SILVA, M. C. L. Identificação e caracterização de espécies de Meloidogyne em áreas agrícolas e dispersão de M. enterolobii em pomares de goiabeiras no estado do Ceará. 2014. 107 F. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. / Submitted by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2015-06-11T21:07:41Z No. of bitstreams: 1 2013_tese_mclsilva.pdf: 3677775 bytes, checksum: dc6eca46c746a2f798aa9281e87b5b1a (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2015-06-11T21:08:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_tese_mclsilva.pdf: 3677775 bytes, checksum: dc6eca46c746a2f798aa9281e87b5b1a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-11T21:08:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_tese_mclsilva.pdf: 3677775 bytes, checksum: dc6eca46c746a2f798aa9281e87b5b1a (MD5) Previous issue date: 2014 / Os nematoides pertencentes ao gênero Meloidogyne estão entre os maiores agentes causadores de danos em plantas, pois possuem ampla distribuição geográfica e são de difícil controle. Considerando que as informações atualizadas sobre as espécies de Meloidogyne afetando plantas em áreas de produção agrícola ainda são escassas no Estado do Ceará, conduziu-se a presente pesquisa com os seguintes objetivos: identificar espécies e raças de Meloidogyne que ocorrem nas diferentes microrregiões do Estado do Ceará e identificar hospedeiras de M. enterolobii em pomares de goiabeira. Cento e doze amostras de plantas infestadas foram coletadas em 29 municípios em áreas produtoras do estado pertencentes a 13 diferentes microrregiões. Verificou-se que das 112 populações obtidas nas coletas, 46 apresentaram fenótipos típicos de M. enterolobii, 27 de M. incognita, 15 de M. javanica, cinco de M. arenaria, uma de M. hapla. Seis populações apresentaram fenótipos de esterase distintos daqueles conhecidos para as espécies de Meloidogyne já relatadas no Brasil. Na determinação das raças fisiológicas, foram encontradas as raças 2 e 3 para M. incognita, a raça 1 para M. arenaria e a raça 2 para M. javanica. As seguintes associações encontradas neste trabalho não foram ainda mencionadas podendo ser os primeiros relatos no estado: M. incognita em acelga (Beta vulgaris var. cicla L.), beterraba (B. vulgaris L.), pimenta de cheiro (Capsicum chinensi Jacq.) e umbu-cajá (Spondia tuberosa x S. mombim); M. javanica em botão de ouro (Siegesbeckia orientalis L.), cajá (S. mombim L.), papaconha (Hybanthus ipecacuanha (L.) Oken.) e quiabo (Abelmoschus esculentus L.); M. arenaria em maria-sem-vergonha (Impatiens walleriana L.), noni (Morinda citrifolia L.) e pingo de ouro (Duranta repens L. var. aurea); M. hapla em roseira (Rosa sp.). A espécie M. enterolobii foi identificada em todas as amostras de raízes de goiabeira coletadas em pomares distribuídos em 13 municípios do estado. Além da goiabaeira, M. enterolobii foi constatada também em acerola (Malpighia glabra L.), batata doce (Ipomoea batatas (L.) Lam), berinjela (Solanum melongena L.), cactos (Cactus sp.), falsa serralha (Emilia fosbergii Nicolson), Hypericum sp, ingá (Inga edulis Mart.), mamão (Carica papaya L.), manjericão (Ocimum basilicum L.), maria-pretinha (Solanum americanum Mill), jurubeba (S. paniculatum L.), palma (Gladiolus sp.) e pimenta tabasco (C. frutescens L.), associações estas relatadas pela primeira vez no Estado do Ceará. A espécie M. enterolboii estava presente em 52% dos municípios e em 77% das microrregiões visitadas enquanto que M. incognita e M. javanica foram constatadas em 35% e 31% dos municípios, respectivamente, ambas em 46% das microrregiões visitadas. Este estudo vem contribuir na atualização das informações sobre a ocorrência de espécies de Meloidogyne nas principais regiões produtoras do Estado do Ceará. / The nematodes from the genus Meloidogyne are the most important causal agents of plant damages considering that they have a large geographical distribution and they are difficult to be controlled. Considering that the actual information about species from the genus Meloidogyne infecting plants in agriculture areas are still short in the State of Ceará, the present research was developed with the following objectives: identify Meloidogyne species and races which occur in the different micro-regions from the State of Ceará and identify the natural hosts for M. enterolobii in guava (Pisidium guajava) orchards. A hundred and twelve plants with gall symptoms in the roots were collected from producing areas of 29 counties including 13 micro-regions from the State of Ceará. It was observed that 112 nematode populations collected from infected plants, 46 presented phenotype typical of M. enterolobii, 27 of M. incognita, 15 of M. javanica, five of M. arenaria and one of M. hapla. Six nematode populations presented esterase phenotype distinct from those known for the Meloidogyne species already described in Brazil. In the physiologic race determination it was found races 2 and 3 of M. incognita, and race 1 of M. arenaria and a race 2 of M. javanica. The following nematode associations found in the present paper were not yet mentioned which could demonstrate that they could be the first report in the State: M. incognita in Beta vulgaris var. cicla L., B. vulgaris L., Capsicum chinensi Jacq. and Spondia tuberosa x S. mombim; M. javanica in Sieges beckiaorientalis L., S. mombim L., Hybanthus ipecacuanha (L.) Oken. and Abelmoschus esculentus L.; M. arenaria in Impatiens walleriana L., Morinda citrifolia L. and Duranta repens L. var. aurea; and M. hapla in Rosa sp. Meloidogyne enterolobii was identified in all guava root samples collected in the orchards distributed in 13 counties from the State. Besides guava, M. enterolobii was also detected in Malpighia glabra L., Ipomoea batatas (L.) Lam, Solanummelongena L., Cactus sp., Emilia fosbergii Nicolson, Hypericum sp., Inga edulis Mart., Carica papaya L., Ocimum basilicum L., Solanum americanum Mill, S. paniculatum L., Gladiolus sp. and C. frutescens L. The present research is the first report about those plant nematode associations in the State of Ceará. The specie M. enterolboii was present in 52% of the counties and in 77% of the micro-regions visited, while M. incognita and M. javanica were detected only in 35% and 31% of the visited counties, respectively, and in 46% of the micro-region visited. The present research will contribute to update the scientific information about the occurrence of Meloidogyne species in the main agriculture producing regions from the State of Ceará.

CAVALCANTE, Ítalo José Mesquita. Descriminação das isoenzimas das adenosina desaminase (ADA) em fluidos corporais humanos. 2010. 125 f. Dissertação (Mestrado em Farmacologia) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2010. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-04-09T13:02:59Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_ijmcavalcante.pdf: 2272178 bytes, checksum: 1a0106a00b7dfd24fb12db6c32ab973e (MD5) / Approved for entry into archive by Eliene Nascimento(elienegvn@hotmail.com) on 2012-04-09T16:04:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_ijmcavalcante.pdf: 2272178 bytes, checksum: 1a0106a00b7dfd24fb12db6c32ab973e (MD5) / Made available in DSpace on 2012-04-09T16:04:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_ijmcavalcante.pdf: 2272178 bytes, checksum: 1a0106a00b7dfd24fb12db6c32ab973e (MD5) Previous issue date: 2010 / Adenosine deaminase (ADA – E.C.3.5.4.4.) is a fundamental enzyme in the catabolism of the purines. It catalyzes the deamination of adenosine or 2’deoxy-adenosine producing ammonium and inosine or 2’-deoxyinosine, respectively. Its activity is expressed by two isoenzymes presented in three isoforms. ADA1 (36 kDa) and ADA1 bound to CD26 (280kDa) are widely distributed in the body tissues. Their action is particularly important because high levels of 2’deoxy-adenosine are toxic for the immune system cells. ADA2 (100kDa) is normally found in serum and is synthesized only in monocyte-macrophage system. The biological importance of ADA2 is not yet fully clear, especially for its kinetics characteristics. The objective of the present work was to discriminate the isoenzymes of human adenosine deaminase using agarose electrophoresis and by mathematical model proposed by Vale and Almeida (1998). In addition, we performed a study of the profile of ADA tests in State of Ceara (Brazil). Samples of of ascites, pleural and pericardial effusion were submitted to electrophoresis in 1% agarose at 80V for 7 hours. The gel was sliced and each slice was incubated in adenosine (22 or 0,55mM) for 20 hours to detect the ammonium released by enzymatic reaction. The results found from electrophoresis were compatible with the model proposed by Vale and Almeida (1998). The pleural fluid is the most frequently requested for the determination of ADA, followed by ascitic fluid, cerebrospinal fluid, pericardial fluid and serum. We observed that the value of enzymatic activity is influenced by corporal fluid type where the enzyme is localized. These data can be associated with the corporal barrier, like brain barrier. We concluded that the proposed mathematical model could be used in clinical laboratories to discriminate ADA isoenzymes to improve the diagnostic method. / A adenosina desaminase (ADA – E.C.3.5.4.4.) é uma enzima fundamental no catabolismo das purinas. Ela catalisa a desaminação da adenosina ou 2’deoxi-adenosina produzindo amônia e inosina ou 2’-deoxi-inosina, respectivamente. Sua atividade é expressa por 2 isoenzimas presentes em 3 isoformas. A ADA1 (36kDa) ou ADA1 ligada ao CD26 (280kDa) são amplamente distribuídas nos tecidos. Sua ação é particularmente importante porque altos níveis de 2’deoxi-adenosina são tóxicos para as células do sistema imunológico. A ADA2 (100kDa) é normalmente encontrada no soro e sintetizada somente pelo sistema monocítico-macrofágico. A importância biológica da ADA2 ainda não está totalmente estabelecida, principalmente devido as suas características cinéticas. O presente trabalho teve como objetivo discriminar as isoenzimas da adenosina desaminase humana através de eletroforese em gel de agarose e pelo modelo proposto por Vale e Almeida (1998), bem como realizar um estudo descritivo retrospectivo sobre o perfil dos exames de ADA no Estado do Ceará. As amostras de líquido ascítico, pleural e pericárdico foram submetidas à eletroforese em agarose a 1% a 80 V por 7 horas. O gel foi fatiado e cada fatia foi incubada em adenosina (22 ou 0,55mM) por 20 horas para a detecção da amônia liberada pela reação enzimática. Os resultados encontrados a partir da eletroforese foram comparados com os resultados achados pelo modelo de Vale e Almeida (1998). O líquido pleural é o fluido que é mais frequentemente solicitado para a determinação da ADA, seguido pelos líquidos ascítico, cefalorraquidiano, pericárdico e soro. Observamos que os valores de atividade enzimática são influenciados pelo tipo de líquido corporal onde a enzima se encontra, podendo estar relacionada às barreiras corporais, tais como a barreira hematoencefálica. A partir dos resultados obtidos, podemos concluir que o modelo matemático proposto pode ser usado em laboratórios clínicos para discriminar as isoenzimas da ADA.

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-27T02:12:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andrade_SoniaCristinadaSilva_M.pdf: 4815593 bytes, checksum: 7d1d9ae004d8227edcdd9b0448c2004e (MD5) Previous issue date: 2000 / Mestrado

Orientador: Jose Francisco Hofling / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-07-27T09:29:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rosa_EdvaldoAntonioRibeiro_D.pdf: 4106339 bytes, checksum: e10ec954dc70951353572a92c523a361 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: Na presente tese, buscou-se estabelecer os graus de diversidade existentes entre diferentes espécies de leveduras do gênero Candida isoladas da cavidade oral de indivíduos saudáveis por meio do emprego da técnica de eletroforese de enzimas constitutivas. Para tanto, linhagens representativas de diferentes espécies de Candida (C. albicans, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. krusei, e C. guilliermondii) e também suas respectivas linhagens-tipo foram crescidas em frascos com meio de cultura líquido, os quais após incubação (37ºC, 150rprn, 18 horas) foram centrifugados e seus pel/ets lavados. As massas celulares obtidas foram processadas num disrruptor celular tipo Mini Bead-beater que permitiu a obtenção dos extratos citossólicos brutos, os quais foram aplicados em tiras de papel de filtro e suas proteínas separadas por eletroforese em gel de amido. A atividade enzimática foi acessada para 20 sistemas: álcool desidrogenase (ADH), lactato desidrogenase (LDH), malato desidrogenase (Iill)H), isocitrato desidrogenase (IDH), glicose-6-fosfato desidrogenase (G6PDH), aspartato desidrogenase (ASD), glucose desidrogenase (GDH), manitol desidrogenase (MADH), sorbitol desidrogenase (SDH), aconitase (ACO), enzima málica (ME), catalase (CAT), superóxido dismutase (SOD), transaminase glutâmico-oxalacética (GOT), a-esterase (EST), B-esterase (EST), leucina aminopeptidase (LAP), glicosil transferase (GTF), peroxidase (PO) e a-amilase (a-AM).A partir dos géis revelados foram feitos os diagramas representativos da mobilidade eletroforética das bandas que permitiram a confecção de fenogramas de similaridade para cada sistema enzimático. Os sistemas que forneceram bandas perceptíveis permitiram a análise da diversidade das espécies analisadas tanto em termos fenéticos quanto genéticos, que possibilitaram a redação de quatro artigos originais. Nesses originais pode-se observar a diversidade acessada através da análise conjunta de todas enzimas, da análise conjunta de todas as desidrogenases, e da análise genética dos diferentes loci, bem como uma comparação da capacidade discriminatória estabelecida entre a técnica de eletroforese de enzimas constitutivas (MLEE) e a técnica de eletroforese de proteínas totais em gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) / Abstract: In the present thesis, it was intended to establish the existing diversity grades among different yeast speeies of Candida genus isolated ITom oral eavities of healthy individuais by means of multiloeus enzyme electrophoresis. For this, representative strains of different species of Candida (C. albicans, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. krusei, e C. guilliermondii) and their respective type-strains were grown in liquid eulture medium bottles, whieh, after ineubation (37°C, 15Orprn, 18 hours), were centrifuged and their pellets were washed. The cell masses were processed in a Mini Bead-beater cell disrupter in order to obtain the crude cytosolie extracts, whieh were separated by stare gel electrophoresis. The enzymatic activity was aeeessed for 20 systems: alcohol dehydrogenate (ADH), lactate dehydrogenate (LDH), maltase dehydrogenate (MDH), isocitrate dehydrogenase (IDH), glueose-6-phosphate dehydrogenase (G6PDH), aspartate dehydrogenase (ASD), glueose dehydrogenase (GDH), mannitol dehydrogenase (MADH), sorbitol dehydrogenase (SDH), aconitase (ACO), malie enzyme (ME), eatalase (CAT), superoxide dismutase (SOD), glutamie-oxalaeetate transaminase (GOT), a-esterase (EST), esterase (EST), leueine aminopeptidase (LAP), glueosil transferase (GTF), peroxidase (PO) e aamylase (a-AM). From revealed gels it were built the diagrams representing the electrophoretie banding mobilities that allowed the Construction of similarity phenograms for eaeh enzymatie system. The systems whieh furnished detectable bands allowed the speeies' diversity analysis in phenetie and genetie tenns, what allowed the writing of four original papers. On these artieles one ean notiee the diversity aeeessed ITom the overall analysis of enzymes, Itom the overall analysis dehydrogenases, and ITom the genetie ana1ysis of different loei, as good as one eomparison of diseriminatory eapacity determined by multiloeus enzyme electrophoresis (MLEE) and whole-cell protein eleetrophoresis on polycrylamide gel slabs (SDS-P AGE) / Doutorado / Biologia e Patologia Buco-Dental / Doutor em Odontologia

Orientador: Flavio Antonio Maes dos Santos, Vera Nisaka Solferini / Texto em portugues e ingles / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T00:22:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ramos_FlavioNunes_D.pdf: 5266120 bytes, checksum: 7016477078901d270024e8f362cc91d1 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: A variabilidade climática espacial e temporal entre áreas pode provocar mudanças nos eventos reprodutivos de populações de animais e plantas. O isolamento de manchas florestais e a criação de bordas pela fragmentação florestal podem ocasionar mudanças nas condições abióticas e bióticas tanto entre quanto dentro de fragmentos florestais, podendo afetar alguns aspectos relacionados à reprodução e fluxo gênico das plantas e conseqüentemente diminuir a qualidade de sementes devido ao aumento do endocruzamento. Essas mudanças também podem ser encontradas em bordas naturais (limites entre florestas e rios ou riachos). Tanto bordas antrópicas, criadas pela fragmentação, quanto bordas naturais, podem apresentar perturbação no fluxo gênico e conseqüentemente na qualidade das sementes produzidas pelas plantas lá localizadas. O objetivo desta tese foi investigar se, em escala regional, (i) houve diferenças climáticas entre fragmentos florestais; (ii) a fenologia reprodutiva de P. tenuinervis seria influenciada pelas-condições climáticas; (iii) existiriam diferenças na fenologia reprodutiva de P. tenuinervis entre fragmentos com diferentes distâncias. E em escala local foi investigar se (iv) houve diferenças no microclima; (v) na fenologia reprodutiva; (vi) nas comunidades de visitantes florais; na freqüência de suas visitas; e na produção de frutos e sementes; (vii) variabilidade e estrutura genética; (viii) massa, taxa e velocidade de germinação de sementes produzidas por indivíduos de Psychotria tenuinervis localizados em bordas antrópicas (BA), bordas naturais (BN) e interior do fragmento (IF). O estudo foi conduzido em cinco fragmentos (em escala regional) no Rio de Janeiro, sudeste do Brasil, e em escala local, dentro de um deles. Houve diferenças no clima entre os cinco fragmentos, porém o padrão fenológico de P. tenuinervis encontrado nos dois anos foi similar entre eles. Esses resultados indicam que o padrão geral da fenologia reprodutiva desta espécie, em uma escala regional, pode ser influenciado por fatores evolutivos. Em escala local, não houve diferenças no microclima; padrões feno lógicos; taxa de visitação floral (só em 2002, BN apresentou mais visitas e BA menos), produção de frutos e sementes; variabilidade e estrutura genética; nem na taxa e velocidade de germinação, entre os três ambientes devido a grande variação entre as parcelas dentro deles. A indicação dessa heterogeneidade e a provável importância de outros fatores, como clareiras ou idade das bordas, ao invés da distância de bordas, nos fragmentos estudados, podem ser muito importantes para programas de conservação / Abstract: Spatial and temporal climatic variability among areas may affect the reproductive events of plant and animal populations. Habitat changes or abrupt limits between habitats can affect the interactions between plants and their pollen and seed vectors and lead to a decrease in seed quality because of increased inbreeding. The isolation of forest patches and the edges created by fragmentation may change the abiotic and biotic conditions among and within forest fragments; they also could' affect some aspects related to plant reproduction and gene flow, decreasing seed quality due to the inbreeding. These changes could also occur at natural edges (limits between forests and rivers or streams). Plants near anthropogenic and natural edges could present alterations of their gene flow and consequent1y in the quality of their seeds. The aim of this thesis was to investigate whether, on a regional scale, there were (i) c1imatic differences among forest fragments, (ii) influences of climatic conditions on the reproductive phenology of P. tenuinervis, or differences in (iii) reproductive phenology of P. tenuinervis arnong forest fragments, and on a local scale, whether there were differences (iv) in microc1imate, (v) reproductive phenology, (vi) community of flower visitors, (vii) genetic variability and structure, and (viii) mass, rate and velocity of germination of seeds produced by Psychotria tenuinervis located on anthropogenic edges (AE), natural edges (NE) and in the forest interior (FI). The study was carried out, on a regional scale, in tive fragments in Rio de Janeiro, Brazi1, and on a local scale, within one of them. In spite of differences in climatic conditions among the five fragments, the phenological pattem of P. tenuinervis found in the two years was similar among them. These results indicated that the general pattern of reproductive phenology of this plant species, on a regional scale, could be influenced by evolutionary factors. On a local scale, there were no differences, among the three habitats, in microclimate, phenological pattern, rate of flower visits (only in 2002, NE with more and . AE fewer visits), fruit and seed production, genetic variability and structure, and rate and velocity of seed germination. These pattern may occurr due to the great variation among the sample plots within each habitat. The heterogeneity found within each habitat, and the probable greater importance of gaps or edge age instead of the distance from the edges, could be very important for conservation programs of forest habitats / Doutorado / Doutor em Ecologia

Orientador: Herculano Penna Medina Filho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T03:10:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ballue_RosaMariaLizana_M.pdf: 3989269 bytes, checksum: b1f2964c0b05c9de0512482afbbed616 (MD5) Previous issue date: 1988 / Resumo: Desenvolveu-se um conjunto de metodologias de eletroforese em gel de amido-aplicáveis à análise de isoenzimas em Palmeiras do gênero Euterpe. Analisaram-se então diversas introduções de E.eudulis, E.oleracea, híbridos entre essas duas espécies e populações de ¿tipos¿ de Euterpe ssp, com e sem perfilhamento, de taxonomia ainda duvidosa. Esses estudos foram realizados comparativamente, em tecidos de caule e de palmito e no pólen de plantas adultas, raízes de plántulas e folhas de plantas, em diversas fases de desenvolvimento, para as isoenzimas de PRX, EST, APS, ADH, PGI, ME. GOT e PPO. Verificou-se a ocorrência de polimorfismos genéticos dentro do gênero para todos os sistemas enzimáticos estudados. Em alguns destes sistemas, embora preliminarmente, identificaram-se possíveis loci, sendo sugerida a estrutura quartenária da isoenzima em questão. Também, através da técnica de eletroforese, foi possível a definição e utilização de marcadores genéticos na identificação de híbridos E.edulis X E.oleracea de grande potencial agronômico, caracterização da origem de palmitos "in natura" bem como o estabelecimento de provável relação de alguns ¿tipos" de Euterpe spp. com E.edulis, E.oleracea ou ambas / Abstract: Starch gel electrophoresis methodology has been developed for the analysis of isozymes in Euterpe (heart of palm) plants. Several accessions of E.oleracea, E.edulis, F hybrids between as well as some populations of tillering and non tillering Euterpe of uncertain taxonomic classification were analysed. PRX, EST, APS, ADH, PGI, ME, GOT and PPO isozymes were comparatively studied in stem, heart of palm and pólen of adult plants, as well as in roots and leaves, from seedling to adult stage. Genetic polymorphism have been detected in the genus for alI the isozymes systems studied. In some of them, although on a preliminary basis, possible loci have been determined along with the quaternary structure of the isozyme specified by them. Also key markers have allowed the identification at any developmental stage of interspecific hybrids of potential agronomic value, helped the caracterization of heart of palm received by processing plants as well as the establishment of the putative origin of some taxonomically uncertain Euterpe spp. populations as related to E.oleracea, E. edulis or both / Mestrado / Mestre em Biologia

A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma espécie amplamente cultivada no Brasil, possuindo grande variabilidade para caracteres morfológicos, e elevada adaptação a climas e solos diferentes. A avaliação da variabilidade genética através da técnica de eletroforese de isoenzimas é bastante empregada em espécies vegetais. Os acessos mantidos em bancos de germplasma constituem um importante recurso genético para futuros trabalhos de melhoramento, porém é necessário conhecer-se as características peculiares de cada acesso. O estudo da variabilidade genética em bancos de germoplasma contribui para o conhecimento do genótipo de cada acesso, além de identificar materiais duplicados, o que reduz o custo com a manutenção do germoplasma. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de 200 acessos de mandioca através de oito sistemas isoenzimáticos [fosfatase ácida (ACP), leucina aminopeptidase (LAP), glucose-6-fosfato desidrogenase (G6PDH), malato desidrogenase (MDH), xiquimato desidrogenase (SKDH), enzima málica (ME), glutamato desidrogenase (GDH) e isocitrato desidrogenase (IDH)] e verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Para a avaliação isoenzimática dos acessos de mandioca utilizou-se folhas tenras (recém-expandidas) e, como meio de suporte, gel de amido de milho a 12% de concentração. Os acessos foram agrupados de acordo com o local de origem, obtendo-se desta forma sete grupos: 1-Amazonas, 2-Amapá, 3-Bahia, 4-Pará, 5-Rondônia, 6-Diversos, incluindo-se neste grupo os acessos que apresentavam-se em pequena quantidade por local de origem (um ou no máximo dois indivíduos), e 7- Acessos sem origem, incluindo-se neste grupo os acessos que não apresentavam local de origem definida. Cada sistema apresentou um loco polimórfico. O número médio de alelos por loco variou de 2,3 a 2,5. A heterozigosidade média observada variou de 0,381 a 0,615 e a esperada de 0,479 a 0,559. A variabilidade genética dentro dos grupos foi maior que a variabilidade entre os grupos para todos os oito locos analisados, com valores médios entre grupos (GST) de 0,049 e dentro de grupos (HS) de 0,482. Através da análise de similaridade genética, utilizando-se o índice de Jaccard, foi confeccionado um dendrograma para cada grupo de acessos, observando-se grande variabilidade genética entre os acessos avaliados. Os dendrogramas foram comparados a uma planilha contendo os 200 acessos agrupados de acordo com a semelhança de seus genótipos para os oito locos avaliados, com a finalidade de verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Os dendrogramas mostraram a presença de 11 pares de acessos repetidos. Destes, somente três pares de acessos apresentaram similaridade para os oito locos analisados, os quais podem ser considerados como possíveis materiais duplicados / not available

Made available in DSpace on 2015-05-27T13:34:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 580.pdf: 1742532 bytes, checksum: 684716d3a71fb503e627b0931f084829 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil / A leishmaniose tegumentar americana (LTA) na Amazônia Ocidental, Brasil, comporta-se, dentro do padrão de transmissão modificado do ponto de vista epidemiológico, pelos diversos fatores que influenciam no ciclo da doença. A ocorrência de casos vem aumentando nos últimos anos em Manaus, com freqüência maior em áreas de assentamentos populacionais, notificados em média 600 casos/ano. Esse estudo tem como objetivo caracterizar as espécies de Leishmania spp. em amostras isoladas de pacientes com leishmaniose tegumentar americana em área endêmica da região norte, Brasil. Pacientes com leishmaniose tegumentar, procedentes de Manaus (61 por cento), região metropolitana, do interior do estado do Amazonas, Pará, Roraima e Rondônia (39 por cento) procuraram os serviços de ambulatório da Fundação de Medicina Tropical do Amazonas. Um total de 209 pacientes submeteu-se aos exames clínicos, epidemiológicos e laboratoriais. Os exames parasitológicos foram realizados nos 209 pacientes através da técnica de escarificação de borda da lesão para a pesquisa direta; em 188 foi realizada punção aspirativa e em 21 biópsias para o isolamento do parasito em meios de cultura NNN/Schnneiders. Foi realizada a identificação e caracterização das espécies de Leishmania spp utilizando painel de anticorpos monoclonais e perfil de isoenzimas (MLEE). Dos 209 isolados 85 por cento (178/209) foram positivas na pesquisa direta e se conseguiu isolamento por cultura de todas as amostras. Na caracterização os serodemas apresentaram maior freqüência para L. (V.) guyanensis (73 por cento) 153/209, zimodemas 83 por cento(173/209). Em 13 por cento (26/209) dos isolados apresentaram mais de uma espécie de parasitos, denominado de infecção mista. Nessas infecções a L. (V.) guyanensis estava presente na maioria dos isolados. O expressivo índice de infecções mistas evidenciado demonstra a grande diversidade de espécies de Leishmania associadas à doença nesta área endêmica da região norte. Esses achados podem contribuir no seguimento de tratamento, com a perspectiva de intervenção terapêutica mais eficaz para o paciente

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-07-19Bitstream added on 2014-06-13T18:29:34Z : No. of bitstreams: 1 facincani_ap_me_jabo.pdf: 1373718 bytes, checksum: b53fbfa950bc393c0258f8d1ac8b5755 (MD5) / Muitas das questões relacionadas a como Xylella fastidiosa vive num ambiente cuja concentração de nutrientes é baixa, e como e porquê ela forma agregados nos vasos do xilema, devem estar relacionados com seu metabolismo. O seqüenciamento deste organismo forneceu informações para serem aplicadas em estudos genéticos funcionais, visando à elucidação da funcionalidade de vias metabólicas que possam estar intimamente ligadas à etiologia do amarelinho. O presente estudo foi conduzido com o objetivo de verificar a funcionalidade da via Glicolítica de X. fastidiosa através de estudo das isoenzimas fosfoglicose isomerase, aldolase ou gliceraldeído-3-fosfato liase, gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e piruvato quinase presentes na via Glicolítica e a glicose 6-fosfato desidrogenase presente na Entner-Doudoroff, bem como a clonagem, expressão e a determinação da atividade da enolase. O gene da enolase é uma das 35 ORFs anotadas no cosmídeo 02F10, denominada XF1291. Estes estudos sugerem que a bactéria X. fastidiosa não utiliza a via Glicolítica no metabolismo de carboidratos, inferindo assim no elevado tempo de duplicação deste fitopatógeno. As atividades enzimáticas da enolase recombinante, da enolase nativa e das isoenzimas aldolase e gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase não foram detectadas, sugerindo que a X. fastidiosa utiliza a via Entner-Doudoroff para a formação de piruvato. São apresentadas evidências de que a regulação gênica e a presença de isoformas, com propriedades regulatórias diferentes, podem dificultar a compreensão do metabolismo de carboidratos em X. fastidiosa. / Many of the questions related to how Xylella fastidiosa lives in an environmental with low concentration of nutrients, and the reason why she forms aggregates in xylem vessels should be related with its metabolism. However, the sequencing this organism provided information to be applied in functional genetic studies. These studies focus on elucidating the functionality of metabolic pathways that might be intimately involved in amarelinho etiology. The objective of this study was to verify the functionality of the Glycolytic pathways by studying the isozymes phosphoglucose isomerase, aldolase or glyceraldehyde-3-phosphato-lyase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase and pyruvate kinase in the Glycolytic pathway and glucose-6-phosphate dehydrogenase in Entner-Doudoroff pathway, as well as the cloning and expression of enolase and determination of its activity. The enolase gene is one of 35 ORFs annoted in 02F10 cosmid and denominated XF 1291. These studies suggested that X. fastidiosa bacterium does not use the Glycolitic pathway in the metabolism of carbohydrates, which might explain the long time of duplication presented by this phytopathogen. The enzymatic activities of recombinant enolase, native enolase and isozymes aldolase and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase have not been detected, suggesting that X. fastidiosa uses the Entner-Doudoroff pathway to produce pyruvate. Evidences are presented that the regulation of genes and the presence of isoforms with different properties of regulation can make it difficult to understand the metabolism of carbohydrates in X. fastidiosa.

Resumo: Muitas das questões relacionadas a como Xylella fastidiosa vive num ambiente cuja concentração de nutrientes é baixa, e como e porquê ela forma agregados nos vasos do xilema, devem estar relacionados com seu metabolismo. O seqüenciamento deste organismo forneceu informações para serem aplicadas em estudos genéticos funcionais, visando à elucidação da funcionalidade de vias metabólicas que possam estar intimamente ligadas à etiologia do amarelinho. O presente estudo foi conduzido com o objetivo de verificar a funcionalidade da via Glicolítica de X. fastidiosa através de estudo das isoenzimas fosfoglicose isomerase, aldolase ou gliceraldeído-3-fosfato liase, gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e piruvato quinase presentes na via Glicolítica e a glicose 6-fosfato desidrogenase presente na Entner-Doudoroff, bem como a clonagem, expressão e a determinação da atividade da enolase. O gene da enolase é uma das 35 ORFs anotadas no cosmídeo 02F10, denominada XF1291. Estes estudos sugerem que a bactéria X. fastidiosa não utiliza a via Glicolítica no metabolismo de carboidratos, inferindo assim no elevado tempo de duplicação deste fitopatógeno. As atividades enzimáticas da enolase recombinante, da enolase nativa e das isoenzimas aldolase e gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase não foram detectadas, sugerindo que a X. fastidiosa utiliza a via Entner-Doudoroff para a formação de piruvato. São apresentadas evidências de que a regulação gênica e a presença de isoformas, com propriedades regulatórias diferentes, podem dificultar a compreensão do metabolismo de carboidratos em X. fastidiosa. / Abstract: Many of the questions related to how Xylella fastidiosa lives in an environmental with low concentration of nutrients, and the reason why she forms aggregates in xylem vessels should be related with its metabolism. However, the sequencing this organism provided information to be applied in functional genetic studies. These studies focus on elucidating the functionality of metabolic pathways that might be intimately involved in "amarelinho" etiology. The objective of this study was to verify the functionality of the Glycolytic pathways by studying the isozymes phosphoglucose isomerase, aldolase or glyceraldehyde-3-phosphato-lyase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase and pyruvate kinase in the Glycolytic pathway and glucose-6-phosphate dehydrogenase in Entner-Doudoroff pathway, as well as the cloning and expression of enolase and determination of its activity. The enolase gene is one of 35 ORFs annoted in 02F10 cosmid and denominated XF 1291. These studies suggested that X. fastidiosa bacterium does not use the Glycolitic pathway in the metabolism of carbohydrates, which might explain the long time of duplication presented by this phytopathogen. The enzymatic activities of recombinant enolase, native enolase and isozymes aldolase and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase have not been detected, suggesting that X. fastidiosa uses the Entner-Doudoroff pathway to produce pyruvate. Evidences are presented that the regulation of genes and the presence of isoforms with different properties of regulation can make it difficult to understand the metabolism of carbohydrates in X. fastidiosa. / Orientadora: Maria Inês Tiraboschi Ferro / Coorientador: João Martins Pizauro Junior / Banca: Julio Cezar Franco de Oliveira / Banca: Luiz Roberto Furlan / Mestre