cefalosporinas de primeira geração, sendo muito prescrita para tratamentos de infecções causadas principalmente por bactérias Gram-positivas. A realização de estudos relacionados ao controle de qualidade é imprescindível aos setores industriais, pois garantem as características dos medicamentos e a segurança e saúde dos pacientes. De acordo com esta importância, o objetivo do trabalho foi desenvolver e validar métodos analíticos físico-químicos e microbiológico para a identificação e quantificação da cefadroxila monoidratada cápsulas, além de desenvolver um modelo de triagem rápido para obtenção de polimorfos da cefadroxila, o qual permitiu caracterizar as diferentes formas obtidas e compará-las com a forma comercial monoidratada, tanto em aspectos físico-químicos como solubilidade e estabilidade, quanto em atividade antimicrobiana. Os métodos desenvolvidos e validados foram espectrofotometria na região do infravermelho médio, cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE), espectrofotometria na região do visível e ensaio microbiológico turbidimétrico, baseados na química verde e estando seus resultados em concordância com guias do ICH e legislação brasileira. No estudo de polimorfos, foram obtidas quatro diferentes formas a partir da cefadroxila... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Infections are the second largest cause of worldwide mortality and several reasons for the need of new studies of antimicrobial agents. Cefadroxil is a β-lactam antimicrobial that belongs to the first-generation cephalosporin group and is highly prescribed for treatment of infections caused mainly by Gram-positive bacteria. The studies performance is related to quality control is essential for the industrial sectors, as they will guarantee the characteristics of the medicines, the safety and health of the patients. According to this importance, the objective of the work was to develop and validate physical-chemical and microbiological analytical methods for the identification and quantification of cefadroxil monohydrate capsules, in addition to develop a rapid screening model to obtain cefadroxil polymorphs, which is allowed to characterize different forms obtained and compare them with the commercial monohydrate form, both in physical-chemical aspects as solubility and stability as in antimicrobial activity. The methods developed and validated were spectrophotometry in the medium infrared region, high performance liquid chromatography (HPLC), spectrophotometry in the visible region and turbidimetric microbiological assay. All methods based on green chemistry and their results were in agreement with ICH guides and Brazilian legislation. In the study of polymorphs, were obtained four different forms obtained from the anhydrous cefadroxil, having presented all the different for... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Avaliação da atividade antioxidante e antimicrobiana da polpa do fruto de Eugenia brasiliensis Lam /

Garcia, Karine Custódio. January 2016 (has links)
Orientador: Iguatemy Lourenço Brunetti / Banca: Cleverton Roberto de Andrade / Banca: Rosemeire Cristina Linhari Rodrigues Pietro / Resumo: As infecções do trato urinário (ITU) são afecções comuns, que podem resultar em níveis significantes de morbidade. Os agentes etiológicos associados a ITU são bactérias Gram-negativas e Gram-positivas, além do fungo comensal Candida albicans. Além dos parâmetros clássicos associados à infecção, as ITU proporcionam o aumento na formação de espécies reativas de oxigênio e nitrogênio, o que também acarreta injúria tecidual, bem como, também ocorre um alto índice de micro-organismos resistentes aos fármacos disponíveis na clínica médica, o que demanda na prospecção por novas abordagens terapêuticas complementares. No Brasil, a espécie Eugenia brasiliensis Lam. é conhecida como "berry brasileira" ou grumixama, e existem poucos relatos na literatura demonstrando sua atividade biológica. Este fator associados à escassez de estudos sobre a espécie brasileira E. brasiliensis, despertou o interesse em novos estudos relacionados à sua ação sobre microrganismos relacionados a ITU e atividade antioxidante. Os extratos utilizados neste estudo foram obtidos a partir da polpa do fruto liofilizado de E. brasiliensis com diferentes solventes, com objetivo de obter dados de sua composição fitoquímica, avaliar suas atividades antioxidantes, antimicrobianas e citotóxicas. Foram utilizados como padrões para os ensaios de atividade antioxidante o ácido elágico, quercetina, ácido gálico, ácido cafeico e trolox. Na caracterização química dos extratos foram determinados, os teores de flavonoides totai... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The urinary tract infections (UTI) are common disorders, which may result in significant levels of morbidity. The etiological agents associated with UTI are Gram-negative and Gram-positive, plus commensal Candida albicans fungus. In addition to the classics associated with infection parameters, the ITU provide increased formation of reactive oxygen and nitrogen species, which also causes tissue damage, as well as a high rate of resistant microorganisms to drugs available in clinical practice, which requires the prospecting for new medicinal approaches. In Brazil, the specie Eugenia brasiliensis Lam. are known as "brazilian berry" or grumixama, and there are few reports in the literature demonstrating your biologic activity. This factor associated with the lack of studies on the brazilian specie E .brasiliensis stir up interest in new research related to the activities of microorganisms related to ITU and antioxidant activity. The extracts used in this study were obtained from the fruit pulp lyophilized of E. brasiliensis with different solvents in order to get data from their phytochemical composition, evaluate their antioxidant activity, antimicrobial and cytotoxicity. For the evaluation of antioxidant activity it was used like standards acid elagic, quercetina, acid gallic, acid cafeico and trolox. In the chemical characterization of the extracts were determined, the contents of total flavonoids... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Caracterização de segurança e tecnológica de bactérias acidoláticas termofílicas autóctones e aplicação em queijo parmesão /

Santos, Cecília Loyola Afonso dos. January 2015 (has links)
Orientador: Ana Lúcia Barretto Penna / Coorientador: / Banca: Daise Aparecida Rossi / Banca: Roberto da Silva / Resumo: As culturas selvagens ou autóctones isoladas de diversos alimentos podem produzir enzimas, vitaminas e compostos aromatizantes, ou ainda, compostos que apresentem efeitos fisiológicos em humanos. Estudos recentes realizados pelo nosso grupo de pesquisa mostraram que algumas cepas autóctones isoladas de muçarela de búfala são produtoras de bacteriocinas, e outras apresentam características probióticas. Neste contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar as características de segurança e tecnológicas de treze cepas autóctones de bactérias acidoláticas (BAL) termófilas de Lactobacillus helveticus (SJRP56 e SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 e SJRP109) e Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149, SJRP181). Para a caracterização de segurança das culturas foram verificadas a susceptibilidade a antibióticos, a atividade hemolítica e das enzimas β-glucosidase, N-acetil-β-glucosaminidase e β-glucuronidase, e a presença de genes que caracterizam fatores de virulência, produção de aminas biogênicas e resistência a antibióticos. As propriedades tecnológicas: cinética de acidificação, produção de exopolissacarídeos e atividade enzimática, foram avaliadas para todas as cepas. Para as cepas consideradas seguras também foram realizadas as análises da hidrólise da caseína e a atividade de aminopeptidases. A partir da caracterização de segurança e tecnológica foram selecionadas quatro cepas: Lb. helveticus SJRP56 e SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 e S. thermophilus SJRP107 para aplicação na produção de queijo Parmesão. Os queijos foram produzidos em escala industrial em dois processamentos independentes, utilizando-se leite pasteurizado e padronizado com 2,3% de gordura. Foi determinada a composição centesimal dos queijos após a produção, e durante o período de maturação foram avaliadas as características físico-químicas... / Abstract: Autochthonous lactic acid bacteria (LAB) isolated from various food can produce enzymes, vitamins, and flavor compounds, or compounds that exhibit physiological effects. Recently, studies performed by our research group showed that some autochthonous strains isolated from water buffalo mozzarella cheese are capable of producing bacteriocin as well as some strains presented probiotic properties. In this context, the aim of this study was to evaluate the safety and technological characteristics of autochthonous thermophilic lactic acid bacteria (LAB) strains of Lactobacillus helveticus (SJRP56 and SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 and SJRP109) and Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149 and SJRP181). For the safety characterization of the cultures, the antibiotic resistance, the hemolytic, β-glucosidase, N-acetyl-β-glucosaminidase and β-glucuronidase activities, and the investigation of the presence of genes that characterize virulence factors, production of biogenic amines and antibiotic resistance were carried out. The technological properties: acidification kinetics, exopolysaccharide production and enzymatic activity were evaluated for all strains. For the safe strains the analyses of the casein hydrolysis and aminopeptidase activity were also performed. From the safety and technological characterization, four strains were selected: Lb. helveticus SJRP56 and SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 and S. thermophilus SJRP107, and used in the production of Parmesan cheese. The cheese were produced in industrial scale in two independent processing using 2.3% fat pasteurized standardized milk. After cheese production, the chemical composition was determined, and during the ripening period, the physicochemical characteristics were evaluated (acidity, pH value and proteolysis). At the third month of ripening, the microbiological quality of cheese was carried out. During ... / Mestre
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Caracterização de segurança e tecnológica de bactérias acidoláticas termofílicas autóctones e aplicação em queijo parmesão

Santos, Cecília Loyola Afonso dos [UNESP] 19 June 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-04-01T17:54:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-19. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-01T18:00:29Z : No. of bitstreams: 1 000859888_20160801.pdf: 334978 bytes, checksum: 81a2861719bda9564d402ab39b8d3b8e (MD5) Bitstreams deleted on 2016-08-01T11:30:03Z: 000859888_20160801.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-01T11:30:59Z : No. of bitstreams: 1 000859888.pdf: 1448324 bytes, checksum: cf4beae2aa8b1123f4ae4731ec579d6c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As culturas selvagens ou autóctones isoladas de diversos alimentos podem produzir enzimas, vitaminas e compostos aromatizantes, ou ainda, compostos que apresentem efeitos fisiológicos em humanos. Estudos recentes realizados pelo nosso grupo de pesquisa mostraram que algumas cepas autóctones isoladas de muçarela de búfala são produtoras de bacteriocinas, e outras apresentam características probióticas. Neste contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar as características de segurança e tecnológicas de treze cepas autóctones de bactérias acidoláticas (BAL) termófilas de Lactobacillus helveticus (SJRP56 e SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 e SJRP109) e Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149, SJRP181). Para a caracterização de segurança das culturas foram verificadas a susceptibilidade a antibióticos, a atividade hemolítica e das enzimas β-glucosidase, N-acetil-β-glucosaminidase e β-glucuronidase, e a presença de genes que caracterizam fatores de virulência, produção de aminas biogênicas e resistência a antibióticos. As propriedades tecnológicas: cinética de acidificação, produção de exopolissacarídeos e atividade enzimática, foram avaliadas para todas as cepas. Para as cepas consideradas seguras também foram realizadas as análises da hidrólise da caseína e a atividade de aminopeptidases. A partir da caracterização de segurança e tecnológica foram selecionadas quatro cepas: Lb. helveticus SJRP56 e SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 e S. thermophilus SJRP107 para aplicação na produção de queijo Parmesão. Os queijos foram produzidos em escala industrial em dois processamentos independentes, utilizando-se leite pasteurizado e padronizado com 2,3% de gordura. Foi determinada a composição centesimal dos queijos após a produção, e durante o período de maturação foram avaliadas as características físico-químicas... / Autochthonous lactic acid bacteria (LAB) isolated from various food can produce enzymes, vitamins, and flavor compounds, or compounds that exhibit physiological effects. Recently, studies performed by our research group showed that some autochthonous strains isolated from water buffalo mozzarella cheese are capable of producing bacteriocin as well as some strains presented probiotic properties. In this context, the aim of this study was to evaluate the safety and technological characteristics of autochthonous thermophilic lactic acid bacteria (LAB) strains of Lactobacillus helveticus (SJRP56 and SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 and SJRP109) and Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149 and SJRP181). For the safety characterization of the cultures, the antibiotic resistance, the hemolytic, β-glucosidase, N-acetyl-β-glucosaminidase and β-glucuronidase activities, and the investigation of the presence of genes that characterize virulence factors, production of biogenic amines and antibiotic resistance were carried out. The technological properties: acidification kinetics, exopolysaccharide production and enzymatic activity were evaluated for all strains. For the safe strains the analyses of the casein hydrolysis and aminopeptidase activity were also performed. From the safety and technological characterization, four strains were selected: Lb. helveticus SJRP56 and SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 and S. thermophilus SJRP107, and used in the production of Parmesan cheese. The cheese were produced in industrial scale in two independent processing using 2.3% fat pasteurized standardized milk. After cheese production, the chemical composition was determined, and during the ripening period, the physicochemical characteristics were evaluated (acidity, pH value and proteolysis). At the third month of ripening, the microbiological quality of cheese was carried out. During ...
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Seleção e caracterização de isolados de Bacillus thuringiensis para o controle de Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepdoptera: Geometridae)

Horta, André Ballerini [UNESP] 05 November 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-11-05Bitstream added on 2014-06-13T19:13:03Z : No. of bitstreams: 1 horta_ab_me_jabo.pdf: 129365 bytes, checksum: a43ecf940bba3f7b21533be60728e859 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Bioinseticidas a base de Bacillus thuringiensis são utilizados há décadas no controle de Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) em plantios de eucalipto no Brasil. No entanto, não há relatos de quais genes cry são eficientes para o controle desta praga. Neste sentido, 74 isolados de B. thuringiensis foram caracterizados por PCR para a detecção dos genes cry1, cry1Ab e cry1Ac e sua eficiência no controle de T. arnobia verificada por bioensaios. Os isolados Br9, Br69 Br74, Br81 e R26 apresentaram elevada mortalidade e sua CL50 foi determinada. Os genes cry1Ab e cry1Ac ocorreram isoladamente em 16% e 45% dos isolados, respectivamente, quando presentes em conjunto o controle das lagartas foi superior a 50%, e os valores de CL50 foram os mais elevados. Ambos os genes ocorreram em 11% dos isolados, os níveis de controle foram superiores a 80% e a CL50 era mais baixa, o que sugere que sua presença em conjunto confere maior toxicidade. É evidente que mais estudos em relação à detecção dos genes presentes em isolados de B. thuringiensis e sua contribuição no controle para T. arnobia são fundamentais para esclarecer quais genes conferem maior toxicidade e como eles atuam isoladamente ou em conjunto no controle dessas lagartas, visando a construção de plantas geneticamente modificadas, formulação de bioinseticidas ou desenvolvimento de programas de manejo de resistência destes insetos para a cultura do eucalipto no Brasil / Biopesticides based on Bacillus thuringiensis have been used for decades to control Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) in eucalyptus plantations in Brazil. However, there are no reports of which cry genes are efficient to control this insect pest. In this study, 74 strains of B. thuringiensis were characterized by PCR for detection of cry1, cry1Ab and cry1Ac genes and its efficiency in controlling T. arnobia was verified by bioassays. The strains Br9, Br69, Br74, Br81 and R26 showed the highest mortality rates and their LC50 was determined. The cry1Ab and cry1Ac genes occurred separately in 16% and 45% of the isolates, respectively, and when present together the larvae control was above 50%, and the LC50 values were the highest. Both genes occured in 11% of the isolates, the control levels exceeded 80% and the LC50 was lower, suggesting that their presence together confers higher toxicity. It became evident that further studies regarding the detection of the genes present in isolates of B. thuringiensis, and its contribution to control T. arnobia are essential to clarify which genes confer higher toxicity and how they act individually or together to control these caterpillars, aiming the construction of genetically modified plants, biopesticides formulation or development of more effective resistance management programs for these insects for the cultivation of eucalyptus in Brazil
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Isolamento e caracterização de amostras comunitárias Staphylococcus aureus resistente à Meticilina (CA-MRSA) em uma população carcerária no município de Avaré

Witzel, Claudia de Lima [UNESP] 15 June 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:24:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-06-15Bitstream added on 2014-06-13T19:10:40Z : No. of bitstreams: 1 witzel_cl_me_botfm_parcial.pdf: 120396 bytes, checksum: ec18337e12bca612c7c9844103a8160d (MD5) Bitstreams deleted on 2014-06-27T19:00:45Z: witzel_cl_me_botfm_parcial.pdf,Bitstream added on 2014-06-27T19:02:01Z : No. of bitstreams: 1 witzel_cl_me_botfm.pdf: 1277080 bytes, checksum: c6e53fb083813be017b346181b7be466 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / As Infecções estafilocócicas são grande causa de mortalidade e morbidade. A emergência de isolados de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) originários da comunidade na década de 1990 trouxe desafios para sua prevenção e abordagem terapêutica. A identificação da prevalência e características de MRSA adquirido em comunidade (CA-MRSA) em populações de alto risco pode fornecer valiosas informações para compreensão de sua epidemiologia. O objetivo deste estudo foi identificar a prevalência, os fatores de risco e as características moleculares de CA-MRSA isolado em nasofaringe de uma população carcerária em Avaré, Brasil. Foram coletados swabs nasais de 302 homens encarcerados no Centro de Ressocialização de Avaré. A caracterização da resistência à meticilina foi feita através de difusão em disco (Oxacilina e Cefoxitina) e identificação do gene mecA (por Reação em Cadeia de Polimerase (PCR). Utilizou-se também PCR para identificação dos genes lukF-PVe lukS-PV que codificam a leucocidina de Panton-Valentine. Fatores de risco para colonização nasal por S. aureus e por MRSA foram avaliados em modelos univariados e multivariados (regressão logística). A prevalência de colonização nasal por S. aureus como um todo foi de 16,5%, e a MRSA (definida como positividade para o gene mecA), de (02) 4,0%. Os testes de difusão com disco de Oxacilina e Cefoxitina identificaram 2 (4%) resistentes simultaneamente a Oxacilina e Cefoxitina. Nenhum dos isolados de S. aureus apresentou genes codificadores da PVL. As amostras positivas para gene mecA apresentaram SCCmec tipo IV, confirmando esta tipagem presente em amostras comunitárias.Uma das amostras positivas para gene mecA apresentou SCCmec IV-d, que pelo método PFGE agrupou em 85,7% com o clone JCSC 4469 de origem japonesa. Os fatores de risco para... / Staphylococci infections are a major cause of morbidity and mortality. The emergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates original from the community in the 1990s brought challenges for prevention and therapeutic approach.Identifying the prevalence and characteristics of community-acquired MRSA (CA-MRSA) in high-risk populations can provide valuable information for understanding its epidemiology. The objective of this study was to identify the prevalence, risk factors and molecular characteristics of CA-MRSA isolates in nasopharynx of a prison population in Avare, Brazil. Nasal swabs were collected from 302 men incarcerated in Central Resocialization of Avaré. The characterization of methicillin resistance was done by disk diffusion (Oxacillin and Cefoxitin) and mecA gene identification (by Polymerase Chain Reaction(PCR). We also used PCR to identify the lukF-PV and lukFS-PV genes that encode the Panton- Valentine Leukocidin. Risk factors for nasal colonization by S. aureus and MRSA were evaluated with univariate and multivariate models (logistic regression). The prevalence of nasal colonization by S. aureus as a whole was 16.5%, and MRSA (defined as positive for the mecA gene), from (02) 4.0%. The diffusion testing with Oxacillin and Cefoxitin identified 2 (4%) isolates resistants to both Oxacillin and Cefoxitin. None of the isolated S.aureus had genes encoding PVL. Positive samples for mecA showed SCCmec type IV, confirming this typing in community samples. One of the positive samples for mecA showed SCCmec IV-d, which by PFGE method grouped in 85.7% with clone 4469 JCSC of Japanese origin. Risk factors for S. aureus acquisition revealed in the survey were: men who... (Complete abstract click electronic access below)
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Isolamento e caracterização de amostras comunitárias Staphylococcus aureus resistente à Meticilina (CA-MRSA) em uma população carcerária no município de Avaré /

Witzel, Claudia de Lima. January 2012 (has links)
Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Coorientador: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Banca: Paulo Câmara Marques Pereira / Banca: Patrícia Yoshida Faccioli Martins / Resumo: As Infecções estafilocócicas são grande causa de mortalidade e morbidade. A emergência de isolados de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) originários da comunidade na década de 1990 trouxe desafios para sua prevenção e abordagem terapêutica. A identificação da prevalência e características de MRSA adquirido em comunidade (CA-MRSA) em populações de alto risco pode fornecer valiosas informações para compreensão de sua epidemiologia. O objetivo deste estudo foi identificar a prevalência, os fatores de risco e as características moleculares de CA-MRSA isolado em nasofaringe de uma população carcerária em Avaré, Brasil. Foram coletados swabs nasais de 302 homens encarcerados no Centro de Ressocialização de Avaré. A caracterização da resistência à meticilina foi feita através de difusão em disco (Oxacilina e Cefoxitina) e identificação do gene mecA (por Reação em Cadeia de Polimerase (PCR). Utilizou-se também PCR para identificação dos genes lukF-PVe lukS-PV que codificam a leucocidina de Panton-Valentine. Fatores de risco para colonização nasal por S. aureus e por MRSA foram avaliados em modelos univariados e multivariados (regressão logística). A prevalência de colonização nasal por S. aureus como um todo foi de 16,5%, e a MRSA (definida como positividade para o gene mecA), de (02) 4,0%. Os testes de difusão com disco de Oxacilina e Cefoxitina identificaram 2 (4%) resistentes simultaneamente a Oxacilina e Cefoxitina. Nenhum dos isolados de S. aureus apresentou genes codificadores da PVL. As amostras positivas para gene mecA apresentaram SCCmec tipo IV, confirmando esta tipagem presente em amostras comunitárias.Uma das amostras positivas para gene mecA apresentou SCCmec IV-d, que pelo método PFGE agrupou em 85,7% com o clone JCSC 4469 de origem japonesa. Os fatores de risco para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Staphylococci infections are a major cause of morbidity and mortality. The emergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates original from the community in the 1990s brought challenges for prevention and therapeutic approach.Identifying the prevalence and characteristics of community-acquired MRSA (CA-MRSA) in high-risk populations can provide valuable information for understanding its epidemiology. The objective of this study was to identify the prevalence, risk factors and molecular characteristics of CA-MRSA isolates in nasopharynx of a prison population in Avare, Brazil. Nasal swabs were collected from 302 men incarcerated in Central Resocialization of Avaré. The characterization of methicillin resistance was done by disk diffusion (Oxacillin and Cefoxitin) and mecA gene identification (by Polymerase Chain Reaction(PCR). We also used PCR to identify the lukF-PV and lukFS-PV genes that encode the Panton- Valentine Leukocidin. Risk factors for nasal colonization by S. aureus and MRSA were evaluated with univariate and multivariate models (logistic regression). The prevalence of nasal colonization by S. aureus as a whole was 16.5%, and MRSA (defined as positive for the mecA gene), from (02) 4.0%. The diffusion testing with Oxacillin and Cefoxitin identified 2 (4%) isolates resistants to both Oxacillin and Cefoxitin. None of the isolated S.aureus had genes encoding PVL. Positive samples for mecA showed SCCmec type IV, confirming this typing in community samples. One of the positive samples for mecA showed SCCmec IV-d, which by PFGE method grouped in 85.7% with clone 4469 JCSC of Japanese origin. Risk factors for S. aureus acquisition revealed in the survey were: men who... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Seleção e caracterização de isolados de Bacillus thuringiensis para o controle de Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepdoptera: Geometridae) /

Horta, André Ballerini. January 2012 (has links)
Orientador: Manoel Victor Franco Lemos / Coorientador: Arlindo Leal Boiça Junior / Banca: Lúcia Maria Carareto Alves / Banca: Fernando Hercos Valicente / Resumo: Bioinseticidas a base de Bacillus thuringiensis são utilizados há décadas no controle de Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) em plantios de eucalipto no Brasil. No entanto, não há relatos de quais genes cry são eficientes para o controle desta praga. Neste sentido, 74 isolados de B. thuringiensis foram caracterizados por PCR para a detecção dos genes cry1, cry1Ab e cry1Ac e sua eficiência no controle de T. arnobia verificada por bioensaios. Os isolados Br9, Br69 Br74, Br81 e R26 apresentaram elevada mortalidade e sua CL50 foi determinada. Os genes cry1Ab e cry1Ac ocorreram isoladamente em 16% e 45% dos isolados, respectivamente, quando presentes em conjunto o controle das lagartas foi superior a 50%, e os valores de CL50 foram os mais elevados. Ambos os genes ocorreram em 11% dos isolados, os níveis de controle foram superiores a 80% e a CL50 era mais baixa, o que sugere que sua presença em conjunto confere maior toxicidade. É evidente que mais estudos em relação à detecção dos genes presentes em isolados de B. thuringiensis e sua contribuição no controle para T. arnobia são fundamentais para esclarecer quais genes conferem maior toxicidade e como eles atuam isoladamente ou em conjunto no controle dessas lagartas, visando a construção de plantas geneticamente modificadas, formulação de bioinseticidas ou desenvolvimento de programas de manejo de resistência destes insetos para a cultura do eucalipto no Brasil / Abstract: Biopesticides based on Bacillus thuringiensis have been used for decades to control Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) in eucalyptus plantations in Brazil. However, there are no reports of which cry genes are efficient to control this insect pest. In this study, 74 strains of B. thuringiensis were characterized by PCR for detection of cry1, cry1Ab and cry1Ac genes and its efficiency in controlling T. arnobia was verified by bioassays. The strains Br9, Br69, Br74, Br81 and R26 showed the highest mortality rates and their LC50 was determined. The cry1Ab and cry1Ac genes occurred separately in 16% and 45% of the isolates, respectively, and when present together the larvae control was above 50%, and the LC50 values were the highest. Both genes occured in 11% of the isolates, the control levels exceeded 80% and the LC50 was lower, suggesting that their presence together confers higher toxicity. It became evident that further studies regarding the detection of the genes present in isolates of B. thuringiensis, and its contribution to control T. arnobia are essential to clarify which genes confer higher toxicity and how they act individually or together to control these caterpillars, aiming the construction of genetically modified plants, biopesticides formulation or development of more effective resistance management programs for these insects for the cultivation of eucalyptus in Brazil / Mestre
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Bioprospecção da atividade antimicrobiana de extratos brutos de fungos endofíticos isolados da espécie Oryctanthus alveolatus (Kunth) Kuijt

Lima, Sanay Feitosa 30 July 2015 (has links)
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No. of bitstreams: 1 Dissertação - Sanay Feitosa Lima.pdf: 1448310 bytes, checksum: 5f834ba306b1fec92af1d35b4e7fc328 (MD5) Previous issue date: 2015-07-30 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The plants belonging to the family Loranthaceae are popularly known as ervas-de- passarinho. Among the various plants known belonging to this family, there is Oryctanthus alveolatus, which sparked interest due to the few phytochemicals and microbial studies with this plant. Microorganisms are mostly seen as pathogenic agents, especially fungi and bacteria. However, they are also useful in the production of chemicals such as antibiotics and antitumor. Among the existing fungi, endophytic fungi are microorganisms that inhabit the interior of plants bringing benefits to them. So the aim of this study was to obtain and evaluate the antimicrobial activity of crude extracts of 29 isolated endophytic fungi of the leaves and stems of Oryctanthus alveolatus species, in the face of pathogenic Gram-positive Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis and Gram-negative Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli. All extracts were subjected to antimicrobial assay using agar diffusion test at concentrations of 0,5 μg.μL-1 and 1000 μg.mL-1. Only three extracts; Coa 007, 009a and 014, were able to inhibit bacterial growth of one or more strains tested at 1000 μg.mL-1. Subsequently, the active extracts were tested at concentrations of 200, 500, 700, 800 and 900μg.mL-1, and the Coa 007 extract showed the CIM values of 900 μg.mL-1 for the bacteria E. coli and P. aeruginosa and CIM of 1000 μg.mL-1 for the bacteria S. aureus. The Coa 009a extract showed CIM of 1000 μg.mL-1 for S. aureus and E. coli bacteria and Coa 014 extract showed CIM in the amount of 900 μg.mL-1 for E. coli and 1000 μg.mL-1 for the bacteria P. aeruginosa and S. aureus. The other fungi tested did not inhibit bacterial growth. Fungi in the extracts were active, they were also evaluated the morphological point of view. The Coa 007 and Coa 014 fungi presented macromorfológicas initially similar characteristics: both possessed white coloring, with algodonosa and opaque texture. Over time, the Coa 007 now presents beige-pink color reverse, differentiating Coa 014 that pasou to present pink pigmentation spots, with reverse part of beige. The Coa 009a initially presented black color, becoming black-gray, cotton wool spots, and reverse the black colony. / As plantas pertencentes à família Loranthaceae são popularmente conhecidas como ervas- de-passarinho. Entre as mais diversas plantas conhecidas pertencentes a essa família, destaca-se Oryctanthus alveolatus, na qual despertou o interesse, devido aos poucos estudos fitoquímicos e microbianos realizados com esta planta. Os microrganismos são em sua maioria, vistos como agentes fitopatogênicos, principalmente fungos e bactérias. Entretanto, eles também são úteis na produção de substâncias químicas, como antibióticos e antitumorais. Dentre os fungos existentes, os fungos endofíticos são microrganismos que habitam o interior das plantas trazendo benefícios às mesmas. Assim o objetivo desse trabalho foi obter e avaliar a atividade antimicrobiana dos extratos brutos de 29 fungos endofíticos isolados das folhas e caules da espécie Oryctanthus alveolatus, frente às bactérias patogênicas Gram-positivas Staphylococcus aureus e Staphylococcus epidermidis e Gram-negativas Pseudomonas aeruginosa e Escherichia coli. Todos os extratos foram submetidos a ensaio antimicrobiano utilizando teste de difusão em ágar nas concentrações de 0,5 μg. μL-1 e 1000 μg.mL-1. Apenas três extratos; Coa 007, 009a e 014, conseguiram inibir o crescimento bacteriano de uma ou mais cepas testadas na concentração de 1000 μg.mL-1. Posteriormente, os extratos ativos foram testados nas concentrações de 200, 500, 700, 800 e 900 μg.mL-1, sendo que o extrato Coa 007 apresentou CIM nos valores de 900 μg.mL-1 para as bactérias E. coli e P. aeruginosa e CIM no valor de 1000 μg.mL-1 para a bactéria S. aureus. O extrato Coa 009a apresentou CIM no valor de 1000 μg.mL-1 para as bactérias S.aureus e E.coli e o extrato Coa 014 apresentou CIM nos valores de 900μg.mL-1 para a bactéria E. coli e 1000 μg.mL-1 para as bactérias P. aeruginosa e S. aureus. Os demais fungos testados não inibiram o crescimento bacteriano. Os fungos, em que os extratos apresentaram atividade, também foram avaliados do ponto de vista morfológico. Os fungos Coa 007 e Coa 014 apresentaram características macromorfológicas inicialmente parecidas: ambos possuiam coloração branca, com textura algodonosa e opaca. Com o tempo, o Coa 007 passou a apresentar coloração reversa bege-rosa, diferenciando do Coa 014 que pasou a apresentar pontos de pigmentação rosa, com parte reversa de cor bege. O Coa 009a apresentou inicialmente coloração preta, tornando-se negro-acinzentado, algodonoso, e reverso da colônia negro.

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