Submitted by ADNAN DARIN PEREIRA RODRIGUES null (adnan_vet_@hotmail.com) on 2017-01-11T19:03:06Z No. of bitstreams: 1 Tese Adnan final.pdf: 1685730 bytes, checksum: 40de998620c394242f975108ad983b4d (MD5) / Rejected by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: O arquivo submetido está sem a ficha catalográfica. O arquivo submetido não contém o certificado de aprovação. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija estas informações e realize uma nova submissão com o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-01-12T17:01:13Z (GMT) / Submitted by ADNAN DARIN PEREIRA RODRIGUES null (adnan_vet_@hotmail.com) on 2017-01-13T22:57:11Z No. of bitstreams: 1 Tese Adnan final.pdf: 1752926 bytes, checksum: 70ff15036b7f0b3068bdbdf3049b5df6 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-01-17T16:05:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rodrigues_adp_dr_bot.pdf: 1752926 bytes, checksum: 70ff15036b7f0b3068bdbdf3049b5df6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-17T16:05:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rodrigues_adp_dr_bot.pdf: 1752926 bytes, checksum: 70ff15036b7f0b3068bdbdf3049b5df6 (MD5) Previous issue date: 2016-12-12 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo dessa tese foi avaliar o desempenho reprodutivo de novilhas Bos indicus (BI) e Bos taurus x Bos indicus (CR) submetidas a protocolos de sincronização da ovulação. No Capitulo 2, novilhas BI e CR púberes e pré-púberes foram submetidas a estratégia reprodutiva proposta por Rodrigues et al. (2014) e um grupo de novilhas púberes foram sincronizadas com o protocolo de IATF padrão. No Capítulo 3, novilhas BI e CR foram submetidas a estratégia reprodutiva aos 12 meses de idade. No Capítulo 4, foi avaliado o efeito da concentração circulante de P4 no Dia 9 do protocolo de IATF e tratamento com eCG em novilhas BI e CR. No experimento do Capítulo 2 uma maior porcentagem de novilhas BI estavam pré-púberes no início do experimento comparadas as novilhas do grupo CR. A taxa de indução não foi diferente entre novilhas BI e novilhas CR. A raça interferiu na prenhez à IATF na Fazenda 1, mas não interferiu na Fazenda 2. Novilhas que não responderam ao protocolo de indução tiveram menor taxa de prenhez à IATF em relação aos demais grupos experimentais. No experimento do Capítulo 3, a presença de CL no D0 não diferiu entre os grupos genéticos. Animais mais pesados apresentaram maior presença de CL, independentemente de raça. Houve efeito de CL no D0 na taxa de prenhez à IATF. Não foi detectada interação entre presença de CL e raça na prenhez, sendo que novilhas BI tiveram menor P/IA do que as novilhas CR. Houve interação entre peso e CL no D0 na P/IA, sendo que em novilhas com CL no D0 o peso não interferiu na probabilidade de prenhez, entretanto para animais sem CL quanto maior peso corporal, maior a probabilidade de prenhez. No experimento do Capítulo 4, a concentração de progesterona no Dia 9 com maior especificidade e sensibilidade para taxa de prenhez foi 2,03 ng/mL. O diâmetro folicular no Dia 9 foi maior para novilhas CR do que para novilha BI e para BAIXA P4 comparado a ALTA P4. O diâmetro folicular no Dia 11 tendeu a ser maior para a BAIXA P4 do que ALTA P4. A probabilidade de prenhez foi negativamente associada à concentração de P4 no Dia 9. A taxa de ovulação foi maior para o tratamento eCG comparado ao Controle. Novilhas CR tiveram maior taxa de concepção e maior taxa de prenhez do que novilhas BI. Novilhas do grupo BAIXA P4 tiveram maiores taxas de concepção e prenhez do que ALTA P4. Conclui-se que é possível induzir a primeira ovulação em novilhas pré-púberes Bos indicus e Bos taurus x Bos indicus, e realizar o protocolo de IATF logo após a indução, sendo que o protocolo apresenta bons resultados em novilhas de 12 a 27 meses de idade, desde que atendidas as exigências nutricionais. / The aim of this dissertation was to evaluated the reproductive performance of Bos indicus (BI) and Bos taurus x Bos indicus heifers submitted to a synchronization of ovulation protocol. In Chapter 2, pubertal and prepubertal BI and CR heifers were submitted to the reproductive program proposed by Rodrigues et al. (2014) and a group of pubertal heifers were synchronized with the standard TAI protocol. In Chapter 3, pubertal and prepubertal BI and CR heifers were submitted to the reproductive program at the age of 12 months. In Chapter 4, was evaluated the effects of progesterone concentration at Day 9 of the TAI protocol and treatment with eCG in BI and CR heifers. In the experiment of Chapter 2 a greater number of BI heifers were pubertal at the beginning of the experimental period than CR heifers. The induction rate did not differ between BI and CR heifers. Breed of the heifers impacted pregnancy rate to TAI in Farm 1, but not in Farm 2. Heifers that did not respond to the induction protocol had lower pregnancy rate when compared to the others experimental groups. In the experiment of Chapter 3, the CL presence on D0 did not differ between breeds. Independent of the genetic group heavier heifers were more likely to have a CL on D0. There was an effect of CL presence at D0 on P/AI vs. Without CL. The interaction between CL presence on D0 and genetic group did not affect P/AI, and BI heifers had lower P/AI in comparison to CR heifers. An interaction between CL presence on D0 x weight was detected for P/AI. In heifers with CL, the weight did not have effect on P/AI; however, in heifers without CL, heavier heifers were more likely to become pregnant. In the experiment of Chapter 4, the progesterone concentration that has more sensibility and specify for pregnancy at Day 9 was 2.03 ng/mL. Follicle diameter at D9 was greater for CR heifers than BI heifers and in Low P4 compared to High P4. The follicle diameter at D11 tended to be greater for Low P4 than High P4. Probability of pregnancy was negatively associated with P4 level at Day 9. Ovulation rate was greater for eCG compared to Control. Crossbred heifers had greater conception rate and greater pregnancy rate than BI. LOW P4 heifers have greater conception and pregnancy rate than HIGH P4. In conclusion, it is possible to induce first ovulation in BI and CR heifers followed by the TAI protocol with satisfactory pregnancy rates in heifers from 12 to 27 months old, after puberty induction, if the nutritional requirements are achieved. / FAPESP: 2014/05270-9

Steers (n = 77) and heifers (n = 68) were assigned randomly to one of three treatment groups. Treatment groups were defined as: no implant, implanted twice with trenbolone acetate (Revalor S or H), or implanted twice with estrodial benzoate (Synovex S or H). Animals were fed to an estimated 10 mm backfat thickness and based on visual appraisal, were assigned a harvest date. Carcass characteristics, color space values, sarcomere length, fat and moisture determination, Warner-Bratzler shear force, and protein degradation were all measured. Implanted animals, as a whole, exhibited heavier hot carcass weights and larger ribeye areas than non-implanted animals. Animals implanted with Revalor displayed significantly lower marbling scores and lower yield grades than those from control or Synovex groups. The distribution of quality grades within treatment groups shifted, with implant groups displaying higher percentages of Select carcasses. Gender impacted percentage of extractable fat and marbling scores, with heifers displaying higher values than steers for both measurements. Both implant groups displayed higher (P < 0.05) Warner-Bratzler shear values following a 0- and 14-d aging periods. However, following the 21-d aging period, differences in tenderness were no longer present between non-implanted and implanted animals. Synovex treated animals displayed longer (P < 0.01) sarcomere lengths than control or Revalor. Differences (P < 0.001) in protein degradation were found between treatment groups. Across gender groups, the non-implanted cattle displayed the greatest amount of degradation (62%), followed by Synovex (48%,) and lastly Revalor (33%), all of which were different (P < .05) from each other. These results indicate that use of anabolic implants positively impacted lean muscle growth, yet was a detriment to quality. Also, tenderness was negatively impacted by the use of these compounds. However, this study found by aging product for at least 21 days, tenderness differences between implanted and non-implanted animals were significantly mitigated.

O gado zebu (Bos indicus) é predominante em todo o mundo. Atualmente, no Brasil, o rebanho de bovinos e zebuínos é composto por aproximadamente 170 milhões de indivíduos, no qual, 80% são zebuínos ou animais de raças cruzadas com zebu. O principal objetivo deste estudo foi determinar a possibilidade da utilização de marcadores moleculares de bovinos na identificação genética de zebuínos. A confirmação desta possibilidade seria de extrema valia, já que a quantidade de informações sobre o genoma zebuíno é limitada e metodologias específicas de identificação de marcadores genéticos para raças zebuínas são raras. Assim, o DNA de 65 zebus, de 4 raças diferentes (Gir, Tabapuã, Nelore e Brahman), foi extraído a partir de sangue aplicado em papel filtro, utilizando o “kit” DNA IQTM SYSTEM (Promega®). Após a extração de DNA, foi feito um PCR Multiplex utilizando o “kit” StockMarks® (Applied Biosystems®), o qual amplifica um total de 11 loci (BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA122, TGLA126, TGLA227 e TGLA53). Os fragmentos gerados pela PCR foram analisados por eletroforese capilar utilizando o analisador genético ABI Prism 3100 (Applied Biosystems®) e o programa GeneScan® v.3.7 (Applied Biosystems®). A freqüência dos marcadores e os índices de variabilidade genética foram calculados utilizando o programa Microsatellite Toolkit v.3.1 e o equilíbrio de Hardy-Weinberg foi determinado através do programa GENEPOP v.3.4. Através destas técnicas foi possível demonstrar que os marcadores moleculares utilizados para identificação genética de bovinos podem também ser utilizados para a realização da técnica de identificação genética de zebuínos Além disso, foi possível demonstrar a freqüência alélica na população de zebuínos analisada como um todo, assim como foi determinada a freqüência alélica para os diferentes marcadores moleculares dentro das 4 raças estudas. Considerando o total de 100 diferentes alelos identificados entre os 11 STR (Short Tandem Repeats) analisados, foi possível observar que a heterozigosidade esperada (He) foi relativamente alta na população analisada, assim como na análise por raça. Estes dados indicam alto grau de diversidade genética nas diferentes raças. Neste sentido, a raça Brahman apresentou a menor diversidade (0,60) e a raça Tabapuã, a maior (0,69). Contudo, estudos complementares são necessários, a fim de confirmar as freqüências alélicas estabelecidas, uma vez que os resultados encontrados no presente trabalho referem-se a um número relativamente pequeno de zebuínos, quando comparados com o total de zebus encontrados no rebanho brasileiro.

O gado zebu (Bos indicus) é predominante em todo o mundo. Atualmente, no Brasil, o rebanho de bovinos e zebuínos é composto por aproximadamente 170 milhões de indivíduos, no qual, 80% são zebuínos ou animais de raças cruzadas com zebu. O principal objetivo deste estudo foi determinar a possibilidade da utilização de marcadores moleculares de bovinos na identificação genética de zebuínos. A confirmação desta possibilidade seria de extrema valia, já que a quantidade de informações sobre o genoma zebuíno é limitada e metodologias específicas de identificação de marcadores genéticos para raças zebuínas são raras. Assim, o DNA de 65 zebus, de 4 raças diferentes (Gir, Tabapuã, Nelore e Brahman), foi extraído a partir de sangue aplicado em papel filtro, utilizando o “kit” DNA IQTM SYSTEM (Promega®). Após a extração de DNA, foi feito um PCR Multiplex utilizando o “kit” StockMarks® (Applied Biosystems®), o qual amplifica um total de 11 loci (BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA122, TGLA126, TGLA227 e TGLA53). Os fragmentos gerados pela PCR foram analisados por eletroforese capilar utilizando o analisador genético ABI Prism 3100 (Applied Biosystems®) e o programa GeneScan® v.3.7 (Applied Biosystems®). A freqüência dos marcadores e os índices de variabilidade genética foram calculados utilizando o programa Microsatellite Toolkit v.3.1 e o equilíbrio de Hardy-Weinberg foi determinado através do programa GENEPOP v.3.4. Através destas técnicas foi possível demonstrar que os marcadores moleculares utilizados para identificação genética de bovinos podem também ser utilizados para a realização da técnica de identificação genética de zebuínos Além disso, foi possível demonstrar a freqüência alélica na população de zebuínos analisada como um todo, assim como foi determinada a freqüência alélica para os diferentes marcadores moleculares dentro das 4 raças estudas. Considerando o total de 100 diferentes alelos identificados entre os 11 STR (Short Tandem Repeats) analisados, foi possível observar que a heterozigosidade esperada (He) foi relativamente alta na população analisada, assim como na análise por raça. Estes dados indicam alto grau de diversidade genética nas diferentes raças. Neste sentido, a raça Brahman apresentou a menor diversidade (0,60) e a raça Tabapuã, a maior (0,69). Contudo, estudos complementares são necessários, a fim de confirmar as freqüências alélicas estabelecidas, uma vez que os resultados encontrados no presente trabalho referem-se a um número relativamente pequeno de zebuínos, quando comparados com o total de zebus encontrados no rebanho brasileiro.

O gado zebu (Bos indicus) é predominante em todo o mundo. Atualmente, no Brasil, o rebanho de bovinos e zebuínos é composto por aproximadamente 170 milhões de indivíduos, no qual, 80% são zebuínos ou animais de raças cruzadas com zebu. O principal objetivo deste estudo foi determinar a possibilidade da utilização de marcadores moleculares de bovinos na identificação genética de zebuínos. A confirmação desta possibilidade seria de extrema valia, já que a quantidade de informações sobre o genoma zebuíno é limitada e metodologias específicas de identificação de marcadores genéticos para raças zebuínas são raras. Assim, o DNA de 65 zebus, de 4 raças diferentes (Gir, Tabapuã, Nelore e Brahman), foi extraído a partir de sangue aplicado em papel filtro, utilizando o “kit” DNA IQTM SYSTEM (Promega®). Após a extração de DNA, foi feito um PCR Multiplex utilizando o “kit” StockMarks® (Applied Biosystems®), o qual amplifica um total de 11 loci (BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA122, TGLA126, TGLA227 e TGLA53). Os fragmentos gerados pela PCR foram analisados por eletroforese capilar utilizando o analisador genético ABI Prism 3100 (Applied Biosystems®) e o programa GeneScan® v.3.7 (Applied Biosystems®). A freqüência dos marcadores e os índices de variabilidade genética foram calculados utilizando o programa Microsatellite Toolkit v.3.1 e o equilíbrio de Hardy-Weinberg foi determinado através do programa GENEPOP v.3.4. Através destas técnicas foi possível demonstrar que os marcadores moleculares utilizados para identificação genética de bovinos podem também ser utilizados para a realização da técnica de identificação genética de zebuínos Além disso, foi possível demonstrar a freqüência alélica na população de zebuínos analisada como um todo, assim como foi determinada a freqüência alélica para os diferentes marcadores moleculares dentro das 4 raças estudas. Considerando o total de 100 diferentes alelos identificados entre os 11 STR (Short Tandem Repeats) analisados, foi possível observar que a heterozigosidade esperada (He) foi relativamente alta na população analisada, assim como na análise por raça. Estes dados indicam alto grau de diversidade genética nas diferentes raças. Neste sentido, a raça Brahman apresentou a menor diversidade (0,60) e a raça Tabapuã, a maior (0,69). Contudo, estudos complementares são necessários, a fim de confirmar as freqüências alélicas estabelecidas, uma vez que os resultados encontrados no presente trabalho referem-se a um número relativamente pequeno de zebuínos, quando comparados com o total de zebus encontrados no rebanho brasileiro.

Correlations between cattle disposition and meat quality were expected to be found, as well as differences in meat quality traits among contemporary groups, sires, and families nested within sires. Temperament effects on meat quality were evaluated in Nellore × Angus F2 cross cattle (n = 238) over a 3-yr period, with harvests twice a year. Five aspects of temperament -- aggressiveness, nervousness, flightiness, gregariousness, and overall temperament -- were evaluated at weaning and yearling ages, as well as an overall temperament score at slaughter. USDA quality grade, fat thickness, adjusted fat thickness, hot carcass weight, USDA yield grade, and chemical fat were correlated negatively (P < 0.05) with weaning temperament scores, aggressiveness, nervousness, flightiness, gregariousness, and overall temperament. No significant correlation was found between Warner-Bratzler shear and weaning temperament traits. USDA quality grade and live weight were correlated negatively (P < 0.05) with yearling temperament scores, nervousness, flightiness, gregariousness, overall temperament score as well as the temperament score observed at slaughter. Fat thickness and adjusted fat thickness also were correlated negatively (P < 0.05) with yearling gregariousness, yearling overall, and slaughter overall temperament. Yearling gregariousness was correlated positively (P < 0.05) with Warner-Bratzler shear from both ES and NON carcasses. Least squares mean differences were evaluated among contemporary groups, sires, and families nested within sires for overall temperament traits and meat quality traits. Contemporary group differences found were thought to be explained by environmental factors, as seen in contemporary group 5, which had the smallest ribeye possibly caused by the shortest feeding period. Steers sired by 297J had the lowest (calmest) temperament scores, most 12th rib fat, highest numerical yield grade, and the heaviest weights. Sire 437J had steers with the highest (wildest) temperament scores, the least fat and lowest numerical yield grade. This population was designed to identify QTL for economically important traits and appears to be useful for this purpose because of the differences found both between and within families.

Reproductive, maternal and weight traits were analyzed for Angus (A), Brahman (B), Hereford (H), and Nellore (N) straightbred cows; F1 NA; 3/8N 5/8A cows; and four breed composite cows (BANH) at the McGregor Research Station in Central Texas. Heterosis was estimated for calf crop born (CCB) (n = 1,698), calf crop weaned (CCW) (n = 1,698), calf survival (CS) (n = 1,388), birth weight (BW) (n = 1380), weaning weight (WW) (n = 1,198), and cow weight at palpation (PWT) (n = 1,929) by linear contrasts for cow breed and cow breed group. F1 NA and the quarter breed composite BANH dam group expressed significant (P < 0.0001) heterosis for calf crop born and calf crop weaned. The 3/8 N 5/8 Aa produced by matings of 3/4 A 1/4 N bulls to NA dams expressed significantly more heterosis for CCB (P < 0.0001) and CCW (P < 0.01), while the 3/8 N 5/8 Ac dams expressed less heterosis than predicted from the dominance model for both traits. For CS the 3/8 N 5/8 Aa expressed the same amount of heterosis as predicted from the dominance model of 0.05, while the 3/8 N 5/8 Ab and 3/8 N 5/8 Ac dams expressed less heterosis than predictions based on the dominance model. Heterosis estimates were only significantly higher (P < 0.10) for BANHb dams than expectations from the dominance model. For BW all the BANH cows expressed significant heterosis except for the BANH2 cows which expressed significant (P < 0.05) negative heterosis of -0.96 kg. Calves out of F1 NA cows were heaviest at weaning with 239 kg. All BANH cows expressed significant (P < 0.0001) heterosis for weaning weight except for the BANHc cows. These heterosis estimates were higher than those expected from the dominance model for BANHb and BANH2 cows, while the heterosis estimate was slightly lower in BANHa cows and similar for BANHc cows. All 3/8 N 5/8 A cows expressed less heterosis for WW than prediction from the dominance model. Nellore cows were the heaviest at four years of age with 542 kg. Only the BANHb and BANHc cows expressed significant (P < 0.05) heterosis for PWT. None of the 3/8 N 5/8 A cows expressed heterosis for cow weight at palpation. Results from this study showed that heterosis levels expressed by the different crossbred cow types were generally equal or higher to those predicted by the dominance model.

O presente estudo está apresentado em Capítulo 1 (Divergência folicular; DF) e 2 (Capacidade ovulatória), e em cada estão incluídos dois experimentos [1 - em bubalinos (Bubalus bubalis); 2 - em zebuínos (Bos indicus)]. Os objetivos do Capítulo 1 foram determinar o momento e diâmetro na DF e avaliar o perfil das concentrações plasmáticas de FSH e LH próximo à seleção folicular. No Experimento 1, a ovulação foi considerada o dia zero (D0), a partir do qual 10 novilhas Murrah foram examinadas por ultra-sonografia (US) a cada oito horas (h) até o D4 e, posteriormente, a cada 24h até o D6. A avaliação da DF foi realizada por análise visual do gráfico de cada novilha (Ginther et al., 1996) e regressão linear segmentada (Bergfelt et al. 2003). As amostras de sangue, para dosagem de FSH e LH, foram colhidas com intervalos de 8h nas primeiras 24h pós-ovulação. A partir deste momento foram feitas colheitas a cada 4h até o D4 e após, a cada 12h até o D6. No método visual, o intervalo ovulação-DF, e o diâmetro dos folículos dominante (FD) e subordinado (FS) foram de, respectivamente, 63,2±5,7h; 7,2±0,3mm e 6,4±0,3mm (média±EPM). No método matemático estes mesmos parâmetros foram de, respectivamente, 61,9±4,9h; 7,3±0,3mm e 6,3±0,3mm. Não houve diferença entre os dois métodos de avaliação da DF (P>0,05). As concentrações plasmáticas de FSH e LH não variaram ao longo do tempo (P>0,05). No Experimento 2, 12 novilhas Nelore foram submetidas à US a cada 12h até o D5 e estes mesmos intervalos foram adotados para as colheitas de sangue (dosagem de FSH e LH). No método visual, o intervalo ovulação-DF, e os diâmetros do FD e FS foram de, respectivamente, 61,0±5,8h; 6,2±0,2mm e 5,8±0,2mm. No método matemático estes mesmos parâmetros foram de, respectivamente, 57,2±6,0h; 6,2±0,3mm e 5,9±0,3mm. Não houve diferença entre os métodos (P>0,05). As concentrações plasmáticas de FSH e LH não variaram ao longo do tempo (P>0,05). No Capítulo 2, o objetivo foi avaliar o diâmetro no qual o FD adquire capacidade ovulatória após administração de 25mg de LH. Os grupos foram formados de acordo com o diâmetro do FD no momento do tratamento com LH (7,0-8,4mm; 8,5-10,0mm e >10,0mm, em ambos os experimentos). No Experimento 1, foram utilizadas 29 novilhas bubalinas Murrah x Mediterrâneo. A partir do D3 (pós-ovulação), os exames US foram realizados a cada 12h até 48h do tratamento com LH. Nos grupos 7,0-8,4; 8,5-10,0 e >10,0mm, os diâmetros foliculares no momento da aplicação do LH foram de 7,8c±0,1; 9,3b±0,2 e 11,0a±0,3mm e as taxas de ovulação de 0,0%b (0/10); 50,0%a (5/10) e 55,6%a (5/9), respectivamente. No Experimento 2, 29 novilhas Bos indicus foram monitoradas por US a cada 24h a partir da ovulação até o tratamento com LH, e então a cada 12h durante 48h. Nos grupos 7,0-8,4; 8,5-10,0 e >10,0mm, os diâmetros foliculares no momento da aplicação do LH foram de 7,6c±0,1; 9,6b±0,1 e 10,9a±0,2mm e as taxas de ovulação de 33,3%b (3/9); 80,0%a (8/10) e 90,0%a (9/10), respectivamente. / Present study is presented in Chapter 1 (Follicle deviation; FD) and 2 (Ovulatory capacity). Each chapter includes two experiments [1 - in buffaloes (Bubalus bubalis); 2 - in zebu cattle (Bos indicus)]. In Chapter 1, aims were to determine moment and diameter deviation and to evaluate FSH and LH plasmatic profiles encompassing follicle selection. In Experiment 1, ovulation was considered day 0 (D0). From D0, 10 Murrah heifers were examined by ultrasound (US) each eight hours (h) until D4 and then, every 24h until D6. FD evaluation was performed by visual analysis (Ginther et al., 1996) and by segmented linear regression (Bergfelt et al., 2003). Blood samples were harvested each 8h in the first 24h post ovulation. From this moment blood collections were performed every 4h until D4 and after that, each 12h until D6. Interval ovulation-FD, dominant (DF) and subordinate follicle (SF) diameters, by visual method, were, respectively, 63.2±5.7h; 7.2±0.3mm and 6.4±0.3mm (mean±SEM). These same end points, by mathematical method, were, respectively, 61.9±4.9h; 7.3±0.3mm and 6.3±0.3mm. No differences between both methods of FD evaluation (P>0.05) were found. No changes in plasmatic FSH and LH levels along the time (P>0.05) were found. In Experiment 2, 12 Nelore heifers were submmited to US each 12h until D5, and these same intervals were used to blood harvests (FSH and LH profiles). Interval ovulation-FD, dominant (DF) and subordinate follicle (SF) diameters, by visual method, were, respectively, 61.0±5.8h; 6.2±0.2mm and 5.8±0.2mm. These same end points, by mathematical method, were, respectively, 57.2±6.0h; 6.2±0.3mm and 5.9±0.3mm. No differences between both methods of FD evaluation (P>0.05) were found. No changes in plasmatic FSH and LH levels along the time (P>0.05) were found. In Chapter 2, aim was to evaluate diameter in which DF acquires ovulatory capacity after administration of 25mg of LH. The animals were assigned in groups according to DF diameter at LH treatment (7.0-8.4mm; 8.5-10.0mm and >10.0mm, in both experiments). In Experiment 1, 29 Murrah x Mediterrâneo heifers were used. From D3 (post ovulation), US examinations were performed each 12h until 48h after LH treatment. Follicle diameters at LH chalenge in groups 7.0-8.4mm, 8.5-10.0mm and >10.0mm, were 7.8c±0.1, 9.3b±0.2 and 11.0a±0.3mm, and ovulation rates were 0.0%b (0/10), 50.0%SUP>a (5/10) and 55.6%a (5/9), respectively. In Experiment 2, 29 Bos indicus heifers were monitored by US every 24h from ovulation until LH chalenge, and then each 12h during 48h. Follicle diameters at LH treatment in groups 7.0-8.4mm, 8.5-10.0mm and >10.0mm, were 7.6c±0.1, 9.6b±0.1 and 10.9a±0.2mm, and ovulation rates were 33.3%b (3/9), 80.0%a (8/10) and 90.0%a (9/10), respectively

Objetivou-se neste trabalho avaliar algumas características da carne de bovinos Nelore, analisando as diferenças entre as progênies (machos e fêmeas) de touros representativos das principais linhagens desta raça e comparar as progênies (machos e fêmeas) dos grupos genéticos Nelore, ½ Angus x Nelore e ½ Brahman x Nelore. Quartorze touros, raça Nelore, dois Aberdeen Angus e um Brahman foram acasalados com 400 vacas comerciais da raça Nelore formando progênies de Nelore (NE), ½ Aberdeen Angus x Nelore (AN) e ½ Brahman x Nelore (BN). Os animais foram confinados por 127 dias, recebendo alto teor de concentrado. Foram abatidos 293 bovinos, determinados o pH e a temperatura das carcaças e avaliados o grau de acabamento das carcaças. Após 24 horas de resfriamento calculou-se o rendimento das carcaças (RC), a área de olho de lombo (AOL) a espessura de gordura subcutânea (EGS) e foi determinado o índice de marmorização no m. Longissimus dorsi. Retiraram-se duas amostras desse músculo, as quais foram maturadas por 14 dias para as análises de força de cisalhamento (FC), perda de água por exsudação (PAE), perdas ao cozimento (PAC) e índice de fragmentação miofibrilar (MFI). Houve interação entre sexos e gupos genéticos para as características de peso vivo final (PVF), rendimento de carcaça (RC) e área de olho de lombo (AOL). Houve diferenças entre sexos e grupos genéticos para o peso de carcaça quente (PCQ) e para a espessura de gordura subcutânea (EGS). A marmorização e a força de cisalhamento foram influenciadas pelos grupos genéticos. O pH, e a temperatura (1 hora pós-morte) não foram influenciados pelos sexos e grupos genéticos, assim como as perdas ao cozimento (PAC) e o índice de fragmentação miofibrilar (MFI). O sexo influenciou nas características de acabamento das carcaças, pH e temperatura (24 horas pós-morte) e nas perdas de água por exudação (PAE). Quando analisadas as diferenças entre as progênies de touros representativos das principais linhagens da raça Nelore houve interação entre sexo e touros para o PVF, PCQ e EGS. Houve diferenças entre sexos e touros para as características de acabamento, RC, AOL e marmorização. Não foram detectadas diferenças entre sexos e entre touros para o pH e temperatura (1 hora pós-morte), PAC e maciez por meio da força de cisalhamento. O sexo influenciou o pH e a temperatura (24 horas pós-morte), assim como a PAE e o MFI do m. Longissimus dorsi maturado por 14 dias também foram influenciados. Constatou-se superioridade dos animais cruzados, em relação aos zebuínos puros, quanto a algumas características de qualidade da carne, com variação dentro da raça Nelore. Foram identificados touros, cujos filhos produziram carne com os melhores padrões de qualidade para o mercado mundial. / This work aimed to evaluate some meat characteristics of Nellore cattle. The differences among the progenies (males and females) of representative sires of the main lines of this breed and also of Nellore, ½ Angus ½ Nellore and ½ Brahman ½ Nellore genetic groups were analyzed. Fourteen Nellore, two Aberdeen Angus and one Brahman bull, were mated to 400 Nellore cows to obtain the Nellore, ½ Angus ½ Nellore and ½ Brahman ½ Nellore progenies. The animals were fed on feedlot during 127 days with high concentrate diets and after the slaughter of 293 animals the pH, temperature and classification of the carcass was performed. After 24 hours chilling the carcass dressing percentage, rib eye area, fat thickness and marbling index of the Longissimus dorsi m. were determined. Two samples of this muscle were collected and aged during 14 days for shear force, water loss, cocking loss and myofribrilar fragmentation index (MFI) determination. There was an interaction between sex ad genetic groups for final live weight, carcass dressing percentage and rib eye area. There were differences between sex and genetic groups in carcass weight and fat thickness. Marbling and shear force were affected by genetic group. The pH and the temperature one hour after slaughter were not affected by sex and genetic group, as well as cocking loss and myofibrilar fragmentation index. Sex affected the finishing characteristics of the carcass, the pH and temperature 24 hours after slaughter and the water loss. Among the progeny of Nellore sires there was an interaction between sex and bull for final live weight, carcass weight and fat thickness. There were differences between sex and sires in the finishing characteristics, carcass dressing percentage, rib eye area and marbling. No differences were detected between sex and sires in pH and temperature one hour after slaughter, cocking loss and tenderness with Warner Bratzler Shear Force. Sex affected pH and temperature 24 hours after slaughter, as well as water loss and MFI of the Longissimus dorsi m. were affected. It was observed superiority of the crossbred steers in some meat quality characteristics, but also large variation inside the Nellore breed. The progeny of some Nellore sires produced meat with enough quality for the world market.

Em eucariotos, o DNA é organizado juntamente com histonas em um complexo nucleoproteico conhecido como cromatina, cuja unidade fundamental corresponde aos nucleossomos. A cromatina apresenta-se de duas maneiras: eucromatina, região estruturalmente menos condensada e, portanto, mais facilmente transcrita, e heterocromatina, região muito condensada e transcricionalmente silenciosa. Na forma de eucromatina, o acesso dos fatores de transcrição a regiões de DNA livres de nucleossomos é facilitado, enquanto que na forma de heterocromatina os fatores de transcrição não conseguem acessar o DNA para ativar ou reprimir a expressão gênica inferindo, assim, que o grau de compactação da cromatina interfere na regulação da expressão gênica e que o nucleossomo atua como silenciador gênico. Neste contexto, os objetivos foram identificar, mapear e caracterizar regiões em eucromatina na musculatura esquelética de bovinos da raça Nelore. As análises foram realizadas em relação ao músculo Longissimus dorsi pela técnica Assay for Transposase-Accessible Chromatin (ATAC-Seq), capaz de isolar regiões livres de nucleossomos a partir do mecanismo enzimático de transposição. A fim de otimizar o protocolo dessa metodologia para tecido muscular, foram testadas concentrações de 50 mil, 75 mil e 100 mil núcleos tratados com transposase. Destes, foram encontrados 6.811, 11.121 e 11.473 picos de eucromatina, respectivamente, e 6.212 regiões de cromatina aberta foram coincidentes nas três amostras. A associação entre regiões eucromáticas, expressão gênica e gordura intrasmuscular foi confirmada a partir da análise de sobreposição com transcriptional start sites (TSS), genes expressos em músculo esquelético, genes diferencialmente expressos (GDE) para gordura intramuscular e regiões de expression quantitative trait loci (eQTL) de tecido muscular reforçando, assim, o potencial regulatório das regiões de eucromatina. / In eukaryotes, DNA is organized along with histones in nucleoproteins complexes known as chromatin, which has nucleosomes as their fundamental unit. Chromatin exists in two forms: euchromatin, corresponding to a lightly condensed structure and an easily transcribed region, and heterochromatin, a highly condensed and transcriptionally silent region. In euchromatin form, transcription factors have free access to nucleosome-depleted DNA regions, while in heterochromatin the transcription factors can not access the DNA for activate or repress genic expression, which suggests that the chromatin compaction degree interferes with regulation of gene expression and that nucleosomes act as gene silencer. In this context, the aims of the present project were to identify, map and characterize euchromatin regions in the skeletal musculature of Nellore cattle. Analyzes were performed considering the muscle Longissimus dorsi using Assay for Transposase-Accessible Chromatin technique (ATAC-Seq), which isolates nucleosome-depleted regions throught transposition enzymatic mechanism. Differente transposase-treated nuclei concentrations were tested: 50 thousand, 75 thousand and 100 thousand. From these, 6.811, 11.121, and 11.473 euchromatin peaks were found, respectively, and 6.212 open chromatin regions were coincident among them. The association between euchromatic regions, gene expression and intrasmuscular fat was confirmed from the overlap analysis with transcriptional start sites (TSS), genes expressed in skeletal muscle, differentially expressed genes (GDE) for intramuscular fat and regions of expression quantitative trait loci (eQTL) of muscle tissue, reinforcing the regulatory potential of the euchromatin regions.