Submitted by PPG Biologia Celular e Molecular (bcm@pucrs.br) on 2018-04-24T12:44:41Z No. of bitstreams: 1 KARINA_VIDARTE_GASPARY_DIS.pdf: 1111674 bytes, checksum: e2b2dc4b1b1eea8b10007b7c07f592ec (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2018-05-11T17:57:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 KARINA_VIDARTE_GASPARY_DIS.pdf: 1111674 bytes, checksum: e2b2dc4b1b1eea8b10007b7c07f592ec (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-11T18:03:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KARINA_VIDARTE_GASPARY_DIS.pdf: 1111674 bytes, checksum: e2b2dc4b1b1eea8b10007b7c07f592ec (MD5) Previous issue date: 2018-02-08 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Memory and learning allow animals to adapt and modify their behavior towards new experiences. Some factors may result in memory deficits such as: neurodegenerative diseases, changes due to intoxication and the use of drugs. Zebrafish can be used to model complex human behavioral traits such as learning and memory. This study aims to establish a protocol for evaluating the object recognition memory or object location tasks in zebrafish. We evaluated novel object recognition memory and analyzed the exploration time of novel and familiar objects in the training and test sessions. There was a preference of the animal to explore the new object in comparison to the familiar object (61% of exploration time). We also evaluated the object location task and measured the exploration time of each object in the familiar and novel object locations. There was a preference of the animal to explore the object in the novel location in comparison to the object in the familiar location (63% of exploration time). We also evaluated the effect of the non-competitive NMDA receptor antagonist MK-801 on the object recognition and object location memory in zebrafish. In this regimen treatment, control (water only) and treated animals (5 ?M MK-801) presented a significant preference in exploring the familiar object in comparison to the new object (66 and 68% of exploration time, respectively); however, 10 ?M MK-801-treated animals did not show differences in the exploration time of the objects. In the object location task, the animals treated with the 5 or 10 ?M MK-801 did not show a significant preference for the familiar or novel location whereas the control group had a higher preference in exploring the object in the familiar location (64% of exploration time). Therefore, it is possible to suggest that 5 ?M MK-801 impaired the memory formation in an object location task, which is in agreement with previous studies demonstrating the cognitive deficit induced by MK-801 treatment in aversive and spatial memory. Considering the different responses of the control group between original task and in the regimen treatment, we evaluated the impact of habituation on cortisol levels of animals in three different protocols: 1) habituated at the experiment apparatus for 3 days (Condition 1 ? C1), 2) habituated at the experiment apparatus for 3 days plus treatment tank exposure at fourth day (Condition 2 - C2), 3) habituated at the treatment tank exposure and experiment apparatus for 3 days and exposed to treatment tank again at fourth day (Condition 3 ? C3). The results showed higher levels of cortisol in animals submitted to C2 and C3 conditions compared to animals submitted to C1. These results demonstrated that the animals submitted to treatment tank exposure have a different performance in object recognition and object location memory due to stress responses. Therefore, these tasks are prone to evaluate memory in physiological and pathological conditions, but its use is limited to perform pharmacological studies due to sensitivity to stress caused by manipulation. / A mem?ria permite que os animais possam adaptar e modificar seu comportamento diante de novas experi?ncias. Uma s?rie de fatores pode resultar num d?ficit de mem?ria como: doen?as neurodegenerativas, altera??es decorrentes de intoxica??es e uso de f?rmacos. O peixe-zebra vem sendo usado para modelar caracter?sticas comportamentais humanas complexas, como o aprendizado e mem?ria. Este estudo tem como objetivo estabelecer um protocolo para avaliar tarefas de mem?ria de reconhecimento de objetos ou de localiza??o de objetos no peixe-zebra. N?s avaliamos a mem?ria de reconhecimento de objeto novo e analisamos o tempo de explora??o de objetos novos e familiares nas sess?es de treino e teste. Houve uma prefer?ncia do animal em explorar o novo objeto em compara??o com o objeto familiar (61% do tempo de explora??o). Tamb?m avaliamos a tarefa de localiza??o de objeto e medimos o tempo de explora??o de cada objeto nos locais familiares e novos. Houve uma prefer?ncia do animal para explorar o objeto na localiza??o nova em compara??o com o objeto na localiza??o familiar (63% do tempo de explora??o). Tamb?m avaliamos o efeito do antagonista n?o competitivo do receptor NMDA MK-801 na mem?ria de reconhecimento de objeto novo e na localiza??o de objeto em peixe-zebra. Neste tratamento, o controle (somente ?gua) e os animais tratados (MK-801 5 ?M) apresentaram uma prefer?ncia significativa na explora??o do objeto familiar em compara??o com o novo objeto (66 e 68% do tempo de explora??o, respectivamente); no entanto, animais tratados com MK-801 10 ?M n?o mostraram diferen?as no tempo de explora??o dos objetos. Na tarefa de localiza??o de objeto, os animais tratados com MK-801 5 ou 10 ?M n?o mostraram prefer?ncia significativa pelo objeto na localiza??o familiar ou nova, enquanto que o grupo controle teve uma prefer?ncia maior em explorar o objeto na localiza??o familiar (64% de tempo de explora??o). Portanto, sugere-se que o MK-801 5 ?M prejudicou a forma??o da mem?ria em uma tarefa de localiza??o de objeto, o que est? de acordo com estudos pr?vios, demonstrando o d?ficit cognitivo induzido pelo MK-801 em mem?rias aversivas ou espaciais. Considerando as diferentes respostas do grupo controle entre a tarefa original e no tratamento, avaliamos o impacto da habitua??o nos n?veis de cortisol dos animais em tr?s protocolos diferentes: 1) habituado ao aparato experimental por 3 dias (Condi??o 1 - C1) 2) habituado ao aparato experimental por 3 dias mais a exposi??o ao aqu?rio de tratamento no quarto dia (Condi??o 2 - C2), 3) habituado na exposi??o ao aqu?rio de tratamento e no aparato experimental por 3 dias e exposto ao aqu?rio de tratamento novamente no quarto dia (Condi??o 3 - C3). Os resultados mostraram n?veis mais elevados de cortisol em animais submetidos a condi??es C2 e C3 em compara??o com animais submetidos a C1. Esses resultados demonstraram que os animais submetidos ? exposi??o ao aqu?rio de tratamento apresentam desempenho diferente nas tarefas de mem?ria de reconhecimento de objetos e de localiza??o do objeto devido ao estresse. Portanto, essas tarefas s?o adequadas para avaliar a mem?ria em condi??es fisiol?gicas e patol?gicas, mas seu uso ? limitado em estudos farmacol?gicos devido ? sensibilidade ao estresse causado pela manipula??o.

Submitted by PPG Biologia Celular e Molecular (bcm@pucrs.br) on 2018-05-24T14:27:28Z No. of bitstreams: 1 FABIANO_PERES_MENEZES_TES.pdf: 24793474 bytes, checksum: 8b7fdf3efa2bb4839dd339d485cee522 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2018-06-11T14:26:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FABIANO_PERES_MENEZES_TES.pdf: 24793474 bytes, checksum: 8b7fdf3efa2bb4839dd339d485cee522 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-11T14:31:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FABIANO_PERES_MENEZES_TES.pdf: 24793474 bytes, checksum: 8b7fdf3efa2bb4839dd339d485cee522 (MD5) Previous issue date: 2018-03-16 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Epilepsy is the most serious neurological condition in the world. It is characterized by recurrent seizures from synchronous neuronal discharges. Disturbances in neuronal signaling in the early stages of development may lead to increased susceptibility to seizures in adulthood, as well as seizures in the early stages of development may lead to alterations in neurotransmission systems. Adenosinergic signaling is known to act as an endogenous anticonvulsant through its neuromodulatory function. Disturbances in adenosinergic signaling in early stages of development lead to changes in the susceptibility to seizures conditionally at the stage of development in which the disturbance occurs, and time of exposure to the disturbing agent. In the four chapters of this thesis, it was discussed about factors that influence the susceptibility to pentylenetetrazole (PTZ)-induced seizure under different aspects using zebrafish. In the first chapter, it was analyzed the influence of temperature on zebrafish sensitivity to PTZ as well as the ability of the MK-801 antagonist to reverse the effects of hyperthermia on susceptibility to PTZ-induced seizures. In addition, it was verifyed possible differences in the susceptibility to seizures according to gender or weight. In the second chapter, it was used transient molecular blockade through the morpholine technique to block the translation of the transcripts corresponding to the adenosinergic A1 and A2A receptors at the beginning of embryogenesis. The animals that underwent transient blockade were evaluated for survival rate and morphology, at 7 days post-fertilization (dpf) and locomotor activity and susceptibility to seizures caused by PTZ at 7 dpf and in adulthood. In the third chapter, it was used the morpholine technique to block the translation of the transcripts corresponding to the enzyme ecto-5'-nucleotidase and concentrative nucleoside transporters type 2 (CNT2) at the beginning of embryogenesis. The animals that underwent transient blockade were evaluated for survival rate and morphology at 7 days post-fertilization (dpf) and locomotor activity and susceptibility to seizures caused by PTZ at 7 dpf and in adulthood. In the fourth chapter, it was performed microinjection of the 8-Cyclopentyl-1,3-dipropylxanthine (DPCPX), antagonist of A1 receptor; ZM241385, A2A antagonist; caffeine, non-selective adenosine receptor antagonist; dipyridamole, equilibrative nucleoside transporter blocker (ENT) and Adenosine 5 '- (?, ?-methylene) diphosphate (AMPCP), ecto-5'-nucleotidase enzyme inhibitor, in zebrafish eggs (1 hour post -fertilization). The animals exposed to these drugs were evaluated for survival rate, morphology and locomotor activity at 7 dpf and susceptibility to seizures caused by PTZ at 7 dpf and in adulthood. These results indicated that hyperthermia increases the susceptibility of zebrafish to PTZ-induced seizures and that this effect is prevented by the administration of MK-801. In addition, there was no difference in susceptibility to PTZ dependent on gender or body mass. These results indicated that disturbances in adenosinergic signaling through blockade via morpholine or in the higher doses of the drugs mentioned above, caused a decrease in the survival rate and high rates of morphological changes. None of the approaches caused alterations in the locomotor activity in the initial phase of development, whereas in the adult phase, there were occasional changes. At 7dpf, none of the targets blocked by morpholine caused alterations in the susceptibility to seizures caused by PTZ, whereas among the targets blocked by drugs there was alteration mainly in animals microinjected with DPCPX, Caffeine and Dipyridamole. However, in the adult phase all the targets blocked by morpholine triggered in greater susceptibility to seizures, while those blocked by drugs showed changes in specific doses and seizure stage. These results corroborate a series of studies that report the importance of adenosinergic signaling in the early stages of development as well as the deleterious effects of both exogenous and endogenous perturbations in this signaling pathway. / A epilepsia ? a condi??o neurol?gica grave de maior incid?ncia no mundo. ? caracterizada por crises convulsivas recorrentes, provenientes de descargas neuronais sincr?nicas. Dist?rbios na sinaliza??o neuronal na fase inicial do desenvolvimento podem acarretar em aumento na suscetibilidade a crises convulsivas na fase adulta, assim como crises convulsivas na fase inicial do desenvolvimento podem acarretar em altera??es nos sistemas de neurotransmiss?o. A sinaliza??o adenosin?rgica reconhecidamente ? capaz de agir como um anticonvulsivante end?geno, atrav?s de sua fun??o neuromoduladora. Perturba??es na sinaliza??o adenosin?rgica em fases inicias do desenvolvimento acarretam em altera??es na suscetibilidade a crises convulsivas de forma condicional ao est?gio de desenvolvimento em que a perturba??o ocorre e tempo de exposi??o ao agente perturbador. Nos quatro cap?tulos integrantes dessa tese foram abordados, sob diferentes aspectos, fatores que influenciam a susceptibilidade a crise convulsiva provocada pela exposi??o ao pentilenotetrazol (PTZ) utilizando peixe-zebra. No primeiro cap?tulo, foi analisada a influ?ncia da temperatura na sensibilidade do peixe-zebra ao PTZ, bem como a capacidade do antagonista MK-801 de reverter os efeitos provocados pela hipertermia na suscetibilidade a crises convulsivas induzidas por PTZ. Al?m de serem verificadas as poss?veis diferen?as na suscetibilidade a crises convulsivas em fun??o do g?nero ou peso. No segundo cap?tulo, foi descrito o uso do bloqueio molecular transit?rio atrav?s da t?cnica de morfolinos para bloquear a tradu??o dos transcritos correspondentes aos receptores adenosin?rgicos A1 e A2A no inicio da embriog?nese. Os animais que sofreram o bloqueio transit?rio foram avaliados quanto a taxa de sobreviv?ncia e morfologia at? os 7 dias p?s-fertiliza??o (dpf) e atividade locomotora e suscetibilidade a crises convulsivas provocadas por PTZ aos 7 dpf e na fase adulta. No terceiro cap?tulo, foi descrito o uso da t?cnica de morfolinos para bloquear a tradu??o dos transcritos correspondentes a enzima ecto-5?-nucleotidase (e5?nt) e transportadores concentrativos de nucleos?deo tipo 2 (CNT2) no inicio da embriog?nese. Os animais que sofreram o bloqueio transit?rio foram avaliados quanto a taxa de sobreviv?ncia e morfologia aos 7 dpf e atividade locomotora e suscetibilidade a crises convulsivas provocadas por PTZ aos 7dpf e na fase adulta. No quarto cap?tulo, foi abordado o efeito da microinje??o de 8-Ciclopentil-1,3-dipropilxantina (DPCPX), antagonista do receptor A1; ZM241385 antagonista do receptor A2A; cafe?na, antagonista n?o-seletivo dos receptores de adenosina; dipiridamol, bloqueador do transportador equilibrativo de nucleos?deo (ENT) e Adenosina 5?-(?,?-metileno)difosfato (AMPCP), inibidor da enzima ecto-5?-nucleotidase, nos ovos do peixe-zebra (1 hora p?s-fertiliza??o). Os animais expostos a estes f?rmacos foram avaliados quanto a taxa de sobreviv?ncia, morfologia, atividade locomotora aos 7 dpf e suscetibilidade a crises convulsivas provocadas por PTZ aos 7dpf e na fase adulta. Nossos resultados apontam que a hipertermia aumenta a suscetibilidade do peixe-zebra a crises convulsivas provocadas por PTZ e que esse efeito ? prevenido pela administra??o de MK-801. Al?m disso, n?o houve diferen?a na suscetibilidade do PTZ dependente de g?nero ou massa corporal. Nossos resultados indicam que perturba??es na sinaliza??o adenosin?rgica atrav?s de bloqueio via morfolinos ou nas doses mais altas dos f?rmacos acima citados, provocaram diminui??o na taxa de sobreviv?ncia e altas taxas de altera??es morfol?gicas. Nenhuma das abordagens provocou altera??es na atividade locomotora na fase inicial do desenvolvimento, enquanto que na fase adulta foram verificadas altera??es pontuais. Aos 7dpf nenhum dos alvos bloqueados por morfolinos provocou altera??o na suscetibilidade a crises convulsivas provocadas por PTZ, enquanto que entre os alvos bloqueados por f?rmacos houve altera??o principalmente em animais microinjetados com DPCPX, Cafe?na e Dipiridamol. J? na fase adulta todos os alvos bloqueados por morfolinos desencadearam em maior suscetibilidade a crises convulsivas enquanto os bloqueados por f?rmacos exibiram altera??es em doses e est?gio de convuls?o espec?ficos. Esses resultados corroboram com uma s?rie de estudos que reportam a import?ncia da sinaliza??o adenosin?rgica na fase inicial do desenvolvimento, bem como os efeitos delet?rios provenientes de perturba??es tanto ex?genas quanto end?genas nessa via de sinaliza??o.

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2017-07-12T22:04:17Z No. of bitstreams: 1 Tese vers?o final com ficha.pdf: 2919026 bytes, checksum: e0cf3c8db3a8cc81cb105cb2fbb154b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-12T22:04:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese vers?o final com ficha.pdf: 2919026 bytes, checksum: e0cf3c8db3a8cc81cb105cb2fbb154b3 (MD5) Previous issue date: 2016-08-03 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The flavonoid rutin (3-0-rutinos?deo-quercetin) stands out among the natural products as a promising alternative in the fight against degenerative diseases and related to aging. However, the low solubility and stability thereof in different media, especially lipophilic limited applications in pharmaceutical preparations. The biocatalytic transformation by enzymatic acylation has been suggested by several authors, with good reaction yields. In this sense, the objective of this study was to promote the enzymatic acylation of rutin, using castor oil as acylating agent and lipase as a catalyst, to characterize the formed product, estimate the efficiency of bioconversion, and to investigate in vitro the antioxidant activity and cytotoxic effect opposite the reaction product Vero cells. The catalytic transformation occurred at 50?C for 120 hours. The product was subjected to column chromatography, followed by filtration by Sephadex LH-20. The chemical structure of rutin-O-ricinoleate was determined by Nuclear Magnetic Resonance (NMR) 1H and 13C and by liquid chromatography / mass spectroscopy (HPLC/MS). In another experiment, it was observed the formation of the ester content by High Performance Liquid Chromatography coupled to a detector diode arrangements (HPLC-DAD) under conditions which allow assessing the reaction yield over 120 hours. The analytical method proposed has been validated considering the linearity parameters, accuracy, precision, limit of quantification and detection proved to be suitable for quantification of ricinoleato rutin. It was found by this method that the reaction product maintained the antioxidant capacity of rutin and there was no evidence of cytotoxicity. / O flavonoide rutina (quercetina-3-0-rutinos?deo) se destaca entre os produtos naturais como uma alternativa promissora no combate ?s doen?as degenerativas e relacionadas ao envelhecimento. No entanto, a baixa solubilidade e estabilidade da mesma em diferentes meios, especialmente lipof?licos, limitam as aplica??es em prepara??es farmac?uticas. A transforma??o biocatal?tica, atrav?s da acila??o enzim?tica, tem sido sugerida por diversos autores, com bons rendimentos reacionais. Neste sentido, o objetivo do presente trabalho foi promover a acila??o enzim?tica da rutina, utilizando ?leo de mamona como agente acilante e lipase como catalizador, caracterizar o produto formado, estimar o rendimento da bioconvers?o, al?m de investigar in vitro a atividade antioxidante e o efeito citot?xico do produto reacional frente ?s c?lulas Vero. A transforma??o catal?tica ocorreu em temperatura de 50?C, durante 120 horas. O produto foi submetido ? cromatografia em coluna, seguida de filtra??o por Sephadex LH-20. A estrutura qu?mica da rutina-O-ricinoleato, foi determinada por Resson?ncia Magn?tica Nuclear (RMN) 1H e de 13C e por cromatografia l?quida/espectroscopia de massas (CLAE/EM). Em outro experimento, foi verificado o teor de forma??o do ?ster por Cromatografia ? L?quidos de Alta Efici?ncia acoplado a um detector de arranjos Diodos (CLAE-DAD), em condi??es que permitiram avaliar o rendimento reacional ao longo de 120 horas. O m?todo anal?tico proposto foi validado considerando os par?metros de linearidade, exatid?o, precis?o, Limites de quantifica??o e de detec??o mostrando-se adequado para a quantifica??o da rutina ricinoleato. Verificou-se pelos m?todos avaliados, que o produto reacional manteve a capacidade antioxidante da rutina e que n?o houve evid?ncia de citotoxicidade.

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2017-11-20T21:56:50Z No. of bitstreams: 1 DISSERTA??O JULIANA PAIX?O-2016.pdf: 2113185 bytes, checksum: 9e5f3d0a2c6c528f026640900a5db77a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-20T21:56:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTA??O JULIANA PAIX?O-2016.pdf: 2113185 bytes, checksum: 9e5f3d0a2c6c528f026640900a5db77a (MD5) Previous issue date: 2016-03-23 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado da Bahia - FAPEB / Chemical characterization and biological activity tests of plants are important approaches to drug discovery, rational use of elements of our biodiversity in view of the variety of plants reflects the diversity of their secondary metabolites and therapeutic potential. Brazil is an invaluable source of natural resources to obtain drugs, however, little study has been done on the pharmacological potential of native species. The Bromeliaceae family includes about 58 genera and about 3,352 species. Brazil comprises about 40% of the total species with Ananas comosus being the best known. Some plants of this family are used for the treatment of various diseases and there are reports on the presence of secondary metabolites such as triterpenoids, steroids, flavonoids, glycerols, cinnamic acid derivatives and others. This study aimed to know the chemical composition and biological activities of accessions and hybrids of different botanical varieties of Ananas genus in partnership with (EMBRAPA). The leaves of the harvested specimens were dried, ground, and subjected to an extraction procedure with methanol and were pre-selected via the screening and biological screening in order to obtain the best species profile. Three accessions and one hybrid were selected, they were subjected to extraction with methanol, then partitioned with solvents of different polarities. Artemia salina lethality, antioxidants and acetylcholinesterase activity tests were performed. The chromatographic fractionation of the species with better chromatography profile was performed using different techniques. The results revealed that 21 collected accessions have different secondary metabolites, and a wide variation among themselves showing no standard. In relation to biological testing several accessions showed lethality to Artemia salina, antioxidants and acetylcholinesterase activity. The results indicate that extracts of accessions contain active constituents that present such activities confirming its biological potential. As a result of preliminary studies the accessions BGA-739, BGA-804, BGA-820 and hybrid HE were selected for further study, and biological tests were conducted. The BGA- 804 access, chloroform fractions (CL) and ethyl acetate (ACT) has been shown to have high potential antioxidant represented by the EC50 in ?g.ml-1 804-CL (203,5?0,528) e 804-ACT 192,5?0,193, lethality represented by the LC50 in ?g.ml-1 804-CL (69,3?0,47) and 804-ACT (87,7?0,49) and inhibition of the enzyme cholinesterase in % 804-ACT (53.230 ? 4,44). Fractionation, chemical profile by HPLC / DAD and chemical characterization of the BGA-804 access, resulted in the finding of the presence of phenolic compounds, flavonoids and the isolation and identification of daucosterol originating from 804 CL fraction. / Caracteriza??o qu?mica de plantas e testes de atividades biol?gicas s?o abordagens importantes na descoberta de novos medicamentos e para o aproveitamento racional de elementos de nossa biodiversidade, tendo em vista que a variedade de plantas reflete a diversidade dos seus metab?litos secund?rios e seu potencial terap?utico. O Brasil ? fonte inestim?vel de recursos naturais para obten??o de farm?cos, contudo as esp?cies nativas t?m sido pouco estudadas quanto ao potencial farmacol?gico. A fam?lia Bromeliaceae inclui aproximadamente 58 g?neros e cerca de 3.352 esp?cies. O Brasil abriga cerca de 40% do total de esp?cies, sendo a mais conhecida o Ananas comosus. Algumas plantas desta fam?lia s?o utilizadas para tratamento de diversas afec??es e existem relatos da presen?a de metab?litos secund?rios, como: triterpenos, esteroides, flavonoides, glicer?is, derivados do ?cido cin?mico e outros. Este estudo teve como objetivo conhecer a composi??o qu?mica e as atividades biol?gicas de acessos e h?bridos de diferentes variedades bot?nicas do g?nero Ananas, em parceria com (EMBRAPA). As folhas dos esp?cimes coletadas foram secas, mo?das, submetidas ao procedimento de extra??o com metanol e pr?-selecionadas via screening e triagem biol?gica, com a finalidade de obter esp?cies com o melhor perfil. Foram selecionados 3 acessos e 1 h?brido, estes foram submetidos a extra??o com metanol, posteriormente particionados com solventes de diferentes polaridades e realizados testes de letalidade frente ? letalidade frente ? Artemia salina, atividade antioxidantes e anticolinester?sica, o fracionamento cromatogr?fico das esp?cies com melhor perfil foi realizado utilizando diferentes t?cnicas de cromatografia. Os resultados revelaram que os 21 acessos coletados apresentam diferentes metab?litos secund?rios e uma varia??o grande entre si, n?o apresentando nenhum padr?o. Com rela??o aos testes biol?gicos v?rios acessos mostraram letalidade frente ? Artemia salina, atividade antioxidantes e anticolinester?sica. Os resultados obtidos indicam que os extratos dos acessos cont?m constituintes ativos que apresentam tais atividades, confirmando seu potencial biol?gico. Como resultado dos estudos preliminares os acessos BGA- 739, BGA-804, BGA-820 e h?brido HE foram selecionados para continua??o dos estudos, sendo realizado os testes biol?gicos. O acesso BGA-804, fra??es clorof?rmio (CL) e acetato de etila (ACT) demonstrou ter alto potencial antioxidante representado pela EC50 em ?g.ml-1 804-CL (203,5?0,528) e 804-ACT 192,5?0,193, letalidade representado pela LC50 em ?g.ml-1 804-CL (69,3?0,47) e 804-ACT (87,7?0,49) e inibi??o da enzima colinesterase em % 804-ACT (53.230 ? 4,44). O fracionamento, perfil qu?mico por CLAE/DAD e a caracteriza??o qu?mica do acesso BGA-804, resultou na verifica??o da presen?a de compostos fen?licos, flavonoides e no isolamento e identifica??o do daucosterol oriundo da fra??o 804 CL.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:50:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Guadalupe.pdf: 2696610 bytes, checksum: c3a517f1d7dc8a87a7bf76c7a5e845aa (MD5) Previous issue date: 2010-08-23 / Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior / The advent of new sequencing technologies and the development of computational tools that facilitate the analysis of genomes, generated the exponential growth of genome databases. New approaches in-silico of the comparative genomics use such data in its comparisons. Nevertheless, recent work on the genome of Escherichia coli indicate that the current state of coding sequences (Coding Sequences - CDS) from annotated genomes contain several errors, which need to be verified (Ochman e Davalos 2006). Therefore the correct description of a CDS is important to allow future genomic comparisons. Currently, there is an innovated proposal of the scientific community of biological databases to establish standards for the submission of the draft genome sequences in the new era of sequencing. Within this context, it is highlighted the identification and/or correction of frameshifts during the assembly of genomic sequences. The goal of this work was developing a tool with two comparative methods to identify CDSs with conflicting attributes. It uses the description of conflict to describe attributes such as frameshifts, large insertions or deletions, truncations, etc.. that are detected from a CDS or several CDSs used as references, depending on model. Also, the proposed tool allows to user to view of the results graphically and provide access to other tools, providing support for future friendly and faster genomic analysis. As a model of study, it was used the analysis of CDSs with conflicting attributes of the genome of E. coli strain CFT073 (NCBI) version AE014075.1, (last update date: April 20 of 2006), with this purpose was used as a reference genome of E.coli strain O157: H7 EDL933 version AE005174.2 (last update date: 6 June of 2008). Through this analysis were identified and stored 1865 CDSs (Included possible paralogs) because they present only alignments with coverage exceeding 30% of the CSD of reference. In a more detailed analysis of these results, 144 CDSs startle in the target genome by probably present frameshifts, of which 21 occur in intergenic regions. The tool developed in this work, also was applied to the case study of a genomic region of the bacterium Klebsiella pneumoniae strain KP13. The genome of this bacterium was sequenced in Computational Genomics Unit (UGC) Darcy Fontoura de Almeida LNCC (unpublished data). From the analysis of these genomes, one can conclude the importance of using the tool in the stages of identification, verification and correction of errors in annotation,and thus the need for its inclusion in the sequencing projects that want to reach high standards in the submission of genomic data. / O advento de novas tecnologias de sequenciamento e o desenvolvimento de ferramentas computacionais que facilitam a análise dos genomas gerou o aumento exponencial dos bancos de dados genômicos. As abordagens in-silico da genômica comparativa usam esse tipo de dados nas suas comparações. Trabalhos recentes desenvolvidos sobre o genoma de Escherichia coli indicam que o estado atual das sequências codificantes (CoDing Sequences CDS) de genomas anotados nos bancos de dados contêm erros nas sequências que precisam ser verificados (Ochman e Davalos 2006). Portanto a correta descrição de uma CDS é importante para permitir futuras comparações genômicas. Atualmente existe uma nova proposta da comunidade científica de bancos de dados biológicos para estabelecer padrões para a submissão de sequências dos projetos de genoma na nova era de sequenciamento. Dentro desse contexto, destaca-se a identificação e/ou correção de frameshifts durante o processo de montagem de sequências genômicas. A finalidade deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta com dois métodos comparativos para identificar CDSs com atributos conflitantes. Usa-se a descrição de conflito para descrever atributos como frameshifts , grandes inserções ou deleções, truncamentos, que são detectados a partir de uma CDS ou várias CDSs usadas como referência, dependendo do modelo. Finalmente, a ferramenta proposta permite visualizar os resultados graficamente e fornecer acesso a outras ferramentas, dando suporte para futuras análises genômicas de maneira amigável e rápida. Foi realizada a busca de CDSs com atributos conflitantes no genoma de E. coli estirpe CFT073 (NCBI) versão AE014075.1, (última data de atualização: 20 de abril do 2006), como referência foi usado o genoma da E.coli estirpe O157:H7 EDL933 versão AE005174.2 ( última data de atualização : 6 de junho do 2008). Através dessa análise foram identificadas e armazenadas 1.865 CDSs (incluem-se possíveis parálogos), por apresentarem alinhamentos únicos com cobertura superior a 30% da CDS de referência. Em uma análise mais fina destes resultados, sobressaltam 144 CDSs no genoma alvo que provavelmente apresentam frameshifts , dos quais 21 acontecem em regiões intergênicas. A ferramenta desenvolvida neste trabalho foi também aplicada para o caso de estudo de uma região genômica da bactéria Klebsiella pneumoniae estirpe KP13. O genoma dessa bactéria foi sequenciado na Unidade Genômica Computacional (UGC) Darcy Fontoura de Almeida do LNCC (dados ainda não publicados). A partir das análises destes genomas, pode se concluir a importância do uso da ferramenta nas fases de identificação, verificação e correção de erros de anotação e, portanto a necessidade da sua inclusão em projetos de sequenciamento que desejam atingir altos padrões na submissão de dados genômicos.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:57:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_PORTUGUES_PEDRO_UFF.pdf: 2590907 bytes, checksum: 3b3623c02d38f036f56c8496b6542010 (MD5) Previous issue date: 2011-10-13 / Embora a compreensão dos fenômenos em nível molecular avance rapidamente, pouco se sabe ainda sobre os mecanismos que regulam a estabilidade e resiliência de ecossistemas tais quais, corais, florestas, lagos e oceanos. Modelos de dinâmica populacional são um possível meio para aperfeiçoar o entendimento dos mecanismos subjacentes a esses fenômenos. Estes modelos podem apresentar múltiplos estados de equilíbrio em virtude de características intrínsecas às espécies, bem como em decorrência de perturbações exógenas, como captura, remoção, aporte alóctone de nutrientes, dentre outros. A possibilidade de reversão entre esses estados de equilíbrio é geralmente ditada pela ocorrência da histerese em função da magnitude das perturbações exógenas. Neste trabalho analisam-se a estabilidade, resiliência e histerese em um conjunto de modelos populacionais sob o enfoque de manejo de ecossistemas.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:57:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_caio_godinho_2014.pdf: 2200918 bytes, checksum: aa8817dd5a147c8a2d55413e1a796132 (MD5) Previous issue date: 2014-03-18 / Mycoplasma hyopneumoniae 7448 e uma bactéria patogênica e parasita obrigatória do trato respiratório de suínos. A compreensão de seus mecanismos de regulação gênica é ainda incompleta e incapaz de explicar a dinâmica observada na expressão de seus genes. Diversos elementos podem exercer funções regulatórias da expressão gênica em bactérias, dentre eles os ncRNAs. Este trabalho reporta a identificação e classificaçãao de 48 regiões no genoma de M. hyopneumoniae 7448 suscetíveis a abrigarem novos genes de ncRNA. Para isso foram utilizadas técnicas de modelagem estocástica e diversas outras ferramentas computacionais. Duas importantes ferramentas foram desenvolvidas no decorrer desta dissertação, sendo uma para a inferência de conservação evolutiva em regiões intergênicas e a outra { denominada FraPS { uma melhoria na delimitação genômica dos candidatos a ncRNA. Os resultados corroboram com a hipótese da existência de ncRNAs como elementos reguladores da expressão gênica na bactéria estudada, exercendo papeis fundamentais na sobrevivência e patogenicidade da mesma. Genes de adesinas, lipoproteínas, e do complexo de transporte ABC foram encontrados entre os possíveis genes-alvo a regulação via ncRNA, resultado que auxilia o planejamento de experimentos moleculares para o estudo da regulação por ncRNAs em micoplasmas.

Made available in DSpace on 2015-03-05T16:20:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 20 / Universidade do Vale do Rio dos Sinos / Ninhais são ambientes chaves para aves aquáticas, cuja oferta afeta a riqueza e abundância de aves em escala regional. Este trabalho investiga a hipótese de que a disponibilidade de hábitats de áreas úmidas e seu arranjo espacial na paisagem influenciam a probabilidade de ocorrência de ninhais. Através de questionários, entrevistas e verificações de campo identificamos a localização de ninhais coloniais em um setor da zona costeira do Rio Grande do Sul, sul do Brasil. Comparamos a estrutura do hábitat e da paisagem em três escalas (raios de 1000 m, 3000 m e 5000 m a partir do centro dos ninhais) com igual número de áreas-controle sem presença ninhais. Identificamos a localização de 15 ninhais de aves aquáticas coloniais. À medida que a escala de análise é ampliada, a porcentagem de arrozais aumenta nas paisagens com presença de ninhais, porém se mantém baixa nas paisagens sem ninhais. A porcentagem ocupada por áreas úmidas diminui com o aumento da escala de análise e não varia entre paisagens com ou sem ninh

Submitted by Mariana Dornelles Vargas (marianadv) on 2015-03-17T19:27:53Z No. of bitstreams: 1 efeitos_gradiente.pdf: 1090807 bytes, checksum: f2565ea69e8353336830ebb1453fd5ae (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-17T19:27:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 efeitos_gradiente.pdf: 1090807 bytes, checksum: f2565ea69e8353336830ebb1453fd5ae (MD5) Previous issue date: 2012 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / PROSUP - Programa de Suporte à Pós-Gradução de Instituições de Ensino Particulares / A qualidade das águas em sistemas lóticos ou lênticos sofre grande influência das atividades que são realizadas em suas margens, alterando a estrutura das comunidades biológicas. O presente estudo foi desenvolvido com vistas a avaliar se áreas com diferentes graus de preservação da mata ripária influenciam na estrutura da comunidade fitoplanctônica em arroios. O estudo foi desenvolvido em três arroios do trecho superior da Bacia Hidrográfica do Rio dos Sinos. Em cada arroio foram amostrados quatro áreas sob a influência de diferentes estágios de conservação da mata ciliar, em um gradiente variando do mais preservado (30m de vegetação) ao menos preservado (<5m), sendo as áreas amostradas distantes pelo menos 1 km um dos outros. Foram coletadas amostras em duas estações (inverno - agosto/2010 e verão - janeiro/fevereiro/2011), para análise de variáveis abióticas e biológicas. Os dados obtidos foram tratados através de testes estatísticos do tipo, Análise de Variância Simples (ANOVA one way), Análise de Componentes Principais (ACP), Escalonamento Muldimensional Não Métrico (NMDS) e Análise de Correspondência Canônica (ACC). As análises das variáveis ambientais e bióticas indicaram que a sazonalidade é a principal determinante dos padrões de biomassa e presença ou ausência de espécies, independente do grau de preservação da mata ciliar. As classes Bacillariophyceae, Chlorophyceae e Cyanobacteria constituíram-se nos três principais grupos taxonômicos identificados, sendo que a classe Bacillariophyceae foi dominante. Na avaliação das espécies e dos grupos funcionais, apesar dos três arroios estarem localizados em regiões de cabeceira, os mesmos indicaram contaminação destes ambientes por nutrientes e matéria orgânica, classificando-os nos níveis de trofia entre meso e eutrófico. A comunidade fitoplanctônica dos arroios estudados respondeu satisfatoriamente as condições ambientais, no entanto, não foram significativamente influenciadas pelos diferentes graus de preservação da mata ripária, como era esperado. Porém a tendência de aumento da biomassa, riqueza e diversidade de espécies, e das concentrações de sólidos totais dissolvidos e condutividade, mesmo que não significativas, dão indicativos que os diferentes gradientes de preservação da mata ciliar estão influenciando a qualidade da água nos arroios estudados e consequentemente a estrutura do potamoplâncton. / Water quality in lotic and lentic systems is greatly influenced by the activities performed at their margins, influencing the structure of biological communities. This study was conducted in order to assess whether different degrees of preservation of riparian forest influence potamplankton community structure in subtropical streams. The study was conducted in three streams in the upper region of Rio dos Sinos Basin. Four sampling sites, distant 1 km from each other, with different degrees of riparian forest width, were considered, from the best (30 m) to the less preserved (5 m). Samplings were gathered for abiotic and biological analyses in summer (january/february 2011) and winter (august 2010). Statistical tests were performed Analysis of Variance ? One-way (One-way ANOVA), Principal Component Analisys (PCA), Nonmetric Multidimensional Scaling (NMDS) e Canonical Correspondence Analysis (CCA). Analysis of environmental and biotic variables indicated that seasonality was the main determinant of biomass patterns, regardless of the degree of preservation of riparian vegetation. Bacillariophyceae, Chlorophyceae and Cyanobacteria constituted the three major taxonomic groups identified, and the class Bacillariophyceae was dominant. Descriptors species and functional groups indicated contamination of these environments by nutrients and organic matter. Potamoplankton community of the studied streams responded satisfactorily to environmental conditions, although lack of significant difference among the different degrees of riparian vegetation preservation has been found. Increasing trends on biomass, richness and diversity of species, and concentrations of total solid dissolved and conductivity, might indicate that the different gradients of preservation of riparian vegetation may influence water quality in subtropical streams and therefore the potamoplankton structure.

Submitted by Mariana Dornelles Vargas (marianadv) on 2015-03-18T13:43:18Z No. of bitstreams: 1 uso_assembleia.pdf: 3872403 bytes, checksum: fd9c8055becd08ba193b54a30db28df5 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-18T13:43:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 uso_assembleia.pdf: 3872403 bytes, checksum: fd9c8055becd08ba193b54a30db28df5 (MD5) Previous issue date: 2011-08 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O crescimento populacional tem sido um dos fatores que mais tem gerado uso dos recursos naturais. No Brasil as ameaças aos sistemas hídricos são principalmente ocasionadas pelo uso da água para agricultura e irrigação, levando a alterações do ambiente e por conseqüência da biota. Estudos de Integridade Biótica, utilizando-se da comunidade de peixes tem obtido boas respostas quanto a avaliação do estado da qualidade dos recursos hídricos. O Índice de Integridade Biótica (IBI), definido por KARR como integrador dos fatores ecológicos e ambientais, tem demonstrado capacidade de avaliar a dimensão das perturbações sofridas, e aos poucos as pesquisas adaptaram-se e se propagaram para comunidades em ambientes muito distintos, como por exemplo, lagos, estuários e recifes. Os trabalhos de IBIs aplicados até o momento normalmente avaliam trechos de um rio ou locais muito distintos, e adaptam métricas que consideram apropriadas a cada caso. Neste estudo avaliaram-se 27 pontos amostrados para conhecimento da estrutura da comunidade e espécies ocorrentes e adaptou-se um IBI padronizado com intuito de avaliar distintos ambientes. Foram registrados 62141 indivíduos, de 95 espécies, sendo a espécie mais abundante Hyphessbrycon luetkenii. Inicialmente foram sugeridas 19 métricas, que passaram por um processo seletivo e de avaliação de sensibilidade, que gerou um protocolo padrão de 8 métricas de avaliação do Índice de Integridade Biótica. / Population growth has led to an increased use of natural resources. In Brazil, the threats to water systems are mostly caused by the use of water in agriculture and irrigation, leading to environmental, and, thus, biota changes. Studies on the Index of Biotic Integrity (IBI) using fish communities have helped clarify the status of the quality of water resources. The Index of Biotic Integrity (IBI), defined by KARR as an integrator of ecological and environmental factors has been successfully used to assess the size of the disruption in the environment, and in subsequent studies the IBI was adapted to fish communities in very different environments, such as lakes, estuaries and reefs. The studies conducted so far using protocols for IBI have usually assessed sections of a river or very different sites, and the metrics are adapted according to the case. In the present study, 27 points sampled for the knowledge of the structure of the fish community and the species occurring there were assessed, and a standard IBI was adapted with the purpose of assessing different sites. 62,141 individuals of 95 species were recorded, with Hyphessbrycon luetkenii being the most abundant species. At first, 19 metrics were suggested, which have undergone a process of selection and evaluation of sensitiveness. A standard protocol of eight final metrics for inclusion in the Index of Biotic Integrity was then generated.