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Fauna incrustante do complexo estuarino de Paranaguá, com ênfase em espécies introduzidas

Felippe, Camilla January 2016 (has links)
Orientador : Profª. Drª. Maria Angélica Haddad / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 03/03/2016 / Inclui referências : f. 53-61 / Área de concentração: Zoologia / Resumo: As comunidades incrustantes estuarinas estão sujeitas às variações físicoquímicas ao longo da extensão do estuário, sendo que a salinidade é o fator que mais afeta a distribuição dos organismos. Uma das principais ameaças aos ecossistemas estuarinos são as bioinvasões, causadas pelo transporte de espécies para locais fora de seus limites naturais de dispersão. A detecção e o controle de espécies invasoras estão conjugados a conhecimentos sobre a fauna local e à detecção precoce das espécies exóticas. Assim, os objetivos deste estudo foram: identificar as espécies da fauna incrustante dos grupos Porifera, Hydrozoa e Anthozoa (Cnidaria), Bryozoa, Entoprocta, Bivalvia (Mollusca), Balanomorpha (Crustacea, Cirripedia) e Ascidiacea (Tunicata); classificar as espécies em nativas, introduzidas e criptogênicas; averiguar se a riqueza e a composição da comunidade incrustante variam entre os diferentes setores de salinidade e tipos de substratos de modo particular para espécies nativas, introduzidas e criptogênicas. O estudo foi realizado no Complexo Estuarino de Paranaguá, dividido em três setores de acordo com a salinidade: mesohalino (0 a 15‰), polihalino (15 a 30‰), euhalino (acima de 30‰). Amostras de aproximadamente 100 cm2 foram raspadas em três pontos de substrato natural e três de substrato artificial em cada setor de salinidade, na região entremarés. Em cada ponto foram raspadas três amostras dentro de um delineamento amostral hierárquico. Em laboratório as espécies de animais incrustantes foram triadas, identificadas e classificadas em introduzidas, nativas e criptogênicas. Foram encontradas 111 morfoespécies, 85 foram identificadas a nível específico, destas, 52 foram classificadas como criptogênicas, 12 introduzidas e 21 nativas. Os táxons com maior riqueza foram Bryozoa e Cnidaria. Ascidiacea e Entoprocta não ocorreram no setor mesohalino. Os setores mais ricos e diversos foram o poli e euhalino, e a composição da comunidade destes setores também foi semelhante. O setor mesohalino, proporcionalmente, apresentou maior riqueza e abundância de espécies introduzidas. O presente estudo atesta que a salinidade não restringiu a distribuição das espécies introduzidas, visto que metade dessas espécies ocorreram em pelo menos dois setores de salinidade, reforçando a hipótese de que muitas espécies introduzidas são eurihalinas. Espécies nativas, criptogênicas e exóticas foram encontradas em abundância e proporções semelhantes em substrato natural e artificial. Este estudo conclui que a principal barreira para o estabelecimento de espécies introduzidas é a competição com as espécies já estabecidas nos locais de estudo. Ambientes perturbados, com comunidades menos diversas, com substratos artificiais limpos e regiões muitas espécies introduzidas e criptogênicas são encontradas, a exemplo do setor mesohalino, necessitam de monitoramento constante. Espécies criptogênicas, cosmopolitas e eurihalinas, que atingem alta abundância e que são facilmente transportáveis devem receber atenção especial. Palavras-chave: Estuários, comunidades incrustantes, bioinvasão, salinidade, Complexo Estuarino de Paranaguá. / Abstratc: Estuarine incrusting communities are subject to physical and chemical changes along the length of the estuary, and the salinity is the factor that most affects the distribution of organisms. One of the main threats to this ecosystem is the bioinvasion, caused by the transport of species to locations outside its natural limits of dispersion. The detection and control of invasive species are combined the knowledge of local fauna and the early detection of exotic species. The objective of this study was: to identify the species of incrusting fauna of Porifera, Hydrozoa and Anthozoa (Cnidaria), Bryozoa, Entoprocta, Bivalvia (Mollusca), Balanomorpha (Crustacea, Cirripedia) and Ascidiacea (Tunicata) groups; classify the species in native, introduced and cryptogenic; investigate whether the richness and composition of the incrusting community vary between different sectors of salinity and substrates types, particularly for native, introduced and cryptogenic species. The study occurred in Estuarine Complex of Paranaguá, which is divided into three sectors according to salinity: mesohaline (0-15‰), polyhaline (15-30‰), euhaline (over 30‰). Samples of approximately 100 cm2 were scraped in three points of natural substrate and three of artificial substrate in each salinity sector at the intertidal zone. At each point three samples were scraped, within a hierarchical sampling design. In laboratory the incrusting animal species were separated, identified and classified as introduced, native and cryptogenic. Were found 111 morphospecies, 85 were identified to species level, of these, 52 were classified as cryptogenic, 12 are introduced and 21 are native. The taxa with higher richness were Bryozoa and Cnidaria. Ascidiacea and Entoprocta not occurred in mesohaline sector. The richest and most diverse sectors were poly and euhalino, and the community composition of these sectors was also similar. The mesohaline sector proportionally showed greater richness and abundance of introduced species.This study attests that the salinity does not restricted the distribution of introduced species, since half of these species occurred in at least two salinity sectors, reinforcing the hypothesis that many introduced species are euryhaline. Native, critptogenic and exotic species were found in similar proportions and abundance in natural and artificial substrates. This study concludes that the main barrier to the establishment of introduced species is competition with species of study sites. Disturbed environments, with decrease in the community richness, with clean artificial substrates even as regions where are found many introduced and cryptogenic species, like the mesohaline sector, require constant monitoring. Cryptogenic, cosmopolitan and euryhaline species, which reach high abundance and are easily transportable should receive special attention. Keywords: Estuary, incrusting commnunity, bioinvasion, salinity, Estuarine Complexo of Paranaguá.
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Avaliação do crescimento, balanço energético e parâmetros fisiológicos do predador invasor Micropterus salmoides (Lacepède, 1802) submetido a diferentes temperaturas

Yamassaki, Gustavo Eidi January 2017 (has links)
Orientador : Profª. Drª. Viviane Prodocimo / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação. Defesa: Curitiba, 08/06/2017 / Inclui referências : f. 59-72 / Resumo: Alterações no padrão de temperaturas ambientais ocasionadas por mudanças climáticas podem influenciar a distribuição e abundância de espécies invasoras parcialmente devido aos seus efeitos sobre a fisiologia destes animais. Dentre as principais espécies de peixes invasoras piscívoras encontradas no Brasil destaca-se o Micropterus salmoides introduzido em 1922. Apesar de ter se passado quase um século da sua introdução, apenas recentemente começaram-se os estudos sobre seu processo de invasão em reservatórios subtropicais. O objetivo deste trabalho foi avaliar o crescimento, a alocação de energia consumida em forma de alimento e parâmetros fisiológicos em diferentes condições termais de juvenis de M. salmoides de uma população encontrada em um reservatório subtropical, no estado do Paraná, Brasil. Os juvenis de M. salmoides (peso entre 5 a 9 g) foram expostos por 28 dias as condições de temperatura de 15, 25, 30 e 33 ºC. A alimentação foi realizada a cada 48 horas com tilápias (Coptodon rendalli e Oreochromis niloticus) vivas. Os resultados obtidos denotam um menor índice de eficiência alimentar, uma menor taxa de crescimento específico e crescimento em comprimento em peixes aclimatados na temperatura de 15 ºC. Nas demais temperaturas de 25, 30 e 33 ºC o crescimento foi semelhante. O fator de condição de Fulton foi significativamente menor em 33 ºC demonstrando uma perda da capacidade de mobilização de energia nesta condição. O balanço energético de juvenis de M. salmoides no minímo crescimento foi em 15 ºC com CO (100 %) = FE(10,7)+M(75)+CR(14,3) e o maior em 33 ºC com CO (100 %) = FE(14,9)+M(29,8)+CR(56,3) (CO-alimento consumido; FE-fezes excretadas; M-metabolismo; CR-crescimento). O aumento de lactato plasmático observado em juvenis de M. salmoides em 15 ºC sugere a ativação do metabolismo anaeróbio. Os maiores níveis de glicose sanguínea observados em peixes em 30 e 33 ºC demonstram uma maior necessidade de energia para sustentar a demanda energética nas células com o aumento da temperatura. Não foram observadas diferenças significativas tanto na atividade da enzima anidrase carbônica quanto no teor hídrico do músculo branco. Os juvenis de M. salmoides utilizados neste estudo demonstraram ser suceptiveis ao estresse termal em temperatura de 15 ºC, assim, em condições naturais do reservatório do Passaúna, o inverno (menores temperaturas registradas) pode ser limitante para os juvenis de M. salmoides, período no qual provavelmente seja crucial para a sua sobrevivência. Por outro lado, em temperaturas mais altas o black bass demonstrou um alto crescimento em condições de temperatura 25, 30 e 33 ºC. Sugere-se que a temperatura de 25 ºC registrada no verão fornece condições ideais para que os juvenis se alimentem e cresçam rapidamente. Além disso, estes resultados indicam que em caso de aquecimento da temperatura da água no reservatório (natural ou antrópica), o black bass ainda continuará a exibir altas taxas de crescimento, o que pode desencadear em desvantagens competitivas para as outras espécies nativas intensificando o impacto da espécie na cadeia trófica local. Palavras-chave: Espécie invasora, juvenis, estresse termal / Abstract: Changes in envirinmental temperature may influence invasive species' abundance and distribution due to its effects on the physiology of these animals. In the group of invasive species of fishes found in Brazil there is the Micropterus salmoides introduced in 1922, and although almost a century has passed, studies on its invasion process in subtropical reservoirs recently started. The aim of this study was to assess the growth, energy allocation consumed as food and physiological parameters of juveniles of M. salmoides in different termal conditions from a population located in a subtropical reservoir in the state of Paraná, Brazil. The juveniles of M. salmoides (weight between 5 to 9 g) were exposed for 28 days at the temperature conditions of 15, 25, 30, and 33 °C. Feeding was offered every 48 hours with live tilapia (Coptodon rendalli and Oreochromis niloticus). The results obtained indicate a lower feed efficiency index, a lower specific growth rate and growth in length in acclimated fish at a temperature of 15 ºC. At the temperatures of 25, 30 and 33 ºC the growth was similar. The Fulton's Condition Factor (K) was significantly lower at 33 ºC demonstrating a loss of capacity of energy mobilization in this condition. The energy budget of juveniles of M. salmoides at the lowest growth was at 15 ºC showing CO (100 %) = FE (10,7) + M (75) + CR (14,3) and the highest at 33ºC showing CO (100 % ) = FE (14.9) + M (29.8) + PS (56.3) (CO-food intake, FE-excreted faeces, M-metabolism, CR-growth). The highest plasma lactate observed in juveniles of M. salmoides at 15ºC suggests activation of anaerobic metabolism. The highest blood glucose levels observed in fish at 30 and 33 ºC demonstrate a greater need of energy to sustain the energy demand in the cells with increasing temperature. No significant differences were observed in the activity of the carbonic anhydrase enzyme and neither in the water content of the white muscle. The juveniles of M. salmoides used in this study have shown to be susceptible to thermal stress at a temperature of 15 ºC, thus, under natural conditions of the Passaúna reservoir, the winter may be limiting for juveniles of M. salmoides. On the other hand, in higher temperatures the black bass demonstrated a higher growth in conditions of temperature 25, 30 and 33 ºC. Thus, the summer temperature of 25 °C may provides ideal conditions for juveniles to feed and grow rapidly to bear the extreme conditions during the winter. In addition, these results indicate that in case of heating of the water temperature in the reservoir (natural or anthropic), juvenile of black bass will still continue to exhibit high growth rates, which can lead to competitive disadvantages for the other native species, intensifying the impact of the species in the local trophic chain. Key-words: Invasive species, juvenile, thermal stress
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Fenologia e variabilidade genética de Ligustrum lucidum W.T.Aiton (Oleaceae) em fragmentos de Floresta Ombrófila Mista

Nogueira, Guilherme de Souza January 2017 (has links)
Orientadora : Profª. Drª. Maria Regina Torres Boeger / Coorientadora : Profª. Drª. Valéria Cunha Muschner / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação. Defesa: Curitiba, 30/08/2017 / Inclui referências ao final de cada capítulo / Resumo: As plantas invasoras são um importante componente das mudanças ambientais globais, pois causam grandes modificações nos ecossistemas. Ligustrum lucidum (Oleaceae) é uma espécie arbórea nativa da China e invasora em vários países. A espécie apresenta grande potencial invasor na Floresta Ombrófila Mista (FOM), uma das principais formações vegetais do sul do Brasil. A fenologia está relacionada a características importantes envolvendo a competição por recursos e também pode influenciar a variabilidade genética de uma população. Sendo assim, este estudo teve como objetivo investigar o papel da fenologia no processo de invasão de L. lucidum na FOM, discutindo sua importância dentro de um contexto ecológico e evolutivo. O Capítulo 1 descreveu a fenologia das populações de L. lucidum e relacionou-a com as variáveis ambientais locais. As fenofases de L. lucidum relacionadas ao florescimento ocorreram nos meses quentes e às relacionadas à frutificação nos meses frios. A ocorrência de frutos maduros de L. lucidum foi diferente do encontrado para as nativas e representa uma vantagem competitiva para a espécie. Portanto, a fenologia de L. lucidum apresenta um papel importante no processo de invasão da espécie na FOM, pois proporciona a utilização de recursos, como os dispersores de sementes, que não são utilizados pelas espécies nativas, ainda que temporalmente. O comprimento do dia e a temperatura foram as variáveis que mais influenciaram a fenologia da espécie. Isso indica que L. lucidum é eficiente na aquisição e na alocação de recursos, o que também auxilia o seu estabelecimento no ambiente invadido. O Capítulo 2 investigou a variabilidade genética de L. lucidum na região de Curitiba e avaliou o possível papel que a ocorrência das fenofases reprodutivas pode ter na estruturação genética das populações de L. lucidum. A baixa variabilidade genética de L. lucidum não compromete seu potencial invasor. Provavelmente isso é resultado da pré-adaptação da espécie às condições climáticas da FOM, uma vez que as condições ambientais nas áreas nativa e introduzida são semelhantes. As populações de L. lucidum encontram-se estruturadas temporalmente indicando a ocorrência de fluxo gênico e de eventos de dispersão no ambiente invadido. O fluxo gênico entre as populações de L. lucidum é reflexo da sincronia das fenofases reprodutivas e, no futuro, pode refletir na redução da estruturação genética espacial encontrada nos indivíduos adultos das populações. Palavras - chave: alfeneiro, estruturação genética, fenofases, fluxo gênico, plantas invasoras / Abstract:Invasive plants are an important component of global environmental changes, because they cause considerable modifications in the ecosystems. Ligustrum lucidum (Oleaceae) is a woody species native from China and invasive in several countries. The species shows a high invasive potential in the Araucaria Forest (AF), one of the main forest types in Southern Brazil. Phenology is related to important characteristics involving the resource competition and may also influence the genetic variability of a population. Therefore, this study had as objective to investigate the role of phenology in the L. lucidum invasion process at AF, discussing its importance in an ecologic and evolutive context. Chapter 1 described the phenology of L. lucidum populations and related it to the climate variables. The phenophases of L. lucidum related to the flowering occurred in the hottest months and the ones related to the fruiting in the coldest months. The occurrence of ripe fruits of L. lucidum was different from the one found in the native species and represents a competitive advantage to the invasive. Thus, L. lucidum phenology has an important role in the species invasion process at AF, because it provides the resource use, like the seed dispersers, that are not being used by the native species, even if temporarily. The day length and the temperature were the variables that most influenced on L. lucidum phenology. It points L. lucidum is efficient in resource acquisition and allocation, which also helps its establishment in the invaded area. Chapter 2 investigated the genetic variability of L. lucidum in the region of Curitiba and evaluated the potential role that the occurrence of reproductive phenophases might have in the genetic structure of L. lucidum populations. The low genetic variability of L. lucidum does not compromise its invasive potential. Probably, this results from the species pre-adaptation to the AF climatic conditions, since the environmental conditions in the native and invaded area are alike. Ligustrum lucidum populations are temporarily structured indicating the occurrence of gene flow and dispersion events in the invaded area. The gene flow among L. lucidum populations is a consequence of reproductive phenophases synchrony and, in the future, might cause the decrease of spatial genetic structure found in the adult individuals of populations. Keywords: glossy privet, genetic structure, phenophases, gene flow, invasive plants
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As interferências das pisciculturas em tanques-rede a assembléia de peixe em grandes reservatórios do rio paranapanema (Bacia doAlto Paraná)

Zanatta, Augusto Seawright [UNESP] 24 February 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T19:46:39Z : No. of bitstreams: 1 zanatta_as_dr_botib.pdf: 464014 bytes, checksum: 38e4cd00fe40771ac221024213068688 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Atualmente, a filosofia da sustentabilidade ambiental que foca a preocupação com o uso racional dos recursos hídricos e pesqueiros, em particular a aqüicultura, está aumentando em nossa sociedade. Portanto, é preciso empregar esforços compatibilizando processos antagônicos da produção de alimento versus preservação ambiental. Neste contexto, o presente trabalho objetivou avaliar as possíveis interferências ambientais (limnológicas e ictiológicas) de um empreendimento de tilapicultura em tanques-rede no reservatório de Chavantes (Médio Rio Paranapanema, SP/PR). Para tanto, foram efetuadas 12 coletas mensais (fev/07-jan/08) de variáveis físico químicas da água e da assembléia de peixes em um trecho vicinal ao sistema de tilapicultura (TR) e outro trecho controle (CR). Em relação às variáveis físico químicas da água apenas a temperatura e o oxigênio dissolvido apresentaram diferenças significativas, sendo a primeira mais elevada no trecho TR e a segunda no trecho CR. Para a assembléia de peixes. Independente do trecho amostrado foram capturados 1274 indivíduos (19 espécies), sendo que cinco espécies foram exclusivas do trecho CR. Dentre os atributos ecológicos tanto a riqueza quanto a diversidade de espécies foram significativamente mais elevadas no trecho CR, assim como a dominância foi para o trecho TR. Os resultados diagnosticados para a dominância podem ser atribuídos devido à elevada representatividade de Pimelodus maculatus no trecho TR, espécie oportunista e onívora, o que favorece a sua adaptação à esse ambiente. Estes dados permitem inferir que o sistema de tilapicultura em tanques-rede está causando consecutivos distúrbios ambientais, os quais estão sendo responsáveis por interferir na integridade ambiental resultando em uma reestruturação significativa da assembléia de peixes na área sob influência da tilapicultura no reservatório de Chavantes / Nowadays the environmental care is focusing on the sustainable use thru the rational occupation of the hydric and fishing sources, particularly aquaculture. For this to occur is necessary a deep correlation between the production system and preservation efforts. The present paper focus on the evaluation of the environmental interferences (limnologyc and ictiologyc) caused by Tilapia cage fish farm activities in the Chavantes reservoir (Middle Paranapanema River SP/PR). This work was based on 12 monthly samplings, occurred between February/2007 to January/2008 focusing on the water physicochemical variation and fish assemblage analysis in two areas: influenced (neighborhood) by cage fish farm (TR) and none influenced area (CR). The water physicochemical analyses shone significant alterations only in the temperature (higher in TR) and dissolved oxygen (higher in CR). A total of 1274 specimens were collected and grouped in 19 species with five species exclusive to stretch CR. The ecological analyses of richness and diversity were significantly higher in the CR zone as the dominance index was higher for TR. The dominance index was considered influenced by the Pimelodus maculatus high representativety in the TR area, this species is considered onivore and opportunist what explain its numerical abundance. These data concludes that the Tilapia cage fish farming is causing successive harm to the natural systems, provoking alterations in the fishing assemblages in the Chavantes reservoir
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Árvores exóticas invasoras em unidades de conservação de Curitiba, Paraná : subsídios ao manejo e controle

Mielke, Erica Costa January 2012 (has links)
Orientadora : Profª Drª Raquel R.B. Negrelle / Coorientadora : Profa. Dra. Francine L. Cuquel / Tese (Doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Defesa: Curitiba, 29/02/2012 / Bibliografia: fls. 96-100 / Área de concentração: Produção vegetal / Resumo: A flora das Unidades de Conservação muitas vezes representa os últimos remanescentes da vegetação nativa de uma região. No entanto, quando em cidades, estes espaços sofrem os efeitos dos processos de urbanização tornando-os suscetíveis à contaminação biológica por espécies exóticas invasoras. Espécie invasora é aquela exótica em ecossistema natural ou antrópico, que desenvolve altas taxas de crescimento, reprodução e dispersão e, sem assistência humana ameaçando habitats naturais ou semi-naturais fora do seu território de origem e causando impactos econômicos, sociais e ambientais. As espécies exóticas invasoras são consideradas atualmente a segunda maior ameaça mundial à biodiversidade, perdendo apenas para a destruição de habitats pela exploração humana direta. Apesar disto, estudos sobre espécies exóticas invasoras em Unidades de Conservação são parcos e recentes. Os diferentes capítulos que compõem este documento apresentam resultados de pesquisa que visaram subsidiar o controle e manejo destas espécies em áreas de mata nativa. Fazem parte desta pesquisa o diagnóstico de árvores exóticas invasoras (AEI) em Unidades de Conservação de Curitiba, detalhando aquela onde se constatou contaminação biológica relevante e uma espécie freqüente, Pittosporum undulatum. Neste caso estudou-se os seus aspectos botânicos e ecológicos, estruturais e dinâmica populacional, bem como condições germinativas. Concluindo-se, este documento apresenta propostas e recomendações que visam o melhor entendimento sobre a ecologia e sobre métodos naturais e eficazes de controle e manejo do Pittosporum undulatum.V / Abstract: The flora of protected areas often represents the last remnant native vegetation in a region. When in cities, these areas suffer from the effects of urbanization making them susceptible to biological contamination by invasive alien species. Invasive alien species can be found in natural or man-made ecosystems, they exhibit high rates of growth, reproduction and dispersal without any human assistance, threatening natural and semi-natural habitats outside their territory of origin, causing economic, social and environmental impacts. Invasive alien species are currently considered the second greatest global threat to biodiversity, second only to habitat destruction by direct human exploitation. Despite this, studies on invasive alien species in protected areas are scarce and quite recent. The different chapters of this document present research results aimed at helping to control and manage these species in areas of native forest. This study includes the diagnosis of invasive alien trees (IAT) in Conservation Units of Curitiba, detailing those where significant biological contamination was found and the frequently found species, Pittosporum undulatum. In this case we studied their botanical, ecological and structural aspects in addition to population dynamics, and germ conditions. In conclusion, this paper has put forward proposals and recommendations aimed at promoting a better understanding of the ecology and effective natural methods for the control and management of Pittosporum undulatum.
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Caracterização fenotípica, sequenciamento e anotação do genoma total de uma cepa de Escherichia coli isolada de uma paciente com Doença de Crohn

Santos, Ana Carolina da Silva [UNESP] 11 September 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-09-27T13:40:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-11. Added 1 bitstream(s) on 2016-09-27T13:45:15Z : No. of bitstreams: 1 000868600.pdf: 2036190 bytes, checksum: 3872e6084fbe526a55b084da83826c3a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A Doença de Crohn (DC) é uma variante das doenças inflamatórias intestinais que não tem uma causa definida, porém há o envolvimento de fatores ambientais e genéticos, entre eles a microbiota. Portadores da DC apresentam desequilíbrio na composição de espécies da microbiota intestinal, incluindo o aumento da Escherichia coli. A E. coli é uma bactéria versátil em sua relação com o hospedeiro, isto é, inclui cepas comensais e várias categorias patogênicas. Estas compreendem dois grupos: linhagens causadoras de infecções intestinais e linhagens causadoras de infecção extraintestinais. As E. coli isoladas de portadores da DC em geral pertencem ao segundo grupo, e uma das principais características apresentadas por estas bactérias é a interação com células epiteliais (aderência e invasão). Estudos feitos na década de 90 levaram a identificação de um novo patótipo de E. coli, capaz de aderir e invadir células epiteliais e ainda invadir e se replicar dentro de macrófagos, produzindo granulomas, característica histopatológica da DC. Este novo patótipo, chamado de Adherent and Invasive E. coli (AIEC), têm sido usada como referência na caracterização de E. coli isoladas a partir de portadores da DC. Neste trabalho, foi feito o estudo de caracterização fenotípica e genética de E. coli isoladas a partir de 9 portadores da DC e 5 pacientes controles, as quais foram submetidas a testes de adesão e invasão celular em células epiteliais, teste de formação de biofilme e identificação de filogrupos da coleção de referência de E. coli (EcoR). Dentre o conjunto de amostras bacterianas estudado, foi encontrada uma amostra isolada de uma paciente com DC que apresentou invasibilidade superior às demais, e foi intensivamente estudada, tendo-se verificado que ela apresenta um perfil de virulência distinto de AIEC. O genoma da amostra em questão foi sequenciado e anotado. Os resultados da caracterização... / FAPESP: 13/04475-3
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Distribuição Espacial e Variação Temporal do Bivalve Exótico Mytilopsis leucophaeta (Conrad, 1831) em duas áreas no Rio Capibaribe PE

Maria Rodrigues de Freitas, Glória 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:07:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3033_1.pdf: 1840371 bytes, checksum: e2cb7a460d91193f697dc5223cb4df9e (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Este estudo analisou a distribuição e estrutura populacional de Mytilopsis leucophaeta após 4 anos da sua introdução no estuário do Rio Capibaribe. A espécie ocorre ao longo de todo o estuário, sendo a espécie com maior amplitude de distribuição no mesmo. Ela forma grandes agregados de indivíduos na região intermediária do estuário, com salinidade mediana entre 25 e 30%o, sendo as temperaturas máximas e mínimas, registradas no estuário de 31,2 e 26oC, respectivamente. Este bivalve apresentou suas maiores densidades no primeiro ano de sua introdução,diminuindo nos outros anos, e voltando a aumentar em 2008. Ele ocorreu em grandes densidades no mediolitoral inferior, junto com Mytella charruana. Na região mais interna do estuário ocorreu apenas na estação seca, quando foram registradas as maiores densidades para a espécie. O comprimento dos indivíduos variou de 1,1 mm a 38,02 mm, com as classes de comprimento entre 1,5 e 30,5 mm registradas ao longo de todo o ano. A fauna incrustante do mediolitoral inferior foi diversa, com a riqueza de espécies sendo significativamente maior na região inferior do estuário. Foi observado o recrutamento de M. leucophaeta em todos os meses, com exceção de julho 2007, com maior intensidade no período seco, sendo que Cirripedia incrustou em maior densidade no período chuvoso. O período chuvoso parece afetar a sobrevivência e recrutamento de M. leucophaeta. Esta espécie está bem estabelecida no estuário do Capibaribe, dominando o substrato consolidado na região intermediaria do estuário, com recrutamento contínuo mas, mais intenso no verão, quando foram registradas as maiores densidades. M. leucophaeta deslocou a população de M. charruana em alguns pontos do estuário
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A presença de pinus spp. torna o ambiente mais susceptível à invasão? /

Chiari, Giovana Letícia. January 2018 (has links)
Orientador: Alessandra Tomaselli Fidelis / Coorientador: Lara Souza / Banca: Davi Rodrigo Rossatto / Banca: Rodolfo Cesar Real de abreu / Resumo: Espécies invasoras são problemáticas em grande parte dos países do mundo. Elas possuem a capacidade de alterar o ambiente, de forma a modificar a disponibilidade de recursos de uma comunidade, o que ameaça a biodiversidade dessa área. O processo de invasão biológica é influenciado pela invasividade (atributos da espécie invasora) e pela invasibilidade (atributos do ambiente). Dessa forma, a susceptibilidade do ambiente à invasão é um importante fator a ser conhecido. Plantas invasoras podem deixar um legado no ambiente mesmo após a sua remoção, alterando características do solo. Somando esse legado a relação entre espécies invasoras (invasional meltdown), o presente estudo teve como objetivos descobrir se o legado de invasão deixado por Pinus spp. em áreas de Cerrado interferem na germinação, crescimento e competição de espécies de gramíneas invasoras e nativas. Foram utilizadas quatro áreas com diferentes históricos de remoção de Pinus, todas inseridas na Estação Ecológica e Experimental de Itirapina, sendo elas: área de Cerrado, onde nunca houve plantio de Pinus spp., área onde o plantio de Pinus spp. foi removido em 1998, área onde o plantio de Pinus spp. foi removido em 2010 e área onde ainda existe o plantio de Pinus spp. No primeiro capítulo, são apresentados resultados de experimentos de germinação de quatro espécies de gramíneas: Urochloa brizantha, Melinis minutiflora (invasoras), Aristida riparia e Aristida megapotamica (nativas) e experimentos de crescimento com A.... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Invasive species are problematic in most countries of the world. They have the ability to change the environment in order to modify the availability of a community's resources, which threatens the biodiversity of invaded areas. The biological invasion proc ess is influenced by invasiveness (invasive species attributes) and by invasibility (environmental attributes). In this way, the susceptibility of the environment to the invasion is an important factor to be known. Invasive plants can leave a legacy in the environment even after their removal, altering soil characteristics. Adding this legacy to invasive species (invasion meltdown), the present study aimed to find out if the legacy of invasion left by Pinus spp. in Cerrado areas interfere with the germination, growth and competition of invasive and native grass species. Four areas with different Pinus removal histories were used, all of them inserted in the Ecological and Experimental Station of Itirapina, being: Cerrado ar ea, where there was never plantation of Pinus spp., area where the planting of Pinus spp. was removed in 1998, an area where Pinus spp. was removed in 2010 and area where there still have a monoculture of Pinus spp. In the first chapter, results of germina tion experiments of four grass species: Urochloa brizantha, Melinis minutiflora (invasive), Aristida riparia and Aristida megapotamica (native), and growth experiments with A. megapotamica and M. minutiflora on collected soils in the legacy areas of P... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Análises isoenzimáticas, moleculares e ultraestruturais em camarões dulcícolas do gênero Macrobrachium /

Lopes, Alessandro Garcia. January 2014 (has links)
Orientador: Carlos Roberto Ceron / Banca: Ana Maria Bonetti / Banca: Lilian Madi Ravazzi / Resumo: Os camarões do gênero Macrobrachium (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae), encontrados em ambientes de água doce, são amplamente distribuídos pelas regiões tropicais e subtropicais do mundo, inclusive em locais próximos ao litoral. Algumas espécies desse gênero, como por exemplo M. rosenbergii, apresentam valor econômico, sendo cultivadas e comercializadas como alimento. Na região Noroeste do Estado de São Paulo, são encontradas as espécies classificadas como M. amazonicum e M. jelskii, as quais são espécies exóticas de camarões dulcícolas recentemente introduzidas e amplamente disseminadas em reservatórios de usinas hidrelétricas desta região. Essas espécies possuem hábitos crípticos e noturnos, sendo predadores de larvas de peixes e também presas de peixes adultos e outros organismos. M. amazonicum e M. jelskii apresentam grande similaridade interespecífica em termos de caracteres morfológicos, o que pode dificultar a classificação taxonômica desses organismos. O objetivo deste estudo foi conduzir análises morfométricas, ultraestruturais, isoenzimáticas e moleculares em M. amazonicum e M. jelskii, na tentativa de obter-se novos dados para distinguí-los. Os camarões foram coletados das populações dos reservatórios de Sales/SP e Mendonça/SP. As análises morfométricas englobaram as medidas do télson, dos espinhos caudais internos e do rostro. As análises por microscopia eletrônica de varredura foram realizadas nas estruturas do télson, nos espinhos caudais internos e no apêndice masculino. As análises isoenzimáticas, realizadas por eletroforese em gel de poliacrilamida, abrangeram as enzimas álcool desidrogenase, octanol desidrogenase, glicose-6-fosfato desidrogenase, lactato desidrogenase, amilase e esterases do hepatopâncreas e tecido muscular. Análises moleculares envolveram a amplificação do espaçador intergênico interno ITS-1 (Internal Transcribed Spacer 1) do rDNA. Os fragmentos ... / Abstract: Prawns of the genus Macrobrachium (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae) can be found in freshwater environments, widely distributed throughout tropical and subtropical regions of the world, including regions near the coast. Some species of this genus, for example Macrobrachium rosenbergii, present economic value, which are reared and traded as food. In the northwest region of São Paulo State two exotic freshwater prawn species are found, classified as M. amazonicum and M. jelskii, which were recently introduced to the aquatic reservoirs of hydroelectric power plants and then, disseminated throughout reservoirs in this region of the State. These species have cryptic and overnight habits, being predators of fish larvae and also being prey to adult fishes and other organisms. M. amazonicum and M. jelskii present high rates of interspecific similarity in terms of morphological characters, which are generally used to distinguish them, what may induce mistakes in taxonomic identification. The objective of this study was to conduct morphometric, ultrastructural, isoenzymatic and molecular analyses of M. amazonicum and M. jelskii, in order to obtain more data about their differentiation. The prawns were collected in reservoirs of Sales/SP and Mendonça/SP. Morphometric analyses were performed involving the structures of telsons, internal caudal spines and rostrums. Scanning electron microscopy analyses were performed on structures of telsons, internal caudal spines and male appendices. Isoenzymatic analyses by polyacrylamide gel electrophoresis included the enzymes alcohol dehydrogenase, octanol dehydrogenase, glucose-6-phophate dehydrogenase, lactate dehydrogenase, amylase and esterases of hepatopancreas and muscle tissue. Molecular analyses were performed by amplification and sequencing of ITS-1(Internal Transcribed Spacer 1) intergenic spacer from rDNA. The amplificated fragments were used for analyzing length polymorphism restriction fragments ... / Mestre
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Investigação do padrão de distribuição do briozoário cosmopolita Zoobotryon verticillatum (Ctenostomata, Vesiculariidae), através de dados moleculares / Investigation of ditribution pattern of cosmopolitan bryozoan Zoobotryon verticillatum (Ctenostomata, Vesiculariidae) through molecular data

Nascimento, Karine Bianca 28 May 2015 (has links)
Zoobotryon verticillatum (delle Chiaje, 1822) é um briozoário cosmopolita amplamente distribuído em regiões tropicais e temperadas em todos os oceanos. Por possuir meios de distribuição natural restritos, é possível supor que o táxon se trate de um complexo de espécies crípticas ou de uma espécie vastamente introduzida por ação antrópica. Para elucidar essa questão, foram realizadas análises populacionais e filogenéticas utilizando-se dois genes mitocôndrias, citocromo c oxidase subunidade 1 região 3\' (COI-3P) e subunidade ribossomal RNA 16S (16S). As análises filogenéticas suportaram o monofiletismo de Z. verticillatum e, juntamente com as análises populacionais, indicam que é uma única espécie distribuída mundialmente. A falta de uma estrutura geográfica evidente nas redes haplotípicas, a ausência majoritária de relacionamentos dicotômicos e clados altamente suportados (pp >= 5%) nas árvores filogenéticas, a falta de resultados significativos na maioria dos teste D e Fs realizados, a baixa diversidade genética em nível populacional e a falta de diferenciação genética entre a maioria das populações comparadas são compatíveis com um processo distribuição antrópico para Z. verticillatum. No entanto, com base nos resultados obtidos durante esta pesquisa, não é possível inferir um possível centro de dispersão ou local de origem para a espécie. / Zoobotryon verticillatum (delle Chiaje, 1822) is a cosmopolitan bryozoan largely distributed in tropical and temperate waters of all oceans. With limited natural dispersal capabilities, it is reasonable to suppose that the taxon is a complex of cryptic species or a widespread species due to anthropogenic activity. In order to elucidate this question, analyses of two mitochondrial genes, cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) and ribosomal RNA subunit (16S) were conducted. Phylogenetic data supported the monophyletism of Z. verticillatum and, together with the population analysis, indicated that it is one species with worldwide distribution. The absence of geographical structure in the haplotype networks, the majority absence of dichotomous relationships, and highly supported clades (pp >= 5%) in phylogenetic trees, the lack of significance in the D test and Fs statistics, the low genetic diversity at the population level and the lack of genetic differentiation between most of the population comparison are consistent with anthropogenic introduction process for Z. verticillatum. However, based on the results obtained during this study, it is not yet possible to infer the center of dispersion for the species.

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