O trabalho foi conduzido na EEA-UFRGS, em Eldorado do Sul/RS, entre jan/2009 e fev/2010 com o objetivo de avaliar as relações entre comportamento ingestivo, consumo de forragem, oferta diária de forragem e as variáveis da estrutura do pasto a fim de definir ambientes adequados ao pastejo em pastagem natural complexa. Para avaliar o tempo diário das atividades de novilhas de corte, verificou-se o potencial de um método acústico, enquanto que para avaliar o consumo de matéria seca utilizou-se a técnica dos alcanos, a partir da teoria do duplo alcano. Foi utilizado um delineamento experimental de blocos completos casualizados com duas repetições. Os tratamentos consistiram dos seguintes níveis de oferta diária de forragem aplicados desde 1986: 4, 8, 12 e 16 kg de MS/100 kg de PV, ou % PV. Foram utilizadas novilhas mestiças com 15 meses de idade e 152±4,0 kg, alocadas na área em Nov/2008. As variáveis utilizadas para descrever a estrutura dos pastos foram: massa de forragem, altura do pasto e frequência de touceiras. As variáveis de comportamento ingestivo consideradas foram: tempo de pastejo, deslocamento e taxa de deslocamento diário em pastejo. Já as variáveis de consumo estudadas foram: consumo e taxa de consumo diário de forragem e de nutrientes. Os resultados apontaram que o manejo da oferta de forragem, mesmo modificando a abundância de forragem e determinando ambientes alimentares contrastantes, não permite controle estrito, tampouco predição, da estrutura do pasto, principalmente nos níveis moderados e altos de oferta de forragem (e.g., 12 e 16% PV). As relações demonstram que elevados níveis de consumo diário estão associados com o aumento na abundância de forragem e com a estrutura do pasto. Ofertas de forragem muito baixas ou altas podem comprometer a taxa de consumo de nutrientes. Elevado tempo de pastejo diário esteve associado com elevados deslocamentos, o que pode gerar maiores gastos energéticos. Os menores valores de tempo de pastejo diário estiveram associados às estruturas de pasto que apresentaram massa de forragem entre 1400-2200 kg de MS/ha e altura do pasto entre 8-13 cm, sendo que a ocorrência de touceiras não ultrapassou 35%. Já as condições de pasto que promoveram maiores consumo diário e elevada taxa de consumo foram observadas quando a oferta de forragem esteve em torno de 11% PV, situação em que a massa de forragem situava-se em 1800 kg de MS/ha, a altura do pasto encontrava-se em 11,9 cm e a presença de touceiras era de 30%. Dentro dessas amplitudes também se configurou elevado consumo de nutrientes, indicando que tais parâmetros caracterizam um ambiente pastoril desejável tanto do ponto de vista de bem-estar quanto em nível de produção animal. / The experiment was carried out at the Research Station of the Federal University of Rio Grande do Sul, Brazil, from Jan/2009 to Feb/2010, in order to assess the relationship of ingestive behaviour and forage intake with the daily herbage allowance and variables of sward structure aiming to define suitable environments to grazing on complex natural grassland. The usefulness for an acoustic method to assess the time of daily activities was studied, while for assessing dry matter intake the technique of alkanes from the theory of the double alkane was performed. A completely randomized block design with two replicates (paddocks) was used. The treatments were levels of daily herbage allowance applied since 1986: 4, 8, 12 and 16 kg DM/100 kg BW, or BW %. The experimental animals were crossbred heifers with 15 months of age and 152±4.0 kg that entered in the experimental area in Nov/2008. The variables used to describe the sward structure were: herbage mass, sward height and the frequency of tussocks. The variables of ingestive behaviour measured and used were: grazing time, displacement and daily displacement rate at grazing. The variables of daily intake studied were: the amount and rate of daily forage intake and nutrients. The results showed that the management of herbage allowance, even changing the abundance of forage and determining contrasting environments, does not allow for a strict control and prediction of sward structure, mainly for levels moderate to high of allowance. The relationships presented demonstrate that high levels of daily intake are associated with an increase in the abundance of forage and sward structure. Herbage allowance excessively low or high may provide lower intake rates of nutrients. High daily grazing time was associated with higher displacements, which can generate higher energy costs. The lowest values of daily grazing time was associated with structures that contained herbage mass between 1400-2200 kg DM/ha and sward height between 8-13 cm, whereas tussocks levels did not exceed 35%. The sward conditions that promoted high daily intake and high intake rate was observed when herbage allowance was around 11% BW, herbage mass was 1800 kg DM/ha, the sward height was 11,9 cm and the occurrence of tussocks of 30%. Within these ranges it has also become a high intake of nutrients indicating those parameters can characterize a suitable grazing environment both for animal welfare as well as for animal production aspects.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-08-22T11:50:51Z No. of bitstreams: 1 Edvania do Nascimento Pereira.pdf: 1151466 bytes, checksum: 9e3056541ef3069eec6437152cf19482 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-22T11:50:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edvania do Nascimento Pereira.pdf: 1151466 bytes, checksum: 9e3056541ef3069eec6437152cf19482 (MD5) Previous issue date: 2015-07-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The acoustic signals in frogs are important for communication, being effective in transmitting information. These songs can be influenced by abiotic factors such as temperature and relative humidity, and biotic factors such as the size of the reproductive aggregates, size and body mass of animals. This study aimed to analyze the physical structure of different vocalizations S. prasinus, the social context in which they occurred and the body posture of individuals at the time of issuance of sounds. In addition to checking whether abiotic factors (temperature and relative humidity) and biotic (animal body size, body mass, presence of males and sexually mature females in the neighborhood, temperature, and relative humidity) influence the advertisement call and the organization of seasonal chorus. For recording acoustic data was using a digital recorder, through the internal omnidirectional microphones. Abiotic data were recorded (temperature and relative humidity) and biotic (micro-habitat of vocalization, the margin distance, distance from the nearest individual, data on CRC (cloacal face length) and body mass of individuals). To assist in the identification and differentiation of vocalizations, in addition to behavioral data was conducted experiment of "playback". 200 corners of 22 individuals were analyzed. They classified three types of vocalizations emitted by males of S. prasinus: advertisement call, cutting and territorial. Distinctions were found between the territorial corners with ad and cut. However, there exist differences between cutting corners and announcement, which can be important to avoid the notice of the female presence in the corner site for other males. The average amplitude of the advertisement call was the parameter that got a greater correlation with the presence of male and sexually mature females. With the objective to maintain minimum spacing between neighbors and increase mating success. The corner of the activities peaks occurred in February and March (hottest), which is common in tropical frogs due to ectotermia. Valuable results on acoustic communication and the influence of abiotic and biotic factors on acoustic parameters of sound S. prasinus, contributing information on the natural history of the species, assisting with important elements for conservation of sensitive taxa environmental changes. / Os sinais acústicos em anuros são importantes para a comunicação, sendo eficaz na transmissão de informações. Esses cantos podem sofrer influências de fatores abióticos, como temperatura e umidade relativa do ar e fatores bióticos como o tamanho dos agregados reprodutivo, tamanho e massa corpórea dos animais. Este trabalho teve por objetivo analisar a estrutura física das diferentes vocalizações de S. prasinus, o contexto social em que ocorreram e a postura corporal dos indivíduos no momento da emissão dos sons. Além de verificar se fatores abióticos (temperatura e umidade relativa do ar) e bióticos (tamanho do corpo dos animais, massa corpórea, presença de machos e fêmeas sexualmente maduros na vizinhança, temperatura, e umidade relativa do ar) influenciam no canto de anúncio e na organização do coro sazonalmente. Para a gravação dos dados acústicos foi utilizando um gravador digital, através dos microfones omnidirecionais internos. Foram anotados os dados abióticos (temperatura e umidade relativa do ar), e bióticos (micro-habitat de vocalização, distância da margem, distância do individuo mais próximo, dados sobre o CRC (comprimento rosto cloacal) e massa corpórea dos indivíduos). Para auxiliar na identificação e diferenciação das vocalizações, além dos dados comportamentais foi realizado experimento de "playback". Foram analisados 200 cantos, de 22 indivíduos. Classificaram-se três tipos de vocalizações emitidos por machos de S. prasinus: canto de anúncio, corte e territorial. Foram encontradas distinções entre os cantos territoriais com os de anúncio e corte. Contudo, não existiriam diferenças entre os cantos de corte e de anúncio, o que pode ser importante para evitar o aviso da presença da fêmea no sítio de canto para outros machos. A amplitude média do canto de anúncio foi o parâmetro que obteve uma maior correlação com a presença de machos e fêmeas sexualmente maduros. Tendo por objetivo manter espaçamento mínimo entre vizinhos e aumentar o sucesso no acasalamento. Os picos de atividades do canto ocorreram nos meses de fevereiro e março (mais quentes), o que é comum em anuros tropicais, devido à ectotermia. Resultados valiosos sobre a comunicação acústica e a influência de fatores abióticos e bióticos nos parâmetros acústicos do som de S. prasinus, contribuindo com informações sobre a história natural da espécie, auxiliando com elementos importantes para conservação de grupos taxonômicos sensíveis as mudanças ambientais.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-09-23T11:26:29Z No. of bitstreams: 1 edsonbrunonovais.pdf: 2920892 bytes, checksum: 3d1fd266b827947d2a99d52954ff89cb (MD5) / Approved for entry into archive by Diamantino Mayra (mayra.diamantino@ufjf.edu.br) on 2016-09-26T20:30:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 edsonbrunonovais.pdf: 2920892 bytes, checksum: 3d1fd266b827947d2a99d52954ff89cb (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-26T20:30:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 edsonbrunonovais.pdf: 2920892 bytes, checksum: 3d1fd266b827947d2a99d52954ff89cb (MD5) Previous issue date: 2016-03-09 / FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Considerando o sucesso dos dispositivos móveis e a evolução de suas tecnologias, o estudo de Odontocetos em tempo real é uma possibilidade emergente. Apesar desta evolução, a análise de grandes volumes de dados por algoritmos complexos requer considerável esforço computacional. A coleta de dados de Odontocetos é executada em ambiente marinho com recursos limitados, o que reduz o potencial de pesquisa. Sendo assim, a escolha dos algoritmos para a criação de um Fluxo de Trabalho deve manter um balanço entre a eficiência computacional e a eficácia de detecção. Esta tese tem como objetivo propor um modelo de Fluxo de Trabalho eficiente para o Monitoramento Acústico Passivo. Para tal, um Fluxo de Trabalho de referência comumente utilizado em campo por pesquisadores foi utilizado como base, sendo inserido uma nova etapa de pré-processamento das informações capturadas. A etapa de detecção, foco deste trabalho devido sua aplicabilidade e notável impacto nas próximas etapas, é responsável por analisar os sinais acústicos recebidos, filtrando boa parte dos dados. A próxima etapa trata da condensação dos dados de forma a facilitar a transferência destes para localidades remotas. Em sequência tem-se a etapa de identificação das informações recebidas a partir da etapa anterior. Por fim, a última etapa baseia-se em componentes de software para o estudo das informações relevantes adquiridas. A aplicação da etapa de detecção no Fluxo de Trabalho de referência apresentou um desempenho satisfatório acarretando em uma redução de 96,52% do volume total de dados a serem armazenados e processados, facilitando que informações relevantes da captura sejam identificadas e distribuídas online para estações de pesquisa remotas. / Considering the success of mobile devices and the evolution of its technologies, the study of Odontoceti in real time is an emerging possibility. Despite the evolution, analysis of big data chunks by complex algorithms requires considerable computing effort. Data collection of Odontoceti is execute in marine environment with limited resources, thus reducing research potential. Therefore, choosing the right algorithm to create the Workflow should maintaining a balance between computational efficiency and detection accuracy. The goal of this thesis is to propose an efficient Workflow for Passive Acoustic Monitoring. For such, a common Workflow used in the field by researchers was used as base, adding a new step for preprocessing of captured data. The detection step, focus of this thesis due to its applicability and notable impact on the next steps, is responsible to analyse received acoustic signals, filtering a good amount of data. The next step condensates data in a way that facilitates transfer of captured information to remote locations. In sequence there is the step responsible for the identification of received information from the previous step. The last step is based on software components to study relevant information. The appplication of the detection step have shown a satisfactory performance providing a reduction of 96.52 of total data to be processed, making it easy for relevant information to be identified and distributed online to remote research stations.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2015-12-08T14:30:37Z No. of bitstreams: 1 julianarodriguesmoron.pdf: 5395147 bytes, checksum: 0f2d0052bd8730bc31eb9bf590e8a739 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2015-12-09T13:42:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 julianarodriguesmoron.pdf: 5395147 bytes, checksum: 0f2d0052bd8730bc31eb9bf590e8a739 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-09T13:42:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 julianarodriguesmoron.pdf: 5395147 bytes, checksum: 0f2d0052bd8730bc31eb9bf590e8a739 (MD5) Previous issue date: 2015-03-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Apesar de investigações bioacústicas de golfinhos-rotadores já terem sido abordadas e descritas na literatura, a região do Oceano Atlântico Sul Ocidental só abrangeu a população do arquipélago de Fernando de Noronha. Portanto, a fim de contribuir para um melhor conhecimento desta espécie cosmopolita, este estudo teve como objetivo descrever os sons através de seus parâmetros acústicos de uma gravação oportunista realizada ao longo da quebra da plataforma continental Brasileira. Um grupo de aproximadamente 400 golfinhos Stenella longirostris foi registrado através de uma matriz de arrasto composta por um hidrofone realizando gravação mono contínua a 96kHz / 24bits. Após uma seleção de 12 minutos a partir do registro, 1.100 assobios foram extraídos e classificados em sete tipos de contornos, juntamente com outras dez variáveis extraídas. Os assobios dos golfinhos-rotadores foram constituídos em sua maioria por contorno ascendente (41,2%). O grupo apresentou ainda assobios com maior índice de modulação de frequência do que já havia sido descrito na literatura, apresentando uma frequência máxima de 26,4 kHz. Apesar da curta duração desses assobios, variando de 0,03 s a 2,56 s (média = 0,67 s), esses valores também foram mais altos do que a maioria dos estudos havia relatado. Apesar de diferenças estatisticamente significativas, a comparação a partir da média dos valores dos parâmetros extraídos apontou que dois estudos anteriores realizados no Oceano Pacífico Norte são mais semelhantes em relação a este estudo. Dessa forma, as possibilidades a partir das comparações discutidas no presente trabalho não só auxiliam a identificar a variabilidade nas emissões de forma a melhorar as classificações de detecção acústica em pesquisas e mitigação de impacto; como também contribuem para a compreensão de populações distintas e / ou espécies distribuídas em diferentes regiões oceânicas. / Spinner dolphins’ bioacoustics have already been described in literature, meanwhile the Western South Atlantic Ocean was only approached inside Fernando de Noronha Archipelago. Therefore, in order to contribute to a better knowledge of this cosmopolitan species, this study aimed to describe the sounds through their acoustic parameters detected during an opportunistic recording carried out at the Brazilian continental shelf break. A group of approximate 400 Stenella longirostris dolphins was recorded through a one-element hydrophone array performing continuous mono recording at 96 kHz/24 bits. After a 12 minutes selection of the record, 1,100 whistles were extracted and classified into seven contours shapes, along with other ten variables extracted. The spinner dolphins whistles was mostly comprised by upsweep (41.2%) contour. The group produced higher pitch frequency modulated whistles than what has been previously described, presenting a maximum frequency of 26.4 kHz. Despite the short whistle durations, ranging from 0.03 s to 2.56 s (mean = 0.67 s), those values were also higher than most of previous works had reported. Despite statistically significant differences, the comparison from the average of the extracted parameters pointed out that two previous studies in the North Pacific Ocean are more similar in relation to this study. Thereby, the possibilities from the comparisons discussed in this paper not only assist in identifying the variability in the emissions in order to improve acoustic detection classifications in research and impact mitigation; but also contribute to the understanding of distinct populations and/or species distributed in different ocean basins.

Três tipos de sons de cortejo foram descritos para machos de tefritídeos: de chamada, na ausência de fêmeas; de aproximação, na proximidade de fêmeas; e de pré-cópula, após a monta das fêmeas pelos machos. Nas espécies do gênero Anastrepha em que foram registrados sons de acasalamento, somente dois tipos estão presentes: de chamada e de précópula. As emissões acústicas de acasalamento de algumas espécies foram caracterizadas quanto a parâmetros como duração e freqüência dos sons, incluindo a espécie nominal Anastrepha fraterculus - importante praga da fruticultura nacional. No entanto, até o presente momento, nenhum estudo teve como foco a diferenciação dentro do complexo A. fraterculus, constituído por diversas espécies crípticas - das quais, três caracterizadas para o Brasil: A. sp. 1 aff. fraterculus, A. sp. 2 aff. fraterculus e A. sp. 3 aff. fraterculus. Este trabalho procurou caracterizar o padrão de emissão acústica de chamada de populações do complexo A. fraterculus (duas de A. sp. 1, uma de A. sp 2 e uma de A. sp. 3) e de A. obliqua, em relação à duração de pulso (PD), intervalo entre pulsos (IPI) e freqüência fundamental (FF), comparando com dados disponíveis na literatura para outras espécies. Os parâmetros acústicos de A. sp. 1 de Serra Negra - SP - não se diferenciaram estatisticamente dos parâmetros de A. sp. 2 de São Sebastião - SP. O padrão de emissão de A. sp. 3 de São Sebastião - SP -, difere do de A. sp. 1 de Serra Negra - SP - e de A. sp. 2 de São Sebastião - SP - no parâmetro PD. Os parâmetros acústicos de A. sp. 1 de São Paulo - SP - foram completamente distintos dos parâmetros das demais populações, inclusive dos de A. sp. 1 de Serra Negra - SP. O padrão de emissão acústica A. obliqua de Águas da Prata - SP - também diferencia-se dos das demais espécies/populações, exceto em relação ao PD de A.. sp. 1 de São Paulo - SP. A relação entre picos de distribuição de FF e de harmônicos, bem como a correlação entre parâmetros acústicos e o comprimento das asas sugerem uma relação entre características físicas das asas e os sons emitidos. Porém, outros fatores também devem estar em atuação, uma vez que a relação entre picos e harmônicos não é observada para todas as populações estudadas e a correlação entre tamanho de asa e valores de parâmetros acústicos é baseada em número limitado de espécies. Não há uma relação entre o valores dos parâmetros acústicos e as relações filogenéticas entre as espécies de moscas-das-frutas. Assim, embora os padrões de emissões acústicas permitam diferenciar as espécies entre si, não é possível utilizá-los para agrupar as espécies quanto a afinidades evolutivas. Dentro dos tefritídeos, a evolução dos tipos de emissão acústica do acasalamento provavelmente envolve uma história bastante complexa com várias homoplasias. / Three courtship songs have been described for tephritid males: calling song, when female flies are absent; approach song, near females; and precopulatory song, after male mounting female. For species of Anastrepha in which mating songs were recorded, only two types are present: calling and precopulatory songs. In these cases mating accoustic emissions were characterized regarding parameters such as duration and sound frequency; including for the nominal species Anastrepha fraterculus - a major fruit crop pest in Brazil. However, no study have focused on differences amid A. fraterculus criptic species complex - including the three species that occur in Brazil: A.. sp. 1 aff. fraterculus, A. sp. 2 aff. fraterculus e A. sp. 3 aff. fraterculus. In this work, the acoustic emission patterns for A. sp. 1, A. sp. 2 A. sp. 3, and for A. obliqua population samples were characterized by comparing pulse duration (PD), interpulse interval (IPI) and fundamental frequency (FF), with data available in literature for other tephritid species. The acoustic parameters of A sp. 1 Serra Negra (SP) do not differ statistically from parameters of A. sp. 2 (São Sebastião, SP). The PD parameter of A. sp. 3 (São Sebastião, SP) differs from A. sp. 1 (Serra Negra, SP) and from A. sp. 2 from São Sebastião (SP). The acoustic parameters of A. sp. 1 from São Paulo (SP) were completely different from parameters of other populations, including A. sp. 1 from Serra Negra (SP). The acoustic emission pattern of A. obliqua from Águas da Prata (SP) is also different from other species/populations, except by the PD of A. sp. 1 from São Paulo (SP). The relationship between FF distribution peaks and sound harmonics as well as the correlation between acoustic parameters and wing length, suggest that the emitted sounds are dependent on the wing physical properties. However, other factors might also influence the sound pattern, because the relation between FF peaks and harmonics is not observed for all population samples, and the correlation between wing length and acoustic parameters were evaluated on few species. There is no relation between acoust parameters values and fruit flies phylogeny. Therefore, it is possible to distinguish between species on the basis of sound parameters, but it is not possible to group them by evolutionary affinities. Among the tephritids, mating acoustic emission patterns probably involves a complex evolutionary history with many homoplasies.

Os fatores físicos que envolvem a incubação artificial são determinantes no desenvolvimento embrionário, eclosão e desempenho das aves. Muitos deles são bem-conceituados, mas acredita-se que ainda existem questões que possam prover melhorias ou adaptar este processo as novas demandas da produção animal. Nesta pesquisa, a bioacústica é colocada como uma dessas questões, motivando a investigação da estimulação sonora na incubação artificial, dados os efeitos do ruído dos incubatórios comerciais e a adição de vocalizações da espécie em respostas fisiológicas, produtivas e comportamentais de pintos de corte. Inicialmente, o Capítulo 3 apresenta a mensuração do nível de pressão sonora (NPS) no interior dos ovos. Para isso, desenvolveu-se um sensor de tamanho reduzido (decibelímetro-miniaturizado) utilizando a plataforma Arduíno®. O sensor foi calibrado e testado, o que forneceu informações como o isolamento da onda sonora pela casca dos ovos e valores de NPS próximos aos embriões. Em sequência realizaram-se incubações experimentais com a aplicação de tratamentos determinados pela associação de dois NPS do ruído de incubadoras [70 ou 90 dB (A)] com ou sem a adição de vocalizações da espécie (estímulos naturais). Estes tratamentos foram avaliados no crescimento embrionário e em respostas da eclosão (Capítulo 4) e no desempenho de pintos de corte na primeira semana (Capítulo 5). Diferente do esperado, a exposição ao maior NPS, que simulava o ruído de incubatórios comerciais, adiantou o tempo para o início das eclosões, aumentou a eclodibilidade e a qualidade do umbigo e jarretes dos pintos. Todavia, as vocalizações da espécie só se mostraram influentes se associadas ao NPS de 70 dB (A). Nas respostas de desempenho a exposição ao NPS inferior resultou em um maior consumo de ração e em uma pior conversão alimentar, com melhores resultados na exposição a 90 dB (A) ou na presença das vocalizações. Por fim, no Capítulo 6, testes comportamentais como o de imobilidade tônica, isolamento social e campo aberto foram realizados com os pintos eclodidos dos tratamentos de incubação descritos anteriormente. Na realização destes testes consideraram-se três períodos no pós-eclosão (24, 72 e 120 horas) e duas condições (testes em silêncio ou com vocalizações ao fundo). Os efeitos da estimulação sonora foram verificados somente em 24 horas pós-eclosão, de modo que a exposição às vocalizações no desenvolvimento embrionário reduziu a movimentação e o nível de vocalização dos pintos, o que foi associado ao menor estresse. Conclui-se que a estimulação sonora na incubação artificial é capaz de alterar respostas produtivas e o comportamento de pintos após a eclosão. / The physical factors that involve artificial incubation are determinant to the embryonic development, hatching and performance of chicks. Although many of them are highly regarded, there are other issues capable of improving or adapting the process to new animal-production demands. The current research addresses the bioacoustics as one of such issues, which motivated the investigation of the sound stimuli in artificial incubation, relating the noise of the commercial hatcheries and the addition of vocalizations of the species with physiological, productive and behavioral of chicks. Initially, the Chapter 3 presents the measuring the sound pressure level (SPL) inside eggs. To do so, a small sensor (miniaturized decibel meter) was developed in the Arduino® platform. The sensor was calibrated and tested under specific conditions to collect information, such as sound wave isolation by egg shells and SPL values close to the embryos. Experimental incubations with treatments based on the association between two noise SPLs of the hatcheries [70 or 90 dB (A)] with, or without, the addition of species-specific vocalizations (natural stimulus). These treatments were evaluated on embryo growth and hatch responses (Chapter 4) and chicks performance in the first week of life (Chapter 5). Against all expectations, egg exposure to the highest SPL, which simulated the noise of commercial hatcheries, reduced the time necessary for hatching, besides increasing the hatchability, as well as the quality of the navel and hocks, of chicks. On the other hand, species-specific vocalizations were only influential when they were associated with 70 dB SPL (A). The exposure to lower NPS resulted in higher feed intake and lower feed conversion with better results in exposure to 90 dB (A) or in the presence of vocalizations. Finally, in Chapter 6, behavioral tests such as tonic immobility, social isolation and open field tests applied to chicks hatching from the incubation treatments described above. The tests comprised three post-hatching periods (24, 72 and 120 hours) and two conditions (silence or species-specific vocalizations in the background). The effects of incubation treatments were just observed in some responses and 24 hours after hatching. The exposure to the vocalizations during embryonic development reduced chicks\' movement and vocalization level, which was associated with lower stress. It is concluded that sound stimulation in hatcheries can alter productive responses and behavior of chicks after hatching.

Sound production is a widespread phenomenon in fishes; however, the importance of acoustic signals and their potential to influence reproduction has not been determined. This dissertation examines fish acoustic courtship signals to investigate whether sound has a role in reproductive success. The pre-spawning sounds of several fishes were recorded and analyzed. The male advertisement call of two species of Belizean toadfish, Sanopus astrifer and Batrachoides gilberti, were found to significantly differ. These data, coupled with data in the literature suggest an influence of habitat characteristics on the calling behavior of toadfishes. Additionally, acoustic playback experiments were employed to investigate the role of male courtship sounds in the Malawi cichlid species, Tramitichromis intermedius. Playback results indicated that male sounds may initiate egg-laying behavior in females, but may not be behaviorally relevant to conspecific males. A discussion of confounding factors in aquarium playback experiments is presented. Technical aspects of fish sound recording, playback, and analysis were also examined to provide information for future fish bioacoustics studies. It was determined that digital cameras are a useful method of recording fish sounds to describe metric characteristics; however, temporal parameters are more accurately captured by hydrophones, which are optimal for use in scientific description of fish sounds. Underwater speakers commonly used in fish playback experiments were tested for fidelity when producing a low-frequency pulsed fish sound. The Electro-Voice UW30 speaker was found to perform the best playback at low sound pressure levels (<120 dB re 1 μPa) and at short distances (< 15 cm). The Clark Synthesis AQ339 speaker performed the best playback at higher sound pressure levels (>120 dB re 1 μPa) and at greater distances than the UW30. Many fish sounds have been described in the literature; however, there is no standardization of sample size used in species descriptions. A method is presented that can be used to estimate the level of inclusiveness of sound variability in sound descriptions, and to approximate sufficient sample sizes of recordings. The courtship calls of Dascyllus albisella and Batrachoides gilberti were examined to illustrate this method and to provide a benchmark for future sound descriptions.

Les études de bioacoustique animale, qui reposent traditionnellement sur des modèles primates non humains et oiseaux chanteurs, convergent vers l'idée que la vie sociale serait la principale force motrice de l'évolution de la complexité de la communication. La comparaison avec les cétacés est également particulièrement intéressante d'un point de vue évolutif. Ce sont des mammifères qui forment des liens sociaux complexes, ont des capacités de plasticité acoustique, mais qui ont dû s'adapter à la vie marine, faisant de l'habitat une autre force de sélection déterminante. Leur habitat naturel impose des contraintes sur la production sonore, l'utilisation et la perception des signaux acoustiques, mais, de la même manière, limite les observations éthologiques. Etudier les cétacés captifs devient alors une source importante de connaissances sur ces animaux. Au-delà de l'analyse des structures acoustiques, l'étude des contextes sociaux dans lesquels les différentes vocalisations sont utilisées est essentielle à la compréhension de la communication vocale. Par rapport aux primates et aux oiseaux, la fonction sociale des signaux acoustiques des dauphins reste largement méconnue. En outre, les adaptations morpho-anatomiques de l’appareil vocal et auditif des cétacés à une vie sous-marine sont uniques dans le règne animal. Leur capacité à percevoir les sons produits dans l'air reste controversée en raison du manque de démonstrations expérimentales. Les objectifs de cette thèse étaient, d'une part, d'explorer l'utilisation contextuelle spontanée des signaux acoustiques dans un groupe captif de dauphins et, d'autre part, de tester expérimentalement les capacités à percevoir les sons sous l’eau comme dans l’air. Notre première étude observationnelle décrit la vie quotidienne de dauphins en captivité et montre que les signaux vocaux reflètent, à grande échelle, la répartition temporelle des activités sociales et non sociales dans un établissement sous contrôle humain. Notre deuxième étude met l'accent sur le contexte d’émission des trois principales catégories acoustiques précédemment identifiées dans le répertoire vocal des dauphins, à savoir les sifflements, les sons pulsés et les séries de clics. Nous avons trouvé des associations préférentielles entre chaque catégorie vocale et certains types d'interactions sociales ainsi que des combinaisons sonores non aléatoires et également dépendantes du contexte. Notre troisième étude a testé expérimentalement, dans des conditions standardisées, la réponse des dauphins à des « labels » acoustiques individuels donnés par l’homme et diffusés dans l’eau et dans l’air. Nous avons constaté que les dauphins peuvent reconnaître et réagir uniquement à leur propre « label » sonore, même lorsqu'il est diffusé dans l’air. En plus de confirmer l'audition aérienne, ces résultats soutiennent l’idée que les dauphins possèdent une notion d'identité. Dans l'ensemble, les résultats obtenus au cours de cette thèse suggèrent que certains signaux sociaux dans le répertoire des dauphins peuvent être utilisés pour communiquer des informations spécifiques sur les contextes comportementaux des individus impliqués et que les individus sont capables de généraliser leur concept d'identité à des signaux générés par l'homme. / Studies on animal bioacoustics, traditionally relying on non-human primate and songbird models, converge towards the idea that social life appears as the main driving force behind the evolution of complex communication. Comparisons with cetaceans is also particularly interesting from an evolutionary point of view. They are indeed mammals forming complex social bonds, with abilities in acoustic plasticity, but that had to adapt to marine life, making habitat another determining selection force. Their natural habitat constrains sound production, usage and perception but, in the same way, constrains ethological observations making studies of captive cetaceans an important source of knowledge on these animals. Beyond the analysis of acoustic structures, the study of the social contexts in which the different vocalizations are used is essential to the understanding of vocal communication. Compared to primates and birds, the social function of dolphins’ acoustic signals remains largely misunderstood. Moreover, the way cetaceans’ vocal apparatus and auditory system adapted morphoanatomically to an underwater life is unique in the animal kingdom. But their ability to perceive sounds produced in the air remains controversial due to the lack of experimental demonstrations. The objectives of this thesis were, on the one hand, to explore the spontaneous contextual usage of acoustic signals in a captive group of bottlenose dolphins and, on the other hand, to test experimentally underwater and aerial abilities in auditory perception. Our first observational study describes the daily life of our dolphins in captivity, and shows that vocal signalling reflects, at a large scale, the temporal distribution of social and non-social activities in a facility under human control. Our second observational study focuses on the immediate context of emission of the three main acoustic categories previously identified in the dolphins’ vocal repertoire, i.e. whistles, burst-pulses and click trains. We found preferential associations between each vocal category and specific types of social interactions and identified context-dependent patterns of sound combinations. Our third study experimentally tested, under standardized conditions, the response of dolphins to human-made individual sound labels broadcast under and above water. We found that dolphins were able to recognize and to react only to their own label, even when broadcast in the air. Apart from confirming aerial hearing, these findings go in line with studies supporting that dolphins possess a concept of identity. Overall, the results obtained during this thesis suggest that some social signals in the dolphin repertoire can be used to communicate specific information about the behavioural contexts of the individuals involved and that individuals are able to generalize their concept of identity for human-generated signals.

6 ABSTRACT Bird song is a sexually selected trait that is crucial for mate choice and for maintenance of pre-mating reproductive barriers. Secondary contact of closely related and partially reproductively isolated song bird species may result in changes in their songs; these can either diverge and strengthen the reproductive barrier between the two species, or converge and contribute to mixing of their gene pools. The Thrush Nightingale (Luscinia luscinia) and its congener Common Nightingale (L. megarhynchos) may serve as model species suitable for studying these phenomena. In their secondary contact zone, an interspecific hybridization has been documented, as well as convergence of songs of Thrush Nightingales caused by copying of heterospecific songs. Such copying may be a result of erroneous learning of species- specific songs or by genetic introgression. We tested these hypotheses by simultaneous analyses of DNA and song recordings of both species from allopatry (Czech Republic and northeastern Poland) and sympatry (central Poland). Comparisons between our recordings and a catalogue of songs recorded in a Common Nightingale population from allopatry (Germany) confirmed that most of Thrush Nightingale males from the sympatric region were 'mixed singers' that use Common Nightingale phrases in their...

Audio data compression seeks to reduce the size of sound files, making them easier to store and transfer, and is thus a highly valued tool for those working with large sets of audio data. For example, some biologists work with audio recordings of bats, which are well known for their frequent use of ultrasonic echolocation, and so these biologists can accrue massive amounts of high frequency audio data. However, as many methods of audio compression are designed to specialize in the more common range of frequencies, they are not able to sufficiently compress bat audio, and many bat biologists instead work without compressing their data at all. This paper investigates the desiderata of a data compression method in the context of bat biology, experimentally compares several modern data compression algorithms, and discusses their pros and cons in terms of their potential use across various relevant contexts. The paper concludes by suggesting the algorithm Monkey’s Audio for machines able to handle the higher resource demands it has. Otherwise, FLAC and WavPack yield similar size reduction rates at a significantly faster speed while being less resource intensive. Of note is the interesting result produced by the algorithm 7-ZIP PPMd Solid, which achieved consistently outstanding results within a single dataset, but its generalizability has yet to be determined.