Dez vacas Gir foram adaptadas em tie-stall por 28 dias (Fase I/ pré-tratamento/ dias -28 a -1), sendo submetidas a duas sessões de OPU (dias -14 e -7). Na Fase II (tratamento/ dias 0 a 28) as mesmas foram divididas em Controle (GC/n=5) e Estresse (GE/n=5). O GC permaneceu em normotermia e o GE foi submetido a estresse calórico (EC) em câmara climática com temperatura e umidade controladas [38°C e 80% UR (DIA); 30°C e 80% UR (NOITE)], por 28 dias, procendendo-se, nesta fase, cinco OPU/fêmea. Na Fase III (pós-tratamento / dias 28 a 147) todas as fêmeas retornaram à normotermia (ambiente), sendo realizadas mais 17 OPU/fêmea. Diariamente foram registradas as temperaturas de bulbo seco (TBS) e úmido (TBU) e o índice de temperatura e umidade (ITU). As respostas fisiológicas avaliadas foram consumo de matéria seca (CMS), freqüência respiratória (FR), temperatura retal (TR), temperatura cutânea (TC), taxa de sudação (TS) e concentrações de cortisol e progesterona (P4). Fase luteínica foi definida como o período compreendido entre colheitas com P4 <1,0ng/mL. Semanalmente, com auxílio de um ultra-som (Scanner 200s) equipado com transdutor setorial intravaginal de 7,5MHz, foram aferidas a população folicular e o diâmetro dos dois maiores folículos. Em seguida, os folículos &ge;3mm foram puncionados e os oócitos recuperados foram avaliados morfologicamente, selecionados, maturados, fertilizados e cultivados in vitro. Os efeitos das variáveis classificatórias (animal, tratamento, fase e semana/sessão de OPU) sobre as variáveis resposta, e suas interações, foram analisadas por ANOVA para medidas repetidas no tempo (PROC MIXED do SAS®) e pelo teste de Qui-quadrado, com significância de 5%. Um animal foi excluído do GE após seis sessões, permanecendo somente quatro animais no GE e cinco no GC. O ITU durante o tratamento foi aumentado no GE em relação ao GC (93,1±0,15 vs. 73,6±0,5, respectivamente; P<0,05), acompanhado de uma elevação altamente significativa na FR, TR e TC (P<0,0001), caracterizando EC efetivo no grupo tratado. Na Fase II o GE apresentou CMS inferior ao GC (6,9±0,2 vs. 8,0±0,3, respectivamente; P<0,05). Nas fases pré e pós-estresse todas as variáveis climáticas e fisiológicas foram similares (P>0,05) entre tratamentos. Não houve efeito do EC na TS e nas concentrações de cortisol. O EC ocasionou longos períodos de aciclicidade (P4 <1ng/mL) e ciclos de curta duração (GE; 37,5% vs. GC; 8,6%; P<0,001). Houve efeito de sessão de OPU, mas não de tratamento no número de folículos visualizados e CCO\'s recuperados. Houve aumento no diâmetro folicular e codominância no GE. O percentual de CCO\'s selecionados para MIV e a taxa de clivagem não sofreram efeito do EC, contudo houve efeito imediato e tardio na taxa de produção de blastocistos, sendo de 35,5% no GE vs. 25,0% no CG (P=0,15) na fase II, e 27,2% vs. 13,3% (P<0,05) para os respectivos grupos, na fase III. De acordo com os dados aqui apresentados conclui-se que o EC em Bos indicus afetou negativamente a dinâmica ovariana, ocasionando falha no mecanismo de dominância folicular e diminuição na produção in vitro de embriões por um período superior a 105 dias. / Ten Gir (Bos indicus) cows were kept in tie-stalls for 28 days (Phase I/ before-trial/ days -28 to -1). Cows were submitted to two OPU sessions (days -14 and -7). In Phase II (trial/ days 0 to 28), cows were divided in Control (C/n=5) and Heat-stressed (HS/n=5). The CG remained in thermoneutral environment and the HS was kept under heat-stress in environmental chamber with controlled temperature and humidity [38°C and 80%UR (DAY), 30°C and 80%UR (NIGHT)], for 28 days. During this phase five OPU sessions were accomplished. In Phase III (post-trial/ days 28 to 147) all cows returned to thermoneutral environmental temperatures and 17 OPU sessions were performed. The dry (DBT) and humid (HBT) bulb temperatures were daily measured and obtained the temperature-humidity index (THI). Physiological responses as dry matter intake (DMI), respiratory frequency (RF), rectal temperature (RT), skin temperature (ST), sweating rate (SR), plasma cortisol and progesterone (P4) were assessed. Luteal phase was defined as the period between two samples with P4 below 1.0ng/mL. Once a week, prior to OPU procedure, the number of follicles in the ovary and the diameter of the two biggest follicles were evaluated using an ultrasound (Scanner 200s, 7.5MHz sectorial probe). Subsequently, all follicles &ge;3mm were aspirated and the oocytes morphologically evaluated, selected, maturated, fertilized and cultivated for embryo production in vitro. The effects of independent variables (cow, treatment, phase, and week/OPU session) on the dependent variables were analyzed by ANOVA for repeated measures (PROC MIXED of SAS®) and by Chi-square test, both with a significance level of 5%. One animal was excluded from HS after sixth session, having remained four vs. five cows for CG and HS groups respectively. The THI increased during heat-stress treatment (93.1 ± 0.15 vs. 73.6 ± 0.5 for HS and CG respectively, P<0.05), simultaneously to a significant increase in RF, RT and ST (P<0.0001). It was characterized as effective heat-stress on the treated cows. In phase II the HS showed lower DMI than CG (6.9±0.2 vs. 8.0±0.3 respectively, P<0.05). All environmental and physiologic variables were similar (P>0.05) between treatments in the periods before and post heat-stress. There was no effect of heat-stress on SR and cortisol levels. The HS treatment induced to longer periods of ovarian inactivity (P4 <1ng/mL) as well as short cycles (HS, 37.5% vs. CG, 8.6%, P<0.001). There was effect of OPU session but not of treatment on number of visualized follicles or recovered oocytes. The diameter of the biggest follicles and incidence of codominance increased in HS treatment (P<0.05). Moreover, there was no effect of heat-stress on percentage of COCs selected to IVF or cleaved. However, immediate and delayed effects were observed on blastocists yield (35.5% vs. 25.0%, P=0.15, for CG and HS groups on the phase II and 27.2% vs. 13.3%, P<0.05, for respective groups on the phase III). Our results suggest that the ovarian dynamics of Bos indicus cattle was affected by heat-stress exposure, showing failures on follicular dominance and on in vitro embryos yield for at least 105 days after the heat-stress subside.

Avaliou-se a influência do desenvolvimento corporal na ciclicidade, na resposta ovariana e na taxa de prenhez à inseminação artificial em tempo fixo (IATF) de novilhas da raça Nelore ao sobreano (Experimento 1). Ainda, avaliou-se a eficiência de um protocolo de indução de ciclicidade (Experimento 2) previamente ao protocolo de IATF. No Experimento 1, 650 novilhas de 13,9&#177;0,03 meses de idade foram submetidas ao mesmo protocolo de sincronização da ovulação para IATF. Dez dias antes do início do protocolo de sincronização (Dia -10), as novilhas foram avaliadas quanto à idade (meses), peso (kg), escore de condição corporal (ECC, escala de 1 a 5), altura de cernelha (hCERN, cm) e relação altura/profundidade de costela (pCOST,% ) escore do trato reprodutivo (ETR, escala de 1 a 5), ciclicidade (presença de CL) e espessura de gordura subcutânea na garupa (EGPU, mm). No Dia 0, as fêmeas foram submetidas a sincronização da ovulação, recebendo IATF 10 dias após (Dia 10). Foram determinados por ultrassonografia a taxa de ciclicidade (presença de CL no Dia -10 e/ou Dia 0) os diâmetros do maior folículo presente no Dia 8 (FDD8), no Dia 10 (FDIA), presença de CL no Dia 17 (ovulação) e taxa de prenhez 30 dias após a IATF. Com relação à análise univariável, não houve diferença na taxa de ciclicidade com relação à hCERN e pCOST (P&gt;0,05), mas isoladamente a idade, o peso, o ECC e a EGPU foram associados com incremento na taxa de ciclicidade (P&lt;0,05). Entretanto, na análise multivariável o parâmetro retido no modelo foi a EGPU (&gt;3,4mm; 19,4 vs. &le;3,4mm; 8,8%; P=0,002). O FDD8 não foi influenciado pela idade, ECC e pCOST (P&gt;0,05) quando analisados de maneira isolada. Entretanto, o peso, hCERN, EGPU e ETR foram associados com maior FDD8 (P&lt;0,05). Contudo, ao se avaliar todos os parâmetros de maneira conjunta, houve efeito de hCERN (&gt;121,5=7,2 vs. &le;121,5=6,9mm; P=0,03), EGPU (&gt;2,6=7,4 vs. &le;2,6=6mm; P=0,02) e ETR (1=6,9ab;2=7,4ab; 3=7,1ab; 4=7,7ª; 5=6,3mmb; P=0,002) sobre o FDD8. O CrescFD e a taxa de ovulação não foram influenciados por nenhum dos parâmetros avaliados, em ambas as análises (P&gt;0,05). Ainda, na análise univariável a hCERN e o ETR (P&gt;0,05) não resultaram em efeito na taxa de prenhez, mas a idade, o peso, o ECC, a pCOST e a EGPU foram associados com incremento no sucesso gestacional (P&lt;0,01). Entretanto, ao se utilizar a análise multivariável os parâmetros retidos no modelo foram a idade (&gt;13,8=43,0 vs. &le;13,8=27,2; P=0,04), a pCOST (&gt;44,0=41,9 vs. &le;44,0=27,0; P = 0,02) e a EGPU (>2,5=44,4 vs. &le;2,5=23,4%; P=0,0003). No Experimento 2, 626 novilhas de 14,2±0,03 meses de idade foram aleatoriamente distribuídas em dois grupos experimentais: Indução (n=307; dispositivo de P4 usado durante 10 dias mais 0.6mg de CE no momento da retirada) e Controle (n=319). Doze dias após a retirada do dispositivo de P4 (Dia 0) todas as fêmeas foram submetidas a protocolo de sincronização para IATF conforme descrito no Experimento 1. As novilhas que receberam o protocolo de indução tiveram maior (P<0,0001) taxa de ciclicidade (75,2%) no Dia 0 em relação ao controle (7,8%). Entretanto, semelhante taxa de prenhez à IATF foi verificada entre os tratamentos (Controle 42,9 vs. Indução = 43,0%; P=0,40). Conclui-se que os parâmetros de desenvolvimento corporal apresentam relação positiva com a ciclicidade e a resposta ao protocolo para IATF em novilhas raça Nelore ao sobreano. Além disso, o estímulo hormonal prévio aumentou a proporção de novilhas com CL no início do protocolo de IATF, entretanto, não influenciou a taxa de prenhez à inseminação artificial / The influence of body development on ciclicity, ovarian response and pregnancy rate after timed artificial insemination (TAI) was evaluated in yearling Nelore beef heifers (Experiment 1). Furthermore, the efficiency of a protocol for ciclicity induction, previously to the TAI was tested (Experiment 2). At Experiment 1, 650 heifers aged 13,9 ± 0.03 months were submitted to the same ovulation synchronization protocol for TAI. Ten days before the beginning of the TAI protocol (Day -10), all females were evaluated for age (months), weight (kg), body condition score (BCS, 1 to 5 scale), withers height (hCERN, cm) and whiters height/depth of rib relationship (pCOST, %), reproductive tract score (RTS, 1 to 5 scale) ciclicity (presence of a CL) and subcutaneuos fat thickness (EGPU, mm). At Day 0, all heifers were submitted to the ovulation synchronization, receiving TAI after 10 days (Day 10). The ciclicity (presence of a CL at Day -10 and/or Day 0), diameter of the biggest follicle at Day 8 (FDD8) and Day 10 (FDIA) as the ovulation rate at Day 17 and pregnancy rate at Day 30 were determined by ultrassonography. In relationship to the univariable analysis, there was no difference of ciclicity rate according to hCERN and pCOST (P>0.05), but age, weight, BCS, and EGPU were associated to greater ciclicity (P<0.05). However, considering the multivariable analysis, heifers with greater EGPU (>3.4mm; 19.4%) presented greater (P=0.002) ciclicity rate in comparison to heifers with lesser EGPU ( &le;3.4mm; 8.8%). The FDD8 was not influenced by age, BCS and pCOST (P>0.05) and was influenced by hCERN, EGPU and RTS when the variables were singly analyzed. Nevertheless, there was an effect of hCERN (>121.5=7.2 vs. &le;121.5=6.9; P=0.03), EGPU (>2.6=7.4 vs. &le;2.6=6.0; P=0.02) and RTS (1=6.9ab; 2=7.4ab; 3=7.1ab; 4=7.7ª; 5=6.3 mmb; P=0.002) over the FDD8, when all variables were analyzed together. The ovulation rate was not influenced by any of the evaluated parameters (P>0.20). Still, considering the univariable statistical model, there was no effect of hCERN and RTS (P=0.05) on pregnancy rate, but age, weight, BCS, pCOST and EGPU were associated with increased pregnancy rate to TAI (P<0.05). Still, heifers with more age (>13.8=43.0 vs. &le;13.8=27.2; P=0.04), greater pCOST (>44.0=41.9 vs. &le;44.0=27.0%; P = 0.02) and greater EGPU (>2.5=44.4 vs.&le;2.5mm=23.4%; P=0.0003) presented greater pregnancy rate when all varaiables were analyzed together. At Experiment 2, 626 heifers aged 14.2±0.03 months were randomly allocated in two experimental groups: Induction (n=307; used P4 device during 10 days plus 0.6mg EC at device removal) and Control (n=319). Twelve days after P4 device removal (Day 0) all females were submitted to the same ovulation synchronization protocol described in Experiment 1. Heifers from Induction group (75.2%) had greater (P<0.0001) ciclicity rate at Day 0 in comparison to Control (7.8%), but similar pregnancy rate to 1st TAI (Control 42.9 vs. Induction 43.0%; P=0.40). It is concluded that the body developmental parameters presents positive relationship with ciclicity and response to the TAI protocol in Nelore yearling heifers. Moreover, a previous hormonal stimulus increases the proportion of heifers with a corpus luteum at the beginning of the TAI protocol, but does not affect pregnancy rate to the artificial insemination

O objetivo deste estudo foi avaliar a dinâmica folicular ovariana, a concentração circulante de progesterona (P4) e a expressão hepática de genes (AKR1C4, AKR1D1, CYP3A4, CYP2C19, SRD5A1, SRD5A3) relacionados ao metabolismo de P4 durante protocolo de sincronização para IATF em novilhas Nelore (n = 16) e Holandesas (n = 16) submetidas a alto (ACMS) e baixo (BCMS) consumo de matéria seca/energia de acordo com o (NRC, 2001). O experimento foi realizado em arranjo fatorial 2 x 2 e delineamento cross-over. A dieta experimental foi fornecida por um período de 34 dias. Os animais foram pré-sincronizados com duas aplicações de cloprostenol sódico (500 &micro;g,i.m. PGF2&#945;, Sincrocio&reg, Ourofino Agronegócio), com intervalo de 12 dias (D -24 e D-12). Duas doses adicionais de PGF2&#945; (18 e 12 h) foram administradas antes da inserção do dispositivo (D0). No D0, os animais receberam um dispositivo intravaginal de P4 (CIDR&reg, Zoetis, Brasil), 2 mg i.m. de benzoato de estradiol (BE, Sincrodiol&reg, Ourofino Agronegócio) e mais uma dose de PGF2&#945;. Após 8 dias, o dispositivo de P4 foi retirado e 24 h após foi administrado i.m. 1 mg de BE. Foram realizados exames ultrassonográficos a cada 24h durante o período de permanência do dispositivo de P4, a cada 12h da retirada do dispositivo até a ovulação, e no D14 e D17 para mensurar o volume do corpo lúteo (CL). Foram realizadas coletas de sangue diárias do D0 ao D10. Uma única réplica foi realizada para biópsia hepática, que foi feita 48 h após a inserção de dispositivo de P4 (D2). Para os dados de dinâmica folicular e concentrações hormonais, os resultados foram analisados pelo PROC MIXED, e para os dados de expressão gênica pelo PROC GLIMMIX do SAS 9.3, e apresentados como média &#177; EPM. O número de folículos recrutados foi maior em novilhas Nelore que Holandesas (42,1 &#177; 3,4 vs. 23,5 &#177; 3,3, P &lt; 0,001). Entretanto, não se verificou efeito da dieta no número de folículos recrutados (ACMS = 33,7 &#177; 3,3 vs. BCMS = 31,9 &#177; 3,3; P = 0,62). O diâmetro máximo do folículo dominante (mm) foi maior em novilhas Holandesas que novilhas Nelore (14,5 &#177; 0,4 vs. 13,0 &#177; 0,4, P = 0,009); e em animais com ACMS, que com BCMS (14,8 &#177; 0,4 vs. 12,7 &#177; 0,4; P &#61; 0,0004). Ainda, novilhas Holandesas apresentaram maior volume do CL (mm3) que novilhas Nelore (6195 &#177; 427 vs. 3507 &#177; 461; P &lt; 0,0001). Novilhas submetidas à BCMS apresentaram maior concentração plasmática de P4 ao longo do protocolo que novilhas submetidas à ACMS (P &lt; 0,05), sendo isto mais evidente em novilhas Nelore (raça &#42; dieta, P = 0,05). Novilhas Holandesas tiveram maior expressão de mRNA para SRD5A1, AKR1C4 e AKR1D1 (P &lt; 0,05), que novilhas Nelore. Entretanto, a expressão de mRNA para CYP3A4 foi maior em novilhas Nelore que Holandesas (P &lt; 0,0001). A expressão de mRNA para AKR1D1 foi maior em novilhas submetidas à ACMS comparada à BCMS (P &#61; 0,004), e a expressão de mRNA para AKR1C4 foi maior em novilhas sob BCMS comparada à ACMS (P &#61; 0,01). Os dados são indicativos de que pode existir característica inerente à raça e à dieta quanto à metabolização de P4, resposta folicular e modulação na expressão de genes envolvidos com a metabolização de P4 em fêmeas bovinas submetidas ao protocolo de sincronização da ovulação com dispositivo intravaginal de P4. / The objective of this study was to evaluate the circulating progesterone (P4) concentration, ovarian follicular dynamics, and liver-gene expression of genes (CYP2C19, CYP3A4, SRD5A1, SRD5A3, AKR1C4, AKR1D1) associated to P4 metabolism in Nelore (n &#61; 16) and Holstein (n &#61; 16) heifers, kept in high (HDM) or low (LDM) dry matter intake according NRC (2001) during a timed AI protocol. The experiment was performed in a cross-over factorial 2 x 2 design. The experimental diet was fed for a period of 34 days. Heifers were presynchronized with two prostaglandin treatments (500 &micro;g,i.m. PGF2&#945;, Sincrocio&reg;, Ourofino Agronegócio) given 12 days apart (D-14 e D-12). Two further PGF2&#945; treatments were also performed 18 and 12 h before device insertion (D0). At the beginning of the synchronization protocol (D0), all heifers received an intravaginal P4 device (CIDR&reg;, Zoetis, Brazil), 2 mg i.m. of estradiol benzoate (BE, Sincrodiol&reg, Ourofino Agronegócio) and a PGF2&#945; treatment. Eight days later, the P4 device was removed and 1 mg of BE was applied i.m. 24h later. Ultrasound exams took place at every 24h throughout the P4 device insertion period, at 12h intervals from device removal to ovulation, and again on D14 and D17 to measure corpus luteum (CL) volume. Daily blood sampling was performed from D0 to D10. A single liver biopsy was done 48 h after P4 device insertion (D2). The PROC MIXED procedure was used to analyze data from follicular dynamics and hormonal profiles, and gene expression records were analyzed by the PROC GLIMMIX of SAS 9.3. Results are presented as mean &#177; SEM. The number of recruited follicles was greater in Nelore than in Holstein heifers (42.1 &#177; 3.4 vs. 23.5 &#177; 3.3, P &lt; 0.001). The diameter of the dominant follicle (mm) was greater in Holstein than in Nelore heifers (14.5 &#177; 0.4 vs. 13.0 &#177; 0.4, P = 0.009) and also for HDM heifers than for LDM (14.8 &#177; 0.4 vs. 12.7 &#177; 0.4; P = 0.0004). In addition, Holstein heifers had greater CL volume (mm3) than Nelore (6195 &#177; 427 vs. 3507 &#177; 461; P &lt; 0.0001). Heifers submitted to BCMS have greater concentrations of P4 during the protocol that heifers submitted to ACMS (P &lt; 0.05), and this is most evident in Nelore heifers (breed &#42; diet, P &lt; 0,05). Holstein heifers had greater mRNA expression of SRD5A1, AKR1C4 and AKR1D1 (P &lt; 0.05) than Nelore heifers. The mRNA expression of the gene CYP3A4 was greater though in Nelore compared Holsteins (P &lt; 0.0001). Furthermore, the mRNA expression of AKR1D1 was greater in heifers on HDM than in LDM (P = 0.004). In contrast, the mRNA expression of AKR1C4 was more expressed in heifers on LDM compared to HDM (P = 0.01). In conclusion, these results suggest that both cattle breed as well as level of dry matter intake can alter P4 metabolism, follicular dynamics and gene expression in heifers supplemented with exogenous P4 during synchronization programs.

O objetivo desta pesquisa foi avaliar os efeitos do período de administração de cloridrato de zilpaterol (CZ) e do tempo de confinamento no desempenho, características de carcaça, rendimento de cortes cárneos comerciais e na qualidade de carne de bovinos Nelore. Foram utilizados 96 bovinos machos não castrados da raça Nelore, com peso vivo inicial de 377 ± 25,1 kg. O delineamento utilizado foi o de blocos completos casualizados em esquema fatorial 4 × 2, sendo quatro períodos de administração com CZ (0, 20, 30 ou 40 dias) e dois tempos de confinamento (90 ou 117 dias). O período de suplementação com CZ (8,33 mg/kg de matéria seca total) iniciou-se 23, 33 e 43 dias antes do abate. Nos últimos três dias que antecederam o abate todos os animais foram alimentados com a dieta sem CZ, respeitando o período de carência do produto. O contrafilé (músculo Longissimus thoracis et lumborum) de todas as meias-carcaças esquerdas foi amostrado para as análises de qualidade de carne. Com exceção da área do olho de lombo obtida por ultrassom (P = 0,02) e área do olho de lombo medida na carcaça resfriada (P = 0,05), não houve interação entre período de administração de CZ e tempo de confinamento (P > 0,10). O aumento do período de suplementação com CZ proporcionou aumento linear da eficiência alimentar (P < 0,01), peso de carcaça quente (P < 0,01), rendimento de carcaça quente (P < 0,01) e rendimento de carne desossada (P < 0,01). Os bifes de contrafilé de animais suplementados com CZ apresentaram maior conteúdo percentual de proteína (P < 0,01), enquanto que a espessura de gordura subcutânea (P = 0,04) e o conteúdo percentual de lipídios intramusculares (P < 0,01) diminuíram com administração de CZ. O valor percentual de ácidos graxos poliinsaturados totais aumentou (P = 0,01) com a administração de CZ, sendo atribuído principalmente ao aumento percentual do ácido linoleico (18:2 cis-9, cis-12; P = 0,01) e ácido araquidônico (20:4 n-6; P < 0,01). A força de cisalhamento das amostras de contrafilé aumentou (P < 0,01) com a inclusão de CZ na dieta, sendo esse resultado independente do tempo de maturação (7, 14, 21 ou 28 dias post-mortem). Observou-se interação entre período de administração de CZ e tempo de maturação (14 ou 28 dias post-mortem) para escore de maciez inicial (P = 0,03) e escore de tecido conjuntivo (P < 0,01), onde o processo de maturação melhorou mais a carne de animais controle do que a carne de animais suplementados com CZ. Mesmo com a diminuição da maciez, os bifes de animais suplementados com CZ foram considerados macios pelos provadores do painel sensorial. O CZ melhora a eficiência de produção de carne de bovinos Nelore, proporcionando aumento na massa muscular dos animais tratados sem alterar o consumo de matéria seca. Por outro lado, o tratamento dos animais com CZ reduz a maciez e a velocidade do processo de amaciamento do contrafilé. / The objective of this research was to evaluate the effects of zilpaterol hydrochloride (ZH) feeding time and feedlot days on performance, carcass characteristics, yield commercial cuts and meat quality of Nellore bulls. Ninety six Nellore bulls with initial body weight of 377 ± 25.1 kg were used in a randomized complete block in 4 × 2 factorial design, with four periods of ZH feeding (0, 20, 30 or 40 d) and 90 or 117 d in the feedlot. The supplementation period with ZH (8.33 mg/kg of dietary dry matter basis) started 23, 33 or 43 d before slaughter. In the last three days prior to slaughter all the animals were fed the diet without ZH, respecting the product grace period. Strip loin (m. Longissimus thoracis et lumborum) of all left-carcases were sampled for meat quality analysis. With the exception of LM area obtained both by ultrasound (P = 0.02) and by refrigerated carcasses (P = 0.05), there was no interaction between periods ZH feeding and days in the feedlot (P > 0.10). The increase of the supplementation period with ZH linearly increased feed efficiency (P < 0.01), hot carcass weight (P < 0.01), hot carcass yield (P < 0.01) and boning yield (P < 0.01). Beef strip loin steaks from animals supplemented with ZH presented a higher percentage of protein content (P < 0.01), while the 12th-rib fat (P = 0.04) and the percentage content of intramuscular fat (P < 0.01) decreased with ZH feeding. The percentage of polyunsaturated fatty acids increased (P = 0.01) with the ZH feeding and was mainly attributed to the increase of linoleic acid (18:2 cis-9, cis-12; P = 0.01) and arachidonic acid (20:4 n-6, P < 0.01). The Warner-Bratzler shear force (P < 0.01) from the strip loin samples increased with the inclusion of dietary ZH and this result was independent of the aging time (7, 14, 21 or 28 d postmortem). There was interaction between ZH feeding period and maturation time (14 or 28 d postmortem) to initial tenderness score (P = 0.03) and connective tissue score (P < 0.01), showing that the maturation process improved meat tenderness of control animals rather than ZH animals. Despite the initial meat tenderness decrease, strip loin steaks of animals supplemented with ZH were still considered tender by trained evaluators. ZH improves Nellore bulls meat production efficiency, providing an increase in muscle mass of the treated animals with no change in dry matter intake. However, treatment of animals with ZH reduces the tenderness and the speed of the strip loin maturation process.

O objetivo desse estudo foi avaliar a eficiência do protocolo de pré-sincronização da ovulação com progesterona (P4) injetável de longa ação em novilhas e a influência de seus efeitos sobre a taxa de prenhez do protocolo de inseminação artificial em tempo fixo (IATF) J-Synch adaptado. Novilhas Nelore (n=638; 21,5&#177;3,1 meses e 295&#177;23,3 kg) foram classificadas por ultrassonografia nos D22 e D12 em púberes (presença de corpo lúteo (CL) no D22 e/ou D12) ou pré-púberes (ausência de CL em ambas avaliações) e receberam 150 mg de P4 de longa ação I.M. no D22 (tratadas) ou não (controle), perfazendo arranjo fatorial 2X2. No D12, apenas as novilhas tratadas, receberam 150 &micro;g de D-cloprostenol (PGF, I.M.) e 1 mg de benzoato de estradiol (BE, I.M.). No D0, avaliou-se a ciclicidade das novilhas e todas foram sincronizadas de acordo com protocolo J-Synch adaptado: D0: dispositivo intravaginal de P4 (1 g) + 2 mg BE e 75 &micro;g PGF; D6: remoção do dispositivo + 150 micro;g PGF. Uma detecção de estro foi realizada 48 h após a retirada dos dispositivos e as detectadas em estro foram inseminadas 12 h depois, ou em tempo fixo no D9, com aplicação I.M. de 10,5 &micro;g acetato de buserelina. Exames ultrassonográficos foram realizados para mensurar o diâmetro do maior folículo e foi determinado um escore uterino (EU=1-6). O diagnóstico de gestação foi realizado no D39. Após 12 dias do tratamento (D0), menor proporção de novilhas, apresentando CL, foi verificada no grupo controle, quando comparada à de novilhas tratadas. Esta diferença foi mais acentuada nas pré-púberes (controle: 11,4% (23/199) vs. tratamento: 63,7% (136/215); P&lt;0,0001), quando comparada às púberes (controle: 79,5% (92/113) vs. tratamento: 91,2% (102/111); P=0,002). A taxa de prenhez geral foi de 42,2% e tendeu a ser influenciada por tratamento (P=0,07). Novilhas do grupo controle apresentaram menor taxa de prenhez, de manifestação de estro 48 h após a retirada do dispositivo (P=0,02) e de ovulação antecipada (P=0,007), quando comparadas às novilhas tratadas (37,3% (119/312) vs. 44,7% (150/326); 15,9% (48/312) vs. 23,3% (52/224); 7,5% (23/258) vs. 15,4% (42/244), respectivamente). Para o diâmetro do folículo dominante, no momento da IATF (D9), houve interação entre status puberal e tratamento (P&lt;0,05), sendo que as novilhas tratadas não diferiram entre si (pré-púberes: 11,1&#177;0,13 mm vs. púberes: 11,1&#177;0,17 mm; P=0,99). Para as novilhas do controle, as pré-púberes apresentaram menores diâmetros foliculares (10,9&#177;0,13 mm), quando comparados aos das púberes (11,5&#177;0,17 mm, P=0,03). A probabilidade de ciclicidade foi influenciada pelo diâmetro do folículo no D22 e no D12, para as novilhas pré-púberes tratadas (P&lt;0,05). O uso da P4 aumentou o diâmetro folicular e o EU, no D12, para as novilhas pré-púberes tratadas, quando comparadas às controles (P&lt;0,05). A taxa de prenhez foi maior nas novilhas que manifestaram estro 48 h após a retirada do dispositivo e foram inseminadas com 60h (60h: 66,1% (85/124); IATF: 34,8% (185/515)), e nas novilhas que apresentaram CL no D0 (com CL: 51,5% (181/353); sem CL: 30,5% (89/286)). Conclui-se que o protocolo de pré-sincronização com P4 injetável aumenta a porcentagem de novilhas ciclando e tende a aumentar a taxa de prenhez apresentada pelo protocolo J-Synch adaptado. / The objective of this study was to evaluate the effect of long-acting injectable progesterone (P4) pre-synchronization protocol and the influence of its effects on the pregnancy rate of the timed artificial insemination (TAI) J -Synch adapted protocol. Nelore heifers (n=638; 21.5&#177;3.1 months and 295&#177;23.3 kg) were classified by ultrasonography on D22 and D12 in pubertal (with corpus luteum (CL) on D22 and/or D12) or prepubertal (absence of CL in both evaluations), and received 150 mg of long-acting P4 I.M. on D22 (treatment) or not (control), making a factorial arrangement 2X2. On D12, only heifers treated with P4 received 150 &micro;g of D-cloprostenol (PGF, I.M.) and 1 mg of estradiol benzoate (EB, I.M.). On D0, presence of CL was evaluated and all heifers were synchronized according to the adapted J-Synch protocol: D0: intravaginal release P4 device (1 g) + 2 mg EB and 75 &micro;g PGF; D6: removal of the P4 device + 150 &micro;g PGF. Animals detected in estrus at 48 hours after device removal were inseminated 12 h after or at fixed time on D9, with application of 10,5 &micro;g buserelin acetate I.M. The largest follicular diameter was evaluated by ultrasound and was determined a uterine score (US= 1-6). The pregnancy diagnostic was performed on D39. After 12 days of treatment (D0), lowest proportion of heifers presenting CL was verified in control group, when compared to treated heifers. This difference was more pronounced in the prepubertal (control: 11.4% (23/199) vs. treatment: 63.7% (136/215); P&lt;0,0001), when compared to pubertal (control: 79.5% (92/113) vs. treatament: 91.2% (102/111); P=0,002). The pregnancy rate was 42.2% and tended to be influenced by treatment (P=0.07). Control heifers had lower pregnancy rate, estrus manifestation 48 h after device remotion (P = 0.02) and early ovulation (P = 0.007), when compared to treated heifers (37.3% (119/312) vs. 44.7% (150/326); 15.9% (48/312) vs. 23.3% (52/224); 7.5% (23/258) vs. 15.4% (42/244), respectively). For diameter of the dominant follicle at TAI (D9) there was interaction between pubertal status and treatment (P&lt;0,05), and the two treated groups did not differ (prepubertal: 11.1&#177;0.13 mm vs. pubertal: 11.1&#177;0.17 mm; P=0,99). For control heifers, follicular diameter was smaller for prepubertal (10.9 &#177; 0.13 mm) than for pubertal (11.5 &#177; 0.17 mm, P = 0.03). Probability of cyclicity was influenced by follicular diameter on D22 and D12, for treated prepubertal heifers (P &lt;0.05). Use of P4 increased the follicular diameter and US on D12 for prepubertal heifers treated, when compared to controls (P &lt;0.05). Pregnancy rates was greater in heifers that showed estrus 48 h after the device was removed and were inseminated with 60h (60h: 66.1% (85/124); TAI: 34.8% (185/515)), and in heifers with CL on D0 (with CL: 51.5% (181/353); without CL: 30.5% (89/286)). In conclusion, pre-synchronization protocol with long-acting P4 increases the percentage of cyclic heifers and tends to increase the pregnancy rate after J-Synch adapted protocol.

A introdução de sistemas automáticos de pesagem tem possibilitado a mensuração do peso vivo em tempo real, sem a necessidade de remover os animais de piquetes e manejá-los em currais com tronco de contenção e balanças. Embora estes equipamentos estejam disponíveis, sua contribuição para tomadas de decisões e gestão da produção de bovinos de corte é ainda pequena, principalmente em função de seu custo e da falta do desenvolvimento de metodologias para processamento e análise do volume de dados produzido. Neste contexto, o presente estudo teve como objetivo central testar e propor metodologias de análise para os dados de peso vivo provenientes de sistemas automáticos de pesagem, que possibilitem a percepção das relações não lineares entre o desempenho dos animais e o tempo. Para isso, este estudo foi subdividido em duas etapas: i) a primeira caracterizou-se pela avaliação do uso do sistema de plataformas de pesagem corporal automática (modelo VW 1000, Intergado&reg;, Brasil) em fazenda comercial de bovinos Nelore P.O., sendo verificado a coerência biológica dos dados e analisado o grau de concordância entre este sistema e o sistema convencional de pesagem. ii) A segunda etapa caracterizou-se pela busca de ferramentas computacionais que permitissem mensurar o ganho de peso diário de modo a acompanhar suas variações em tempo real. Para isso, dois métodos de suavização foram analisados: a) Suavizador de gráfico de dispersão localmente ponderado (do inglês, Locally-Weighted Scatterplot Smoother, LOWESS) e b) B-spline penalizada (do inglês, Penalized B-splines, PB-splines). Ambos os métodos apresentaram bons ajustes aos dados de peso vivo, mas LOWESS estimou curvas menos suaves, as quais resultaram, por sua vez, em trajetórias de ganho de peso com maior variabilidade. Por outro lado, o método de suavização PB-splines estimou curvas com estruturas mais rígidas às flutuações que ocorrem com o peso vivo, não distorcendo, porém, a relação de dependência entre as variáveis. Assim, o presente estudo possibilitou afirmar que sistemas automáticos de pesagem, quando integrados aos métodos de suavização de dados aqui explorados, permitem estimar a relação entre o peso vivo e o tempo sem o estabelecimento prévio de uma função. Com isso, permitem também a construção de trajetórias de ganho de peso diário passíveis de serem utilizadas para a identificação de problemas tanto de lote quanto de indivíduos. As ferramentas aqui exploradas poderão auxiliar os futuros estudos de identificação das variações do ganho de peso inerentes aos animais ou ao ambiente, permitindo, assim, melhorar a identificação de problemas em sistemas de pecuária de precisão. / The introduction of automatic weighing systems presents opportunities to record cattle body weight multiple times per day without the need to remove them from pens or paddocks and handling them in squeeze-chute equipped with static weighing systems. Although these systems are available, its contribution to decision making in beef cattle management is still rather small. This area remains uninvestigated partially because the steps to data processing and analysis are not well defined, reducing the potential of this system to monitoring changes in animal performance. In this context, the main objective of this study was to develop an approach for analyzing the body weight records by an automatic weighing system that describes and shows the nonlinearity of the animal performance as a function of time. For this, the study was subdivided in two steps; First, daily body weight of Nelore cattle were collected in a commercial farm and analyzed in relation its biological coherence and to understand the agreement of such weighing systems to the conventional system. Second, characterization was performed, by the search for computational tools that allowed to measure the daily weight gain to follow its real variations. For this, two smoothing techniques were analyzed: a) Locally-Weighted Scatterplot Smoother (LOWESS), and b) penalized B-spline (PB-spline). Both techniques fitted well the body weight data, but LOWESS estimated curves less smoothed, which resulted in daily body weight gain trajectories with greater variability. On the other hand, the penalized PB-spline estimated curves that had structures more rigid to fluctuations that occur with body weight. But the form of the regression function not distorted the dependence relationship between the two variables. Thus, the present study concluded that automatic weighing systems when integrated with the smoothing techniques used allowed us to estimate the structural form between body weight and time without the reference to a specific model. Hence, it allowed the construction of daily weight gain trajectories that may be used to identify problems in pens or in individual animals. The tools used here may help future studies to identify the inherent and unnatural variations of daily weight gain, thus improving the efficiency of identifying problems in animal performance.

Em eucariotos, o DNA é organizado juntamente com histonas em um complexo nucleoproteico conhecido como cromatina, cuja unidade fundamental corresponde aos nucleossomos. A cromatina apresenta-se de duas maneiras: eucromatina, região estruturalmente menos condensada e, portanto, mais facilmente transcrita, e heterocromatina, região muito condensada e transcricionalmente silenciosa. Na forma de eucromatina, o acesso dos fatores de transcrição a regiões de DNA livres de nucleossomos é facilitado, enquanto que na forma de heterocromatina os fatores de transcrição não conseguem acessar o DNA para ativar ou reprimir a expressão gênica inferindo, assim, que o grau de compactação da cromatina interfere na regulação da expressão gênica e que o nucleossomo atua como silenciador gênico. Neste contexto, os objetivos foram identificar, mapear e caracterizar regiões em eucromatina na musculatura esquelética de bovinos da raça Nelore. As análises foram realizadas em relação ao músculo Longissimus dorsi pela técnica Assay for Transposase-Accessible Chromatin (ATAC-Seq), capaz de isolar regiões livres de nucleossomos a partir do mecanismo enzimático de transposição. A fim de otimizar o protocolo dessa metodologia para tecido muscular, foram testadas concentrações de 50 mil, 75 mil e 100 mil núcleos tratados com transposase. Destes, foram encontrados 6.811, 11.121 e 11.473 picos de eucromatina, respectivamente, e 6.212 regiões de cromatina aberta foram coincidentes nas três amostras. A associação entre regiões eucromáticas, expressão gênica e gordura intrasmuscular foi confirmada a partir da análise de sobreposição com transcriptional start sites (TSS), genes expressos em músculo esquelético, genes diferencialmente expressos (GDE) para gordura intramuscular e regiões de expression quantitative trait loci (eQTL) de tecido muscular reforçando, assim, o potencial regulatório das regiões de eucromatina. / In eukaryotes, DNA is organized along with histones in nucleoproteins complexes known as chromatin, which has nucleosomes as their fundamental unit. Chromatin exists in two forms: euchromatin, corresponding to a lightly condensed structure and an easily transcribed region, and heterochromatin, a highly condensed and transcriptionally silent region. In euchromatin form, transcription factors have free access to nucleosome-depleted DNA regions, while in heterochromatin the transcription factors can not access the DNA for activate or repress genic expression, which suggests that the chromatin compaction degree interferes with regulation of gene expression and that nucleosomes act as gene silencer. In this context, the aims of the present project were to identify, map and characterize euchromatin regions in the skeletal musculature of Nellore cattle. Analyzes were performed considering the muscle Longissimus dorsi using Assay for Transposase-Accessible Chromatin technique (ATAC-Seq), which isolates nucleosome-depleted regions throught transposition enzymatic mechanism. Differente transposase-treated nuclei concentrations were tested: 50 thousand, 75 thousand and 100 thousand. From these, 6.811, 11.121, and 11.473 euchromatin peaks were found, respectively, and 6.212 open chromatin regions were coincident among them. The association between euchromatic regions, gene expression and intrasmuscular fat was confirmed from the overlap analysis with transcriptional start sites (TSS), genes expressed in skeletal muscle, differentially expressed genes (GDE) for intramuscular fat and regions of expression quantitative trait loci (eQTL) of muscle tissue, reinforcing the regulatory potential of the euchromatin regions.

Avaliou-se o efeito da dieta com diferentes níveis de energia [mantença (M) e alta energia (1,7M)] nos parâmetros metabólicos, endócrinos e reprodutivos de vacas não lactantes Bos indicus (14 Gir) e Bos taurus (14 HPB) submetidas aspiração folicular (OPU) seguida de produção in vitro de embriões. Os animais foram distribuídos aleatoriamente de acordo com a raça e a dieta. As doadoras foram mantidas em sistema Tie stall e as dietas foram fornecidas duas vezes ao dia (8:00 e 16:00 h). Os animais receberam dieta M por uhm período de adaptação de 21 dias. Após esse período, os grupos experimentais foram submetidos a nove punções foliculares com intervalos de 14 dias. Para realização da OPU, no D0 as doadoras foram sincronizadas com 2 mg de benzoato de estradiol e um implante auricular de norgestomet. No D5, as OPUs foram realizadas. Não houve interação entre as espécies e níveis de energia na dieta para as variáveis estudadas. Não foram observadas diferenças quali-quantitativa dos oócitos entre as dietas. Porém, houve diferença na quantidade e qualidade oocitária entre as espécies estudadas. Vacas Bos indicus apresentaram maior quantidade de estruturas recuperadas e melhor qualidade oocitária que as doadoras Bos taurus. Semelhantemente aos resultados da qualidade e quantidade oocitária, a produção in vitro de embriões também não diferiu entre as dietas e verificou-se maior produção in vitro de embriões em vacas Bos indicus. No entanto, foi observado que o excesso de energia reduziu a produção in vitro de embriões após 60 dias de fornecimento da dieta somente em vacas Bos indicus. Verificou-se menor abundância de transcritos para os genes IGF2R e HSP70.1 em oócitos de vacas alimentadas com alta energia na dieta. Além disso, observou-se que vacas da raça Gir apresentaram maior abundância de transcritos para os genes GLUT1 e IGF1R. Vacas alimentadas com excesso de energia na dieta apresentaram maiores concentrações séricas e no fluido folicular de glicose e colesterol e maiores níveis de AGNE no líquido folicular. Porém, a concentração de nitrogênio ureico no soro e no fluido folicular foi maior nas vacas que receberam dieta de mantença. Quanto ao grupo genético, observou-se que vacas Bos indicus apresentavam maiores concentrações de glicose, colesterol, AGNE e nitrogênio ureico, tanto no líquido folicular quanto no soro. Além disso, as concentrações de insulina e IGF1 no líquido folicular foram maiores nas vacas do Grupo alta energia Bos indicus . Por fim, observou-se quadro de hiperinsulinemia (Gir [insulina] &gt; 51,9 &#956;UI/ml e HPB [insulina] &gt;17,2 &#956;UI/ml) em 60% das vacas Bos indicus que receberam alta energia na dieta. Conclui-se que o aumento de energia na dieta não interferiu na quantidade e qualidade (avaliada visualmente) de oócitos. No entanto, o excesso de energia reduziu a produção in vitro de embriões em vacas Bos indicus após 60 dias de fornecimento da dieta. Além disso, vacas Bos indicus apresentaram melhor qualidade e maior quantidade de oócitos viáveis e produção in vitro de embriões que as doadoras Bos taurus. / The effect of different energy levels in diet [maintenance (M) and high energy (1.7M)] was evaluated on metabolic, endocrine and reproductive parameters of non lactating Bos indicus (n=14) and Bos taurus (n=14) cows submitted to ultrasound guided ovum pick up (OPU) followed by in vitro embryo production. Cows were randomly assigned, according to their breed and diet. The oocyte donors were housed in Tie Stall System and the diets were given twice daily (8:00 AM e 4:00 PM). During 21 days prior to the beginning of experiment, animals were fed with the maintenance diet for their adaptation. After this period, the experimental groups were submitted to nine OPU procedures, fourteen days apart each. To synchronize the donors, cows received 2mg of estradiol benzoate on day 0 (D0) and one norgestomet auricular implant. The OPU were performed on D5. There were no interaction between breeds and energy level in diet for the evaluated variables. No qualitative or quantitative differences were in oocytes between the two diets. However, there was difference in oocyte number and quality between breeds. Bos indicus cows showed higher number of recovered structures and better oocyte quality when compared to Bos taurus donors. Similar to what was found in oocyte quality and number, the in vitro embryo production also did not differ between diets and it was observed that Bos indicus cows had higher production of embryos. However, we verified that the energy surplus reduced in vitro embryo production in Bos indicus cows after 60 days of high energy diet. It was also possible to observe lower oocytes transcripts abundance for IGF2R and HSP70.1 genes of cows fed with high energy diet. Moreover, Gir cows showed higher transcript abundance for GLUT1 and IGF1R genes. Cows fed with excess of energy in diet presented higher serum and follicular fluid concentrations of glucose and cholesterol and increased NEFA levels in follicular fluid. However, the ureic nitrogen concentration was higher in cows which received maintenance diet. When comparing the two genetic groups, it was observed that Bos indicus cows presented higher concentrations of glucose, cholesterol, NEFA and ureic nitrogen both in follicular fluid and in blood. Furthermore, cows that presented decreased blastocyst rate (high energy - Bos indicus) exhibited high follicular fluid concentrations of insulin and IGF1. Finally, it was observed that 60% of Bos indicus cows fed with high energy diet presented yperinsulinemia (Gir [insulin] > 51.9 &#956;UI/ml and HPB [insulin] >17.2 &#956;UI/ml). In conclusion, increasing energy in diet did not interfere in oocyte number and quality (visual evaluation). However, the energy surplus reduced the in vitro embryo production in Bos indicus cows after 60 days of diet. Moreover, Bos indicus cows showed better oocyte quality, higher number of viable oocytes and increased in vitro embryo production than Bos taurus donors.

Tendo em vista a possibilidade da utilização de marcadores moleculares relacionados à leptina em programas de melhoramento genético no Brasil, com o objetivo de auxiliar a seleção de bovinos da raça Nelore para características de importância econômica e, particularmente, para aquelas relacionadas ao crescimento e precocidade de acabamento, a proposta do presente trabalho foi caracterizar as freqüências gênicas e genotípicas de alguns polimorfismos e estudar seus efeitos nas características de precocidade de acabamento e crescimento em bovinos da raça Nelore. Foram avaliadas as associações dos marcadores moleculares com medidas de ultra-som de área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), espessura de gordura da picanha (EGP), peso à desmama (PD), peso ao sobreano (PS), ganho de peso da desmama ao sobreano (GPS) e circunferência escrotal ao sobreano (CE). Para a caracterização dos marcadores na população Nelore foram avaliadas as freqüências genotípicas e gênicas, testes de equilíbrio de Hardy-Weinberg, heterozigoses, diversidades alélicas e conteúdos de informação polimórfica. A análise dos efeitos dos diferentes genótipos dos marcadores moleculares foi realizada através da análise de variância, desvios de dominância, efeitos aditivos e efeitos médios de substituição. As freqüências genotípicas e gênicas demonstraram que alguns alelos de determinados marcadores moleculares se encontram em baixa freqüência na população, porém apresentam os mesmos polimorfismos já relatados em bovinos de raças européias. Os marcadores A1457G, C963T e UASMS1 apresentaram associação significativa com características avaliadas por ultra-som. Os marcadores E2JW, A59V e T945M apresentaram associação significativa com características de crescimento. O marcador E2FB apresentou associações significativas apenas pela análise de efeito médio de substituição. Estes achados reforçam o potencial de utilização dos marcadores moleculares ligados a leptina na melhoria das características economicamente importantes em animais da raça Nelore. A seleção assistida por marcadores de animais portadores de alelos favoráveis pode impactar positivamente na cadeia produtiva de bovinos de corte em todos os seus segmentos. / Considering the possibility of utilization of molecular markers linked to leptin in animal breeding programs from Brazil and aiming to aid in the selection of Nellore cattle to economic traits and particularly, for those related to growth and finishing traits, the purpose of this research was to characterize the allelic and genotypic frequencies and associate with growth and finishing in Nellore cattle. There were evaluated the associations of the molecular markers on the ultrasound Longissimus muscle area (AOL), ultrasound backfat thickness (EGS), ultrasound fat thickness in Biceps femoris muscle, weaning weight (PD), yearling weight (PS), weight gain from weaning to yearling (GPS) and yearling scrotal circumference (CE). The characterization of the molecular markers in Nellore cattle was evaluated through of the allelic and genotypic frequencies, Hardy-Weinberg equilibrium tests, heterozigosity, allelic diversity and polymorphism information content. The different genotype effects of the molecular markers were evaluated through ANOVA, dominance deviation, additive and substitution effect. The allelic and genotype frequencies shown some alleles of the molecular markers were low frequencies in Nellore cattle. However there were identified the same polymorphisms described in taurine cattle. Markers A1457G, C963T and UASMS1 demonstrated significant association with ultrasound measurement traits. The E2JW, A59V and T945M markers showed significant association with growth traits. The E2FB marker showed significant effects when it was evaluated for substitution effect. These findings emphasize the potential utilization of molecular markers linked to leptin in the improvement of economic traits in the Nellore cattle. The improvement this traits through marker assisted selection of carrier animals of desirable alleles might positively aid the whole beef cattle productive chain.

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A habilidade desses segmentos em elucidar sobre eventos genéticos populacionais torna-os uma ferramenta capaz de prover informações valiosas a respeito da evolução demográfica de uma população ao longo do tempo. Além disso, informações amplas do genoma fornecem subsídios relevantes para compreender a constituição genética de um animal por meio da caracterização dos ROH, constituindo uma metodologia acurada para manter a diversidade genética em diversas populações animais. O objetivo deste estudo foi (i) acessar a autozigosidade do genoma de bovinos da raça Gir Leiteiro a fim de caracterizar os padrões de ROH; (ii) prospectar genes em ROH compartilhados por mais de 50% da população, e por fim (iii) comparar as estimativas de endogamia calculadas a partir da proporção genômica em homozigose (FROH), da matriz genômica de parentesco G (FGRM) e do pedigree tradicional (FPED). Animais da raça Gir Leiteiro foram genotipados com o BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA) que contêm 777.962 SNPs (n=582), BovineSNP50 BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA) contendo 54.609 SNPs (n=1664) e GGP-LD Indicus (Geneseek® Genomic Profiler Indicus 30K) que contêm 27.533 SNPs (n=662). Todos os genótipos foram imputados para o painel BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA). SNPs sem posição definida ou mapeados nos cromossomos sexuais foram removidos do conjunto de dados. Após a edição, 2908 animais e 735,236 SNPs foram mantidos para as análises. Os ROH foram identificados por meio do software PLINK v1.07 considerando os seguintes parâmetros: uma janela deslizante de 50 SNPs, o número mínimo de SNPs consecutivos incluídos em um ROH foi 100, o comprimento mínimo de um ROH foi ajustado para 1 Mb, o intervalo máximo entre SNPs homozigóticos consecutivos foi de 500 kb, uma densidade de 1 SNP por 50 kb, cinco SNPs com genótipos faltantes e um genótipo heterozigoto. O FPED foi estimado por meio do software INBUPGF90. Para cada animal foi calculado um FROH (FROH1-2 Mb, FROH2-4 Mb, FROH4-8 Mb, FROH8-16 Mb e FROH>16 Mb) com base na distribuição de ROH a partir de cinco comprimentos (ROHj): 1-2, 2-4, 4-8, 8-16 e > 16 Mb, respectivamente. O FGRM foi calculado a partir da diagonal da matriz de relação genômica (G). Os ROH foram identificados em todos os animais, apresentando um número médio de 55,12±10,37 segmentos por animal e um comprimento médio de 3,17 Mb. Segmentos curtos (ROH1-2 Mb) foram abundantes nos genomas, representando cerca de 60% de todos os segmentos identificados, no entanto, cobriram apenas uma pequena proporção do genoma. Nossos resultados demonstraram que em média 7,01% (175,28 Mb) do genoma dessa população é autozigótico. As estimativas de FPED variaram de 0,000 a 0,327 e as de FROH de 0,001 a 0,201. Correlações baixas a moderadas foram observadas entre as estimativas de FPED-FROH e FGRM-FROH, com valores entre -0,16 e 0,59. As correlações entre FROH de diferentes comprimentos e FPED aumentaram com comprimento dos ROH. ROH compartilhados por mais de 50% das amostras foram classificados como ilhas de ROH. Quatorze ilhas de ROH foram identificadas e diversos genes contidos nessas ilhas foram associados com o teor de gordura do leite (DGAT1, CYP11B, EEF1D, INSIG2 e STAT1), involução da glândula mamária (IGFBP7), lactação (CHR e TRAPPC9) e adaptação ao calor (HSF1). Nossos resultados sugerem que (i) as baixas correlações (r<0.44) entre FPED-FROH para segmentos pequenos indicam que o FPED não é adequado para capturar eventos remotos de endogamia. As correlações moderadas (r>0.44) entre segmentos grandes indica que os níveis de autozigosidade derivados dos ROH podem ser utilizados como uma estimativa acurada dos níveis de endogamia; e (ii) ROH podem ser utilizados para identificar regiões genômicas sob seleção, uma vez que várias regiões compartilhadas estavam associadas com características de leite e adaptação. / Runs of homozygosity (ROH) are continuous homozygous segments that are common in individuals and populations. The ability of these segments to give insight into a population's genetic events makes them a useful tool to provide information about the demographic evolution of a population over time. Additionally, genome-wide information provides valuable information to comprehend the animal’s genome based on ROH, being and accurate tool to maintain diversity and fitness in livestock populations. The aim of this study was (i) to access genome-wide autozygosity to identify and characterize ROH patterns in Gyr dairy cattle genome; (ii) identify ROH islands for gene content and enrichment in segments shared by more than 50% of the samples, and (iii) compare estimates of molecular inbreeding calculated from ROH (FROH), GRM approach (FGRM), and from pedigree-based coefficient (FPED). Gyr dairy animals were genotyped with the BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA), that contains 777,962 bialleleic SNPs markers (n=582); the BovineSNP50 BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA), containing 54,609 SNPs (n=1664); and with the GGP-LD Indicus (Geneseek® Genomic Profiler Indicus 30K), that contains 27,533 bialleleic SNPs markers (n=662). All genotypes were imputed to the BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA). SNPs unsigned to any chromosome and mapped to sexual chromosomes were removed from the dataset. After editing, 2908 animals and 735,236 SNPs were retained for the analyses. ROH were identified using PLINK v1.07 considering the following parameters: a sliding window of 50 SNPs, the minimum number of consecutive SNPs included in a ROH was 100, the minimum length of a ROH was set to 1 Mb, the maximum gap between consecutive homozygous SNPs was 500 kb, a density of 1 SNP per 50 kb, and a maximum of five SNPs with missing genotypes and up to one heterozygous genotype were allowed in a ROH. FPED was estimated through the software INBUPGF90. For each animal FROH (FROH1-2 Mb, FROH2-4 Mb, FROH4-8 Mb, FROH8-16 Mb, and FROH>16 Mb) was calculated based on ROH distribution of five minimum different lengths (ROHj): 1-2, 2-4, 4-8, 8-16, and >16 Mb, respectively. FGRM was calculated from the diagonal of the genomic relationship matrix (G). ROH were identified in all animals, with an average number of 55.12±10.37 segments and a mean length of 3.17 Mb. Short segments (ROH1-2 Mb) were abundant through the genomes, accounting for 60% of all segments identified, however, they just covered a small proportion of the genome. Our results suggest that on average 7.01% (175.28Mb) of the genome of this population is autozygous. FPED estimates ranged from 0.000 to 0.327 and FROH from 0.001 to 0.201. Low to moderate correlations were observed between FPED-FROH and FGRM-FROH, with values ranging from -0.16 to 0.59. Correlations between FROH from different lengths and FPED increased with ROH length. ROH shared by more than 50% of the samples were chosen as an indication of a possible ROH islands throughout the genome, and 14 regions were identified. Several genes inside those ROH islands were associated with milk fat content (DGAT1, CYP11B, EEF1D, INSIG2, and STAT1), mammary gland involution (IGFBP7), lactation (CHR and TRAPPC9), and heat adaptation (HSF1). Our results suggest that (i) low correlations (r<0.44) between FPED-FROH for small segments indicate that FPED estimates are not the most suitable method to capture ancient inbreeding. Moderate correlations (r>0.44) between larger ROH indicate that the levels of autozygosity derived from ROH can be used as an accurate estimator of individual inbreeding levels, and (ii) ROH might be used to identify genomic regions under selection as several overlapping regions were associated with dairy and adaptive traits.